Result of FASTA (ccds) for pF1KB5093
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5093, 951 aa
  1>>>pF1KB5093 951 - 951 aa - 951 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5967+/-0.00121; mu= 21.6227+/- 0.072
 mean_var=146.2194+/-34.855, 0's: 0 Z-trim(105.7): 224  B-trim: 512 in 1/48
 Lambda= 0.106065
 statistics sampled from 8305 (8562) to 8305 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.614), E-opt: 0.2 (0.263), width:  16
 Scan time:  3.770

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs108|chr11         ( 951) 6343 984.0       0
CCDS9000.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12           ( 907) 1748 280.8 8.2e-75
CCDS30971.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1          ( 967) 1676 269.8 1.8e-71
CCDS1424.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1           ( 915) 1558 251.7 4.7e-66
CCDS61195.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12          ( 835) 1171 192.5   3e-48
CCDS61194.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12          ( 883) 1041 172.6   3e-42
CCDS30972.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1          ( 828)  969 161.6   6e-39
CCDS9872.1 TSHR gene_id:7253|Hs108|chr14           ( 764)  685 118.1 6.9e-26
CCDS1844.2 FSHR gene_id:2492|Hs108|chr2            ( 669)  682 117.5 8.7e-26
CCDS1843.1 FSHR gene_id:2492|Hs108|chr2            ( 695)  651 112.8 2.4e-24
CCDS10446.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16        ( 605)  592 103.7 1.1e-21
CCDS53982.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16        ( 643)  592 103.7 1.2e-21
CCDS73766.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs108|chr15       ( 614)  533 94.7   6e-19
CCDS45313.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs108|chr15       ( 620)  533 94.7 6.1e-19
CCDS1842.1 LHCGR gene_id:3973|Hs108|chr2           ( 699)  531 94.4 8.1e-19
CCDS3306.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3        ( 581)  514 91.7 4.4e-18
CCDS46984.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3       ( 587)  514 91.7 4.4e-18
CCDS6524.1 LINGO2 gene_id:158038|Hs108|chr9        ( 606)  481 86.7 1.5e-16
CCDS45905.1 LINGO3 gene_id:645191|Hs108|chr19      ( 592)  459 83.3 1.5e-15
CCDS9039.1 DCN gene_id:1634|Hs108|chr12            ( 359)  423 77.5 5.1e-14
CCDS43276.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4         ( 757)  426 78.4 5.8e-14
CCDS13777.1 RTN4R gene_id:65078|Hs108|chr22        ( 473)  420 77.2 8.3e-14
CCDS46715.1 CHADL gene_id:150356|Hs108|chr22       ( 762)  420 77.5 1.1e-13
CCDS75204.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4         ( 784)  419 77.4 1.2e-13
CCDS30855.1 LINGO4 gene_id:339398|Hs108|chr1       ( 593)  416 76.7 1.5e-13
CCDS58930.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4         ( 724)  416 76.9 1.6e-13
CCDS3846.1 TLR3 gene_id:7098|Hs108|chr4            ( 904)  417 77.1 1.7e-13
CCDS1448.1 LRRN2 gene_id:10446|Hs108|chr1          ( 713)  407 75.5 4.2e-13
CCDS31464.1 LRRC4C gene_id:57689|Hs108|chr11       ( 640)  401 74.5 7.5e-13
CCDS47272.1 LRRTM2 gene_id:26045|Hs108|chr5        ( 516)  399 74.1 8.1e-13
CCDS5799.1 LRRC4 gene_id:64101|Hs108|chr7          ( 653)  395 73.6 1.4e-12
CCDS33783.1 LRIG1 gene_id:26018|Hs108|chr3         (1093)  396 74.0 1.7e-12
CCDS42595.1 LRRC4B gene_id:94030|Hs108|chr19       ( 713)  393 73.3 1.9e-12
CCDS47218.1 LRRC70 gene_id:100130733|Hs108|chr5    ( 622)  389 72.6 2.6e-12
CCDS14721.1 BGN gene_id:633|Hs108|chrX             ( 368)  385 71.7 2.9e-12
CCDS33920.1 CPN2 gene_id:1370|Hs108|chr3           ( 545)  387 72.3   3e-12
CCDS55124.1 LRRD1 gene_id:401387|Hs108|chr7        ( 860)  382 71.8 6.7e-12
CCDS54226.1 PODNL1 gene_id:79883|Hs108|chr19       ( 510)  376 70.5 9.2e-12
CCDS12300.1 PODNL1 gene_id:79883|Hs108|chr19       ( 512)  376 70.5 9.3e-12
CCDS75111.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4          (1521)  375 71.0   2e-11
CCDS75110.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4          (1525)  375 71.0   2e-11
CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4           (1529)  375 71.0   2e-11
CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10          (1534)  371 70.4   3e-11
CCDS44933.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12       (1059)  368 69.7 3.3e-11
CCDS8960.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12        (1119)  368 69.8 3.4e-11
CCDS11192.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17          (1269)  364 69.2 5.7e-11
CCDS58521.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17          (1258)  363 69.1 6.3e-11
CCDS81341.1 LRRC7 gene_id:57554|Hs108|chr1         (1495)  361 68.9 8.6e-11
CCDS645.1 LRRC7 gene_id:57554|Hs108|chr1           (1537)  361 68.9 8.7e-11
CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5           (1523)  360 68.7 9.6e-11


