Result of FASTA (ccds) for pF1KB9409
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9409, 289 aa
  1>>>pF1KB9409 289 - 289 aa - 289 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5601+/-0.000841; mu= 13.7680+/- 0.050
 mean_var=63.6845+/-12.679, 0's: 0 Z-trim(106.6): 34  B-trim: 220 in 1/50
 Lambda= 0.160715
 statistics sampled from 9027 (9060) to 9027 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.654), E-opt: 0.2 (0.278), width:  16
 Scan time:  2.540

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS8524.1 CCND2 gene_id:894|Hs108|chr12           ( 289) 1928 455.6  2e-128
CCDS8191.1 CCND1 gene_id:595|Hs108|chr11           ( 295) 1190 284.5 6.5e-77
CCDS4863.1 CCND3 gene_id:896|Hs108|chr6            ( 292) 1174 280.7 8.5e-76
CCDS75452.1 CCND3 gene_id:896|Hs108|chr6           ( 242)  923 222.5 2.4e-58
CCDS47426.1 CCND3 gene_id:896|Hs108|chr6           ( 211)  819 198.4 3.8e-51
CCDS47425.1 CCND3 gene_id:896|Hs108|chr6           ( 220)  548 135.5 3.2e-32
CCDS45031.1 CCNA1 gene_id:8900|Hs108|chr13         ( 421)  303 78.8 7.3e-15
CCDS45030.1 CCNA1 gene_id:8900|Hs108|chr13         ( 464)  303 78.9   8e-15
CCDS9357.1 CCNA1 gene_id:8900|Hs108|chr13          ( 465)  303 78.9   8e-15
CCDS47427.1 CCND3 gene_id:896|Hs108|chr6           (  96)  288 75.1 2.2e-14
CCDS6264.1 CCNE2 gene_id:9134|Hs108|chr8           ( 404)  295 77.0 2.5e-14
CCDS3723.1 CCNA2 gene_id:890|Hs108|chr4            ( 432)  293 76.5 3.7e-14
CCDS12419.1 CCNE1 gene_id:898|Hs108|chr19          ( 410)  271 71.4 1.2e-12
CCDS3997.1 CCNB1 gene_id:891|Hs108|chr5            ( 433)  244 65.2 9.8e-11


>>CCDS8524.1 CCND2 gene_id:894|Hs108|chr12                (289 aa)
 initn: 1928 init1: 1928 opt: 1928  Z-score: 2419.2  bits: 455.6 E(32554): 2e-128
Smith-Waterman score: 1928; 100.0% identity (100.0% similar) in 289 aa overlap (1-289:1-289)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MELLCHEVDPVRRAVRDRNLLRDDRVLQNLLTIEERYLPQCSYFKCVQKDIQPYMRRMVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 MELLCHEVDPVRRAVRDRNLLRDDRVLQNLLTIEERYLPQCSYFKCVQKDIQPYMRRMVA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 TWMLEVCEEQKCEEEVFPLAMNYLDRFLAGVPTPKSHLQLLGAVCMFLASKLKETSPLTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 TWMLEVCEEQKCEEEVFPLAMNYLDRFLAGVPTPKSHLQLLGAVCMFLASKLKETSPLTA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 EKLCIYTDNSIKPQELLEWELVVLGKLKWNLAAVTPHDFIEHILRKLPQQREKLSLIRKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 EKLCIYTDNSIKPQELLEWELVVLGKLKWNLAAVTPHDFIEHILRKLPQQREKLSLIRKH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 AQTFIALCATDFKFAMYPPSMIATGSVGAAICGLQQDEEVSSLTCDALTELLAKITNTDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 AQTFIALCATDFKFAMYPPSMIATGSVGAAICGLQQDEEVSSLTCDALTELLAKITNTDV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280         
pF1KB9 DCLKACQEQIEAVLLNSLQQYRQDQRDGSKSEDELDQASTPTDVRDIDL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 DCLKACQEQIEAVLLNSLQQYRQDQRDGSKSEDELDQASTPTDVRDIDL
              250       260       270       280         

