seq1 = pF1KB4877.tfa, 2418 bp
seq2 = pF1KB4877/gi568815597r_244754453.tfa (gi568815597r:244754453_244964307), 209855 bp

>pF1KB4877 2418
>gi568815597r:244754453_244964307 (Chr1)

(complement)

1-634  (100001-100634)   100% ->
635-746  (101578-101689)   100% ->
747-820  (101774-101847)   100% ->
821-960  (103834-103973)   100% ->
961-1060  (104934-105033)   99% ->
1061-1173  (105467-105579)   100% ->
1174-1437  (106034-106297)   100% ->
1438-1557  (106591-106710)   100% ->
1558-1686  (107452-107580)   100% ->
1687-1855  (107683-107851)   100% ->
1856-2110  (108150-108404)   100% ->
2111-2295  (108700-108884)   100% ->
2296-2367  (109264-109335)   100% ->
2368-2418  (109805-109855)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTTCCTCGCCTGTTAATGTAAAAAAGCTGAAGGTGTCGGAGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTTCCTCGCCTGTTAATGTAAAAAAGCTGAAGGTGTCGGAGCTGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAGGAGCTCAAGAAGCGACGCCTTTCTGACAAGGGTCTCAAGGCCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGAGGAGCTCAAGAAGCGACGCCTTTCTGACAAGGGTCTCAAGGCCGAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCATGGAGCGACTCCAGGCTGCGCTGGACGACGAGGAGGCCGGGGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCATGGAGCGACTCCAGGCTGCGCTGGACGACGAGGAGGCCGGGGGCCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCGCCATGGAGCCCGGGAACGGCAGCCTAGACCTGGGCGGGGATTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCGCCATGGAGCCCGGGAACGGCAGCCTAGACCTGGGCGGGGATTCCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGGGCGCTCGGGAGCAGGCCTCGAGCAGGAGGCCGCGGCCGGCGGCGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGGGCGCTCGGGAGCAGGCCTCGAGCAGGAGGCCGCGGCCGGCGGCGATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AAGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAAGGAATCTCCGCTCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AAGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAAGGAATCTCCGCTCTGGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCGACCAGATGGAGCTAGGAGAGGAGAACGGGGCCGCGGGGGCGGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCGACCAGATGGAGCTAGGAGAGGAGAACGGGGCCGCGGGGGCGGCCGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTCGGGCCCGATGGAGGAGGAGGAGGCCGCCTCGGAAGACGAGAACGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTCGGGCCCGATGGAGGAGGAGGAGGCCGCCTCGGAAGACGAGAACGGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACGATCAGGGTTTCCAGGAAGGGGAAGATGAGCTCGGGGACGAAGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACGATCAGGGTTTCCAGGAAGGGGAAGATGAGCTCGGGGACGAAGAGGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGCGCGGGCGACGAGAACGGGCACGGGGAGCAGCAGCCTCAACCGCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGCGCGGGCGACGAGAACGGGCACGGGGAGCAGCAGCCTCAACCGCCGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GACGCAGCAGCAACAGCCCCAACAGCAGCGCGGGGCCGCCAAGGAGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GACGCAGCAGCAACAGCCCCAACAGCAGCGCGGGGCCGCCAAGGAGGCCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CGGGGAAGAGCAGCGGCCCCACCTCGCTGTTCGCGGTGACGGTGGCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CGGGGAAGAGCAGCGGCCCCACCTCGCTGTTCGCGGTGACGGTGGCGCCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCCGGGGCGAGGCAGGGCCAGCAGCAGGCGGGAG         GGGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100601 CCCGGGGCGAGGCAGGGCCAGCAGCAGGCGGGAGGTA...TAGGGGACGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CAAAACAGAACAGAAAGGCGGAGATAAAAAGAGGGGTGTTAAAAGACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101585 CAAAACAGAACAGAAAGGCGGAGATAAAAAGAGGGGTGTTAAAAGACCAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GAGAAGATCATGGCCGTGGATATTTTGAGTACATTGAAGAGAACAAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101635 GAGAAGATCATGGCCGTGGATATTTTGAGTACATTGAAGAGAACAAGTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AGCAG         AGCCAAATCTCCTCAGCCACCTGTTGAAGAAGAAGA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101685 AGCAGGTA...CAGAGCCAAATCTCCTCAGCCACCTGTTGAAGAAGAAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 TGAACACTTCGATGACACAGTGGTTTGTCTTGATACTT         ATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 101810 TGAACACTTCGATGACACAGTGGTTTGTCTTGATACTTGTA...CAGATA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 ATTGTGATCTACATTTTAAAATATCAAGAGATCGTCTCAGTGCTTCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103837 ATTGTGATCTACATTTTAAAATATCAAGAGATCGTCTCAGTGCTTCTTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CTTACAATGGAGAGTTTTGCTTTTCTTTGGGCTGGAGGAAGAGCATCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103887 CTTACAATGGAGAGTTTTGCTTTTCTTTGGGCTGGAGGAAGAGCATCCTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TGGTGTGTCAAAAGGCAAAGTGTGTTTTGAGATGAAG         GTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 103937 TGGTGTGTCAAAAGGCAAAGTGTGTTTTGAGATGAAGGTA...CAGGTTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CAGAGAAGATACCAGTAAGGCATTTATATACAAAAGATATTGACATACAT
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104938 CAGAGAAGATCCCAGTAAGGCATTTATATACAAAAGATATTGACATACAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GAAGTTCGTATTGGCTGGTCACTAACTACAAGTGGAATGTTACTTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 104988 GAAGTTCGTATTGGCTGGTCACTAACTACAAGTGGAATGTTACTTGGTA.