>>CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs108|chr11              (951 aa)
 initn: 6343 init1: 6343 opt: 6343  Z-score: 5256.4  bits: 984.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6343; 100.0% identity (100.0% similar) in 951 aa overlap (1-951:1-951)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MPGPLGLLCFLALGLLGSAGPSGAAPPLCAAPCSCDGDRRVDCSGKGLTAVPEGLSAFTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MPGPLGLLCFLALGLLGSAGPSGAAPPLCAAPCSCDGDRRVDCSGKGLTAVPEGLSAFTQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 ALDISMNNITQLPEDAFKNFPFLEELQLAGNDLSFIHPKALSGLKELKVLTLQNNQLKTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ALDISMNNITQLPEDAFKNFPFLEELQLAGNDLSFIHPKALSGLKELKVLTLQNNQLKTV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 PSEAIRGLSALQSLRLDANHITSVPEDSFEGLVQLRHLWLDDNSLTEVPVHPLSNLPTLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PSEAIRGLSALQSLRLDANHITSVPEDSFEGLVQLRHLWLDDNSLTEVPVHPLSNLPTLQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 ALTLALNKISSIPDFAFTNLSSLVVLHLHNNKIRSLSQHCFDGLDNLETLDLNYNNLGEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ALTLALNKISSIPDFAFTNLSSLVVLHLHNNKIRSLSQHCFDGLDNLETLDLNYNNLGEF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 PQAIKALPSLKELGFHSNSISVIPDGAFDGNPLLRTIHLYDNPLSFVGNSAFHNLSDLHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PQAIKALPSLKELGFHSNSISVIPDGAFDGNPLLRTIHLYDNPLSFVGNSAFHNLSDLHS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 LVIRGASMVQQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSIPNNLCQEQKMLRTLDLSYNNIRDLPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LVIRGASMVQQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSIPNNLCQEQKMLRTLDLSYNNIRDLPS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 FNGCHALEEISLQRNQIYQIKEGTFQGLISLRILDLSRNLIHEIHSRAFATLGPITNLDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FNGCHALEEISLQRNQIYQIKEGTFQGLISLRILDLSRNLIHEIHSRAFATLGPITNLDV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 SFNELTSFPTEGLNGLNQLKLVGNFKLKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCCAFWGCDSYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SFNELTSFPTEGLNGLNQLKLVGNFKLKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCCAFWGCDSYA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 NLNTEDNSLQDHSVAQEKGTADAANVTSTLENEEHSQIIIHCTPSTGAFKPCEYLLGSWM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NLNTEDNSLQDHSVAQEKGTADAANVTSTLENEEHSQIIIHCTPSTGAFKPCEYLLGSWM
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 IRLTVWFIFLVALFFNLLVILTTFASCTSLPSSKLFIGLISVSNLFMGIYTGILTFLDAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IRLTVWFIFLVALFFNLLVILTTFASCTSLPSSKLFIGLISVSNLFMGIYTGILTFLDAV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 SWGRFAEFGIWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLLMLATVERSLSAKDIMKNGKSNHLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SWGRFAEFGIWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLLMLATVERSLSAKDIMKNGKSNHLK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 QFRVAALLAFLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPFPTGETPSLGFTVTLVLLNSLAFLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QFRVAALLAFLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPFPTGETPSLGFTVTLVLLNSLAFLL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB5 MAVIYTKLYCNLEKEDLSENSQSSMIKHVAWLIFTNCIFFCPVAFFSFAPLITAISISPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAVIYTKLYCNLEKEDLSENSQSSMIKHVAWLIFTNCIFFCPVAFFSFAPLITAISISPE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB5 IMKSVTLIFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKLLKRRVTKKSGSVSVSISSQGGCLEQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IMKSVTLIFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKLLKRRVTKKSGSVSVSISSQGGCLEQD
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB5 FYYDCGMYSHLQGNLTVCDCCESFLLTKPVSCKHLIKSHSCPALAVASCQRPEGYWSDCG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FYYDCGMYSHLQGNLTVCDCCESFLLTKPVSCKHLIKSHSCPALAVASCQRPEGYWSDCG
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950 
pF1KB5 TQSAHSDYADEEDSFVSDSSDQVQACGRACFYQSRGFPLVRYAYNLPRVKD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TQSAHSDYADEEDSFVSDSSDQVQACGRACFYQSRGFPLVRYAYNLPRVKD
              910       920       930       940       950 

>>CCDS9000.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12                (907 aa)
 initn: 2687 init1: 1688 opt: 1748  Z-score: 1456.6  bits: 280.8 E(32554): 8.2e-75
Smith-Waterman score: 2731; 50.9% identity (76.0% similar) in 845 aa overlap (5-832:10-854)

                    10        20        30        40            50 
pF1KB5      MPGPLGLLCFLALGLLGSAGPSGAAPPLCAAPCSCDGDRR----VDCSGKGLTAV
                :.:  .: :.  ::.  ::.    : . : :. : :    ::::  ::. .
CCDS90 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSEL
               10        20        30        40        50        60

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB5 PEGLSAFTQALDISMNNITQLPEDAFKNFPFLEELQLAGNDLSFIHPKALSGLKELKVLT
       : .::.::. ::.:::::.::  . . .. :::::.:::: :..:   :..::  :::: 
CCDS90 PSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLM
               70        80        90       100       110       120