>>CCDS8191.1 CCND1 gene_id:595|Hs108|chr11                (295 aa)
 initn: 1176 init1: 1059 opt: 1190  Z-score: 1494.3  bits: 284.5 E(32554): 6.5e-77
Smith-Waterman score: 1190; 61.8% identity (81.9% similar) in 293 aa overlap (2-289:4-295)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB9   MELLCHEVDPVRRAVRDRNLLRDDRVLQNLLTIEERYLPQCSYFKCVQKDIQPYMRRM
          .::: ::. .:::  : ::: .::::. .:  ::   :. ::::::::.. : ::..
CCDS81 MEHQLLCCEVETIRRAYPDANLL-NDRVLRAMLKAEETCAPSVSYFKCVQKEVLPSMRKI
               10        20         30        40        50         

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB9 VATWMLEVCEEQKCEEEVFPLAMNYLDRFLAGVPTPKSHLQLLGAVCMFLASKLKETSPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::.  :. ::.::::::.:::.:::.::: ::
CCDS81 VATWMLEVCEEQKCEEEVFPLAMNYLDRFLSLEPVKKSRLQLLGATCMFVASKMKETIPL
      60        70        80        90       100       110         

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB9 TAEKLCIYTDNSIKPQELLEWELVVLGKLKWNLAAVTPHDFIEHILRKLPQQREKLSLIR
       :::::::::::::.:.:::. ::....::::::::.::::::::.: :.:. .:. ..::
CCDS81 TAEKLCIYTDNSIRPEELLQMELLLVNKLKWNLAAMTPHDFIEHFLSKMPEAEENKQIIR
     120       130       140       150       160       170         

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB9 KHAQTFIALCATDFKFAMYPPSMIATGSVGAAICGLQQDEEVSSLTCDALTELLAKITNT
       ::::::.:::::: ::   ::::.:.::: ::. ::.     . :.   ::..:... . 
CCDS81 KHAQTFVALCATDVKFISNPPSMVAAGSVVAAVQGLNLRSPNNFLSYYRLTRFLSRVIKC
     180       190       200       210       220       230         

      240       250       260            270       280         
pF1KB9 DVDCLKACQEQIEAVLLNSLQQYRQDQ-----RDGSKSEDELDQASTPTDVRDIDL
       : :::.::::::::.: .::.: .:..     ..  . :.:.: : :::::::.:.
CCDS81 DPDCLRACQEQIEALLESSLRQAQQNMDPKAAEEEEEEEEEVDLACTPTDVRDVDI
     240       250       260       270       280       290     

>>CCDS4863.1 CCND3 gene_id:896|Hs108|chr6                 (292 aa)
 initn: 1171 init1: 977 opt: 1174  Z-score: 1474.3  bits: 280.7 E(32554): 8.5e-76
Smith-Waterman score: 1174; 61.6% identity (81.8% similar) in 297 aa overlap (1-289:1-292)

                10        20        30        40        50         
pF1KB9 MELLCHE-VDPVRRAVRDRNLLRDDRVLQNLLTIEERYLPQCSYFKCVQKDIQPYMRRMV
       ::::: : .  . ::  :  :: :.::::.:: .::::.:. :::.:::..:.:.::.:.
CCDS48 MELLCCEGTRHAPRAGPDPRLLGDQRVLQSLLRLEERYVPRASYFQCVQREIKPHMRKML
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB9 ATWMLEVCEEQKCEEEVFPLAMNYLDRFLAGVPTPKSHLQLLGAVCMFLASKLKETSPLT
       : :::::::::.:::::::::::::::.:. ::: :..:::::::::.:::::.::.:::
CCDS48 AYWMLEVCEEQRCEEEVFPLAMNYLDRYLSCVPTRKAQLQLLGAVCMLLASKLRETTPLT
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB9 AEKLCIYTDNSIKPQELLEWELVVLGKLKWNLAAVTPHDFIEHILRKLPQQREKLSLIRK
        ::::::::....:..: .::..:::::::.::::  :::.  ::..:   :.. .:..:
CCDS48 IEKLCIYTDHAVSPRQLRDWEVLVLGKLKWDLAAVIAHDFLAFILHRLSLPRDRQALVKK
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB9 HAQTFIALCATDFKFAMYPPSMIATGSVGAAICGLQQDEEVSSLTCDALTELLAKITNTD
       :::::.::::::. :::::::::::::.:::. ::     . :.. : :::::: ::.:.
CCDS48 HAQTFLALCATDYTFAMYPPSMIATGSIGAAVQGLG----ACSMSGDELTELLAGITGTE
              190       200       210           220       230      

