Result of FASTA (omim) for pF1KB5670
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5670, 925 aa
  1>>>pF1KB5670 925 - 925 aa - 925 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2252+/-0.000476; mu= 16.8568+/- 0.030
 mean_var=97.8519+/-20.125, 0's: 0 Z-trim(110.7): 88  B-trim: 227 in 1/49
 Lambda= 0.129655
 statistics sampled from 19034 (19122) to 19034 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.584), E-opt: 0.2 (0.224), width:  16
 Scan time: 10.310

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_055129 (OMIM: 609631,616298) probable ATP-depen ( 925) 6171 1165.9       0
NP_077024 (OMIM: 608588) probable ATP-dependent RN ( 678)  436 93.1 5.2e-18
XP_016880548 (OMIM: 608588) PREDICTED: probable AT ( 678)  436 93.1 5.2e-18
XP_016880549 (OMIM: 608588) PREDICTED: probable AT ( 678)  436 93.1 5.2e-18
NP_001295063 (OMIM: 189960,609644,614087) Fanconi  ( 669)  363 79.4 6.6e-14
XP_016877012 (OMIM: 189960,609644,614087) PREDICTE (1801)  363 79.7 1.5e-13
NP_065988 (OMIM: 189960,609644,614087) Fanconi ane (2048)  363 79.7 1.6e-13
XP_011535336 (OMIM: 189960,609644,614087) PREDICTE (2053)  363 79.7 1.6e-13
NP_071451 (OMIM: 182250,606951,615846) interferon- (1025)  313 70.2 6.1e-11
NP_001295062 (OMIM: 189960,609644,614087) Fanconi  (2022)  247 58.0 5.5e-07
XP_011535337 (OMIM: 189960,609644,614087) PREDICTE (2027)  247 58.0 5.5e-07
XP_016876611 (OMIM: 138800,180295,601200,606241) P (1787)  205 50.1 0.00012
XP_016876612 (OMIM: 138800,180295,601200,606241) P (1787)  205 50.1 0.00012
XP_011534906 (OMIM: 138800,180295,601200,606241) P (1787)  205 50.1 0.00012
NP_001182502 (OMIM: 138800,180295,601200,606241) e (1829)  205 50.1 0.00012
NP_001258211 (OMIM: 138800,180295,601200,606241) e (1922)  205 50.1 0.00012
XP_011534902 (OMIM: 138800,180295,601200,606241) P (1922)  205 50.1 0.00012
XP_016876609 (OMIM: 138800,180295,601200,606241) P (1922)  205 50.1 0.00012
XP_011534904 (OMIM: 138800,180295,601200,606241) P (1922)  205 50.1 0.00012
NP_085124 (OMIM: 138800,180295,601200,606241) endo (1922)  205 50.1 0.00012
XP_011534903 (OMIM: 138800,180295,601200,606241) P (1922)  205 50.1 0.00012
XP_016876610 (OMIM: 138800,180295,601200,606241) P (1922)  205 50.1 0.00012
NP_803187 (OMIM: 138800,180295,601200,606241) endo (1922)  205 50.1 0.00012
XP_011534901 (OMIM: 138800,180295,601200,606241) P (1922)  205 50.1 0.00012
NP_001278557 (OMIM: 138800,180295,601200,606241) e (1922)  205 50.1 0.00012
XP_011534228 (OMIM: 606286) PREDICTED: probable AT ( 604)  191 47.2 0.00029
XP_011534229 (OMIM: 606286) PREDICTED: probable AT ( 529)  165 42.3  0.0077
XP_011534230 (OMIM: 606286) PREDICTED: probable AT ( 529)  165 42.3  0.0077
NP_061135 (OMIM: 606286) probable ATP-dependent RN ( 648)  165 42.4  0.0091


>>NP_055129 (OMIM: 609631,616298) probable ATP-dependent  (925 aa)
 initn: 6171 init1: 6171 opt: 6171  Z-score: 6240.0  bits: 1165.9 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 6171; 100.0% identity (100.0% similar) in 925 aa overlap (1-925:1-925)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MTTEQRRSLQAFQDYIRKTLDPTYILSYMAPWFREEEVQYIQAEKNNKGPMEAATLFLKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MTTEQRRSLQAFQDYIRKTLDPTYILSYMAPWFREEEVQYIQAEKNNKGPMEAATLFLKF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 LLELQEEGWFRGFLDALDHAGYSGLYEAIESWDFKKIEKLEEYRLLLKRLQPEFKTRIIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LLELQEEGWFRGFLDALDHAGYSGLYEAIESWDFKKIEKLEEYRLLLKRLQPEFKTRIIP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 TDIISDLSECLINQECEEILQICSTKGMMAGAEKLVECLLRSDKENWPKTLKLALEKERN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TDIISDLSECLINQECEEILQICSTKGMMAGAEKLVECLLRSDKENWPKTLKLALEKERN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 KFSELWIVEKGIKDVETEDLEDKMETSDIQIFYQEDPECQNLSENSCPPSEVSDTNLYSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KFSELWIVEKGIKDVETEDLEDKMETSDIQIFYQEDPECQNLSENSCPPSEVSDTNLYSP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 FKPRNYQLELALPAMKGKNTIICAPTGCGKTFVSLLICEHHLKKFPQGQKGKVVFFANQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FKPRNYQLELALPAMKGKNTIICAPTGCGKTFVSLLICEHHLKKFPQGQKGKVVFFANQI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 PVYEQQKSVFSKYFERHGYRVTGISGATAENVPVEQIVENNDIIILTPQILVNNLKKGTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PVYEQQKSVFSKYFERHGYRVTGISGATAENVPVEQIVENNDIIILTPQILVNNLKKGTI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 PSLSIFTLMIFDECHNTSKQHPYNMIMFNYLDQKLGGSSGPLPQVIGLTASVGVGDAKNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PSLSIFTLMIFDECHNTSKQHPYNMIMFNYLDQKLGGSSGPLPQVIGLTASVGVGDAKNT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 DEALDYICKLCASLDASVIATVKHNLEELEQVVYKPQKFFRKVESRISDKFKYIIAQLMR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DEALDYICKLCASLDASVIATVKHNLEELEQVVYKPQKFFRKVESRISDKFKYIIAQLMR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 DTESLAKRICKDLENLSQIQNREFGTQKYEQWIVTVQKACMVFQMPDKDEESRICKALFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DTESLAKRICKDLENLSQIQNREFGTQKYEQWIVTVQKACMVFQMPDKDEESRICKALFL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 YTSHLRKYNDALIISEHARMKDALDYLKDFFSNVRAAGFDEIEQDLTQRFEEKLQELESV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YTSHLRKYNDALIISEHARMKDALDYLKDFFSNVRAAGFDEIEQDLTQRFEEKLQELESV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 SRDPSNENPKLEDLCFILQEEYHLNPETITILFVKTRALVDALKNWIEGNPKLSFLKPGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SRDPSNENPKLEDLCFILQEEYHLNPETITILFVKTRALVDALKNWIEGNPKLSFLKPGI
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 LTGRGKTNQNTGMTLPAQKCILDAFKASGDHNILIATSVADEGIDIAQCNLVILYEYVGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LTGRGKTNQNTGMTLPAQKCILDAFKASGDHNILIATSVADEGIDIAQCNLVILYEYVGN
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB5 VIKMIQTRGRGRARGSKCFLLTSNAGVIEKEQINMYKEKMMNDSILRLQTWDEAVFREKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VIKMIQTRGRGRARGSKCFLLTSNAGVIEKEQINMYKEKMMNDSILRLQTWDEAVFREKI
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB5 LHIQTHEKFIRDSQEKPKPVPDKENKKLLCRKCKALACYTADVRVIEECHYTVLGDAFKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LHIQTHEKFIRDSQEKPKPVPDKENKKLLCRKCKALACYTADVRVIEECHYTVLGDAFKE
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB5 CFVSRPHPKPKQFSSFEKRAKIFCARQNCSHDWGIHVKYKTFEIPVIKIESFVVEDIATG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 CFVSRPHPKPKQFSSFEKRAKIFCARQNCSHDWGIHVKYKTFEIPVIKIESFVVEDIATG
              850       860       870       880       890       900

