Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0738
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0738, 921 aa
  1>>>pF1KSDA0738 921 - 921 aa - 921 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6332+/-0.000961; mu= 18.8287+/- 0.057
 mean_var=65.7490+/-13.339, 0's: 0 Z-trim(104.5): 19  B-trim: 3 in 1/49
 Lambda= 0.158172
 statistics sampled from 7942 (7948) to 7942 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.606), E-opt: 0.2 (0.244), width:  16
 Scan time:  4.450

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5886.1 TCAF1 gene_id:9747|Hs108|chr7           ( 921) 6284 1443.5       0
CCDS56514.1 TCAF1 gene_id:9747|Hs108|chr7          ( 919) 6264 1438.9       0
CCDS34769.1 TCAF2 gene_id:285966|Hs108|chr7        ( 845) 3700 853.8       0
CCDS47735.2 TCAF2 gene_id:285966|Hs108|chr7        ( 815) 1934 450.8 4.8e-126


>>CCDS5886.1 TCAF1 gene_id:9747|Hs108|chr7                (921 aa)
 initn: 6284 init1: 6284 opt: 6284  Z-score: 7740.2  bits: 1443.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6284; 99.9% identity (100.0% similar) in 921 aa overlap (1-921:1-921)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MATPSAAFEALMNGVTSWDVPEDAVPCELLLIGEASFPVMVNDMGQVLIAASSYGRGRLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MATPSAAFEALMNGVTSWDVPEDAVPCELLLIGEASFPVMVNDMGQVLIAASSYGRGRLV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD VVSHEDYLVEAQLTPFLLNAVGWLCSSPGAPIGVHPSLAPLAKILEGSGVDAKVEPEVKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VVSHEDYLVEAQLTPFLLNAVGWLCSSPGAPIGVHPSLAPLAKILEGSGVDAKVEPEVKD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD SLGVYCIDAYNETMTEKLVKFMKCGGGLLIGGQAWDWANQGEDERVLFTFPGNLVTSVAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SLGVYCIDAYNETMTEKLVKFMKCGGGLLIGGQAWDWANQGEDERVLFTFPGNLVTSVAG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD IYFTDNKGDTSFFKVSKKMPKIPVLVSCEDDLSDDREELLHGISELDISNSDCFPSQLLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IYFTDNKGDTSFFKVSKKMPKIPVLVSCEDDLSDDREELLHGISELDISNSDCFPSQLLV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD HGALAFPLGLDSYHGCVIAAARYGRGRVVVTGHKVLFTVGKLGPFLLNAVRWLDGGRRGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HGALAFPLGLDSYHGCVIAAARYGRGRVVVTGHKVLFTVGKLGPFLLNAVRWLDGGRRGK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD IVVQTELRTLSGLLAVGGIDTSIEPNLTSDASVYCFEPVSEVGVKELQEFVAEGGGLFVG
       .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VVVQTELRTLSGLLAVGGIDTSIEPNLTSDASVYCFEPVSEVGVKELQEFVAEGGGLFVG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD AQAWWWAFKNPGVSPLARFPGNLLLNPFGISITSQSLNPGPFRTPKAGIRTYHFRSTLAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AQAWWWAFKNPGVSPLARFPGNLLLNPFGISITSQSLNPGPFRTPKAGIRTYHFRSTLAE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD FQVIMGRKRGNVEKGWLAKLGPDGAAFLQIPAEEIPAYMSVHRLLRKLLSRYRLPVATRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FQVIMGRKRGNVEKGWLAKLGPDGAAFLQIPAEEIPAYMSVHRLLRKLLSRYRLPVATRE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD NPVINDCCRGAMLSLATGLAHSGSDLSLLVPEIEDMYSSPYLRPSESPITVEVNCTNPGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NPVINDCCRGAMLSLATGLAHSGSDLSLLVPEIEDMYSSPYLRPSESPITVEVNCTNPGT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD RYCWMSTGLYIPGRQIIEVSLPEAAASADLKIQIGCHTDDLTRASKLFRGPLVINRCCLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RYCWMSTGLYIPGRQIIEVSLPEAAASADLKIQIGCHTDDLTRASKLFRGPLVINRCCLD
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD KPTKSITCLWGGLLYIIVPQNSKLGSVPVTVKGAVHAPYYKLGETTLEEWKRRIQENPGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KPTKSITCLWGGLLYIIVPQNSKLGSVPVTVKGAVHAPYYKLGETTLEEWKRRIQENPGP
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD WGELATDNIILTVPTANLRTLENPEPLLRLWDEVMQAVARLGAEPFPLRLPQRIVADVQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 WGELATDNIILTVPTANLRTLENPEPLLRLWDEVMQAVARLGAEPFPLRLPQRIVADVQI
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD SVGWMHAGYPIMCHLESVQELINEKLIRTKGLWGPVHELGRNQQRQEWEFPPHTTEATCN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SVGWMHAGYPIMCHLESVQELINEKLIRTKGLWGPVHELGRNQQRQEWEFPPHTTEATCN
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD LWCVYVHETVLGIPRSRANIALWPPVREKRVRIYLSKGPNVKNWNAWTALETYLQLQEAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LWCVYVHETVLGIPRSRANIALWPPVREKRVRIYLSKGPNVKNWNAWTALETYLQLQEAF
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD GWEPFIRLFTEYRNQTNLPTENVDKMNLWVKMFSHQVQKNLAPFFEAWAWPIQKEVATSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GWEPFIRLFTEYRNQTNLPTENVDKMNLWVKMFSHQVQKNLAPFFEAWAWPIQKEVATSL
              850       860       870       880       890       900

