Result of FASTA (ccds) for pF1KB5691
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5691, 860 aa
  1>>>pF1KB5691 860 - 860 aa - 860 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6819+/-0.00105; mu= 0.2830+/- 0.063
 mean_var=202.9669+/-41.554, 0's: 0 Z-trim(110.5): 39  B-trim: 122 in 2/50
 Lambda= 0.090025
 statistics sampled from 11630 (11653) to 11630 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.7), E-opt: 0.2 (0.358), width:  16
 Scan time:  4.740

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS30933.1 DCAF6 gene_id:55827|Hs108|chr1         ( 860) 5765 762.0       0
CCDS1267.2 DCAF6 gene_id:55827|Hs108|chr1          ( 880) 3167 424.6 3.7e-118
CCDS55657.1 DCAF6 gene_id:55827|Hs108|chr1         ( 951) 3123 418.9 2.1e-116
CCDS55658.1 DCAF6 gene_id:55827|Hs108|chr1         ( 920) 2548 344.2 6.2e-94
CCDS1200.1 DCAF8 gene_id:50717|Hs108|chr1          ( 597)  461 73.1 1.7e-12
CCDS59162.1 DCAF8L2 gene_id:347442|Hs108|chrX      ( 631)  455 72.3   3e-12
CCDS35222.1 DCAF8L1 gene_id:139425|Hs108|chrX      ( 600)  430 69.1 2.7e-11


>>CCDS30933.1 DCAF6 gene_id:55827|Hs108|chr1              (860 aa)
 initn: 5765 init1: 5765 opt: 5765  Z-score: 4058.5  bits: 762.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5765; 99.9% identity (100.0% similar) in 860 aa overlap (1-860:1-860)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSDNNNEKLSPKPGTGEPVLSLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSDNNNEKLSPKPGTGEPVLSLH
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 YSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFVPQSSVQPPEGDSETKAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFVPQSSVQPPEGDSETKAP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 EESSEDATKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGERNDLNLDRSCGVPEESA
       ::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EESSEDVTKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGERNDLNLDRSCGVPEESA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 SSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEETSTRDSALQDTDDSDDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEETSTRDSALQDTDDSDDD
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 PVLIPGARYRAGPGDRRSAVARIQEFFRRRKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PVLIPGARYRAGPGDRRSAVARIQEFFRRRKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSR
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB5 TMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSG
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB5 IDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 IDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRAD
              790       800       810       820       830       840

              850       860
pF1KB5 RLEGDRSEGSGQENENEDEE
       ::::::::::::::::::::
CCDS30 RLEGDRSEGSGQENENEDEE
              850       860

>>CCDS1267.2 DCAF6 gene_id:55827|Hs108|chr1               (880 aa)
 initn: 3161 init1: 3126 opt: 3167  Z-score: 2234.7  bits: 424.6 E(32554): 3.7e-118
Smith-Waterman score: 5715; 97.6% identity (97.7% similar) in 880 aa overlap (1-860:1-880)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QSNRGRGRSRPRGGTSQSDISTLPTVPSSPDLEVSETAMEVDTPAEQFLQPSTSSTMSAQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460                    
pF1KB5 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSD--------------------
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                    
CCDS12 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQSDSPSSVVNKQLGSMSLDEQQD
              430       440       450       460       470       480

              470       480       490       500       510       520
pF1KB5 NNNEKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NNNEKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEE
              490       500       510       520       530       540

              530       540       550       560       570       580
pF1KB5 SFVPQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDATKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSN
       ::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SFVPQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDVTKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSN
              550       560       570       580       590       600

              590       600       610       620       630       640
pF1KB5 SGERNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SGERNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSA
              610       620       630       640       650       660

              650       660       670       680       690       700
pF1KB5 HEETSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDRRSAVARIQEFFRRRKERKEMEELD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HEETSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDRRSAVARIQEFFRRRKERKEMEELD
              670       680       690       700       710       720

              710       720       730       740       750       760
pF1KB5 TLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLLEAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRHTAEHLMLLEAD
              730       740       750       760       770       780

              770       780       790       800       810       820
pF1KB5 NHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRNELMLEETRNTI
              790       800       810       820       830       840

              830       840       850       860
pF1KB5 TVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
              850       860       870       880

>>CCDS55657.1 DCAF6 gene_id:55827|Hs108|chr1              (951 aa)
 initn: 4373 init1: 3115 opt: 3123  Z-score: 2203.3  bits: 418.9 E(32554): 2.1e-116
Smith-Waterman score: 5193; 89.7% identity (89.8% similar) in 892 aa overlap (1-801:1-892)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
               10        20        30        40        50        60

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                     
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pF1KB5 --------------------------------------------------------DNNN
                                                               ::::
CCDS55 KAEQQRQQELAAHTQQQPSTSDQSSHEGSSQDPHASDSPSSVVNKQLGSMSLDEQQDNNN
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pF1KB5 EKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFV
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       :::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDVTKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEE
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pF1KB5 TSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDR--------------RSAVARIQEFFRR
       :::::::::::::::::::::::::::::::::              :::::::::::::
CCDS55 TSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDRFNIRGTTIGDRIMRRSAVARIQEFFRR
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pF1KB5 RKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRH
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pF1KB5 TAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::        
CCDS55 TAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRN
              850       860       870       880       890       900

