Result of FASTA (ccds) for pF1KB5346
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5346, 618 aa
  1>>>pF1KB5346 618 - 618 aa - 618 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9420+/-0.00121; mu= 2.3514+/- 0.072
 mean_var=194.1988+/-39.514, 0's: 0 Z-trim(107.8): 29  B-trim: 12 in 1/50
 Lambda= 0.092035
 statistics sampled from 9770 (9788) to 9770 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.645), E-opt: 0.2 (0.301), width:  16
 Scan time:  3.680

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS45168.1 KLC1 gene_id:3831|Hs108|chr14          ( 618) 4011 545.7 6.5e-155
CCDS41996.1 KLC1 gene_id:3831|Hs108|chr14          ( 573) 3600 491.1 1.6e-138
CCDS32165.1 KLC1 gene_id:3831|Hs108|chr14          ( 560) 3590 489.8  4e-138
CCDS4883.1 KLC4 gene_id:89953|Hs108|chr6           ( 619) 2688 370.1 4.9e-102
CCDS4882.1 KLC4 gene_id:89953|Hs108|chr6           ( 637) 2688 370.1  5e-102
CCDS8130.1 KLC2 gene_id:64837|Hs108|chr11          ( 622) 2614 360.2 4.5e-99
CCDS75459.1 KLC4 gene_id:89953|Hs108|chr6          ( 542) 2060 286.7 5.6e-77
CCDS44653.1 KLC2 gene_id:64837|Hs108|chr11         ( 545) 2055 286.0 8.9e-77
CCDS12660.2 KLC3 gene_id:147700|Hs108|chr19        ( 504) 1691 237.6 2.9e-62
CCDS47429.1 KLC4 gene_id:89953|Hs108|chr6          ( 315) 1323 188.7   1e-47
CCDS3078.1 NPHP3 gene_id:27031|Hs108|chr3          (1330)  464 75.0 7.2e-13


>>CCDS45168.1 KLC1 gene_id:3831|Hs108|chr14               (618 aa)
 initn: 4011 init1: 4011 opt: 4011  Z-score: 2894.7  bits: 545.7 E(32554): 6.5e-155
Smith-Waterman score: 4011; 100.0% identity (100.0% similar) in 618 aa overlap (1-618:1-618)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 PNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQAL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 EDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 NNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEY
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 YYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 DENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 EAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYESGPDGGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYESGPDGGE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 EVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASLAEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASLAEP
              550       560       570       580       590       600

              610        
pF1KB5 LFVENDSSSSGLEDATAN
       ::::::::::::::::::
CCDS45 LFVENDSSSSGLEDATAN
              610        

>>CCDS41996.1 KLC1 gene_id:3831|Hs108|chr14               (573 aa)
 initn: 3600 init1: 3600 opt: 3600  Z-score: 2600.3  bits: 491.1 E(32554): 1.6e-138
Smith-Waterman score: 3600; 97.0% identity (98.1% similar) in 571 aa overlap (1-571:1-571)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 PNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQAL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 EDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 NNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEY
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 YYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 YYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 DENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 EAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYESGPDGGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYESGPDGGE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 EVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASLAEP
       ::::::::::  .:  .  :. .. .   ::                             
CCDS41 EVSMSVEWNGGVSGRASFCGKRQQQQWPGRRHR                           
              550       560       570                              

              610        
pF1KB5 LFVENDSSSSGLEDATAN

>>CCDS32165.1 KLC1 gene_id:3831|Hs108|chr14               (560 aa)
 initn: 3590 init1: 3590 opt: 3590  Z-score: 2593.2  bits: 489.8 E(32554): 4e-138
Smith-Waterman score: 3590; 100.0% identity (100.0% similar) in 550 aa overlap (1-550:1-550)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 PNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQAL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 EDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 NNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVEY
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 YYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSVD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 DENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGKF
              430       440       450       460       470       480

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pF1KB5 EAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYESGPDGGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYESGPDGGE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 EVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASLAEP
       ::::::::::                                                  
CCDS32 EVSMSVEWNGMRKMKLGLVN                                        
              550       560                                        

