Result of FASTA (omim) for pF1KB5093
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5093, 951 aa
  1>>>pF1KB5093 951 - 951 aa - 951 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6962+/-0.00049; mu= 20.3752+/- 0.030
 mean_var=140.9593+/-31.933, 0's: 0 Z-trim(112.0): 497  B-trim: 1935 in 2/50
 Lambda= 0.108026
 statistics sampled from 20125 (20758) to 20125 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.594), E-opt: 0.2 (0.243), width:  16
 Scan time:  9.850

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_060960 (OMIM: 606666,615311) leucine-rich repea ( 951) 6343 1001.9       0
NP_001333361 (OMIM: 606666,615311) leucine-rich re ( 927) 5770 912.6       0
NP_003658 (OMIM: 606667) leucine-rich repeat-conta ( 907) 1748 285.8 6.8e-76
NP_001017403 (OMIM: 606653) leucine-rich repeat-co ( 967) 1676 274.6 1.7e-72
XP_011508141 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 900) 1665 272.9 5.3e-72
NP_067649 (OMIM: 606653) leucine-rich repeat-conta ( 915) 1558 256.2 5.6e-67
XP_005245461 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 924) 1556 255.9   7e-67
XP_011508143 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 833) 1314 218.1 1.5e-55
XP_016857486 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 833) 1314 218.1 1.5e-55
XP_016857485 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 876) 1256 209.1 8.1e-53
NP_001264156 (OMIM: 606667) leucine-rich repeat-co ( 835) 1171 195.8 7.6e-49
XP_011508140 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 900) 1084 182.3 9.6e-45
XP_011508144 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 777) 1082 181.9 1.1e-44
XP_011508148 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 777) 1082 181.9 1.1e-44
XP_011508145 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 777) 1082 181.9 1.1e-44
XP_011508142 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 852) 1071 180.2 3.8e-44
NP_001264155 (OMIM: 606667) leucine-rich repeat-co ( 883) 1041 175.6 9.9e-43
XP_016857487 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 609) 1003 169.5 4.8e-41
NP_001017404 (OMIM: 606653) leucine-rich repeat-co ( 828)  969 164.3 2.3e-39
XP_011508146 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 708)  760 131.7 1.3e-29
XP_005268094 (OMIM: 275200,603372,603373,609152) P ( 764)  685 120.0 4.6e-26
NP_000360 (OMIM: 275200,603372,603373,609152) thyr ( 764)  685 120.0 4.6e-26
NP_852111 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) foll ( 669)  682 119.5 5.8e-26
NP_000136 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) foll ( 695)  651 114.7 1.7e-24
XP_011535421 (OMIM: 275200,603372,603373,609152) P ( 671)  611 108.4 1.2e-22
NP_004961 (OMIM: 601489,615961) insulin-like growt ( 605)  592 105.4 9.1e-22
NP_001139478 (OMIM: 601489,615961) insulin-like gr ( 643)  592 105.4 9.5e-22
XP_011531036 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) P ( 618)  557 100.0 4.1e-20
XP_011531035 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) P ( 729)  557 100.1 4.5e-20
XP_011531037 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) P ( 431)  542 97.4 1.6e-19
XP_011531038 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) P ( 431)  542 97.4 1.6e-19
XP_011531136 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 380)  531 95.6   5e-19
XP_005264366 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 380)  531 95.6   5e-19
XP_006712078 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 389)  531 95.7 5.1e-19
NP_001288115 (OMIM: 609791) leucine-rich repeat an ( 614)  533 96.2 5.4e-19
NP_001288129 (OMIM: 609791) leucine-rich repeat an ( 614)  533 96.2 5.4e-19
NP_001288123 (OMIM: 609791) leucine-rich repeat an ( 614)  533 96.2 5.4e-19
NP_001288126 (OMIM: 609791) leucine-rich repeat an ( 614)  533 96.2 5.4e-19
NP_001288127 (OMIM: 609791) leucine-rich repeat an ( 614)  533 96.2 5.4e-19