              910       920     
pF1KB5 VQTLYSKWKDFHFEKIPFDPAEMSK
       :::::::::::::::::::::::::
NP_055 VQTLYSKWKDFHFEKIPFDPAEMSK
              910       920     

>>NP_077024 (OMIM: 608588) probable ATP-dependent RNA he  (678 aa)
 initn: 820 init1: 180 opt: 436  Z-score: 444.4  bits: 93.1 E(85289): 5.2e-18
Smith-Waterman score: 1072; 32.2% identity (61.9% similar) in 693 aa overlap (244-919:4-663)

           220       230       240       250       260       270   
pF1KB5 QEDPECQNLSENSCPPSEVSDTNLYSPFKPRNYQLELALPAMKGKNTIICAPTGCGKTFV
                                     :.:: :. .::..::: ::  ::: ::: .
NP_077                            MELRSYQWEVIMPALEGKNIIIWLPTGAGKTRA
                                          10        20        30   

           280       290       300       310       320       330   
pF1KB5 SLLICEHHLKKFPQGQKGKVVFFANQIPVYEQQKSVFSKYFERHGYRVTGISGATAENVP
       .  . ..::.   .:  .::: ..:.. .  :.   : .... . . :: .::  .  . 
NP_077 AAYVAKRHLETV-DG--AKVVVLVNRVHLVTQHGEEFRRMLDGR-WTVTTLSGDMGPRAG
            40           50        60        70         80         

           340       350       360          370       380       390
pF1KB5 VEQIVENNDIIILTPQILVNNLKKGTIPS---LSIFTLMIFDECHNTSKQHPYNMIMFNY
         .... .:..: : ..:   : .        :..:.:.. ::::.: :.  ::.:: .:
NP_077 FGHLARCHDLLICTAELLQMALTSPEEEEHVELTVFSLIVVDECHHTHKDTVYNVIMSQY
      90       100       110       120       130       140         

              400       410       420       430       440       450
pF1KB5 LDQKLGGSSGPLPQVIGLTASVGVGDAKNTDEALDYICKLCASLDASVIATVKHNLEELE
       :. ::   . :::::.::::: :.: :.. : :.... .:::.::.  : . ..   .:.
NP_077 LELKLQ-RAQPLPQVLGLTASPGTGGASKLDGAINHVLQLCANLDTWCIMSPQNCCPQLQ
     150        160       170       180       190       200        

              460       470       480       490       500       510
pF1KB5 QVVYKPQKFFRKVESRISDKFKYIIAQLMRDTESLAKRICKDLENLSQIQNREFGTQKYE
       .   .: : .   . : .: :  .. .::        .:   :: . .. .:.:::: ::
NP_077 EHSQQPCKQYNLCHRRSQDPFGDLLKKLM-------DQIHDHLE-MPEL-SRKFGTQMYE
      210       220       230              240         250         

              520       530       540       550       560       570
pF1KB5 QWIVTVQKACMVFQMPDKDEESRICKALFLYTSHLRKYNDALIISEHARMKDALDYLKDF
       : .: ...:  .  .    .:.:.      :. :::.:::::.: . .:  :::  :.::
NP_077 QQVVKLSEAAALAGL----QEQRV------YALHLRRYNDALLIHDTVRAVDALAALQDF
     260       270                 280       290       300         

                580       590       600       610       620        
pF1KB5 FS--NVRAAGFDEIEQDLTQRFEEKLQELESVSRDPSNENPKLEDLCFILQEEYHLNPET
       .   .:  . .   :. :   :... .::  ..   . :::::: :  :::...  .   
NP_077 YHREHVTKTQILCAERRLLALFDDRKNELAHLATH-GPENPKLEMLEKILQRQFSSSNSP
     310       320       330       340        350       360        

      630       640       650         660       670       680      
pF1KB5 ITILFVKTRALVDALKNWIEGNPKLSF--LKPGILTGRGKTNQNTGMTLPAQKCILDAFK
         :.:..::  . .:  :.. .  :.   ..  .: : :...:.: ::   :. ... :.
NP_077 RGIIFTRTRQSAHSLLLWLQQQQGLQTVDIRAQLLIGAGNSSQSTHMTQRDQQEVIQKFQ
      370       380       390       400       410       420        

        690       700       710       720       730        740     
pF1KB5 ASGDHNILIATSVADEGIDIAQCNLVILYEYVGNVIKMIQTRGRGRARGS-KCFLLTSNA
        .:  :.:.:::::.::.:: .::.:. :  . : :.:.:.:::.::  :   :. : ..
NP_077 -DGTLNLLVATSVAEEGLDIPHCNVVVRYGLLTNEISMVQARGRARADQSVYAFVATEGS
       430       440       450       460       470       480       

         750       760       770       780              790        
pF1KB5 GVIEKEQINMYKEKMMNDSILRLQTWDEAVFREKILHIQ-------THEKFIRDSQEKPK
         ...: ::   : .:....  .:  :.: .. ::  .:       . .   :..:..  
NP_077 RELKRELINEALETLMEQAVAAVQKMDQAEYQAKIRDLQQAALTKRAAQAAQRENQRQQF
       490       500       510       520       530       540       

      800       810       820       830       840         850      
pF1KB5 PVPDKENKKLLCRKCKALACYTADVRVIEECHYTVLGDAFKECF-VSR-PHPKPKQFSSF
       ::   :. .::: .: . . . .:.: .:  :.. ..  :.. . ::: :    : :...
NP_077 PV---EHVQLLCINCMVAVGHGSDLRKVEGTHHVNVNPNFSNYYNVSRDPVVINKVFKDW
          550       560       570       580       590       600    

        860       870       880       890       900       910      
pF1KB5 EKRAKIFCARQNCSHDWGIHVKYKTFEIPVIKIESFVVEDIATGVQTLYSKWKDFHFEKI
       .  . : :  .::.. ::... ::. ..::.:..:...:     .:.  .::.   :   
NP_077 KPGGVISC--RNCGEVWGLQMIYKSVKLPVLKVRSMLLETPQGRIQA--KKWSRVPFSVP
          610         620       630       640         650       660

        920              
pF1KB5 PFDPAEMSK         
        ::               
NP_077 DFDFLQHCAENLSDLSLD
              670        

>>XP_016880548 (OMIM: 608588) PREDICTED: probable ATP-de  (678 aa)
 initn: 820 init1: 180 opt: 436  Z-score: 444.4  bits: 93.1 E(85289): 5.2e-18
Smith-Waterman score: 1072; 32.2% identity (61.9% similar) in 693 aa overlap (244-919:4-663)

           220       230       240       250       260       270   
pF1KB5 QEDPECQNLSENSCPPSEVSDTNLYSPFKPRNYQLELALPAMKGKNTIICAPTGCGKTFV
                                     :.:: :. .::..::: ::  ::: ::: .
XP_016                            MELRSYQWEVIMPALEGKNIIIWLPTGAGKTRA
                                          10        20        30   

           280       290       300       310       320       330   
pF1KB5 SLLICEHHLKKFPQGQKGKVVFFANQIPVYEQQKSVFSKYFERHGYRVTGISGATAENVP
       .  . ..::.   .:  .::: ..:.. .  :.   : .... . . :: .::  .  . 
XP_016 AAYVAKRHLETV-DG--AKVVVLVNRVHLVTQHGEEFRRMLDGR-WTVTTLSGDMGPRAG
            40           50        60        70         80         