     240       250       260              270       280         
pF1KB9 VDCLKACQEQIEAVLLNSLQQYRQDQRD-------GSKSEDELDQASTPTDVRDIDL
       ::::.::::::::.: .::..  : . .       ::.:.   .:.::::::  : :
CCDS48 VDCLRACQEQIEAALRESLREASQTSSSPAPKAPRGSSSQGP-SQTSTPTDVTAIHL
        240       250       260       270        280       290  

>>CCDS75452.1 CCND3 gene_id:896|Hs108|chr6                (242 aa)
 initn: 915 init1: 746 opt: 923  Z-score: 1161.1  bits: 222.5 E(32554): 2.4e-58
Smith-Waterman score: 923; 62.3% identity (82.3% similar) in 231 aa overlap (66-289:17-242)

          40        50        60        70        80        90     
pF1KB9 RYLPQCSYFKCVQKDIQPYMRRMVATWMLEVCEEQKCEEEVFPLAMNYLDRFLAGVPTPK
                                     :::::.:::::::::::::::.:. ::: :
CCDS75               MKSAGGSGRSLLPSPRVCEEQRCEEEVFPLAMNYLDRYLSCVPTRK
                             10        20        30        40      

         100       110       120       130       140       150     
pF1KB9 SHLQLLGAVCMFLASKLKETSPLTAEKLCIYTDNSIKPQELLEWELVVLGKLKWNLAAVT
       ..:::::::::.:::::.::.::: ::::::::....:..: .::..:::::::.:::: 
CCDS75 AQLQLLGAVCMLLASKLRETTPLTIEKLCIYTDHAVSPRQLRDWEVLVLGKLKWDLAAVI
         50        60        70        80        90       100      

         160       170       180       190       200       210     
pF1KB9 PHDFIEHILRKLPQQREKLSLIRKHAQTFIALCATDFKFAMYPPSMIATGSVGAAICGLQ
        :::.  ::..:   :.. .:..::::::.::::::. :::::::::::::.:::. :: 
CCDS75 AHDFLAFILHRLSLPRDRQALVKKHAQTFLALCATDYTFAMYPPSMIATGSIGAAVQGLG
        110       120       130       140       150       160      

         220       230       240       250       260               
pF1KB9 QDEEVSSLTCDALTELLAKITNTDVDCLKACQEQIEAVLLNSLQQYRQDQRD-------G
           . :.. : :::::: ::.:.::::.::::::::.: .::..  : . .       :
CCDS75 ----ACSMSGDELTELLAGITGTEVDCLRACQEQIEAALRESLREASQTSSSPAPKAPRG
            170       180       190       200       210       220  

      270       280         
pF1KB9 SKSEDELDQASTPTDVRDIDL
       :.:.   .:.::::::  : :
CCDS75 SSSQGP-SQTSTPTDVTAIHL
             230       240  

>>CCDS47426.1 CCND3 gene_id:896|Hs108|chr6                (211 aa)
 initn: 811 init1: 642 opt: 819  Z-score: 1031.7  bits: 198.4 E(32554): 3.8e-51
Smith-Waterman score: 819; 60.2% identity (81.0% similar) in 216 aa overlap (81-289:1-211)

               60        70        80        90       100       110
pF1KB9 IQPYMRRMVATWMLEVCEEQKCEEEVFPLAMNYLDRFLAGVPTPKSHLQLLGAVCMFLAS
                                     ::::::.:. ::: :..:::::::::.:::
CCDS47                               MNYLDRYLSCVPTRKAQLQLLGAVCMLLAS
                                             10        20        30