             120       130       140       150       160       170 
pF1KB5 LQNNQLKTVPSEAIRGLSALQSLRLDANHITSVPEDSFEGLVQLRHLWLDDNSLTEVPVH
       ::::::. ::.::...: .:::::::::::. :: . : :: .:::::::::.:::.::.
CCDS90 LQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQ
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pF1KB5 PLSNLPTLQALTLALNKISSIPDFAFTNLSSLVVLHLHNNKIRSLSQHCFDGLDNLETLD
        . .: .:::.:::::::  :::.:: :::::::::::::.:.::...::::: .:::::
CCDS90 AFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLD
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             240       250       260       270       280       290 
pF1KB5 LNYNNLGEFPQAIKALPSLKELGFHSNSISVIPDGAFDGNPLLRTIHLYDNPLSFVGNSA
       :::::: ::: ::..: .:::::::::.:  ::. :: ::: : :::.::::..::: ::
CCDS90 LNYNNLDEFPTAIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRSA
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pF1KB5 FHNLSDLHSLVIRGASMVQQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSIPNNLCQEQKMLRTLDLS
       :..: .:..:.. :::.. .::.::::..::::::::..:::.:...:..   :..::::
CCDS90 FQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLS
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pF1KB5 YNNIRDLPSFNGCHALEEISLQRNQIYQIKEGTFQGLISLRILDLSRNLIHEIHSRAFAT
       :: ..:::::. :. :..:.:..:.::.::  ::: :.::: :.:. : :  ::  ::.:
CCDS90 YNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFST
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pF1KB5 LGPITNLDVSFNELTSFPTEGLNGLNQLKLVGNFKLKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCC
       :  . .::.: : :.:::  ::.::..:::.::  :.  .....: .:. . .:::::::
CCDS90 LPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCC
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pF1KB5 AFWGCDSYANLNTE----DNSLQDHSVAQEKG---TADAANVTSTLENEEHSQIIIH---
       ::  :..  .....    ::: .:    .. :   . :  .. . : . :..   .:   
CCDS90 AFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQDERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQ
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pF1KB5 CTPSTGAFKPCEYLLGSWMIRLTVWFIFLVALFFNLLVILTTFASCTSLPSSKLFIGLIS
       :.:: : :::::.:: .:.::. :: : ..::  : ::  :.: :   .   ::.::.:.
CCDS90 CSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIA
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pF1KB5 VSNLFMGIYTGILTFLDAVSWGRFAEFGIWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLLMLATV
       . :.. :. ...:. .:: ..: ::. : :::.: ::.: :::..:.:::..::: ::..
CCDS90 AVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAAL
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pF1KB5 ERSLSAKDIMKNGKSNHLKQFRVAALLAFLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPFPTGET
       ::..:.:   :   .  .....:  ::  : : . .  ::.  ..:.:::::::.: :: 
CCDS90 ERGFSVKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEP
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pF1KB5 PSLGFTVTLVLLNSLAFLLMAVIYTKLYCNLEKEDLSENSQSSMIKHVAWLIFTNCIFFC
        ..:. :.:.::::: ::.:.. ::::::::.: :: .  . ::.::.: :.:::::. :
CCDS90 STMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNC
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pF1KB5 PVAFFSFAPLITAISISPEIMKSVTLIFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKLLKRRV--
       ::::.::. ::.   ::::..: . :.  ::::::::.::..:::.::::   :....  
CCDS90 PVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYV
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pF1KB5 -TKKSGSVSVSISSQGGCLEQDFYYDCGMYSHLQGNLTVCDCCESFLLTKPVSCKHLIKS
        :...    .::.:                                              
CCDS90 WTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSS
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>>CCDS30971.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1               (967 aa)
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pF1KB5 MPGPLGL----LC--FLALGLLGSAGPSGAAPPLCAAPCSCDGDR---RVDCSGKGLTAV
       ::.: ::    ::  . :    :.:   : .:  : ::: :. :     .:::  ::.::
CCDS30 MPSPPGLRALWLCAALCASRRAGGAPQPGPGPTACPAPCHCQEDGIMLSADCSELGLSAV
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB5 PEGLSAFTQALDISMNNITQLPEDAFKNFPFLEELQLAGNDLSFIHPKALSGLKELKVLT
       :  :. .:  ::.::::.:.:    :... :::::.:.:: :: :  .:.:::  ::.: 
CCDS30 PGDLDPLTAYLDLSMNNLTELQPGLFHHLRFLEELRLSGNHLSHIPGQAFSGLYSLKILM
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pF1KB5 LQNNQLKTVPSEAIRGLSALQSLRLDANHITSVPEDSFEGLVQLRHLWLDDNSLTEVPVH
       ::::::  .:.::.  : .::::::::: :. ::: ::::: .:::::::::.:::.::.
CCDS30 LQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLRLDANLISLVPERSFEGLSSLRHLWLDDNALTEIPVR
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pF1KB5 PLSNLPTLQALTLALNKISSIPDFAFTNLSSLVVLHLHNNKIRSLSQHCFDGLDNLETLD
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CCDS30 ALNNLPALQAMTLALNRISHIPDYAFQNLTSLVVLHLHNNRIQHLGTHSFEGLHNLETLD
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pF1KB5 LNYNNLGEFPQAIKALPSLKELGFHSNSISVIPDGAFDGNPLLRTIHLYDNPLSFVGNSA
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CCDS30 LNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNIKAIPEKAFMGNPLLQTIHFYDNPIQFVGRSA
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pF1KB5 FHNLSDLHSLVIRGASMVQQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSIPNNLCQEQKMLRTLDLS
       :. :  ::.: . ::  .:.::.: ::. :: :::: . :  .:...::.   ::.:.::
CCDS30 FQYLPKLHTLSLNGAMDIQEFPDLKGTTSLEILTLTRAGIRLLPSGMCQQLPRLRVLELS
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pF1KB5 YNNIRDLPSFNGCHALEEISLQRNQIYQIKEGTFQGLISLRILDLSRNLIHEIHSRAFAT
       .:.:..:::.. :. ::::.::.:.:..:   ::. : ::. :::: : :. :: .::.:
CCDS30 HNQIEELPSLHRCQKLEEIGLQHNRIWEIGADTFSQLSSLQALDLSWNAIRSIHPEAFST
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pF1KB5 LGPITNLDVSFNELTSFPTEGLNGLNQLKLVGNFKLKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCC
       :  ...::.. :.::..:  ::.:: .::: ::. :..:..  .: .:: : ::::::::
CCDS30 LHSLVKLDLTDNQLTTLPLAGLGGLMHLKLKGNLALSQAFSKDSFPKLRILEVPYAYQCC
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pF1KB5 AFWGCDSY----ANLNTEDNSLQDHSVA---------QEKGTADAANVTSTLENEEHS-Q
        .  : :.    .. ..::  :.:.  .         : ..  :       :: :. . .
CCDS30 PYGMCASFFKASGQWEAEDLHLDDEESSKRPLGLLARQAENHYDQDLDELQLEMEDSKPH
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pF1KB5 IIIHCTPSTGAFKPCEYLLGSWMIRLTVWFIFLVALFFNLLVILTTFASC-TSLPSSKLF
         ..:.:. : :::::::. :: :::.:: : :.... : ::.::.::.  . ::  :. 
CCDS30 PSVQCSPTPGPFKPCEYLFESWGIRLAVWAIVLLSVLCNGLVLLTVFAGGPVPLPPVKFV
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pF1KB5 IGLISVSNLFMGIYTGILTFLDAVSWGRFAEFGIWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLL
       .: :. .: . ::  :.:. .::...:.:.:.:  :::: ::...:::::..::....::
CCDS30 VGAIAGANTLTGISCGLLASVDALTFGQFSEYGARWETGLGCRATGFLAVLGSEASVLLL
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pF1KB5 MLATVERSLSAKDIMKNGKSNHLKQFRVAALLAFLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPF
        ::.:. :.:.. .   :::  : . :...:  .  : .:. .::   :::.:::::::.
CCDS30 TLAAVQCSVSVSCVRAYGKSPSLGSVRAGVLGCLALAGLAAALPLASVGEYGASPLCLPY
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pF1KB5 --PTGETPSLGFTVTLVLLNSLAFLLMAVIYTKLYCNLEKEDLSENSQSSMIKHVAWLIF
         : :.  .:::::.::..::. ::..:  : ::::.: . :.    . .:..:::::::
CCDS30 APPEGQPAALGFTVALVMMNSFCFLVVAGAYIKLYCDLPRGDFEAVWDCAMVRHVAWLIF
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pF1KB5 TNCIFFCPVAFFSFAPLITAISISPEIMKSVTLIFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKL
       .. ...:::::.::: ..  . ..:: .::: :. .::::::::.::..:::.:..:   
CCDS30 ADGLLYCPVAFLSFASMLGLFPVTPEAVKSVLLVVLPLPACLNPLLYLLFNPHFRDDL--
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pF1KB5 LKRRVTKKSGSVSVSISSQGGCLEQDFYYDCGMYSHLQGNLTVCDCCESFLLTKPVSCKH
         ::.  ..:. .    . .: ::..   .:   . : .   :    :.    .: .   
CCDS30 --RRLRPRAGDSGPLAYAAAGELEKS---SCDSTQALVAFSDVDLILEASEAGRPPG---
        840       850       860          870       880       890   

