Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0742
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0742, 1321 aa
  1>>>pF1KSDA0742 1321 - 1321 aa - 1321 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3206+/-0.00106; mu= 13.5864+/- 0.064
 mean_var=119.7928+/-23.195, 0's: 0 Z-trim(107.4): 21  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.117181
 statistics sampled from 9572 (9582) to 9572 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.294), width:  16
 Scan time:  5.560

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1990.1 KDM3A gene_id:55818|Hs108|chr2          (1321) 8980 1530.3       0
CCDS34242.1 KDM3B gene_id:51780|Hs108|chr5         (1761) 2173 379.6 4.2e-104
CCDS60538.1 JMJD1C gene_id:221037|Hs108|chr10      (2358) 1509 267.4 3.3e-70
CCDS41532.1 JMJD1C gene_id:221037|Hs108|chr10      (2540) 1509 267.4 3.5e-70
CCDS6023.1 HR gene_id:55806|Hs108|chr8             (1134)  397 79.2 6.9e-14


>>CCDS1990.1 KDM3A gene_id:55818|Hs108|chr2               (1321 aa)
 initn: 8980 init1: 8980 opt: 8980  Z-score: 8203.7  bits: 1530.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 8980; 99.9% identity (100.0% similar) in 1321 aa overlap (1-1321:1-1321)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MVLTLGESWPVLVGRRFLSLSAADGSDGSHDSWDVERVAEWPWLSGTIRAVSHTDVTKKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 MVLTLGESWPVLVGRRFLSLSAADGSDGSHDSWDVERVAEWPWLSGTIRAVSHTDVTKKD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD LKVCVEFDGESWRKRRWIEVYSLLRRAFLVEHNLVLAERKSPEISERIVQWPAITYKPLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 LKVCVEFDGESWRKRRWIEVYSLLRRAFLVEHNLVLAERKSPEISERIVQWPAITYKPLL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD DKAGLGSITSVRFLGDQQRVFLSKDLLKPIQDVNSLRLSLTDNQIVSKEFQALIVKHLDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 DKAGLGSITSVRFLGDQQRVFLSKDLLKPIQDVNSLRLSLTDNQIVSKEFQALIVKHLDE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD SHLLKGDKNLVGSEVKIYSLDPSTQWFSATVVNGNPASKTLQVNCEEIPALKIVDPSLIH
       :::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 SHLLKGDKNLVGSEVKIYSLDPSTQWFSATVINGNPASKTLQVNCEEIPALKIVDPSLIH
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD VEVVHDNLVTCGNSARIGAVKRKSSENNGTLVSKQAKSCSEASPSMCPVQSVPTTVFKEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 VEVVHDNLVTCGNSARIGAVKRKSSENNGTLVSKQAKSCSEASPSMCPVQSVPTTVFKEI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD LLGCTAATPPSKDPRQQSTPQAANSPPNLGAKIPQGCHKQSLPEEISSCLNTKSEALRTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 LLGCTAATPPSKDPRQQSTPQAANSPPNLGAKIPQGCHKQSLPEEISSCLNTKSEALRTK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD PDVCKAGLLSKSSQIGTGDLKILTEPKGSCTQPKTNTDQENRLESVPQALTGLPKECLPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 PDVCKAGLLSKSSQIGTGDLKILTEPKGSCTQPKTNTDQENRLESVPQALTGLPKECLPT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD KASSKAELEIANPPELQKHLEHAPSPSDVSNAPEVKAGVNSDSPNNCSGKKVEPSALACR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 KASSKAELEIANPPELQKHLEHAPSPSDVSNAPEVKAGVNSDSPNNCSGKKVEPSALACR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD SQNLKESSVKVDNESCCSRSNNKIQNAPSRKSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQDDSCVNIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 SQNLKESSVKVDNESCCSRSNNKIQNAPSRKSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQDDSCVNIV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD AQLPKCRECRLDSLRKDKEQQKDSPVFCRFFHFRRLQFNKHGVLRVEGFLTPNKYDNEAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 AQLPKCRECRLDSLRKDKEQQKDSPVFCRFFHFRRLQFNKHGVLRVEGFLTPNKYDNEAI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD GLWLPLTKNVVGIDLDTAKYILANIGDHFCQMVISEKEAMSTIEPHRQVAWKRAVKGVRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 GLWLPLTKNVVGIDLDTAKYILANIGDHFCQMVISEKEAMSTIEPHRQVAWKRAVKGVRE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD MCDVCDTTIFNLHWVCPRCGFGVCVDCYRMKRKNCQQGAAYKTFSWLKCVKSQIHEPENL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 MCDVCDTTIFNLHWVCPRCGFGVCVDCYRMKRKNCQQGAAYKTFSWLKCVKSQIHEPENL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD MPTQIIPGKALYDVGDIVHSVRAKWGIKANCPCSNRQFKLFSKPASKEDLKQTSLAGEKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 MPTQIIPGKALYDVGDIVHSVRAKWGIKANCPCSNRQFKLFSKPASKEDLKQTSLAGEKP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD TLGAVLQQNPSVLEPAAVGGEAASKPAGSMKPACPASTSPLNWLADLTSGNVNKENKEKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 TLGAVLQQNPSVLEPAAVGGEAASKPAGSMKPACPASTSPLNWLADLTSGNVNKENKEKQ
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD PTMPILKNEIKCLPPLPPLSKSSTVLHTFNSTILTPVSNNNSGFLRNLLNSSTGKTENGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 PTMPILKNEIKCLPPLPPLSKSSTVLHTFNSTILTPVSNNNSGFLRNLLNSSTGKTENGL
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD KNTPKILDDIFASLVQNKTTSDLSKRPQGLTIKPSILGFDTPHYWLCDNRLLCLQDPNNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 KNTPKILDDIFASLVQNKTTSDLSKRPQGLTIKPSILGFDTPHYWLCDNRLLCLQDPNNK
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD SNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHHKLNSELWKPESFRKEFGEQEVDLVNCRTNEIITGATV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 SNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHHKLNSELWKPESFRKEFGEQEVDLVNCRTNEIITGATV
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD GDFWDGFEDVPNRLKNEKEPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPSRFDDLMANIPLPEYTRRDGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 GDFWDGFEDVPNRLKNEKEPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPSRFDDLMANIPLPEYTRRDGK
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD LNLASRLPNYFVRPDLGPKMYNAYGLITPEDRKYGTTNLHLDVSDAANVMVYVGIPKGQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 LNLASRLPNYFVRPDLGPKMYNAYGLITPEDRKYGTTNLHLDVSDAANVMVYVGIPKGQC
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD EQEEEVLKTIQDGDSDELTIKRFIEGKEKPGALWHIYAAKDTEKIREFLKKVSEEQGQEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 EQEEEVLKTIQDGDSDELTIKRFIEGKEKPGALWHIYAAKDTEKIREFLKKVSEEQGQEN
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD PADHDPIHDQSWYLDRSLRKRLHQEYGVQGWAIVQFLGDVVFIPAGAPHQVHNLYSCIKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 PADHDPIHDQSWYLDRSLRKRLHQEYGVQGWAIVQFLGDVVFIPAGAPHQVHNLYSCIKV
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD AEDFVSPEHVKHCFWLTQEFRYLSQTHTNHEDKLQVKNVIYHAVKDAVAMLKASESSFGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 AEDFVSPEHVKHCFWLTQEFRYLSQTHTNHEDKLQVKNVIYHAVKDAVAMLKASESSFGK
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

