Result of FASTA (ccds) for pF1KB5439
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5439, 207 aa
  1>>>pF1KB5439 207 - 207 aa - 207 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5974+/-0.00102; mu= 11.6934+/- 0.061
 mean_var=83.0027+/-17.021, 0's: 0 Z-trim(105.4): 206  B-trim: 268 in 1/49
 Lambda= 0.140776
 statistics sampled from 8177 (8414) to 8177 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.258), width:  16
 Scan time:  1.740

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3052.1 RAB7A gene_id:7879|Hs108|chr3           ( 207) 1364 286.8 6.6e-78
CCDS14515.1 RAB9B gene_id:51209|Hs108|chrX         ( 201)  696 151.1 4.5e-37
CCDS14156.1 RAB9A gene_id:9367|Hs108|chrX          ( 201)  688 149.5 1.4e-36
CCDS73011.1 RAB7B gene_id:338382|Hs108|chr1        ( 199)  618 135.2 2.6e-32
CCDS76258.1 RAB7B gene_id:338382|Hs108|chr1        ( 157)  461 103.3 8.6e-23
CCDS11419.1 RAB5C gene_id:5878|Hs108|chr17         ( 216)  437 98.5 3.2e-21
CCDS58551.1 RAB5C gene_id:5878|Hs108|chr17         ( 249)  437 98.5 3.6e-21
CCDS3082.1 RAB6B gene_id:51560|Hs108|chr3          ( 208)  434 97.9 4.8e-21
CCDS8900.1 RAB5B gene_id:5869|Hs108|chr12          ( 215)  430 97.1 8.7e-21
CCDS10183.1 RAB8B gene_id:51762|Hs108|chr15        ( 207)  429 96.9 9.7e-21
CCDS8224.1 RAB6A gene_id:5870|Hs108|chr11          ( 208)  427 96.5 1.3e-20
CCDS1058.1 RAB13 gene_id:5872|Hs108|chr1           ( 203)  426 96.2 1.5e-20
CCDS2633.1 RAB5A gene_id:5868|Hs108|chr3           ( 215)  426 96.3 1.5e-20
CCDS8223.1 RAB6A gene_id:5870|Hs108|chr11          ( 208)  425 96.1 1.7e-20
CCDS31613.1 RAB1B gene_id:81876|Hs108|chr11        ( 201)  424 95.8 1.9e-20
CCDS45826.1 RAB31 gene_id:11031|Hs108|chr18        ( 195)  423 95.6 2.1e-20
CCDS46306.1 RAB1A gene_id:5861|Hs108|chr2          ( 205)  421 95.2   3e-20
CCDS12339.1 RAB8A gene_id:4218|Hs108|chr19         ( 207)  417 94.4 5.2e-20
CCDS10212.1 RAB11A gene_id:8766|Hs108|chr15        ( 216)  417 94.4 5.4e-20
CCDS8264.1 RAB30 gene_id:27314|Hs108|chr11         ( 203)  416 94.2 5.9e-20
CCDS8281.1 RAB38 gene_id:23682|Hs108|chr11         ( 211)  416 94.2 6.1e-20
CCDS9570.1 RAB2B gene_id:84932|Hs108|chr14         ( 216)  416 94.2 6.2e-20
CCDS12201.1 RAB11B gene_id:9230|Hs108|chr19        ( 218)  415 94.0 7.2e-20
CCDS1720.1 RAB10 gene_id:10890|Hs108|chr2          ( 200)  414 93.8 7.8e-20
CCDS6175.1 RAB2A gene_id:5862|Hs108|chr8           ( 212)  411 93.2 1.2e-19
CCDS4962.1 RAB23 gene_id:51715|Hs108|chr6          ( 237)  410 93.0 1.6e-19
CCDS7155.1 RAB18 gene_id:22931|Hs108|chr10         ( 206)  404 91.8 3.3e-19
CCDS1459.1 RAB29 gene_id:8934|Hs108|chr1           ( 203)  403 91.6 3.7e-19
CCDS31050.1 RAB4A gene_id:5867|Hs108|chr1          ( 218)  402 91.4 4.5e-19
CCDS3976.1 RAB3C gene_id:115827|Hs108|chr5         ( 227)  401 91.2 5.4e-19
CCDS41846.1 RAB35 gene_id:11021|Hs108|chr12        ( 201)  400 91.0 5.6e-19
CCDS5210.1 RAB32 gene_id:10981|Hs108|chr6          ( 225)  400 91.0 6.1e-19
CCDS11703.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17       ( 216)  398 90.6 7.9e-19
CCDS33497.1 RAB22A gene_id:57403|Hs108|chr20       ( 194)  396 90.1 9.6e-19
CCDS42410.1 RAB12 gene_id:201475|Hs108|chr18       ( 244)  395 90.0 1.3e-18
CCDS560.1 RAB3B gene_id:5865|Hs108|chr1            ( 219)  393 89.6 1.6e-18
CCDS82198.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17       ( 196)  389 88.7 2.6e-18
CCDS12372.1 RAB3A gene_id:5864|Hs108|chr19         ( 220)  389 88.8 2.8e-18
CCDS32722.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17       ( 223)  389 88.8 2.9e-18
CCDS54161.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17       ( 228)  389 88.8 2.9e-18
CCDS33030.1 RAB4B gene_id:53916|Hs108|chr19        ( 213)  388 88.5 3.2e-18
CCDS35322.2 RAB41 gene_id:347517|Hs108|chrX        ( 221)  385 87.9   5e-18
CCDS14766.1 RAB39B gene_id:116442|Hs108|chrX       ( 213)  379 86.7 1.1e-17
CCDS6827.1 RAB14 gene_id:51552|Hs108|chr9          ( 215)  379 86.7 1.1e-17
CCDS41413.1 RAB25 gene_id:57111|Hs108|chr1         ( 213)  378 86.5 1.3e-17
CCDS33850.1 RAB43 gene_id:339122|Hs108|chr3        ( 212)  377 86.3 1.5e-17
CCDS82514.1 WTH3DI gene_id:150786|Hs108|chr2       ( 254)  377 86.4 1.7e-17
CCDS10460.1 RAB26 gene_id:25837|Hs108|chr16        ( 256)  377 86.4 1.7e-17
CCDS34762.2 RAB19 gene_id:401409|Hs108|chr7        ( 217)  376 86.1 1.7e-17
CCDS12257.1 RAB3D gene_id:9545|Hs108|chr19         ( 219)  373 85.5 2.7e-17