>>CCDS4883.1 KLC4 gene_id:89953|Hs108|chr6                (619 aa)
 initn: 1982 init1: 1452 opt: 2688  Z-score: 1945.3  bits: 370.1 E(32554): 4.9e-102
Smith-Waterman score: 2688; 68.3% identity (88.6% similar) in 615 aa overlap (5-613:1-603)

               10          20        30        40        50        
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKL--EKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKK
           :: .:  ..:.   ..:.:.::...:. : ::::::..::...:::: .:..::..
CCDS48     MSGLVLGQRDEPAGHRLSQEEILGSTRLVSQGLEALRSEHQAVLQSLSQTIECLQQ
                   10        20        30        40        50      

       60         70        80        90       100       110       
pF1KB5 DD-ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQEN
          : .::.::. ..:.:.: .::::::::::.::..::..:::::::::::::::::::
CCDS48 GGHEEGLVHEKARQLRRSMENIELGLSEAQVMLALASHLSTVESEKQKLRAQVRRLCQEN
         60        70        80        90       100       110      

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB5 QWLRDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLD
       ::::::::.:::.::.:::.:::::::::::::..::..::.:   ::.:. :.::. ::
CCDS48 QWLRDELAGTQQRLQRSEQAVAQLEEEKKHLEFLGQLRQYDEDGHTSEEKEGDATKDSLD
        120       130       140       150       160       170      

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pF1KB5 DLFPNDED-DPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLC
       :::::.:. ::..:...  ...:.::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS48 DLFPNEEEEDPSNGLSR--GQGATAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYAAQGRYEVAVPLC
        180       190         200       210       220       230    

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB5 KQALEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAV
       ::::::::.:::. ::::::::::::::::::::::.::.::::::.:::.::: :::::
CCDS48 KQALEDLERTSGRGHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALSIRESTLGPDHPAV
          240       250       260       270       280       290    

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pF1KB5 AATLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYE
       ::::::::::::::::::::::::.::::::::::: .::::::::::::::::::::::
CCDS48 AATLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCQRALEIREKVLGTNHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYE
          300       310       320       330       340       350    

        360       370       380       390       400       410      
pF1KB5 EVEYYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREF
        :: :::::: ::. .::::.::::.::::::::::::::. .::::::::::::: .::
CCDS48 AVERYYQRALAIYEGQLGPDNPNVARTKNNLASCYLKQGKYAEAETLYKEILTRAHVQEF
          360       370       380       390       400       410    

        420       430        440        450       460       470    
pF1KB5 GSVDDENKPIWMHAEEREE-CKGKQKDG-TSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALY
       :::::..::::::::::::  :.....: : ..:::::::::::.::::.:::.::::::
CCDS48 GSVDDDHKPIWMHAEEREEMSKSRHHEGGTPYAEYGGWYKACKVSSPTVNTTLRNLGALY
          420       430       440       450       460       470    

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pF1KB5 RRQGKFEAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYES
       :::::.:::::::: :.:::.:: : . . .:::.:.. ..  .: :.:. . : ::.: 
CCDS48 RRQGKLEAAETLEECALRSRRQGTDPISQTKVAELLGESDG--RRTSQEGPG-DSVKFE-
          480       490       500       510         520        530 

          540       550       560       570       580       590    
pF1KB5 GPDGGEEVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPG
          :::..:..:::.:::.:.:.::::..:.:  .::::: :::::.:    : .:.. .
CCDS48 ---GGEDASVAVEWSGDGSGTLQRSGSLGKIRDVLRRSSELLVRKLQG---TEPRPSSSN
                 540       550       560       570          580    

          600       610                   
pF1KB5 ASLAEPLFVENDSSSSGLEDATAN           
        . :  :   :. :.. :.                
CCDS48 MKRAASLNYLNQPSAAPLQVSRGLSASTMDLSSSS
          590       600       610         

>>CCDS4882.1 KLC4 gene_id:89953|Hs108|chr6                (637 aa)
 initn: 1982 init1: 1452 opt: 2688  Z-score: 1945.1  bits: 370.1 E(32554): 5e-102
Smith-Waterman score: 2688; 68.3% identity (88.6% similar) in 615 aa overlap (5-613:19-621)