        
pF1KSD P
       :
CCDS19 P
        

>>CCDS34242.1 KDM3B gene_id:51780|Hs108|chr5              (1761 aa)
 initn: 3606 init1: 1649 opt: 2173  Z-score: 1982.5  bits: 379.6 E(32554): 4.2e-104
Smith-Waterman score: 3530; 59.4% identity (79.9% similar) in 890 aa overlap (505-1320:871-1760)

          480       490       500       510         520       530  
pF1KSD SALACRSQNLKESSVKVDNESCCSRSNNKIQNAPSR--KSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQ
                                     ..:: .  .::: : .:.:::.:::: :.:
CCDS34 LMGKLGPNGERSAELLLGKSKGKQAPKGRPRTAPLKVGQSVLKDVSKVKKLKQSGEPFLQ
              850       860       870       880       890       900

            540       550       560        570       580       590 
pF1KSD DDSCVNIVAQLPKCRECRLDSLRKDKEQ-QKDSPVFCRFFHFRRLQFNKHGVLRVEGFLT
       : ::.:.. .: :::::::.  :: ::: : :: : ::::::::: :...:::::::::.
CCDS34 DGSCINVAPHLHKCRECRLERYRKFKEQEQDDSTVACRFFHFRRLIFTRKGVLRVEGFLS
              910       920       930       940       950       960

             600       610       620       630       640       650 
pF1KSD PNKYDNEAIGLWLPLTKNVVGIDLDTAKYILANIGDHFCQMVISEKEAMSTIEPHRQVAW
       :.. : .:..::.: .. . ::::.:.::::::.::.:::.:.::::::  .:::..:::
CCDS34 PQQSDPDAMNLWIPSSSLAEGIDLETSKYILANVGDQFCQLVMSEKEAMMMVEPHQKVAW
              970       980       990      1000      1010      1020

             660       670       680       690           700       
pF1KSD KRAVKGVREMCDVCDTTIFNLHWVCPRCGFGVCVDCYRMK----RKNCQQGAAYKTFSWL
       ::::.:::::::::.::.::.:::: .::::::.::::..    :.. .. .  ..::::
CCDS34 KRAVRGVREMCDVCETTLFNIHWVCRKCGFGVCLDCYRLRKSRPRSETEEMGDEEVFSWL
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

       710       720       730       740       750       760       
pF1KSD KCVKSQIHEPENLMPTQIIPGKALYDVGDIVHSVRAKWGIKANCPCSNRQFKLFSKPASK
       ::.:.: :::::::::::::: :::..::.::..:.:::::::::: .:: :   .::  
CCDS34 KCAKGQSHEPENLMPTQIIPGTALYNIGDMVHAARGKWGIKANCPCISRQNKSVLRPAVT
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