>>CCDS3052.1 RAB7A gene_id:7879|Hs108|chr3                (207 aa)
 initn: 1364 init1: 1364 opt: 1364  Z-score: 1512.1  bits: 286.8 E(32554): 6.6e-78
Smith-Waterman score: 1364; 100.0% identity (100.0% similar) in 207 aa overlap (1-207:1-207)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 IWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 IWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 VVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       
pF1KB5 ELYNEFPEPIKLDKNDRAKASAESCSC
       :::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ELYNEFPEPIKLDKNDRAKASAESCSC
              190       200       

>>CCDS14515.1 RAB9B gene_id:51209|Hs108|chrX              (201 aa)
 initn: 710 init1: 679 opt: 696  Z-score: 779.1  bits: 151.1 E(32554): 4.5e-37
Smith-Waterman score: 696; 52.2% identity (80.8% similar) in 203 aa overlap (3-205:2-201)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQ
         : :..:::::.:::.::::.::::.::..::..:   :::..::.... :: :.::.:
CCDS14  MSGKSLLLKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDSQAFHTIGVEFLNRDLEVDGRFVTLQ
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 IWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPF
       ::::::::::.:: . ::::::::.:.:.:   ..:..: .:. ::.  :. .:::.:::
CCDS14 IWDTAGQERFKSLRTPFYRGADCCLLTFSVDDRQSFENLGNWQKEFIYYADVKDPEHFPF
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 VVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEV
       ::::::.: :.:::.:..::.::. ... ::.:::::.  ::  ::.  .:..:  : ..
CCDS14 VVLGNKVDKEDRQVTTEEAQTWCMENGDYPYLETSAKDDTNVTVAFEEAVRQVLAVEEQL
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       
pF1KB5 ELYNEFPEPIKLDKNDRAKASAESCSC
       : .  . . :  : :. .::..  :  
CCDS14 E-HCMLGHTI--DLNSGSKAGSSCC  
     180          190       200   