           340       350       360          370       380       390
pF1KB5 VEQIVENNDIIILTPQILVNNLKKGTIPS---LSIFTLMIFDECHNTSKQHPYNMIMFNY
         .... .:..: : ..:   : .        :..:.:.. ::::.: :.  ::.:: .:
XP_016 FGHLARCHDLLICTAELLQMALTSPEEEEHVELTVFSLIVVDECHHTHKDTVYNVIMSQY
      90       100       110       120       130       140         

              400       410       420       430       440       450
pF1KB5 LDQKLGGSSGPLPQVIGLTASVGVGDAKNTDEALDYICKLCASLDASVIATVKHNLEELE
       :. ::   . :::::.::::: :.: :.. : :.... .:::.::.  : . ..   .:.
XP_016 LELKLQ-RAQPLPQVLGLTASPGTGGASKLDGAINHVLQLCANLDTWCIMSPQNCCPQLQ
     150        160       170       180       190       200        

              460       470       480       490       500       510
pF1KB5 QVVYKPQKFFRKVESRISDKFKYIIAQLMRDTESLAKRICKDLENLSQIQNREFGTQKYE
       .   .: : .   . : .: :  .. .::        .:   :: . .. .:.:::: ::
XP_016 EHSQQPCKQYNLCHRRSQDPFGDLLKKLM-------DQIHDHLE-MPEL-SRKFGTQMYE
      210       220       230              240         250         

              520       530       540       550       560       570
pF1KB5 QWIVTVQKACMVFQMPDKDEESRICKALFLYTSHLRKYNDALIISEHARMKDALDYLKDF
       : .: ...:  .  .    .:.:.      :. :::.:::::.: . .:  :::  :.::
XP_016 QQVVKLSEAAALAGL----QEQRV------YALHLRRYNDALLIHDTVRAVDALAALQDF
     260       270                 280       290       300         

                580       590       600       610       620        
pF1KB5 FS--NVRAAGFDEIEQDLTQRFEEKLQELESVSRDPSNENPKLEDLCFILQEEYHLNPET
       .   .:  . .   :. :   :... .::  ..   . :::::: :  :::...  .   
XP_016 YHREHVTKTQILCAERRLLALFDDRKNELAHLATH-GPENPKLEMLEKILQRQFSSSNSP
     310       320       330       340        350       360        

      630       640       650         660       670       680      
pF1KB5 ITILFVKTRALVDALKNWIEGNPKLSF--LKPGILTGRGKTNQNTGMTLPAQKCILDAFK
         :.:..::  . .:  :.. .  :.   ..  .: : :...:.: ::   :. ... :.
XP_016 RGIIFTRTRQSAHSLLLWLQQQQGLQTVDIRAQLLIGAGNSSQSTHMTQRDQQEVIQKFQ
      370       380       390       400       410       420        

        690       700       710       720       730        740     
pF1KB5 ASGDHNILIATSVADEGIDIAQCNLVILYEYVGNVIKMIQTRGRGRARGS-KCFLLTSNA
        .:  :.:.:::::.::.:: .::.:. :  . : :.:.:.:::.::  :   :. : ..
XP_016 -DGTLNLLVATSVAEEGLDIPHCNVVVRYGLLTNEISMVQARGRARADQSVYAFVATEGS
       430       440       450       460       470       480       

         750       760       770       780              790        
pF1KB5 GVIEKEQINMYKEKMMNDSILRLQTWDEAVFREKILHIQ-------THEKFIRDSQEKPK
         ...: ::   : .:....  .:  :.: .. ::  .:       . .   :..:..  
XP_016 RELKRELINEALETLMEQAVAAVQKMDQAEYQAKIRDLQQAALTKRAAQAAQRENQRQQF
       490       500       510       520       530       540       

      800       810       820       830       840         850      
pF1KB5 PVPDKENKKLLCRKCKALACYTADVRVIEECHYTVLGDAFKECF-VSR-PHPKPKQFSSF
       ::   :. .::: .: . . . .:.: .:  :.. ..  :.. . ::: :    : :...
XP_016 PV---EHVQLLCINCMVAVGHGSDLRKVEGTHHVNVNPNFSNYYNVSRDPVVINKVFKDW
          550       560       570       580       590       600    

        860       870       880       890       900       910      
pF1KB5 EKRAKIFCARQNCSHDWGIHVKYKTFEIPVIKIESFVVEDIATGVQTLYSKWKDFHFEKI
       .  . : :  .::.. ::... ::. ..::.:..:...:     .:.  .::.   :   
XP_016 KPGGVISC--RNCGEVWGLQMIYKSVKLPVLKVRSMLLETPQGRIQA--KKWSRVPFSVP
          610         620       630       640         650       660

        920              
pF1KB5 PFDPAEMSK         
        ::               
XP_016 DFDFLQHCAENLSDLSLD
              670        

>>XP_016880549 (OMIM: 608588) PREDICTED: probable ATP-de  (678 aa)
 initn: 820 init1: 180 opt: 436  Z-score: 444.4  bits: 93.1 E(85289): 5.2e-18
Smith-Waterman score: 1072; 32.2% identity (61.9% similar) in 693 aa overlap (244-919:4-663)

           220       230       240       250       260       270   
pF1KB5 QEDPECQNLSENSCPPSEVSDTNLYSPFKPRNYQLELALPAMKGKNTIICAPTGCGKTFV
                                     :.:: :. .::..::: ::  ::: ::: .
XP_016                            MELRSYQWEVIMPALEGKNIIIWLPTGAGKTRA
                                          10        20        30   

           280       290       300       310       320       330   
pF1KB5 SLLICEHHLKKFPQGQKGKVVFFANQIPVYEQQKSVFSKYFERHGYRVTGISGATAENVP
       .  . ..::.   .:  .::: ..:.. .  :.   : .... . . :: .::  .  . 
XP_016 AAYVAKRHLETV-DG--AKVVVLVNRVHLVTQHGEEFRRMLDGR-WTVTTLSGDMGPRAG
            40           50        60        70         80         

           340       350       360          370       380       390
pF1KB5 VEQIVENNDIIILTPQILVNNLKKGTIPS---LSIFTLMIFDECHNTSKQHPYNMIMFNY
         .... .:..: : ..:   : .        :..:.:.. ::::.: :.  ::.:: .:
XP_016 FGHLARCHDLLICTAELLQMALTSPEEEEHVELTVFSLIVVDECHHTHKDTVYNVIMSQY
      90       100       110       120       130       140         

              400       410       420       430       440       450
pF1KB5 LDQKLGGSSGPLPQVIGLTASVGVGDAKNTDEALDYICKLCASLDASVIATVKHNLEELE
       :. ::   . :::::.::::: :.: :.. : :.... .:::.::.  : . ..   .:.
XP_016 LELKLQ-RAQPLPQVLGLTASPGTGGASKLDGAINHVLQLCANLDTWCIMSPQNCCPQLQ
     150        160       170       180       190       200        

              460       470       480       490       500       510
pF1KB5 QVVYKPQKFFRKVESRISDKFKYIIAQLMRDTESLAKRICKDLENLSQIQNREFGTQKYE
       .   .: : .   . : .: :  .. .::        .:   :: . .. .:.:::: ::
XP_016 EHSQQPCKQYNLCHRRSQDPFGDLLKKLM-------DQIHDHLE-MPEL-SRKFGTQMYE
      210       220       230              240         250         

              520       530       540       550       560       570
pF1KB5 QWIVTVQKACMVFQMPDKDEESRICKALFLYTSHLRKYNDALIISEHARMKDALDYLKDF
       : .: ...:  .  .    .:.:.      :. :::.:::::.: . .:  :::  :.::
XP_016 QQVVKLSEAAALAGL----QEQRV------YALHLRRYNDALLIHDTVRAVDALAALQDF
     260       270                 280       290       300         

                580       590       600       610       620        
pF1KB5 FS--NVRAAGFDEIEQDLTQRFEEKLQELESVSRDPSNENPKLEDLCFILQEEYHLNPET
       .   .:  . .   :. :   :... .::  ..   . :::::: :  :::...  .   
XP_016 YHREHVTKTQILCAERRLLALFDDRKNELAHLATH-GPENPKLEMLEKILQRQFSSSNSP
     310       320       330       340        350       360        