       770             780             790                  800    
pF1KSD EDLKQ------TSLAGEKPTLGA------VLQQNPSVL-----------EPAAVGGEAAS
       . ..:      .. .:.. :...      :   .:. .           ::  . . :..
CCDS34 NGMSQLPSINPSASSGNETTFSGGGGPAPVTTPEPDHVPKADSTDIRSEEPLKTDSSASN
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

            810       820          830       840       850         
pF1KSD KPA--GSMKPACPASTSP---LNWLADLTSGNVNKENKEKQPTMPILKNEIKCLPPLPPL
       . .   ...: :: .. :   :.:::::.. ....:.::      .:..: .    :  .
CCDS34 SNSELKAIRPPCPDTAPPSSALHWLADLATQKAKEETKEAGSLRSVLNKESHSPFGLDSF
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

     860           870       880          890                      
pF1KSD SKSSTVL----HTFNSTILTPVSNNNS---GFLRNLLNSSTGK-----------------
       .... :     . ::: .: :...::.   . ::.::.:. ::                 
CCDS34 NSTAKVSPLTPKLFNSLLLGPTASNNKTEGSSLRDLLHSGPGKLPQTPLDTGIPFPPVFS
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

          900          910       920       930            940      
pF1KSD -TENGLKNT---PKILDDIFASLVQNKTTSDLSKRPQGLT-----IKPSILGFD-----T
        .  :.:.    :..:: :.::.:.:: ::: :::  .::     .:  ..:..     :
CCDS34 TSSAGVKSKASLPNFLDHIIASVVENKKTSDASKRACNLTDTQKEVKEMVMGLNVLDPHT
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             950       960       970       980       990      1000 
pF1KSD PHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQPVMVSGVHHKLNSELWKPESFRKEFGE
        : ::::.:::::.::.::.::..:::::::::::.:::::.::.:::::::.: .:::.
CCDS34 SHSWLCDGRLLCLHDPSNKNNWKIFRECWKQGQPVLVSGVHKKLKSELWKPEAFSQEFGD
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

            1010      1020      1030       1040      1050      1060
pF1KSD QEVDLVNCRTNEIITGATVGDFWDGFEDVPNRLKNEK-EPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPS
       :.:::::::.  ::. . : ::::::: . .::..:  .::::::::::::::::::::.
CCDS34 QDVDLVNCRNCAIISDVKVRDFWDGFEIICKRLRSEDGQPMVLKLKDWPPGEDFRDMMPT
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1070      1080      1090      1100      1110      1120
pF1KSD RFDDLMANIPLPEYTRRDGKLNLASRLPNYFVRPDLGPKMYNAYGLITPEDRKYGTTNLH
       ::.::: :.::::::.:::.::::::::.::::::::::::::::::: :::. ::::::
CCDS34 RFEDLMENLPLPEYTKRDGRLNLASRLPSYFVRPDLGPKMYNAYGLITAEDRRVGTTNLH
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

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pF1KSD LDVSDAANVMVYVGIPKGQCEQEEEVLKTIQDGDSDELTIKRFIEGKEKPGALWHIYAAK
       ::::::.::::::::: :.  ..:::::::..::.::.: .:. .:::::::::::::::
CCDS34 LDVSDAVNVMVYVGIPIGEGAHDEEVLKTIDEGDADEVTKQRIHDGKEKPGALWHIYAAK
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

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pF1KSD DTEKIREFLKKVSEEQGQENPADHDPIHDQSWYLDRSLRKRLHQEYGVQGWAIVQFLGDV
       :.:::::.:.::.:::::::: :::::::::::::..:::::..:::::::::::::::.
CCDS34 DAEKIRELLRKVGEEQGQENPPDHDPIHDQSWYLDQTLRKRLYEEYGVQGWAIVQFLGDA
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1250      1260      1270      1280      1290      1300
pF1KSD VFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFWLTQEFRYLSQTHTNHEDKLQVKNVI
       :::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::.:::::::::::::.:
CCDS34 VFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFRLTQEFRHLSNTHTNHEDKLQVKNII
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1310      1320 
pF1KSD YHAVKDAVAMLKASESSFGKP
       ::::::::. ::: ::.... 
CCDS34 YHAVKDAVGTLKAHESKLARS
             1750      1760 

>--
 initn: 436 init1: 142 opt: 418  Z-score: 379.0  bits: 82.9 E(32554): 8.6e-15
Smith-Waterman score: 418; 25.3% identity (55.5% similar) in 510 aa overlap (13-484:9-503)

               10        20        30        40                50  
pF1KSD MVLTLGESWPVLVGRRFLSLSAADGSDGSHDSWDVERVAEWP--------WLSGTIRAVS
                   ::.:.: : :  ....: ..  .  ..  :        : .::.::.:
CCDS34     MADAAASPVGKRLLLLFADTAASASASAPAAAAASGDPGPALRTRAWRAGTVRAMS
                   10        20        30        40        50      

