Result of FASTA (ccds) for pF1KB5062
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5062, 655 aa
  1>>>pF1KB5062 655 - 655 aa - 655 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1001+/-0.00123; mu= 15.0737+/- 0.074
 mean_var=72.8619+/-14.425, 0's: 0 Z-trim(101.4): 75  B-trim: 0 in 0/49
 Lambda= 0.150253
 statistics sampled from 6418 (6493) to 6418 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.548), E-opt: 0.2 (0.199), width:  16
 Scan time:  3.230

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3628.1 ABCG2 gene_id:9429|Hs108|chr4           ( 655) 4250 931.3       0
CCDS58910.1 ABCG2 gene_id:9429|Hs108|chr4          ( 611) 3520 773.0       0
CCDS13682.1 ABCG1 gene_id:9619|Hs108|chr21         ( 678)  945 214.9   3e-55
CCDS1815.1 ABCG8 gene_id:64241|Hs108|chr2          ( 673)  850 194.3 4.7e-49
CCDS1814.1 ABCG5 gene_id:64240|Hs108|chr2          ( 651)  670 155.3 2.5e-37
CCDS13681.1 ABCG1 gene_id:9619|Hs108|chr21         ( 663)  620 144.4 4.7e-34
CCDS42938.1 ABCG1 gene_id:9619|Hs108|chr21         ( 666)  620 144.4 4.7e-34
CCDS42937.1 ABCG1 gene_id:9619|Hs108|chr21         ( 668)  620 144.4 4.8e-34
CCDS13683.1 ABCG1 gene_id:9619|Hs108|chr21         ( 677)  620 144.4 4.8e-34
CCDS8415.1 ABCG4 gene_id:64137|Hs108|chr11         ( 646)  613 142.9 1.3e-33
CCDS11681.1 ABCA9 gene_id:10350|Hs108|chr17        (1624)  317 78.9 6.3e-14
CCDS74138.1 ABCA8 gene_id:10351|Hs108|chr17        (1616)  304 76.0 4.5e-13
CCDS74139.1 ABCA8 gene_id:10351|Hs108|chr17        (1621)  304 76.0 4.5e-13
CCDS43909.1 ABCA2 gene_id:20|Hs108|chr9            (2436)  288 72.6 7.2e-12
CCDS11684.1 ABCA10 gene_id:10349|Hs108|chr17       (1543)  280 70.8 1.6e-11
CCDS12055.1 ABCA7 gene_id:10347|Hs108|chr19        (2146)  281 71.1 1.8e-11
CCDS64798.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7         ( 630)  271 68.8 2.7e-11
CCDS5913.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7          ( 718)  271 68.8   3e-11
CCDS64799.1 ABCB8 gene_id:11194|Hs108|chr7         ( 735)  271 68.8 3.1e-11
CCDS11683.1 ABCA6 gene_id:23460|Hs108|chr17        (1617)  274 69.5   4e-11