      630       640       650         660       670       680      
pF1KB5 ITILFVKTRALVDALKNWIEGNPKLSF--LKPGILTGRGKTNQNTGMTLPAQKCILDAFK
         :.:..::  . .:  :.. .  :.   ..  .: : :...:.: ::   :. ... :.
XP_016 RGIIFTRTRQSAHSLLLWLQQQQGLQTVDIRAQLLIGAGNSSQSTHMTQRDQQEVIQKFQ
      370       380       390       400       410       420        

        690       700       710       720       730        740     
pF1KB5 ASGDHNILIATSVADEGIDIAQCNLVILYEYVGNVIKMIQTRGRGRARGS-KCFLLTSNA
        .:  :.:.:::::.::.:: .::.:. :  . : :.:.:.:::.::  :   :. : ..
XP_016 -DGTLNLLVATSVAEEGLDIPHCNVVVRYGLLTNEISMVQARGRARADQSVYAFVATEGS
       430       440       450       460       470       480       

         750       760       770       780              790        
pF1KB5 GVIEKEQINMYKEKMMNDSILRLQTWDEAVFREKILHIQ-------THEKFIRDSQEKPK
         ...: ::   : .:....  .:  :.: .. ::  .:       . .   :..:..  
XP_016 RELKRELINEALETLMEQAVAAVQKMDQAEYQAKIRDLQQAALTKRAAQAAQRENQRQQF
       490       500       510       520       530       540       

      800       810       820       830       840         850      
pF1KB5 PVPDKENKKLLCRKCKALACYTADVRVIEECHYTVLGDAFKECF-VSR-PHPKPKQFSSF
       ::   :. .::: .: . . . .:.: .:  :.. ..  :.. . ::: :    : :...
XP_016 PV---EHVQLLCINCMVAVGHGSDLRKVEGTHHVNVNPNFSNYYNVSRDPVVINKVFKDW
          550       560       570       580       590       600    

        860       870       880       890       900       910      
pF1KB5 EKRAKIFCARQNCSHDWGIHVKYKTFEIPVIKIESFVVEDIATGVQTLYSKWKDFHFEKI
       .  . : :  .::.. ::... ::. ..::.:..:...:     .:.  .::.   :   
XP_016 KPGGVISC--RNCGEVWGLQMIYKSVKLPVLKVRSMLLETPQGRIQA--KKWSRVPFSVP
          610         620       630       640         650       660

        920              
pF1KB5 PFDPAEMSK         
        ::               
XP_016 DFDFLQHCAENLSDLSLD
              670        

>>NP_001295063 (OMIM: 189960,609644,614087) Fanconi anem  (669 aa)
 initn: 303 init1: 111 opt: 363  Z-score: 370.6  bits: 79.4 E(85289): 6.6e-14
Smith-Waterman score: 403; 23.1% identity (55.6% similar) in 649 aa overlap (201-808:47-637)

              180       190       200        210       220         
pF1KB5 LKLALEKERNKFSELWIVEKGIKDVETEDLEDKMETSD-IQIFYQEDPECQNLSENSCPP
                                     : ..:..: . .    . : :   ::.   
NP_001 SRSSGTPGCSSGTERPQSPGSSKAPLPAAAEAQLESDDDVLLVAAYEAERQLCLENGGFC
         20        30        40        50        60        70      

     230       240        250       260       270       280        
pF1KB5 SEVSDTNLYSPFKP-RNYQLELALPAMKGKNTIICAPTGCGKTFVSLLICEHHLKKFPQG
       . ..   .:    : :.:::...  :.   ::..: ::: ::::.. ..  .  . ::. 
NP_001 TSAGALWIYPTNCPVRDYQLHISRAALFC-NTLVCLPTGLGKTFIAAVVMYNFYRWFPS-
         80        90       100        110       120       130     

      290       300       310          320       330       340     
pF1KB5 QKGKVVFFANQIPVYEQQKSVFSKYF---ERHGYRVTGISGATAENVPVEQIVENNDIII
         :::::.:   :.  ::  .  . .   . :  ..:: . :...    ..:  .. ...
NP_001 --GKVVFMAPTKPLVTQQIEACYQVMGIPQSHMAEMTGSTQASTR----KEIWCSKRVLF
            140       150       160       170           180        

         350       360       370       380       390       400     
pF1KB5 LTPQILVNNLKKGTIPSLSIFTLMIFDECHNTSKQHPYNMIMFNYLDQKLGGSSGPLPQV
       ::::..::.:..:. :.  :  :.: :: :..  .. : ...     ..:   .. . ..
NP_001 LTPQVMVNDLSRGACPAAEIKCLVI-DEAHKALGNYAYCQVV-----RELVKYTNHF-RI
      190       200       210        220            230        240 

         410       420         430        440       450       460  
pF1KB5 IGLTASVGVGDAKNTDEALD--YICKL-CASLDASVIATVKHNLEELEQVVYKPQKFFRK
       ..:.:. : .: : .....    : ..   : :.  : : .:. ...:...  :   . .
NP_001 LALSATPG-SDIKAVQQVITNLLIGQIELRSEDSPDILTYSHE-RKVEKLIV-P---LGE
              250       260       270       280        290         

            470       480          490       500          510      
pF1KB5 VESRISDKFKYIIAQLMRDTESLAKR---ICKDLENLSQIQ---NREFGTQKYEQWIVTV
         . :.  .  :. .. :   :: .:   . .:. ::.. :    :.   ..    :: .
NP_001 ELAAIQKTYIQILESFAR---SLIQRNVLMRRDIPNLTKYQIILARDQFRKNPSPNIVGI
         300       310          320       330       340       350  

                520       530       540       550         560      
pF1KB5 QKA--------CMVFQMPDKDEESRICKALFLYTSHLRKYNDALIIS--EHARMKDAL--
       :..        :. .    .  ..   ..:...   .   . ..  :  : .: .: .  
NP_001 QQGIIEGEFAICISLYHGYELLQQMGMRSLYFFLCGIMDGTKGMTRSKNELGRNEDFMKL
            360       370       380       390       400       410  

           570          580        590          600             610
pF1KB5 -DYLKDFFSNVR---AAGFDEIEQ-DLTQRF---EEKLQELESV------SRDPSNENPK
        ..:. .:. .:   : :.. :.: : ...:   . ::..:: :      : .  : . :
NP_001 YNHLECMFARTRSTSANGISAIQQGDKNKKFVYSHPKLKKLEEVVIEHFKSWNAENTTEK
            420       430       440       450       460       470  

              620       630       640       650       660       670
pF1KB5 LEDLCFILQEEYHLNPETITILFVKTRALVDALKNWIEGNPKLSFLKPGILTGRGKTNQN
        .:             :: ...: . :  :. . . .  .  .  ..   ..:... ...
NP_001 KRD-------------ETRVMIFSSFRDSVQEIAEMLSQHQPI--IRVMTFVGHASGKST
                         480       490       500         510       

              680       690       700       710       720       730
pF1KB5 TGMTLPAQKCILDAFKASGDHNILIATSVADEGIDIAQCNLVILYEYVGNVIKMIQTRGR
        :.:   :  ..  :. .: .: :..: :..::.::.. .:.: ..   . :...:  ::
NP_001 KGFTQKEQLEVVKQFR-DGGYNTLVSTCVGEEGLDIGEVDLIICFDSQKSPIRLVQRMGR
       520       530        540       550       560       570      

               740       750       760       770       780         
pF1KB5 -GRARGSKCFLLTSNAGVIEKEQINMYKEKMMNDSILRLQTWDEAVFREKILHIQTHEKF
        :: : ..  .. :..           .:...:.:    :.  .....     :..... 
NP_001 TGRKRQGRIVIILSEG----------REERIYNQS----QSNKRSIYKA----ISSNRQV
        580       590                 600           610            

