Result of FASTA (ccds) for pF1KB5634
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5634, 784 aa
  1>>>pF1KB5634 784 - 784 aa - 784 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9573+/-0.000986; mu= 18.2402+/- 0.060
 mean_var=91.8696+/-18.467, 0's: 0 Z-trim(106.5): 194  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.133810
 statistics sampled from 8838 (9037) to 8838 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.634), E-opt: 0.2 (0.278), width:  16
 Scan time:  3.290

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS10804.1 CDH5 gene_id:1003|Hs108|chr16          ( 784) 5186 1011.9       0
CCDS11977.1 CDH20 gene_id:28316|Hs108|chr18        ( 801) 1925 382.3 1.6e-105
CCDS3889.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5           ( 790) 1845 366.9 7.2e-101
CCDS3893.1 CDH9 gene_id:1007|Hs108|chr5            ( 789) 1840 365.9 1.4e-100
CCDS3894.1 CDH6 gene_id:1004|Hs108|chr5            ( 790) 1834 364.8 3.1e-100
CCDS3892.1 CDH10 gene_id:1008|Hs108|chr5           ( 788) 1830 364.0 5.3e-100
CCDS10802.1 CDH8 gene_id:1006|Hs108|chr16          ( 799) 1823 362.7 1.4e-99
CCDS9586.1 CDH24 gene_id:64403|Hs108|chr14         ( 781) 1781 354.5 3.7e-97
CCDS11993.1 CDH7 gene_id:1005|Hs108|chr18          ( 785) 1776 353.6 7.3e-97
CCDS3890.1 CDH12 gene_id:1010|Hs108|chr5           ( 794) 1756 349.7 1.1e-95
CCDS11994.1 CDH19 gene_id:28513|Hs108|chr18        ( 772) 1668 332.7 1.4e-90
CCDS10803.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16         ( 796) 1502 300.7 6.2e-81
CCDS13395.1 CDH22 gene_id:64405|Hs108|chr20        ( 828) 1431 287.0 8.5e-77
CCDS82259.1 CDH7 gene_id:1005|Hs108|chr18          ( 630) 1411 283.1   1e-75
CCDS81992.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16         ( 670) 1300 261.6   3e-69
CCDS82991.1 CDH12 gene_id:1010|Hs108|chr5          ( 754) 1279 257.6 5.4e-68
CCDS75229.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5          ( 575) 1247 251.4 3.2e-66
CCDS54835.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5          ( 574) 1245 251.0 4.1e-66
CCDS81993.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16         ( 693) 1215 245.2 2.6e-64
CCDS10976.1 CDH15 gene_id:1013|Hs108|chr16         ( 814) 1168 236.2 1.6e-61
CCDS59325.1 CDH19 gene_id:28513|Hs108|chr18        ( 490) 1092 221.4 2.8e-57
CCDS9585.1 CDH24 gene_id:64403|Hs108|chr14         ( 819) 1075 218.3 4.1e-56
CCDS77172.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18          ( 875) 1013 206.3 1.7e-52
CCDS11891.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18          ( 906) 1013 206.3 1.8e-52
CCDS58784.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20          ( 842) 1004 204.6 5.6e-52
CCDS13488.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20          ( 916) 1004 204.6   6e-52
CCDS82004.1 CDH3 gene_id:1001|Hs108|chr16          ( 784)  798 164.8   5e-40
CCDS13485.1 CDH26 gene_id:60437|Hs108|chr20        ( 832)  679 141.8 4.3e-33
CCDS3785.1 DCHS2 gene_id:54798|Hs108|chr4          (2916)  599 126.7 5.2e-28
CCDS75329.1 PCDHGA3 gene_id:56112|Hs108|chr5       ( 829)  570 120.8 9.3e-27
CCDS47290.1 PCDHGA3 gene_id:56112|Hs108|chr5       ( 932)  570 120.8   1e-26
CCDS58487.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16         ( 674)  553 117.4 7.7e-26
CCDS58486.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16         ( 713)  553 117.5   8e-26
CCDS58485.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16         ( 760)  553 117.5 8.4e-26
CCDS81769.1 PCDH9 gene_id:5101|Hs108|chr13         (1032)  539 114.9   7e-25
CCDS42423.1 DSG2 gene_id:1829|Hs108|chr18          (1118)  539 114.9 7.5e-25
CCDS81770.1 PCDH9 gene_id:5101|Hs108|chr13         (1195)  539 114.9 7.9e-25
CCDS9443.1 PCDH9 gene_id:5101|Hs108|chr13          (1203)  539 114.9 7.9e-25
CCDS9444.1 PCDH9 gene_id:5101|Hs108|chr13          (1237)  539 114.9 8.1e-25
CCDS75336.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5       ( 817)  526 112.3 3.3e-24
CCDS54927.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5       ( 932)  526 112.3 3.7e-24
CCDS11897.1 DSG4 gene_id:147409|Hs108|chr18        (1040)  526 112.4   4e-24
CCDS45845.1 DSG4 gene_id:147409|Hs108|chr18        (1059)  526 112.4 4.1e-24
CCDS58472.1 CDH16 gene_id:1014|Hs108|chr16         ( 732)  516 110.3 1.2e-23
CCDS10823.1 CDH16 gene_id:1014|Hs108|chr16         ( 829)  516 110.4 1.3e-23
CCDS81472.1 CDH23 gene_id:64072|Hs108|chr10        (1381)  513 109.9 2.9e-23
CCDS11898.1 DSG3 gene_id:1830|Hs108|chr18          ( 999)  511 109.4 2.9e-23
CCDS75348.1 PCDHGC3 gene_id:5098|Hs108|chr5        ( 863)  509 109.0 3.4e-23
CCDS4261.1 PCDHGC3 gene_id:5098|Hs108|chr5         ( 934)  509 109.0 3.6e-23
CCDS75344.1 PCDHGB7 gene_id:56099|Hs108|chr5       ( 808)  503 107.8 7.1e-23


>>CCDS10804.1 CDH5 gene_id:1003|Hs108|chr16               (784 aa)
 initn: 5186 init1: 5186 opt: 5186  Z-score: 5410.2  bits: 1011.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5186; 100.0% identity (100.0% similar) in 784 aa overlap (1-784:1-784)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MQRLMMLLATSGACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTHRRQKRDWIWNQMHIDEEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MQRLMMLLATSGACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTHRRQKRDWIWNQMHIDEEK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 NTSLPHHVGKIKSSVSRKNAKYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIERLDRENISEYHLTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NTSLPHHVGKIKSSVSRKNAKYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIERLDRENISEYHLTA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 VIVDKDTGENLETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAVGTSVISVTAVDADD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VIVDKDTGENLETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAVGTSVISVTAVDADD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 PTVGDHASVMYQILKGKEYFAIDNSGRIITITKSLDREKQARYEIVVEARDAQGLRGDSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PTVGDHASVMYQILKGKEYFAIDNSGRIITITKSLDREKQARYEIVVEARDAQGLRGDSG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 TATVLVTLQDINDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVEDPDEPQNRMTKYSILRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TATVLVTLQDINDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVEDPDEPQNRMTKYSILRG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 DYQDAFTIETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTIDLRYMSPPAGNRAQVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DYQDAFTIETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTIDLRYMSPPAGNRAQVI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 INITDVDEPPIFQQPFYHFQLKENQKKPLIGTVLAMDPDAARHSIGYSIRRTSDKGQFFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 INITDVDEPPIFQQPFYHFQLKENQKKPLIGTVLAMDPDAARHSIGYSIRRTSDKGQFFR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 VTKKGDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTPTGKESIVQVHIEVLDENDNAPEFA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VTKKGDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTPTGKESIVQVHIEVLDENDNAPEFA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 KPYQPKVCENAVHGQLVLQISAIDKDITPRNVKFKFILNTENNFTLTDNHDNTANITVKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KPYQPKVCENAVHGQLVLQISAIDKDITPRNVKFKFILNTENNFTLTDNHDNTANITVKY
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 GQFDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVCKCNEQGEFTFCEDMAAQVGVSIQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GQFDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVCKCNEQGEFTFCEDMAAQVGVSIQA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 VVAILLCILTITVITLLIFLRRRLRKQARAHGKSVPEIHEQLVTYDEEGGGEMDTTSYDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VVAILLCILTITVITLLIFLRRRLRKQARAHGKSVPEIHEQLVTYDEEGGGEMDTTSYDV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 SVLNSVRRGGAKPPRPALDARPSLYAQVQKPPRHAPGAHGGPGEMAAMIEVKKDEADHDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SVLNSVRRGGAKPPRPALDARPSLYAQVQKPPRHAPGAHGGPGEMAAMIEVKKDEADHDG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB5 DGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDSSDSDVDYDFLNDWGPRFKMLAELYGSDPRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDSSDSDVDYDFLNDWGPRFKMLAELYGSDPRE
              730       740       750       760       770       780

           
pF1KB5 ELLY
       ::::
CCDS10 ELLY
           

>>CCDS11977.1 CDH20 gene_id:28316|Hs108|chr18             (801 aa)
 initn: 1581 init1: 433 opt: 1925  Z-score: 2007.8  bits: 382.3 E(32554): 1.6e-105
Smith-Waterman score: 1925; 41.6% identity (69.0% similar) in 781 aa overlap (16-776:24-793)