             60        70        80        90       100            
pF1KSD HTDVTKKDLKVCVEFDGESWRKRRWIEVYSLLRRAFLVEHNLVLAERKSPEISE----RI
          .. .:: . ::::: .:... :..:..    ..:.: .:: : :..: . .     :
CCDS34 --GAVPQDLAIFVEFDGCNWKQHSWVKVHAEEVIVLLLEGSLVWAPREDPVLLQGIRVSI
           60        70        80        90       100       110    

      110       120       130       140        150        160      
pF1KSD VQWPAITYKPLLDKAGLGSITSVRFLGDQQRVFLSK-DLLKPIQ-DVNSLRLSLTDNQIV
       .::::.:. ::.:: ::::.. :..: :..  :::  . :. .:  ..:    : ..  .
CCDS34 AQWPALTFTPLVDKLGLGSVVPVEYLLDRELRFLSDANGLHLFQMGTDSQNQILLEHAAL
          120       130       140       150       160       170    

        170       180       190       200       210       220      
pF1KSD SKEFQALIVKHLDESHLLKGDKNLVGSEVKIYSLDPSTQWFSATVVNGNPASKTLQVNCE
        .  .:::  .  .  . .:  .. : .::::. .    :. ..: . .  .. ..:.  
CCDS34 RETVNALISDQKLQEIFSRGPYSVQGHRVKIYQPEGEEGWLYGVVSHQDSITRLMEVSVT
          180       190       200       210       220       230    

        230       240       250       260        270       280     
pF1KSD EIPALKIVDPSLIHVEVVHDNLVTCGNSARIGAVKR-KSSENNGTLVSKQAKSCSEASPS
       :   .: ::: :::: .. :: .  .... . :::  :....  .. .:...  . :: :
CCDS34 ESGEIKSVDPRLIHV-MLMDNSAPQSEGGTLKAVKSSKGKKKRESIEGKDGRRRKSASDS
          240        250       260       270       280       290   

          290       300           310       320          330       
pF1KSD MC-PVQSVPTTVFKEILL----GCTAATPPSKDPRQQSTP---QAANSPPNLGAKIPQGC
        : :...       :.      :  :.  : :    .. :   : :..::.  . .::  
CCDS34 GCDPASKKLKGDRGEVDSNGSDGGEASRGPWKGGNASGEPGLDQRAKQPPS--TFVPQI-
           300       310       320       330       340         350 

       340       350       360         370       380       390     
pF1KSD HKQSLPEEISSCLNTKSEALRTKP--DVCKAGLLSKSSQIGTGDLKILTEPKGSCTQPKT
        ....     .  : .. ... .:      :..   :.  .::.  .  :  :.      
CCDS34 -NRNIRFATYTKENGRTLVVQDEPVGGDTPASFTPYST--ATGQTPLAPEVGGA-----E
               360       370       380         390       400       

         400       410       420       430              440        
pF1KSD NTDQENRLESVPQALTGLPKECLPTKASSKAELEIANP-------PELQKHLEHAPSPSD
       : .  . ::.: :....     . : .:.   ..:..        :: ::  .   :  .
CCDS34 NKEAGKTLEQVGQGIVA-SAAVVTTASSTPNTVRISDTGLAAGTVPEKQKGSRSQASGEN
            410        420       430       440       450       460 

      450       460             470       480       490       500  
pF1KSD VSNAPEVKAGVNSDSPNNC------SGKKVEPSALACRSQNLKESSVKVDNESCCSRSNN
         :.  ...: ..  :..       ::..   ..:: ... :                  
CCDS34 SRNSILASSGFGAPLPSSSQPLTFGSGRSQSNGVLATENKPLGFSFGCSSAQEAQKDTDL
             470       480       490       500       510       520 

            510       520       530       540       550       560  
pF1KSD KIQNAPSRKSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQDDSCVNIVAQLPKCRECRLDSLRKDKEQQK
                                                                   
CCDS34 SKNLFFQCMSQTLPTSNYFTTVSESLADDSSSRDSFKQSLESLSSGLCKGRSVLGTDTKP
             530       540       550       560       570       580 

>>CCDS60538.1 JMJD1C gene_id:221037|Hs108|chr10           (2358 aa)
 initn: 2315 init1: 756 opt: 1509  Z-score: 1373.9  bits: 267.4 E(32554): 3.3e-70
Smith-Waterman score: 2598; 41.7% identity (71.3% similar) in 1027 aa overlap (363-1315:1341-2349)

            340       350       360       370       380            
pF1KSD IPQGCHKQSLPEEISSCLNTKSEALRTKPDVCKAGLLSKSSQIGTGDLKILTEP------
                                     .:..  ..:....:.:. .  ..:      
CCDS60 QYKSSNASETEPNAIKNQTLSASLPLDSTVICST--INKANSVGNGQASQTSQPNYHTKL
             1320      1330      1340        1350      1360        

