Result of SIM4 for pF1KSDA2008

seq1 = pF1KSDA2008.tfa, 2376 bp
seq2 = pF1KSDA2008/gi568815581f_76769030.tfa (gi568815581f:76769030_77048835), 279806 bp

>pF1KSDA2008 2376
>gi568815581f:76769030_77048835 (Chr17)

1-68  (100001-100068)   100% ->
69-181  (103822-103934)   100% ->
182-329  (113122-113269)   100% ->
330-445  (133526-133641)   100% ->
446-519  (134274-134347)   100% ->
520-690  (135223-135393)   100% ->
691-855  (136140-136304)   100% ->
856-1025  (136989-137158)   100% ->
1026-1157  (155937-156068)   100% ->
1158-1291  (157568-157701)   100% ->
1292-1428  (163616-163752)   97% ->
1429-1584  (168959-169114)   100% ->
1585-1731  (171373-171519)   100% ->
1732-1848  (171703-171819)   100% ->
1849-1923  (177347-177421)   100% ->
1924-2180  (178801-179057)   100% ->
2181-2376  (179611-179806)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATCACCGTCAACCCCGATGGGAAGATAATGGTCAGAAGATGCCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATCACCGTCAACCCCGATGGGAAGATAATGGTCAGAAGATGCCTGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACCCTGAGACCCTTTCG         GCTTTTTGTCCTGGGCATCGGCT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100051 CACCCTGAGACCCTTTCGGTA...CAGGCTTTTTGTCCTGGGCATCGGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCTTCACTCTCTGCTTCCTGATGACGTCTCTGGGAGGCCAGTTCTCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103845 TCTTCACTCTCTGCTTCCTGATGACGTCTCTGGGAGGCCAGTTCTCGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGGCGCCTGGGGGACTCGCCATTCACCATCCGCACAGAAG         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 103895 CGGCGCCTGGGGGACTCGCCATTCACCATCCGCACAGAAGGTA...CAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GATGGGGGGCCCCGAGTCCCGCGGCGTCCTGCGCAAGATGAGCGACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113123 GATGGGGGGCCCCGAGTCCCGCGGCGTCCTGCGCAAGATGAGCGACCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGGAGCTGATGGTGAAGCGCATGGACGCACTGGCCAGGCTGGAGAACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113173 TGGAGCTGATGGTGAAGCGCATGGACGCACTGGCCAGGCTGGAGAACAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGTGAGCTGCACCGGGCCGGCGGCGACCTGCACTTTCCCGCAGACAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 113223 AGTGAGCTGCACCGGGCCGGCGGCGACCTGCACTTTCCCGCAGACAGGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    330       GATGCCCCCTGGGGCCGGCCTCATGGAGCGGATCCAGGCTATTG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113273 ...TAGGATGCCCCCTGGGGCCGGCCTCATGGAGCGGATCCAGGCTATTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCCAGAACGTCTCCGACATCGCTGTGAAGGTGGACCAGATCCTGCGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133570 CCCAGAACGTCTCCGACATCGCTGTGAAGGTGGACCAGATCCTGCGCCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGTCTGCTCCTGCACAGCAAGG         TGTCAGAAGGCCGGCGGGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 133620 AGTCTGCTCCTGCACAGCAAGGGTG...CAGTGTCAGAAGGCCGGCGGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCAGTGTGAGGCACCCAGTGACCCCAAGTTCCCTGACTGCTCAGGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134293 CCAGTGTGAGGCACCCAGTGACCCCAAGTTCCCTGACTGCTCAGGGAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGGAG         TGGATGCGTGCCCGCTGGACCTCTGACCCCTGCTAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134343 TGGAGGTG...CAGTGGATGCGTGCCCGCTGGACCTCTGACCCCTGCTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GCCTTCTTTGGGGTGGACGGCACCGAGTGCTCCTTCCTCATCTACCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135259 GCCTTCTTTGGGGTGGACGGCACCGAGTGCTCCTTCCTCATCTACCTCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGAGGTCGAGTGGTTCTGCCCCCCGCTGCCCTGGAGGAACCAGACGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135309 TGAGGTCGAGTGGTTCTGCCCCCCGCTGCCCTGGAGGAACCAGACGGCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CCCAGAGGGCACCCAAGCCCCTCCCCAAAGTCCAG         GCAGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 135359 CCCAGAGGGCACCCAAGCCCCTCCCCAAAGTCCAGGTG...CAGGCAGTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TTCCGAAGCAACCTGTCCCACCTTCTGGACCTGATGGGCAGCGGGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136146 TTCCGAAGCAACCTGTCCCACCTTCTGGACCTGATGGGCAGCGGGAAGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GTCCCTGATCTTCATGAAGAAGCGGACCAAGAGGCTCACAGCCCAGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136196 GTCCCTGATCTTCATGAAGAAGCGGACCAAGAGGCTCACAGCCCAGTGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CGCTGGCTGCCCAGCGCCTGGCACAGAAGCTGGGGGCCACCCAGAGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136246 CGCTGGCTGCCCAGCGCCTGGCACAGAAGCTGGGGGCCACCCAGAGGGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CAGAAGCAG         ATCCTGGTCCACATCGGCTTCCTGACGGAGGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 136296 CAGAAGCAGGTG...CAGATCCTGGTCCACATCGGCTTCCTGACGGAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GTCCGGGGACGTGTTCAGCCCTCGGGTCCTGAAGGGCGGGCCCCTAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137021 GTCCGGGGACGTGTTCAGCCCTCGGGTCCTGAAGGGCGGGCCCCTAGGGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AGATGGTGCAGTGGGCGGACATTCTGACTGCACTCTATGTCCTGGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137071 AGATGGTGCAGTGGGCGGACATTCTGACTGCACTCTATGTCCTGGGCCAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GGCCTGCGGGTCACAGTCTCCCTGAAGGAGCTGCAGAG         TAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 137121 GGCCTGCGGGTCACAGTCTCCCTGAAGGAGCTGCAGAGGTG...CAGTAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CTTAGGGGTACCGCCAGGCCGGGGAAGCTGCCCGCTCACCATGCCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155940 CTTAGGGGTACCGCCAGGCCGGGGAAGCTGCCCGCTCACCATGCCCCTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CCTTCGACCTCATCTACACCGACTACCACGGCCTGCAGCAGATGAAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155990 CCTTCGACCTCATCTACACCGACTACCACGGCCTGCAGCAGATGAAGCGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CACATGGGACTCTCCTTCAAGAAGTACCG         GTGCCGAATCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 156040 CACATGGGACTCTCCTTCAAGAAGTACCGGTG...CAGGTGCCGAATCAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GGTCATCGACACCTTCGGGACGGAACCTGCGTACAACCACGAGGAGTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157580 GGTCATCGACACCTTCGGGACGGAACCTGCGTACAACCACGAGGAGTACG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CCACGCTGCACGGCTACCGGACCAACTGGGGCTACTGGAACCTCAACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157630 CCACGCTGCACGGCTACCGGACCAACTGGGGCTACTGGAACCTCAACCCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 AAGCAGTTCATGACCATGTTTC         CTCATACCCCCGACAACTC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 157680 AAGCAGTTCATGACCATGTTTCGTG...CAGCTCATACCCCCGACAACTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CTTCATGGGCTTCGTGTCCGAGGAGCTCAACGAGACGGAGAAGCGGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163635 CTTCATGGGCTTCGTGTCCGAGGAGCTCAACGAGACGGAGAAGCGGCTCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TCAAAGGCGGCAAGGCCAGCAACATGGCCGTGGTGTACGGCAAGGAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163685 TCAAAGGCGGCAAGGCCAGCAACATGGCCGTGGTGTACGGCAAGGAGGCG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 AGCATCTGGAAGCTCCAG          GGGAAGGAGAAGTTCCTGGGCA
        |||||||||||| | -||->>>...>>>||||||||||||||||||||||