                       10        20        30           40         
pF1KB5         MQRLMMLLATSGACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLL---P-THRRQKRD
                              ::. ..... . .   : . ..::   : .:.: ::.
CCDS11 MWTSGRMSNAKNWLGLGMSLYFWGLMDLTTTVLSDTPTPQGELEALLSDKPQSHQRTKRS
               10        20        30        40        50        60

       50        60        70        80          90       100      
pF1KB5 WIWNQMHIDEEKNTSLPHHVGKIKSSVSRKNA--KYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIE
       :.:::. . :: . . : .:::..:...: ..  ::.:.:: .: :: .:  :::. ::.
CCDS11 WVWNQFFVLEEYTGTDPLYVGKLHSDMDRGDGSIKYILSGEGAGIVFTIDDTTGDIHAIQ
               70        80        90       100       110       120

        110       120       130       140       150       160      
pF1KB5 RLDRENISEYHLTAVIVDKDTGENLETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAV
       :::::. ..: : :  .:. ::. .:  : : ::..:.::: : :    . :.::: : :
CCDS11 RLDREERAQYTLRAQALDRRTGRPMEPESEFIIKIQDINDNEPKFLDGPYVATVPEMSPV
              130       140       150       160       170       180

        170       180       190       200        210       220     
pF1KB5 GTSVISVTAVDADDPTVGDHASVMYQILKGKEYFAIDN-SGRIITITKSLDREKQARYEI
       :::::.:::.:::::: :. : :.:.::.:. ::..:. .: : :   ..::: .  ::.
CCDS11 GTSVIQVTATDADDPTYGNSARVVYSILQGQPYFSVDSKTGVIRTALMNMDREAKEYYEV
              190       200       210       220       230       240

         230        240       250       260       270       280    
pF1KB5 VVEARDAQG-LRGDSGTATVLVTLQDINDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVED
       ...:.:  : : : .::.:: .::.:.::: : : : .: . : :.. ....:: .:..:
CCDS11 IIQAKDMGGQLGGLAGTTTVNITLSDVNDNPPRFPQKHYQMSVLESAPISSTVGRVFAKD
              250       260       270       280       290       300

          290       300       310       320       330       340    
pF1KB5 PDEPQNRMTKYSILRGDYQDAFTIETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTI
        ::  :   ::.:. ::  ::: : :.:  . :::   :::..:  ..:.. ::...: .
CCDS11 LDEGINAEMKYTIVDGDGADAFDISTDPNFQVGIITVKKPLSFESKKSYTLKVEGANPHL
              310       320       330       340       350       360

          350        360       370       380        390       400  
pF1KB5 DLRYMS-PPAGNRAQVIINITDVDEPPIFQQPFYHFQLKENQK-KPLIGTVLAMDPDAAR
       ..:...  :  . . : :.. ::::::.:.  ::  .. :.      :  . : :::.. 
CCDS11 EMRFLNLGPFQDTTTVHISVEDVDEPPVFEPGFYFVEVPEDVAIGTTIQIISAKDPDVTN
              370       380       390       400       410       420

            410       420        430       440       450       460 
pF1KB5 HSIGYSIRRTSDKGQFFRVT-KKGDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTPTGKES
       .:: ::: :.:: :.:: :    : ... . :::: . :.:.:: : :...   :.   :
CCDS11 NSIRYSIDRSSDPGRFFYVDITTGALMTARPLDREEFSWHNITVLAMEMNN---PSQVGS
              430       440       450       460       470          

             470       480       490       500       510        520
pF1KB5 IVQVHIEVLDENDNAPEFAKPYQPKVCENAVHGQLVLQISAIDKDITPRNVK-FKFILNT
        : : :.::: ::::::: . :.  :::::  :::.  .::.:.:  ::: . : . :  
CCDS11 -VPVTIKVLDVNDNAPEFPRFYEAFVCENAKAGQLIQTVSAVDQD-DPRNGQHFYYSLAP
        480       490       500       510       520        530     

                  530       540       550       560       570      
pF1KB5 EN----NFTLTDNHDNTANITVKYGQFDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVC
       :     :::. ::.:::: : .. . : ... .:  ::..:.:.:.:  ..:.:::. ::
CCDS11 EAANNPNFTIRDNQDNTARILTRRSGFRQQEQSVFHLPILIADSGQPVLSSTGTLTIQVC
         540       550       560       570       580       590     

        580       590         600       610       620       630    
pF1KB5 KCNEQGEFTFCEDMAAQVGVSIQ--AVVAILLCILTITVITLLIFLRRRLRKQARAHGKS
       .:...:.   :   : .. ::..  :..::: ::... :..:::.  :: :::       
CCDS11 SCDDDGHVMSCSPEAYMLPVSLSRGALIAILACIFVLLVLVLLILSMRRHRKQPYIIDDE
         600       610       620       630       640       650     

          640       650       660         670       680       690  
pF1KB5 VPEIHEQLVTYDEEGGGEMDTTSYDVSVLNSVR--RGGAKPPRPALDARPSLYAQVQKPP
         .:::..: ::.::::: :: ..:.... . :  ..:: :      .: ..  ....  
CCDS11 -ENIHENIVRYDDEGGGEEDTEAFDIAAMWNPREAQAGAAPK-----TRQDMLPEIESLS
          660       670       680       690            700         

            700       710       720       730       740       750  
pF1KB5 RHAPGAHGGPGEMAAMIEVKKDEADHDGDGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDSSD
       :..: . .  . . ... .:  ::: :  .::.:.:. : .::. :.: ::::: . .::
CCDS11 RYVPQTCAVNSTVHSYVLAKLYEADMDLWAPPFDSLQTYMFEGDGSVAGSLSSLQSATSD
     710       720       730       740       750       760         

            760       770       780    
pF1KB5 SDVDYDFLNDWGPRFKMLAELYGSDPREELLY
       :. ..:::.::::::. ::::::.        
CCDS11 SEQSFDFLTDWGPRFRKLAELYGASEGPAPLW
     770       780       790       800 

>>CCDS3889.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5                (790 aa)
 initn: 1502 init1: 398 opt: 1845  Z-score: 1924.4  bits: 366.9 E(32554): 7.2e-101
Smith-Waterman score: 1845; 41.4% identity (68.9% similar) in 747 aa overlap (42-775:48-782)

              20        30        40        50        60        70 
pF1KB5 GACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTHRRQKRDWIWNQMHIDEEKNTSLPHHVGKI
                                     :.: :: :.:::. . ::.    :..:::.
CCDS38 FVQRCYGTAHHSSIKVMRNQTKHIEGETEVHHRPKRGWVWNQFFVLEEHMGPDPQYVGKL
        20        30        40        50        60        70       

              80          90       100       110       120         
pF1KB5 KSSVSRKNA--KYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIERLDRENISEYHLTAVIVDKDTGE
       .:. .. ..  ::.: :: .: .: .:  :::. . . ::::. ..: : :  .:. :..
CCDS38 HSNSDKGDGSVKYILTGEGAGTIFIIDDTTGDIHSTKSLDREQKTHYVLHAQAIDRRTNK
        80        90       100       110       120       130       