                             10          20        30        40    
pF1KB5               MYDNMSTMVYIKEDKL--EKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNS
                         :: .:  ..:.   ..:.:.::...:. : ::::::..::..
CCDS48 MEVTGFGVTRPGKVPQARMSGLVLGQRDEPAGHRLSQEEILGSTRLVSQGLEALRSEHQA
               10        20        30        40        50        60

           50        60         70        80        90       100   
pF1KB5 ILQSLLETLKCLKKDD-ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEK
       .:::: .:..::..   : .::.::. ..:.:.: .::::::::::.::..::..:::::
CCDS48 VLQSLSQTIECLQQGGHEEGLVHEKARQLRRSMENIELGLSEAQVMLALASHLSTVESEK
               70        80        90       100       110       120

           110       120       130       140       150       160   
pF1KB5 QKLRAQVRRLCQENQWLRDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISP
       ::::::::::::::::::::::.:::.::.:::.:::::::::::::..::..::.:   
CCDS48 QKLRAQVRRLCQENQWLRDELAGTQQRLQRSEQAVAQLEEEKKHLEFLGQLRQYDEDGHT
              130       140       150       160       170       180

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pF1KB5 SEDKDTDSTKEPLDDLFPNDED-DPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQ
       ::.:. :.::. :::::::.:. ::..:...  ...:.::::::::::::::::::::::
CCDS48 SEEKEGDATKDSLDDLFPNEEEEDPSNGLSR--GQGATAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQ
              190       200       210         220       230        

            230       240       250       260       270       280  
pF1KB5 YASQGRYEVAVPLCKQALEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDAL
       ::.:::::::::::::::::::.:::. ::::::::::::::::::::::.::.::::::
CCDS48 YAAQGRYEVAVPLCKQALEDLERTSGRGHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDAL
      240       250       260       270       280       290        

            290       300       310       320       330       340  
pF1KB5 AIREKTLGKDHPAVAATLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQL
       .:::.::: :::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::: .::::::::
CCDS48 SIRESTLGPDHPAVAATLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCQRALEIREKVLGTNHPDVAKQL
      300       310       320       330       340       350        

            350       360       370       380       390       400  
pF1KB5 NNLALLCQNQGKYEEVEYYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAET
       :::::::::::::: :: :::::: ::. .::::.::::.::::::::::::::. .:::
CCDS48 NNLALLCQNQGKYEAVERYYQRALAIYEGQLGPDNPNVARTKNNLASCYLKQGKYAEAET
      360       370       380       390       400       410        

            410       420       430        440        450       460
pF1KB5 LYKEILTRAHEREFGSVDDENKPIWMHAEEREE-CKGKQKDG-TSFGEYGGWYKACKVDS
       :::::::::: .:::::::..::::::::::::  :.....: : ..:::::::::::.:
CCDS48 LYKEILTRAHVQEFGSVDDDHKPIWMHAEEREEMSKSRHHEGGTPYAEYGGWYKACKVSS
      420       430       440       450       460       470        

              470       480       490       500       510       520
pF1KB5 PTVTTTLKNLGALYRRQGKFEAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRR
       :::.:::.:::::::::::.:::::::: :.:::.:: : . . .:::.:.. ..  .: 
CCDS48 PTVNTTLRNLGALYRRQGKLEAAETLEECALRSRRQGTDPISQTKVAELLGESDG--RRT
      480       490       500       510       520       530        

              530       540       550       560       570       580
pF1KB5 SRESLNVDVVKYESGPDGGEEVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKL
       :.:. . : ::.:    :::..:..:::.:::.:.:.::::..:.:  .::::: :::::
CCDS48 SQEGPG-DSVKFE----GGEDASVAVEWSGDGSGTLQRSGSLGKIRDVLRRSSELLVRKL
        540            550       560       570       580       590 

              590       600       610                   
pF1KB5 KGGSSRESEPKNPGASLAEPLFVENDSSSSGLEDATAN           
       .:    : .:.. . . :  :   :. :.. :.                
CCDS48 QG---TEPRPSSSNMKRAASLNYLNQPSAAPLQVSRGLSASTMDLSSSS
                600       610       620       630       

