Result of FASTA (omim) for pF1KB4700
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4700, 906 aa
  1>>>pF1KB4700 906 - 906 aa - 906 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1152+/-0.000398; mu= 17.4703+/- 0.025
 mean_var=93.8751+/-18.792, 0's: 0 Z-trim(113.5): 422  B-trim: 287 in 1/53
 Lambda= 0.132373
 statistics sampled from 22476 (22902) to 22476 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.269), width:  16
 Scan time: 13.250

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001783 (OMIM: 114020) cadherin-2 isoform 1 prep ( 906) 6041 1164.8       0
NP_001295105 (OMIM: 114020) cadherin-2 isoform 2 [ ( 875) 5686 1097.0       0
XP_016881003 (OMIM: 114020) PREDICTED: cadherin-2  ( 848) 5573 1075.4       0
XP_011524090 (OMIM: 114020) PREDICTED: cadherin-2  ( 821) 5486 1058.7       0
NP_001239268 (OMIM: 603006) cadherin-4 isoform 3 [ ( 842) 3883 752.6 1.8e-216
NP_001239267 (OMIM: 603006) cadherin-4 isoform 2 [ ( 879) 3883 752.6 1.9e-216
NP_001785 (OMIM: 603006) cadherin-4 isoform 1 prep ( 916) 3883 752.6 1.9e-216
NP_004924 (OMIM: 114019,612580) cadherin-15 prepro ( 814) 2061 404.7 9.7e-112
NP_004351 (OMIM: 114480,137215,167000,176807,19209 ( 882) 1804 355.6 6.1e-97
XP_011521106 (OMIM: 601364) PREDICTED: cadherin-13 ( 612) 1692 334.1 1.3e-90
NP_001248 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 1 pre ( 713) 1685 332.8 3.6e-90
NP_001207417 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 2  ( 760) 1685 332.8 3.8e-90
NP_001207418 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 3  ( 674) 1588 314.3 1.3e-84
NP_001304125 (OMIM: 114021,225280,601553) cadherin ( 774) 1495 296.6 3.2e-79
NP_001304124 (OMIM: 114021,225280,601553) cadherin ( 784) 1495 296.6 3.2e-79
XP_011521102 (OMIM: 114021,225280,601553) PREDICTE ( 808) 1495 296.6 3.3e-79
NP_001784 (OMIM: 114021,225280,601553) cadherin-3  ( 829) 1495 296.6 3.4e-79
XP_005255818 (OMIM: 600023) PREDICTED: cadherin-11 ( 796) 1401 278.6 8.3e-74
XP_011521105 (OMIM: 600023) PREDICTED: cadherin-11 ( 796) 1401 278.6 8.3e-74
NP_001788 (OMIM: 600023) cadherin-11 isoform 1 pre ( 796) 1401 278.6 8.3e-74
XP_005255819 (OMIM: 600023) PREDICTED: cadherin-11 ( 796) 1401 278.6 8.3e-74
XP_005255820 (OMIM: 600023) PREDICTED: cadherin-11 ( 796) 1401 278.6 8.3e-74
NP_114097 (OMIM: 605807) cadherin-20 preproprotein ( 801) 1344 267.7 1.6e-70
NP_004940 (OMIM: 125645,610476) desmocollin-2 isof ( 847) 1344 267.7 1.7e-70
NP_077740 (OMIM: 125645,610476) desmocollin-2 isof ( 901) 1344 267.8 1.7e-70
NP_077741 (OMIM: 600271) desmocollin-3 isoform Dsc ( 839) 1340 267.0 2.8e-70
NP_001932 (OMIM: 600271) desmocollin-3 isoform Dsc ( 896) 1340 267.0 2.9e-70
NP_001207419 (OMIM: 601364) cadherin-13 isoform 4  ( 459) 1333 265.5 4.3e-70
NP_001317505 (OMIM: 600023) cadherin-11 isoform 3  ( 670) 1322 263.5 2.5e-69
NP_004939 (OMIM: 125643) desmocollin-1 isoform Dsc ( 840) 1300 259.3 5.6e-68
NP_077739 (OMIM: 125643) desmocollin-1 isoform Dsc ( 894) 1300 259.4 5.8e-68
XP_005258263 (OMIM: 125645,610476) PREDICTED: desm ( 758) 1298 258.9 6.7e-68
XP_011521103 (OMIM: 601120) PREDICTED: cadherin-5  ( 793) 1293 258.0 1.3e-67
NP_001934 (OMIM: 125671,610193,612877) desmoglein- (1118) 1177 235.9 8.3e-61
NP_004352 (OMIM: 605806) cadherin-7 isoform 1 prep ( 785) 1169 234.3 1.8e-60
NP_387450 (OMIM: 605806) cadherin-7 isoform 1 prep ( 785) 1169 234.3 1.8e-60
XP_016881012 (OMIM: 605806) PREDICTED: cadherin-7  ( 785) 1169 234.3 1.8e-60
XP_016878318 (OMIM: 603008) PREDICTED: cadherin-8  ( 621) 1153 231.2 1.2e-59
NP_001787 (OMIM: 603008) cadherin-8 preproprotein  ( 799) 1153 231.2 1.5e-59
XP_005255817 (OMIM: 603008) PREDICTED: cadherin-8  ( 711) 1151 230.8 1.8e-59
NP_004923 (OMIM: 603007) cadherin-6 preproprotein  ( 790) 1123 225.5 7.9e-58
XP_016864399 (OMIM: 603007) PREDICTED: cadherin-6  ( 790) 1123 225.5 7.9e-58
XP_011512223 (OMIM: 603007) PREDICTED: cadherin-6  ( 790) 1123 225.5 7.9e-58
XP_011512229 (OMIM: 600562) PREDICTED: cadherin-12 ( 794) 1123 225.5   8e-58
XP_016864410 (OMIM: 600562) PREDICTED: cadherin-12 ( 794) 1123 225.5   8e-58
NP_004052 (OMIM: 600562) cadherin-12 isoform 1 pre ( 794) 1123 225.5   8e-58
NP_001304156 (OMIM: 600562) cadherin-12 isoform 1  ( 794) 1123 225.5   8e-58
XP_016864409 (OMIM: 600562) PREDICTED: cadherin-12 ( 794) 1123 225.5   8e-58
NP_057363 (OMIM: 609974) cadherin-9 preproprotein  ( 789) 1108 222.6 5.8e-57
NP_001304157 (OMIM: 600562) cadherin-12 isoform 2  ( 754) 1106 222.3 7.2e-57