 163735 AGCATCTGGAAGGTG AGCGCG...CAGGGGAAGGAGAAGTTCCTGGGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 TCCTGAACAAATACATGGAGATCCATGGCACCGTGTACTACGAGAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168981 TCCTGAACAAATACATGGAGATCCATGGCACCGTGTACTACGAGAGCCAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CGGCCCCCCGAGGTGCCAGCCTTTGTGAAGAACCACGGCCTCTTACCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169031 CGGCCCCCCGAGGTGCCAGCCTTTGTGAAGAACCACGGCCTCTTACCGCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GCCTGAGTTTCAGCAGCTGCTGCGCAAGGCCAAA         CTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 169081 GCCTGAGTTTCAGCAGCTGCTGCGCAAGGCCAAAGTG...CAGCTCTTCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 TCGGGTTTGGCTTCCCCTACGAGGGCCCCGCCCCCCTGGAGGCCATCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171380 TCGGGTTTGGCTTCCCCTACGAGGGCCCCGCCCCCCTGGAGGCCATCGCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 AATGGTTGCATCTTCCTGCAGTCCCGCTTCAGCCCGCCCCACAGCTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171430 AATGGTTGCATCTTCCTGCAGTCCCGCTTCAGCCCGCCCCACAGCTCCCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1692 CAACCACGAGTTCTTCCGAGGCAAGCCCACCTCCAGAGAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 171480 CAACCACGAGTTCTTCCGAGGCAAGCCCACCTCCAGAGAGGTG...CAGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1733 TGTTCTCCCAGCATCCCTACGCGGAGAACTTCATCGGCAAGCCCCACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171704 TGTTCTCCCAGCATCCCTACGCGGAGAACTTCATCGGCAAGCCCCACGTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1783 TGGACAGTCGACTACAACAACTCAGAGGAGTTTGAAGCAGCCATCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171754 TGGACAGTCGACTACAACAACTCAGAGGAGTTTGAAGCAGCCATCAAGGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1833 CATTATGAGAACTCAG         GTAGACCCCTACCTACCCTACGAGT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 171804 CATTATGAGAACTCAGGTG...CAGGTAGACCCCTACCTACCCTACGAGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1874 ACACCTGCGAGGGGATGCTGGAGCGGATCCACGCCTACATCCAGCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177372 ACACCTGCGAGGGGATGCTGGAGCGGATCCACGCCTACATCCAGCACCAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1924          GACTTCTGCAGAGCTCCAGACCCTGCCCTACCAGAGGCCCA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177422 GTC...CAGGACTTCTGCAGAGCTCCAGACCCTGCCCTACCAGAGGCCCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1965 CGCCCCGCAGAGCCCCTTTGTCCTGGCCCCCAATGCCACCCACCTCGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178842 CGCCCCGCAGAGCCCCTTTGTCCTGGCCCCCAATGCCACCCACCTCGAGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2015 GGGCTCGGAACACCAGCTTGGCTCCTGGGGCCTGGCCCCCCGCGCACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178892 GGGCTCGGAACACCAGCTTGGCTCCTGGGGCCTGGCCCCCCGCGCACGCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2065 CTGCGGGCCTGGCTGGCCGTGCCTGGGAGGGCCTGCACCGACACCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178942 CTGCGGGCCTGGCTGGCCGTGCCTGGGAGGGCCTGCACCGACACCTGCCT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2115 GGACCACGGGCTAATCTGTGAGCCCTCCTTCTTCCCCTTCCTGAACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178992 GGACCACGGGCTAATCTGTGAGCCCTCCTTCTTCCCCTTCCTGAACAGCC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2165 AGGACGCCTTCCTCAA         GCTGCAGGTGCCCTGTGACAGCACC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 179042 AGGACGCCTTCCTCAAGTG...CAGGCTGCAGGTGCCCTGTGACAGCACC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2206 GAGTCGGAGATGAACCACCTGTACCCGGCGTTCGCCCAGCCTGGCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179636 GAGTCGGAGATGAACCACCTGTACCCGGCGTTCGCCCAGCCTGGCCAGGA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2256 GTGCTACCTGCAGAAGGAGCCTCTGCTCTTCAGCTGCGCCGGCTCCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179686 GTGCTACCTGCAGAAGGAGCCTCTGCTCTTCAGCTGCGCCGGCTCCAACA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2306 CCAAGTACCGCCGGCTCTGCCCCTGCCGCGACTTCCGCAAGGGCCAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179736 CCAAGTACCGCCGGCTCTGCCCCTGCCGCGACTTCCGCAAGGGCCAGGTG

   2500     .    :    .    :
   2356 GCCTTGTGCCAGGGCTGTCTG
        |||||||||||||||||||||
 179786 GCCTTGTGCCAGGGCTGTCTG

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