Result of FASTA (ccds) for pF1KB7785
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7785, 457 aa
  1>>>pF1KB7785 457 - 457 aa - 457 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9585+/-0.00202; mu= 10.8583+/- 0.119
 mean_var=265.0083+/-51.528, 0's: 0 Z-trim(104.7): 978  B-trim: 42 in 1/49
 Lambda= 0.078785
 statistics sampled from 6965 (8032) to 6965 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.575), E-opt: 0.2 (0.247), width:  16
 Scan time:  2.670

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS9282.1 ZNF140 gene_id:7699|Hs108|chr12         ( 457) 3216 380.0 2.8e-105
CCDS73550.1 ZNF140 gene_id:7699|Hs108|chr12        ( 354) 2527 301.5 9.1e-82
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19      ( 810) 1554 191.5 2.8e-48
CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19      ( 836) 1554 191.5 2.9e-48
CCDS33102.1 ZNF331 gene_id:55422|Hs108|chr19       ( 463) 1407 174.4 2.2e-43
CCDS12505.1 ZNF571 gene_id:51276|Hs108|chr19       ( 609) 1371 170.5 4.4e-42
CCDS77346.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19      ( 492) 1361 169.2 8.6e-42
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 616) 1353 168.4 1.8e-41
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 658) 1353 168.5 1.9e-41
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 670) 1353 168.5 1.9e-41
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 682) 1353 168.5 1.9e-41
CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19      ( 569) 1334 166.2 7.8e-41
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19      ( 688) 1332 166.1   1e-40
CCDS42639.1 ZNF154 gene_id:7710|Hs108|chr19        ( 437) 1319 164.3 2.2e-40
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9          ( 474) 1317 164.2 2.7e-40
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9           ( 498) 1317 164.2 2.8e-40
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19       ( 488) 1315 164.0 3.2e-40
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5       ( 563) 1311 163.6 4.7e-40
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19       ( 670) 1311 163.7 5.2e-40
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12         ( 738) 1305 163.1 8.8e-40
CCDS42712.1 ZNF2 gene_id:7549|Hs108|chr2           ( 425) 1299 162.0   1e-39
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8           ( 682) 1299 162.4 1.4e-39
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1          ( 470) 1291 161.2 2.1e-39
CCDS12491.1 ZNF565 gene_id:147929|Hs108|chr19      ( 499) 1286 160.7 3.2e-39
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19      ( 536) 1286 160.7 3.3e-39
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19      ( 592) 1286 160.8 3.5e-39
CCDS10901.1 ZNF19 gene_id:7567|Hs108|chr16         ( 458) 1283 160.3 3.8e-39
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19      ( 591) 1284 160.6 4.1e-39
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17       ( 761) 1285 160.8 4.3e-39
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19      ( 676) 1284 160.6 4.4e-39
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19      ( 697) 1284 160.7 4.5e-39
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5           ( 461) 1281 160.1 4.5e-39
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19        ( 623) 1283 160.5 4.6e-39
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19        ( 624) 1283 160.5 4.6e-39
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 665) 1277 159.8 7.6e-39
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 667) 1277 159.8 7.6e-39
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 692) 1277 159.9 7.7e-39
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6          ( 751) 1275 159.7 9.5e-39
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3        ( 754) 1275 159.7 9.5e-39
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5        ( 568) 1272 159.2   1e-38
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5         ( 604) 1272 159.2 1.1e-38
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5        ( 620) 1272 159.2 1.1e-38
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19      ( 527) 1265 158.3 1.7e-38
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19      (1058) 1269 159.2 1.8e-38
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19      (1090) 1269 159.3 1.9e-38
CCDS33002.1 ZFP14 gene_id:57677|Hs108|chr19        ( 533) 1264 158.2 1.9e-38
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19      ( 686) 1265 158.5   2e-38
CCDS33130.1 ZNF543 gene_id:125919|Hs108|chr19      ( 600) 1264 158.3   2e-38
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19       ( 839) 1266 158.7   2e-38
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19       ( 840) 1266 158.7   2e-38


