Result of FASTA (omim) for pF1KSDA0945
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0945, 779 aa
  1>>>pF1KSDA0945 779 - 779 aa - 779 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.5270+/-0.000386; mu= -7.7998+/- 0.024
 mean_var=365.3746+/-75.216, 0's: 0 Z-trim(124.0): 44  B-trim: 755 in 1/58
 Lambda= 0.067097
 statistics sampled from 44859 (44923) to 44859 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.803), E-opt: 0.2 (0.527), width:  16
 Scan time: 13.950

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001288061 (OMIM: 613880) bromo adjacent homolog ( 779) 5520 548.6 3.6e-155
XP_011519669 (OMIM: 613880) PREDICTED: bromo adjac ( 831) 5520 548.7 3.8e-155
XP_011519671 (OMIM: 613880) PREDICTED: bromo adjac ( 780) 5508 547.5 8.1e-155
NP_055767 (OMIM: 613880) bromo adjacent homology d ( 780) 5508 547.5 8.1e-155
XP_011519668 (OMIM: 613880) PREDICTED: bromo adjac ( 832) 5508 547.5 8.5e-155
XP_011519670 (OMIM: 613880) PREDICTED: bromo adjac ( 829) 5470 543.8 1.1e-153
XP_011536691 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2078)  315 45.1  0.0036
XP_006719477 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082)  315 45.1  0.0036
XP_006719475 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082)  315 45.1  0.0036
XP_006719476 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082)  315 45.1  0.0036


>>NP_001288061 (OMIM: 613880) bromo adjacent homology do  (779 aa)
 initn: 5520 init1: 5520 opt: 5520  Z-score: 2906.7  bits: 548.6 E(85289): 3.6e-155
Smith-Waterman score: 5520; 99.9% identity (100.0% similar) in 779 aa overlap (1-779:1-779)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MTHTRRKSLPMLSSGLTGRREPLQMEDSNMEQGVEGVEPGMPESPGHLTGRRKNYPLRKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MTHTRRKSLPMLSSGLTGRREPLQMEDSNMEQGVEGVEPGMPESPGHLTGRRKNYPLRKR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD PLVPEKPKACKVLLTRLENVAGPRSADEADELPPDLPKPPSPAPSSEDPGLAQPRKRRLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLVPEKPKACKVLLTRLENVAGPRSADEADELPPDLPKPPSPAPSSEDPGLAQPRKRRLA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD SLNAEALNNLLLEREDTSSLAGTRRSRAGDPHRSRDRDRATGGWSSSKKRPRLGDLGGGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLNAEALNNLLLEREDTSSLAGTRRSRAGDPHRSRDRDRATGGWSSSKKRPRLGDLGGGS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD RDLSPEPAPDEGPRRDGDPAPKRLASLNAAAFLKLSQERELPLRLPRAHAEVDGRSTEPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDLSPEPAPDEGPRRDGDPAPKRLASLNAAAFLKLSQERELPLRLPRAHAEVDGRSTEPP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD APKAPRPKWPKVNGKNYPKAWQGASSGEAAGPPGWQGCPDEPWPSATPCGPSVQPSHKPL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
NP_001 APKAPRPKWPKVNGKNYPKAWQGASSGEAAGPPGWQGCPDEPWPSATPCGPSVQPSHQPL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SKALESPLGLRPHLPLLMGGQAALKPEPGRPGEESPAPKQELHQPSFPTPQLSPLPMPGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SKALESPLGLRPHLPLLMGGQAALKPEPGRPGEESPAPKQELHQPSFPTPQLSPLPMPGN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD PADYNGLCVGPELTALGSFYLYCGQEGLQCGGYSPCPMLPEGKLSPVAAPHEEGLLLAPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PADYNGLCVGPELTALGSFYLYCGQEGLQCGGYSPCPMLPEGKLSPVAAPHEEGLLLAPS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD SVPSGTPFQHPPWGSSRYCSSEDTGVNGYSICGVLPLSVTHAGTTCGGCPYKMPFAAGCR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVPSGTPFQHPPWGSSRYCSSEDTGVNGYSICGVLPLSVTHAGTTCGGCPYKMPFAAGCR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD SLGQLEFPLPEAGHPASPAHPLLGCPVPSVPPAAEPVPHLQTPTSEPQTVARACPQSAKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLGQLEFPLPEAGHPASPAHPLLGCPVPSVPPAAEPVPHLQTPTSEPQTVARACPQSAKP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD PSGSKSGLRTGSSCRHTARSKAARRPSHPKQPRVQRPRPRRRRRRRTNGWVPVGAACEKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSGSKSGLRTGSSCRHTARSKAARRPSHPKQPRVQRPRPRRRRRRRTNGWVPVGAACEKA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD VYVLDEPEPAIRKSYQAVERHGETIRVRDTVLLKSGPRKTSTPYVAKISALWENPESGEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VYVLDEPEPAIRKSYQAVERHGETIRVRDTVLLKSGPRKTSTPYVAKISALWENPESGEL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD MMSLLWYYRPEHLQGGRSPSMHEPLQNEVFASRHQDQNSVACIEEKCYVLTFAEYCRFCA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MMSLLWYYRPEHLQGGRSPSMHEPLQNEVFASRHQDQNSVACIEEKCYVLTFAEYCRFCA
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770         
pF1KSD MAKRRGEGLPSRKTALVPPSADYSTPPHRTVPEDTDPELVFLCRHVYDFRHGRILKNPQ
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAKRRGEGLPSRKTALVPPSADYSTPPHRTVPEDTDPELVFLCRHVYDFRHGRILKNPQ
              730       740       750       760       770         