     790       800       810       820       830       840         
pF1KB5 IRDSQEKPKPVPDKENKKLLCRKCKALACYTADVRVIEECHYTVLGDAFKECFVSRPHPK
       ..  :..:. :::  : ::                                         
NP_001 LHFYQRSPRMVPDGINPKLHKMFITHGVYEPEKPSRNLQRKSSIFSYRDGK         
      620       630       640       650       660                  

>>XP_016877012 (OMIM: 189960,609644,614087) PREDICTED: F  (1801 aa)
 initn: 169 init1: 108 opt: 363  Z-score: 364.4  bits: 79.7 E(85289): 1.5e-13
Smith-Waterman score: 403; 23.1% identity (55.6% similar) in 649 aa overlap (201-808:47-637)

              180       190       200        210       220         
pF1KB5 LKLALEKERNKFSELWIVEKGIKDVETEDLEDKMETSD-IQIFYQEDPECQNLSENSCPP
                                     : ..:..: . .    . : :   ::.   
XP_016 SRSSGTPGCSSGTERPQSPGSSKAPLPAAAEAQLESDDDVLLVAAYEAERQLCLENGGFC
         20        30        40        50        60        70      

     230       240        250       260       270       280        
pF1KB5 SEVSDTNLYSPFKP-RNYQLELALPAMKGKNTIICAPTGCGKTFVSLLICEHHLKKFPQG
       . ..   .:    : :.:::...  :.   ::..: ::: ::::.. ..  .  . ::. 
XP_016 TSAGALWIYPTNCPVRDYQLHISRAALFC-NTLVCLPTGLGKTFIAAVVMYNFYRWFPS-
         80        90       100        110       120       130     

      290       300       310          320       330       340     
pF1KB5 QKGKVVFFANQIPVYEQQKSVFSKYF---ERHGYRVTGISGATAENVPVEQIVENNDIII
         :::::.:   :.  ::  .  . .   . :  ..:: . :...    ..:  .. ...
XP_016 --GKVVFMAPTKPLVTQQIEACYQVMGIPQSHMAEMTGSTQASTR----KEIWCSKRVLF
            140       150       160       170           180        

         350       360       370       380       390       400     
pF1KB5 LTPQILVNNLKKGTIPSLSIFTLMIFDECHNTSKQHPYNMIMFNYLDQKLGGSSGPLPQV
       ::::..::.:..:. :.  :  :.: :: :..  .. : ...     ..:   .. . ..
XP_016 LTPQVMVNDLSRGACPAAEIKCLVI-DEAHKALGNYAYCQVV-----RELVKYTNHF-RI
      190       200       210        220            230        240 

         410       420         430        440       450       460  
pF1KB5 IGLTASVGVGDAKNTDEALD--YICKL-CASLDASVIATVKHNLEELEQVVYKPQKFFRK
       ..:.:. : .: : .....    : ..   : :.  : : .:. ...:...  :   . .
XP_016 LALSATPG-SDIKAVQQVITNLLIGQIELRSEDSPDILTYSHE-RKVEKLIV-P---LGE
              250       260       270       280        290         

            470       480          490       500          510      
pF1KB5 VESRISDKFKYIIAQLMRDTESLAKR---ICKDLENLSQIQ---NREFGTQKYEQWIVTV
         . :.  .  :. .. :   :: .:   . .:. ::.. :    :.   ..    :: .
XP_016 ELAAIQKTYIQILESFAR---SLIQRNVLMRRDIPNLTKYQIILARDQFRKNPSPNIVGI
         300       310          320       330       340       350  

                520       530       540       550         560      
pF1KB5 QKA--------CMVFQMPDKDEESRICKALFLYTSHLRKYNDALIIS--EHARMKDAL--
       :..        :. .    .  ..   ..:...   .   . ..  :  : .: .: .  
XP_016 QQGIIEGEFAICISLYHGYELLQQMGMRSLYFFLCGIMDGTKGMTRSKNELGRNEDFMKL
            360       370       380       390       400       410  

           570          580        590          600             610
pF1KB5 -DYLKDFFSNVR---AAGFDEIEQ-DLTQRF---EEKLQELESV------SRDPSNENPK
        ..:. .:. .:   : :.. :.: : ...:   . ::..:: :      : .  : . :
XP_016 YNHLECMFARTRSTSANGISAIQQGDKNKKFVYSHPKLKKLEEVVIEHFKSWNAENTTEK
            420       430       440       450       460       470  

              620       630       640       650       660       670
pF1KB5 LEDLCFILQEEYHLNPETITILFVKTRALVDALKNWIEGNPKLSFLKPGILTGRGKTNQN
        .:             :: ...: . :  :. . . .  .  .  ..   ..:... ...
XP_016 KRD-------------ETRVMIFSSFRDSVQEIAEMLSQHQPI--IRVMTFVGHASGKST
                         480       490       500         510       

              680       690       700       710       720       730
pF1KB5 TGMTLPAQKCILDAFKASGDHNILIATSVADEGIDIAQCNLVILYEYVGNVIKMIQTRGR
        :.:   :  ..  :. .: .: :..: :..::.::.. .:.: ..   . :...:  ::
XP_016 KGFTQKEQLEVVKQFR-DGGYNTLVSTCVGEEGLDIGEVDLIICFDSQKSPIRLVQRMGR
       520       530        540       550       560       570      

               740       750       760       770       780         
pF1KB5 -GRARGSKCFLLTSNAGVIEKEQINMYKEKMMNDSILRLQTWDEAVFREKILHIQTHEKF
        :: : ..  .. :..           .:...:.:    :.  .....     :..... 
XP_016 TGRKRQGRIVIILSEG----------REERIYNQS----QSNKRSIYKA----ISSNRQV
        580       590                 600           610            

     790       800       810       820       830       840         
pF1KB5 IRDSQEKPKPVPDKENKKLLCRKCKALACYTADVRVIEECHYTVLGDAFKECFVSRPHPK
       ..  :..:. :::  : ::                                         
XP_016 LHFYQRSPRMVPDGINPKLHKMFITHGVYEPEKPSRNLQRKSSIFSYRDGMRQSSLKKDW
      620       630       640       650       660       670        

>>NP_065988 (OMIM: 189960,609644,614087) Fanconi anemia   (2048 aa)
 initn: 169 init1: 108 opt: 363  Z-score: 363.6  bits: 79.7 E(85289): 1.6e-13
Smith-Waterman score: 403; 23.1% identity (55.6% similar) in 649 aa overlap (201-808:47-637)

              180       190       200        210       220         
pF1KB5 LKLALEKERNKFSELWIVEKGIKDVETEDLEDKMETSD-IQIFYQEDPECQNLSENSCPP
                                     : ..:..: . .    . : :   ::.   
NP_065 SRSSGTPGCSSGTERPQSPGSSKAPLPAAAEAQLESDDDVLLVAAYEAERQLCLENGGFC
         20        30        40        50        60        70      

     230       240        250       260       270       280        
pF1KB5 SEVSDTNLYSPFKP-RNYQLELALPAMKGKNTIICAPTGCGKTFVSLLICEHHLKKFPQG
       . ..   .:    : :.:::...  :.   ::..: ::: ::::.. ..  .  . ::. 
NP_065 TSAGALWIYPTNCPVRDYQLHISRAALFC-NTLVCLPTGLGKTFIAAVVMYNFYRWFPS-
         80        90       100        110       120       130     

      290       300       310          320       330       340     
pF1KB5 QKGKVVFFANQIPVYEQQKSVFSKYF---ERHGYRVTGISGATAENVPVEQIVENNDIII
         :::::.:   :.  ::  .  . .   . :  ..:: . :...    ..:  .. ...
NP_065 --GKVVFMAPTKPLVTQQIEACYQVMGIPQSHMAEMTGSTQASTR----KEIWCSKRVLF
            140       150       160       170           180        