>>NP_001783 (OMIM: 114020) cadherin-2 isoform 1 prepropr  (906 aa)
 initn: 6041 init1: 6041 opt: 6041  Z-score: 6234.2  bits: 1164.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 6041; 100.0% identity (100.0% similar) in 906 aa overlap (1-906:1-906)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MCRIAGALRTLLPLLAALLQASVEASGEIALCKTGFPEDVYSAVLSKDVHEGQPLLNVKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MCRIAGALRTLLPLLAALLQASVEASGEIALCKTGFPEDVYSAVLSKDVHEGQPLLNVKF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 SNCNGKRKVQYESSEPADFKVDEDGMVYAVRSFPLSSEHAKFLIYAQDKETQEKWQVAVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SNCNGKRKVQYESSEPADFKVDEDGMVYAVRSFPLSSEHAKFLIYAQDKETQEKWQVAVK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 LSLKPTLTEESVKESAEVEEIVFPRQFSKHSGHLQRQKRDWVIPPINLPENSRGPFPQEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSLKPTLTEESVKESAEVEEIVFPRQFSKHSGHLQRQKRDWVIPPINLPENSRGPFPQEL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 VRIRSDRDKNLSLRYSVTGPGADQPPTGIFIINPISGQLSVTKPLDREQIARFHLRAHAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VRIRSDRDKNLSLRYSVTGPGADQPPTGIFIINPISGQLSVTKPLDREQIARFHLRAHAV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 DINGNQVENPIDIVINVIDMNDNRPEFLHQVWNGTVPEGSKPGTYVMTVTAIDADDPNAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DINGNQVENPIDIVINVIDMNDNRPEFLHQVWNGTVPEGSKPGTYVMTVTAIDADDPNAL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 NGMLRYRIVSQAPSTPSPNMFTINNETGDIITVAAGLDREKVQQYTLIIQATDMEGNPTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NGMLRYRIVSQAPSTPSPNMFTINNETGDIITVAAGLDREKVQQYTLIIQATDMEGNPTY
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 GLSNTATAVITVTDVNDNPPEFTAMTFYGEVPENRVDIIVANLTVTDKDQPHTPAWNAVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLSNTATAVITVTDVNDNPPEFTAMTFYGEVPENRVDIIVANLTVTDKDQPHTPAWNAVY
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 RISGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFETNRMFVLTVAAENQVPLAKGIQHPPQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RISGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFETNRMFVLTVAAENQVPLAKGIQHPPQS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 TATVSVTVIDVNENPYFAPNPKIIRQEEGLHAGTMLTTFTAQDPDRYMQQNIRYTKLSDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TATVSVTVIDVNENPYFAPNPKIIRQEEGLHAGTMLTTFTAQDPDRYMQQNIRYTKLSDP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 ANWLKIDPVNGQITTIAVLDRESPNVKNNIYNATFLASDNGIPPMSGTGTLQIYLLDIND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ANWLKIDPVNGQITTIAVLDRESPNVKNNIYNATFLASDNGIPPMSGTGTLQIYLLDIND
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 NAPQVLPQEAETCETPDPNSINITALDYDIDPNAGPFAFDLPLSPVTIKRNWTITRLNGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NAPQVLPQEAETCETPDPNSINITALDYDIDPNAGPFAFDLPLSPVTIKRNWTITRLNGD
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 FAQLNLKIKFLEAGIYEVPIIITDSGNPPKSNISILRVKVCQCDSNGDCTDVDRIVGAGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FAQLNLKIKFLEAGIYEVPIIITDSGNPPKSNISILRVKVCQCDSNGDCTDVDRIVGAGL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB4 GTGAIIAILLCIIILLILVLMFVVWMKRRDKERQAKQLLIDPEDDVRDNILKYDEEGGGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GTGAIIAILLCIIILLILVLMFVVWMKRRDKERQAKQLLIDPEDDVRDNILKYDEEGGGE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB4 EDQDYDLSQLQQPDTVEPDAIKPVGIRRMDERPIHAEPQYPVRSAAPHPGDIGDFINEGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EDQDYDLSQLQQPDTVEPDAIKPVGIRRMDERPIHAEPQYPVRSAAPHPGDIGDFINEGL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB4 KAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSLSSLNSSSSGGEQDYDYLNDWGPRFKKLADM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSLSSLNSSSSGGEQDYDYLNDWGPRFKKLADM
              850       860       870       880       890       900