>>XP_011519669 (OMIM: 613880) PREDICTED: bromo adjacent   (831 aa)
 initn: 5520 init1: 5520 opt: 5520  Z-score: 2906.4  bits: 548.7 E(85289): 3.8e-155
Smith-Waterman score: 5520; 99.9% identity (100.0% similar) in 779 aa overlap (1-779:53-831)

                                             10        20        30
pF1KSD                               MTHTRRKSLPMLSSGLTGRREPLQMEDSNM
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CVFILSVLIPLGLAPATSGLSTLSQGWKYSMTHTRRKSLPMLSSGLTGRREPLQMEDSNM
             30        40        50        60        70        80  

               40        50        60        70        80        90
pF1KSD EQGVEGVEPGMPESPGHLTGRRKNYPLRKRPLVPEKPKACKVLLTRLENVAGPRSADEAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EQGVEGVEPGMPESPGHLTGRRKNYPLRKRPLVPEKPKACKVLLTRLENVAGPRSADEAD
             90       100       110       120       130       140  

              100       110       120       130       140       150
pF1KSD ELPPDLPKPPSPAPSSEDPGLAQPRKRRLASLNAEALNNLLLEREDTSSLAGTRRSRAGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ELPPDLPKPPSPAPSSEDPGLAQPRKRRLASLNAEALNNLLLEREDTSSLAGTRRSRAGD
            150       160       170       180       190       200  

              160       170       180       190       200       210
pF1KSD PHRSRDRDRATGGWSSSKKRPRLGDLGGGSRDLSPEPAPDEGPRRDGDPAPKRLASLNAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PHRSRDRDRATGGWSSSKKRPRLGDLGGGSRDLSPEPAPDEGPRRDGDPAPKRLASLNAA
            210       220       230       240       250       260  

              220       230       240       250       260       270
pF1KSD AFLKLSQERELPLRLPRAHAEVDGRSTEPPAPKAPRPKWPKVNGKNYPKAWQGASSGEAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AFLKLSQERELPLRLPRAHAEVDGRSTEPPAPKAPRPKWPKVNGKNYPKAWQGASSGEAA
            270       280       290       300       310       320  

              280       290       300       310       320       330
pF1KSD GPPGWQGCPDEPWPSATPCGPSVQPSHKPLSKALESPLGLRPHLPLLMGGQAALKPEPGR
       :::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GPPGWQGCPDEPWPSATPCGPSVQPSHQPLSKALESPLGLRPHLPLLMGGQAALKPEPGR
            330       340       350       360       370       380  

              340       350       360       370       380       390
pF1KSD PGEESPAPKQELHQPSFPTPQLSPLPMPGNPADYNGLCVGPELTALGSFYLYCGQEGLQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PGEESPAPKQELHQPSFPTPQLSPLPMPGNPADYNGLCVGPELTALGSFYLYCGQEGLQC
            390       400       410       420       430       440  

              400       410       420       430       440       450
pF1KSD GGYSPCPMLPEGKLSPVAAPHEEGLLLAPSSVPSGTPFQHPPWGSSRYCSSEDTGVNGYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GGYSPCPMLPEGKLSPVAAPHEEGLLLAPSSVPSGTPFQHPPWGSSRYCSSEDTGVNGYS
            450       460       470       480       490       500  

              460       470       480       490       500       510
pF1KSD ICGVLPLSVTHAGTTCGGCPYKMPFAAGCRSLGQLEFPLPEAGHPASPAHPLLGCPVPSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ICGVLPLSVTHAGTTCGGCPYKMPFAAGCRSLGQLEFPLPEAGHPASPAHPLLGCPVPSV
            510       520       530       540       550       560  

              520       530       540       550       560       570
pF1KSD PPAAEPVPHLQTPTSEPQTVARACPQSAKPPSGSKSGLRTGSSCRHTARSKAARRPSHPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PPAAEPVPHLQTPTSEPQTVARACPQSAKPPSGSKSGLRTGSSCRHTARSKAARRPSHPK
            570       580       590       600       610       620  