         350       360       370       380       390       400     
pF1KB5 LTPQILVNNLKKGTIPSLSIFTLMIFDECHNTSKQHPYNMIMFNYLDQKLGGSSGPLPQV
       ::::..::.:..:. :.  :  :.: :: :..  .. : ...     ..:   .. . ..
NP_065 LTPQVMVNDLSRGACPAAEIKCLVI-DEAHKALGNYAYCQVV-----RELVKYTNHF-RI
      190       200       210        220            230        240 

         410       420         430        440       450       460  
pF1KB5 IGLTASVGVGDAKNTDEALD--YICKL-CASLDASVIATVKHNLEELEQVVYKPQKFFRK
       ..:.:. : .: : .....    : ..   : :.  : : .:. ...:...  :   . .
NP_065 LALSATPG-SDIKAVQQVITNLLIGQIELRSEDSPDILTYSHE-RKVEKLIV-P---LGE
              250       260       270       280        290         

            470       480          490       500          510      
pF1KB5 VESRISDKFKYIIAQLMRDTESLAKR---ICKDLENLSQIQ---NREFGTQKYEQWIVTV
         . :.  .  :. .. :   :: .:   . .:. ::.. :    :.   ..    :: .
NP_065 ELAAIQKTYIQILESFAR---SLIQRNVLMRRDIPNLTKYQIILARDQFRKNPSPNIVGI
         300       310          320       330       340       350  

                520       530       540       550         560      
pF1KB5 QKA--------CMVFQMPDKDEESRICKALFLYTSHLRKYNDALIIS--EHARMKDAL--
       :..        :. .    .  ..   ..:...   .   . ..  :  : .: .: .  
NP_065 QQGIIEGEFAICISLYHGYELLQQMGMRSLYFFLCGIMDGTKGMTRSKNELGRNEDFMKL
            360       370       380       390       400       410  

           570          580        590          600             610
pF1KB5 -DYLKDFFSNVR---AAGFDEIEQ-DLTQRF---EEKLQELESV------SRDPSNENPK
        ..:. .:. .:   : :.. :.: : ...:   . ::..:: :      : .  : . :
NP_065 YNHLECMFARTRSTSANGISAIQQGDKNKKFVYSHPKLKKLEEVVIEHFKSWNAENTTEK
            420       430       440       450       460       470  

              620       630       640       650       660       670
pF1KB5 LEDLCFILQEEYHLNPETITILFVKTRALVDALKNWIEGNPKLSFLKPGILTGRGKTNQN
        .:             :: ...: . :  :. . . .  .  .  ..   ..:... ...
NP_065 KRD-------------ETRVMIFSSFRDSVQEIAEMLSQHQPI--IRVMTFVGHASGKST
                         480       490       500         510       

              680       690       700       710       720       730
pF1KB5 TGMTLPAQKCILDAFKASGDHNILIATSVADEGIDIAQCNLVILYEYVGNVIKMIQTRGR
        :.:   :  ..  :. .: .: :..: :..::.::.. .:.: ..   . :...:  ::
NP_065 KGFTQKEQLEVVKQFR-DGGYNTLVSTCVGEEGLDIGEVDLIICFDSQKSPIRLVQRMGR
       520       530        540       550       560       570      

               740       750       760       770       780         
pF1KB5 -GRARGSKCFLLTSNAGVIEKEQINMYKEKMMNDSILRLQTWDEAVFREKILHIQTHEKF
        :: : ..  .. :..           .:...:.:    :.  .....     :..... 
NP_065 TGRKRQGRIVIILSEG----------REERIYNQS----QSNKRSIYKA----ISSNRQV
        580       590                 600           610            

     790       800       810       820       830       840         
pF1KB5 IRDSQEKPKPVPDKENKKLLCRKCKALACYTADVRVIEECHYTVLGDAFKECFVSRPHPK
       ..  :..:. :::  : ::                                         
NP_065 LHFYQRSPRMVPDGINPKLHKMFITHGVYEPEKPSRNLQRKSSIFSYRDGMRQSSLKKDW
      620       630       640       650       660       670        

>>XP_011535336 (OMIM: 189960,609644,614087) PREDICTED: F  (2053 aa)
 initn: 169 init1: 108 opt: 363  Z-score: 363.6  bits: 79.7 E(85289): 1.6e-13
Smith-Waterman score: 403; 23.1% identity (55.6% similar) in 649 aa overlap (201-808:47-637)

              180       190       200        210       220         
pF1KB5 LKLALEKERNKFSELWIVEKGIKDVETEDLEDKMETSD-IQIFYQEDPECQNLSENSCPP
                                     : ..:..: . .    . : :   ::.   
XP_011 SRSSGTPGCSSGTERPQSPGSSKAPLPAAAEAQLESDDDVLLVAAYEAERQLCLENGGFC
         20        30        40        50        60        70      

     230       240        250       260       270       280        
pF1KB5 SEVSDTNLYSPFKP-RNYQLELALPAMKGKNTIICAPTGCGKTFVSLLICEHHLKKFPQG
       . ..   .:    : :.:::...  :.   ::..: ::: ::::.. ..  .  . ::. 
XP_011 TSAGALWIYPTNCPVRDYQLHISRAALFC-NTLVCLPTGLGKTFIAAVVMYNFYRWFPS-
         80        90       100        110       120       130     

      290       300       310          320       330       340     
pF1KB5 QKGKVVFFANQIPVYEQQKSVFSKYF---ERHGYRVTGISGATAENVPVEQIVENNDIII
         :::::.:   :.  ::  .  . .   . :  ..:: . :...    ..:  .. ...
XP_011 --GKVVFMAPTKPLVTQQIEACYQVMGIPQSHMAEMTGSTQASTR----KEIWCSKRVLF
            140       150       160       170           180        

         350       360       370       380       390       400     
pF1KB5 LTPQILVNNLKKGTIPSLSIFTLMIFDECHNTSKQHPYNMIMFNYLDQKLGGSSGPLPQV
       ::::..::.:..:. :.  :  :.: :: :..  .. : ...     ..:   .. . ..
XP_011 LTPQVMVNDLSRGACPAAEIKCLVI-DEAHKALGNYAYCQVV-----RELVKYTNHF-RI
      190       200       210        220            230        240 

         410       420         430        440       450       460  
pF1KB5 IGLTASVGVGDAKNTDEALD--YICKL-CASLDASVIATVKHNLEELEQVVYKPQKFFRK
       ..:.:. : .: : .....    : ..   : :.  : : .:. ...:...  :   . .
XP_011 LALSATPG-SDIKAVQQVITNLLIGQIELRSEDSPDILTYSHE-RKVEKLIV-P---LGE
              250       260       270       280        290         

            470       480          490       500          510      
pF1KB5 VESRISDKFKYIIAQLMRDTESLAKR---ICKDLENLSQIQ---NREFGTQKYEQWIVTV
         . :.  .  :. .. :   :: .:   . .:. ::.. :    :.   ..    :: .
XP_011 ELAAIQKTYIQILESFAR---SLIQRNVLMRRDIPNLTKYQIILARDQFRKNPSPNIVGI
         300       310          320       330       340       350  

                520       530       540       550         560      
pF1KB5 QKA--------CMVFQMPDKDEESRICKALFLYTSHLRKYNDALIIS--EHARMKDAL--
       :..        :. .    .  ..   ..:...   .   . ..  :  : .: .: .  
XP_011 QQGIIEGEFAICISLYHGYELLQQMGMRSLYFFLCGIMDGTKGMTRSKNELGRNEDFMKL
            360       370       380       390       400       410  

           570          580        590          600             610
pF1KB5 -DYLKDFFSNVR---AAGFDEIEQ-DLTQRF---EEKLQELESV------SRDPSNENPK
        ..:. .:. .:   : :.. :.: : ...:   . ::..:: :      : .  : . :
XP_011 YNHLECMFARTRSTSANGISAIQQGDKNKKFVYSHPKLKKLEEVVIEHFKSWNAENTTEK
            420       430       440       450       460       470  