     130       140       150       160       170       180         
pF1KB5 NLETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAVGTSVISVTAVDADDPTVGDHASV
        ::  : : :::.:.::: : ::   . ..::: : .::::..:::.:::::: :. : :
CCDS38 PLEPESEFIIKVQDINDNAPKFTDGPYIVTVPEMSDMGTSVLQVTATDADDPTYGNSARV
       140       150       160       170       180       190       

     190       200        210       220       230        240       
pF1KB5 MYQILKGKEYFAID-NSGRIITITKSLDREKQARYEIVVEARDAQGLRGD-SGTATVLVT
       .:.::.:. ::..: ..: : :  ...::: . .: .:..:.:  :  :  ::..:: .:
CCDS38 VYSILQGQPYFSVDPKTGVIRTALHNMDREAREHYSVVIQAKDMAGQVGGLSGSTTVNIT
       200       210       220       230       240       250       

       250       260       270       280       290       300       
pF1KB5 LQDINDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVEDPDEPQNRMTKYSILRGDYQDAFT
       : :.::: : : : .: . :::...::..::.. ..: :  .:    :::. :: .  :.
CCDS38 LTDVNDNPPRFPQKHYQLYVPESAQVGSAVGKIKANDADTGSNADMTYSIINGDGMGIFS
       260       270       280       290       300       310       

       310       320       330       340       350        360      
pF1KB5 IETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTIDLRYMS-PPAGNRAQVIINITDV
       : :.    :::..  :::.::  ..:.. .:...  .:.:.    :  . ... : . ::
CCDS38 ISTDKETREGILSLKKPLNYEKKKSYTLNIEGANTHLDFRFSHLGPFKDATMLKIIVGDV
       320       330       340       350       360       370       

        370       380        390       400       410       420     
pF1KB5 DEPPIFQQPFYHFQLKENQK-KPLIGTVLAMDPDAARHSIGYSIRRTSDKGQFFRV-TKK
       ::::.:..: : ... :: :   ..:::::.:::..   . : :  . .  .:: . .. 
CCDS38 DEPPLFSMPSYLMEVYENAKIGTVVGTVLAQDPDSTNSLVRYFINYNVEDDRFFNIDANT
       380       390       400       410       420       430       

          430       440       450       460       470       480    
pF1KB5 GDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTPTGKESIVQVHIEVLDENDNAPEFAKPYQ
       : : . : ::::  ::::.:: :.:.:.        : : : :.::: ::: ::.:. :.
CCDS38 GTIRTTKVLDREETPWYNITVTASEIDNPDL----LSHVTVGIRVLDVNDNPPELAREYD
       440       450       460           470       480       490   

          490       500       510           520       530       540
pF1KB5 PKVCENAVHGQLVLQISAIDKDITPRNVKFKFILN----TENNFTLTDNHDNTANITVKY
         ::::.  ::..  ::: :::    . .:.:.:.    .. :::: ::.::::.: .. 
CCDS38 IIVCENSKPGQVIHTISATDKDDFANGPRFNFFLDERLPVNPNFTLKDNEDNTASILTRR
           500       510       520       530       540       550   

              550       560       570       580         590        
pF1KB5 GQFDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVCKCNEQGEFTFC--EDMAAQVGVSI
        .:.:    :..::..:::.:.:: ...::::. :: :...:.   :  : . ...:.: 
CCDS38 RRFSRTVQDVYYLPIMISDGGIPSLSSSSTLTIRVCACERDGRVRTCHAEAFLSSAGLST
           560       570       580       590       600       610   

      600       610       620       630       640       650        
pF1KB5 QAVVAILLCILTITVITLLIFLRRRLRKQARAHGKSVPEIHEQLVTYDEEGGGEMDTTSY
        :..:::::.: . .:..:..  :: .:.      :  ...:..::::.::::: :: ..
CCDS38 GALIAILLCVLILLAIVVLFITLRRSKKEPLI--ISEEDVRENVVTYDDEGGGEEDTEAF
           620       630       640         650       660       670 

      660       670       680       690       700       710        
pF1KB5 DVSVLNSVRRGGAKPPRPALDARPSLYAQVQKPPRHAPGAHGGPGEMAAMIEVKKDEADH
       :...: .   ..:.  .   : ::    .:.  :::  ..     ..  .:. .  ::: 
CCDS38 DITALRN--PSAAEELKYRRDIRP----EVKLTPRHQTSSTLESIDVQEFIKQRLAEADL
               680       690           700       710       720     

      720       730       740       750       760       770        
pF1KB5 DGDGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDSSDSDVDYDFLNDWGPRFKMLAELYGSDP
       : . ::::.:. :.:::..: : :.::: . ...:: :: .:.::::.:: ::::::   
CCDS38 DPSVPPYDSLQTYAYEGQRSEAGSISSLDSATTQSDQDYHYLGDWGPEFKKLAELYGEIE
         730       740       750       760       770       780     

      780    
pF1KB5 REELLY
             
CCDS38 SERTT 
         790 

>>CCDS3893.1 CDH9 gene_id:1007|Hs108|chr5                 (789 aa)
 initn: 1538 init1: 440 opt: 1840  Z-score: 1919.2  bits: 365.9 E(32554): 1.4e-100
Smith-Waterman score: 1840; 41.4% identity (69.5% similar) in 751 aa overlap (43-777:49-784)

             20        30        40        50        60        70  
pF1KB5 ACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTHRRQKRDWIWNQMHIDEEKNTSLPHHVGKIK
                                     :: :: :.:::. . :: . .  ..:::..
CCDS38 VDTILLQEKPNSYLSSKKIAGLTKDDGKMLRRTKRGWMWNQFFLLEEYTGTDTQYVGKLH
       20        30        40        50        60        70        

               80        90       100       110       120       130
pF1KB5 SSVSRK--NAKYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIERLDRENISEYHLTAVIVDKDTGEN
       .. ..   : ::.: :. .:..: .: .:::. : ..::::. : : : :  .:. ::..
CCDS38 TDQDKGDGNLKYILTGDGAGSLFVIDENTGDIHAAKKLDREEKSLYILRAKAIDRKTGRQ
       80        90       100       110       120       130        

              140       150       160       170       180       190
pF1KB5 LETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAVGTSVISVTAVDADDPTVGDHASVM
       .:  : : ::.::.::: : ::. :..::::: :.::::::.:::.:::: . :. :.:.
CCDS38 VEPESEFIIKIHDINDNEPKFTKDLYTASVPEMSGVGTSVIQVTATDADDANYGNSAKVV
      140       150       160       170       180       190        

              200        210       220       230        240        
pF1KB5 YQILKGKEYFAID-NSGRIITITKSLDREKQARYEIVVEARDAQG-LRGDSGTATVLVTL
       :.::.:. ::..: .:: : :   ...::.. .:..:..:.:  : . : :::.:: .::
CCDS38 YSILQGQPYFSVDPESGIIKTALPDMSRENREQYQVVIQAKDMGGQMGGLSGTTTVNITL
      200       210       220       230       240       250        

      250       260       270       280       290       300        
pF1KB5 QDINDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVEDPDEPQNRMTKYSILRGDYQDAFTI
        :.:.: : : :. : :  ::.. .:: .: . ..:::  .:   .::: .::  : : .
CCDS38 TDVNNNPPRFPQSTYQFNSPESVPLGTHLGRIKANDPDVGENAEMEYSIAEGDGADMFDV
      260       270       280       290       300       310        

      310       320       330       340       350        360       
pF1KB5 ETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTIDLRYMS-PPAGNRAQVIINITDVD
        :.   .::::   . ::.:  . :.. :.:..   : :..   :  . : : :.. :.:
CCDS38 ITDKDTQEGIITVKQNLDFENQMLYTLRVDASNTHPDPRFLHLGPFKDTAVVKISVEDID
      320       330       340       350       360       370        