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pF1KB5 LIKSHSCPALAVASCQRPEGYWSDCGTQSAHSDYADEEDSFVSDSSDQVQACGRACFYQS
        ..... :.... :::.:                                          
CCDS30 -LETYGFPSVTLISCQQPGAPRLEGSHCVEPEGNHFGNPQPSMDGELLLRAEGSTPAGGG
               900       910       920       930       940         

>>CCDS1424.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1                (915 aa)
 initn: 2172 init1: 1556 opt: 1558  Z-score: 1299.4  bits: 251.7 E(32554): 4.7e-66
Smith-Waterman score: 2515; 47.8% identity (73.8% similar) in 855 aa overlap (55-892:12-855)

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pF1KB5 APPLCAAPCSCDGDRRVDCSGKGLTAVPEGLSAFTQALDISMNNITQLPEDAFKNFPFLE
                                     .: . .: :.::::.:.:    :... :::
CCDS14                    MGRPRLTLVCQVSIIISARDLSMNNLTELQPGLFHHLRFLE
                                  10        20        30        40 

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pF1KB5 ELQLAGNDLSFIHPKALSGLKELKVLTLQNNQLKTVPSEAIRGLSALQSLRLDANHITSV
       ::.:.:: :: :  .:.:::  ::.: ::::::  .:.::.  : .::::::::: :. :
CCDS14 ELRLSGNHLSHIPGQAFSGLYSLKILMLQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLRLDANLISLV
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pF1KB5 PEDSFEGLVQLRHLWLDDNSLTEVPVHPLSNLPTLQALTLALNKISSIPDFAFTNLSSLV
       :: ::::: .:::::::::.:::.::. :.:::.:::.:::::.:: :::.:: ::.:::
CCDS14 PERSFEGLSSLRHLWLDDNALTEIPVRALNNLPALQAMTLALNRISHIPDYAFQNLTSLV
             110       120       130       140       150       160 

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pF1KB5 VLHLHNNKIRSLSQHCFDGLDNLETLDLNYNNLGEFPQAIKALPSLKELGFHSNSISVIP
       :::::::.:. :. : :.:: ::::::::::.: ::: ::..:  :.:::::.:.:..::
CCDS14 VLHLHNNRIQHLGTHSFEGLHNLETLDLNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNIKAIP
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pF1KB5 DGAFDGNPLLRTIHLYDNPLSFVGNSAFHNLSDLHSLVIRGASMVQQFPNLTGTVHLESL
       . :: :::::.:::.::::..::: :::. :  ::.: . ::  .:.::.: ::. :: :
CCDS14 EKAFMGNPLLQTIHFYDNPIQFVGRSAFQYLPKLHTLSLNGAMDIQEFPDLKGTTSLEIL
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pF1KB5 TLTGTKISSIPNNLCQEQKMLRTLDLSYNNIRDLPSFNGCHALEEISLQRNQIYQIKEGT
       ::: . :  .:...::.   ::.:.::.:.:..:::.. :. ::::.::.:.:..:   :
CCDS14 TLTRAGIRLLPSGMCQQLPRLRVLELSHNQIEELPSLHRCQKLEEIGLQHNRIWEIGADT
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pF1KB5 FQGLISLRILDLSRNLIHEIHSRAFATLGPITNLDVSFNELTSFPTEGLNGLNQLKLVGN
       :. : ::. :::: : :. :: .::.::  ...::.. :.::..:  ::.:: .::: ::
CCDS14 FSQLSSLQALDLSWNAIRSIHPEAFSTLHSLVKLDLTDNQLTTLPLAGLGGLMHLKLKGN
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pF1KB5 FKLKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCCAFWGCDSY----ANLNTEDNSLQDHSVA-----
       . :..:..  .: .:: : :::::::: .  : :.    .. ..::  :.:.  .     
CCDS14 LALSQAFSKDSFPKLRILEVPYAYQCCPYGMCASFFKASGQWEAEDLHLDDEESSKRPLG
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pF1KB5 ----QEKGTADAANVTSTLENEEHS-QIIIHCTPSTGAFKPCEYLLGSWMIRLTVWFIFL
           : ..  :       :: :. . .  ..:.:. : :::::::. :: :::.:: : :
CCDS14 LLARQAENHYDQDLDELQLEMEDSKPHPSVQCSPTPGPFKPCEYLFESWGIRLAVWAIVL
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pF1KB5 VALFFNLLVILTTFASC-TSLPSSKLFIGLISVSNLFMGIYTGILTFLDAVSWGRFAEFG
       .... : ::.::.::.  . ::  :. .: :. .: . ::  :.:. .::...:.:.:.:
CCDS14 LSVLCNGLVLLTVFAGGPVPLPPVKFVVGAIAGANTLTGISCGLLASVDALTFGQFSEYG
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pF1KB5 IWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLLMLATVERSLSAKDIMKNGKSNHLKQFRVAALLA
         :::: ::...:::::..::....:: ::.:. :.:.. .   :::  : . :...:  
CCDS14 ARWETGLGCRATGFLAVLGSEASVLLLTLAAVQCSVSVSCVRAYGKSPSLGSVRAGVLGC
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pF1KB5 FLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPF--PTGETPSLGFTVTLVLLNSLAFLLMAVIYTK
       .  : .:. .::   :::.:::::::.  : :.  .:::::.::..::. ::..:  : :
CCDS14 LALAGLAAALPLASVGEYGASPLCLPYAPPEGQPAALGFTVALVMMNSFCFLVVAGAYIK
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pF1KB5 LYCNLEKEDLSENSQSSMIKHVAWLIFTNCIFFCPVAFFSFAPLITAISISPEIMKSVTL
       :::.: . :.    . .:..:::::::.. ...:::::.::: ..  . ..:: .::: :
CCDS14 LYCDLPRGDFEAVWDCAMVRHVAWLIFADGLLYCPVAFLSFASMLGLFPVTPEAVKSVLL
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pF1KB5 IFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKLLKRRVTKKSGSVSVSISSQGGCLEQDFYYDCGM
       . .::::::::.::..:::.:..:     ::.  ..:. .    . .: ::..   .:  
CCDS14 VVLPLPACLNPLLYLLFNPHFRDDL----RRLRPRAGDSGPLAYAAAGELEKS---SCDS
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pF1KB5 YSHLQGNLTVCDCCESFLLTKPVSCKHLIKSHSCPALAVASCQRPEGYWSDCGTQSAHSD
        . : .   :    :.    .: .    ..... :.... :::.:               
CCDS14 TQALVAFSDVDLILEASEAGRPPG----LETYGFPSVTLISCQQPGAPRLEGSHCVEPEG
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pF1KB5 YADEEDSFVSDSSDQVQACGRACFYQSRGFPLVRYAYNLPRVKD 
                                                    