              120       130       140       150       160       170
pF1KB9 KLKETSPLTAEKLCIYTDNSIKPQELLEWELVVLGKLKWNLAAVTPHDFIEHILRKLPQQ
       ::.::.::: ::::::::....:..: .::..:::::::.::::  :::.  ::..:   
CCDS47 KLRETTPLTIEKLCIYTDHAVSPRQLRDWEVLVLGKLKWDLAAVIAHDFLAFILHRLSLP
               40        50        60        70        80        90

              180       190       200       210       220       230
pF1KB9 REKLSLIRKHAQTFIALCATDFKFAMYPPSMIATGSVGAAICGLQQDEEVSSLTCDALTE
       :.. .:..::::::.::::::. :::::::::::::.:::. ::     . :.. : :::
CCDS47 RDRQALVKKHAQTFLALCATDYTFAMYPPSMIATGSIGAAVQGLG----ACSMSGDELTE
              100       110       120       130           140      

              240       250       260              270       280   
pF1KB9 LLAKITNTDVDCLKACQEQIEAVLLNSLQQYRQDQRD-------GSKSEDELDQASTPTD
       ::: ::.:.::::.::::::::.: .::..  : . .       ::.:.   .:.:::::
CCDS47 LLAGITGTEVDCLRACQEQIEAALRESLREASQTSSSPAPKAPRGSSSQGP-SQTSTPTD
        150       160       170       180       190        200     

             
pF1KB9 VRDIDL
       :  : :
CCDS47 VTAIHL
         210 

>>CCDS47425.1 CCND3 gene_id:896|Hs108|chr6                (220 aa)
 initn: 565 init1: 371 opt: 548  Z-score: 691.8  bits: 135.5 E(32554): 3.2e-32
Smith-Waterman score: 643; 43.4% identity (58.9% similar) in 297 aa overlap (1-289:1-220)

                10        20        30        40        50         
pF1KB9 MELLCHE-VDPVRRAVRDRNLLRDDRVLQNLLTIEERYLPQCSYFKCVQKDIQPYMRRMV
       ::::: : .  . ::  :  :: :.::::.:: .::::.:. :::.:::..:.:.::.:.
CCDS47 MELLCCEGTRHAPRAGPDPRLLGDQRVLQSLLRLEERYVPRASYFQCVQREIKPHMRKML
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB9 ATWMLEVCEEQKCEEEVFPLAMNYLDRFLAGVPTPKSHLQLLGAVCMFLASKLKETSPLT
       : ::::                                                      
CCDS47 AYWMLE------------------------------------------------------
                                                                   

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB9 AEKLCIYTDNSIKPQELLEWELVVLGKLKWNLAAVTPHDFIEHILRKLPQQREKLSLIRK
                         .::..:::::::.::::  :::.  ::..:   :.. .:..:
CCDS47 ------------------DWEVLVLGKLKWDLAAVIAHDFLAFILHRLSLPRDRQALVKK
                           70        80        90       100        

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB9 HAQTFIALCATDFKFAMYPPSMIATGSVGAAICGLQQDEEVSSLTCDALTELLAKITNTD
       :::::.::::::. :::::::::::::.:::. ::     . :.. : :::::: ::.:.
CCDS47 HAQTFLALCATDYTFAMYPPSMIATGSIGAAVQGLG----ACSMSGDELTELLAGITGTE
      110       120       130       140           150       160    

     240       250       260              270       280         
pF1KB9 VDCLKACQEQIEAVLLNSLQQYRQDQRD-------GSKSEDELDQASTPTDVRDIDL
       ::::.::::::::.: .::..  : . .       ::.:.   .:.::::::  : :
CCDS47 VDCLRACQEQIEAALRESLREASQTSSSPAPKAPRGSSSQGP-SQTSTPTDVTAIHL
          170       180       190       200        210       220

>>CCDS45031.1 CCNA1 gene_id:8900|Hs108|chr13              (421 aa)
 initn: 251 init1: 251 opt: 303  Z-score: 380.3  bits: 78.8 E(32554): 7.3e-15
Smith-Waterman score: 309; 29.1% identity (59.4% similar) in 254 aa overlap (24-275:169-407)