>>CCDS9282.1 ZNF140 gene_id:7699|Hs108|chr12              (457 aa)
 initn: 3216 init1: 3216 opt: 3216  Z-score: 2003.6  bits: 380.0 E(32554): 2.8e-105
Smith-Waterman score: 3216; 100.0% identity (100.0% similar) in 457 aa overlap (1-457:1-457)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MSQGSVTFRDVAIDFSQEEWKWLQPAQRDLYRCVMLENYGHLVSLGLSISKPDVVSLLEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 MSQGSVTFRDVAIDFSQEEWKWLQPAQRDLYRCVMLENYGHLVSLGLSISKPDVVSLLEQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 GKEPWLGKREVKRDLFSVSESSGEIKDFSPKNVIYDDSSQYLIMERILSQGPVYSSFKGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 GKEPWLGKREVKRDLFSVSESSGEIKDFSPKNVIYDDSSQYLIMERILSQGPVYSSFKGG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 WKCKDHTEMLQENQGCIRKVTVSHQEALAQHMNISTVERPYGCHECGKTFGRRFSLVLHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 WKCKDHTEMLQENQGCIRKVTVSHQEALAQHMNISTVERPYGCHECGKTFGRRFSLVLHQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 RTHTGEKPYACKECGKTFSQISNLVKHQMIHTGKKPHECKDCNKTFSYLSFLIEHQRTHT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 RTHTGEKPYACKECGKTFSQISNLVKHQMIHTGKKPHECKDCNKTFSYLSFLIEHQRTHT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 GEKPYECTECGKAFSRASNLTRHQRIHIGKKQYICRKCGKAFSSGSELIRHQITHTGEKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 GEKPYECTECGKAFSRASNLTRHQRIHIGKKQYICRKCGKAFSSGSELIRHQITHTGEKP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 YECIECGKAFRRFSHLTRHQSIHTTKTPYECNECRKAFRCHSFLIKHQRIHAGEKLYECD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 YECIECGKAFRRFSHLTRHQSIHTTKTPYECNECRKAFRCHSFLIKHQRIHAGEKLYECD
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 ECGKVFTWHASLIQHTKSHTGEKPYACAECDKAFSRSFSLILHQRTHTGEKPYVCKVCNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 ECGKVFTWHASLIQHTKSHTGEKPYACAECDKAFSRSFSLILHQRTHTGEKPYVCKVCNK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       
pF1KB7 SFSWSSNLAKHQRTHTLDNPYEYENSFNYHSFLTEHQ
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 SFSWSSNLAKHQRTHTLDNPYEYENSFNYHSFLTEHQ
              430       440       450       

>>CCDS73550.1 ZNF140 gene_id:7699|Hs108|chr12             (354 aa)
 initn: 2527 init1: 2527 opt: 2527  Z-score: 1581.5  bits: 301.5 E(32554): 9.1e-82
Smith-Waterman score: 2527; 100.0% identity (100.0% similar) in 354 aa overlap (104-457:1-354)

            80        90       100       110       120       130   
pF1KB7 DLFSVSESSGEIKDFSPKNVIYDDSSQYLIMERILSQGPVYSSFKGGWKCKDHTEMLQEN
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73                               MERILSQGPVYSSFKGGWKCKDHTEMLQEN
                                             10        20        30

           140       150       160       170       180       190   
pF1KB7 QGCIRKVTVSHQEALAQHMNISTVERPYGCHECGKTFGRRFSLVLHQRTHTGEKPYACKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QGCIRKVTVSHQEALAQHMNISTVERPYGCHECGKTFGRRFSLVLHQRTHTGEKPYACKE
               40        50        60        70        80        90

           200       210       220       230       240       250   
pF1KB7 CGKTFSQISNLVKHQMIHTGKKPHECKDCNKTFSYLSFLIEHQRTHTGEKPYECTECGKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 CGKTFSQISNLVKHQMIHTGKKPHECKDCNKTFSYLSFLIEHQRTHTGEKPYECTECGKA
              100       110       120       130       140       150

           260       270       280       290       300       310   
pF1KB7 FSRASNLTRHQRIHIGKKQYICRKCGKAFSSGSELIRHQITHTGEKPYECIECGKAFRRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FSRASNLTRHQRIHIGKKQYICRKCGKAFSSGSELIRHQITHTGEKPYECIECGKAFRRF
              160       170       180       190       200       210

           320       330       340       350       360       370   
pF1KB7 SHLTRHQSIHTTKTPYECNECRKAFRCHSFLIKHQRIHAGEKLYECDECGKVFTWHASLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SHLTRHQSIHTTKTPYECNECRKAFRCHSFLIKHQRIHAGEKLYECDECGKVFTWHASLI
              220       230       240       250       260       270

           380       390       400       410       420       430   
pF1KB7 QHTKSHTGEKPYACAECDKAFSRSFSLILHQRTHTGEKPYVCKVCNKSFSWSSNLAKHQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QHTKSHTGEKPYACAECDKAFSRSFSLILHQRTHTGEKPYVCKVCNKSFSWSSNLAKHQR
              280       290       300       310       320       330