>>CCDS14156.1 RAB9A gene_id:9367|Hs108|chrX               (201 aa)
 initn: 675 init1: 675 opt: 688  Z-score: 770.3  bits: 149.5 E(32554): 1.4e-36
Smith-Waterman score: 688; 50.7% identity (79.6% similar) in 201 aa overlap (5-205:4-201)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQ
           :. :.:::.:::.::::.::::.::..::..:   :::..::.:.. :: ..::::
CCDS14  MAGKSSLFKVILLGDGGVGKSSLMNRYVTNKFDTQLFHTIGVEFLNKDLEVDGHFVTMQ
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 IWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPF
       ::::::::::.:: . ::::.:::.:.:.:   ..:..:..:. ::.  :. ..::.:::
CCDS14 IWDTAGQERFRSLRTPFYRGSDCCLLTFSVDDSQSFQNLSNWKKEFIYYADVKEPESFPF
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 VVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEV
       :.::::::. .:::.:..::::: .... ::::::::.: ::  ::.  .: .:  : . 
CCDS14 VILGNKIDISERQVSTEEAQAWCRDNGDYPYFETSAKDATNVAAAFEEAVRRVLATEDRS
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       
pF1KB5 ELYNEFPEPIKLDKNDRAKASAESCSC
       .   .  . ..: .  . : :.  :  
CCDS14 DHLIQ-TDTVNLHR--KPKPSSSCC  
     180        190         200   

>>CCDS73011.1 RAB7B gene_id:338382|Hs108|chr1             (199 aa)
 initn: 584 init1: 390 opt: 618  Z-score: 693.5  bits: 135.2 E(32554): 2.6e-32
Smith-Waterman score: 618; 49.2% identity (77.4% similar) in 195 aa overlap (1-195:1-192)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQ
       :. :::: ::.::.:  :::::::..:::.: : ..:..:.::..:.: ... :  . .:
CCDS73 MNPRKKVDLKLIIVGAIGVGKTSLLHQYVHKTFYEEYQTTLGASILSKIIILGDTTLKLQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 IWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPF
       ::::.:::::.:.  .::.:.: :.:.::::  ..:..:: :: . : .  : . ...:.
CCDS73 IWDTGGQERFRSMVSTFYKGSDGCILAFDVTDLESFEALDIWRGDVLAKIVPME-QSYPM
               70        80        90       100       110          

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 VVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEV
       :.::::::: .:.:  . ::.::  :. :::::.:::. ::: :::. .:  ::..   .
CCDS73 VLLGNKIDLADRKVPQEVAQGWCREKD-IPYFEVSAKNDINVVQAFEMLASRALSRYQSI
     120       130       140        150       160       170        

              190       200       
pF1KB5 ELYNEFPEPIKLDKNDRAKASAESCSC
        : :.. : :::. .            
CCDS73 -LENHLTESIKLSPDQSRSRCC     
       180       190              

>>CCDS76258.1 RAB7B gene_id:338382|Hs108|chr1             (157 aa)
 initn: 449 init1: 390 opt: 461  Z-score: 522.7  bits: 103.3 E(32554): 8.6e-23
Smith-Waterman score: 461; 50.4% identity (81.2% similar) in 133 aa overlap (1-133:1-132)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQ
       :. :::: ::.::.:  :::::::..:::.: : ..:..:.::..:.: ... :  . .:
CCDS76 MNPRKKVDLKLIIVGAIGVGKTSLLHQYVHKTFYEEYQTTLGASILSKIIILGDTTLKLQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 IWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPF
       ::::.:::::.:.  .::.:.: :.:.::::  ..:..:: :: . : .  : . ...:.
CCDS76 IWDTGGQERFRSMVSTFYKGSDGCILAFDVTDLESFEALDIWRGDVLAKIVPME-QSYPM
               70        80        90       100       110          

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 VVLGNKIDLENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNALKQETEV
       :.::::::: .:.                                               
CCDS76 VLLGNKIDLADRKYQSILENHLTESIKLSPDQSRSRCC                      
     120       130       140       150                             