NP_001288118 (OMIM: 609791) leucine-rich repeat an ( 614)  533 96.2 5.4e-19
NP_001288124 (OMIM: 609791) leucine-rich repeat an ( 614)  533 96.2 5.4e-19
NP_001288120 (OMIM: 609791) leucine-rich repeat an ( 614)  533 96.2 5.4e-19
NP_001288121 (OMIM: 609791) leucine-rich repeat an ( 614)  533 96.2 5.4e-19
XP_011520420 (OMIM: 609791) PREDICTED: leucine-ric ( 614)  533 96.2 5.4e-19
XP_016878171 (OMIM: 609791) PREDICTED: leucine-ric ( 614)  533 96.2 5.4e-19
NP_001288116 (OMIM: 609791) leucine-rich repeat an ( 614)  533 96.2 5.4e-19
NP_001288128 (OMIM: 609791) leucine-rich repeat an ( 614)  533 96.2 5.4e-19
NP_116197 (OMIM: 609791) leucine-rich repeat and i ( 620)  533 96.2 5.4e-19
XP_016859579 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 487)  531 95.8 5.8e-19
XP_011531133 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 487)  531 95.8 5.8e-19


>>NP_060960 (OMIM: 606666,615311) leucine-rich repeat-co  (951 aa)
 initn: 6343 init1: 6343 opt: 6343  Z-score: 5353.5  bits: 1001.9 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 6343; 100.0% identity (100.0% similar) in 951 aa overlap (1-951:1-951)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MPGPLGLLCFLALGLLGSAGPSGAAPPLCAAPCSCDGDRRVDCSGKGLTAVPEGLSAFTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 MPGPLGLLCFLALGLLGSAGPSGAAPPLCAAPCSCDGDRRVDCSGKGLTAVPEGLSAFTQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 ALDISMNNITQLPEDAFKNFPFLEELQLAGNDLSFIHPKALSGLKELKVLTLQNNQLKTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 ALDISMNNITQLPEDAFKNFPFLEELQLAGNDLSFIHPKALSGLKELKVLTLQNNQLKTV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 PSEAIRGLSALQSLRLDANHITSVPEDSFEGLVQLRHLWLDDNSLTEVPVHPLSNLPTLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 PSEAIRGLSALQSLRLDANHITSVPEDSFEGLVQLRHLWLDDNSLTEVPVHPLSNLPTLQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 ALTLALNKISSIPDFAFTNLSSLVVLHLHNNKIRSLSQHCFDGLDNLETLDLNYNNLGEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 ALTLALNKISSIPDFAFTNLSSLVVLHLHNNKIRSLSQHCFDGLDNLETLDLNYNNLGEF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 PQAIKALPSLKELGFHSNSISVIPDGAFDGNPLLRTIHLYDNPLSFVGNSAFHNLSDLHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 PQAIKALPSLKELGFHSNSISVIPDGAFDGNPLLRTIHLYDNPLSFVGNSAFHNLSDLHS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 LVIRGASMVQQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSIPNNLCQEQKMLRTLDLSYNNIRDLPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 LVIRGASMVQQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSIPNNLCQEQKMLRTLDLSYNNIRDLPS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 FNGCHALEEISLQRNQIYQIKEGTFQGLISLRILDLSRNLIHEIHSRAFATLGPITNLDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 FNGCHALEEISLQRNQIYQIKEGTFQGLISLRILDLSRNLIHEIHSRAFATLGPITNLDV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 SFNELTSFPTEGLNGLNQLKLVGNFKLKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCCAFWGCDSYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 SFNELTSFPTEGLNGLNQLKLVGNFKLKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCCAFWGCDSYA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 NLNTEDNSLQDHSVAQEKGTADAANVTSTLENEEHSQIIIHCTPSTGAFKPCEYLLGSWM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 NLNTEDNSLQDHSVAQEKGTADAANVTSTLENEEHSQIIIHCTPSTGAFKPCEYLLGSWM
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 IRLTVWFIFLVALFFNLLVILTTFASCTSLPSSKLFIGLISVSNLFMGIYTGILTFLDAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 IRLTVWFIFLVALFFNLLVILTTFASCTSLPSSKLFIGLISVSNLFMGIYTGILTFLDAV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 SWGRFAEFGIWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLLMLATVERSLSAKDIMKNGKSNHLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 SWGRFAEFGIWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLLMLATVERSLSAKDIMKNGKSNHLK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 QFRVAALLAFLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPFPTGETPSLGFTVTLVLLNSLAFLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 QFRVAALLAFLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPFPTGETPSLGFTVTLVLLNSLAFLL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB5 MAVIYTKLYCNLEKEDLSENSQSSMIKHVAWLIFTNCIFFCPVAFFSFAPLITAISISPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 MAVIYTKLYCNLEKEDLSENSQSSMIKHVAWLIFTNCIFFCPVAFFSFAPLITAISISPE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB5 IMKSVTLIFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKLLKRRVTKKSGSVSVSISSQGGCLEQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 IMKSVTLIFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKLLKRRVTKKSGSVSVSISSQGGCLEQD
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB5 FYYDCGMYSHLQGNLTVCDCCESFLLTKPVSCKHLIKSHSCPALAVASCQRPEGYWSDCG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 FYYDCGMYSHLQGNLTVCDCCESFLLTKPVSCKHLIKSHSCPALAVASCQRPEGYWSDCG
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950 
pF1KB5 TQSAHSDYADEEDSFVSDSSDQVQACGRACFYQSRGFPLVRYAYNLPRVKD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 TQSAHSDYADEEDSFVSDSSDQVQACGRACFYQSRGFPLVRYAYNLPRVKD
              910       920       930       940       950 

>>NP_001333361 (OMIM: 606666,615311) leucine-rich repeat  (927 aa)
 initn: 5757 init1: 5757 opt: 5770  Z-score: 4871.0  bits: 912.6 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 6126; 97.5% identity (97.5% similar) in 951 aa overlap (1-951:1-927)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MPGPLGLLCFLALGLLGSAGPSGAAPPLCAAPCSCDGDRRVDCSGKGLTAVPEGLSAFTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MPGPLGLLCFLALGLLGSAGPSGAAPPLCAAPCSCDGDRRVDCSGKGLTAVPEGLSAFTQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 ALDISMNNITQLPEDAFKNFPFLEELQLAGNDLSFIHPKALSGLKELKVLTLQNNQLKTV
       ::                        ::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AL------------------------QLAGNDLSFIHPKALSGLKELKVLTLQNNQLKTV
                                       70        80        90      

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 PSEAIRGLSALQSLRLDANHITSVPEDSFEGLVQLRHLWLDDNSLTEVPVHPLSNLPTLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSEAIRGLSALQSLRLDANHITSVPEDSFEGLVQLRHLWLDDNSLTEVPVHPLSNLPTLQ
        100       110       120       130       140       150      

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 ALTLALNKISSIPDFAFTNLSSLVVLHLHNNKIRSLSQHCFDGLDNLETLDLNYNNLGEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALTLALNKISSIPDFAFTNLSSLVVLHLHNNKIRSLSQHCFDGLDNLETLDLNYNNLGEF
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVIRGASMVQQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSIPNNLCQEQKMLRTLDLSYNNIRDLPS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IMKSVTLIFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKLLKRRVTKKSGSVSVSISSQGGCLEQD
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pF1KB5 FYYDCGMYSHLQGNLTVCDCCESFLLTKPVSCKHLIKSHSCPALAVASCQRPEGYWSDCG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FYYDCGMYSHLQGNLTVCDCCESFLLTKPVSCKHLIKSHSCPALAVASCQRPEGYWSDCG
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pF1KB5 TQSAHSDYADEEDSFVSDSSDQVQACGRACFYQSRGFPLVRYAYNLPRVKD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TQSAHSDYADEEDSFVSDSSDQVQACGRACFYQSRGFPLVRYAYNLPRVKD
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                :.:  .: :.  ::.  ::.    : . : :. : :    ::::  ::. .
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pF1KB5 PEGLSAFTQALDISMNNITQLPEDAFKNFPFLEELQLAGNDLSFIHPKALSGLKELKVLT
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NP_003 PSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLM
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pF1KB5 LQNNQLKTVPSEAIRGLSALQSLRLDANHITSVPEDSFEGLVQLRHLWLDDNSLTEVPVH
       ::::::. ::.::...: .:::::::::::. :: . : :: .:::::::::.:::.::.