             
pF1KB4 YGGGDD
       ::::::
NP_001 YGGGDD
             

>>NP_001295105 (OMIM: 114020) cadherin-2 isoform 2 [Homo  (875 aa)
 initn: 5685 init1: 5685 opt: 5686  Z-score: 5868.0  bits: 1097.0 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5686; 99.1% identity (99.4% similar) in 860 aa overlap (47-906:16-875)

         20        30        40        50        60        70      
pF1KB4 ALLQASVEASGEIALCKTGFPEDVYSAVLSKDVHEGQPLLNVKFSNCNGKRKVQYESSEP
                                     :.  :   .:.:::::::::::::::::::
NP_001                MFLLRRYVCIFTEKLKNQAELYVFLSVKFSNCNGKRKVQYESSEP
                              10        20        30        40     

         80        90       100       110       120       130      
pF1KB4 ADFKVDEDGMVYAVRSFPLSSEHAKFLIYAQDKETQEKWQVAVKLSLKPTLTEESVKESA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ADFKVDEDGMVYAVRSFPLSSEHAKFLIYAQDKETQEKWQVAVKLSLKPTLTEESVKESA
          50        60        70        80        90       100     

        140       150       160       170       180       190      
pF1KB4 EVEEIVFPRQFSKHSGHLQRQKRDWVIPPINLPENSRGPFPQELVRIRSDRDKNLSLRYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVEEIVFPRQFSKHSGHLQRQKRDWVIPPINLPENSRGPFPQELVRIRSDRDKNLSLRYS
         110       120       130       140       150       160     

        200       210       220       230       240       250      
pF1KB4 VTGPGADQPPTGIFIINPISGQLSVTKPLDREQIARFHLRAHAVDINGNQVENPIDIVIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VTGPGADQPPTGIFIINPISGQLSVTKPLDREQIARFHLRAHAVDINGNQVENPIDIVIN
         170       180       190       200       210       220     