              910       920 
pF1KSD AYLPEWKENIMKLYLLTQMPH
       :::::::::::::::::::::
CCDS58 AYLPEWKENIMKLYLLTQMPH
              910       920 

>>CCDS56514.1 TCAF1 gene_id:9747|Hs108|chr7               (919 aa)
 initn: 6264 init1: 6264 opt: 6264  Z-score: 7715.5  bits: 1438.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6264; 99.9% identity (100.0% similar) in 919 aa overlap (1-919:1-919)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MATPSAAFEALMNGVTSWDVPEDAVPCELLLIGEASFPVMVNDMGQVLIAASSYGRGRLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MATPSAAFEALMNGVTSWDVPEDAVPCELLLIGEASFPVMVNDMGQVLIAASSYGRGRLV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD VVSHEDYLVEAQLTPFLLNAVGWLCSSPGAPIGVHPSLAPLAKILEGSGVDAKVEPEVKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VVSHEDYLVEAQLTPFLLNAVGWLCSSPGAPIGVHPSLAPLAKILEGSGVDAKVEPEVKD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD SLGVYCIDAYNETMTEKLVKFMKCGGGLLIGGQAWDWANQGEDERVLFTFPGNLVTSVAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SLGVYCIDAYNETMTEKLVKFMKCGGGLLIGGQAWDWANQGEDERVLFTFPGNLVTSVAG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD IYFTDNKGDTSFFKVSKKMPKIPVLVSCEDDLSDDREELLHGISELDISNSDCFPSQLLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IYFTDNKGDTSFFKVSKKMPKIPVLVSCEDDLSDDREELLHGISELDISNSDCFPSQLLV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD HGALAFPLGLDSYHGCVIAAARYGRGRVVVTGHKVLFTVGKLGPFLLNAVRWLDGGRRGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 HGALAFPLGLDSYHGCVIAAARYGRGRVVVTGHKVLFTVGKLGPFLLNAVRWLDGGRRGK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD IVVQTELRTLSGLLAVGGIDTSIEPNLTSDASVYCFEPVSEVGVKELQEFVAEGGGLFVG
       .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VVVQTELRTLSGLLAVGGIDTSIEPNLTSDASVYCFEPVSEVGVKELQEFVAEGGGLFVG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD AQAWWWAFKNPGVSPLARFPGNLLLNPFGISITSQSLNPGPFRTPKAGIRTYHFRSTLAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 AQAWWWAFKNPGVSPLARFPGNLLLNPFGISITSQSLNPGPFRTPKAGIRTYHFRSTLAE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD FQVIMGRKRGNVEKGWLAKLGPDGAAFLQIPAEEIPAYMSVHRLLRKLLSRYRLPVATRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 FQVIMGRKRGNVEKGWLAKLGPDGAAFLQIPAEEIPAYMSVHRLLRKLLSRYRLPVATRE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD NPVINDCCRGAMLSLATGLAHSGSDLSLLVPEIEDMYSSPYLRPSESPITVEVNCTNPGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 NPVINDCCRGAMLSLATGLAHSGSDLSLLVPEIEDMYSSPYLRPSESPITVEVNCTNPGT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD RYCWMSTGLYIPGRQIIEVSLPEAAASADLKIQIGCHTDDLTRASKLFRGPLVINRCCLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RYCWMSTGLYIPGRQIIEVSLPEAAASADLKIQIGCHTDDLTRASKLFRGPLVINRCCLD