NP_003 LQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQ
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pF1KB5 PLSNLPTLQALTLALNKISSIPDFAFTNLSSLVVLHLHNNKIRSLSQHCFDGLDNLETLD
        . .: .:::.:::::::  :::.:: :::::::::::::.:.::...::::: .:::::
NP_003 AFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLD
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pF1KB5 LNYNNLGEFPQAIKALPSLKELGFHSNSISVIPDGAFDGNPLLRTIHLYDNPLSFVGNSA
       :::::: ::: ::..: .:::::::::.:  ::. :: ::: : :::.::::..::: ::
NP_003 LNYNNLDEFPTAIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRSA
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pF1KB5 FHNLSDLHSLVIRGASMVQQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSIPNNLCQEQKMLRTLDLS
       :..: .:..:.. :::.. .::.::::..::::::::..:::.:...:..   :..::::
NP_003 FQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLS
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pF1KB5 YNNIRDLPSFNGCHALEEISLQRNQIYQIKEGTFQGLISLRILDLSRNLIHEIHSRAFAT
       :: ..:::::. :. :..:.:..:.::.::  ::: :.::: :.:. : :  ::  ::.:
NP_003 YNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFST
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pF1KB5 LGPITNLDVSFNELTSFPTEGLNGLNQLKLVGNFKLKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCC
       :  . .::.: : :.:::  ::.::..:::.::  :.  .....: .:. . .:::::::
NP_003 LPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCC
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pF1KB5 AFWGCDSYANLNTE----DNSLQDHSVAQEKG---TADAANVTSTLENEEHSQIIIH---
       ::  :..  .....    ::: .:    .. :   . :  .. . : . :..   .:   
NP_003 AFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQDERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQ
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pF1KB5 CTPSTGAFKPCEYLLGSWMIRLTVWFIFLVALFFNLLVILTTFASCTSLPSSKLFIGLIS
       :.:: : :::::.:: .:.::. :: : ..::  : ::  :.: :   .   ::.::.:.
NP_003 CSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIA
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pF1KB5 VSNLFMGIYTGILTFLDAVSWGRFAEFGIWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLLMLATV
       . :.. :. ...:. .:: ..: ::. : :::.: ::.: :::..:.:::..::: ::..
NP_003 AVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAAL
              610       620       630       640       650       660

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pF1KB5 ERSLSAKDIMKNGKSNHLKQFRVAALLAFLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPFPTGET
       ::..:.:   :   .  .....:  ::  : : . .  ::.  ..:.:::::::.: :: 
NP_003 ERGFSVKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEP
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pF1KB5 PSLGFTVTLVLLNSLAFLLMAVIYTKLYCNLEKEDLSENSQSSMIKHVAWLIFTNCIFFC
        ..:. :.:.::::: ::.:.. ::::::::.: :: .  . ::.::.: :.:::::. :
NP_003 STMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNC
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pF1KB5 PVAFFSFAPLITAISISPEIMKSVTLIFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKLLKRRV--
       ::::.::. ::.   ::::..: . :.  ::::::::.::..:::.::::   :....  
NP_003 PVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYV
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pF1KB5 -TKKSGSVSVSISSQGGCLEQDFYYDCGMYSHLQGNLTVCDCCESFLLTKPVSCKHLIKS
        :...    .::.:                                              
NP_003 WTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSS
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>>NP_001017403 (OMIM: 606653) leucine-rich repeat-contai  (967 aa)
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pF1KB5 MPGPLGL----LC--FLALGLLGSAGPSGAAPPLCAAPCSCDGDR---RVDCSGKGLTAV
       ::.: ::    ::  . :    :.:   : .:  : ::: :. :     .:::  ::.::
NP_001 MPSPPGLRALWLCAALCASRRAGGAPQPGPGPTACPAPCHCQEDGIMLSADCSELGLSAV
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pF1KB5 PEGLSAFTQALDISMNNITQLPEDAFKNFPFLEELQLAGNDLSFIHPKALSGLKELKVLT
       :  :. .:  ::.::::.:.:    :... :::::.:.:: :: :  .:.:::  ::.: 
NP_001 PGDLDPLTAYLDLSMNNLTELQPGLFHHLRFLEELRLSGNHLSHIPGQAFSGLYSLKILM
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pF1KB5 LQNNQLKTVPSEAIRGLSALQSLRLDANHITSVPEDSFEGLVQLRHLWLDDNSLTEVPVH
       ::::::  .:.::.  : .::::::::: :. ::: ::::: .:::::::::.:::.::.