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pF1KSD -KGSCTQPKTNTDQENRLESVPQALTGLPKEC---LPTKASSKAELEIANPPELQKHLEH
        :.  :. . .  . :..:.  .... . : :   : ...::  .  . .   ..:... 
CCDS60 KKAWLTRHSEEDKNTNKMENSGNSVSEIIKPCSVNLIASTSSDIQNSVDSKIIVDKYVKD
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pF1KSD APSPSDVSNAPEVKAGVNSDSPNNCSGK----KVEPSALACRSQN-LKESSVKVDNE---
              ..    ... ..:: .. : .    : .:.    ..:: :.. . .....   
CCDS60 DKVNRRKAKRTYESGSESGDSDESESKSEQRTKRQPKPTYKKKQNDLQKRKGEIEEDLKP
     1430      1440      1450      1460      1470      1480        

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pF1KSD ------SCCSRSNNKIQNAPSR---KSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQDDSCVNIVAQLPK
             :   ::. :.:.  .    .::: :  :.:::.:.::.:.::::: .:  .: :
CCDS60 NGVLSRSAKERSKLKLQSNSNTGIPRSVLKDWRKVKKLKQTGESFLQDDSCCEIGPNLQK
     1490      1500      1510      1520      1530      1540        

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pF1KSD CRECRLDSLRKDK-EQQKDSPVFCRFFHFRRLQFNKHGVLRVEGFLTPNKYDNEAIGLWL
       ::::::  .:. : :.   :::::::..::::.:.:.::.:..:: .:..::.::..:: 
CCDS60 CRECRL--IRSKKGEEPAHSPVFCRFYYFRRLSFSKNGVVRIDGFSSPDQYDDEAMSLWT
     1550        1560      1570      1580      1590      1600      

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pF1KSD PLTKNVVGIDLDTAKYILANIGDHFCQMVISEKEAMSTIEPHRQVAWKRAVKGVREMCDV
         . .   .:..:.::::  :::.:::.: ::: :.: ..   ..::::::.:::::::.
CCDS60 HENFEDDELDIETSKYILDIIGDKFCQLVTSEKTALSWVKKDAKIAWKRAVRGVREMCDA
       1610      1620      1630      1640      1650      1660      

          670       680       690       700       710       720    
pF1KSD CDTTIFNLHWVCPRCGFGVCVDCYRMKRKNCQQGAAYKTFSWLKCVKSQIHEPENLMPTQ
       :..:.::.:::: .::: ::.:::. :... ..    . ..:.::::.: :. ..:::::
CCDS60 CEATLFNIHWVCQKCGFVVCLDCYKAKERKSSRDK--ELYAWMKCVKGQPHDHKHLMPTQ
       1670      1680      1690      1700        1710      1720    

          730       740       750        760         770        780
pF1KSD IIPGKALYDVGDIVHSVRAKWGIKANCPCSNRQ-FKLFSKPASK--EDLKQTSLA-GEKP
       ::::..: :. : .:..: :.:::..: :.:.: ... . :. .   .. :. :  ..: 
CCDS60 IIPGSVLTDLLDAMHTLREKYGIKSHCHCTNKQNLQVGNFPTMNGVSQVLQNVLNHSNKI
         1730      1740      1750      1760      1770      1780    

                 790       800        810       820       830      
pF1KSD TL--GAVLQQN-PSVLEPAAVGGEAASKPAGS-MKPACPASTSPLNWLADLTSGNVNKEN
       .:      ::: :   :    :: .  . .:.  : . : : :::.:::::.  .. .:.
CCDS60 SLCMPESQQQNTPPKSEKN--GGSSPESDVGTDNKLTPPESQSPLHWLADLAEQKAREEK
         1790      1800        1810      1820      1830      1840  

        840       850       860       870       880       890      
pF1KSD KEKQPTMPILKNEIKCLPPLPPLSKSSTVLHTFNSTILTPVSNNNSGFLRNLLNSSTGK-
       ::..     :.:.::         ....   .  .. :.  .:.... ::.::....:: 
CCDS60 KENKEL--TLENQIK-----EEREQDNSESPNGRTSPLVSQNNEQGSTLRDLLTTTAGKL
             1850           1860      1870      1880      1890     

             900                       910           920       930 
pF1KSD ----TENGL----------------KNTPKILDDIFASLVQNKT----TSDLSKRPQGLT
           :. :.                .. :.:::::.::.:.::     :: .. .:. : 
CCDS60 RVGSTDAGIAFAPVYSMGAPSSKSGRTMPNILDDIIASVVENKIPPSKTSKINVKPE-LK
        1900      1910      1920      1930      1940      1950     

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pF1KSD IKP--SILGF---------DTPHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQPVMVSG
        .:  ::..          : :: :.:....: :.: .:.:::..:.::::::::..:::
CCDS60 EEPEESIISAVDENNKLYSDIPHSWICEKHILWLKDYKNSSNWKLFKECWKQGQPAVVSG
         1960      1970      1980      1990      2000      2010    