>>CCDS11419.1 RAB5C gene_id:5878|Hs108|chr17              (216 aa)
 initn: 423 init1: 329 opt: 437  Z-score: 494.4  bits: 98.5 E(32554): 3.2e-21
Smith-Waterman score: 437; 39.7% identity (68.6% similar) in 204 aa overlap (9-206:22-215)

                            10        20        30        40       
pF1KB5              MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLT
                            .:...::.:.:::.::. ..:. .: .  ..:::: :::
CCDS11 MAGRGGAARPNGPAAGNKICQFKLVLLGESAVGKSSLVLRFVKGQFHEYQESTIGAAFLT
               10        20        30        40        50        60

        50        60        70        80        90       100       
pF1KB5 KEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFL
       . : .::  : ..:::::::::..::.  .::::.  ..:.:.:  .::    .:  :. 
CCDS11 QTVCLDDTTVKFEIWDTAGQERYHSLAPMYYRGAQAAIVVYDITNTDTFARAKNWVKELQ
               70        80        90       100       110       120

       110       120       130        140       150       160      
pF1KB5 IQASPRDPENFPFVVLGNKIDLEN-RQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAF
        ::::    :. ... ::: :: . : :  ..:::.  . :.. ..::::: :.::.. :
CCDS11 RQASP----NIVIALAGNKADLASKRAVEFQEAQAYA-DDNSLLFMETSAKTAMNVNEIF
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        170       180            190       200       
pF1KB5 QTIARNALKQETEVELYNEFPEP-----IKLDKNDRAKASAESCSC
       ..::..  :.: .    :    :     . :..:. :. : . :: 
CCDS11 MAIAKKLPKNEPQ----NATGAPGRNRGVDLQENNPASRS-QCCSN
         180           190       200       210       

>>CCDS58551.1 RAB5C gene_id:5878|Hs108|chr17              (249 aa)
 initn: 423 init1: 329 opt: 437  Z-score: 493.5  bits: 98.5 E(32554): 3.6e-21
Smith-Waterman score: 437; 39.7% identity (68.6% similar) in 204 aa overlap (9-206:55-248)

                                     10        20        30        
pF1KB5                       MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYK
                                     .:...::.:.:::.::. ..:. .: .  .
CCDS58 LWTTTAGRAMAGRGGAARPNGPAAGNKICQFKLVLLGESAVGKSSLVLRFVKGQFHEYQE
           30        40        50        60        70        80    

       40        50        60        70        80        90        
pF1KB5 ATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKT
       .:::: :::. : .::  : ..:::::::::..::.  .::::.  ..:.:.:  .::  
CCDS58 STIGAAFLTQTVCLDDTTVKFEIWDTAGQERYHSLAPMYYRGAQAAIVVYDITNTDTFAR
           90       100       110       120       130       140    

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pF1KB5 LDSWRDEFLIQASPRDPENFPFVVLGNKIDLEN-RQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAK
         .:  :.  ::::    :. ... ::: :: . : :  ..:::.  . :.. ..:::::
CCDS58 AKNWVKELQRQASP----NIVIALAGNKADLASKRAVEFQEAQAYA-DDNSLLFMETSAK
          150           160       170       180        190         

       160       170       180            190       200       
pF1KB5 EAINVEQAFQTIARNALKQETEVELYNEFPEP-----IKLDKNDRAKASAESCSC
        :.::.. :..::..  :.: .    :    :     . :..:. :. : . :: 
CCDS58 TAMNVNEIFMAIAKKLPKNEPQ----NATGAPGRNRGVDLQENNPASRS-QCCSN
     200       210       220           230       240          

>>CCDS3082.1 RAB6B gene_id:51560|Hs108|chr3               (208 aa)
 initn: 445 init1: 320 opt: 434  Z-score: 491.3  bits: 97.9 E(32554): 4.8e-21
Smith-Waterman score: 434; 37.0% identity (69.5% similar) in 200 aa overlap (9-207:14-208)