                      10        20        30        40        50   
pF1KB9        MELLCHEVDPVRRAVRDRNLLRDDRVLQNLLTIEERYLPQCSYFKCVQKDIQP
                                     ... : :   : :. :.  :.:  : ::  
CCDS45 SPMLVDSSLLSQSEDISSLGTDVINVTEYAEEIYQYLREAEIRHRPKAHYMKK-QPDITE
      140       150       160       170       180       190        

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pF1KB9 YMRRMVATWMLEVCEEQKCEEEVFPLAMNYLDRFLAGVPTPKSHLQLLGAVCMFLASKLK
        :: ... :..:: :: : . :.. ::.:.:::::. . . ...:::.:.. :.:::: .
CCDS45 GMRTILVDWLVEVGEEYKLRAETLYLAVNFLDRFLSCMSVLRGKLQLVGTAAMLLASKYE
       200       210       220       230       240       250       

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB9 ETSPLTAEKLCIYTDNSIKPQELLEWELVVLGKLKWNLAAVTPHDFIEHILRKLPQQREK
       :  :  ....   ::..   ..::. : ..:  : ..:.. : ..:. . ::.     . 
CCDS45 EIYPPEVDEFVYITDDTYTKRQLLKMEHLLLKVLAFDLTVPTTNQFLLQYLRRQGVCVRT
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           180       190       200       210       220         230 
pF1KB9 LSLIRKHAQTFIALCATDFKFAMYPPSMIATGSVGAAICGLQQDEEVSSLTCDA--LTEL
        .: .  :.  ..:  .:  :  : ::.::.    ::.:       ... : .     : 
CCDS45 ENLAKYVAE--LSLLEAD-PFLKYLPSLIAA----AAFC-------LANYTVNKHFWPET
       320         330        340                  350       360   

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pF1KB9 LAKITNTDVDCLKACQEQIEAVLLNSLQQYRQDQRDGSKSEDELDQASTPTDVRDIDL
       :: .:. ... .  :  ... . :.  .. .:  :.  :.   :              
CCDS45 LAAFTGYSLSEIVPCLSELHKAYLDIPHRPQQAIREKYKASKYLCVSLMEPPAVLLLQ
           370       380       390       400       410       420 

>>CCDS45030.1 CCNA1 gene_id:8900|Hs108|chr13              (464 aa)
 initn: 251 init1: 251 opt: 303  Z-score: 379.6  bits: 78.9 E(32554): 8e-15
Smith-Waterman score: 309; 29.1% identity (59.4% similar) in 254 aa overlap (24-275:212-450)

                      10        20        30        40        50   
pF1KB9        MELLCHEVDPVRRAVRDRNLLRDDRVLQNLLTIEERYLPQCSYFKCVQKDIQP
                                     ... : :   : :. :.  :.:  : ::  
CCDS45 SPMLVDSSLLSQSEDISSLGTDVINVTEYAEEIYQYLREAEIRHRPKAHYMKK-QPDITE
             190       200       210       220       230        240

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB9 YMRRMVATWMLEVCEEQKCEEEVFPLAMNYLDRFLAGVPTPKSHLQLLGAVCMFLASKLK
        :: ... :..:: :: : . :.. ::.:.:::::. . . ...:::.:.. :.:::: .
CCDS45 GMRTILVDWLVEVGEEYKLRAETLYLAVNFLDRFLSCMSVLRGKLQLVGTAAMLLASKYE
              250       260       270       280       290       300

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB9 ETSPLTAEKLCIYTDNSIKPQELLEWELVVLGKLKWNLAAVTPHDFIEHILRKLPQQREK
       :  :  ....   ::..   ..::. : ..:  : ..:.. : ..:. . ::.     . 
CCDS45 EIYPPEVDEFVYITDDTYTKRQLLKMEHLLLKVLAFDLTVPTTNQFLLQYLRRQGVCVRT
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pF1KB9 LSLIRKHAQTFIALCATDFKFAMYPPSMIATGSVGAAICGLQQDEEVSSLTCDA--LTEL
        .: .  :.  ..:  .:  :  : ::.::.    ::.:       ... : .     : 
CCDS45 ENLAKYVAE--LSLLEAD-PFLKYLPSLIAA----AAFC-------LANYTVNKHFWPET
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pF1KB9 LAKITNTDVDCLKACQEQIEAVLLNSLQQYRQDQRDGSKSEDELDQASTPTDVRDIDL
       :: .:. ... .  :  ... . :.  .. .:  :.  :.   :              
CCDS45 LAAFTGYSLSEIVPCLSELHKAYLDIPHRPQQAIREKYKASKYLCVSLMEPPAVLLLQ
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>>CCDS9357.1 CCNA1 gene_id:8900|Hs108|chr13               (465 aa)
 initn: 251 init1: 251 opt: 303  Z-score: 379.6  bits: 78.9 E(32554): 8e-15
Smith-Waterman score: 309; 29.1% identity (59.4% similar) in 254 aa overlap (24-275:213-451)