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pF1KSD VHHKLNSELWKPESFRKEFGEQEVDLVNCRTNEIITGATVGDFWDGFEDVPNRLKNEK-E
       ::.:.:  ::: ::.  .::....::.::. . ::..:.: .::::::.: .: ::.. :
CCDS60 VHKKMNISLWKAESISLDFGDHQADLLNCK-DSIISNANVKEFWDGFEEVSKRQKNKSGE
         2020      2030      2040       2050      2060      2070   

    1040      1050      1060      1070      1080      1090         
pF1KSD PMVLKLKDWPPGEDFRDMMPSRFDDLMANIPLPEYTRRDGKLNLASRLPNYFVRPDLGPK
        .:::::::: ::::. :::.:..::. ..:::::   .::.::::.::..::::::::.
CCDS60 TVVLKLKDWPSGEDFKTMMPARYEDLLKSLPLPEYCNPEGKFNLASHLPGFFVRPDLGPR
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pF1KSD MYNAYGLITPEDRKYGTTNLHLDVSDAANVMVYVGIPKGQ-CEQEEEVLKTIQDGDSDEL
       . .:::... .:.  ::::::..:::..:..::::: ::.   ..  .:: ... : :..
CCDS60 LCSAYGVVAAKDHDIGTTNLHIEVSDVVNILVYVGIAKGNGILSKAGILKKFEEEDLDDI
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pF1KSD TIKRFIEGKEKPGALWHIYAAKDTEKIREFLKKVSEEQGQENPADHDPIHDQSWYLDRSL
         ::. ...: :::::::::.::..::::::.:.:.::: :   .::::.:::::....:
CCDS60 LRKRLKDSSEIPGALWHIYAGKDVDKIREFLQKISKEQGLEVLPEHDPIRDQSWYVNKKL
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pF1KSD RKRLHQEYGVQGWAIVQFLGDVVFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFWLTQ
       :.:: .::::.  ...:::::.. .:::: :::.:..:::.:.::::::::. . : :::
CCDS60 RQRLLEEYGVRTCTLIQFLGDAIVLPAGALHQVQNFHSCIQVTEDFVSPEHLVESFHLTQ
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pF1KSD EFRYLSQTHTNHEDKLQVKNVIYHAVKDAVAMLKASESSFGKP   
       :.: :.. . :..:::::::..:::::. :  ::  :         
CCDS60 ELRLLKE-EINYDDKLQVKNILYHAVKEMVRALKIHEDEVEDMEEN
          2320       2330      2340      2350        

>>CCDS41532.1 JMJD1C gene_id:221037|Hs108|chr10           (2540 aa)
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pF1KSD IPQGCHKQSLPEEISSCLNTKSEALRTKPDVCKAGLLSKSSQIGTGDLKILTEP------
                                     .:..  ..:....:.:. .  ..:      
CCDS41 QYKSSNASETEPNAIKNQTLSASLPLDSTVICST--INKANSVGNGQASQTSQPNYHTKL
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pF1KSD -KGSCTQPKTNTDQENRLESVPQALTGLPKEC---LPTKASSKAELEIANPPELQKHLEH
        :.  :. . .  . :..:.  .... . : :   : ...::  .  . .   ..:... 
CCDS41 KKAWLTRHSEEDKNTNKMENSGNSVSEIIKPCSVNLIASTSSDIQNSVDSKIIVDKYVKD
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pF1KSD APSPSDVSNAPEVKAGVNSDSPNNCSGK----KVEPSALACRSQN-LKESSVKVDNE---
              ..    ... ..:: .. : .    : .:.    ..:: :.. . .....   
CCDS41 DKVNRRKAKRTYESGSESGDSDESESKSEQRTKRQPKPTYKKKQNDLQKRKGEIEEDLKP
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pF1KSD ------SCCSRSNNKIQNAPSR---KSVLTDPAKLKKLQQSGEAFVQDDSCVNIVAQLPK
             :   ::. :.:.  .    .::: :  :.:::.:.::.:.::::: .:  .: :
CCDS41 NGVLSRSAKERSKLKLQSNSNTGIPRSVLKDWRKVKKLKQTGESFLQDDSCCEIGPNLQK
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pF1KSD CRECRLDSLRKDK-EQQKDSPVFCRFFHFRRLQFNKHGVLRVEGFLTPNKYDNEAIGLWL
       ::::::  .:. : :.   :::::::..::::.:.:.::.:..:: .:..::.::..:: 
CCDS41 CRECRL--IRSKKGEEPAHSPVFCRFYYFRRLSFSKNGVVRIDGFSSPDQYDDEAMSLWT
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pF1KSD PLTKNVVGIDLDTAKYILANIGDHFCQMVISEKEAMSTIEPHRQVAWKRAVKGVREMCDV
         . .   .:..:.::::  :::.:::.: ::: :.: ..   ..::::::.:::::::.
CCDS41 HENFEDDELDIETSKYILDIIGDKFCQLVTSEKTALSWVKKDAKIAWKRAVRGVREMCDA
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pF1KSD CDTTIFNLHWVCPRCGFGVCVDCYRMKRKNCQQGAAYKTFSWLKCVKSQIHEPENLMPTQ
       :..:.::.:::: .::: ::.:::. :... ..    . ..:.::::.: :. ..:::::
CCDS41 CEATLFNIHWVCQKCGFVVCLDCYKAKERKSSRDK--ELYAWMKCVKGQPHDHKHLMPTQ
     1850      1860      1870      1880        1890      1900      