           440       450       
pF1KB7 THTLDNPYEYENSFNYHSFLTEHQ
       ::::::::::::::::::::::::
CCDS73 THTLDNPYEYENSFNYHSFLTEHQ
              340       350    

>>CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19           (810 aa)
 initn: 1208 init1: 1208 opt: 1554  Z-score: 980.2  bits: 191.5 E(32554): 2.8e-48
Smith-Waterman score: 1554; 49.5% identity (71.5% similar) in 463 aa overlap (1-456:29-489)

                                           10        20        30  
pF1KB7                             MSQGSVTFRDVAIDFSQEEWKWLQPAQRDLYR
                                   :.. :..::::.::.:::::. :. .:::::.
CCDS77 MQPRFLWILCFSMEETQGELTSSCGSKTMANVSLAFRDVSIDLSQEEWECLDAVQRDLYK
               10        20        30        40        50        60

             40        50        60        70        80         90 
pF1KB7 CVMLENYGHLVSLGLSISKPDVVSLLEQGKEPWLGKREVKRDLFSVSESSGEIKDF-SPK
        ::::::..::::: .: ::::..:::: ::::.  ::  :. :.  : .   :.. : :
CCDS77 DVMLENYSNLVSLGYTIPKPDVITLLEQEKEPWIVMREGTRNWFTDLEYKYITKNLLSEK
               70        80        90       100       110       120