>>CCDS3628.1 ABCG2 gene_id:9429|Hs108|chr4                (655 aa)
 initn: 4250 init1: 4250 opt: 4250  Z-score: 4977.5  bits: 931.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4250; 100.0% identity (100.0% similar) in 655 aa overlap (1-655:1-655)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MSSSNVEVFIPVSQGNTNGFPATASNDLKAFTEGAVLSFHNICYRVKLKSGFLPCRKPVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 MSSSNVEVFIPVSQGNTNGFPATASNDLKAFTEGAVLSFHNICYRVKLKSGFLPCRKPVE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 KEILSNINGIMKPGLNAILGPTGGGKSSLLDVLAARKDPSGLSGDVLINGAPRPANFKCN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 KEILSNINGIMKPGLNAILGPTGGGKSSLLDVLAARKDPSGLSGDVLINGAPRPANFKCN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 SGYVVQDDVVMGTLTVRENLQFSAALRLATTMTNHEKNERINRVIQELGLDKVADSKVGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 SGYVVQDDVVMGTLTVRENLQFSAALRLATTMTNHEKNERINRVIQELGLDKVADSKVGT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 QFIRGVSGGERKRTSIGMELITDPSILFLDEPTTGLDSSTANAVLLLLKRMSKQGRTIIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 QFIRGVSGGERKRTSIGMELITDPSILFLDEPTTGLDSSTANAVLLLLKRMSKQGRTIIF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 SIHQPRYSIFKLFDSLTLLASGRLMFHGPAQEALGYFESAGYHCEAYNNPADFFLDIING
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 SIHQPRYSIFKLFDSLTLLASGRLMFHGPAQEALGYFESAGYHCEAYNNPADFFLDIING
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 DSTAVALNREEDFKATEIIEPSKQDKPLIEKLAEIYVNSSFYKETKAELHQLSGGEKKKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 DSTAVALNREEDFKATEIIEPSKQDKPLIEKLAEIYVNSSFYKETKAELHQLSGGEKKKK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 ITVFKEISYTTSFCHQLRWVSKRSFKNLLGNPQASIAQIIVTVVLGLVIGAIYFGLKNDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 ITVFKEISYTTSFCHQLRWVSKRSFKNLLGNPQASIAQIIVTVVLGLVIGAIYFGLKNDS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 TGIQNRAGVLFFLTTNQCFSSVSAVELFVVEKKLFIHEYISGYYRVSSYFLGKLLSDLLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 TGIQNRAGVLFFLTTNQCFSSVSAVELFVVEKKLFIHEYISGYYRVSSYFLGKLLSDLLP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 MRMLPSIIFTCIVYFMLGLKPKADAFFVMMFTLMMVAYSASSMALAIAAGQSVVSVATLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 MRMLPSIIFTCIVYFMLGLKPKADAFFVMMFTLMMVAYSASSMALAIAAGQSVVSVATLL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 MTICFVFMMIFSGLLVNLTTIASWLSWLQYFSIPRYGFTALQHNEFLGQNFCPGLNATGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 MTICFVFMMIFSGLLVNLTTIASWLSWLQYFSIPRYGFTALQHNEFLGQNFCPGLNATGN
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650     
pF1KB5 NPCNYATCTGEEYLVKQGIDLSPWGLWKNHVALACMIVIFLTIAYLKLLFLKKYS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 NPCNYATCTGEEYLVKQGIDLSPWGLWKNHVALACMIVIFLTIAYLKLLFLKKYS
              610       620       630       640       650     