              580       590       600       610       620       630
pF1KSD QPRVQRPRPRRRRRRRTNGWVPVGAACEKAVYVLDEPEPAIRKSYQAVERHGETIRVRDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QPRVQRPRPRRRRRRRTNGWVPVGAACEKAVYVLDEPEPAIRKSYQAVERHGETIRVRDT
            630       640       650       660       670       680  

              640       650       660       670       680       690
pF1KSD VLLKSGPRKTSTPYVAKISALWENPESGELMMSLLWYYRPEHLQGGRSPSMHEPLQNEVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VLLKSGPRKTSTPYVAKISALWENPESGELMMSLLWYYRPEHLQGGRSPSMHEPLQNEVF
            690       700       710       720       730       740  

              700       710       720       730       740       750
pF1KSD ASRHQDQNSVACIEEKCYVLTFAEYCRFCAMAKRRGEGLPSRKTALVPPSADYSTPPHRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASRHQDQNSVACIEEKCYVLTFAEYCRFCAMAKRRGEGLPSRKTALVPPSADYSTPPHRT
            750       760       770       780       790       800  

              760       770         
pF1KSD VPEDTDPELVFLCRHVYDFRHGRILKNPQ
       :::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VPEDTDPELVFLCRHVYDFRHGRILKNPQ
            810       820       830 

>>XP_011519671 (OMIM: 613880) PREDICTED: bromo adjacent   (780 aa)
 initn: 3433 init1: 3391 opt: 5508  Z-score: 2900.5  bits: 547.5 E(85289): 8.1e-155
Smith-Waterman score: 5508; 99.7% identity (99.9% similar) in 780 aa overlap (1-779:1-780)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MTHTRRKSLPMLSSGLTGRREPLQMEDSNMEQGVEGVEPGMPESPGHLTGRRKNYPLRKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MTHTRRKSLPMLSSGLTGRREPLQMEDSNMEQGVEGVEPGMPESPGHLTGRRKNYPLRKR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD PLVPEKPKACKVLLTRLENVAGPRSADEADELPPDLPKPPSPAPSSEDPGLAQPRKRRLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PLVPEKPKACKVLLTRLENVAGPRSADEADELPPDLPKPPSPAPSSEDPGLAQPRKRRLA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD SLNAEALNNLLLEREDTSSLAGTRRSRAGDPHRSRDRDRATGGWSSSKKRPRLGDLGGGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLNAEALNNLLLEREDTSSLAGTRRSRAGDPHRSRDRDRATGGWSSSKKRPRLGDLGGGS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD RDLSPEPAPDEGPRRDGDPAPKRLASLNAAAFLKLSQERELPLRLPRAHAEVDGRSTEPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RDLSPEPAPDEGPRRDGDPAPKRLASLNAAAFLKLSQERELPLRLPRAHAEVDGRSTEPP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD APKAPRPKWPKVNGKNYPKAWQGASSGEAAGPPGWQGCPDEPWPSATPCGPSVQPSHKPL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
XP_011 APKAPRPKWPKVNGKNYPKAWQGASSGEAAGPPGWQGCPDEPWPSATPCGPSVQPSHQPL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SKALESPLGLRPHLPLLMGGQAALKPEPGRPGEESPAPKQELHQPSFPTPQLSPLPMPGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SKALESPLGLRPHLPLLMGGQAALKPEPGRPGEESPAPKQELHQPSFPTPQLSPLPMPGN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD PADYNGLCVGPELTALGSFYLYCGQEGLQCGGYSPCPMLPEGKLSPVAAPHEEGLLLAPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PADYNGLCVGPELTALGSFYLYCGQEGLQCGGYSPCPMLPEGKLSPVAAPHEEGLLLAPS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470          
pF1KSD SVPSGTPFQHPPWGSSRYCSSEDTGVNGYSICGVLPLSVTHAGTTCGGCPYKMPFAA-GC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
XP_011 SVPSGTPFQHPPWGSSRYCSSEDTGVNGYSICGVLPLSVTHAGTTCGGCPYKMPFAAEGC
              430       440       450       460       470       480

     480       490       500       510       520       530         
pF1KSD RSLGQLEFPLPEAGHPASPAHPLLGCPVPSVPPAAEPVPHLQTPTSEPQTVARACPQSAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RSLGQLEFPLPEAGHPASPAHPLLGCPVPSVPPAAEPVPHLQTPTSEPQTVARACPQSAK
              490       500       510       520       530       540

     540       550       560       570       580       590         
pF1KSD PPSGSKSGLRTGSSCRHTARSKAARRPSHPKQPRVQRPRPRRRRRRRTNGWVPVGAACEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PPSGSKSGLRTGSSCRHTARSKAARRPSHPKQPRVQRPRPRRRRRRRTNGWVPVGAACEK
              550       560       570       580       590       600