             100       110         120       130        140        
pF1KB7 NVIYDDSSQYLIMERILSQGPVYSS--FKGGWKCKDHTEMLQENQ-GCIRKVTVSHQEAL
       ::     ::    :.  :.. .. .  :..: .:: . :  ...: ::. .. ...: . 
CCDS77 NVCKIYLSQLQTGEK--SKNTIHEDTIFRNGLQCKHEFERQERHQMGCVSQMLIQKQISH
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         : .: . :. : :.:: :.: ..  :. : : ::::.:: : ::::.: ....:  :.
CCDS77 PLHPKIHAREKSYECKECRKAFRQQSYLIQHLRIHTGERPYKCMECGKAFCRVGDLRVHH
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pF1KB7 MIHTGKKPHECKDCNKTFSYLSFLIEHQRTHTGEKPYECTECGKAFSRASNLTRHQRIHI
        ::.:..:.:::.:.:.:     : :::: :.: ::::: ::::::::. .:  :: :: 
CCDS77 TIHAGERPYECKECGKAFRLHYHLTEHQRIHSGVKPYECKECGKAFSRVRDLRVHQTIHA
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       :.. : :..:::::    .: .::  ::::.::::  :::.::   :...::.:::   :
CCDS77 GERPYECKECGKAFRLHYQLTEHQRIHTGERPYECKVCGKTFRVQRHISQHQKIHTGVKP
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       :.:::: :::   :.:..::.::.::: ::: :::: :..:: : .: . ::::::: : 
CCDS77 YKCNECGKAFSHGSYLVQHQKIHTGEKPYECKECGKSFSFHAELARHRRIHTGEKPYECR
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pF1KB7 ECDKAFSRSFSLILHQRTHTGEKPYVCKVCNKSFSWSSNLAKHQRTHTLDNPYEYEN---
       :: :::  .  :  :.::::::::: :: :.:.:  . .:. : :::: . ::: ..   
CCDS77 ECGKAFRLQTELTRHHRTHTGEKPYECKECGKAFICGYQLTLHLRTHTGEIPYECKECGK
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       .:. .  ::.:                                                 
CCDS77 TFSSRYHLTQHYRIHTGEKPYICNECGKAFRLQGELTRHHRIHTCEKPYECKECGKAFIH
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>--
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CCDS77 LRTHTGEIPYECKECGKTFSSRYHLTQHYRIHTGEKPYICNECGKAFRLQGELTRHHRIH
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pF1KB7 TGEKPYACKECGKTFSQISNLVKHQMIHTGKKPHECKDCNKTFSYLSFLIEHQRTHTGEK
       : :::: ::::::.: . .....:: :::... . ::.:.: ::    : .: . :::::
CCDS77 TCEKPYECKECGKAFIHSNQFISHQRIHTSESTYICKECGKIFSRRYNLTQHFKIHTGEK
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pF1KB7 PYECTECGKAFSRASNLTRHQRIHIGKKQYICRKCGKAFSSGSELIRHQITHTGEKPYEC
       :: :.::::::   ..::.:.::: :.: : : .:::::  ...: .:.  :::::::::
CCDS77 PYICNECGKAFRFQTELTQHHRIHTGEKPYKCTECGKAFIRSTHLTQHHRIHTGEKPYEC
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        ::::.: :  :::.:.  :: . :: :::: .:: :   :  :::::.::  ::: :::
CCDS77 TECGKTFSRHYHLTQHHRGHTGEKPYICNECGNAFICSYRLTLHQRIHTGELPYECKECG
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pF1KB7 KVFTWHASLIQHTKSHTGEKPYACAECDKAFSRSFSLILHQRTHTGEKPYVCKVCNKSFS
       :.:. .  : :: . :::::::.: :: .::  .  :  :. .::::::: :: :.:.::
CCDS77 KTFSRRYHLTQHFRLHTGEKPYSCKECGNAFRLQAELTRHHIVHTGEKPYKCKECGKAFS
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        .:.:..:.: :: ..::. ..   .:   . :: ::            
CCDS77 VNSELTRHHRIHTGEKPYQCKECGKAFIRSDQLTLHQRNHISEEVLCIM
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>>CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19           (836 aa)
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CCDS12 LSIMPRFLWILCFSMEETQGELTSSCGSKTMANVSLAFRDVSIDLSQEEWECLDAVQRDL
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       :. ::::::..::::: .: ::::..:::: ::::.  ::  :. :.  : .   :.. :
CCDS12 YKDVMLENYSNLVSLGYTIPKPDVITLLEQEKEPWIVMREGTRNWFTDLEYKYITKNLLS
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pF1KB7 PKNVIYDDSSQYLIMERILSQGPVYSS--FKGGWKCKDHTEMLQENQ-GCIRKVTVSHQE
        :::     ::    :.  :.. .. .  :..: .:: . :  ...: ::. .. ...: 
CCDS12 EKNVCKIYLSQLQTGEK--SKNTIHEDTIFRNGLQCKHEFERQERHQMGCVSQMLIQKQI
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pF1KB7 ALAQHMNISTVERPYGCHECGKTFGRRFSLVLHQRTHTGEKPYACKECGKTFSQISNLVK
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CCDS12 SHPLHPKIHAREKSYECKECRKAFRQQSYLIQHLRIHTGERPYKCMECGKAFCRVGDLRV
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pF1KB7 HQMIHTGKKPHECKDCNKTFSYLSFLIEHQRTHTGEKPYECTECGKAFSRASNLTRHQRI
       :. ::.:..:.:::.:.:.:     : :::: :.: ::::: ::::::::. .:  :: :
CCDS12 HHTIHAGERPYECKECGKAFRLHYHLTEHQRIHSGVKPYECKECGKAFSRVRDLRVHQTI
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pF1KB7 HIGKKQYICRKCGKAFSSGSELIRHQITHTGEKPYECIECGKAFRRFSHLTRHQSIHTTK
       : :.. : :..:::::    .: .::  ::::.::::  :::.::   :...::.:::  
CCDS12 HAGERPYECKECGKAFRLHYQLTEHQRIHTGERPYECKVCGKTFRVQRHISQHQKIHTGV
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pF1KB7 TPYECNECRKAFRCHSFLIKHQRIHAGEKLYECDECGKVFTWHASLIQHTKSHTGEKPYA
        ::.:::: :::   :.:..::.::.::: ::: :::: :..:: : .: . ::::::: 
CCDS12 KPYKCNECGKAFSHGSYLVQHQKIHTGEKPYECKECGKSFSFHAELARHRRIHTGEKPYE
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pF1KB7 CAECDKAFSRSFSLILHQRTHTGEKPYVCKVCNKSFSWSSNLAKHQRTHTLDNPYEYEN-
       : :: :::  .  :  :.::::::::: :: :.:.:  . .:. : :::: . ::: .. 
CCDS12 CRECGKAFRLQTELTRHHRTHTGEKPYECKECGKAFICGYQLTLHLRTHTGEIPYECKEC
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pF1KB7 --SFNYHSFLTEHQ                                              
         .:. .  ::.:                                               
CCDS12 GKTFSSRYHLTQHYRIHTGEKPYICNECGKAFRLQGELTRHHRIHTCEKPYECKECGKAF
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>--
 initn: 3035 init1: 1105 opt: 1125  Z-score: 716.6  bits: 142.7 E(32554): 1.4e-33
Smith-Waterman score: 1125; 52.1% identity (72.3% similar) in 307 aa overlap (154-457:518-824)