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_001 VFDYEGSGSTAGSLSSLNSSSSGGEQDYDYLNDWGPRFKKLADMYGGGDD
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>>XP_016881003 (OMIM: 114020) PREDICTED: cadherin-2 isof  (848 aa)
 initn: 5573 init1: 5573 opt: 5573  Z-score: 5751.6  bits: 1075.4 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5573; 100.0% identity (100.0% similar) in 838 aa overlap (1-838:1-838)

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_016 FAQLNLKIKFLEAGIYEVPIIITDSGNPPKSNISILRVKVCQCDSNGDCTDVDRIVGAGL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GTGAIIAILLCIIILLILVLMFVVWMKRRDKERQAKQLLIDPEDDVRDNILKYDEEGGGE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::  
XP_016 EDQDYDLSQLQQPDTVEPDAIKPVGIRRMDERPIHAEPQYPVRSAAPHPGDIGDFINEKT
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>>XP_011524090 (OMIM: 114020) PREDICTED: cadherin-2 isof  (821 aa)
 initn: 5486 init1: 5486 opt: 5486  Z-score: 5662.0  bits: 1058.7 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5486; 100.0% identity (100.0% similar) in 821 aa overlap (86-906:1-821)

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XP_011                               MVYAVRSFPLSSEHAKFLIYAQDKETQEKW
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       :::::::::::
XP_011 KLADMYGGGDD
              820 

>>NP_001239268 (OMIM: 603006) cadherin-4 isoform 3 [Homo  (842 aa)
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NP_001 DSQTAEKWDAVVRLLVAQTSSPHSGHKPQKGKKVVALDPSPPPKDTLLPWPQHQNANGLR
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pF1KB4 RQKRDWVIPPINLPENSRGPFPQELVRIRSDRDKNLSLRYSVTGPGADQPPTGIFIINPI
       :.::::::::::.::::::::::.:::::::.:... .:::.:: ::::::  .: :. .
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NP_001 VDEGSKPGTYVMTVTANDADDSTTANGMVRYRIVTQTPQSPSQNMFTINSETGDIVTVAA
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       :. .:::::: :.::::.: ::::::: .:::.:.:...::: .:.:.::::: .:.: :
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pF1KB4 RMFVLTVAAENQVPLAKGIQHPPQSTATVSVTVIDVNENPYFAPNPKIIRQEEGLHAGTM
       : :.::: . ::.:::.:::   :::: :.....:.:: :::  : :.:: :::.  ::.
NP_001 RAFMLTVMVSNQAPLASGIQMSFQSTAGVTISIMDINEAPYFPSNHKLIRLEEGVPPGTV
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       ::::.: ::::.::: .::.::::::.::.:. .:::::: :::::::  .:::.:.:::
NP_001 LTTFSAVDPDRFMQQAVRYSKLSDPASWLHINATNGQITTAAVLDRESLYTKNNVYEATF
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pF1KB4 LASDNGIPPMSGTGTLQIYLLDINDNAPQVLPQEAETCETPDPNSINITALDYDIDPNAG
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NP_001 LAADNGIPPASGTGTLQIYLIDINDNAPELLPKEAQICEKPNLNAINITAADADVDPNIG
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pF1KB4 PFAFDLPLSPVTIKRNWTITRLNGDFAQLNLKIKFLEAGIYEVPIIITDSGNPPKSNISI
       :..:.::. :.....::::::::::.:::.:.: .::::.:.::::.::::::: :: ::
NP_001 PYVFELPFVPAAVRKNWTITRLNGDYAQLSLRILYLEAGMYDVPIIVTDSGNPPLSNTSI
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       ..:::: ::.::::: .  ...::::::::.:::.::.::: .::.::.:::::.:::..
NP_001 IKVKVCPCDDNGDCTTIGAVAAAGLGTGAIVAILICILILLTMVLLFVMWMKRREKERHT
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pF1KB4 KQLLIDPEDDVRDNILKYDEEGGGEEDQDYDLSQLQQPDTVEPDAIKPVGIRRMDERPIH
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NP_001 KQLLIDPEDDVRDNILKYDEEGGGEEDQDYDLSQLQQPEAMGHVPSKAPGVRRVDERPVG
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pF1KB4 AEPQYPVRSAAPHPGDIGDFINEGLKAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSLSSLNS
       ::::::.:  .::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::::
NP_001 AEPQYPIRPMVPHPGDIGDFINEGLRAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSVSSLNS
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pF1KB4 SSSGGEQDYDYLNDWGPRFKKLADMYGGGDD 
       :::: .:::::::::::::::::::::::.. 
NP_001 SSSG-DQDYDYLNDWGPRFKKLADMYGGGEED
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>>NP_001239267 (OMIM: 603006) cadherin-4 isoform 2 [Homo  (879 aa)
 initn: 4028 init1: 3709 opt: 3883  Z-score: 4007.1  bits: 752.6 E(85289): 1.9e-216
Smith-Waterman score: 4044; 67.5% identity (86.5% similar) in 861 aa overlap (58-906:20-878)