     600       610       620       630       640       650         
pF1KSD AVYVLDEPEPAIRKSYQAVERHGETIRVRDTVLLKSGPRKTSTPYVAKISALWENPESGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AVYVLDEPEPAIRKSYQAVERHGETIRVRDTVLLKSGPRKTSTPYVAKISALWENPESGE
              610       620       630       640       650       660

     660       670       680       690       700       710         
pF1KSD LMMSLLWYYRPEHLQGGRSPSMHEPLQNEVFASRHQDQNSVACIEEKCYVLTFAEYCRFC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LMMSLLWYYRPEHLQGGRSPSMHEPLQNEVFASRHQDQNSVACIEEKCYVLTFAEYCRFC
              670       680       690       700       710       720

     720       730       740       750       760       770         
pF1KSD AMAKRRGEGLPSRKTALVPPSADYSTPPHRTVPEDTDPELVFLCRHVYDFRHGRILKNPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AMAKRRGEGLPSRKTALVPPSADYSTPPHRTVPEDTDPELVFLCRHVYDFRHGRILKNPQ
              730       740       750       760       770       780

>>NP_055767 (OMIM: 613880) bromo adjacent homology domai  (780 aa)
 initn: 3433 init1: 3391 opt: 5508  Z-score: 2900.5  bits: 547.5 E(85289): 8.1e-155
Smith-Waterman score: 5508; 99.7% identity (99.9% similar) in 780 aa overlap (1-779:1-780)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MTHTRRKSLPMLSSGLTGRREPLQMEDSNMEQGVEGVEPGMPESPGHLTGRRKNYPLRKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MTHTRRKSLPMLSSGLTGRREPLQMEDSNMEQGVEGVEPGMPESPGHLTGRRKNYPLRKR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD PLVPEKPKACKVLLTRLENVAGPRSADEADELPPDLPKPPSPAPSSEDPGLAQPRKRRLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PLVPEKPKACKVLLTRLENVAGPRSADEADELPPDLPKPPSPAPSSEDPGLAQPRKRRLA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD SLNAEALNNLLLEREDTSSLAGTRRSRAGDPHRSRDRDRATGGWSSSKKRPRLGDLGGGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SLNAEALNNLLLEREDTSSLAGTRRSRAGDPHRSRDRDRATGGWSSSKKRPRLGDLGGGS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD RDLSPEPAPDEGPRRDGDPAPKRLASLNAAAFLKLSQERELPLRLPRAHAEVDGRSTEPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RDLSPEPAPDEGPRRDGDPAPKRLASLNAAAFLKLSQERELPLRLPRAHAEVDGRSTEPP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD APKAPRPKWPKVNGKNYPKAWQGASSGEAAGPPGWQGCPDEPWPSATPCGPSVQPSHKPL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
NP_055 APKAPRPKWPKVNGKNYPKAWQGASSGEAAGPPGWQGCPDEPWPSATPCGPSVQPSHQPL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SKALESPLGLRPHLPLLMGGQAALKPEPGRPGEESPAPKQELHQPSFPTPQLSPLPMPGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SKALESPLGLRPHLPLLMGGQAALKPEPGRPGEESPAPKQELHQPSFPTPQLSPLPMPGN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD PADYNGLCVGPELTALGSFYLYCGQEGLQCGGYSPCPMLPEGKLSPVAAPHEEGLLLAPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PADYNGLCVGPELTALGSFYLYCGQEGLQCGGYSPCPMLPEGKLSPVAAPHEEGLLLAPS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470          
pF1KSD SVPSGTPFQHPPWGSSRYCSSEDTGVNGYSICGVLPLSVTHAGTTCGGCPYKMPFAA-GC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
NP_055 SVPSGTPFQHPPWGSSRYCSSEDTGVNGYSICGVLPLSVTHAGTTCGGCPYKMPFAAEGC
              430       440       450       460       470       480

     480       490       500       510       520       530         
pF1KSD RSLGQLEFPLPEAGHPASPAHPLLGCPVPSVPPAAEPVPHLQTPTSEPQTVARACPQSAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RSLGQLEFPLPEAGHPASPAHPLLGCPVPSVPPAAEPVPHLQTPTSEPQTVARACPQSAK
              490       500       510       520       530       540

     540       550       560       570       580       590         
pF1KSD PPSGSKSGLRTGSSCRHTARSKAARRPSHPKQPRVQRPRPRRRRRRRTNGWVPVGAACEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PPSGSKSGLRTGSSCRHTARSKAARRPSHPKQPRVQRPRPRRRRRRRTNGWVPVGAACEK
              550       560       570       580       590       600

     600       610       620       630       640       650         
pF1KSD AVYVLDEPEPAIRKSYQAVERHGETIRVRDTVLLKSGPRKTSTPYVAKISALWENPESGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 AVYVLDEPEPAIRKSYQAVERHGETIRVRDTVLLKSGPRKTSTPYVAKISALWENPESGE
              610       620       630       640       650       660

