Result of FASTA (omim) for pF1KB5346
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5346, 618 aa
  1>>>pF1KB5346 618 - 618 aa - 618 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6366+/-0.000484; mu= -1.9433+/- 0.030
 mean_var=229.7505+/-46.403, 0's: 0 Z-trim(115.7): 25  B-trim: 41 in 1/53
 Lambda= 0.084615
 statistics sampled from 26318 (26339) to 26318 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.645), E-opt: 0.2 (0.309), width:  16
 Scan time: 10.630

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001123579 (OMIM: 600025) kinesin light chain 1  ( 618) 4011 503.4 9.5e-142
NP_891553 (OMIM: 600025) kinesin light chain 1 iso ( 573) 3600 453.2 1.1e-126
NP_005543 (OMIM: 600025) kinesin light chain 1 iso ( 560) 3590 452.0 2.6e-126
XP_005274241 (OMIM: 609541,611729) PREDICTED: kine ( 600) 2614 332.8   2e-90
NP_001305663 (OMIM: 609541,611729) kinesin light c ( 622) 2614 332.8 2.1e-90
NP_073733 (OMIM: 609541,611729) kinesin light chai ( 622) 2614 332.8 2.1e-90
NP_001128248 (OMIM: 609541,611729) kinesin light c ( 622) 2614 332.8 2.1e-90
XP_005274240 (OMIM: 609541,611729) PREDICTED: kine ( 622) 2614 332.8 2.1e-90
NP_001128247 (OMIM: 609541,611729) kinesin light c ( 622) 2614 332.8 2.1e-90
NP_001128246 (OMIM: 609541,611729) kinesin light c ( 545) 2055 264.6 6.5e-70
NP_803136 (OMIM: 601334) kinesin light chain 3 [Ho ( 504) 1691 220.1 1.5e-56
XP_016873622 (OMIM: 609541,611729) PREDICTED: kine ( 425) 1576 206.0 2.1e-52
NP_694972 (OMIM: 208540,267010,604387,608002) neph (1330)  464 70.6 3.9e-11


>>NP_001123579 (OMIM: 600025) kinesin light chain 1 isof  (618 aa)
 initn: 4011 init1: 4011 opt: 4011  Z-score: 2665.8  bits: 503.4 E(85289): 9.5e-142
Smith-Waterman score: 4011; 100.0% identity (100.0% similar) in 618 aa overlap (1-618:1-618)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 PNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQAL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 EDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 NNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEY
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 YYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 DENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 EAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYESGPDGGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYESGPDGGE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 EVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASLAEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASLAEP
              550       560       570       580       590       600

              610        
pF1KB5 LFVENDSSSSGLEDATAN
       ::::::::::::::::::
NP_001 LFVENDSSSSGLEDATAN
              610        

>>NP_891553 (OMIM: 600025) kinesin light chain 1 isoform  (573 aa)
 initn: 3600 init1: 3600 opt: 3600  Z-score: 2395.1  bits: 453.2 E(85289): 1.1e-126
Smith-Waterman score: 3600; 97.0% identity (98.1% similar) in 571 aa overlap (1-571:1-571)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 PNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 PNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQAL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 EDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 EDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 NNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 NNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEY
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 YYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 YYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 DENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 DENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 EAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYESGPDGGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_891 EAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYESGPDGGE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 EVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASLAEP
       ::::::::::  .:  .  :. .. .   ::                             
NP_891 EVSMSVEWNGGVSGRASFCGKRQQQQWPGRRHR                           
              550       560       570                              