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pF1KB7 KDHTEMLQENQGCIRKVTVSHQEALAQHMNISTVERPYGCHECGKTFGRRFSLVLHQRTH
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CCDS12 LRTHTGEIPYECKECGKTFSSRYHLTQHYRIHTGEKPYICNECGKAFRLQGELTRHHRIH
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pF1KB7 TGEKPYACKECGKTFSQISNLVKHQMIHTGKKPHECKDCNKTFSYLSFLIEHQRTHTGEK
       : :::: ::::::.: . .....:: :::... . ::.:.: ::    : .: . :::::
CCDS12 TCEKPYECKECGKAFIHSNQFISHQRIHTSESTYICKECGKIFSRRYNLTQHFKIHTGEK
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pF1KB7 PYECTECGKAFSRASNLTRHQRIHIGKKQYICRKCGKAFSSGSELIRHQITHTGEKPYEC
       :: :.::::::   ..::.:.::: :.: : : .:::::  ...: .:.  :::::::::
CCDS12 PYICNECGKAFRFQTELTQHHRIHTGEKPYKCTECGKAFIRSTHLTQHHRIHTGEKPYEC
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pF1KB7 IECGKAFRRFSHLTRHQSIHTTKTPYECNECRKAFRCHSFLIKHQRIHAGEKLYECDECG
        ::::.: :  :::.:.  :: . :: :::: .:: :   :  :::::.::  ::: :::
CCDS12 TECGKTFSRHYHLTQHHRGHTGEKPYICNECGNAFICSYRLTLHQRIHTGELPYECKECG
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pF1KB7 KVFTWHASLIQHTKSHTGEKPYACAECDKAFSRSFSLILHQRTHTGEKPYVCKVCNKSFS
       :.:. .  : :: . :::::::.: :: .::  .  :  :. .::::::: :: :.:.::
CCDS12 KTFSRRYHLTQHFRLHTGEKPYSCKECGNAFRLQAELTRHHIVHTGEKPYKCKECGKAFS
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pF1KB7 WSSNLAKHQRTHTLDNPYEYEN---SFNYHSFLTEHQ            
        .:.:..:.: :: ..::. ..   .:   . :: ::            
CCDS12 VNSELTRHHRIHTGEKPYQCKECGKAFIRSDQLTLHQRNHISEEVLCIM
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>>CCDS33102.1 ZNF331 gene_id:55422|Hs108|chr19            (463 aa)
 initn: 3109 init1: 1221 opt: 1407  Z-score: 892.3  bits: 174.4 E(32554): 2.2e-43
Smith-Waterman score: 1407; 48.5% identity (68.3% similar) in 464 aa overlap (1-457:1-458)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MSQGSVTFRDVAIDFSQEEWKWLQPAQRDLYRCVMLENYGHLVSLGLSISKPDVVSLLEQ
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CCDS33 MAQGLVTFADVAIDFSQEEWACLNSAQRDLYWDVMLENYSNLVSLDLESAYENKSLPTEK
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pF1KB7 G-KEPWLGKREVKRDLFSVSES---SGEIKDFSPKNVIYDDSSQYLIMERILSQGPVYSS
       . .:   .::.  :   :....    : ..   :.       .:..:    ...  .  .
CCDS33 NIHEIRASKRNSDRRSKSLGRNWICEGTLE--RPQRSRGRYVNQMII--NYVKRPATREG
               70        80        90         100         110      

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB7 FKGGWKCKDHTEMLQENQGCIRKVTVSHQEALAQHMNISTVERPYGCHECGKTFGRRFSL
            . . : :   : . : .  . ..:  :.::..: : :.:: :.:: :.:    .:
CCDS33 TPPRTHQRHHKENSFECKDCGKAFSRGYQ--LSQHQKIHTGEKPYECKECKKAFRWGNQL
        120       130       140         150       160       170    

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB7 VLHQRTHTGEKPYACKECGKTFSQISNLVKHQMIHTGKKPHECKDCNKTFSYLSFLIEHQ
       . ::. ::::::: ::.:::.:   :.:: :. ::::.::.:::::.:.:   . : .::
CCDS33 TQHQKIHTGEKPYECKDCGKAFRWGSSLVIHKRIHTGEKPYECKDCGKAFRRGDELTQHQ
          180       190       200       210       220       230    

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB7 RTHTGEKPYECTECGKAFSRASNLTRHQRIHIGKKQYICRKCGKAFSSGSELIRHQITHT
       : ::::: ::: .:::.:::. .: .:.::: :.: : :. :::::  :: ::.:.  ::
CCDS33 RFHTGEKDYECKDCGKTFSRVYKLIQHKRIHSGEKPYECKDCGKAFICGSSLIQHKRIHT
          240       250       260       270       280       290    