     660       670       680       690       700       710         
pF1KSD LMMSLLWYYRPEHLQGGRSPSMHEPLQNEVFASRHQDQNSVACIEEKCYVLTFAEYCRFC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LMMSLLWYYRPEHLQGGRSPSMHEPLQNEVFASRHQDQNSVACIEEKCYVLTFAEYCRFC
              670       680       690       700       710       720

     720       730       740       750       760       770         
pF1KSD AMAKRRGEGLPSRKTALVPPSADYSTPPHRTVPEDTDPELVFLCRHVYDFRHGRILKNPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 AMAKRRGEGLPSRKTALVPPSADYSTPPHRTVPEDTDPELVFLCRHVYDFRHGRILKNPQ
              730       740       750       760       770       780

>>XP_011519668 (OMIM: 613880) PREDICTED: bromo adjacent   (832 aa)
 initn: 3433 init1: 3391 opt: 5508  Z-score: 2900.1  bits: 547.5 E(85289): 8.5e-155
Smith-Waterman score: 5508; 99.7% identity (99.9% similar) in 780 aa overlap (1-779:53-832)

                                             10        20        30
pF1KSD                               MTHTRRKSLPMLSSGLTGRREPLQMEDSNM
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CVFILSVLIPLGLAPATSGLSTLSQGWKYSMTHTRRKSLPMLSSGLTGRREPLQMEDSNM
             30        40        50        60        70        80  

               40        50        60        70        80        90
pF1KSD EQGVEGVEPGMPESPGHLTGRRKNYPLRKRPLVPEKPKACKVLLTRLENVAGPRSADEAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EQGVEGVEPGMPESPGHLTGRRKNYPLRKRPLVPEKPKACKVLLTRLENVAGPRSADEAD
             90       100       110       120       130       140  

              100       110       120       130       140       150
pF1KSD ELPPDLPKPPSPAPSSEDPGLAQPRKRRLASLNAEALNNLLLEREDTSSLAGTRRSRAGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ELPPDLPKPPSPAPSSEDPGLAQPRKRRLASLNAEALNNLLLEREDTSSLAGTRRSRAGD
            150       160       170       180       190       200  

              160       170       180       190       200       210
pF1KSD PHRSRDRDRATGGWSSSKKRPRLGDLGGGSRDLSPEPAPDEGPRRDGDPAPKRLASLNAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PHRSRDRDRATGGWSSSKKRPRLGDLGGGSRDLSPEPAPDEGPRRDGDPAPKRLASLNAA
            210       220       230       240       250       260  

              220       230       240       250       260       270
pF1KSD AFLKLSQERELPLRLPRAHAEVDGRSTEPPAPKAPRPKWPKVNGKNYPKAWQGASSGEAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AFLKLSQERELPLRLPRAHAEVDGRSTEPPAPKAPRPKWPKVNGKNYPKAWQGASSGEAA
            270       280       290       300       310       320  

              280       290       300       310       320       330
pF1KSD GPPGWQGCPDEPWPSATPCGPSVQPSHKPLSKALESPLGLRPHLPLLMGGQAALKPEPGR
       :::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GPPGWQGCPDEPWPSATPCGPSVQPSHQPLSKALESPLGLRPHLPLLMGGQAALKPEPGR
            330       340       350       360       370       380  

              340       350       360       370       380       390
pF1KSD PGEESPAPKQELHQPSFPTPQLSPLPMPGNPADYNGLCVGPELTALGSFYLYCGQEGLQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PGEESPAPKQELHQPSFPTPQLSPLPMPGNPADYNGLCVGPELTALGSFYLYCGQEGLQC
            390       400       410       420       430       440  

              400       410       420       430       440       450
pF1KSD GGYSPCPMLPEGKLSPVAAPHEEGLLLAPSSVPSGTPFQHPPWGSSRYCSSEDTGVNGYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GGYSPCPMLPEGKLSPVAAPHEEGLLLAPSSVPSGTPFQHPPWGSSRYCSSEDTGVNGYS
            450       460       470       480       490       500  

              460       470        480       490       500         
pF1KSD ICGVLPLSVTHAGTTCGGCPYKMPFAA-GCRSLGQLEFPLPEAGHPASPAHPLLGCPVPS
       ::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ICGVLPLSVTHAGTTCGGCPYKMPFAAEGCRSLGQLEFPLPEAGHPASPAHPLLGCPVPS
            510       520       530       540       550       560  

     510       520       530       540       550       560         
pF1KSD VPPAAEPVPHLQTPTSEPQTVARACPQSAKPPSGSKSGLRTGSSCRHTARSKAARRPSHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VPPAAEPVPHLQTPTSEPQTVARACPQSAKPPSGSKSGLRTGSSCRHTARSKAARRPSHP
            570       580       590       600       610       620  