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD KPTKSITCLWGGLLYIIVPQNSKLGSVPVTVKGAVHAPYYKLGETTLEEWKRRIQENPGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KPTKSITCLWGGLLYIIVPQNSKLGSVPVTVKGAVHAPYYKLGETTLEEWKRRIQENPGP
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD WGELATDNIILTVPTANLRTLENPEPLLRLWDEVMQAVARLGAEPFPLRLPQRIVADVQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 WGELATDNIILTVPTANLRTLENPEPLLRLWDEVMQAVARLGAEPFPLRLPQRIVADVQI
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD SVGWMHAGYPIMCHLESVQELINEKLIRTKGLWGPVHELGRNQQRQEWEFPPHTTEATCN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SVGWMHAGYPIMCHLESVQELINEKLIRTKGLWGPVHELGRNQQRQEWEFPPHTTEATCN
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD LWCVYVHETVLGIPRSRANIALWPPVREKRVRIYLSKGPNVKNWNAWTALETYLQLQEAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LWCVYVHETVLGIPRSRANIALWPPVREKRVRIYLSKGPNVKNWNAWTALETYLQLQEAF
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD GWEPFIRLFTEYRNQTNLPTENVDKMNLWVKMFSHQVQKNLAPFFEAWAWPIQKEVATSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GWEPFIRLFTEYRNQTNLPTENVDKMNLWVKMFSHQVQKNLAPFFEAWAWPIQKEVATSL
              850       860       870       880       890       900

              910       920 
pF1KSD AYLPEWKENIMKLYLLTQMPH
       :::::::::::::::::::  
CCDS56 AYLPEWKENIMKLYLLTQM  
              910           

>>CCDS34769.1 TCAF2 gene_id:285966|Hs108|chr7             (845 aa)
 initn: 3697 init1: 2682 opt: 3700  Z-score: 4554.0  bits: 853.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3700; 64.5% identity (84.3% similar) in 837 aa overlap (1-836:1-836)

                10        20        30        40        50         
pF1KSD MAT-PSAAFEALMNGVTSWDVPEDAVPCELLLIGEASFPVMVNDMGQVLIAASSYGRGRL
       :::  .:::::::.::: ::::.  .: ::::::::.::::::: :::::::::::::::
CCDS34 MATIAAAAFEALMDGVTCWDVPRGPIPSELLLIGEAAFPVMVNDKGQVLIAASSYGRGRL
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KSD VVVSHEDYLVEAQLTPFLLNAVGWLCSSPGAPIGVHPSLAPLAKILEGSGVDAKVEPEVK
       :::::: :: .. :.:::::::.:::  ::::.:::::::::..::. .:..:.:.::  
CCDS34 VVVSHEGYLSHTGLAPFLLNAVSWLCPCPGAPVGVHPSLAPLVNILQDAGLEAQVKPEPG
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KSD DSLGVYCIDAYNETMTEKLVKFMKCGGGLLIGGQAWDWANQGEDERVLFTFPGNLVTSVA
       . ::::::.:::.:.:  :..:.: ::::::::::: ::.:   ..::  :::: :::::
CCDS34 EPLGVYCINAYNDTLTATLIQFVKHGGGLLIGGQAWYWASQHGPDKVLSRFPGNKVTSVA
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD GIYFTDNKGDTSFFKVSKKMPKIPVLVSCEDDLSDDREELLHGISELDISNSDCFPSQLL
       :.::::. :: . ::::::.::::. :   .:. .:...::.::::::: ..   :::::
CCDS34 GVYFTDTYGDRDRFKVSKKVPKIPLHVRYGEDVRQDQQQLLEGISELDIRTGGV-PSQLL
              190       200       210       220       230          