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061      GTGAAGAAGAATTTTCTTATGGGTATTCTCTAAAAGGAATAAAAA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105038 ..TAGGTGAAGAAGAATTTTCTTATGGGTATTCTCTAAAAGGAATAAAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 CATGCAACTGTGAGACTGAAGATTATGGAGAAAAGTTTGATGAAAATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105512 CATGCAACTGTGAGACTGAAGATTATGGAGAAAAGTTTGATGAAAATGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 GTGATTACATGTTTTGCT         AACTTTGAAAGTGATGAAGTAGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 105562 GTGATTACATGTTTTGCTGTA...CAGAACTTTGAAAGTGATGAAGTAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 ACTCTCGTATGCTAAGAATGGACAAGATCTTGGCGTTGCCTTCAAAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106057 ACTCTCGTATGCTAAGAATGGACAAGATCTTGGCGTTGCCTTCAAAATCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 GTAAGGAAGTTCTTGCTGGACGGCCACTGTTCCCGCATGTTCTCTGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106107 GTAAGGAAGTTCTTGCTGGACGGCCACTGTTCCCGCATGTTCTCTGCCAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 AACTGTGCAGTTGAATTTAATTTTGGTCAGAAGGAAAAGCCATATTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106157 AACTGTGCAGTTGAATTTAATTTTGGTCAGAAGGAAAAGCCATATTTTCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 AATACCTGAAGAGTATACTTTCATCCAGAACGTCCCCTTAGAGGATCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106207 AATACCTGAAGAGTATACTTTCATCCAGAACGTCCCCTTAGAGGATCGAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 TTAGAGGACCAAAGGGGCCTGAAGAGAAGAAAGATTGTGAA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 106257 TTAGAGGACCAAAGGGGCCTGAAGAGAAGAAAGATTGTGAAGTA...TAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 GTTGTGATGATGATTGGCTTGCCAGGAGCTGGAAAAACTACCTGGGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106591 GTTGTGATGATGATTGGCTTGCCAGGAGCTGGAAAAACTACCTGGGTTAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 TAAACATGCAGCAGAAAATCCAGGGAAATATAACATTCTTGGCACAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106641 TAAACATGCAGCAGAAAATCCAGGGAAATATAACATTCTTGGCACAAATA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 CTATTATGGATAAGATGATG         GTGGCAGGTTTTAAGAAGCAA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 106691 CTATTATGGATAAGATGATGGTA...TAGGTGGCAGGTTTTAAGAAGCAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 ATGGCAGATACTGGAAAACTGAACACACTGTTGCAGAGAGCCCCCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107473 ATGGCAGATACTGGAAAACTGAACACACTGTTGCAGAGAGCCCCCCAGTG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 TCTTGGGAAATTTATTGAGATTGCTGCCCGAAAGAAGCGAAATTTTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107523 TCTTGGGAAATTTATTGAGATTGCTGCCCGAAAGAAGCGAAATTTTATTC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 TGGATCAG         ACAAATGTGTCTGCTGCTGCCCAGAGGAGAAAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 107573 TGGATCAGGTA...AAGACAAATGTGTCTGCTGCTGCCCAGAGGAGAAAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 ATGTGCCTGTTTGCAGGCTTCCAGCGAAAAGCTGTTGTAGTTTGCCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107716 