       370       380        390       400       410       420      
pF1KB5 EPPIFQQPFYHFQLKENQKK-PLIGTVLAMDPDAARHSIGYSIRRTSDKGQFFRV-TKKG
       :::.: .  : ... :. :.  .:: : :.::::  . : ::. : .:  ..: . ...:
CCDS38 EPPVFTKVSYLIEVDEDVKEGSIIGQVTAYDPDARNNLIKYSVDRHTDMDRIFGIHSENG
      380       390       400       410       420       430        

         430       440       450       460       470       480     
pF1KB5 DIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTPTGKESIVQVHIEVLDENDNAPEFAKPYQP
       .:.. : ::::  ::.:.:: : :...   :  . : . : :..:: ::.:::::  :. 
CCDS38 SIFTLKALDRESSPWHNITVTATEINN---PK-QSSHIPVFIRILDINDHAPEFAMYYET
      440       450       460           470       480       490    

         490       500       510             520       530         
pF1KB5 KVCENAVHGQLVLQISAIDKDITPRNVKF------KFILNTENNFTLTDNHDNTANITVK
        :::::  :::.  .:..:::  ::. ::      .: ::   :::..::.::::.: ..
CCDS38 FVCENAKPGQLIQTVSVMDKDDPPRGHKFFFEPVPEFTLNP--NFTIVDNKDNTAGIMTR
          500       510       520       530         540       550  

     540       550       560       570       580         590       
pF1KB5 YGQFDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVCKCNEQGEFTFC--EDMAAQVGVS
          ..:.. ....::..: :: .: ...:.:::. :: :..::..  :  : .  ..:.:
CCDS38 KDGYSRNKMSTYLLPILIFDNDYPIQSSTGTLTIRVCACDNQGNMQSCTAEALILSAGLS
            560       570       580       590       600       610  

       600       610       620       630       640       650       
pF1KB5 IQAVVAILLCILTITVITLLIFLRRRLRKQARAHGKSVPEIHEQLVTYDEEGGGEMDTTS
         :.::::::.: . ....:.   .: ::. .    :  ......:::..::::: :: .
CCDS38 TGALVAILLCVLILLILVVLFAALKRQRKK-EPLIISKDDVRDNIVTYNDEGGGEEDTQA
            620       630       640        650       660       670 

       660        670       680       690       700       710      
pF1KB5 YDVSVL-NSVRRGGAKPPRPALDARPSLYAQVQKPPRHAPGAHGGPGEMAAMIEVKKDEA
       .:...: :   :  .:  :   :. :    :..   : .:  ..   ..  .:. .  : 
CCDS38 FDIGTLRNPEAREDSKLRR---DVMPETIFQIR---RTVPLWEN--IDVQDFIHRRLKEN
             680       690          700            710       720   

        720       730       740       750       760       770      
pF1KB5 DHDGDGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDSSDSDVDYDFLNDWGPRFKMLAELYGS
       : : ..::::.:  :.:::..:::.::::: . ..: . :::.:.::::::: ::..::.
CCDS38 DADPSAPPYDSLATYAYEGNDSIADSLSSLESLTADCNQDYDYLSDWGPRFKKLADMYGG
           730       740       750       760       770       780   

        780    
pF1KB5 DPREELLY
       :       
CCDS38 DDSDRD  
               

>>CCDS3894.1 CDH6 gene_id:1004|Hs108|chr5                 (790 aa)
 initn: 1444 init1: 416 opt: 1834  Z-score: 1912.9  bits: 364.8 E(32554): 3.1e-100
Smith-Waterman score: 1834; 39.9% identity (68.5% similar) in 794 aa overlap (3-775:5-782)

                 10        20        30        40            50    
pF1KB5   MQRLMMLLATSGACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTHR----RQKRDWIWNQM
           : ..::   :     :..     ... ::.. .  :  . .    :.::.:.:::.
CCDS38 MRTYRYFLLLFWVGQPYPTLSTPLSKRTSGFPAKKRALELSGNSKNELNRSKRSWMWNQF
               10        20        30        40        50        60

           60        70        80          90       100       110  
pF1KB5 HIDEEKNTSLPHHVGKIKSSVSRKNA--KYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIERLDREN
        . :: . :  ..:::..:. .: ..  ::.:.:. .: .: .. .:::. : .:::::.
CCDS38 FLLEEYTGSDYQYVGKLHSDQDRGDGSLKYILSGDGAGDLFIINENTGDIQATKRLDREE
               70        80        90       100       110       120

            120       130       140       150       160       170  
pF1KB5 ISEYHLTAVIVDKDTGENLETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAVGTSVIS
          : : :  ... ::. .:  : : ::.::.::: :.::.....:.::: : ::: :..
CCDS38 KPVYILRAQAINRRTGRPVEPESEFIIKIHDINDNEPIFTKEVYTATVPEMSDVGTFVVQ
              130       140       150       160       170       180

            180       190       200        210       220       230 
pF1KB5 VTAVDADDPTVGDHASVMYQILKGKEYFAIDN-SGRIITITKSLDREKQARYEIVVEARD
       :::.:::::: :. :.:.:.::.:. ::.... .: : :   ..:::.. .:..:..:.:
CCDS38 VTATDADDPTYGNSAKVVYSILQGQPYFSVESETGIIKTALLNMDRENREQYQVVIQAKD
              190       200       210       220       230       240

              240       250       260       270       280       290
pF1KB5 AQG-LRGDSGTATVLVTLQDINDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVEDPDEPQN
         : . : :::.:: .:: :.::: : : :. : : .::..  :: .: . . : :  .:
CCDS38 MGGQMGGLSGTTTVNITLTDVNDNPPRFPQSTYQFKTPESSPPGTPIGRIKASDADVGEN
              250       260       270       280       290       300

              300       310       320       330       340       350
pF1KB5 RMTKYSILRGDYQDAFTIETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTIDLRYMS
          .:::  :.  : : . :.   .::::   : ::.:  . :.. :::..: .. :.. 
CCDS38 AEIEYSITDGEGLDMFDVITDQETQEGIITVKKLLDFEKKKVYTLKVEASNPYVEPRFLY
              310       320       330       340       350       360

               360       370       380        390       400        
pF1KB5 -PPAGNRAQVIINITDVDEPPIFQQPFYHFQLKEN-QKKPLIGTVLAMDPDAARHSIGYS
         :  . : : : . ::::::.:..  : .:..:. : .  ::.: :.::::::. . ::
CCDS38 LGPFKDSATVRIVVEDVDEPPVFSKLAYILQIREDAQINTTIGSVTAQDPDAARNPVKYS
              370       380       390       400       410       420

      410       420        430       440       450       460       
pF1KB5 IRRTSDKGQFFRV-TKKGDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTPTGKESIVQVHI
       . : .:  ..: . . .:.:.. : ::::.  :.:.:: : :...   :  . : : ..:
CCDS38 VDRHTDMDRIFNIDSGNGSIFTSKLLDRETLLWHNITVIATEINN---PK-QSSRVPLYI
              430       440       450       460           470      

       470       480       490       500       510       520       
pF1KB5 EVLDENDNAPEFAKPYQPKVCENAVHGQLVLQISAIDKDITPRNVKFKFILNTE----NN
       .::: ::::::::. :.  :::.:   ::.  . :.:::    . .:.: :  :    .:
CCDS38 KVLDVNDNAPEFAEFYETFVCEKAKADQLIQTLHAVDKDDPYSGHQFSFSLAPEAASGSN
        480       490       500       510       520       530      

           530       540       550       560       570       580   
pF1KB5 FTLTDNHDNTANITVKYGQFDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVCKCNEQGE
       ::. ::.::::.: .. . ..:.. ....:::::::: .: ...:.:.:: :: :...:.
CCDS38 FTIQDNKDNTAGILTRKNGYNRHEMSTYLLPVVISDNDYPVQSSTGTVTVRVCACDHHGN
        540       550       560       570       580       590      

             590       600       610         620       630         
pF1KB5 FTFC--EDMAAQVGVSIQAVVAILLCILTITVITLLIF--LRRRLRKQARAHGKSVPEIH
       .  :  : .   .:.:  :.:::::::. : ..:...:  :::. .:.    .:   .:.
CCDS38 MQSCHAEALIHPTGLSTGALVAILLCIV-ILLVTVVLFAALRRQRKKEPLIISK--EDIR
        600       610       620        630       640         650   