>>CCDS58910.1 ABCG2 gene_id:9429|Hs108|chr4               (611 aa)
 initn: 3520 init1: 3520 opt: 3520  Z-score: 4122.8  bits: 773.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3520; 99.8% identity (100.0% similar) in 550 aa overlap (1-550:1-550)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MSSSNVEVFIPVSQGNTNGFPATASNDLKAFTEGAVLSFHNICYRVKLKSGFLPCRKPVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MSSSNVEVFIPVSQGNTNGFPATASNDLKAFTEGAVLSFHNICYRVKLKSGFLPCRKPVE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 KEILSNINGIMKPGLNAILGPTGGGKSSLLDVLAARKDPSGLSGDVLINGAPRPANFKCN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KEILSNINGIMKPGLNAILGPTGGGKSSLLDVLAARKDPSGLSGDVLINGAPRPANFKCN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 SGYVVQDDVVMGTLTVRENLQFSAALRLATTMTNHEKNERINRVIQELGLDKVADSKVGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SGYVVQDDVVMGTLTVRENLQFSAALRLATTMTNHEKNERINRVIQELGLDKVADSKVGT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 QFIRGVSGGERKRTSIGMELITDPSILFLDEPTTGLDSSTANAVLLLLKRMSKQGRTIIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QFIRGVSGGERKRTSIGMELITDPSILFLDEPTTGLDSSTANAVLLLLKRMSKQGRTIIF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 SIHQPRYSIFKLFDSLTLLASGRLMFHGPAQEALGYFESAGYHCEAYNNPADFFLDIING
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SIHQPRYSIFKLFDSLTLLASGRLMFHGPAQEALGYFESAGYHCEAYNNPADFFLDIING
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 DSTAVALNREEDFKATEIIEPSKQDKPLIEKLAEIYVNSSFYKETKAELHQLSGGEKKKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DSTAVALNREEDFKATEIIEPSKQDKPLIEKLAEIYVNSSFYKETKAELHQLSGGEKKKK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 ITVFKEISYTTSFCHQLRWVSKRSFKNLLGNPQASIAQIIVTVVLGLVIGAIYFGLKNDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ITVFKEISYTTSFCHQLRWVSKRSFKNLLGNPQASIAQIIVTVVLGLVIGAIYFGLKNDS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 TGIQNRAGVLFFLTTNQCFSSVSAVELFVVEKKLFIHEYISGYYRVSSYFLGKLLSDLLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TGIQNRAGVLFFLTTNQCFSSVSAVELFVVEKKLFIHEYISGYYRVSSYFLGKLLSDLLP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 MRMLPSIIFTCIVYFMLGLKPKADAFFVMMFTLMMVAYSASSMALAIAAGQSVVSVATLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MRMLPSIIFTCIVYFMLGLKPKADAFFVMMFTLMMVAYSASSMALAIAAGQSVVSVATLL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 MTICFVFMMIFSGLLVNLTTIASWLSWLQYFSIPRYGFTALQHNEFLGQNFCPGLNATGN
       :::::::::.                                                  
CCDS58 MTICFVFMMVCWSISQPLHLGCHGFSTSAFHDMDLRLCSIMNFWDKTSAQDSMQQETILV
              550       560       570       580       590       600

>>CCDS13682.1 ABCG1 gene_id:9619|Hs108|chr21              (678 aa)
 initn: 740 init1: 369 opt: 945  Z-score: 1105.4  bits: 214.9 E(32554): 3e-55
Smith-Waterman score: 954; 29.2% identity (66.8% similar) in 602 aa overlap (56-650:93-672)

          30        40        50        60        70         80    
pF1KB5 NDLKAFTEGAVLSFHNICYRVKLKSGFLPCRKPVEKEILSNINGIMKPG-LNAILGPTGG
                                     ::   : .:..:.: .. : : ::.::.:.
CCDS13 AQRFSSLPRRAAVNIEFRDLSYSVPEGPWWRKKGYKTLLKGISGKFNSGELVAIMGPSGA
             70        80        90       100       110       120  

           90       100       110        120       130       140   
pF1KB5 GKSSLLDVLAARKDPSGLSGDVLINGAPRPAN-FKCNSGYVVQDDVVMGTLTVRENLQFS
       :::.:...::. .. .:..: ::::: ::    :.  : :..:::...  :::.: .. :
CCDS13 GKSTLMNILAGYRE-TGMKGAVLINGLPRDLRCFRKVSCYIMQDDMLLPHLTVQEAMMVS
            130        140       150       160       170       180 

           150       160       170       180       190       200   
pF1KB5 AALRLATTMTNHEKNERINRVIQELGLDKVADSKVGTQFIRGVSGGERKRTSIGMELITD
       : :.:     .. . : .....  ::: . :....:.     .:::.::: .:..::...
CCDS13 AHLKLQEK--DEGRREMVKEILTALGLLSCANTRTGS-----LSGGQRKRLAIALELVNN
               190       200       210            220       230    

           210       220       230       240       250       260   
pF1KB5 PSILFLDEPTTGLDSSTANAVLLLLKRMSKQGRTIIFSIHQPRYSIFKLFDSLTLLASGR
       : ..:.::::.::::..   :. :.: ... ::.:: .::::  ..:.:::.: .:..:.
CCDS13 PPVMFFDEPTSGLDSASCFQVVSLMKGLAQGGRSIICTIHQPSAKLFELFDQLYVLSQGQ
          240       250       260       270       280       290    