              610        
pF1KB5 LFVENDSSSSGLEDATAN

>>NP_005543 (OMIM: 600025) kinesin light chain 1 isoform  (560 aa)
 initn: 3590 init1: 3590 opt: 3590  Z-score: 2388.7  bits: 452.0 E(85289): 2.6e-126
Smith-Waterman score: 3590; 100.0% identity (100.0% similar) in 550 aa overlap (1-550:1-550)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 PNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQAL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 EDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 NNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEY
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 YYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 YYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 DENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKF
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pF1KB5 EAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYESGPDGGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYESGPDGGE
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pF1KB5 EVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASLAEP
       ::::::::::                                                  
NP_005 EVSMSVEWNGMRKMKLGLVN                                        
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>>XP_005274241 (OMIM: 609541,611729) PREDICTED: kinesin   (600 aa)
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           :. ::. .:   :::.::::.  :: ::::::.:..:: ..:  :.      .  .
XP_005     MAMMVFPRE---EKLSQDEIVLGTKAVIQGLETLRGEHRALLAPLVAP----EAGE
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            .:.  ..:.::: .::::.::::..:::.::.:::::::::::::::: ::::::
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       :.:::.::::::.:::.::::::::.:: ::.:..: :.: ::.:.:  :  :. :::::
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       :: ::..:. .     ... ...:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB5 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::
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pF1KB5 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::.::::::::::: ::::
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pF1KB5 YYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSV
       :::.:::::: :.::::::::::::::::::::::::...::::::::::::::.:::::
XP_005 YYYRRALEIYATRLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKYQDAETLYKEILTRAHEKEFGSV
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pF1KB5 DDENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGK
       . .::::::::::::: : :..:.. .::::.::::::::::::.:::..::::::::::
XP_005 NGDNKPIWMHAEEREESKDKRRDSAPYGEYGSWYKACKVDSPTVNTTLRSLGALYRRQGK
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pF1KB5 FEAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENM--EKRRSRESLNVDVVKYESGPD
       .:::.:::. : :.:::::: . . .:.:.:.:  .   ..: ::.  .    . ::   
XP_005 LEAAHTLEDCASRNRKQGLDPASQTKVVELLKDGSGRRGDRRSSRDMAGGAGPRSESDL-
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pF1KB5 GGEEVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASL
         :.:. ..::::::.:::.:::::.::: ..::::: ::.::.::. .  :: ::  . 
XP_005 --EDVGPTAEWNGDGSGSLRRSGSFGKLRDALRRSSEMLVKKLQGGTPQ--EPPNPRMKR
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pF1KB5 AEPLFVENDSSSSGLEDATAN
       :  :   : :           
XP_005 ASSLNFLNKSVEEPTQQGPLP
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>>NP_001305663 (OMIM: 609541,611729) kinesin light chain  (622 aa)
 initn: 2557 init1: 1778 opt: 2614  Z-score: 1744.1  bits: 332.8 E(85289): 2.1e-90
Smith-Waterman score: 2625; 69.1% identity (85.1% similar) in 606 aa overlap (5-607:1-589)

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pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
           :. ::. .:   :::.::::.  :: ::::::.:..:: ..:  :.      .  .
NP_001     MAMMVFPRE---EKLSQDEIVLGTKAVIQGLETLRGEHRALLAPLVAP----EAGE
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pF1KB5 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
            .:.  ..:.::: .::::.::::..:::.::.:::::::::::::::: ::::::
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pF1KB5 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
       :.:::.::::::.:::.::::::::.:: ::.:..: :.: ::.:.:  :  :. :::::
NP_001 REELAGTQQKLQRSEQAVAQLEEEKQHLLFMSQIRKLDEDASPNEEKG-DVPKDTLDDLF
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pF1KB5 PN-DEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQA
       :: ::..:. .     ... ...:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PNEDEQSPAPS----PGGGDVSGQHGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQA
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pF1KB5 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::
NP_001 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
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pF1KB5 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::.::::::::::: ::::
NP_001 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKFHPDVAKQLSNLALLCQNQGKAEEVE
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pF1KB5 YYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSV
       :::.:::::: :.::::::::::::::::::::::::...::::::::::::::.:::::
NP_001 YYYRRALEIYATRLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKYQDAETLYKEILTRAHEKEFGSV
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pF1KB5 DDENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGK
       . .::::::::::::: : :..:.. .::::.::::::::::::.:::..::::::::::
NP_001 NGDNKPIWMHAEEREESKDKRRDSAPYGEYGSWYKACKVDSPTVNTTLRSLGALYRRQGK
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pF1KB5 FEAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENM--EKRRSRESLNVDVVKYESGPD
       .:::.:::. : :.:::::: . . .:.:.:.:  .   ..: ::.  .    . ::   
NP_001 LEAAHTLEDCASRNRKQGLDPASQTKVVELLKDGSGRRGDRRSSRDMAGGAGPRSESDL-
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pF1KB5 GGEEVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASL
         :.:. ..::::::.:::.:::::.::: ..::::: ::.::.::. .  :: ::  . 
NP_001 --EDVGPTAEWNGDGSGSLRRSGSFGKLRDALRRSSEMLVKKLQGGTPQ--EPPNPRMKR
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pF1KB5 AEPLFVENDSSSSGLEDATAN                      
       :  :   : :                                 
NP_001 ASSLNFLNKSVEEPTQPGGTGLSDSRTLSSSSMDLSRRSSLVG
     580       590       600       610       620  