        300       310       320       330       340       350      
pF1KB7 GEKPYECIECGKAFRRFSHLTRHQSIHTTKTPYECNECRKAFRCHSFLIKHQRIHAGEKL
       ::::::: :::::: : ..::.::.::: . :.::.:: ::::  : :.::.:::.::: 
CCDS33 GEKPYECQECGKAFTRVNYLTQHQKIHTGEKPHECKECGKAFRWGSSLVKHERIHTGEKP
          300       310       320       330       340       350    

        360       370       380       390       400       410      
pF1KB7 YECDECGKVFTWHASLIQHTKSHTGEKPYACAECDKAFSRSFSLILHQRTHTGEKPYVCK
       :.: ::::.:.    : :: . :::: :: : :: :::  . ::. :.: ::: ::: : 
CCDS33 YKCTECGKAFNCGYHLTQHERIHTGETPYKCKECGKAFIYGSSLVKHERIHTGVKPYGCT
          360       370       380       390       400       410    

        420       430       440          450            
pF1KB7 VCNKSFSWSSNLAKHQRTHTLDNPYEYEN---SFNYHSFLTEHQ     
        :.:::: . .:..::.::.  . :: ..   . :. . : :::     
CCDS33 ECGKSFSHGHQLTQHQKTHSGAKSYECKECGKACNHLNHLREHQRIHNS
          420       430       440       450       460   

>>CCDS12505.1 ZNF571 gene_id:51276|Hs108|chr19            (609 aa)
 initn: 3212 init1: 1172 opt: 1371  Z-score: 869.0  bits: 170.5 E(32554): 4.4e-42
Smith-Waterman score: 1374; 46.2% identity (63.9% similar) in 493 aa overlap (6-457:6-466)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MSQGSVTFRDVAIDFSQEEWKWLQPAQRDLYRCVMLENYGHLVSLGLSISKPDVVSLLEQ
            :::::::::::::::. :.:::::::: ::::::..:.:: :             
CCDS12 MPHLLVTFRDVAIDFSQEEWECLDPAQRDLYRDVMLENYSNLISLDL-------------
               10        20        30        40                    

               70        80        90        100       110         
pF1KB7 GKEPWLGKREVKRDLFSVSESSGEIKDFSPKNVIYD-DSSQYLIMERILSQGPVYSSFKG
                          :::   : .::.. ::. .: :.  : . ...   :...  
CCDS12 -------------------ESSCVTKKLSPEKEIYEMESLQWENMGKRINHHLQYNGLGD
                           50        60        70        80        

     120       130                140       150       160          
pF1KB7 GWKCKDHTEMLQENQ-G---CIR-----KVTVSHQEALAQHMNISTVERPYGCHECGK--
       . .:: . :  . .: :   :..     :.: ::. . . :  : : :. : :.:: .  
CCDS12 NMECKGNLEGQEASQEGLYMCVKITCEEKATESHSTSSTFHRIIPTKEKLYKCKECRQGF
       90       100       110       120       130       140        

                                170       180       190       200  
pF1KB7 --------------------------TFGRRFSLVLHQRTHTGEKPYACKECGKTFSQIS
                                 ::... : . ::: .:::::: : ::::.:.. :
CCDS12 SYLSCLIQHEENHNIEKCSEVKKHRNTFSKKPSYIQHQRIQTGEKPYECMECGKAFGRTS
      150       160       170       180       190       200        

            210       220       230       240       250       260  
pF1KB7 NLVKHQMIHTGKKPHECKDCNKTFSYLSFLIEHQRTHTGEKPYECTECGKAFSRASNLTR
       .:..:: :::..::..:. :.:.:   : : ::::.::::::::: .::::::  :. : 
CCDS12 DLIQHQKIHTNEKPYQCNACGKAFIRGSQLTEHQRVHTGEKPYECKKCGKAFSYCSQYTL
      210       220       230       240       250       260        

            270       280       290       300       310       320  
pF1KB7 HQRIHIGKKQYICRKCGKAFSSGSELIRHQITHTGEKPYECIECGKAFRRFSHLTRHQSI
       ::::: :.: : :. :::::  ::.:  ::  :.::::::: ::::::   :::: :: .
CCDS12 HQRIHSGEKPYECKDCGKAFILGSQLTYHQRIHSGEKPYECKECGKAFILGSHLTYHQRV
      270       280       290       300       310       320        