     640       650       660       670       680         690       
pF1KB5 EQLVTYDEEGGGEMDTTSYDVSVLNSVRRGGAKPPRPALDA--RPSLYAQVQKPPRHAPG
       ...:.:..::::: :: ..:...:        . :.   :   : ..  ..   ::..: 
CCDS38 DNIVSYNDEGGGEEDTQAFDIGTL--------RNPEAIEDNKLRRDIVPEALFLPRRTPT
           660       670               680       690       700     

       700       710       720       730       740       750       
pF1KB5 AHGGPGEMAAMIEVKKDEADHDGDGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDSSDSDVDY
       :. .  ..  .:. .  : : :  .::::.:  :.:::. :.:.::::: . ..:.: ::
CCDS38 ARDNT-DVRDFINQRLKENDTDPTAPPYDSLATYAYEGTGSVADSLSSLESVTTDADQDY
         710        720       730       740       750       760    

       760       770       780    
pF1KB5 DFLNDWGPRFKMLAELYGSDPREELLY
       :.:.::::::: ::..::         
CCDS38 DYLSDWGPRFKKLADMYGGVDSDKDS 
          770       780       790 

>>CCDS3892.1 CDH10 gene_id:1008|Hs108|chr5                (788 aa)
 initn: 1158 init1: 413 opt: 1830  Z-score: 1908.8  bits: 364.0 E(32554): 5.3e-100
Smith-Waterman score: 1830; 41.7% identity (68.9% similar) in 762 aa overlap (30-775:32-780)

                10        20        30        40             50    
pF1KB5  MQRLMMLLATSGACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTH-----RRQKRDWIWNQM
                                     : ::   : .:       .:::: :.:::.
CCDS38 TIHQFLLLFLFWVCLPHFCSPEIMFRRTPVPQQRILSSRVPRSDGKILHRQKRGWMWNQF
              10        20        30        40        50        60 

           60        70        80          90       100       110  
pF1KB5 HIDEEKNTSLPHHVGKIKSSVSRKNA--KYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIERLDREN
        . :: . :  ..:::..:. .. ..  ::.:.:. .: .: .: .:::. : .:.:::.
CCDS38 FLLEEYTGSDYQYVGKLHSDQDKGDGSLKYILSGDGAGTLFIIDEKTGDIHATRRIDREE
              70        80        90       100       110       120 

            120       130       140       150       160       170  
pF1KB5 ISEYHLTAVIVDKDTGENLETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAVGTSVIS
        . : : :  ... : . .:  : :.::.::.::: :.: .....::::: :.:::::..
CCDS38 KAFYTLRAQAINRRTLRPVEPESEFVIKIHDINDNEPTFPEEIYTASVPEMSVVGTSVVQ
             130       140       150       160       170       180 

            180       190       200        210       220       230 
pF1KB5 VTAVDADDPTVGDHASVMYQILKGKEYFAID-NSGRIITITKSLDREKQARYEIVVEARD
       :::.:::::. :. : :.:.::.:. ::... ..: : :   ...::.. .:..:..:.:
CCDS38 VTATDADDPSYGNSARVIYSILQGQPYFSVEPETGIIRTALPNMNRENREQYQVVIQAKD
             190       200       210       220       230       240 

              240       250       260       270       280       290
pF1KB5 AQG-LRGDSGTATVLVTLQDINDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVEDPDEPQN
         : . : :::.:: .:: :.::: : : :.   . : :.. :::..::. . : :  .:
CCDS38 MGGQMGGLSGTTTVNITLTDVNDNPPRFPQNTIHLRVLESSPVGTAIGSVKATDADTGKN
             250       260       270       280       290       300 

              300       310       320       330       340          
pF1KB5 RMTKYSILRGDYQDAFTIETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTIDLR-YM
         ..: :. ::  : : : :.   .::::   ::::::  . :.. ::: .  .: : :.
CCDS38 AEVEYRIIDGDGTDMFDIVTEKDTQEGIITVKKPLDYESRRLYTLKVEAENTHVDPRFYY
             310       320       330       340       350       360 

     350       360       370       380        390       400        
pF1KB5 SPPAGNRAQVIINITDVDEPPIFQQPFYHFQLKEN-QKKPLIGTVLAMDPDAARHSIGYS
         :  . . : :.: ::::::.:..  : :...:. .   .::::.: :::.    : .:
CCDS38 LGPFKDTTIVKISIEDVDEPPVFSRSSYLFEVHEDIEVGTIIGTVMARDPDSISSPIRFS
             370       380       390       400       410       420 

      410       420        430       440       450       460       
pF1KB5 IRRTSDKGQFFRV-TKKGDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTPTGKESI-VQVH
       . : .:  ..: . . .:..:. : ::::.  :.:::: : :...   :  ::.  : : 
CCDS38 LDRHTDLDRIFNIHSGNGSLYTSKPLDRELSQWHNLTVIAAEINN---P--KETTRVAVF
             430       440       450       460            470      

        470       480       490       500       510       520      
pF1KB5 IEVLDENDNAPEFAKPYQPKVCENAVHGQLVLQISAIDKDITPRNVKFKFILNTEN-NFT
       ...:: :::::.::  :.  :::::  :::.  :::.:::    . :: : : . : :::
CCDS38 VRILDVNDNAPQFAVFYDTFVCENARPGQLIQTISAVDKDDPLGGQKFFFSLAAVNPNFT
        480       490       500       510       520       530      

         530       540       550       560       570       580     
pF1KB5 LTDNHDNTANITVKYGQFDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVCKCNEQGEFT
       . ::.:::: : .. . :.:.. ....:::::::: .: ...:.:::. :: :. ::.. 
CCDS38 VQDNEDNTARILTRKNGFNRHEISTYLLPVVISDNDYPIQSSTGTLTIRVCACDSQGNMQ
        540       550       560       570       580       590      

           590       600       610       620       630       640   
pF1KB5 FC--EDMAAQVGVSIQAVVAILLCILTITVITLLIFLRRRLRKQARAHGKSVPEIHEQLV
        :  : .   .:.:  :..::::::. . ::..:.   .: ::. .    :  .:....:
CCDS38 SCSAEALLLPAGLSTGALIAILLCIIILLVIVVLFAALKRQRKK-EPLILSKEDIRDNIV
        600       610       620       630       640        650     

           650       660       670       680       690       700   
pF1KB5 TYDEEGGGEMDTTSYDVSVLNSVRRGGAKPPRPALDARPSLYAQVQKPPRHAPGAHGGPG
       .:..::::: :: ..:...:    :. :   .  :  : ..  ..   ::..: :  .  
CCDS38 SYNDEGGGEEDTQAFDIGTL----RNPAAIEEKKL--RRDIIPETLFIPRRTPTAPDNT-
         660       670           680         690       700         

           710       720       730       740       750       760   
pF1KB5 EMAAMIEVKKDEADHDGDGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDSSDSDVDYDFLNDW
       ..  .:. .  : : :  .::::.:  :.:::..::::::::: . ....: .::.: .:
CCDS38 DVRDFINERLKEHDLDPTAPPYDSLATYAYEGNDSIAESLSSLESGTTEGDQNYDYLREW
      710       720       730       740       750       760        

           770       780    
pF1KB5 GPRFKMLAELYGSDPREELLY
       ::::. :::.::         
CCDS38 GPRFNKLAEMYGGGESDKDS 
      770       780         

>>CCDS10802.1 CDH8 gene_id:1006|Hs108|chr16               (799 aa)
 initn: 1228 init1: 429 opt: 1823  Z-score: 1901.4  bits: 362.7 E(32554): 1.4e-99
Smith-Waterman score: 1823; 40.5% identity (67.0% similar) in 800 aa overlap (4-780:16-798)

                           10          20        30        40      
pF1KB5             MQRLMMLLATSGACLGL--LAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTHR---
                      :..:  :   :. .  .  . :  .:. :   . .::   .:   
CCDS10 MPERLAEMLLDLWTPLIILWITLPPCIYMAPMNQSQVLMSGS-PL--ELNSLGEEQRILN
               10        20        30        40           50       