                      10        20        30        40        50   
pF1KB9        MELLCHEVDPVRRAVRDRNLLRDDRVLQNLLTIEERYLPQCSYFKCVQKDIQP
                                     ... : :   : :. :.  :.:  : ::  
CCDS93 SPMLVDSSLLSQSEDISSLGTDVINVTEYAEEIYQYLREAEIRHRPKAHYMKK-QPDITE
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pF1KB9 YMRRMVATWMLEVCEEQKCEEEVFPLAMNYLDRFLAGVPTPKSHLQLLGAVCMFLASKLK
        :: ... :..:: :: : . :.. ::.:.:::::. . . ...:::.:.. :.:::: .
CCDS93 GMRTILVDWLVEVGEEYKLRAETLYLAVNFLDRFLSCMSVLRGKLQLVGTAAMLLASKYE
             250       260       270       280       290       300 

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pF1KB9 ETSPLTAEKLCIYTDNSIKPQELLEWELVVLGKLKWNLAAVTPHDFIEHILRKLPQQREK
       :  :  ....   ::..   ..::. : ..:  : ..:.. : ..:. . ::.     . 
CCDS93 EIYPPEVDEFVYITDDTYTKRQLLKMEHLLLKVLAFDLTVPTTNQFLLQYLRRQGVCVRT
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pF1KB9 LSLIRKHAQTFIALCATDFKFAMYPPSMIATGSVGAAICGLQQDEEVSSLTCDA--LTEL
        .: .  :.  ..:  .:  :  : ::.::.    ::.:       ... : .     : 
CCDS93 ENLAKYVAE--LSLLEAD-PFLKYLPSLIAA----AAFC-------LANYTVNKHFWPET
             370          380           390              400       

             240       250       260       270       280         
pF1KB9 LAKITNTDVDCLKACQEQIEAVLLNSLQQYRQDQRDGSKSEDELDQASTPTDVRDIDL
       :: .:. ... .  :  ... . :.  .. .:  :.  :.   :              
CCDS93 LAAFTGYSLSEIVPCLSELHKAYLDIPHRPQQAIREKYKASKYLCVSLMEPPAVLLLQ
       410       420       430       440       450       460     

>>CCDS47427.1 CCND3 gene_id:896|Hs108|chr6                (96 aa)
 initn: 280 init1: 153 opt: 288  Z-score: 371.8  bits: 75.1 E(32554): 2.2e-14
Smith-Waterman score: 288; 54.5% identity (72.3% similar) in 101 aa overlap (196-289:1-96)

         170       180       190       200       210       220     
pF1KB9 KLPQQREKLSLIRKHAQTFIALCATDFKFAMYPPSMIATGSVGAAICGLQQDEEVSSLTC
                                     :::::::::::.:::. ::     . :.. 
CCDS47                               MYPPSMIATGSIGAAVQGLG----ACSMSG
                                             10        20          

         230       240       250       260              270        
pF1KB9 DALTELLAKITNTDVDCLKACQEQIEAVLLNSLQQYRQDQRD-------GSKSEDELDQA
       : :::::: ::.:.::::.::::::::.: .::..  : . .       ::.:.   .:.
CCDS47 DELTELLAGITGTEVDCLRACQEQIEAALRESLREASQTSSSPAPKAPRGSSSQGP-SQT
         30        40        50        60        70        80      

      280         
pF1KB9 STPTDVRDIDL
       ::::::  : :
CCDS47 STPTDVTAIHL
          90      




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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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