NP_001 LQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLRLDANLISLVPERSFEGLSSLRHLWLDDNALTEIPVR
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pF1KB5 PLSNLPTLQALTLALNKISSIPDFAFTNLSSLVVLHLHNNKIRSLSQHCFDGLDNLETLD
        :.:::.:::.:::::.:: :::.:: ::.::::::::::.:. :. : :.:: ::::::
NP_001 ALNNLPALQAMTLALNRISHIPDYAFQNLTSLVVLHLHNNRIQHLGTHSFEGLHNLETLD
              190       200       210       220       230       240

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pF1KB5 LNYNNLGEFPQAIKALPSLKELGFHSNSISVIPDGAFDGNPLLRTIHLYDNPLSFVGNSA
       ::::.: ::: ::..:  :.:::::.:.:..::. :: :::::.:::.::::..::: ::
NP_001 LNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNIKAIPEKAFMGNPLLQTIHFYDNPIQFVGRSA
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       :. :  ::.: . ::  .:.::.: ::. :: :::: . :  .:...::.   ::.:.::
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        .  : :.    .. ..::  :.:.  .         : ..  :       :: :. . .
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        ::.:. :.:.. .   :::  : . :...:  .  : .:. .::   :::.:::::::.
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pF1KB5 TNCIFFCPVAFFSFAPLITAISISPEIMKSVTLIFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKL
       .. ...:::::.::: ..  . ..:: .::: :. .::::::::.::..:::.:..:   
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         ::.  ..:. .    . .: ::..   .:   . : .   :    :.    .: .   
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        ..... :.... :::.:                                          
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XP_011                            MRLEGEGRSARAGQNLSRA--GSARRGAPRDLS
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XP_011 KLEEIGLQHNRIWEIGADTFSQLSSLQALDLTDN------------------------QL
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       .::..::. ::..:  : ::::.: . :.    . .:..:::::::.. ...:::::.::
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NP_067 ELRLSGNHLSHIPGQAFSGLYSLKILMLQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLRLDANLISLV
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NP_067 PERSFEGLSSLRHLWLDDNALTEIPVRALNNLPALQAMTLALNRISHIPDYAFQNLTSLV
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       .... : ::.::.::.  . ::  :. .: :. .: . ::  :.:. .::...:.:.:.:
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       :::.: . :.    . .:..:::::::.. ...:::::.::: ..  . ..:: .::: :
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XP_005 LAYAAAGELEKS---SCDSTQALVAFSDVDLILEASEAGRPPG----LETYGFPSVTLIS
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XP_005 CQQPGAPRLEGSHCVEPEGNHFGNPQPSMDGELLLRAEGSTPAGGGLSGGGGFQPSGLAF
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XP_011                      MKERMNSTRRLDANLISLVPERSFEGLSSLRHLWLDDNA
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pF1KB5 LTEVPVHPLSNLPTLQALTLALNKISSIPDFAFTNLSSLVVLHLHNNKIRSLSQHCFDGL
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XP_011 LTEIPVRALNNLPALQAMTLALNRISHIPDYAFQNLTSLVVLHLHNNRIQHLGTHSFEGL
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XP_016 RPPG----LETYGFPSVTLISCQQPGAPRLEGSHCVEPEGNHFGNPQPSMDGELLLRAEG
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>>XP_016857485 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-rich re  (876 aa)
 initn: 1868 init1: 1252 opt: 1256  Z-score: 1069.2  bits: 209.1 E(85289): 8.1e-53
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XP_016                            MRLEGEGRSARAGQNLSRA--GSARRGAPRDLS
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pF1KB5 MNNITQLPEDAFKNFPFLEELQLAGNDLSFIHPKALSGLKELKVLTLQNNQLKTVPSEAI
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