            50        60        70          80        90       100 
pF1KB5 RQKRDWIWNQMHIDEEKNTSLPHHVGKIKSSVS--RKNAKYLLKGEYVGKVFRVDAETGD
       :.:: :.:::: . :: .   :  ::.......   :. ::.:.:. .: .:...  :::
CCDS10 RSKRGWVWNQMFVLEEFSGPEPILVGRLHTDLDPGSKKIKYILSGDGAGTIFQINDVTGD
        60        70        80        90       100       110       

             110       120       130       140       150       160 
pF1KB5 VFAIERLDRENISEYHLTAVIVDKDTGENLETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVP
       . ::.:::::. .:: :::  :: .:.. :: :: : :::.:.::: : : .  ..:.::
CCDS10 IHAIKRLDREEKAEYTLTAQAVDWETSKPLEPPSEFIIKVQDINDNAPEFLNGPYHATVP
       120       130       140       150       160       170       

             170       180       190       200        210       220
pF1KB5 ESSAVGTSVISVTAVDADDPTVGDHASVMYQILKGKEYFAIDNSGRII-TITKSLDREKQ
       : : .:::: .:::.:::::. :. :...:.::.:. ::.:.    :: :   ..::: .
CCDS10 EMSILGTSVTNVTATDADDPVYGNSAKLVYSILEGQPYFSIEPETAIIKTALPNMDREAK
       180       190       200       210       220       230       

              230        240       250       260       270         
pF1KB5 ARYEIVVEARDAQGLRGD-SGTATVLVTLQDINDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGS
        .: .:..:.:  :  :  :::.:. ::: :.::: : :.:. : : ::::. .::..: 
CCDS10 EEYLVVIQAKDMGGHSGGLSGTTTLTVTLTDVNDNPPKFAQSLYHFSVPEDVVLGTAIGR
       240       250       260       270       280       290       

     280       290       300       310       320       330         
pF1KB5 LFVEDPDEPQNRMTKYSILRGDYQDAFTIETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEA
       . ..: :  .: ...:.:. ::    : : ..   ..:::.  ::::.:  ..:.. :::
CCDS10 VKANDQDIGENAQSSYDIIDGDGTALFEITSDAQAQDGIIRLRKPLDFETKKSYTLKVEA
       300       310       320       330       340       350       

     340       350        360       370       380        390       
pF1KB5 TDPTIDLRYMS-PPAGNRAQVIINITDVDEPPIFQQPFYHFQLKENQK-KPLIGTVLAMD
       ..  :: :. .  :  . : : : . :.::::.:..: : ....::   . .:: : : :
CCDS10 ANVHIDPRFSGRGPFKDTATVKIVVEDADEPPVFSSPTYLLEVHENAALNSVIGQVTARD
       360       370       380       390       400       410       

       400       410       420        430       440       450      
pF1KB5 PDAARHSIGYSIRRTSDKGQFFRVTKK-GDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTP
       :: .   : .:: : .:  . : ..   : :     ::::.  :.:.:. : :. .    
CCDS10 PDITSSPIRFSIDRHTDLERQFNINADDGKITLATPLDRELSVWHNITIIATEIRNH---
       420       430       440       450       460       470       

        460       470       480       490       500       510      
pF1KB5 TGKESIVQVHIEVLDENDNAPEFAKPYQPKVCENAVHGQLVLQISAIDKDITPRNVK-FK
        .. : : : :.::: ::::::::. :.  .:::.  ::..  .::.:::  :.: . : 
CCDS10 -SQISRVPVAIKVLDVNDNAPEFASEYEAFLCENGKPGQVIQTVSAMDKD-DPKNGHYFL
           480       490       500       510       520        530  

         520           530       540       550       560       570 
pF1KB5 FILNTEN----NFTLTDNHDNTANITVKYGQFDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTL
       . :  :     :::.  :.::. .: .:.. :.:.. .:..::..:::.: :  ..::::
CCDS10 YSLLPEMVNNPNFTIKKNEDNSLSILAKHNGFNRQKQEVYLLPIIISDSGNPPLSSTSTL
            540       550       560       570       580       590  

             580         590       600       610       620         
pF1KB5 TVAVCKCNEQGEFTFC--EDMAAQVGVSIQAVVAILLCILTITVITLLIFLRRRLRKQAR
       :. :: :...:    :  : ..  .:.:. :..::: ::. . ::..:.   :: ...  
CCDS10 TIRVCGCSNDGVVQSCNVEAYVLPIGLSMGALIAILACIILLLVIVVLFVTLRRHKNEPL
            600       610       620       630       640       650  

     630       640       650       660       670       680         
pF1KB5 AHGKSVPEIHEQLVTYDEEGGGEMDTTSYDVSVLNSVRRGGAKPPRPALDARPSLYAQVQ
          :.  ...:... ::.::::: :: ..:...:..    : .   :  : .:.:    :
CCDS10 II-KDDEDVRENIIRYDDEGGGEEDTEAFDIATLQNP--DGINGFLPRKDIKPDL----Q
             660       670       680         690       700         

     690         700       710       720       730       740       
pF1KB5 KPPRH--APGAHGGPGEMAAMIEVKKDEADHDGDGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLG
         ::.  ::  .:   ..  .:.:.  :::.:  .::::...::::::  :.: ::::: 
CCDS10 FMPRQGLAPVPNGV--DVDEFINVRLHEADNDPTAPPYDSIQIYGYEGRGSVAGSLSSLE
         710         720       730       740       750       760   

       750       760       770         780    
pF1KB5 TDSSDSDVDYDFLNDWGPRFKMLAELY--GSDPREELLY
       . .:::: ..:.:.::::::: :.:::  : . .:    
CCDS10 STTSDSDQNFDYLSDWGPRFKRLGELYSVGESDKET   
           770       780       790            

>>CCDS9586.1 CDH24 gene_id:64403|Hs108|chr14              (781 aa)
 initn: 1265 init1: 396 opt: 1781  Z-score: 1857.7  bits: 354.5 E(32554): 3.7e-97
Smith-Waterman score: 1781; 40.1% identity (65.9% similar) in 791 aa overlap (3-776:6-775)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB5    MQRLMMLLATSGACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTHRRQKRDWIWNQMHID
            ::..    . .:.: ::. : : ::.    :.  .  :.  : .:.:.:::. . 
CCDS95 MWGLVRLLLAWLGGWGCMGRLAAPARAWAGS----REHPG--PALLRTRRSWVWNQFFVI
               10        20        30              40        50    

        60        70        80          90       100       110     
pF1KB5 EEKNTSLPHHVGKIKSSVSRKNA--KYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIERLDRENISE
       ::     :  .::..:.:.: ..  :::: :: .: :: .:  ::.. . . ::::. ..
CCDS95 EEYAGPEPVLIGKLHSDVDRGEGRTKYLLTGEGAGTVFVIDEATGNIHVTKSLDREEKAQ
           60        70        80        90       100       110    

         120       130       140       150       160       170     
pF1KB5 YHLTAVIVDKDTGENLETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAVGTSVISVTA
       : : :  ::. ... :: :: : :::.:.::: :.:    ..:.::: : ::::::.:::
CCDS95 YVLLAQAVDRASNRPLEPPSEFIIKVQDINDNPPIFPLGPYHATVPEMSNVGTSVIQVTA
          120       130       140       150       160       170    

         180       190       200        210       220       230    
pF1KB5 VDADDPTVGDHASVMYQILKGKEYFAID-NSGRIITITKSLDREKQARYEIVVEARDAQG
        :::::. :. :...: .: :  .:..: ..: . :   ..::: : .. .:..:.:  :
CCDS95 HDADDPSYGNSAKLVYTVLDGLPFFSVDPQTGVVRTAIPNMDRETQEEFLVVIQAKDMGG
          180       190       200       210       220       230    

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB5 -LRGDSGTATVLVTLQDINDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVEDPDEPQNRMT
        . : ::..:: :::.:.::: : : :. : : : : .  :: :: : ..:::  .: . 
CCDS95 HMGGLSGSTTVTVTLSDVNDNPPKFPQSLYQFSVVETAGPGTLVGRLRAQDPDLGDNALM
          240       250       260       270       280       290    