              620       630       640       650       660       670
pF1KB5 LEDLCFILQEEYHLNPETITILFVKTRALVDALKNWIEGNPKLSFLKPGILTGRGKTNQN
        .:             :: ...: . :  :. . . .  .  .  ..   ..:... ...
XP_011 KRD-------------ETRVMIFSSFRDSVQEIAEMLSQHQPI--IRVMTFVGHASGKST
                         480       490       500         510       

              680       690       700       710       720       730
pF1KB5 TGMTLPAQKCILDAFKASGDHNILIATSVADEGIDIAQCNLVILYEYVGNVIKMIQTRGR
        :.:   :  ..  :. .: .: :..: :..::.::.. .:.: ..   . :...:  ::
XP_011 KGFTQKEQLEVVKQFR-DGGYNTLVSTCVGEEGLDIGEVDLIICFDSQKSPIRLVQRMGR
       520       530        540       550       560       570      

               740       750       760       770       780         
pF1KB5 -GRARGSKCFLLTSNAGVIEKEQINMYKEKMMNDSILRLQTWDEAVFREKILHIQTHEKF
        :: : ..  .. :..           .:...:.:    :.  .....     :..... 
XP_011 TGRKRQGRIVIILSEG----------REERIYNQS----QSNKRSIYKA----ISSNRQV
        580       590                 600           610            

     790       800       810       820       830       840         
pF1KB5 IRDSQEKPKPVPDKENKKLLCRKCKALACYTADVRVIEECHYTVLGDAFKECFVSRPHPK
       ..  :..:. :::  : ::                                         
XP_011 LHFYQRSPRMVPDGINPKLHKMFITHGVYEPEKPSRNLQRKSSIFSYRDGMRQSSLKKDW
      620       630       640       650       660       670        

>>NP_071451 (OMIM: 182250,606951,615846) interferon-indu  (1025 aa)
 initn: 1061 init1: 218 opt: 313  Z-score: 317.4  bits: 70.2 E(85289): 6.1e-11
Smith-Waterman score: 1300; 32.1% identity (58.1% similar) in 995 aa overlap (49-922:54-1017)

       20        30        40        50        60         70       
pF1KB5 TLDPTYILSYMAPWFREEEVQYIQAEKNNKGPMEAATLFLKFLLE-LQEEGWFRGFLDAL
                                     : :.:. :.:. : . . . :: : :..::
NP_071 MYIQVEPVLDYLTFLPAEVKEQIQRTVATSGNMQAVELLLSTLEKGVWHLGWTREFVEAL
            30        40        50        60        70        80   

        80          90         100        110       120        130 
pF1KB5 DHAG--YSGLYEAIESWDFKK--IEKL-EEYRLLLKRLQPEFKTRIIPTDIISD-LSECL
        ..:   .. :   :  :. .  .:.  .::  ::. ::: .  ...  :...  . : :
NP_071 RRTGSPLAARYMNPELTDLPSPSFENAHDEYLQLLNLLQPTLVDKLLVRDVLDKCMEEEL
            90       100       110       120       130       140   

             140       150       160       170       180           
pF1KB5 INQECEEILQICSTKGMMAGAEKLVECLLRSDKENWPKTLKLALEKERNK--FSELWIVE
       .. : .. .    ..:  .:...:.. ...  :::: ...  .:..  :.   .::   .
NP_071 LTIEDRNRIAAAENNGNESGVRELLKRIVQ--KENWFSAFLNVLRQTGNNELVQELTGSD
           150       160       170         180       190       200 

     190       200               210         220       230         
pF1KB5 KGIKDVETEDL--------EDKMETSDIQIFYQED--PECQNLSENSCPPSEV---SDTN
        . ...: :.:        :... .. .:   ...     .: ::.:   : :   :::.
NP_071 CSESNAEIENLSQVDGPQVEEQLLSTTVQPNLEKEVWGMENNSSESSFADSSVVSESDTS
             210       220       230       240       250       260 

                                             240          250      
pF1KB5 LY-------------------------------------SP---FKPRNYQLELALPAMK
       :                                      ::   .. : ::.:.: ::..
NP_071 LAEGSVSCLDESLGHNSNMGSDSGTMGSDSDEENVAARASPEPELQLRPYQMEVAQPALE
             270       280       290       300       310       320 

        260       270       280        290       300       310     
pF1KB5 GKNTIICAPTGCGKTFVSLLICEHHL-KKFPQGQKGKVVFFANQIPVYEQQKSVFSKYFE
       ::: ::: ::: ::: :.. : . :: ::   .. :::. ..:.. . ::   .: : :.
NP_071 GKNIIICLPTGSGKTRVAVYIAKDHLDKKKKASEPGKVIVLVNKVLLVEQ---LFRKEFQ
             330       340       350       360       370           

            320       330       340       350          360         
pF1KB5 ---RHGYRVTGISGATAENVPVEQIVENNDIIILTPQILVN---NLKKGTIPS--LSIFT
          .. ::: :.:: :  ..   ..:.. :::: : ::: :   ::..:   .  :: :.
NP_071 PFLKKWYRVIGLSGDTQLKISFPEVVKSCDIIISTAQILENSLLNLENGEDAGVQLSDFS
      380       390       400       410       420       430        

       370       380       390       400               410         
pF1KB5 LMIFDECHNTSKQHPYNMIMFNYLDQKLGGSSG--------PLPQVIGLTASVGVGDAKN
       :.:.::::.:.:.  :: :: .:: ::: ..          ::::..::::: ::: : .
NP_071 LIIIDECHHTNKEAVYNNIMRHYLMQKLKNNRLKKENKPVIPLPQILGLTASPGVGGATK
      440       450       460       470       480       490        

     420       430       440       450       460       470         
pF1KB5 TDEALDYICKLCASLDASVIATVKHNLEELEQVVYKPQKFFRKVESRISDKFKYIIAQLM
         .: ..: ::::.::: .: :::.::..:.. . .: : :  ...   : ::  . ..:
NP_071 QAKAEEHILKLCANLDAFTIKTVKENLDQLKNQIQEPCKKFAIADATREDPFKEKLLEIM
      500       510       520       530       540       550        

     480       490       500       510       520       530         
pF1KB5 RDTESLAKRICKDLENLSQIQNREFGTQKYEQWIVTVQKACMVFQMPDKDEESRICKALF
          ..     :.    .: ...  :::: :::: . ..:        . ... :.:    
NP_071 TRIQTY----CQ----MSPMSD--FGTQPYEQWAIQMEKKA----AKEGNRKERVC----
      560               570         580           590       600    

     540       550       560       570                         580 
pF1KB5 LYTSHLRKYNDALIISEHARMKDALDYLKDFFSNVRAAGF------------------DE
         . ::::::.:: :..  :: ::  .:. :... .   :                  ::
NP_071 --AEHLRKYNEALQINDTIRMIDAYTHLETFYNEEKDKKFAVIEDDSDEGGDDEYCDGDE
                610       620       630       640       650        

                     590            600       610       620        
pF1KB5 IEQDL--------TQRFEEKL-----QELESVSRDPSNENPKLEDLCFILQEEYHLNPET
        :.::        :.::   :     . :. ....:  :: ::  :   ..:.:  . :.
NP_071 DEDDLKKPLKLDETDRFLMTLFFENNKMLKRLAENPEYENEKLTKLRNTIMEQYTRTEES
      660       670       680       690       700       710        

      630        640       650         660       670       680     
pF1KB5 IT-ILFVKTRALVDALKNWIEGNPKLSFL--KPGILTGRGKTNQNTGMTLPAQKCILDAF
          :.:.:::  . ::..::  : :.. .  :   : : :....   ::   :: ... :
NP_071 ARGIIFTKTRQSAYALSQWITENEKFAEVGVKAHHLIGAGHSSEFKPMTQNEQKEVISKF
      720       730       740       750       760       770        