ATGTGCCTGTTTGCAGGCTTCCAGCGAAAAGCTGTTGTAGTTTGCCCAAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1770 AGATGAAGACTATAAGCAAAGAACACAGAAGAAAGCAGAAGTAGAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107766 AGATGAAGACTATAAGCAAAGAACACAGAAGAAAGCAGAAGTAGAGGGGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1820 AAGACCTACCAGAACATGCGGTCCTCAAAATGAAAG         GAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 107816 AAGACCTACCAGAACATGCGGTCCTCAAAATGAAAGGCA...CAGGAAAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1861 TTTACCCTCCCAGAGGTAGCTGAGTGCTTTGATGAAATAACCTATGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108155 TTTACCCTCCCAGAGGTAGCTGAGTGCTTTGATGAAATAACCTATGTTGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1911 ACTTCAGAAGGAAGAAGCCCAAAAACTCTTGGAGCAATATAAGGAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108205 ACTTCAGAAGGAAGAAGCCCAAAAACTCTTGGAGCAATATAAGGAAGAAA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1961 GCAAAAAGGCTCTTCCACCAGAAAAGAAACAGAACACTGGCTCAAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108255 GCAAAAAGGCTCTTCCACCAGAAAAGAAACAGAACACTGGCTCAAAGAAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2011 AGCAATAAAAATAAGAGTGGCAAGAACCAGTTTAACAGAGGTGGTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108305 AGCAATAAAAATAAGAGTGGCAAGAACCAGTTTAACAGAGGTGGTGGCCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2061 TAGAGGACGTGGAGGATTCAATATGCGTGGTGGAAATTTCAGAGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108355 TAGAGGACGTGGAGGATTCAATATGCGTGGTGGAAATTTCAGAGGAGGAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2111          CCCCTGGGAATCGTGGCGGATATAATAGGAGGGGCAACATG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108405 GCA...TAGCCCCTGGGAATCGTGGCGGATATAATAGGAGGGGCAACATG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2152 CCACAGAGAGGTGGTGGCGGTGGAGGAAGTGGTGGAATCGGCTATCCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108741 CCACAGAGAGGTGGTGGCGGTGGAGGAAGTGGTGGAATCGGCTATCCATA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2202 CCCTCGTGCCCCTGTTTTTCCTGGCCGTGGTAGTTACTCAAACAGAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108791 CCCTCGTGCCCCTGTTTTTCCTGGCCGTGGTAGTTACTCAAACAGAGGGA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2252 ACTACAACAGAGGTGGAATGCCCAACAGAGGGAACTACAACCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 108841 ACTACAACAGAGGTGGAATGCCCAACAGAGGGAACTACAACCAGGTA...

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2296    AACTTCAGAGGACGAGGAAACAATCGTGGCTACAAAAATCAATCTCA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109261 TAGAACTTCAGAGGACGAGGAAACAATCGTGGCTACAAAAATCAATCTCA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2343 GGGCTACAACCAGTGGCAGCAGGGT         CAATTCTGGGGTCAGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 109311 GGGCTACAACCAGTGGCAGCAGGGTGTA...CAGCAATTCTGGGGTCAGA

   2500     .    :    .    :    .    :    .
   2384 AGCCATGGAGTCAGCATTATCACCAAGGATATTAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109821 AGCCATGGAGTCAGCATTATCACCAAGGATATTAT