           270       280       290       300       310       320   
pF1KB5 LMFHGPAQEALGYFESAGYHCEAYNNPADFFLDIINGDSTAVALNREEDFKATEIIEPSK
        ...: . . . :... : .: .:.::::: ... .:.        ... . .. .. . 
CCDS13 CVYRGKVCNLVPYLRDLGLNCPTYHNPADFVMEVASGEYG------DQNSRLVRAVREGM
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pF1KB5 QDKPLIEKLA-EIYVNSSFYKETKAELHQLS--GGEKKKKITVFKEISYTTSFCHQLRWV
        :.   . :. .  ::  .... . :..: .   : .: . ..    :...:   :.  .
CCDS13 CDSDHKRDLGGDAEVNPFLWHRPSEEVKQTKRLKGLRKDSSSMEGCHSFSASCLTQFCIL
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pF1KB5 SKRSFKNLLGNPQASIAQIIVTVVLGLVIGAIYFGLKNDSTGIQNRAGVLFFLTTNQCFS
        ::.: ... .   .  .:   . .::.:: .:.:. :..  . . .: :::      :.
CCDS13 FKRTFLSIMRDSVLTHLRITSHIGIGLLIGLLYLGIGNEAKKVLSNSGFLFFSMLFLMFA
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pF1KB5 SV-SAVELFVVEKKLFIHEYISGYYRVSSYFLGKLLSDLLPMRMLPSIIFTCIVYFMLGL
       ..  .:  : .:  .:..:... .: ...:.:.: ..:. :....  . .  :::.: . 
CCDS13 ALMPTVLTFPLEMGVFLREHLNYWYSLKAYYLAKTMADV-PFQIMFPVAYCSIVYWMTS-
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pF1KB5 KPKADAFFVMMFTL-MMVAYSASSMALAIAAGQSVVSVATLLMTICFVFMMIFSGLLVNL
       .:.  . ::.. .:  :..  :.:..: :.:... ..:::..  .  . ...:::..:..
CCDS13 QPSDAVRFVLFAALGTMTSLVAQSLGLLIGAASTSLQVATFVGPVTAIPVLLFSGFFVSF
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pF1KB5 TTIASWLSWLQYFSIPRYGFTALQHNEFLGQNFCPGLNATGNNPCNYATCTGEEYLVKQG
        :: ..:.:..:.:  :::: ..  . . : .    :.   .. :..      : .... 
CCDS13 DTIPTYLQWMSYISYVRYGFEGVILSIY-GLDR-EDLHCDIDETCHFQKS---EAILRE-
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pF1KB5 IDLSPWGLWKNHVALACMIVIFLTIAYLKLLFLKKYS 
       .:.    :. . ..:. ... .  :::. : .      
CCDS13 LDVENAKLYLDFIVLGIFFISLRLIAYFVLRYKIRAER
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>>CCDS1815.1 ABCG8 gene_id:64241|Hs108|chr2               (673 aa)
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CCDS18 RDLNYQVDLASQVPWFEQLAQFKMPWTSPSCQNSCELGI-QNLSFKVRSGQMLAIIGSSG
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pF1KB5 GGKSSLLDVLAARKDPSGL-SGDVLINGAPRPANF--KCNSGYVVQDDVVMGTLTVRENL
        :..:::::...:   . . ::.. ::: :   ..  ::  ..: : . .. .:::::.:
CCDS18 CGRASLLDVITGRGHGGKIKSGQIWINGQPSSPQLVRKC-VAHVRQHNQLLPNLTVRETL
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pF1KB5 QFSAALRLATTMTNHEKNERINRVIQELGLDKVADSKVGTQFIRGVSGGERKRTSIGMEL