>>CCDS8130.1 KLC2 gene_id:64837|Hs108|chr11               (622 aa)
 initn: 2557 init1: 1778 opt: 2614  Z-score: 1892.2  bits: 360.2 E(32554): 4.5e-99
Smith-Waterman score: 2625; 69.1% identity (85.1% similar) in 606 aa overlap (5-607:1-589)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
           :. ::. .:   :::.::::.  :: ::::::.:..:: ..:  :.      .  .
CCDS81     MAMMVFPRE---EKLSQDEIVLGTKAVIQGLETLRGEHRALLAPLVAP----EAGE
                      10        20        30        40             

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
            .:.  ..:.::: .::::.::::..:::.::.:::::::::::::::: ::::::
CCDS81 AEPGSQERCILLRRSLEAIELGLGEAQVILALSSHLGAVESEKQKLRAQVRRLVQENQWL
      50        60        70        80        90       100         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
       :.:::.::::::.:::.::::::::.:: ::.:..: :.: ::.:.:  :  :. :::::
CCDS81 REELAGTQQKLQRSEQAVAQLEEEKQHLLFMSQIRKLDEDASPNEEKG-DVPKDTLDDLF
     110       120       130       140       150        160        

               190       200       210       220       230         
pF1KB5 PN-DEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQA
       :: ::..:. .     ... ...:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PNEDEQSPAPS----PGGGDVSGQHGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQA
      170           180       190       200       210       220    

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB5 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::
CCDS81 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
          230       240       250       260       270       280    

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB5 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::.::::::::::: ::::
CCDS81 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKFHPDVAKQLSNLALLCQNQGKAEEVE
          290       300       310       320       330       340    

     360       370       380       390       400       410         
pF1KB5 YYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSV
       :::.:::::: :.::::::::::::::::::::::::...::::::::::::::.:::::
CCDS81 YYYRRALEIYATRLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKYQDAETLYKEILTRAHEKEFGSV
          350       360       370       380       390       400    

     420       430       440       450       460       470         
pF1KB5 DDENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGK
       . .::::::::::::: : :..:.. .::::.::::::::::::.:::..::::::::::
CCDS81 NGDNKPIWMHAEEREESKDKRRDSAPYGEYGSWYKACKVDSPTVNTTLRSLGALYRRQGK
          410       420       430       440       450       460    

     480       490       500       510         520       530       
pF1KB5 FEAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENM--EKRRSRESLNVDVVKYESGPD
       .:::.:::. : :.:::::: . . .:.:.:.:  .   ..: ::.  .    . ::   
CCDS81 LEAAHTLEDCASRNRKQGLDPASQTKVVELLKDGSGRRGDRRSSRDMAGGAGPRSESDL-
          470       480       490       500       510       520    

       540       550       560       570       580       590       
pF1KB5 GGEEVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASL
         :.:. ..::::::.:::.:::::.::: ..::::: ::.::.::. .  :: ::  . 
CCDS81 --EDVGPTAEWNGDGSGSLRRSGSFGKLRDALRRSSEMLVKKLQGGTPQ--EPPNPRMKR
             530       540       550       560       570           

       600       610                              
pF1KB5 AEPLFVENDSSSSGLEDATAN                      
       :  :   : :                                 
CCDS81 ASSLNFLNKSVEEPTQPGGTGLSDSRTLSSSSMDLSRRSSLVG
     580       590       600       610       620  

>>CCDS75459.1 KLC4 gene_id:89953|Hs108|chr6               (542 aa)
 initn: 2125 init1: 1390 opt: 2060  Z-score: 1495.5  bits: 286.7 E(32554): 5.6e-77
Smith-Waterman score: 2119; 58.5% identity (76.6% similar) in 615 aa overlap (5-613:1-526)

               10          20        30        40        50        
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKL--EKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKK
           :: .:  ..:.   ..:.:.::...:. : ::::::..::...:::: .:..::..
CCDS75     MSGLVLGQRDEPAGHRLSQEEILGSTRLVSQGLEALRSEHQAVLQSLSQTIECLQQ
                   10        20        30        40        50      

