Result of FASTA (omim) for pF1KB5691
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5691, 860 aa
  1>>>pF1KB5691 860 - 860 aa - 860 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2789+/-0.000442; mu= -3.0125+/- 0.028
 mean_var=238.8043+/-47.805, 0's: 0 Z-trim(117.9): 28  B-trim: 0 in 0/57
 Lambda= 0.082995
 statistics sampled from 30319 (30344) to 30319 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.699), E-opt: 0.2 (0.356), width:  16
 Scan time: 14.480

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001017977 (OMIM: 610494) DDB1- and CUL4-associa ( 860) 5765 704.1 6.8e-202
XP_016857270 (OMIM: 610494) PREDICTED: DDB1- and C ( 713) 4759 583.7 1.1e-165
XP_005245390 (OMIM: 610494) PREDICTED: DDB1- and C ( 874) 4536 557.0 1.4e-157
NP_060912 (OMIM: 610494) DDB1- and CUL4-associated ( 880) 3167 393.1  3e-108
XP_005245389 (OMIM: 610494) PREDICTED: DDB1- and C ( 894) 3167 393.1 3.1e-108
XP_005245388 (OMIM: 610494) PREDICTED: DDB1- and C ( 937) 3123 387.8 1.2e-106
NP_001185885 (OMIM: 610494) DDB1- and CUL4-associa ( 951) 3123 387.8 1.3e-106
XP_016857269 (OMIM: 610494) PREDICTED: DDB1- and C ( 733) 2682 335.0 7.9e-91
NP_001185886 (OMIM: 610494) DDB1- and CUL4-associa ( 920) 2548 319.0 6.5e-86
XP_016857268 (OMIM: 610494) PREDICTED: DDB1- and C ( 804) 2117 267.3   2e-70
NP_056541 (OMIM: 610100,615820) DDB1- and CUL4-ass ( 597)  461 69.0 7.5e-11


>>NP_001017977 (OMIM: 610494) DDB1- and CUL4-associated   (860 aa)
 initn: 5765 init1: 5765 opt: 5765  Z-score: 3745.7  bits: 704.1 E(85289): 6.8e-202
Smith-Waterman score: 5765; 99.9% identity (100.0% similar) in 860 aa overlap (1-860:1-860)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSDNNNEKLSPKPGTGEPVLSLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSDNNNEKLSPKPGTGEPVLSLH
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 YSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFVPQSSVQPPEGDSETKAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFVPQSSVQPPEGDSETKAP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 EESSEDATKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGERNDLNLDRSCGVPEESA
       ::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EESSEDVTKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGERNDLNLDRSCGVPEESA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 SSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEETSTRDSALQDTDDSDDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEETSTRDSALQDTDDSDDD
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 PVLIPGARYRAGPGDRRSAVARIQEFFRRRKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PVLIPGARYRAGPGDRRSAVARIQEFFRRRKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSR
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB5 TMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSG
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB5 IDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRAD
              790       800       810       820       830       840

              850       860
pF1KB5 RLEGDRSEGSGQENENEDEE
       ::::::::::::::::::::
NP_001 RLEGDRSEGSGQENENEDEE
              850       860

>>XP_016857270 (OMIM: 610494) PREDICTED: DDB1- and CUL4-  (713 aa)
 initn: 4759 init1: 4759 opt: 4759  Z-score: 3095.9  bits: 583.7 E(85289): 1.1e-165
Smith-Waterman score: 4759; 99.9% identity (100.0% similar) in 713 aa overlap (148-860:1-713)

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB5 GVIFYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSC
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016                               MTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSC
                                             10        20        30

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB5 TKEDCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TKEDCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGT
               40        50        60        70        80        90

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB5 TGMVARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TGMVARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEE
              100       110       120       130       140       150

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB5 RREELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RREELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEAS
              160       170       180       190       200       210

       360       370       380       390       400       410       
pF1KB5 EVAQSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EVAQSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTM
              220       230       240       250       260       270

       420       430       440       450       460       470       
pF1KB5 SAQAHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSDNNNEKLSPKPGTGEPVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SAQAHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSDNNNEKLSPKPGTGEPVL
              280       290       300       310       320       330

       480       490       500       510       520       530       
pF1KB5 SLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFVPQSSVQPPEGDSET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFVPQSSVQPPEGDSET
              340       350       360       370       380       390

       540       550       560       570       580       590       
pF1KB5 KAPEESSEDATKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGERNDLNLDRSCGVPE
       :::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KAPEESSEDVTKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGERNDLNLDRSCGVPE
              400       410       420       430       440       450

       600       610       620       630       640       650       
pF1KB5 ESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEETSTRDSALQDTDDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEETSTRDSALQDTDDS
              460       470       480       490       500       510