>>NP_073733 (OMIM: 609541,611729) kinesin light chain 2   (622 aa)
 initn: 2557 init1: 1778 opt: 2614  Z-score: 1744.1  bits: 332.8 E(85289): 2.1e-90
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               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
           :. ::. .:   :::.::::.  :: ::::::.:..:: ..:  :.      .  .
NP_073     MAMMVFPRE---EKLSQDEIVLGTKAVIQGLETLRGEHRALLAPLVAP----EAGE
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pF1KB5 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
            .:.  ..:.::: .::::.::::..:::.::.:::::::::::::::: ::::::
NP_073 AEPGSQERCILLRRSLEAIELGLGEAQVILALSSHLGAVESEKQKLRAQVRRLVQENQWL
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pF1KB5 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
       :.:::.::::::.:::.::::::::.:: ::.:..: :.: ::.:.:  :  :. :::::
NP_073 REELAGTQQKLQRSEQAVAQLEEEKQHLLFMSQIRKLDEDASPNEEKG-DVPKDTLDDLF
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pF1KB5 PN-DEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQA
       :: ::..:. .     ... ...:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_073 PNEDEQSPAPS----PGGGDVSGQHGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQA
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pF1KB5 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::
NP_073 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
          230       240       250       260       270       280    

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pF1KB5 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::.::::::::::: ::::
NP_073 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKFHPDVAKQLSNLALLCQNQGKAEEVE
          290       300       310       320       330       340    

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pF1KB5 YYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSV
       :::.:::::: :.::::::::::::::::::::::::...::::::::::::::.:::::
NP_073 YYYRRALEIYATRLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKYQDAETLYKEILTRAHEKEFGSV
          350       360       370       380       390       400    

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pF1KB5 DDENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGK
       . .::::::::::::: : :..:.. .::::.::::::::::::.:::..::::::::::
NP_073 NGDNKPIWMHAEEREESKDKRRDSAPYGEYGSWYKACKVDSPTVNTTLRSLGALYRRQGK
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pF1KB5 FEAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENM--EKRRSRESLNVDVVKYESGPD
       .:::.:::. : :.:::::: . . .:.:.:.:  .   ..: ::.  .    . ::   
NP_073 LEAAHTLEDCASRNRKQGLDPASQTKVVELLKDGSGRRGDRRSSRDMAGGAGPRSESDL-
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pF1KB5 GGEEVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASL
         :.:. ..::::::.:::.:::::.::: ..::::: ::.::.::. .  :: ::  . 
NP_073 --EDVGPTAEWNGDGSGSLRRSGSFGKLRDALRRSSEMLVKKLQGGTPQ--EPPNPRMKR
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pF1KB5 AEPLFVENDSSSSGLEDATAN                      
       :  :   : :                                 
NP_073 ASSLNFLNKSVEEPTQPGGTGLSDSRTLSSSSMDLSRRSSLVG
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>>NP_001128248 (OMIM: 609541,611729) kinesin light chain  (622 aa)
 initn: 2557 init1: 1778 opt: 2614  Z-score: 1744.1  bits: 332.8 E(85289): 2.1e-90
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           :. ::. .:   :::.::::.  :: ::::::.:..:: ..:  :.      .  .
NP_001     MAMMVFPRE---EKLSQDEIVLGTKAVIQGLETLRGEHRALLAPLVAP----EAGE
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            .:.  ..:.::: .::::.::::..:::.::.:::::::::::::::: ::::::
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       :.:::.::::::.:::.::::::::.:: ::.:..: :.: ::.:.:  :  :. :::::
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       :: ::..:. .     ... ...:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB5 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::
NP_001 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
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pF1KB5 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::.::::::::::: ::::
NP_001 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKFHPDVAKQLSNLALLCQNQGKAEEVE
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pF1KB5 YYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSV
       :::.:::::: :.::::::::::::::::::::::::...::::::::::::::.:::::
NP_001 YYYRRALEIYATRLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKYQDAETLYKEILTRAHEKEFGSV
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pF1KB5 DDENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGK
       . .::::::::::::: : :..:.. .::::.::::::::::::.:::..::::::::::
NP_001 NGDNKPIWMHAEEREESKDKRRDSAPYGEYGSWYKACKVDSPTVNTTLRSLGALYRRQGK
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pF1KB5 FEAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENM--EKRRSRESLNVDVVKYESGPD
       .:::.:::. : :.:::::: . . .:.:.:.:  .   ..: ::.  .    . ::   
NP_001 LEAAHTLEDCASRNRKQGLDPASQTKVVELLKDGSGRRGDRRSSRDMAGGAGPRSESDL-
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pF1KB5 GGEEVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASL
         :.:. ..::::::.:::.:::::.::: ..::::: ::.::.::. .  :: ::  . 
NP_001 --EDVGPTAEWNGDGSGSLRRSGSFGKLRDALRRSSEMLVKKLQGGTPQ--EPPNPRMKR
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pF1KB5 AEPLFVENDSSSSGLEDATAN                      
       :  :   : :                                 
NP_001 ASSLNFLNKSVEEPTQPGGTGLSDSRTLSSSSMDLSRRSSLVG
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>>XP_005274240 (OMIM: 609541,611729) PREDICTED: kinesin   (622 aa)
 initn: 2557 init1: 1778 opt: 2614  Z-score: 1744.1  bits: 332.8 E(85289): 2.1e-90
Smith-Waterman score: 2625; 69.1% identity (85.1% similar) in 606 aa overlap (5-607:1-589)