                    10        20        30        40        50     
pF1KB5      MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDR
                    .:...::...::::::.....  .:.: :.:::: :::.: ....::
CCDS30 MSAGGDFGNPLRKFKLVFLGEQSVGKTSLITRFMYDSFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDR
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB5 LVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDP
        : .:.:::::::::.::  .. : .   :.:.:.:  :.:.  ..: :.   . .    
CCDS30 TVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSTVAVVVYDITNLNSFQQTSKWIDDVRTERGS---
               70        80        90       100       110          

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pF1KB5 ENFPFVVLGNKIDL-ENRQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNAL
        .  ....::: :: ..::.. ....    .. .. ..::::: . ::.: :. .:    
CCDS30 -DVIIMLVGNKTDLADKRQITIEEGEQRA-KELSVMFIETSAKTGYNVKQLFRRVASALP
        120       130       140        150       160       170     

          180       190       200       
pF1KB5 KQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRAKASAESCSC
        .:.  :  .:    ::::: ..  ::  .:::
CCDS30 GMENVQEKSKEGMIDIKLDKPQEPPASEGGCSC
         180       190       200        

>>CCDS8900.1 RAB5B gene_id:5869|Hs108|chr12               (215 aa)
 initn: 422 init1: 328 opt: 430  Z-score: 486.7  bits: 97.1 E(32554): 8.7e-21
Smith-Waterman score: 430; 38.5% identity (70.5% similar) in 200 aa overlap (9-207:21-213)

                           10        20        30        40        
pF1KB5             MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTK
                           .:...::.:.:::.::. ..:. .: .  ..:::: :::.
CCDS89 MTSRSTARPNGQPQASKICQFKLVLLGESAVGKSSLVLRFVKGQFHEYQESTIGAAFLTQ
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB5 EVMVDDRLVTMQIWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLI
        : .::  : ..:::::::::..::.  .::::.  ..:.:.:  .::    .:  :.  
CCDS89 SVCLDDTTVKFEIWDTAGQERYHSLAPMYYRGAQAAIVVYDITNQETFARAKTWVKELQR
               70        80        90       100       110       120

      110       120       130        140       150       160       
pF1KB5 QASPRDPENFPFVVLGNKIDLEN-RQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQ
       ::::    .. ... ::: :: : :.:  ..:::.  . :.. ..::::: :.::.. : 
CCDS89 QASP----SIVIALAGNKADLANKRMVEYEEAQAYA-DDNSLLFMETSAKTAMNVNDLFL
                  130       140       150        160       170     

       170       180       190       200         
pF1KB5 TIARNALKQETEVELYNEFPEPIKLDKNDRAKASAESCSC  
       .::..  :.: . .: .   .   .: ..... .  .: :  
CCDS89 AIAKKLPKSEPQ-NLGGAAGRSRGVDLHEQSQQNKSQC-CSN
         180        190       200       210      

>>CCDS10183.1 RAB8B gene_id:51762|Hs108|chr15             (207 aa)
 initn: 418 init1: 301 opt: 429  Z-score: 485.8  bits: 96.9 E(32554): 9.7e-21
Smith-Waterman score: 429; 36.7% identity (66.7% similar) in 210 aa overlap (1-206:1-205)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MTSRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQ
       :..    :.:....:::::::: :. .. .  :.. . .::: ::  . . .: . . .:
CCDS10 MAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCLLFRFSEDAFNTTFISTIGIDFKIRTIELDGKKIKLQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 IWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVFDVTAPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPF
       ::::::::::... .:.::::   .::.:.:  ..: .. .:  ..  .::  : :    
CCDS10 IWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIKNWIRNIEEHASS-DVER---
               70        80        90       100       110          

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pF1KB5 VVLGNKIDLEN-RQVATKRAQAWCYSKNNIPYFETSAKEAINVEQAFQTIARNAL-KQET
       ..:::: :... :::. .:..    . . : ..::::: . :::.:: :.::. . : . 
CCDS10 MILGNKCDMNDKRQVSKERGEKLAIDYG-IKFLETSAKSSANVEEAFFTLARDIMTKLNR
        120       130       140        150       160       170     

      180         190       200        
pF1KB5 EVELYNEFPE--PIKLDKNDRAKASAESCSC 
       ...  :      :.:. .:   :.:   ::  
CCDS10 KMNDSNSAGAGGPVKITENRSKKTSFFRCSLL
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207 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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