CCDS14 NHFGNPQPSMDGELLLRAEGSTPAGGGLSGGGGFQPSGLAFASHV
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>>CCDS61195.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12               (835 aa)
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CCDS61 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSEL
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       ::::::. ::.::...: .::::                                     
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CCDS61 -----------------------------------HLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLD
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       :::::: ::: ::..: .:::::::::.:  ::. :: ::: : :::.::::..::: ::
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pF1KB5 FHNLSDLHSLVIRGASMVQQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSIPNNLCQEQKMLRTLDLS
       :..: .:..:.. :::.. .::.::::..::::::::..:::.:...:..   :..::::
CCDS61 FQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLS
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pF1KB5 YNNIRDLPSFNGCHALEEISLQRNQIYQIKEGTFQGLISLRILDLSRNLIHEIHSRAFAT
       :: ..:::::. :. :..:.:..:.::.::  ::: :.::: :.:. : :  ::  ::.:
CCDS61 YNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFST
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pF1KB5 LGPITNLDVSFNELTSFPTEGLNGLNQLKLVGNFKLKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCC
       :  . .::.: : :.:::  ::.::..:::.::  :.  .....: .:. . .:::::::
CCDS61 LPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCC
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pF1KB5 AFWGCDSYANLNTE----DNSLQDHSVAQEKG---TADAANVTSTLENEEHSQIIIH---
       ::  :..  .....    ::: .:    .. :   . :  .. . : . :..   .:   
CCDS61 AFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQDERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQ
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pF1KB5 CTPSTGAFKPCEYLLGSWMIRLTVWFIFLVALFFNLLVILTTFASCTSLPSSKLFIGLIS
       :.:: : :::::.:: .:.::. :: : ..::  : ::  :.: :   .   ::.::.:.
CCDS61 CSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIA
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pF1KB5 VSNLFMGIYTGILTFLDAVSWGRFAEFGIWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLLMLATV
       . :.. :. ...:. .:: ..: ::. : :::.: ::.: :::..:.:::..::: ::..
CCDS61 AVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAAL
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pF1KB5 ERSLSAKDIMKNGKSNHLKQFRVAALLAFLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPFPTGET
       ::..:.:   :   .  .....:  ::  : : . .  ::.  ..:.:::::::.: :: 
CCDS61 ERGFSVKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEP
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        ..:. :.:.::::: ::.:.. ::::::::.: :: .  . ::.::.: :.:::::. :
CCDS61 STMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNC
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pF1KB5 PVAFFSFAPLITAISISPEIMKSVTLIFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKLLKRRV--
       ::::.::. ::.   ::::..: . :.  ::::::::.::..:::.::::   :....  
CCDS61 PVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYV
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pF1KB5 -TKKSGSVSVSISSQGGCLEQDFYYDCGMYSHLQGNLTVCDCCESFLLTKPVSCKHLIKS
        :...    .::.:                                              
CCDS61 WTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSS
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>>CCDS61194.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12               (883 aa)
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Smith-Waterman score: 2575; 49.0% identity (73.8% similar) in 845 aa overlap (5-832:10-830)