       60         70        80        90       100       110       
pF1KB5 DD-ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQEN
          : .::.::. ..:.:.: .::::::::                              
CCDS75 GGHEEGLVHEKARQLRRSMENIELGLSEAQ------------------------------
         60        70        80                                    

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB5 QWLRDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLD
                                                      :.:. :.::. ::
CCDS75 -----------------------------------------------EEKEGDATKDSLD
                                                        90         

       180        190       200       210       220       230      
pF1KB5 DLFPNDED-DPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLC
       :::::.:. ::..:...  ...:.::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS75 DLFPNEEEEDPSNGLSR--GQGATAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYAAQGRYEVAVPLC
     100       110         120       130       140       150       

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB5 KQALEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAV
       ::::::::.:::. ::::::::::::::::::::::.::.::::::.:::.::: :::::
CCDS75 KQALEDLERTSGRGHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALSIRESTLGPDHPAV
       160       170       180       190       200       210       

        300       310       320       330       340       350      
pF1KB5 AATLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYE
       ::::::::::::::::::::::::.::::::::::: .::::::::::::::::::::::
CCDS75 AATLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCQRALEIREKVLGTNHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYE
       220       230       240       250       260       270       

        360       370       380       390       400       410      
pF1KB5 EVEYYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREF
        :: :::::: ::. .::::.::::.::::::::::::::. .::::::::::::: .::
CCDS75 AVERYYQRALAIYEGQLGPDNPNVARTKNNLASCYLKQGKYAEAETLYKEILTRAHVQEF
       280       290       300       310       320       330       

        420       430        440        450       460       470    
pF1KB5 GSVDDENKPIWMHAEEREE-CKGKQKDG-TSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALY
       :::::..::::::::::::  :.....: : ..:::::::::::.::::.:::.::::::
CCDS75 GSVDDDHKPIWMHAEEREEMSKSRHHEGGTPYAEYGGWYKACKVSSPTVNTTLRNLGALY
       340       350       360       370       380       390       

          480       490       500       510       520       530    
pF1KB5 RRQGKFEAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENMEKRRSRESLNVDVVKYES
       :::::.:::::::: :.:::.:: : . . .:::.:.. ..  .: :.:. . : ::.: 
CCDS75 RRQGKLEAAETLEECALRSRRQGTDPISQTKVAELLGESDG--RRTSQEGPG-DSVKFE-
       400       410       420       430         440        450    

          540       550       560       570       580       590    
pF1KB5 GPDGGEEVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPG
          :::..:..:::.:::.:.:.::::..:.:  .::::: :::::.:    : .:.. .
CCDS75 ---GGEDASVAVEWSGDGSGTLQRSGSLGKIRDVLRRSSELLVRKLQG---TEPRPSSSN
              460       470       480       490          500       

          600       610                   
pF1KB5 ASLAEPLFVENDSSSSGLEDATAN           
        . :  :   :. :.. :.                
CCDS75 MKRAASLNYLNQPSAAPLQVSRGLSASTMDLSSSS
       510       520       530       540  

>>CCDS44653.1 KLC2 gene_id:64837|Hs108|chr11              (545 aa)
 initn: 2147 init1: 1778 opt: 2055  Z-score: 1491.9  bits: 286.0 E(32554): 8.9e-77
Smith-Waterman score: 2073; 59.6% identity (73.1% similar) in 606 aa overlap (5-607:1-512)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
           :. ::. .:   :::.::::.  :: ::::::.:..:: ..:  :.      .  .
CCDS44     MAMMVFPRE---EKLSQDEIVLGTKAVIQGLETLRGEHRALLAPLVAP----EAGE
                      10        20        30        40             

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
            .:.  ..:.::: .::::.:::                                 
CCDS44 AEPGSQERCILLRRSLEAIELGLGEAQ---------------------------------
      50        60        70                                       

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
                             :::                        :  :. :::::
CCDS44 ----------------------EEKG-----------------------DVPKDTLDDLF
                               80                               90 

               190       200       210       220       230         
pF1KB5 PN-DEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQA
       :: ::..:.     . ... ...:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PNEDEQSPA----PSPGGGDVSGQHGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQA
             100           110       120       130       140       