     570       580       590       600       610       620         
pF1KSD KQPRVQRPRPRRRRRRRTNGWVPVGAACEKAVYVLDEPEPAIRKSYQAVERHGETIRVRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KQPRVQRPRPRRRRRRRTNGWVPVGAACEKAVYVLDEPEPAIRKSYQAVERHGETIRVRD
            630       640       650       660       670       680  

     630       640       650       660       670       680         
pF1KSD TVLLKSGPRKTSTPYVAKISALWENPESGELMMSLLWYYRPEHLQGGRSPSMHEPLQNEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TVLLKSGPRKTSTPYVAKISALWENPESGELMMSLLWYYRPEHLQGGRSPSMHEPLQNEV
            690       700       710       720       730       740  

     690       700       710       720       730       740         
pF1KSD FASRHQDQNSVACIEEKCYVLTFAEYCRFCAMAKRRGEGLPSRKTALVPPSADYSTPPHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FASRHQDQNSVACIEEKCYVLTFAEYCRFCAMAKRRGEGLPSRKTALVPPSADYSTPPHR
            750       760       770       780       790       800  

     750       760       770         
pF1KSD TVPEDTDPELVFLCRHVYDFRHGRILKNPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TVPEDTDPELVFLCRHVYDFRHGRILKNPQ
            810       820       830  

>>XP_011519670 (OMIM: 613880) PREDICTED: bromo adjacent   (829 aa)
 initn: 4080 init1: 3391 opt: 5470  Z-score: 2880.2  bits: 543.8 E(85289): 1.1e-153
Smith-Waterman score: 5470; 99.4% identity (99.5% similar) in 780 aa overlap (1-779:53-829)

                                             10        20        30
pF1KSD                               MTHTRRKSLPMLSSGLTGRREPLQMEDSNM
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CVFILSVLIPLGLAPATSGLSTLSQGWKYSMTHTRRKSLPMLSSGLTGRREPLQMEDSNM
             30        40        50        60        70        80  

               40        50        60        70        80        90
pF1KSD EQGVEGVEPGMPESPGHLTGRRKNYPLRKRPLVPEKPKACKVLLTRLENVAGPRSADEAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EQGVEGVEPGMPESPGHLTGRRKNYPLRKRPLVPEKPKACKVLLTRLENVAGPRSADEAD
             90       100       110       120       130       140  

              100       110       120       130       140       150
pF1KSD ELPPDLPKPPSPAPSSEDPGLAQPRKRRLASLNAEALNNLLLEREDTSSLAGTRRSRAGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ELPPDLPKPPSPAPSSEDPGLAQPRKRRLASLNAEALNNLLLEREDTSSLAGTRRSRAGD
            150       160       170       180       190       200  

              160       170       180       190       200       210
pF1KSD PHRSRDRDRATGGWSSSKKRPRLGDLGGGSRDLSPEPAPDEGPRRDGDPAPKRLASLNAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PHRSRDRDRATGGWSSSKKRPRLGDLGGGSRDLSPEPAPDEGPRRDGDPAPKRLASLNAA
            210       220       230       240       250       260  

              220       230       240       250       260       270
pF1KSD AFLKLSQERELPLRLPRAHAEVDGRSTEPPAPKAPRPKWPKVNGKNYPKAWQGASSGEAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AFLKLSQERELPLRLPRAHAEVDGRSTEPPAPKAPRPKWPKVNGKNYPKAWQGASSGEAA
            270       280       290       300       310       320  

              280       290       300       310       320       330
pF1KSD GPPGWQGCPDEPWPSATPCGPSVQPSHKPLSKALESPLGLRPHLPLLMGGQAALKPEPGR
       :::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GPPGWQGCPDEPWPSATPCGPSVQPSHQPLSKALESPLGLRPHLPLLMGGQAALKPEPGR
            330       340       350       360       370       380  

              340       350       360       370       380       390
pF1KSD PGEESPAPKQELHQPSFPTPQLSPLPMPGNPADYNGLCVGPELTALGSFYLYCGQEGLQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PGEESPAPKQELHQPSFPTPQLSPLPMPGNPADYNGLCVGPELTALGSFYLYCGQEGLQC
            390       400       410       420       430       440  

              400       410       420       430       440       450
pF1KSD GGYSPCPMLPEGKLSPVAAPHEEGLLLAPSSVPSGTPFQHPPWGSSRYCSSEDTGVNGYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GGYSPCPMLPEGKLSPVAAPHEEGLLLAPSSVPSGTPFQHPPWGSSRYCSSEDTGVNGYS
            450       460       470       480       490       500  

              460       470        480       490       500         
pF1KSD ICGVLPLSVTHAGTTCGGCPYKMPFAA-GCRSLGQLEFPLPEAGHPASPAHPLLGCPVPS
       ::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ICGVLPLSVTHAGTTCGGCPYKMPFAAEGCRSLGQLEFPLPEAGHPASPAHPLLGCPVPS
            510       520       530       540       550       560  