       660       670       680       690       700       710       
pF1KB5 DDDPVLIPGARYRAGPGDRRSAVARIQEFFRRRKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DDDPVLIPGARYRAGPGDRRSAVARIQEFFRRRKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHR
              520       530       540       550       560       570

       720       730       740       750       760       770       
pF1KB5 NSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILA
              580       590       600       610       620       630

       780       790       800       810       820       830       
pF1KB5 SSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHI
              640       650       660       670       680       690

       840       850       860
pF1KB5 RADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
       :::::::::::::::::::::::
XP_016 RADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
              700       710   

>>XP_005245390 (OMIM: 610494) PREDICTED: DDB1- and CUL4-  (874 aa)
 initn: 4563 init1: 4535 opt: 4536  Z-score: 2950.3  bits: 557.0 E(85289): 1.4e-157
Smith-Waterman score: 5727; 98.3% identity (98.4% similar) in 874 aa overlap (1-860:1-874)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
               70        80        90       100       110       120

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XP_005 MLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
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>>NP_060912 (OMIM: 610494) DDB1- and CUL4-associated fac  (880 aa)
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Smith-Waterman score: 5715; 97.6% identity (97.7% similar) in 880 aa overlap (1-860:1-880)

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NP_060 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 NHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 TVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
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>>XP_005245389 (OMIM: 610494) PREDICTED: DDB1- and CUL4-  (894 aa)
 initn: 4384 init1: 3126 opt: 3167  Z-score: 2064.2  bits: 393.1 E(85289): 3.1e-108
Smith-Waterman score: 5665; 96.1% identity (96.2% similar) in 892 aa overlap (1-858:1-892)

               10        20        30        40        50        60
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XP_005 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
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pF1KB5 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
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pF1KB5 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
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XP_005 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
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pF1KB5 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
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XP_005 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
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pF1KB5 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460                    
pF1KB5 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSD--------------------
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                    
XP_005 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSDSPSSVVNKQLGSMSLDEQQD
              430       440       450       460       470       480

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pF1KB5 NNNEKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NNNEKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEE
              490       500       510       520       530       540

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pF1KB5 SFVPQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDATKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSN
       ::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SFVPQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDVTKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSN
              550       560       570       580       590       600

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pF1KB5 SGERNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SGERNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSA
              610       620       630       640       650       660

              650       660       670                     680      
pF1KB5 HEETSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDR--------------RSAVARIQEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::              ::::::::::
XP_005 HEETSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDRFNIRGTTIGDRIMRRSAVARIQEF
              670       680       690       700       710       720

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pF1KB5 FRRRKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FRRRKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIW
              730       740       750       760       770       780

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pF1KB5 DRHTAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DRHTAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVI
              790       800       810       820       830       840

        810       820       830       840       850       860
pF1KB5 TRNELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::  
XP_005 TRNELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
              850       860       870       880       890    

>>XP_005245388 (OMIM: 610494) PREDICTED: DDB1- and CUL4-  (937 aa)
 initn: 3150 init1: 3115 opt: 3123  Z-score: 2035.4  bits: 387.8 E(85289): 1.2e-106
Smith-Waterman score: 5314; 91.3% identity (91.4% similar) in 892 aa overlap (1-815:1-892)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB5 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
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pF1KB5 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
              130       140       150       160       170       180

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pF1KB5 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
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pF1KB5 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
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pF1KB5 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
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pF1KB5 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQS---------------------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                     
XP_005 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSEFLRGPEIALLRKRLQQLRLK
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pF1KB5 --------------------------------------------------------DNNN
                                                               ::::
XP_005 KAEQQRQQELAAHTQQQPSTSDQSSHEGSSQDPHASDSPSSVVNKQLGSMSLDEQQDNNN
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pF1KB5 EKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFV
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pF1KB5 PQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDATKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGE
       :::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDVTKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGE
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pF1KB5 RNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEE
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pF1KB5 TSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDRRSAVARIQEFFRRRKERKEMEELDTLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDRRSAVARIQEFFRRRKERKEMEELDTLN
              730       740       750       760       770       780

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pF1KB5 IRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLLEADNHV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLLEADNHV
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pF1KB5 VNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::        
XP_005 VNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVP
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           830       840       850       860
pF1KB5 ASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
                                            
XP_005 ASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
              910       920       930       

>--
 initn: 287 init1: 287 opt: 287  Z-score: 200.2  bits: 48.2 E(85289): 0.00021
Smith-Waterman score: 287; 100.0% identity (100.0% similar) in 45 aa overlap (816-860:893-937)

         790       800       810       820       830       840     
pF1KB5 KIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGD
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGD
            870       880       890       900       910       920  

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pF1KB5 RSEGSGQENENEDEE
       :::::::::::::::
XP_005 RSEGSGQENENEDEE
            930       