            330       340       350       360       370       380  
pF1KB7 HTTKTPYECNECRKAFRCHSFLIKHQRIHAGEKLYECDECGKVFTWHASLIQHTKSHTGE
       :: . :: :.:: ::: : : : .:::::.::: ::: ::::.:   ..:  : . :.::
CCDS12 HTGEKPYICKECGKAFLCASQLNEHQRIHTGEKPYECKECGKTFFRGSQLTYHLRVHSGE
      330       340       350       360       370       380        

            390       400       410       420       430       440  
pF1KB7 KPYACAECDKAFSRSFSLILHQRTHTGEKPYVCKVCNKSFSWSSNLAKHQRTHTLDNPYE
       .:: : :: :::  . .:: ::: ::::::: :: :.:.:  ...:..::: :: ..:.:
CCDS12 RPYKCKECGKAFISNSNLIQHQRIHTGEKPYKCKECGKAFICGKQLSEHQRIHTGEKPFE
      390       400       410       420       430       440        

               450                                                 
pF1KB7 YEN---SFNYHSFLTEHQ                                          
        ..   .:   ..::.:.                                          
CCDS12 CKECGKAFIRVAYLTQHEKIHGEKHYECKECGKTFVRATQLTYHQRIHTGEKPYKCKECD
      450       460       470       480       490       500        

>--
 initn: 1708 init1: 637 opt: 637  Z-score: 418.1  bits: 87.0 E(32554): 5.7e-17
Smith-Waterman score: 637; 61.9% identity (78.4% similar) in 139 aa overlap (185-323:470-608)

          160       170       180       190       200       210    
pF1KB7 STVERPYGCHECGKTFGRRFSLVLHQRTHTGEKPYACKECGKTFSQISNLVKHQMIHTGK
                                     ::: : :::::::: . ..:. :: ::::.
CCDS12 IHTGEKPFECKECGKAFIRVAYLTQHEKIHGEKHYECKECGKTFVRATQLTYHQRIHTGE
     440       450       460       470       480       490         

          220       230       240       250       260       270    
pF1KB7 KPHECKDCNKTFSYLSFLIEHQRTHTGEKPYECTECGKAFSRASNLTRHQRIHIGKKQYI
       ::..::.:.:.: : : : :::: : ::::::: .::::: :.:.::.: : : :.: : 
CCDS12 KPYKCKECDKAFIYGSQLSEHQRIHRGEKPYECKQCGKAFIRGSHLTEHLRTHTGEKPYE
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          280       290       300       310       320       330    
pF1KB7 CRKCGKAFSSGSELIRHQITHTGEKPYECIECGKAFRRFSHLTRHQSIHTTKTPYECNEC
       :..::.::: ::::  ::  ::::::: :..::: ::  :.::.:  .:           
CCDS12 CKECGRAFSRGSELTLHQRIHTGEKPYTCVQCGKDFRCPSQLTQHTRLHN          
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          340       350       360       370       380       390    
pF1KB7 RKAFRCHSFLIKHQRIHAGEKLYECDECGKVFTWHASLIQHTKSHTGEKPYACAECDKAF

>>CCDS77346.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19           (492 aa)
 initn: 2263 init1: 1170 opt: 1361  Z-score: 863.8  bits: 169.2 E(32554): 8.6e-42
Smith-Waterman score: 1361; 45.8% identity (69.5% similar) in 476 aa overlap (1-456:22-486)

                                    10        20        30         
pF1KB7                      MSQGSVTFRDVAIDFSQEEWKWLQPAQRDLYRCVMLENY
                            . :: .:::::::.::: ::: :.:::: ::. ::::::
CCDS77 MLCDEKAQKRRKRKAKESGMALPQGHLTFRDVAIEFSQAEWKCLDPAQRALYKDVMLENY
               10        20        30        40        50        60

      40        50        60        70         80        90        
pF1KB7 GHLVSLGLSISKPDVVSLLEQGKEPWLGKREVKRDL-FSVSESSGEIKDFSPKNVI----
        .::::: : .       : .. :     . .:..:  :     .:.. :  . ::    
CCDS77 RNLVSLGSSYA-------LGSNAED----KPIKKQLGVSFHLHLSELELFPDERVINGCN
               70                   80        90       100         