                    10        20        30        40            50 
pF1KB5      MPGPLGLLCFLALGLLGSAGPSGAAPPLCAAPCSCDGDRR----VDCSGKGLTAV
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CCDS61 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSEL
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pF1KB5 PEGLSAFTQALDISMNNITQLPEDAFKNFPFLEELQLAGNDLSFIHPKALSGLKELKVLT
       : .::.::. ::.:::::.::  . . .. :::::.:::: :..:   :..::  :::: 
CCDS61 PSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLM
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB5 LQNNQLKTVPSEAIRGLSALQSLRLDANHITSVPEDSFEGLVQLRHLWLDDNSLTEVPVH
       ::::::. ::.::...: .:::::::::::. :: . : :: .:::::::::.:::.::.
CCDS61 LQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQ
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pF1KB5 PLSNLPTLQALTLALNKISSIPDFAFTNLSSLVVLHLHNNKIRSLSQHCFDGLDNLETLD
        . .: .:::.:::::::  :::.:: :::::::::::::.:.::...::::: .:::::
CCDS61 AFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLD
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pF1KB5 LNYNNLGEFPQAIKALPSLKELGFHSNSISVIPDGAFDGNPLLRTIHLYDNPLSFVGNSA
       :::::: ::: ::..: .::::                        :.::::..::: ::
CCDS61 LNYNNLDEFPTAIRTLSNLKEL------------------------HFYDNPIQFVGRSA
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pF1KB5 FHNLSDLHSLVIRGASMVQQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSIPNNLCQEQKMLRTLDLS
       :..: .:..:.. :::.. .::.::::..::::::::..:::.:...:..   :..::::
CCDS61 FQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLS
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       :: ..:::::. :. :..:.:..:.::.::  ::: :.::: :.:. : :  ::  ::.:
CCDS61 YNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFST
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pF1KB5 LGPITNLDVSFNELTSFPTEGLNGLNQLKLVGNFKLKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCC
       :  . .::.: : :.:::  ::.::..:::.::  :.  .....: .:. . .:::::::
CCDS61 LPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCC
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pF1KB5 AFWGCDSYANLNTE----DNSLQDHSVAQEKG---TADAANVTSTLENEEHSQIIIH---
       ::  :..  .....    ::: .:    .. :   . :  .. . : . :..   .:   
CCDS61 AFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQDERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQ
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pF1KB5 CTPSTGAFKPCEYLLGSWMIRLTVWFIFLVALFFNLLVILTTFASCTSLPSSKLFIGLIS
       :.:: : :::::.:: .:.::. :: : ..::  : ::  :.: :   .   ::.::.:.
CCDS61 CSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIA
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pF1KB5 VSNLFMGIYTGILTFLDAVSWGRFAEFGIWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLLMLATV
       . :.. :. ...:. .:: ..: ::. : :::.: ::.: :::..:.:::..::: ::..
CCDS61 AVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAAL
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pF1KB5 ERSLSAKDIMKNGKSNHLKQFRVAALLAFLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPFPTGET
       ::..:.:   :   .  .....:  ::  : : . .  ::.  ..:.:::::::.: :: 
CCDS61 ERGFSVKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEP
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pF1KB5 PSLGFTVTLVLLNSLAFLLMAVIYTKLYCNLEKEDLSENSQSSMIKHVAWLIFTNCIFFC
        ..:. :.:.::::: ::.:.. ::::::::.: :: .  . ::.::.: :.:::::. :
CCDS61 STMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNC
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pF1KB5 PVAFFSFAPLITAISISPEIMKSVTLIFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKLLKRRV--
       ::::.::. ::.   ::::..: . :.  ::::::::.::..:::.::::   :....  
CCDS61 PVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYV
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pF1KB5 -TKKSGSVSVSISSQGGCLEQDFYYDCGMYSHLQGNLTVCDCCESFLLTKPVSCKHLIKS
        :...    .::.:                                              
CCDS61 WTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSS
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>>CCDS30972.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1               (828 aa)
 initn: 1583 init1: 967 opt: 969  Z-score: 812.8  bits: 161.6 E(32554): 6e-39
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CCDS30  MRLEGEGRSARAGQNLSRAGSARRGAPRDLSMNNLTELQPGLFHHLRFLEELRLSGNHL
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pF1KB5 SSIPDFAFTNLSSLVVLHLHNNKIRSLSQHCFDGLDNLETLDLNYNNLGEFPQAIKALPS
       : ::  ::..: :: .: :.::.. ..  . .  : .:..::::::.: ::: ::..:  
CCDS30 SHIPGQAFSGLYSLKILMLQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLDLNYNKLQEFPVAIRTLGR
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CCDS30 QEFPDLKGTTSLEILTLTRAGIRLLPSGMCQQLPRLRVLELSHNQIEELPSLHRCQKLEE
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pF1KB5 ISLQRNQIYQIKEGTFQGLISLRILDLSRNLIHEIHSRAFATLGPITNLDVSFNELTSFP
       :.::.:.:..:   ::. : ::. :::: : :. :: .::.::  ...::.. :.::..:
CCDS30 IGLQHNRIWEIGADTFSQLSSLQALDLSWNAIRSIHPEAFSTLHSLVKLDLTDNQLTTLP
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pF1KB5 TEGLNGLNQLKLVGNFKLKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCCAFWGCDSY----ANLNTE
         ::.:: .::: ::. :..:..  .: .:: : :::::::: .  : :.    .. ..:
CCDS30 LAGLGGLMHLKLKGNLALSQAFSKDSFPKLRILEVPYAYQCCPYGMCASFFKASGQWEAE
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pF1KB5 DNSLQDHSVA---------QEKGTADAANVTSTLENEEHS-QIIIHCTPSTGAFKPCEYL
       :  :.:.  .         : ..  :       :: :. . .  ..:.:. : :::::::
CCDS30 DLHLDDEESSKRPLGLLARQAENHYDQDLDELQLEMEDSKPHPSVQCSPTPGPFKPCEYL
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pF1KB5 LGSWMIRLTVWFIFLVALFFNLLVILTTFASC-TSLPSSKLFIGLISVSNLFMGIYTGIL
       . :: :::.:: : :.... : ::.::.::.  . ::  :. .: :. .: . ::  :.:
CCDS30 FESWGIRLAVWAIVLLSVLCNGLVLLTVFAGGPVPLPPVKFVVGAIAGANTLTGISCGLL
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pF1KB5 TFLDAVSWGRFAEFGIWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLLMLATVERSLSAKDIMKNG
       . .::...:.:.:.:  :::: ::...:::::..::....:: ::.:. :.:.. .   :
CCDS30 ASVDALTFGQFSEYGARWETGLGCRATGFLAVLGSEASVLLLTLAAVQCSVSVSCVRAYG
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pF1KB5 KSNHLKQFRVAALLAFLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPF--PTGETPSLGFTVTLVL
       ::  : . :...:  .  : .:. .::   :::.:::::::.  : :.  .:::::.::.
CCDS30 KSPSLGSVRAGVLGCLALAGLAAALPLASVGEYGASPLCLPYAPPEGQPAALGFTVALVM
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pF1KB5 LNSLAFLLMAVIYTKLYCNLEKEDLSENSQSSMIKHVAWLIFTNCIFFCPVAFFSFAPLI
       .::. ::..:  : ::::.: . :.    . .:..:::::::.. ...:::::.::: ..
CCDS30 MNSFCFLVVAGAYIKLYCDLPRGDFEAVWDCAMVRHVAWLIFADGLLYCPVAFLSFASML
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CCDS30 GLFPVTPEAVKSVLLVVLPLPACLNPLLYLLFNPHFRDDL----RRLRPRAGDSGPLAYA
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pF1KB5 QGGCLEQDFYYDCGMYSHLQGNLTVCDCCESFLLTKPVSCKHLIKSHSCPALAVASCQRP
        .: ::..   .:   . : .   :    :.    .: .    ..... :.... :::.:
CCDS30 AAGELEKS---SCDSTQALVAFSDVDLILEASEAGRPPG----LETYGFPSVTLISCQQP
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pF1KB5 EGYWSDCGTQSAHSDYADEEDSFVSDSSDQVQACGRACFYQSRGFPLVRYAYNLPRVKD 
                                                                   