     810       820       830       840       850       860
pF1KB5 ELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
                                                          
CCDS55 ELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
              910       920       930       940       950 

>>CCDS55658.1 DCAF6 gene_id:55827|Hs108|chr1              (920 aa)
 initn: 3798 init1: 2540 opt: 2548  Z-score: 1799.9  bits: 344.2 E(32554): 6.2e-94
Smith-Waterman score: 4911; 86.2% identity (86.3% similar) in 892 aa overlap (1-801:1-861)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::      
CCDS55 MSRGGSYPHLLWDVRKRSLGLEDPSRLRSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCV------
               10        20        30        40        50          

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 DTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
                                :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 -------------------------LTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVI
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              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEIMTVPNDPYTFLSCGEDGTVRWFDTRIKTSCTKE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DCKDDILINCRRAATSVAICPPIPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGM
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VARFIPSHLNNKSCRVTSLCYSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERRE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ELRQPPVKRLRLRGDWSDTGPRARPESERERDGEQSPNVSLMQRMSDMLSRWFEEASEVA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB5 AHSTSSPTESPHSTPLLSSPDSEQRQSVEASGHHTHHQS---------------------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                     
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                                                             460   
pF1KB5 --------------------------------------------------------DNNN
                                                               ::::
CCDS55 KAEQQRQQELAAHTQQQPSTSDQSSHEGSSQDPHASDSPSSVVNKQLGSMSLDEQQDNNN
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EKLSPKPGTGEPVLSLHYSTEGTTTSTIKLNFTDEWSSIASSSRGIGSHCKSEGQEESFV
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       :::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PQSSVQPPEGDSETKAPEESSEDVTKYQEGVSAENPVENHINITQSDKFTAKPLDSNSGE
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pF1KB5 RNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RNDLNLDRSCGVPEESASSEKAKEPETSDQTSTESATNENNTNPEPQFQTEATGPSAHEE
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pF1KB5 TSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDR--------------RSAVARIQEFFRR
       :::::::::::::::::::::::::::::::::              :::::::::::::
CCDS55 TSTRDSALQDTDDSDDDPVLIPGARYRAGPGDRFNIRGTTIGDRIMRRSAVARIQEFFRR
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     690       700       710       720       730       740         
pF1KB5 RKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RKERKEMEELDTLNIRRPLVKMVYKGHRNSRTMIKEANFWGANFVMSGSDCGHIFIWDRH
     750       760       770       780       790       800         

     750       760       770       780       790       800         
pF1KB5 TAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::        
CCDS55 TAEHLMLLEADNHVVNCLQPHPFDPILASSGIDYDIKIWSPLEESRIFNRKLADEVITRN
     810       820       830       840       850       860         

     810       820       830       840       850       860
pF1KB5 ELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
                                                          
CCDS55 ELMLEETRNTITVPASFMLRMLASLNHIRADRLEGDRSEGSGQENENEDEE
     870       880       890       900       910       920

>>CCDS1200.1 DCAF8 gene_id:50717|Hs108|chr1               (597 aa)
 initn: 732 init1: 312 opt: 461  Z-score: 338.0  bits: 73.1 E(32554): 1.7e-12
Smith-Waterman score: 502; 32.5% identity (60.3% similar) in 302 aa overlap (2-291:142-426)

                                            10            20       
pF1KB5                              MSRGGSYPHLLWD----VRKRSLGLEDPSRL
                                     :. .. :.  :.    .:.: ::  . .:.
CCDS12 EQPRRRVQRKRANRDQDSSDDERALEDWVSSETSALPRPRWQALPALRERELG--SSARF
             120       130       140       150       160           

        30        40        50        60        70        80       
pF1KB5 RSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWNDTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLT
         .  : : :.::..:.  :. : :::::. .:. : .. ::::: :.:. .   :. . 
CCDS12 VYEACGARVFVQRFRLQHGLEGHTGCVNTLHFNQRGTWLASGSDDLKVVVWDWVRRQPVL
     170       180       190       200       210       220         