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB5 KYSILRGDYQDAFTIETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTIDLRYMS-PP
        :::: :. ..::.: :.    .:..   ::::.:  ..::: ::::.  ::  :.   :
CCDS95 AYSILDGEGSEAFSISTDLQGRDGLLTVRKPLDFESQRSYSFRVEATNTLIDPAYLRRGP
          300       310       320       330       340       350    

            360       370       380         390       400       410
pF1KB5 AGNRAQVIINITDVDEPPIFQQPFYHFQLKENQKKP--LIGTVLAMDPDAARHSIGYSIR
         . :.: . . :. ::: : :  ::. . :: : :  :.: . : : :.    : ::: 
CCDS95 FKDVASVRVAVQDAPEPPAFTQAAYHLTVPEN-KAPGTLVGQISAADLDSPASPIRYSIL
          360       370       380        390       400       410   

              420        430       440       450       460         
pF1KB5 RTSDKGQFFRVT-KKGDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTPTGKESIVQVHIEV
         ::  . : .  ..: :..   ::::.  :.:::: : ::::..    . : ::: :..
CCDS95 PHSDPERCFSIQPEEGTIHTAAPLDREARAWHNLTVLATELDSSA----QASRVQVAIQT
           420       430       440       450           460         

     470       480       490       500         510       520       
pF1KB5 LDENDNAPEFAKPYQPKVCENAVHGQLVLQISAIDKDIT--PRNVKFKFILNTENNFTLT
       ::::::::..:.::.  ::..:. :::.  : :.:.: .    .:.:.  :. . :::. 
CCDS95 LDENDNAPQLAEPYDTFVCDSAAPGQLIQVIRALDRDEVGNSSHVSFQGPLGPDANFTVQ
     470       480       490       500       510       520         

       530       540       550       560       570       580       
pF1KB5 DNHDNTANITVKYGQFDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVCKCNEQGEFTFC
       ::.:..:.. .       .:.  ...:. . : :.:. ..:.:.::.::.:. .:  . :
CCDS95 DNRDGSASLLLPSRPAPPRHAP-YLVPIELWDWGQPALSSTATVTVSVCRCQPDGSVASC
     530       540       550        560       570       580        

         590       600        610       620       630       640    
pF1KB5 --EDMAAQVGVSIQAVVAILLCI-LTITVITLLIFLRRRLRKQARAHGKSVPEIHEQLVT
         :   . .:.:  :..::. :.   .....:.. :::  .::         ...:...:
CCDS95 WPEAHLSAAGLSTGALLAIITCVGALLALVVLFVALRR--QKQEALMVLEEEDVRENIIT
      590       600       610       620         630       640      

          650       660       670       680         690       700  
pF1KB5 YDEEGGGEMDTTSYDVSVLNSVRRGGAKPPRPALDARPSLY--AQVQKPPRHAPGAHGGP
       ::.::::: :: ..:...:..    :: :: :.  :: ..   :.:.. ::  ::    :
CCDS95 YDDEGGGEEDTEAFDITALQNP--DGAAPPAPGPPARRDVLPRARVSRQPR-PPG----P
        650       660         670       680       690              

            710       720       730       740       750         760
pF1KB5 GEMAAMIEVKKDEADHDGDGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDSSDSDVD--YDFL
       ...: .. ..  :::.:   ::::....:::::  :   ::::::. :  . .    . :
CCDS95 ADVAQLLALRLREADEDPGVPPYDSVQVYGYEGRGSSCGSLSSLGSGSEAGGAPGPAEPL
     700       710       720       730       740       750         

              770       780    
pF1KB5 NDWGPRFKMLAELYGSDPREELLY
       .:::: :. ::::::.        
CCDS95 DDWGPLFRTLAELYGAKEPPAP  
     760       770       780   

>>CCDS11993.1 CDH7 gene_id:1005|Hs108|chr18               (785 aa)
 initn: 1340 init1: 397 opt: 1776  Z-score: 1852.5  bits: 353.6 E(32554): 7.3e-97
Smith-Waterman score: 1776; 40.9% identity (67.6% similar) in 756 aa overlap (44-784:44-784)

            20        30        40        50        60        70   
pF1KB5 CLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTHRRQKRDWIWNQMHIDEEKNTSLPHHVGKIKS
                                     : ::.:.:::. . ::   : : .:::..:
CCDS11 LIALFLCFSGMSQAELSRSRSKPYFQSGRSRTKRSWVWNQFFVLEEYMGSDPLYVGKLHS
            20        30        40        50        60        70   

            80          90       100       110       120       130 
pF1KB5 SVSRKNA--KYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIERLDRENISEYHLTAVIVDKDTGENL
       .:.. ..  ::.:.:: ....: .: .:::. : .:::::. . : : :  .:. :.. .
CCDS11 DVDKGDGSIKYILSGEGASSIFIIDENTGDIHATKRLDREEQAYYTLRAQALDRLTNKPV
            80        90       100       110       120       130   

             140       150       160       170       180       190 
pF1KB5 ETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAVGTSVISVTAVDADDPTVGDHASVMY
       :  : :.::..:.::: : :    ..:.::: : :::::..:::.:::::: :. : :.:
CCDS11 EPESEFVIKIQDINDNEPKFLDGPYTAGVPEMSPVGTSVVQVTATDADDPTYGNSARVVY
           140       150       160       170       180       190   

             200        210       220       230        240         
pF1KB5 QILKGKEYFAID-NSGRIITITKSLDREKQARYEIVVEARDAQGLRGD-SGTATVLVTLQ
       .::.:. ::... ..: : :   ..::: . .: .:..:.:  :  :  :::..: ::: 
CCDS11 SILQGQPYFSVEPKTGVIKTALPNMDREAKDQYLLVIQAKDMVGQNGGLSGTTSVTVTLT
           200       210       220       230       240       250   

     250       260       270       280       290       300         
pF1KB5 DINDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVEDPDEPQNRMTKYSILRGDYQDAFTIE
       :.::: : : . .: . :::.  :.. :. . . : :   :   .:.:. ::    : : 
CCDS11 DVNDNPPRFPRRSYQYNVPESLPVASVVARIKAADADIGANAEMEYKIVDGDGLGIFKIS
           260       270       280       290       300       310   

     310       320       330       340       350        360        
pF1KB5 TNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTIDLRYMS-PPAGNRAQVIINITDVDE
       ..   .::::  .: ::.:   .:.. .::..   : :..:  : .. . : : . ::::
CCDS11 VDKETQEGIITIQKELDFEAKTSYTLRIEAANKDADPRFLSLGPFSDTTTVKIIVEDVDE
           320       330       340       350       360       370   

      370       380        390       400       410       420       
pF1KB5 PPIFQQPFYHFQLKE-NQKKPLIGTVLAMDPDAARHSIGYSIRRTSDKGQFFRV-TKKGD
       ::.:..:.: ....: .:   .:::: : :::..   . ::: :..:  ..: . ...: 
CCDS11 PPVFSSPLYPMEVSEATQVGNIIGTVAAHDPDSSNSPVRYSIDRNTDLERYFNIDANSGV
           380       390       400       410       420       430   

        430       440       450       460       470       480      
pF1KB5 IYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTPTGKESIVQVHIEVLDENDNAPEFAKPYQPK
       : . : ::::.   .:.:: : : ... . .:.     : : .:: ::::::::  :.  
CCDS11 ITTAKSLDRETNAIHNITVLAME-SQNPSQVGRG---YVAITILDINDNAPEFAMDYETT
           440       450        460          470       480         

        490       500       510       520           530       540  
pF1KB5 VCENAVHGQLVLQISAIDKDITPRNVKFKFILNTE----NNFTLTDNHDNTANITVKYGQ
       :::::  ::.. .:::.:::    . .: : :.:.    .::.: ::.::::.: .. . 
CCDS11 VCENAQPGQVIQKISAVDKDEPSNGHQFYFSLTTDATNNHNFSLKDNKDNTASILTRRNG
     490       500       510       520       530       540         

            550       560       570       580         590       600
pF1KB5 FDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVCKCNEQGEFTFC--EDMAAQVGVSIQA
       : :.. .:..::. : :.: :: ..:.:::. :: :. .:    :  : ..  .:.:  :
CCDS11 FRRQEQSVYYLPIFIVDSGSPSLSSTNTLTIRVCDCDADGVAQTCNAEAYVLPAGLSTGA
     550       560       570       580       590       600         