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pF1KSD IIPGKALYDVGDIVHSVRAKWGIKANCPCSNRQ-FKLFSKPASK--EDLKQTSLA-GEKP
       ::::..: :. : .:..: :.:::..: :.:.: ... . :. .   .. :. :  ..: 
CCDS41 IIPGSVLTDLLDAMHTLREKYGIKSHCHCTNKQNLQVGNFPTMNGVSQVLQNVLNHSNKI
       1910      1920      1930      1940      1950      1960      

                 790       800        810       820       830      
pF1KSD TL--GAVLQQN-PSVLEPAAVGGEAASKPAGS-MKPACPASTSPLNWLADLTSGNVNKEN
       .:      ::: :   :    :: .  . .:.  : . : : :::.:::::.  .. .:.
CCDS41 SLCMPESQQQNTPPKSEKN--GGSSPESDVGTDNKLTPPESQSPLHWLADLAEQKAREEK
       1970      1980        1990      2000      2010      2020    

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pF1KSD KEKQPTMPILKNEIKCLPPLPPLSKSSTVLHTFNSTILTPVSNNNSGFLRNLLNSSTGK-
       ::..     :.:.::         ....   .  .. :.  .:.... ::.::....:: 
CCDS41 KENKEL--TLENQIK-----EEREQDNSESPNGRTSPLVSQNNEQGSTLRDLLTTTAGKL
         2030             2040      2050      2060      2070       

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pF1KSD ----TENGL----------------KNTPKILDDIFASLVQNKT----TSDLSKRPQGLT
           :. :.                .. :.:::::.::.:.::     :: .. .:. : 
CCDS41 RVGSTDAGIAFAPVYSMGAPSSKSGRTMPNILDDIIASVVENKIPPSKTSKINVKPE-LK
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pF1KSD IKP--SILGF---------DTPHYWLCDNRLLCLQDPNNKSNWNVFRECWKQGQPVMVSG
        .:  ::..          : :: :.:....: :.: .:.:::..:.::::::::..:::
CCDS41 EEPEESIISAVDENNKLYSDIPHSWICEKHILWLKDYKNSSNWKLFKECWKQGQPAVVSG
       2140      2150      2160      2170      2180      2190      

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pF1KSD VHHKLNSELWKPESFRKEFGEQEVDLVNCRTNEIITGATVGDFWDGFEDVPNRLKNEK-E
       ::.:.:  ::: ::.  .::....::.::. . ::..:.: .::::::.: .: ::.. :
CCDS41 VHKKMNISLWKAESISLDFGDHQADLLNCK-DSIISNANVKEFWDGFEEVSKRQKNKSGE
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pF1KSD PMVLKLKDWPPGEDFRDMMPSRFDDLMANIPLPEYTRRDGKLNLASRLPNYFVRPDLGPK
        .:::::::: ::::. :::.:..::. ..:::::   .::.::::.::..::::::::.
CCDS41 TVVLKLKDWPSGEDFKTMMPARYEDLLKSLPLPEYCNPEGKFNLASHLPGFFVRPDLGPR
        2260      2270      2280      2290      2300      2310     

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pF1KSD MYNAYGLITPEDRKYGTTNLHLDVSDAANVMVYVGIPKGQ-CEQEEEVLKTIQDGDSDEL
       . .:::... .:.  ::::::..:::..:..::::: ::.   ..  .:: ... : :..
CCDS41 LCSAYGVVAAKDHDIGTTNLHIEVSDVVNILVYVGIAKGNGILSKAGILKKFEEEDLDDI
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pF1KSD TIKRFIEGKEKPGALWHIYAAKDTEKIREFLKKVSEEQGQENPADHDPIHDQSWYLDRSL
         ::. ...: :::::::::.::..::::::.:.:.::: :   .::::.:::::....:
CCDS41 LRKRLKDSSEIPGALWHIYAGKDVDKIREFLQKISKEQGLEVLPEHDPIRDQSWYVNKKL
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pF1KSD RKRLHQEYGVQGWAIVQFLGDVVFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFWLTQ
       :.:: .::::.  ...:::::.. .:::: :::.:..:::.:.::::::::. . : :::
CCDS41 RQRLLEEYGVRTCTLIQFLGDAIVLPAGALHQVQNFHSCIQVTEDFVSPEHLVESFHLTQ
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pF1KSD EFRYLSQTHTNHEDKLQVKNVIYHAVKDAVAMLKASESSFGKP   
       :.: :.. . :..:::::::..:::::. :  ::  :         
CCDS41 ELRLLKE-EINYDDKLQVKNILYHAVKEMVRALKIHEDEVEDMEEN
        2500       2510      2520      2530      2540