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NP_001            MNGSCDFILSASFLPCFKEVKFSSCVGTKGTQYETNS-MDFKVGADGTV
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pF1KB4 YAVRSFPLSSEHAKFLIYAQDKETQEKWQVAVKLSLKPTLTEESVKESAEVEEIV-----
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NP_001 FATRELQVPSEQVAFTVTAWDSQTAEKWDAVVRLLVAQTSSPHSGHKPQKGKKVVALDPS
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pF1KB4 -------FPRQFSKHSGHLQRQKRDWVIPPINLPENSRGPFPQELVRIRSDRDKNLSLRY
              .:    .... :.:.::::::::::.::::::::::.:::::::.:... .::
NP_001 PPPKDTLLPWPQHQNANGLRRRKRDWVIPPINVPENSRGPFPQQLVRIRSDKDNDIPIRY
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pF1KB4 SVTGPGADQPPTGIFIINPISGQLSVTKPLDREQIARFHLRAHAVDINGNQVENPIDIVI
       :.:: ::::::  .: :. .::.. ::.:.:::. : .::::::::.:::.::::::. :
NP_001 SITGVGADQPPMEVFSIDSMSGRMYVTRPMDREEHASYHLRAHAVDMNGNKVENPIDLYI
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pF1KB4 NVIDMNDNRPEFLHQVWNGTVPEGSKPGTYVMTVTAIDADDPNALNGMLRYRIVSQAPST
        :::::::::::..::.::.: :::::::::::::: :::: .. :::.:::::.:.:..
NP_001 YVIDMNDNRPEFINQVYNGSVDEGSKPGTYVMTVTANDADDSTTANGMVRYRIVTQTPQS
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pF1KB4 PSPNMFTINNETGDIITVAAGLDREKVQQYTLIIQATDMEGNPTYGLSNTATAVITVTDV
       :: ::::::.:::::.:::::::::::::::.:.:::::::: .:::::::::.::::::
NP_001 PSQNMFTINSETGDIVTVAAGLDREKVQQYTVIVQATDMEGNLNYGLSNTATAIITVTDV
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pF1KB4 NDNPPEFTAMTFYGEVPENRVDIIVANLTVTDKDQPHTPAWNAVYRISGGDPTGRFAIQT
       ::::::::: :: ::::::::. .:::::: :.::::.: ::::::: .:::.:.:...:
NP_001 NDNPPEFTASTFAGEVPENRVETVVANLTVMDRDQPHSPNWNAVYRIISGDPSGHFSVRT
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pF1KB4 DPNSNDGLVTVVKPIDFETNRMFVLTVAAENQVPLAKGIQHPPQSTATVSVTVIDVNENP
       :: .:.:.::::: .:.: :: :.::: . ::.:::.:::   :::: :.....:.:: :
NP_001 DPVTNEGMVTVVKAVDYELNRAFMLTVMVSNQAPLASGIQMSFQSTAGVTISIMDINEAP
      410       420       430       440       450       460        

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pF1KB4 YFAPNPKIIRQEEGLHAGTMLTTFTAQDPDRYMQQNIRYTKLSDPANWLKIDPVNGQITT
       ::  : :.:: :::.  ::.::::.: ::::.::: .::.::::::.::.:. .::::::
NP_001 YFPSNHKLIRLEEGVPPGTVLTTFSAVDPDRFMQQAVRYSKLSDPASWLHINATNGQITT
      470       480       490       500       510       520        