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 VVAILLCILTITVITLLIFLRRRLRKQARAHGKSVPEIHEQLVTYDEEGGGEMDTTSYDV
       ..::: :.::. :. :::   :: .:.     .   .:.:..: ::.::::: :: ..:.
CCDS11 LIAILACVLTLLVLILLIVTMRRRKKEPLIFDEER-DIRENIVRYDDEGGGEEDTEAFDM
     610       620       630       640        650       660        

              670       680       690       700         710        
pF1KB5 SVLNSVRRGGAKPPRPALDARPSLYAQVQKPPRHAPGAHGGPGEMA--AMIEVKKDEADH
       ..: ..     .  .   :. :    ..:   :  :. .. : ..    .:  .  ::: 
CCDS11 AALRNLNV--IRDTKTRRDVTP----EIQFLSR--PAFKSIPDNVIFREFIWERLKEADV
      670         680           690         700       710       720

      720       730       740       750       760       770        
pF1KB5 DGDGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDSSDSDVDYDFLNDWGPRFKMLAELYGSDP
       :  .::::.:. :..::. :.::::::: . ::.:: .::.:.::::::: ::..::.  
CCDS11 DPGAPPYDSLQTYAFEGNGSVAESLSSLDSISSNSDQNYDYLSDWGPRFKRLADMYGTG-
              730       740       750       760       770          

      780     
pF1KB5 REELLY 
        .: :: 
CCDS11 -QESLYS
      780     

>>CCDS3890.1 CDH12 gene_id:1010|Hs108|chr5                (794 aa)
 initn: 1364 init1: 385 opt: 1756  Z-score: 1831.5  bits: 349.7 E(32554): 1.1e-95
Smith-Waterman score: 1756; 38.3% identity (66.7% similar) in 793 aa overlap (4-777:9-785)

                    10        20        30        40            50 
pF1KB5      MQRLMMLLATSGACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTHR----RQKRDWIW
               :.. .  .:. :  :      . ...: .   :  :: .:    : :: :.:
CCDS38 MLTRNCLSLLLWVLFDGGLLTPLQPQPQQTLATEPRENVIH--LPGQRSHFQRVKRGWVW
               10        20        30        40          50        

              60        70        80          90       100         
pF1KB5 NQMHIDEEKNTSLPHHVGKIKSSVSRKNA--KYLLKGEYVGKVFRVDAETGDVFAIERLD
       ::. . ::   : :..:::..:.... ..  :: :.:. .: :: .:  :::. ::. ::
CCDS38 NQFFVLEEYVGSEPQYVGKLHSDLDKGEGTVKYTLSGDGAGTVFTIDETTGDIHAIRSLD
       60        70        80        90       100       110        

     110       120       130       140       150       160         
pF1KB5 RENISEYHLTAVIVDKDTGENLETPSSFTIKVHDVNDNWPVFTHRLFNASVPESSAVGTS
       ::.   : : :  :: .: . ::  : : :::.:.::: : :    . :.::: : ::. 
CCDS38 REEKPFYTLRAQAVDIETRKPLEPESEFIIKVQDINDNEPKFLDGPYVATVPEMSPVGAY
      120       130       140       150       160       170        

     170       180       190       200        210       220        
pF1KB5 VISVTAVDADDPTVGDHASVMYQILKGKEYFAID-NSGRIITITKSLDREKQARYEIVVE
       :..: :.:::::: :. : :.:.::.:. ::.:: ..: : :   ..::: . .:.....
CCDS38 VLQVKATDADDPTYGNSARVVYSILQGQPYFSIDPKTGVIRTALPNMDREVKEQYQVLIQ
      180       190       200       210       220       230        

      230        240       250       260       270       280       
pF1KB5 ARDAQG-LRGDSGTATVLVTLQDINDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVEDPDE
       :.:  : : : .::. : .:: :.::: : : .. . . :::.. .:...: . . ::: 
CCDS38 AKDMGGQLGGLAGTTIVNITLTDVNDNPPRFPKSIFHLKVPESSPIGSAIGRIRAVDPDF
      240       250       260       270       280       290        

       290       300       310       320       330       340       
pF1KB5 PQNRMTKYSILRGDYQDAFTIETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTIDLR
        ::   .:.:. ::  . : : :.   .::.::  ::::.:  . :.: :::..  .: :
CCDS38 GQNAEIEYNIVPGDGGNLFDIVTDEDTQEGVIKLKKPLDFETKKAYTFKVEASNLHLDHR
      300       310       320       330       340       350        

       350        360       370       380        390       400     
pF1KB5 YMSP-PAGNRAQVIINITDVDEPPIFQQPFYHFQLKENQK-KPLIGTVLAMDPDAARHSI
       . :  :  . : : :.. ::::::.:..:.: ... :.     .::.: :.: :..  ..
CCDS38 FHSAGPFKDTATVKISVLDVDEPPVFSKPLYTMEVYEDTPVGTIIGAVTAQDLDVGSSAV
      360       370       380       390       400       410        

         410       420        430       440       450       460    
pF1KB5 GYSIRRTSDKGQFFRVT-KKGDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKELDSTGTPTGKESIVQ
        : :   ::  ..: .  ..: : ... ::::    ::... :... :.   :.:   :.
CCDS38 RYFIDWKSDGDSYFTIDGNEGTIATNELLDRESTAQYNFSIIASKV-SNPLLTSK---VN
      420       430       440       450       460        470       

          470       480       490       500       510       520    
pF1KB5 VHIEVLDENDNAPEFAKPYQPKVCENAVHGQLVLQISAIDKDITPRNVKFKFILNTEN--
       . :.::: :.  ::.. ::.  :::::  ::..  .:: :.:..: . .:.: :. :   
CCDS38 ILINVLDVNEFPPEISVPYETAVCENAKPGQIIQIVSAADRDLSPAGQQFSFRLSPEAAI
          480       490       500       510       520       530    

              530       540       550       560       570       580
pF1KB5 --NFTLTDNHDNTANITVKYGQFDREHTKVHFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVCKCNE
         :::. : ..:::.: .. . ..:.. ...:::::: :...: ...:.:.:. ::.:. 
CCDS38 KPNFTVRDFRNNTAGIETRRNGYSRRQQELYFLPVVIEDSSYPVQSSTNTMTIRVCRCDS
          540       550       560       570       580       590    

                590       600        610       620       630       
pF1KB5 QGEFTFC--EDMAAQVGVSIQAVVAILLCI-LTITVITLLIFLRRRLRKQARAHGKSVPE
       .: .  :  : .   ::.:  :..:::::: . .....: . :::. .:..   .:   .
CCDS38 DGTILSCNVEAIFLPVGLSTGALIAILLCIVILLAIVVLYVALRRQKKKDTLMTSKE--D
          600       610       620       630       640       650    

       640       650       660       670       680        690      
pF1KB5 IHEQLVTYDEEGGGEMDTTSYDVSVLNSVRRGGAKPPRPALDARP-SLYAQVQKPPRHAP
       :..... ::.::::: :: ..:...: . .    .  .   : .: ::    :.:: .  
CCDS38 IRDNVIHYDDEGGGEEDTQAFDIGALRNPKV--IEENKIRRDIKPDSLCLPRQRPPME--
            660       670       680         690       700          

        700       710       720       730       740       750      
pF1KB5 GAHGGPGEMAAMIEVKKDEADHDGDGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDSSDSDVD
              ..  .:. . .: : :  .::::.:  :.:::: :.::::::. . ....: :
CCDS38 ----DNTDIRDFIHQRLQENDVDPTAPPYDSLATYAYEGSGSVAESLSSIDSLTTEADQD
          710       720       730       740       750       760    

        760       770       780      
pF1KB5 YDFLNDWGPRFKMLAELYGSDPREELLY  
       ::.:.:::::::.::...: .         
CCDS38 YDYLTDWGPRFKVLADMFGEEESYNPDKVT
          770       780       790    




784 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 17:47:28 2016 done: Thu Nov  3 17:47:28 2016
 Total Scan time:  3.290 Total Display time:  0.250

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com