>>NP_001185885 (OMIM: 610494) DDB1- and CUL4-associated   (951 aa)
 initn: 4373 init1: 3115 opt: 3123  Z-score: 2035.3  bits: 387.8 E(85289): 1.3e-106
Smith-Waterman score: 5193; 89.7% identity (89.8% similar) in 892 aa overlap (1-801:1-892)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
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pF1KB5 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB5 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
              130       140       150       160       170       180

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pF1KB5 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
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pF1KB5 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
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pF1KB5 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
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pF1KB5 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
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pF1KB5 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQS---------------------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                     
NP_001 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSEFLRGPEIALLRKRLQQLRLK
              430       440       450       460       470       480

                                                             460   
pF1KB5 --------------------------------------------------------DNNN
                                                               ::::
NP_001 KAEQQRQQELAAHTQQQPSTSDQSSHEGSSQDPHASDSPSSVVNKQLGSMSLDEQQDNNN
              490       500       510       520       530       540

           470       480       490       500       510       520   
pF1KB5 EKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFV
              550       560       570       580       590       600

           530       540       550       560       570       580   
pF1KB5 PQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDATKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGE
       :::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDVTKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGE
              610       620       630       640       650       660

           590       600       610       620       630       640   
pF1KB5 RNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEE
              670       680       690       700       710       720

           650       660       670                     680         
pF1KB5 TSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDR--------------RSAVARIQEFFRR
       :::::::::::::::::::::::::::::::::              :::::::::::::
NP_001 TSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDRFNIRGTTIGDRIMRRSAVARIQEFFRR
              730       740       750       760       770       780

     690       700       710       720       730       740         
pF1KB5 RKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRH
              790       800       810       820       830       840

     750       760       770       780       790       800         
pF1KB5 TAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::        
NP_001 TAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRN
              850       860       870       880       890       900

     810       820       830       840       850       860
pF1KB5 ELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
                                                          
NP_001 ELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
              910       920       930       940       950 

>--
 initn: 370 init1: 370 opt: 370  Z-score: 253.8  bits: 58.2 E(85289): 2.1e-07
Smith-Waterman score: 370; 100.0% identity (100.0% similar) in 59 aa overlap (802-860:893-951)

             780       790       800       810       820       830 
pF1KB5 FDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRML
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRML
            870       880       890       900       910       920  

             840       850       860
pF1KB5 ASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
       :::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
            930       940       950 

>>XP_016857269 (OMIM: 610494) PREDICTED: DDB1- and CUL4-  (733 aa)
 initn: 2659 init1: 2659 opt: 2682  Z-score: 1751.7  bits: 335.0 E(85289): 7.9e-91
Smith-Waterman score: 4709; 97.1% identity (97.3% similar) in 733 aa overlap (148-860:1-733)

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB5 GVIFYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSC
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016                               MTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSC
                                             10        20        30

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB5 TKEDCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TKEDCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGT
               40        50        60        70        80        90

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB5 TGMVARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TGMVARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEE
              100       110       120       130       140       150

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB5 RREELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RREELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEAS
              160       170       180       190       200       210

       360       370       380       390       400       410       
pF1KB5 EVAQSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EVAQSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTM
              220       230       240       250       260       270

       420       430       440       450       460                 
pF1KB5 SAQAHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSD-----------------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                 
XP_016 SAQAHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSDSPSSVVNKQLGSMSLDE
              280       290       300       310       320       330

                 470       480       490       500       510       
pF1KB5 ---NNNEKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEG
          :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QQDNNNEKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEG
              340       350       360       370       380       390

       520       530       540       550       560       570       
pF1KB5 QEESFVPQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDATKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPL
       :::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QEESFVPQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDVTKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPL
              400       410       420       430       440       450

       580       590       600       610       620       630       
pF1KB5 DSNSGERNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DSNSGERNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATG
              460       470       480       490       500       510

       640       650       660       670       680       690       
pF1KB5 PSAHEETSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDRRSAVARIQEFFRRRKERKEME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PSAHEETSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDRRSAVARIQEFFRRRKERKEME
              520       530       540       550       560       570

       700       710       720       730       740       750       
pF1KB5 ELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLL
              580       590       600       610       620       630

       760       770       780       790       800       810       
pF1KB5 EADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETR
              640       650       660       670       680       690

       820       830       840       850       860
pF1KB5 NTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
              700       710       720       730   

>>NP_001185886 (OMIM: 610494) DDB1- and CUL4-associated   (920 aa)
 initn: 3798 init1: 2540 opt: 2548  Z-score: 1663.5  bits: 319.0 E(85289): 6.5e-86
Smith-Waterman score: 4911; 86.2% identity (86.3% similar) in 892 aa overlap (1-801:1-861)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::      
NP_001 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCV------
               10        20        30        40        50          