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB5 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::
CCDS44 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
       150       160       170       180       190       200       

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB5 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::.::::::::::: ::::
CCDS44 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKFHPDVAKQLSNLALLCQNQGKAEEVE
       210       220       230       240       250       260       

     360       370       380       390       400       410         
pF1KB5 YYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSV
       :::.:::::: :.::::::::::::::::::::::::...::::::::::::::.:::::
CCDS44 YYYRRALEIYATRLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKYQDAETLYKEILTRAHEKEFGSV
       270       280       290       300       310       320       

     420       430       440       450       460       470         
pF1KB5 DDENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGK
       . .::::::::::::: : :..:.. .::::.::::::::::::.:::..::::::::::
CCDS44 NGDNKPIWMHAEEREESKDKRRDSAPYGEYGSWYKACKVDSPTVNTTLRSLGALYRRQGK
       330       340       350       360       370       380       

     480       490       500       510         520       530       
pF1KB5 FEAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENM--EKRRSRESLNVDVVKYESGPD
       .:::.:::. : :.:::::: . . .:.:.:.:  .   ..: ::.  .    . ::   
CCDS44 LEAAHTLEDCASRNRKQGLDPASQTKVVELLKDGSGRRGDRRSSRDMAGGAGPRSESDL-
       390       400       410       420       430       440       

       540       550       560       570       580       590       
pF1KB5 GGEEVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASL
         :.:. ..::::::.:::.:::::.::: ..::::: ::.::.::. .  :: ::  . 
CCDS44 --EDVGPTAEWNGDGSGSLRRSGSFGKLRDALRRSSEMLVKKLQGGTPQ--EPPNPRMKR
          450       460       470       480       490         500  

       600       610                              
pF1KB5 AEPLFVENDSSSSGLEDATAN                      
       :  :   : :                                 
CCDS44 ASSLNFLNKSVEEPTQPGGTGLSDSRTLSSSSMDLSRRSSLVG
            510       520       530       540     

>>CCDS12660.2 KLC3 gene_id:147700|Hs108|chr19             (504 aa)
 initn: 2148 init1: 1168 opt: 1691  Z-score: 1231.2  bits: 237.6 E(32554): 2.9e-62
Smith-Waterman score: 1691; 66.2% identity (87.1% similar) in 396 aa overlap (17-410:16-404)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
                       :.:. .:.. .:.::.::::::. ::...   : :.:       
CCDS12  MSVQVAAPGSAGLGPERLSPEELVRQTRQVVQGLEALRAEHHGLAGHLAEALAGQGPAA
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
         ...:::.... .::: .::::.::::..::: :..:.:.:::.::.:.::: ::: ::
CCDS12 GLEMLEEKQQVVSHSLEAIELGLGEAQVLLALSAHVGALEAEKQRLRSQARRLAQENVWL
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170          
pF1KB5 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDST--KEPLDD
       :.:: .::..:. ::.:::::::::.::::..::..::    :.:.....:   .. : .
CCDS12 REELEETQRRLRASEESVAQLEEEKRHLEFLGQLRQYDP---PAESQQSESPPRRDSLAS
     120       130       140       150          160       170      

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB5 LFPNDEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQ
       :::..:..  .:    ....::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.:
CCDS12 LFPSEEEER-KG---PEAAGAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYAGQGRYEVAVPLCRQ
        180           190       200       210       220       230  

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB5 ALEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAA
       ::::::..::: ::::::::::::::::::::::.:..::.::: :::.::: .::::::
CCDS12 ALEDLERSSGHCHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEATDLLHDALQIREQTLGPEHPAVAA
            240       250       260       270       280       290  

      300       310       320       330       340       350        
pF1KB5 TLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEV
       :::::::::::::.:.::::::.::::::::::: :::::::::::::::::::::.:.:
CCDS12 TLNNLAVLYGKRGRYREAEPLCQRALEIREKVLGADHPDVAKQLNNLALLCQNQGKFEDV
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CCDS47 DLFPNEEEEDPSNGLSR--GQGATAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYAAQGRYEVAVPLC
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CCDS47 SIPCPPHPTPRTPHHCCFGLS                                       
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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