        : : .::  :... ....:.. :: :: : . ::..::....::.:::::.:.:::..:
CCDS18 AFIAQMRLPRTFSQAQRDKRVEDVIAELRLRQCADTRVGNMYVRGLSGGERRRVSIGVQL
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pF1KB5 ITDPSILFLDEPTTGLDSSTANAVLLLLKRMSKQGRTIIFSIHQPRYSIFKLFDSLTLLA
       . .:.::.:::::.:::: ::. ..  :.:..: .: ...:.:::: .::.::: . :..
CCDS18 LWNPGILILDEPTSGLDSFTAHNLVKTLSRLAKGNRLVLISLHQPRSDIFRLFDLVLLMT
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pF1KB5 SGRLMFHGPAQEALGYFESAGYHCEAYNNPADFFLDIINGDSTAVALNREEDFKATEIIE
       ::  .. : ::. . :: . :: :  :.:::::..:. . :  .    ::... . :  .
CCDS18 SGTPIYLGAAQHMVQYFTAIGYPCPRYSNPADFYVDLTSIDRRS----REQELATRE--K
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pF1KB5 PSKQDKPLIEKLAEIYVNSSFYKETKAELHQLSGGEKKKKITVFKEISYTTSF---CHQL
        ..    ..::. ..  .. ..:    .: . .  :..      . .   :..    .:.
CCDS18 AQSLAALFLEKVRDL--DDFLWKAETKDLDEDTCVESSVTPLDTNCLPSPTKMPGAVQQF
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pF1KB5 RWVSKRSFKNLLGNPQASIAQIIVTVVLGLVIGAIYFGLKNDSTGIQNRAGVLFFLTTNQ
         . .:...: . .  . . .   . .....:: .:::  . . .... :..::.. .  
CCDS18 TTLIRRQISNDFRDLPTLLIHGAEACLMSMTIGFLYFGHGSIQLSFMDTAALLFMIGALI
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pF1KB5 CFSSV-SAVELFVVEKKLFIHEYISGYYRVSSYFLGKLLSDLLPMRMLPSIIFTCIVYFM
        :. . ...     :. .. .:  .: : .. ::..:.:..: : .    ::.   .:..
CCDS18 PFNVILDVISKCYSERAMLYYELEDGLYTTGPYFFAKILGEL-PEHCAYIIIYGMPTYWL
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pF1KB5 LGLKPKADAFFVMMFTLMMVAYSASSMALAIAAGQSVVSVATLLMTICFVFMMIFSGLLV
        .:.:  . :.. .. . .:..    :::: ::   .  .:... .  .  ... .:...
CCDS18 ANLRPGLQPFLLHFLLVWLVVFCCRIMALAAAALLPTFHMASFFSNALYNSFYLAGGFMI
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pF1KB5 NLTTIASWLSWLQYFSIPRYGFTALQHNEFLGQNFCPGLNATGNNPCNYATCTGEEYLVK
       ::... .  .:..  :. :. : .:.. .:  ...   :   ::      . .:.. :  
CCDS18 NLSSLWTVPAWISKVSFLRWCFEGLMKIQFSRRTYKMPL---GNLT---IAVSGDKILSV
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pF1KB5 QGIDLSPWGLWKNHVALACMIVIFLTIAYLKLLFLKKYS    
       . .:  :  :.  .. .  .   :... :..: :.:.      
CCDS18 MELDSYP--LYAIYLIVIGLSGGFMVLYYVSLRFIKQKPSQDW
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>>CCDS1814.1 ABCG5 gene_id:64240|Hs108|chr2               (651 aa)
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Smith-Waterman score: 893; 29.8% identity (64.5% similar) in 611 aa overlap (13-605:21-602)