CCDS30 GAPRLEGSHCVEPEGNHFGNPQPSMDGELLLRAEGSTPAGGGLSGGGGFQPSGLAFASHV
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>>CCDS9872.1 TSHR gene_id:7253|Hs108|chr14                (764 aa)
 initn: 730 init1: 384 opt: 685  Z-score: 578.3  bits: 118.1 E(32554): 6.9e-26
Smith-Waterman score: 685; 25.8% identity (60.7% similar) in 670 aa overlap (165-811:44-688)

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CCDS98 DLPRDLGGMGCSSPPCECHQEEDFRVTCKDIQRIPSLP----PSTQTLKLIETHLRTIPS
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pF1KB5 FAFTNLSSLVVLHLHNN-KIRSLSQHCFDGLDNLETLDL-NYNNLGEF-PQAIKALPSLK
        ::.:: ..  ...  .  ...: .: : .:...  ... :  ::  . :.:.: :: ::
CCDS98 HAFSNLPNISRIYVSIDVTLQQLESHSFYNLSKVTHIEIRNTRNLTYIDPDALKELPLLK
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pF1KB5 ELGFHSNSISVIPD-GAFDGNPLLRTIHLYDNP-LSFVGNSAFHNLSDLHSLVIR----G
        ::. .......::     .. ..  ... ::: .. .  .::..: . ..:...    :
CCDS98 FLGIFNTGLKMFPDLTKVYSTDIFFILEITDNPYMTSIPVNAFQGLCN-ETLTLKLYNNG
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pF1KB5 ASMVQQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSI--PNNLCQEQKMLRTLDLSYNNIRDLPSFNG
        . :: .  ..:: .:... :. .:  ..   . .    .    ::.: ...  ::: .:
CCDS98 FTSVQGYA-FNGT-KLDAVYLNKNKYLTVIDKDAFGGVYSGPSLLDVSQTSVTALPS-KG
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pF1KB5 CHALEEISLQRNQIYQIKEGTFQGLISLRILDLSR-NLIHEIHSRAFATLGPITNLDVSF
        . :.:. . ::  . .:.      .:: .: :.: .: .  :  :: .   : ..  :.
CCDS98 LEHLKEL-IARNT-WTLKKLP----LSLSFLHLTRADLSYPSHCCAFKNQKKIRGILESL
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pF1KB5 NELTSFPTEGLNGLNQLKLVGNFKLKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCCAFWGCDSYANL
           :    ....: : : :.   :.  :  .   :: .  : :  .   :    . :. 
CCDS98 MCNES----SMQSLRQRKSVNA--LNSPLHQEYEENLGDSIVGYKEKS-KFQDTHNNAHY
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pF1KB5 -----NTEDNSL---QDHSVAQEKGT-ADAANVTSTLENEEHSQIIIHCTPSTGAFKPCE
            . ::. .   :. .  ::.   :  ..   :. .. ....   :::..  :.:::
CCDS98 YVFFEEQEDEIIGFGQELKNPQEETLQAFDSHYDYTICGDSEDMV---CTPKSDEFNPCE
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pF1KB5 YLLGSWMIRLTVWFIFLVALFFNLLVILTTFASCTSLPSSKLFIGLISVSNLFMGIYTGI
        ..:  ..:..:::. :.::. :..:.:  ..:  .:   ....  .. ... ::.:  .
CCDS98 DIMGYKFLRIVVWFVSLLALLGNVFVLLILLTSHYKLNVPRFLMCNLAFADFCMGMYLLL
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pF1KB5 LTFLDAVSWGRFAEFGIWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLLMLATVERSLSAKDIMKN
       .. .:  . ... . .: :.:: ::..:::..::.:: ... : . :.::  .    :. 
CCDS98 IASVDLYTHSEYYNHAIDWQTGPGCNTAGFFTVFASELSVYTLTVITLERWYAITFAMRL
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        .. .:..  .  . ...   . . .::   . :.   .:::. : ::: .:.. : .. 
CCDS98 DRKIRLRHACAIMVGGWVCCFLLALLPLVGISSYAKVSICLPMDT-ETPLALAYIVFVLT
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       :: .::...   :.:.: .... . . ..... : :..: ::::. : . :..:.... .
CCDS98 LNIVAFVIVCCCYVKIYITVRNPQYNPGDKDTKIAKRMAVLIFTDFICMAPISFYALSAI
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       ..   :.    : . ..:.:: .: :: ::..:.  :..:                    
CCDS98 LNKPLITVSNSKILLVLFYPLNSCANPFLYAIFTKAFQRDVFILLSKFGICKRQAQAYRG
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CCDS98 QRVPPKNSTDIQVQKVTHEMRQGLHNMEDVYELIENSHLTPKKQGQISEEYMQTVL    
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>>CCDS1844.2 FSHR gene_id:2492|Hs108|chr2                 (669 aa)
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CCDS18 HRICHCSNRVFLCQESKVTEIPSDLPRNAIELRFVLTKLRVIQKGAFSGFGDLEKIEISQ
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       :  :  .  ..: ::  :: . :. :.      ::        : ..   ....::    
CCDS18 NDVLEVIEADVFSNLPKLHEIRIEKAN------NL--------LYINPEAFQNLPN----
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           :. : .: ..:. ::. .  :.:... :  ..: : .:.. .:.:  .:  :.:: 
CCDS18 ----LQYLLISNTGIKHLPDVHKIHSLQKVLLWLNKNGIQEIHNCAFNGT-QLDELNLSD
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        : ..:. . .: .. ::.  ::.: ... :.:. ::..:..:.  ....::.  . . .
CCDS18 NNNLEELPNDVFHGASGPVI-LDISRTRIHSLPSYGLENLKKLRARSTYNLKKLPTLEKL
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       : :   :. :  .::::  :          :.. . :  : . .     :  :.:... .
CCDS18 VALMEASLTYPSHCCAFANWRRQISELHPICNK-SILRQEVDYMTQARGQRSSLAEDNES
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pF1KB5 ADAANVTSTLENEEH---SQII-IHCTPSTGAFKPCEYLLGSWMIRLTVWFIFLVALFFN
       . . .   :  . ..   .... . :.:.  ::.::: ..:  ..:. .::: ..:.  :
CCDS18 SYSRGFDMTYTEFDYDLCNEVVDVTCSPKPDAFNPCEDIMGYNILRVLIWFISILAITGN
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pF1KB5 LLVILTTFASCTSLPSSKLFIGLISVSNLFMGIYTGILTFLDAVSWGRFAEFGIWWETGS
       ..:..   .:  .:   ....  .. ..: .:::  ... .:  . ... ...: :.::.
CCDS18 IIVLVILTTSQYKLTVPRFLMCNLAFADLCIGIYLLLIASVDIHTKSQYHNYAIDWQTGA
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pF1KB5 GCKVAGFLAVFSSESAIFLLMLATVERSLSAKDIMKNGKSNHLKQFRVAALLAFLGATVA
       :: .:::..::.:: ... :   :.::  .    :.   . .:..   . ..... : .:
CCDS18 GCDAAGFFTVFASELSVYTLTAITLERWHTITHAMQLDCKVQLRHAASVMVMGWIFAFAA
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pF1KB5 GCFPLFHRGEYSASPLCLPFPTGETPSLGFTVTLVLLNSLAFLLMAVIYTKLYCNLEKED
       . ::.:  . :    .:::.      :  ....:..:: :::...   : ..: .... .
CCDS18 ALFPIFGISSYMKVSICLPMDIDSPLSQLYVMSLLVLNVLAFVVICGCYIHIYLTVRNPN
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pF1KB5 L-SENSQSSMIKHVAWLIFTNCIFFCPVAFFSFAPLITAISISPEIMKSVTLIFFPLPAC
       . : .:.. . :..: ::::. . . :..::...  . .  :.    : . ..: :. .:
CCDS18 IVSSSSDTRIAKRMAMLIFTDFLCMAPISFFAISASLKVPLITVSKAKILLVLFHPINSC
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pF1KB5 LNPVLYVFFNPKFKEDWKLLKRRVTKKSGSVSVSISSQGGCLEQDFYYDCGMYSHLQGNL
        :: ::..:. .:..:. .:                                        
CCDS18 ANPFLYAIFTKNFRRDFFILLSKCGCYEMQAQIYRTETSSTVHNTHPRNGHCSSAPRVTS
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>>CCDS1843.1 FSHR gene_id:2492|Hs108|chr2                 (695 aa)
 initn: 671 init1: 355 opt: 651  Z-score: 550.6  bits: 112.8 E(32554): 2.4e-24
Smith-Waterman score: 748; 27.5% identity (62.0% similar) in 600 aa overlap (252-815:50-640)