        90       100       110       120       130       140       
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        ..:::..:.:.::::: ..:. .. :. :: .  ...      .   . . : :.....
CCDS12 DFESGHKSNVFQAKFLPNSGDSTLAMCARDGQVRVAELSATQCCKNTKRVAQHKGASHKL
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          :..: :::: :::..:  .: :      :   :::  :       . .  .. . : 
CCDS12 ALEPDSPCTFLSAGEDAVVFTIDLRQDRPASKLVVTKEKEK-------KVGLYTIYVNPA
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pF1KB5 IPYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGMVARFIPSHLNNKSCR--VTSLC
         . .:::  :. :::::.: .            ..:.. .: : :: :.  .  .: : 
CCDS12 NTHQFAVGGRDQFVRIYDQRKIDENE--------NNGVLKKFCPHHLVNSESKANITCLV
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pF1KB5 YSEDGQEILVSYSSDYIYLFDPK-DDTARELKTPSAEERREELRQPPVKRLRLRGDWSDT
       ::.:: :.:.::... ::::. . .: :. .:                            
CCDS12 YSHDGTELLASYNDEDIYLFNSSHSDGAQYVKRYKGHRNNATVKGVNFYGPKSEFVVSGS
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CCDS12 DCGHIFLWEKSSCQIIQFMEGDKGGVVNCLEPHPHLPVLATSGLDHDVKIWAPTAEASTE
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>>CCDS59162.1 DCAF8L2 gene_id:347442|Hs108|chrX           (631 aa)
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                                     :. .. :.  :.:    ..:.::    :: 
CCDS59 EQPRAGPQGSGGNHEQYSLEEDQALEEWVSSETSALPRPRWQVVTALHQRQLG----SRP
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       :  :   : : :.::..:.  :  : :::::. .:. :  . :..:: :... .   .. 
CCDS59 RFVYEACGARAFVQRFRLQYRLADHVGCVNTVHFNQRGTRLASSGDDLKVIVWDWVRQRP
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pF1KB5 LTTIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVIFYTN-VEQDAETNRQCQFTCHYGTT
       . ...:::  :.:.:::::  .:. .. :. :: .  .. .. .  .: .:  . : : .
CCDS59 VLNFESGHTNNVFQAKFLPNCGDSTLAMCARDGQVRVAELINASYFNNTKC-VAQHRGPA
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       ...   :..:: ::. :::..:  .: :     .:     .   : ....  .... :  
CCDS59 HKLALEPDSPYKFLTSGEDAVVFTIDLRQDRPASKVVVTRE---NDKKVGLYTITVNPAN
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pF1KB5 PYYLAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGMVARFIPSHLNNKS--CRVTSLCY
        : .::: .:. :::::.: .  . .        .:.. .: : :: : .    .: . :
CCDS59 TYQFAVGGQDQFVRIYDQRKIDKKEN--------NGVLKKFTPHHLVNCDFPTNITCVVY
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pF1KB5 SEDGQEILVSYSSDYIYLFDPKDDTARELKTPSAEERREELRQPPVKRLRLRGDWSDTGP
       :.:: :.:.::..: ::::.                                        
CCDS59 SHDGTELLASYNDDDIYLFNSSHSDGAQYSKRFKGHRNNTTVKGVNFYGPRSEFVVSGSD
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>>CCDS35222.1 DCAF8L1 gene_id:139425|Hs108|chrX           (600 aa)
 initn: 667 init1: 259 opt: 430  Z-score: 316.2  bits: 69.1 E(32554): 2.7e-11
Smith-Waterman score: 454; 29.5% identity (60.7% similar) in 298 aa overlap (2-291:145-429)

                                            10            20       
pF1KB5                              MSRGGSYPHLLWDV----RKRSLGLEDPSRL
                                     :. .. :.  :.:    :.:.::  . .:.
CCDS35 EQPRMCPRCGGTNHDQCLLDEDQALEEWISSETSALPRSRWQVLTALRQRQLG--SSARF
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pF1KB5 RSRYLGRREFIQRLKLEATLNVHDGCVNTICWNDTGEYILSGSDDTKLVISNPYSRKVLT
         .  : : :.::..:.  :. : : :.:: .:. :  . :..:: .... .   .: . 
CCDS35 VYEACGARTFVQRFRLQYLLGSHAGSVSTIHFNQRGTRLASSGDDLRVIVWDWVRQKPVL
            180       190       200       210       220       230  

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pF1KB5 TIRSGHRANIFSAKFLPCTNDKQIVSCSGDGVIFYTNVEQDAETNRQCQFTCHYGTTYEI
       ...:::  :...:::.:  .:. .. :. :: .  ... . .  .   . . : : ..:.
CCDS35 NFESGHDINVIQAKFFPNCGDSTLAMCGHDGQVRVAELINASYCENTKRVAKHRGPAHEL
            240       250       260       270       280       290  

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          :..:: ::. :::..:  .: :     .:     .   : ....  .... :   : 
CCDS35 ALEPDSPYKFLTSGEDAVVFTIDLRQDRPASKVVVTRE---NDKKVGLYTISMNPANIYQ
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pF1KB5 LAVGCSDSSVRIYDRRMLGTRATGNYAGRGTTGMVARFIPSHL--NNKSCRVTSLCYSED
       .:::  :. :::::.: .  .         ..:.. .: : ::   .    .: . ::.:
CCDS35 FAVGGHDQFVRIYDQRRIDKKE--------NNGVLKKFTPHHLVYCDFPTNITCVVYSHD
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CCDS35 GTELLASYNDEDIYLFNSSLSDGAQYVKRYKGHRNNDTIKCVNFYGPRSEFVVSGSDCGH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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