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pF1KB4 IAVLDRESPNVKNNIYNATFLASDNGIPPMSGTGTLQIYLLDINDNAPQVLPQEAETCET
        :::::::  .:::.:.:::::.:::::: ::::::::::.:::::::..::.::. :: 
NP_001 AAVLDRESLYTKNNVYEATFLAADNGIPPASGTGTLQIYLIDINDNAPELLPKEAQICEK
      530       540       550       560       570       580        

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pF1KB4 PDPNSINITALDYDIDPNAGPFAFDLPLSPVTIKRNWTITRLNGDFAQLNLKIKFLEAGI
       :. :.::::: : :.::: ::..:.::. :.....::::::::::.:::.:.: .::::.
NP_001 PNLNAINITAADADVDPNIGPYVFELPFVPAAVRKNWTITRLNGDYAQLSLRILYLEAGM
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pF1KB4 DQPHTPAWNAVYRISGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFETNRMFVLTVAAENQV
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pF1KB4 GTLQIYLLDINDNAPQVLPQEAETCETPDPNSINITALDYDIDPNAGPFAFDLPLSPVTI
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NP_001 CTTIGAVAAAGLGTGAIVAILICILILLTMVLLFVMWMKRREKERHTKQLLIDPEDDVRD
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pF1KB4 NILKYDEEGGGEEDQDYDLSQLQQPDTVEPDAIKPVGIRRMDERPIHAEPQYPVRSAAPH
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pF1KB4 PGDIGDFINEGLKAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSLSSLNSSSSGGEQDYDYLN
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NP_001 PGDIGDFINEGLRAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSVSSLNSSSSG-DQDYDYLN
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NP_001 DWGPRFKKLADMYGGGEED
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NP_004 GGSTLEDPTDLEIVVVDQNDNRPAFLQEAFTGRVLEGAVPGTYVTRAEATDADDPETDNA
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pF1KB4 MLRYRIVSQAPSTPSPNMFTINNETGDIITVAAGLDREKVQQYTLIIQATDMEGNPTYGL
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NP_004 ALRFSILQQG----SPELFSIDELTGEIRTVQVGLDREVVAVYNLTLQVADMSGD---GL
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pF1KB4 SNTATAVITVTDVNDNPPEFTAMTFYGEVPENRVDIIVANLTVTDKDQPHTPAWNAVYRI
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NP_004 TATASAIITLDDINDNAPEFTRDEFFMEAIEAVSGVDVGRLEVEDRDLPGSPNWVARFTI
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NP_004 LEGDPDGQFTIRTDPKTNEGVLSIVKALDYESCEHYELKVSVQNEAPLQAAALRAERGQA
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NP_004 WLQVDAATGRIQTQHVLSPASPFLKGGWYRAIVLAQDDASQPRTATGTLSIEILEVNDHA
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pF1KB4 PQVLPQEAET-CETPDPN-SINITALDYDIDPNAGPFAFDL-PLSPVTIKRNWTITRLNG
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NP_004 PVLAPPPPGSLCSEPHQGPGLLLGATDEDLPPHGAPFHFQLSPRLP-ELGRNWSLSQVNV
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pF1KB4 DFAQLNLKIKFLEAGIYEVPIIITDSGNPPKSNISILRVKVCQCDSNGDCTDVDRIV---
       . :.:  . .  : :.... ... :::.::..  . : : ::.: ..: :      .   
NP_004 SHARLRPRHQVPE-GLHRLSLLLRDSGQPPQQREQPLNVTVCRCGKDGVCLPGAAALLAG
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pF1KB4 GAGLGTGAIIAILLCIIILLILVLMFVVWMKRRDKERQAKQLLIDPEDDVRDNILKYDEE
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NP_004 GTGLSLGALVIVLASALLLLVLVLL-VALRARFWKQSRGKGLLHGPQDDLRDNVLNYDEQ
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pF1KB4 GGGEEDQD-YDLSQLQQPDTVEPDAIKPVGIRRMDERPIHAEPQYPVRSAAPHPGDIGDF
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NP_004 VYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLDARPE------VTRNDVAPTLMSVPRYLPRPA--N
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906 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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 start: Thu Nov  3 15:24:53 2016 done: Thu Nov  3 15:24:55 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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