>--
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pF1KSD MVLTLGESWPVLVGRRFLSLSAADGSDGSHDSWDVERVAEW-PWLSGTIRAVSHTDVTKK
             :.   :::.::: ....:  ..  . :.  :   :  : .:.:::::: :  . 
CCDS41    MAVETRAELVGKRFLCVAVGD--EARSERWESGR--GWRSWRAGVIRAVSHRDSRNP
                  10        20          30          40        50   

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pF1KSD DLKVCVEFDGESWRKRRWIEVYSLLRRAFLVEHNLVLAERKSPEISE----RIVQWPAIT
       :: : ::::   : ::.:..::  .  .::::..:. :.:..:  ..    . .::::.:
CCDS41 DLAVYVEFDDLEWDKREWVKVYEDFS-TFLVEYHLIWAKRNDPSQTQGSKSKQIQWPALT
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pF1KSD YKPLLDKAGLGSITSVRFLGDQQRVFLSKD-LLKPIQD-VNSLRLSLTDNQIVSKEFQAL
       .:::...   .:.:.:.:: :.:  ::..:  ..: :: ..::   : ::  . .: .. 
CCDS41 FKPLVERNIPSSVTAVEFLVDKQLDFLTEDSAFQPYQDDIDSLNPVLRDNPQLHEEVKVW
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pF1KSD IVKHLDESHLLKGDKNLVGSEVKIYSLDPSTQWFSATVVNGNPASKTLQVNCEEIPALKI
       . ..  .  ...:  .: : .:..:  : .::::.. ... .  ..:. :  ...   . 
CCDS41 VKEQKVQEIFMQGPYSLNGYRVRVYRQDSATQWFTGIITHHDLFTRTMIVMNDQVLEPQN
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pF1KSD VDPSLIHVEVVHDNLVTCGNSARIGAVKRKSSENNGTLVSKQAKSCSEASPSMCPVQSVP
       ::::....  . : . .  ..  :: ..:. :. : .. . ...     . :  :...  
CCDS41 VDPSMVQMTFLDDVVHSLLKGENIGITSRRRSRANQNVNAVHSHYTRAQANSPRPAMNSQ
            240       250       260       270       280       290  

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pF1KSD TTVFKEIL---LGCTAATPPSKDPRQQSTPQAANSPPNLGAKI-----PQGCHKQSL---
       ..: :.         .  : ..   ..: :.  .   .    :     :.: .:. .   
CCDS41 AAVPKQNTHQQQQQRSIRPNKRKGSDSSIPDEEKMKEEKYDYISRGENPKGKNKHLMNKR
            300       310       320       330       340       350  

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pF1KSD --PEEISSCLNTKSEALRTKPDVCKAGLLSKSSQIGTGDLKILTEPKGSCTQPKTNTDQE
         :::  . :: :    : . :  ... .:.::.  ... .:.     . .. : ... .
CCDS41 RKPEEDEKKLNMK----RLRTD--NVSDFSESSDSENSNKRIID----NSSEQKPENELK
            360           370         380       390           400  

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pF1KSD NRLESVPQALTGLPKECLPTKASSKAELEIANPP--ELQKHLEHAPSPSDVSNAPEVKAG
       :.  :  ..  : :..   .. ...  :. ..::  ..:.  .:  .        : . .
CCDS41 NKNTSKINGEEGKPHN---NEKAGEETLKNSQPPWDQIQEDKKHEEA--------EKRKS
            410          420       430       440               450 

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pF1KSD VNSDSPNNCSGKKVEPSALACRSQNLKESSVKVDNESCCSRSNNKIQNAPSRKSVLTDPA
       :...  ..   .. : :... ...:       .  . :   ... ..  :..: :   :.
CCDS41 VDTQLQEDMIIHSSEQSTVSDHNSN------DLLPQECNMDKTHTMELLPKEKFVSRPPT
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           ..      . .:. .. :::  .     :..:.:   . .::              
CCDS41 PKCVID------ITNDTNLEKVAQ-ENSSTFGLQTLQKMDPNVSDS--------------
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        ::..  .. ::   : :..    :.   ..:: .::  ..   :. :.   .:   :::
CCDS41 -KHSIANAK-FLETAKKDSDQS--WV---SDVVKVDLTQSSVTNASSGNDHLNM---EKE
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         .: : :   :.                                               
CCDS41 KYVSYISPLSAVSVMEDKLHKRSPPPETIKSKLNTSVDTHKIKSSPSPEVVKPKITHSPD
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        :. .:  ..   .  .     :. : :       :.:   :    . :..: ::     
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         ::.....: .:.    .  .:   . ..     :.....:  . :..  : .... ..
CCDS60 --EVQGAMGSPAPK----RPPDPFPGTAEQGAGGWQEVRDTS--IGNKDVDSGQHDEQKG
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CCDS60 -------EGLWSPGSQVSTVWHVFRAQDAQRIRRFLQMVQGLVSTVSVTQHFLSP-ETSA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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