     240       250       260       270       280       290         
pF1KSD VHGALAFPLGLDSYHGCVIAAARYGRGRVVVTGHKVLFTVGKLGPFLLNAVRWLDGGRRG
       ::::::::::::.  .: .:::.:::::::...:. :. . :.:::::::::::  :. :
CCDS34 VHGALAFPLGLDASLNCFLAAAHYGRGRVVLAAHECLLCAPKMGPFLLNAVRWLARGQTG
     240       250       260       270       280       290         

     300       310       320       330       340       350         
pF1KSD KIVVQTELRTLSGLLAVGGIDTSIEPNLTSDASVYCFEPVSEVGVKELQEFVAEGGGLFV
       :. :.:.:. :  ::.  :.. :.::.:.::  ::: .  :.  .:.:::::::::::..
CCDS34 KVGVNTNLKDLCPLLSEHGLQCSLEPHLNSDLCVYCCKAYSDKEAKQLQEFVAEGGGLLI
     300       310       320       330       340       350         

     360       370       380       390       400       410         
pF1KSD GAQAWWWAFKNPGVSPLARFPGNLLLNPFGISITSQSLNPGPFRTPKAGIRTYHFRSTLA
       :.:::::: .:::  ::: ::::..:: ::.::  :.:. : : .:   .:.::::..:.
CCDS34 GGQAWWWASQNPGHCPLAGFPGNIILNCFGLSILPQTLKAGCFPVPTPEMRSYHFRKALS
     360       370       380       390       400       410         

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pF1KSD EFQVIMGRKRGNVEKGWLAKLGPDGAAFLQIPAEEIPAYMSVHRLLRKLLSRYRLPVATR
       .::.:.... ::.::. ::::  ::::::::::: .:::.:.::::::.:    ::...:
CCDS34 QFQAILNHENGNLEKSCLAKLRVDGAAFLQIPAEGVPAYISLHRLLRKMLRGSGLPAVSR
     420       430       440       450       460       470         

     480       490       500       510       520       530         
pF1KSD ENPVINDCCRGAMLSLATGLAHSGSDLSLLVPEIEDMYSSPYLRPSESPITVEVNCTNPG
       :::: .:  ..:.:::::::::::.: : :.  .     :  : ::. :::::.:  :::
CCDS34 ENPVASDSYEAAVLSLATGLAHSGTDCSQLAQGLGTWTCSSSLYPSKHPITVEINGINPG
     480       490       500       510       520       530         

     540       550       560       570       580       590         
pF1KSD TRYCWMSTGLYIPGRQIIEVSLPEAAASADLKIQIGCHTDDLTRASKLFRGPLVINRCCL
       .  ::.:::::.   :  :::: :::::: :..::::::::::.: :: :.:.: ..: .
CCDS34 NNDCWVSTGLYLLEGQNAEVSLSEAAASAGLRVQIGCHTDDLTKARKLSRAPVVTHQCWM
     540       550       560       570       580       590         

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pF1KSD DKPTKSITCLWGGLLYIIVPQNSKLGSVPVTVKGAVHAPYYKLGETTLEEWKRRIQENPG
       :.  .:..::::::::.:::..:.:: ::::..::: :::::::.:.::::::..::: .
CCDS34 DRTERSVSCLWGGLLYVIVPKGSQLGPVPVTIRGAVPAPYYKLGKTSLEEWKRQMQENLA
     600       610       620       630       640       650         