     510       520       530       540       550       560         
pF1KSD VPPAAEPVPHLQTPTSEPQTVARACPQSAKPPSGSKSGLRTGSSCRHTARSKAARRPSHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VPPAAEPVPHLQTPTSEPQTVARACPQSAKPPSGSKSGLRTGSSCRHTARSKAARRPSHP
            570       580       590       600       610       620  

     570       580       590       600       610       620         
pF1KSD KQPRVQRPRPRRRRRRRTNGWVPVGAACEKAVYVLDEPEPAIRKSYQAVERHGETIRVRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KQPRVQRPRPRRRRRRRTNGWVPVGAACEKAVYVLDEPEPAIRKSYQAVERHGETIRVRD
            630       640       650       660       670       680  

     630       640       650       660       670       680         
pF1KSD TVLLKSGPRKTSTPYVAKISALWENPESGELMMSLLWYYRPEHLQGGRSPSMHEPLQNEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::   :::
XP_011 TVLLKSGPRKTSTPYVAKISALWENPESGELMMSLLWYYRPEHLQGGRSPSMHE---NEV
            690       700       710       720       730            

     690       700       710       720       730       740         
pF1KSD FASRHQDQNSVACIEEKCYVLTFAEYCRFCAMAKRRGEGLPSRKTALVPPSADYSTPPHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FASRHQDQNSVACIEEKCYVLTFAEYCRFCAMAKRRGEGLPSRKTALVPPSADYSTPPHR
     740       750       760       770       780       790         

     750       760       770         
pF1KSD TVPEDTDPELVFLCRHVYDFRHGRILKNPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TVPEDTDPELVFLCRHVYDFRHGRILKNPQ
     800       810       820         

>>XP_011536691 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent polypep  (2078 aa)
 initn: 159 init1: 108 opt: 315  Z-score: 177.8  bits: 45.1 E(85289): 0.0036
Smith-Waterman score: 345; 25.5% identity (43.3% similar) in 635 aa overlap (35-643:876-1452)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KSD RRKSLPMLSSGLTGRREPLQMEDSNMEQGVEGVEPGMPESPGHLTGRRKNYPLRKR-PLV
                                     .::     :.:   :    : :. :. : .
XP_011 SKDSPATTHSPTPPSPKGAPTPSAVTPLSPKGVTLPPKETP---TPSVVNLPFPKEGPAT
         850       860       870       880          890       900  

            70        80        90       100       110       120   
pF1KSD PEKPKACKVLLTRLENVAGPRSADEADELPPDLPKPPSPAPSSEDPGLAQPRKRRLASLN
       :   .:  . .:     ..:..: .:   :  .:  :::  .   :. . :  .     .
XP_011 PAPKQAPALSMTS----SSPKKA-RATPAPKGIPASPSPKGAPTPPAATPPSPK-----G
            910           920        930       940       950       

           130       140       150       160       170       180   
pF1KSD AEALNNLLLEREDTSSLAGTRRSRAGDPHRSRDRDRATGGWSSSKKRPRLGDLGGGSRDL
       . :  .    .   .  :.:  :  : :     .   :   ...   :.     ::    
XP_011 GPATPS---PKWAPTPPAATPPSPKGGPATPSPKGAPTPP-AATPPSPK-----GGPATP
               960       970       980        990           1000   

           190       200       210       220       230       240   
pF1KSD SPEPAPDEGPRRDGDPAPKRLASLNAAAFLKLSQERELPLRLPRAHAEVDGRSTEPP-AP
       ::. ::   :     :.::  .:  :. : : ..    :   : .     . .  :  ::
XP_011 SPKGAPT--PPAVTPPSPK--GSPAATPFPKGASTP--PAATPPSPKGSPAATPLPKGAP
          1010        1020        1030        1040      1050       

            250       260       270       280       290            
pF1KSD KAPRPKWPKVNGKNYPKAWQGASSGEAAGPPGWQGCPDEPWPSATPCGPSVQP-SHK---
        .:    :. .:     . .:: .  :: ::. .: :  : :...:  :.. : : :   
XP_011 TTPAATLPSPKGGPATPSLKGAPTPPAATPPSPKGGPATPSPKGAPMPPAATPPSPKGGL
      1060      1070      1080      1090      1100      1110       

        300       310       320         330       340       350    
pF1KSD --PLSKALESPLGLRPHLPLLMGGQAALKPE--PGRPGEESPAPKQELHQPSFPTPQLSP
         :  :.  .  .  :  :   :: :.  :.  :  :.   :.::  :   . : :. .:
XP_011 ATPPHKGAPTTPAATPPSP--KGGLATPPPKGAPTTPAATPPSPKGGL---ATPPPKGAP
      1120      1130        1140      1150      1160         1170  