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pF1KB5         MSSSNVEVFIPVSQGNTNGFPATASNDLKAFTEGAVLSFHNICYRVKLKSGF
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CCDS18 MGDLSSLTPGGSMGLQVNRGSQSSLEGAPATAP---EPHSLGILHASYSVSHRVRPWWDI
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pF1KB5 LPCRKPVEKEILSNINGIMKPG-LNAILGPTGGGKSSLLDVLAARKDPSG-LSGDVLING
         ::.   ..::....  .. : .  ::: .:.::..:::....:   .: . :.: .::
CCDS18 TSCRQQWTRQILKDVSLYVESGQIMCILGSSGSGKTTLLDAMSGRLGRAGTFLGEVYVNG
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pF1KB5 -APRPANFKCNSGYVVQDDVVMGTLTVRENLQFSAALRLATTMTNHEKNERINRVIQELG
        : :  .:.   .::.:.:.....:::::.:...: : .     .  . .... :. ::.
CCDS18 RALRREQFQDCFSYVLQSDTLLSSLTVRETLHYTALLAIRRGNPGSFQ-KKVEAVMAELS
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pF1KB5 LDKVADSKVGTQFIRGVSGGERKRTSIGMELITDPSILFLDEPTTGLDSSTANAVLLLLK
       :..:::  .:.  . :.: :::.:.::. .:. ::.....::::::::  ::: ...:: 
CCDS18 LSHVADRLIGNYSLGGISTGERRRVSIAAQLLQDPKVMLFDEPTTGLDCMTANQIVVLLV
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pF1KB5 RMSKQGRTIIFSIHQPRYSIFKLFDSLTLLASGRLMFHGPAQEALGYFESAGYHCEAYNN
       ......: ....:::::  .:.:::....:. :.:.: :   : : .:.. :: :  ..:
CCDS18 ELARRNRIVVLTIHQPRSELFQLFDKIAILSFGELIFCGTPAEMLDFFNDCGYPCPEHSN
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pF1KB5 PADFFLDIINGDSTAVALNREEDFKATEIIEPSKQDKPLIEKLAEIYVNSSFYKETKAEL
       : ::..:. . :. .    .:..      :: ::. . .::         : ::..    
CCDS18 PFDFYMDLTSVDTQS----KERE------IETSKRVQ-MIE---------SAYKKSAICH
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pF1KB5 HQLSGGEKKKKITVFKEISYTTS----FCHQLRWVSKRSFKNLLGNPQASIAQIIVTVVL
       . :.. :. :.. ..  . . :.       .:  . .:  .::. :  : :.... ....
CCDS18 KTLKNIERMKHLKTLPMVPFKTKDSPGVFSKLGVLLRRVTRNLVRNKLAVITRLLQNLIM
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pF1KB5 GLVIGAIYFGLKNDST----GIQNRAGVLF-FLTTNQCFSSVSAVELFVVEKKLFIHEYI
       :: .  ..: :.  :.    .::.:.:.:. :. ..   . ..::.:: : . .  .:  
CCDS18 GLFL--LFFVLRVRSNVLKGAIQDRVGLLYQFVGATPYTGMLNAVNLFPVLRAVSDQESQ
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pF1KB5 SGYYRVSSYFLGKLLSDLLPMRMLPSIIFTCIVYFMLGLKPKADAFFVMMFTLM---MVA
       .: :.  ...:.  :  .::. .. ..::. . :. :::.:..  :  .  .:.   ...
CCDS18 DGLYQKWQMMLAYALH-VLPFSVVATMIFSSVCYWTLGLHPEVARFGYFSAALLAPHLIG
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pF1KB5 YSASSMALAIAAGQSVVSVATLLMTICFVFMMIFSGLLVNLTTIASWLSWLQYFSIPRYG
          . . :.:. . ..:. .. :..:  :  .. ::.: :.  .   .. ..::.. .: 
CCDS18 EFLTLVLLGIVQNPNIVNSVVALLSIAGV--LVGSGFLRNIQEMPIPFKIISYFTFQKYC
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pF1KB5 FTALQHNEFLGQNF-CPGLNAT-GNNP-CNYATCTGEEYLVKQGIDLSPWGLWKNHVALA
          :  ::: : :: : . :..  .:: : .                             
CCDS18 SEILVVNEFYGLNFTCGSSNVSVTTNPMCAFTQGIQFIEKTCPGATSRFTMNFLILYSFI
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pF1KB5 CMIVIFLTIAYLKLLFLKKYS
                            