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pF1KB5 DGLDNLETLDLNYNNLGEFPQAIKALPSLKELGFHSNSISVIPDGAFDGNPLLRTIHLYD
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CCDS18 HRICHCSNRVFLCQESKVTEIPSDLPRNAIELRFVLTKLRVIQKGAFSGFGDLEKIEISQ
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pF1KB5 NP-LSFVGNSAFHNLSDLHSLVIRGASMV-----QQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSIP
       :  :  .  ..: ::  :: . :. :. .     . : ::    .:. : ...: :. .:
CCDS18 NDVLEVIEADVFSNLPKLHEIRIEKANNLLYINPEAFQNLP---NLQYLLISNTGIKHLP
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pF1KB5 N--NLCQEQKMLRTLDLSYN-NIRDLP--SFNGCHALEEISL--QRNQIYQIKEGTFQGL
       .  .. . ::.:  ::.. : ::. .   :: :  ..: . :  ..: : .:.. .:.: 
CCDS18 DVHKIHSLQKVL--LDIQDNINIHTIERNSFVGL-SFESVILWLNKNGIQEIHNCAFNGT
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pF1KB5 ISLRILDLS-RNLIHEIHSRAF-ATLGPITNLDVSFNELTSFPTEGLNGLNQLKLVGNFK
        .:  :.::  : ..:. . .: .. ::.  ::.: ... :.:. ::..:..:.  ....
CCDS18 -QLDELNLSDNNNLEELPNDVFHGASGPVI-LDISRTRIHSLPSYGLENLKKLRARSTYN
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pF1KB5 LKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCCAF--WG---------CDSYANLNTEDNSL-----Q
       ::.  . . .: :   :. :  .::::  :          :.. . :  : . .     :
CCDS18 LKKLPTLEKLVALMEASLTYPSHCCAFANWRRQISELHPICNK-SILRQEVDYMTQARGQ
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pF1KB5 DHSVAQEKGTADAANVTSTLENEEH---SQII-IHCTPSTGAFKPCEYLLGSWMIRLTVW
         :.:... .. . .   :  . ..   .... . :.:.  ::.::: ..:  ..:. .:
CCDS18 RSSLAEDNESSYSRGFDMTYTEFDYDLCNEVVDVTCSPKPDAFNPCEDIMGYNILRVLIW
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pF1KB5 FIFLVALFFNLLVILTTFASCTSLPSSKLFIGLISVSNLFMGIYTGILTFLDAVSWGRFA
       :: ..:.  :..:..   .:  .:   ....  .. ..: .:::  ... .:  . ... 
CCDS18 FISILAITGNIIVLVILTTSQYKLTVPRFLMCNLAFADLCIGIYLLLIASVDIHTKSQYH
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pF1KB5 EFGIWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLLMLATVERSLSAKDIMKNGKSNHLKQFRVAA
       ...: :.::.:: .:::..::.:: ... :   :.::  .    :.   . .:..   . 
CCDS18 NYAIDWQTGAGCDAAGFFTVFASELSVYTLTAITLERWHTITHAMQLDCKVQLRHAASVM
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pF1KB5 LLAFLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPFPTGETPSLGFTVTLVLLNSLAFLLMAVIYT
       ..... : .:. ::.:  . :    .:::.      :  ....:..:: :::...   : 
CCDS18 VMGWIFAFAAALFPIFGISSYMKVSICLPMDIDSPLSQLYVMSLLVLNVLAFVVICGCYI
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pF1KB5 KLYCNLEKEDL-SENSQSSMIKHVAWLIFTNCIFFCPVAFFSFAPLITAISISPEIMKSV
       ..: .... .. : .:.. . :..: ::::. . . :..::...  . .  :.    : .
CCDS18 HIYLTVRNPNIVSSSSDTRIAKRMAMLIFTDFLCMAPISFFAISASLKVPLITVSKAKIL
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pF1KB5 TLIFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKLLKRRVTKKSGSVSVSISSQGGCLEQDFYYDC
        ..: :. .: :: ::..:. .:..:. .:                              
CCDS18 LVLFHPINSCANPFLYAIFTKNFRRDFFILLSKCGCYEMQAQIYRTETSSTVHNTHPRNG
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951 residues in 1 query   sequences
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 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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