           360           370       380       390       400         
pF1KSD L-PMPGNPADYNGLCV----GPELTALGSFYLYCGQEGLQCGGYSPCPMLPEGKL-SP--
         :    :.  .:: .    :   :  ..     :  ::   . .  :  : .   ::  
XP_011 TTPAATPPSPKGGLATPSPKGAPTTPAATPPSPKG--GLATPSPKGAPTTPAATPPSPKG
           1180      1190      1200        1210      1220      1230

         410       420          430       440       450       460  
pF1KSD -VAAPHEEGLLLAPSSVP---SGTPFQHPPWGSSRYCSSEDTGVNGYSICGVLPLSVTHA
        .:.:  .:   .:...:   .: :   :: :.    ..   ...:    :.   .  : 
XP_011 GLATPSPKGAPTTPAATPPSPKGGPATPPPKGAPTPPAATPPSLKG----GL--ATPPHK
             1240      1250      1260      1270            1280    

            470       480       490       500       510       520  
pF1KSD GTTCGGCPYKMPFAAGCRSLGQLEFPLPEAGHPASPAHPLLGCPVPSVPPAAEPVPHLQT
       :.   .        .:  .      : : :. : ::     : :  . :: . :.:   :
XP_011 GAPNPAVVTPPSPKGGPATSPPKGAPTPPAATPPSPK----GSP-GTPPPKGAPTPPAVT
         1290      1300      1310      1320           1330         

            530       540       550       560       570       580  
pF1KSD PTSEPQTVARACPQSAKPPSGSKSGLRTGSSCRHTARSKAARRPSHPKQPRVQRPRPRRR
       : : :. .  . :  :  :: ::.:  : ::  . . .  :  :::   : .  : :.: 
XP_011 PPS-PKGTP-TLP--ATTPS-SKGGPTTPSS--KEGPTPPAATPSHKGGPAMTPPSPKRG
    1340        1350         1360        1370      1380      1390  

            590       600          610       620        630        
pF1KSD RRRRTNGWVPVGAACEKAVYVLDE---PEPAIRKSYQAVERHGE-TIRVRDTVLLKSGPR
           .    : :     ::  :.    :   . .   :.  .:. :  .   : ::..: 
XP_011 PAIPS----PKGDPTSPAVIPLSPKKAPATPVTREGAATPSKGDLTPPAVTPVSLKKAP-
               1400      1410      1420      1430      1440        

      640       650       660       670       680       690        
pF1KSD KTSTPYVAKISALWENPESGELMMSLLWYYRPEHLQGGRSPSMHEPLQNEVFASRHQDQN
        ::.:                                                       
XP_011 ATSAPKGGPATPSSKGDPTLPAVTPPSPKEPPAPKQVATSSSPKKAPATPAPMGAPTLPA
      1450      1460      1470      1480      1490      1500       

>>XP_006719477 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent polypep  (2082 aa)
 initn: 159 init1: 108 opt: 315  Z-score: 177.8  bits: 45.1 E(85289): 0.0036
Smith-Waterman score: 345; 25.5% identity (43.3% similar) in 635 aa overlap (35-643:876-1452)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KSD RRKSLPMLSSGLTGRREPLQMEDSNMEQGVEGVEPGMPESPGHLTGRRKNYPLRKR-PLV
                                     .::     :.:   :    : :. :. : .
XP_006 SKDSPATTHSPTPPSPKGAPTPSAVTPLSPKGVTLPPKETP---TPSVVNLPFPKEGPAT
         850       860       870       880          890       900  

            70        80        90       100       110       120   
pF1KSD PEKPKACKVLLTRLENVAGPRSADEADELPPDLPKPPSPAPSSEDPGLAQPRKRRLASLN
       :   .:  . .:     ..:..: .:   :  .:  :::  .   :. . :  .     .
XP_006 PAPKQAPALSMTS----SSPKKA-RATPAPKGIPASPSPKGAPTPPAATPPSPK-----G
            910           920        930       940       950       

           130       140       150       160       170       180   
pF1KSD AEALNNLLLEREDTSSLAGTRRSRAGDPHRSRDRDRATGGWSSSKKRPRLGDLGGGSRDL
       . :  .    .   .  :.:  :  : :     .   :   ...   :.     ::    
XP_006 GPATPS---PKWAPTPPAATPPSPKGGPATPSPKGAPTPP-AATPPSPK-----GGPATP
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       : : :. .  . :  :  :: ::.:  : ::  . . .  :  :::   : .  : :.: 
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           .    : :     ::  :.    :   . .   :.  .:. :  .   : ::..: 
XP_006 PAIPS----PKGDPTSPAVIPLSPKKAPATPVTREGAATPSKGDLTPPAVTPVSLKKAP-
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        ::.:                                                       
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