CCDS18 PALVILGIVVFKIRDHLISR 
             640       650  

>>CCDS13681.1 ABCG1 gene_id:9619|Hs108|chr21              (663 aa)
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Smith-Waterman score: 927; 29.3% identity (66.5% similar) in 600 aa overlap (56-650:90-657)

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pF1KB5 NDLKAFTEGAVLSFHNICYRVKLKSGFLPCRKPVEKEILSNINGIMKPG-LNAILGPTGG
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CCDS13 AQRFSSLPRRAAVNIEFRDLSYSVPEGPWWRKKGYKTLLKGISGKFNSGELVAIMGPSGA
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pF1KB5 GKSSLLDVLAARKDPSGLSGDVLINGAPRPAN-FKCNSGYVVQDDVVMGTLTVRENLQFS
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CCDS13 GKSTLMNILAGYRE-TGMKGAVLINGLPRDLRCFRKVSCYIMQDDMLLPHLTVQEAMMVS
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CCDS13 AHLKLQEK--DEGRREMVKEILTALGLLSCANTRTGS-----LSGGQRKRLAIALELVNN
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CCDS13 CVYRGKVCNLVPYLRDLGLNCPTYHNPADFVMEVASGEYG------DQNSRLVRAVREGM
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CCDS13 CDSDHKRDLGGDAEVNPFLWHRPSEE--DSSSMEGCHSFSA----SCLTQFC----ILFK
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CCDS13 RTFLSIMRDSVLTHLRITSHIGIGLLIGLLYLGIGNEAKKVLSNSGFLFFSMLFLMFAAL
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CCDS13 MPTVLTFPLEMGVFLREHLNYWYSLKAYYLAKTMADV-PFQIMFPVAYCSIVYWMTS-QP
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pF1KB5 KADAFFVMMFTL-MMVAYSASSMALAIAAGQSVVSVATLLMTICFVFMMIFSGLLVNLTT
       .  . ::.. .:  :..  :.:..: :.:... ..:::..  .  . ...:::..:.. :
CCDS13 SDAVRFVLFAALGTMTSLVAQSLGLLIGAASTSLQVATFVGPVTAIPVLLFSGFFVSFDT
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       : ..:.:..:.:  :::: ..  . . : .    :.   .. :..      : .... .:
CCDS13 IPTYLQWMSYISYVRYGFEGVILSIY-GLDR-EDLHCDIDETCHFQKS---EAILRE-LD
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pF1KB5 LSPWGLWKNHVALACMIVIFLTIAYLKLLFLKKYS 
       .    :. . ..:. ... .  :::. : .      
CCDS13 VENAKLYLDFIVLGIFFISLRLIAYFVLRYKIRAER
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CCDS84 MVSANLKLSEKQ--EVKKELVTEILTALGLMSCSHTRTAL-----LSGGQRKRLAIALEL
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CCDS84 QGQCIFKGVVTNLIPYLKGLGLHCPTYHNPADFIIEVASGEYG--DLN------------
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CCDS84 ------PMLFRAVQNGLCAMAEKKSSPEKNEVPAPCPPCPPEVDPIESHTFATSTLTQFC
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CCDS84 FAALMPTVLTFPLEMAVFMREHLNYWYSLKAYYLAKTMADV-PFQVVCPVVYCSIVYWMT
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CCDS84 G-QPAETSRF-LLFSALATATALVAQSLGLLIGAASNSLQVATFVGPVTAIPVLLFSGFF
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655 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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