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pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
           :. ::. .:   :::.::::.  :: ::::::.:..:: ..:  :.      .  .
XP_005     MAMMVFPRE---EKLSQDEIVLGTKAVIQGLETLRGEHRALLAPLVAP----EAGE
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pF1KB5 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
            .:.  ..:.::: .::::.::::..:::.::.:::::::::::::::: ::::::
XP_005 AEPGSQERCILLRRSLEAIELGLGEAQVILALSSHLGAVESEKQKLRAQVRRLVQENQWL
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pF1KB5 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
       :.:::.::::::.:::.::::::::.:: ::.:..: :.: ::.:.:  :  :. :::::
XP_005 REELAGTQQKLQRSEQAVAQLEEEKQHLLFMSQIRKLDEDASPNEEKG-DVPKDTLDDLF
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pF1KB5 PN-DEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQA
       :: ::..:. .     ... ...:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB5 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::
XP_005 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
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pF1KB5 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::.::::::::::: ::::
XP_005 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKFHPDVAKQLSNLALLCQNQGKAEEVE
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pF1KB5 YYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSV
       :::.:::::: :.::::::::::::::::::::::::...::::::::::::::.:::::
XP_005 YYYRRALEIYATRLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKYQDAETLYKEILTRAHEKEFGSV
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pF1KB5 DDENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGK
       . .::::::::::::: : :..:.. .::::.::::::::::::.:::..::::::::::
XP_005 NGDNKPIWMHAEEREESKDKRRDSAPYGEYGSWYKACKVDSPTVNTTLRSLGALYRRQGK
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pF1KB5 FEAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENM--EKRRSRESLNVDVVKYESGPD
       .:::.:::. : :.:::::: . . .:.:.:.:  .   ..: ::.  .    . ::   
XP_005 LEAAHTLEDCASRNRKQGLDPASQTKVVELLKDGSGRRGDRRSSRDMAGGAGPRSESDL-
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pF1KB5 GGEEVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASL
         :.:. ..::::::.:::.:::::.::: ..::::: ::.::.::. .  :: ::  . 
XP_005 --EDVGPTAEWNGDGSGSLRRSGSFGKLRDALRRSSEMLVKKLQGGTPQ--EPPNPRMKR
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pF1KB5 AEPLFVENDSSSSGLEDATAN                      
       :  :   : :                                 
XP_005 ASSLNFLNKSVEEPTQPGGTGLSDSRTLSSSSMDLSRRSSLVG
     580       590       600       610       620  

>>NP_001128247 (OMIM: 609541,611729) kinesin light chain  (622 aa)
 initn: 2557 init1: 1778 opt: 2614  Z-score: 1744.1  bits: 332.8 E(85289): 2.1e-90
Smith-Waterman score: 2625; 69.1% identity (85.1% similar) in 606 aa overlap (5-607:1-589)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
           :. ::. .:   :::.::::.  :: ::::::.:..:: ..:  :.      .  .
NP_001     MAMMVFPRE---EKLSQDEIVLGTKAVIQGLETLRGEHRALLAPLVAP----EAGE
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pF1KB5 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
            .:.  ..:.::: .::::.::::..:::.::.:::::::::::::::: ::::::
NP_001 AEPGSQERCILLRRSLEAIELGLGEAQVILALSSHLGAVESEKQKLRAQVRRLVQENQWL
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pF1KB5 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
       :.:::.::::::.:::.::::::::.:: ::.:..: :.: ::.:.:  :  :. :::::
NP_001 REELAGTQQKLQRSEQAVAQLEEEKQHLLFMSQIRKLDEDASPNEEKG-DVPKDTLDDLF
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pF1KB5 PN-DEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQA
       :: ::..:. .     ... ...:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PNEDEQSPAPS----PGGGDVSGQHGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQA
      170           180       190       200       210       220    

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB5 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::
NP_001 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
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pF1KB5 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::.::::::::::: ::::
NP_001 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKFHPDVAKQLSNLALLCQNQGKAEEVE
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pF1KB5 YYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSV
       :::.:::::: :.::::::::::::::::::::::::...::::::::::::::.:::::
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pF1KB5 DDENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGK
       . .::::::::::::: : :..:.. .::::.::::::::::::.:::..::::::::::
NP_001 NGDNKPIWMHAEEREESKDKRRDSAPYGEYGSWYKACKVDSPTVNTTLRSLGALYRRQGK
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       .:::.:::. : :.:::::: . . .:.:.:.:  .   ..: ::.  .    . ::   
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         :.:. ..::::::.:::.:::::.::: ..::::: ::.::.::. .  :: ::  . 
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618 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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