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
                                :::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 -------------------------LTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
                                    60        70        80         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
      90       100       110       120       130       140         

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
     150       160       170       180       190       200         

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
     210       220       230       240       250       260         

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
     270       280       290       300       310       320         

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
     330       340       350       360       370       380         

              430       440       450                              
pF1KB5 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQS---------------------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                     
NP_001 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSEFLRGPEIALLRKRLQQLRLK
     390       400       410       420       430       440         

                                                             460   
pF1KB5 --------------------------------------------------------DNNN
                                                               ::::
NP_001 KAEQQRQQELAAHTQQQPSTSDQSSHEGSSQDPHASDSPSSVVNKQLGSMSLDEQQDNNN
     450       460       470       480       490       500         

           470       480       490       500       510       520   
pF1KB5 EKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFV
     510       520       530       540       550       560         

           530       540       550       560       570       580   
pF1KB5 PQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDATKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGE
       :::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDVTKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGE
     570       580       590       600       610       620         

           590       600       610       620       630       640   
pF1KB5 RNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEE
     630       640       650       660       670       680         

           650       660       670                     680         
pF1KB5 TSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDR--------------RSAVARIQEFFRR
       :::::::::::::::::::::::::::::::::              :::::::::::::
NP_001 TSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDRFNIRGTTIGDRIMRRSAVARIQEFFRR
     690       700       710       720       730       740         

     690       700       710       720       730       740         
pF1KB5 RKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRH
     750       760       770       780       790       800         

     750       760       770       780       790       800         
pF1KB5 TAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::        
NP_001 TAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRN
     810       820       830       840       850       860         

     810       820       830       840       850       860
pF1KB5 ELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
                                                          
NP_001 ELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
     870       880       890       900       910       920

>--
 initn: 370 init1: 370 opt: 370  Z-score: 254.0  bits: 58.2 E(85289): 2.1e-07
Smith-Waterman score: 370; 100.0% identity (100.0% similar) in 59 aa overlap (802-860:862-920)

             780       790       800       810       820       830 
pF1KB5 FDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRML
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRML
             840       850       860       870       880       890 

             840       850       860
pF1KB5 ASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
       :::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
             900       910       920

>>XP_016857268 (OMIM: 610494) PREDICTED: DDB1- and CUL4-  (804 aa)
 initn: 3367 init1: 2109 opt: 2117  Z-score: 1385.4  bits: 267.3 E(85289): 2e-70
Smith-Waterman score: 4187; 87.7% identity (87.8% similar) in 745 aa overlap (148-801:1-745)

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB5 GVIFYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSC
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016                               MTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSC
                                             10        20        30

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB5 TKEDCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TKEDCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGT
               40        50        60        70        80        90

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB5 TGMVARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TGMVARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEE
              100       110       120       130       140       150

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pF1KB5 RREELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RREELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEAS
              160       170       180       190       200       210

       360       370       380       390       400       410       
pF1KB5 EVAQSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EVAQSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTM
              220       230       240       250       260       270

       420       430       440       450                           
pF1KB5 SAQAHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQS------------------
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                  
XP_016 SAQAHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSEFLRGPEIALLRKRLQQL
              280       290       300       310       320       330

                                                                460
pF1KB5 -----------------------------------------------------------D
                                                                  :
XP_016 RLKKAEQQRQQELAAHTQQQPSTSDQSSHEGSSQDPHASDSPSSVVNKQLGSMSLDEQQD
              340       350       360       370       380       390

              470       480       490       500       510       520
pF1KB5 NNNEKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NNNEKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEE
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pF1KB5 SFVPQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDATKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSN
       ::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SFVPQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDVTKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSN
              460       470       480       490       500       510

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pF1KB5 SGERNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SGERNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSA
              520       530       540       550       560       570

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pF1KB5 HEETSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDR--------------RSAVARIQEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::              ::::::::::
XP_016 HEETSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDRFNIRGTTIGDRIMRRSAVARIQEF
              580       590       600       610       620       630

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pF1KB5 FRRRKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FRRRKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIW
              640       650       660       670       680       690

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pF1KB5 DRHTAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVI
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::     
XP_016 DRHTAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVI
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pF1KB5 TRNELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
                                                             
XP_016 TRNELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
              760       770       780       790       800    

>--
 initn: 370 init1: 370 opt: 370  Z-score: 254.9  bits: 58.2 E(85289): 1.8e-07
Smith-Waterman score: 370; 100.0% identity (100.0% similar) in 59 aa overlap (802-860:746-804)

             780       790       800       810       820       830 
pF1KB5 FDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRML
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRML
         720       730       740       750       760       770     

             840       850       860
pF1KB5 ASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
       :::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
         780       790       800    




860 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 18:00:50 2016 done: Thu Nov  3 18:00:52 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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