         690       700       710       720       730       740     
pF1KB5 KASGDHNILIATSVADEGIDIAQCNLVILYEYVGNVIKMIQTRGRGRARGSKCFLLT-SN
       . .:  :.::::.::.::.:: .::.:: :  : : : :.:.:::.::  :   :.. :.
NP_071 R-TGKINLLIATTVAEEGLDIKECNIVIRYGLVTNEIAMVQARGRARADESTYVLVAHSG
       780       790       800       810       820       830       

          750       760       770       780          790       800 
pF1KB5 AGVIEKEQINMYKEKMMNDSILRLQTWDEAVFREKILHIQTH---EKFIRDSQEKPKPVP
       .::::.: .: ..::::  .:  .:.     . .:::..: .   :: .. ...  :   
NP_071 SGVIEHETVNDFREKMMYKAIHCVQNMKPEEYAHKILELQMQSIMEKKMKTKRNIAKHY-
       840       850       860       870       880       890       

                810       820       830       840        850       
pF1KB5 DKENKKL---LCRKCKALACYTADVRVIEECHYTVLGDAFKECFVSRPHPK-PKQFSSFE
        :.: .:   ::..:..:::   :..:::. :.. .   ::: .. : .    :. ....
NP_071 -KNNPSLITFLCKNCSVLACSGEDIHVIEKMHHVNMTPEFKELYIVRENKALQKKCADYQ
         900       910       920       930       940       950     

       860       870       880       890       900       910       
pF1KB5 KRAKIFCARQNCSHDWGIHVKYKTFEIPVIKIESFVVEDIATGVQTLYSKWKDFHFEKIP
         ..:.:   .:.. ::  . .: ...: .::..:::    ....  :.:: .. .    
NP_071 INGEIIC---KCGQAWGTMMVHKGLDLPCLKIRNFVVVFKNNSTKKQYKKWVELPITFPN
         960          970       980       990      1000      1010  

       920          
pF1KB5 FDPAEMSK     
       .: .:        
NP_071 LDYSECCLFSDED
           1020     

>>NP_001295062 (OMIM: 189960,609644,614087) Fanconi anem  (2022 aa)
 initn: 169 init1: 108 opt: 247  Z-score: 246.4  bits: 58.0 E(85289): 5.5e-07
Smith-Waterman score: 383; 23.4% identity (52.9% similar) in 629 aa overlap (201-808:47-611)

              180       190       200        210       220         
pF1KB5 LKLALEKERNKFSELWIVEKGIKDVETEDLEDKMETSD-IQIFYQEDPECQNLSENSCPP
                                     : ..:..: . .    . : :   ::.   
NP_001 SRSSGTPGCSSGTERPQSPGSSKAPLPAAAEAQLESDDDVLLVAAYEAERQLCLENGGFC
         20        30        40        50        60        70      

     230       240        250       260       270       280        
pF1KB5 SEVSDTNLYSPFKP-RNYQLELALPAMKGKNTIICAPTGCGKTFVSLLICEHHLKKFPQG
       . ..   .:    : :.:::...  :.   ::..: ::: ::::.. ..  .  . ::. 
NP_001 TSAGALWIYPTNCPVRDYQLHISRAALFC-NTLVCLPTGLGKTFIAAVVMYNFYRWFPS-
         80        90       100        110       120       130     

      290       300       310          320       330       340     
pF1KB5 QKGKVVFFANQIPVYEQQKSVFSKYF---ERHGYRVTGISGATAENVPVEQIVENNDIII
         :::::.:   :.  ::  .  . .   . :  ..:: . :...    ..:  .. ...
NP_001 --GKVVFMAPTKPLVTQQIEACYQVMGIPQSHMAEMTGSTQASTR----KEIWCSKRVLF
            140       150       160       170           180        

         350       360       370       380           390       400 
pF1KB5 LTPQILVNNLKKGTIPSLSIFTLMIFDECHNTSKQHPY----NMIMFNYLDQKLGGSSGP
       ::::..::.:..:. :.  :  :.: :: :..  .. :    .... : :  ..   :  
NP_001 LTPQVMVNDLSRGACPAAEIKCLVI-DEAHKALGNYAYCQAVQQVITNLLIGQIELRSED
      190       200       210        220       230       240       

             410       420       430       440       450       460 
pF1KB5 LPQVIGLTASVGVGDAKNTDEALDYICKLCASLDASVIATVKHNLEELEQVVYKPQKFFR
        :...  .    :       : :  :  :   : :..  :  . :: . . . . . ..:
NP_001 SPDILTYSHERKV-------EKL--IVPLGEEL-AAIQKTYIQILESFARSLIQRNVLMR
       250       260                270        280       290       

             470       480       490        500       510       520
pF1KB5 KVESRISDKFKYIIAQLMRDTESLAKRICKDLENLSQ-IQNREFGTQKYEQWIVTVQKAC
       .    : .  :: :  : ::  .. :    .. ...: : . ::.       :   .   
NP_001 R---DIPNLTKYQII-LARD--QFRKNPSPNIVGIQQGIIEGEFAIC-----ISLYHGYE
          300        310         320       330            340      

              530       540       550       560       570       580
pF1KB5 MVFQMPDKDEESRICKALFLYTSHLRKYNDALIISEHARMKDALDYLKDFFSNVRAAGFD
       .. ::  ..    .:  .    .  :. :.     .  .. . :. .     .. : :..
NP_001 LLQQMGMRSLYFFLCGIMDGTKGMTRSKNELGRNEDFMKLYNHLECMFARTRSTSANGIS
        350       360       370       380       390       400      

               590          600             610       620       630
pF1KB5 EIEQ-DLTQRF---EEKLQELESV------SRDPSNENPKLEDLCFILQEEYHLNPETIT
        :.: : ...:   . ::..:: :      : .  : . : .:             :: .
NP_001 AIQQGDKNKKFVYSHPKLKKLEEVVIEHFKSWNAENTTEKKRD-------------ETRV
        410       420       430       440                    450   

              640       650       660       670       680       690
pF1KB5 ILFVKTRALVDALKNWIEGNPKLSFLKPGILTGRGKTNQNTGMTLPAQKCILDAFKASGD
       ..: . :  :. . . .  .  .  ..   ..:... ... :.:   :  ..  :. .: 
NP_001 MIFSSFRDSVQEIAEMLSQHQPI--IRVMTFVGHASGKSTKGFTQKEQLEVVKQFR-DGG
           460       470         480       490       500        510

              700       710       720       730        740         
pF1KB5 HNILIATSVADEGIDIAQCNLVILYEYVGNVIKMIQTRGR-GRARGSKCFLLTSNAGVIE
       .: :..: :..::.::.. .:.: ..   . :...:  :: :: : ..  .. :..    
NP_001 YNTLVSTCVGEEGLDIGEVDLIICFDSQKSPIRLVQRMGRTGRKRQGRIVIILSEG----
              520       530       540       550       560          

     750       760       770       780       790       800         
pF1KB5 KEQINMYKEKMMNDSILRLQTWDEAVFREKILHIQTHEKFIRDSQEKPKPVPDKENKKLL
              .:...:.:    :.  .....     :..... ..  :..:. :::  : :: 
NP_001 ------REERIYNQS----QSNKRSIYKA----ISSNRQVLHFYQRSPRMVPDGINPKLH
              570           580           590       600       610  

     810       820       830       840       850       860         
pF1KB5 CRKCKALACYTADVRVIEECHYTVLGDAFKECFVSRPHPKPKQFSSFEKRAKIFCARQNC
                                                                   
NP_001 KMFITHGVYEPEKPSRNLQRKSSIFSYRDGMRQSSLKKDWFLSEEEFKLWNRLYRLRDSD
            620       630       640       650       660       670  




925 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 17:56:18 2016 done: Thu Nov  3 17:56:19 2016
 Total Scan time: 10.310 Total Display time:  0.290

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com