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pF1KSD PWGELATDNIILTVPTANLRTLENPEPLLRLWDEVMQAVARLGAEPFPLRLPQRIVADVQ
       ::::::::::::::::.::..:..:::.::::::.:::::::.:::::.: :.:::::::
CCDS34 PWGELATDNIILTVPTTNLQALKDPEPVLRLWDEMMQAVARLAAEPFPFRRPERIVADVQ
     660       670       680       690       700       710         

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pF1KSD ISVGWMHAGYPIMCHLESVQELINEKLIRTKGLWGPVHELGRNQQRQEWEFPPHTTEATC
       ::.::::.:::::::::::.:.:::  .:..:.:::.::::.::::. ::::::::::::
CCDS34 ISAGWMHSGYPIMCHLESVKEIINEMDMRSRGVWGPIHELGHNQQRHGWEFPPHTTEATC
     720       730       740       750       760       770         

     780       790       800       810       820       830         
pF1KSD NLWCVYVHETVLGIPRSRANIALWPPVREKRVRIYLSKGPNVKNWNAWTALETYLQLQEA
       ::: ::::::::::::..:. :: :: ::.:.. .:.::  . .::.:::::::::.   
CCDS34 NLWSVYVHETVLGIPRAQAHEALSPPERERRIKAHLGKGAPLCDWNVWTALETYLQVLSR
     780       790       800       810       820       830         

     840       850       860       870       880       890         
pF1KSD FGWEPFIRLFTEYRNQTNLPTENVDKMNLWVKMFSHQVQKNLAPFFEAWAWPIQKEVATS
                                                                   
CCDS34 NSGRRG                                                      
     840                                                           

>>CCDS47735.2 TCAF2 gene_id:285966|Hs108|chr7             (815 aa)
 initn: 2332 init1: 1934 opt: 1934  Z-score: 2376.3  bits: 450.8 E(32554): 4.8e-126
Smith-Waterman score: 3028; 59.1% identity (78.6% similar) in 766 aa overlap (210-915:47-811)

     180       190       200       210       220       230         
pF1KSD GIYFTDNKGDTSFFKVSKKMPKIPVLVSCEDDLSDDREELLHGISELDISNSDCFPSQLL
                                     .:. .:...::.::::::: ..   :::::
CCDS47 PIQKYREENGNSSSSPHHQLQSHASGPRYGEDVRQDQQQLLEGISELDIRTGGV-PSQLL
         20        30        40        50        60        70      

     240       250       260       270       280       290         
pF1KSD VHGALAFPLGLDSYHGCVIAAARYGRGRVVVTGHKVLFTVGKLGPFLLNAVRWLDGGRRG
       ::::::::::::.  .: .:::.:::::::...:. :. . :.:::::::::::  :. :
CCDS47 VHGALAFPLGLDASLNCFLAAAHYGRGRVVLAAHECLLCAPKMGPFLLNAVRWLARGQTG
          80        90       100       110       120       130     

     300       310       320       330       340       350         
pF1KSD KIVVQTELRTLSGLLAVGGIDTSIEPNLTSDASVYCFEPVSEVGVKELQEFVAEGGGLFV
       :. :.:.:. :  ::.  :.. :.::.:.::  ::: .  :.  .:.:::::::::::..
CCDS47 KVGVNTNLKDLCPLLSEHGLQCSLEPHLNSDLCVYCCKAYSDKEAKQLQEFVAEGGGLLI
         140       150       160       170       180       190     

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pF1KSD GAQAWWWAFKNPGVSPLARFPGNLLLNPFGISITSQSLNPGPFRTPKAGIRTYHFRSTLA
       :.:::::: .:::  ::: ::::..:: ::.::  :.:. : : .:   .:.::::..:.
CCDS47 GGQAWWWASQNPGHCPLAGFPGNIILNCFGLSILPQTLKAGCFPVPTPEMRSYHFRKALS
         200       210       220       230       240       250     