               100         110          120       130        140   
pF1KB7 -----YDDSSQYLIMERILS--QGPVYS--SFK-GGWKCKDHTEMLQENQG-CIRKVTVS
             . ::.   .... :  . :...  .:  ...  ...   :.:.   : ..  : 
CCDS77 QVENFINHSSSVSCLQEMSSSVKTPIFNRNDFDDSSFLPQEQKVHLREKPYECNEHSKVF
     110       120       130       140       150       160         

            150       160       170       180       190       200  
pF1KB7 H-QEALAQHMNISTVERPYGCHECGKTFGRRFSLVLHQRTHTGEKPYACKECGKTFSQIS
       . . .:..:. : :::.:: :. :::.:.:   :. : : ::::::: :. :::.::  :
CCDS77 RVSSSLTKHQVIHTVEKPYKCNSCGKVFSRNSHLAEHCRIHTGEKPYKCNVCGKVFSYNS
     170       180       190       200       210       220         

            210       220       230       240       250       260  
pF1KB7 NLVKHQMIHTGKKPHECKDCNKTFSYLSFLIEHQRTHTGEKPYECTECGKAFSRASNLTR
       :...:: ::: .::.::..:.:.::  :.: .::: :. ::::.:.::::.::. :.:. 
CCDS77 NFARHQRIHTREKPYECNECGKVFSNNSYLARHQRIHAEEKPYKCNECGKGFSHKSSLAN
     230       240       250       260       270       280         

            270       280       290       300       310       320  
pF1KB7 HQRIHIGKKQYICRKCGKAFSSGSELIRHQITHTGEKPYECIECGKAFRRFSHLTRHQSI
       : ::. :.: : : .:::::   . :.:::  :::::::.: ::::.: . :::..:  :
CCDS77 HWRIYTGEKPYKCDECGKAFYRIALLVRHQKIHTGEKPYKCNECGKVFIQNSHLAQHWRI
     290       300       310       320       330       340         

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pF1KB7 HTTKTPYECNECRKAFRCHSFLIKHQRIHAGEKLYECDECGKVFTWHASLIQHTKSHTGE
       :: . ::.:::: :.:   : : .:.:::.::: :.:.::::.:. ...:  :   ::::
CCDS77 HTGEKPYKCNECGKVFNQLSNLARHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSEYSGLSAHLVIHTGE
     350       360       370       380       390       400         

            390       400       410       420       430       440  
pF1KB7 KPYACAECDKAFSRSFSLILHQRTHTGEKPYVCKVCNKSFSWSSNLAKHQRTHTLDNPY-
       ::: :.:: ::: ...::  ::: ::::.:: :. :.: :.  ..::.:.. :: ..:: 
CCDS77 KPYKCSECGKAFRHKLSLTNHQRIHTGERPYKCNECGKVFNRIAHLARHRKIHTGEKPYK
     410       420       430       440       450       460         

               450            
pF1KB7 --EYENSFNYHSFLTEHQ     
         :  ..:.  :.:..:      
CCDS77 CNECGKAFSRISYLAQHWTIHMG
     470       480       490  

>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (616 aa)
 initn: 1333 init1: 1333 opt: 1353  Z-score: 857.9  bits: 168.4 E(32554): 1.8e-41
Smith-Waterman score: 1353; 56.8% identity (76.6% similar) in 338 aa overlap (124-457:248-583)

           100       110       120        130       140       150  
pF1KB7 IYDDSSQYLIMERILSQGPVYSSFKGGWKCKDHT-EMLQENQGCIRKVTVSHQEALAQHM
                                     . :: :   : . : .  . : . ...:: 
CCDS74 HQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGK--SFSFRSSFSQHE
       220       230       240       250       260         270     

            160       170       180       190       200       210  
pF1KB7 NISTVERPYGCHECGKTFGRRFSLVLHQRTHTGEKPYACKECGKTFSQISNLVKHQMIHT
          : :.:: : ::::.: . . :. : : ::::::: : ::::.::. :.:.::: :::
CCDS74 RTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHT
         280       290       300       310       320       330     

            220       230       240       250       260       270  
pF1KB7 GKKPHECKDCNKTFSYLSFLIEHQRTHTGEKPYECTECGKAFSRASNLTRHQRIHIGKKQ
       :.::.::..:.:.:. .. ::.::::::::::::: :::::::... ::.:.::: :.: 
CCDS74 GEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKP
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CCDS74 STHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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>>CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (670 aa)
 initn: 1333 init1: 1333 opt: 1353  Z-score: 857.6  bits: 168.5 E(32554): 1.9e-41
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pF1KB7 NISTVERPYGCHECGKTFGRRFSLVLHQRTHTGEKPYACKECGKTFSQISNLVKHQMIHT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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