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pF1KSD EFQVIMGRKRGNVEKGWLAKLGPDGAAFLQIPAEEIPAYMSVHRLLRKLLSRYRLPVATR
       .::.:.... ::.::. ::::  ::::::::::: .:::.:.::::::.:    ::...:
CCDS47 QFQAILNHENGNLEKSCLAKLRVDGAAFLQIPAEGVPAYISLHRLLRKMLRGSGLPAVSR
         260       270       280       290       300       310     

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pF1KSD ENPVINDCCRGAMLSLATGLAHSGSDLSLLVPEIEDMYSSPYLRPSESPITVEVNCTNP-
       :::: .:  ..:.:::::::::::.: : :.  .     :  : ::. :::::.:  :: 
CCDS47 ENPVASDSYEAAVLSLATGLAHSGTDCSQLAQGLGTWTCSSSLYPSKHPITVEINGINPE
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pF1KSD --------------------------------------GTRY------------------
                                             :::.                  
CCDS47 SHSVIQVGMQWRDLSSCNLHLLGLSNSSLSASCVAGTTGTRHHAWLIFVFLVEREFHRKG
         380       390       400       410       420       430     

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pF1KSD ---CWMSTGLYIPGRQIIEVSLPEAAASADLKIQIGCHTDDLTRASKLFRGPLVINRCCL
          ::.:::::.   :  :::: :::::: :..::::::::::.: :: :.:.: ..: .
CCDS47 NNDCWVSTGLYLLEGQNAEVSLSEAAASAGLRVQIGCHTDDLTKARKLSRAPVVTHQCWM
         440       450       460       470       480       490     

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pF1KSD DKPTKSITCLWGGLLYIIVPQNSKLGSVPVTVKGAVHAPYYKLGETTLEEWKRRIQENPG
       :.  .:..::::::::.:::..:.:: ::::..::: :::::::.:.::::::..::: .
CCDS47 DRTERSVSCLWGGLLYVIVPKGSQLGPVPVTIRGAVPAPYYKLGKTSLEEWKRQMQENLA
         500       510       520       530       540       550     

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pF1KSD PWGELATDNIILTVPTANLRTLENPEPLLRLWDEVMQAVARLGAEPFPLRLPQRIVADVQ
       ::::::::::::::::.::..:..:::.::::::.:::::::.:::::.: :.:::::::
CCDS47 PWGELATDNIILTVPTTNLQALKDPEPVLRLWDEMMQAVARLAAEPFPFRRPERIVADVQ
         560       570       580       590       600       610     

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pF1KSD ISVGWMHAGYPIMCHLESVQELINEKLIRTKGLWGPVHELGRNQQRQEWEFPPHTTEATC
       ::.::::.:::::::::::.:.:::  .:..:.:::.::::.::::. ::::::::::::
CCDS47 ISAGWMHSGYPIMCHLESVKEIINEMDMRSRGVWGPIHELGHNQQRHGWEFPPHTTEATC
         620       630       640       650       660       670     

     780       790       800       810       820       830         
pF1KSD NLWCVYVHETVLGIPRSRANIALWPPVREKRVRIYLSKGPNVKNWNAWTALETYLQLQEA
       ::: ::::::::::::..:. :: :: ::.:.. .:.::  . .::.:::::::::::::
CCDS47 NLWSVYVHETVLGIPRAQAHEALSPPERERRIKAHLGKGAPLCDWNVWTALETYLQLQEA
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pF1KSD FGWEPFIRLFTEYRNQTNLPTENVDKMNLWVKMFSHQVQKNLAPFFEAWAWPIQKEVATS
       :::::: .::.::.. ..:: .:. .:::::: ::..:.:::.::::::.:::::::: :
CCDS47 FGWEPFTQLFAEYQTLSHLPKDNTGRMNLWVKKFSEKVKKNLVPFFEAWGWPIQKEVADS
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pF1KSD LAYLPEWKENIMKLYLLTQMPH
       :: ::::.:: :..::      
CCDS47 LASLPEWQENPMQVYLRARK  
         800       810       




921 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 18:40:59 2016 done: Thu Nov  3 18:41:00 2016
 Total Scan time:  4.450 Total Display time:  0.120

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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