Result of FASTA (omim) for pF1KB4431
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4431, 890 aa
  1>>>pF1KB4431 890 - 890 aa - 890 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6523+/-0.000497; mu= -1.9737+/- 0.031
 mean_var=722.3507+/-163.813, 0's: 0 Z-trim(119.6): 791  B-trim: 0 in 0/59
 Lambda= 0.047720
 statistics sampled from 32920 (33803) to 32920 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.711), E-opt: 0.2 (0.396), width:  16
 Scan time: 15.470

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_006284 (OMIM: 600341) tyrosine-protein kinase r ( 890) 6031 432.1 5.6e-120
NP_001317193 (OMIM: 600341) tyrosine-protein kinas ( 845) 5735 411.7 7.4e-114
XP_016878032 (OMIM: 600341) PREDICTED: tyrosine-pr ( 771) 5141 370.8 1.4e-101
NP_001690 (OMIM: 109135) tyrosine-protein kinase r ( 885) 2244 171.4 1.7e-41
NP_001265528 (OMIM: 109135) tyrosine-protein kinas ( 626) 1822 142.1 7.9e-33
NP_068713 (OMIM: 109135) tyrosine-protein kinase r ( 894) 1822 142.4 9.5e-33
XP_011508792 (OMIM: 604705,613862) PREDICTED: tyro ( 936) 1632 129.3 8.4e-29
XP_016858653 (OMIM: 604705,613862) PREDICTED: tyro ( 936) 1632 129.3 8.4e-29
NP_006334 (OMIM: 604705,613862) tyrosine-protein k ( 999) 1632 129.4 8.7e-29
XP_016858654 (OMIM: 604705,613862) PREDICTED: tyro ( 594) 1544 122.9 4.5e-27
XP_005263622 (OMIM: 604705,613862) PREDICTED: tyro ( 832) 1468 117.9   2e-25
XP_005263625 (OMIM: 604705,613862) PREDICTED: tyro ( 733)  949 82.1 1.1e-14
XP_011534355 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2299)  787 71.8 4.3e-11
XP_016866662 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2333)  787 71.8 4.4e-11
XP_016866661 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2334)  787 71.8 4.4e-11
XP_006715611 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2342)  787 71.8 4.4e-11
XP_011534354 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2343)  787 71.8 4.4e-11
NP_002935 (OMIM: 165020) proto-oncogene tyrosine-p (2347)  787 71.8 4.4e-11
XP_011534353 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2348)  787 71.8 4.4e-11
XP_011534352 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2356)  787 71.8 4.4e-11
XP_011534351 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2357)  787 71.8 4.4e-11
XP_006710932 (OMIM: 600222) PREDICTED: tyrosine-pr ( 783)  773 70.0 4.9e-11
NP_001240286 (OMIM: 600222) tyrosine-protein kinas (1093)  773 70.3 5.8e-11
XP_005271220 (OMIM: 600222) PREDICTED: tyrosine-pr (1095)  773 70.3 5.8e-11
NP_005415 (OMIM: 600222) tyrosine-protein kinase r (1138)  773 70.3 5.9e-11
XP_011519819 (OMIM: 147370,270450) PREDICTED: insu ( 922)  755 68.9 1.3e-10
XP_011519818 (OMIM: 147370,270450) PREDICTED: insu (1064)  755 69.0 1.3e-10
XP_016877628 (OMIM: 147370,270450) PREDICTED: insu (1246)  755 69.1 1.5e-10
NP_001278787 (OMIM: 147370,270450) insulin-like gr (1366)  755 69.2 1.5e-10
NP_000866 (OMIM: 147370,270450) insulin-like growt (1367)  755 69.2 1.5e-10
XP_016877627 (OMIM: 147370,270450) PREDICTED: insu (1391)  755 69.2 1.5e-10
XP_016877625 (OMIM: 147370,270450) PREDICTED: insu (1392)  755 69.2 1.5e-10
XP_016877626 (OMIM: 147370,270450) PREDICTED: insu (1392)  755 69.2 1.5e-10
XP_011526291 (OMIM: 147670,246200,262190,609968,61 (1369)  748 68.7 2.1e-10
NP_001073285 (OMIM: 147670,246200,262190,609968,61 (1370)  748 68.7 2.1e-10
XP_011526290 (OMIM: 147670,246200,262190,609968,61 (1381)  748 68.7 2.1e-10
NP_000199 (OMIM: 147670,246200,262190,609968,61054 (1382)  748 68.7 2.1e-10
NP_001311331 (OMIM: 114550,164860,605074,607278,61 ( 960)  714 66.1   9e-10
XP_006716053 (OMIM: 114550,164860,605074,607278,61 ( 960)  714 66.1   9e-10
NP_000236 (OMIM: 114550,164860,605074,607278,61670 (1390)  714 66.4 1.1e-09
NP_001120972 (OMIM: 114550,164860,605074,607278,61 (1408)  714 66.4 1.1e-09
XP_011514525 (OMIM: 114550,164860,605074,607278,61 (1409)  714 66.4 1.1e-09
NP_001305842 (OMIM: 600168,617075) macrophage-stim (1294)  704 65.7 1.7e-09
XP_011532046 (OMIM: 600168,617075) PREDICTED: macr (1295)  704 65.7 1.7e-09
XP_011532043 (OMIM: 600168,617075) PREDICTED: macr (1332)  704 65.7 1.7e-09
NP_001231866 (OMIM: 600168,617075) macrophage-stim (1351)  704 65.7 1.7e-09
XP_011532042 (OMIM: 600168,617075) PREDICTED: macr (1352)  704 65.7 1.7e-09
XP_011532041 (OMIM: 600168,617075) PREDICTED: macr (1361)  704 65.7 1.7e-09
NP_002438 (OMIM: 600168,617075) macrophage-stimula (1400)  704 65.7 1.8e-09
XP_005265227 (OMIM: 600168,617075) PREDICTED: macr (1401)  704 65.7 1.8e-09


>>NP_006284 (OMIM: 600341) tyrosine-protein kinase recep  (890 aa)
 initn: 6031 init1: 6031 opt: 6031  Z-score: 2275.0  bits: 432.1 E(85289): 5.6e-120
Smith-Waterman score: 6031; 99.9% identity (99.9% similar) in 890 aa overlap (1-890:1-890)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MALRRSMGRPGLPPLPLPPPPRLGLLLAALASLLLPESAAAGLKLMGAPVKLTVSQGQPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MALRRSMGRPGLPPLPLPPPPRLGLLLAALASLLLPESAAAGLKLMGAPVKLTVSQGQPV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 KLNCSVEGMEEPDIQWVKDGAVVQNLDQLYIPVSEQHWIGFLSLKSVERSDAGRYWCQVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 KLNCSVEGMEEPDIQWVKDGAVVQNLDQLYIPVSEQHWIGFLSLKSVERSDAGRYWCQVE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 DGGETEISQPVWLTVEGVPFFTVEPKDLAVPPNAPFQLSCEAVGPPEPVTIVWWRGTTKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 DGGETEISQPVWLTVEGVPFFTVEPKDLAVPPNAPFQLSCEAVGPPEPVTIVWWRGTTKI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 GGPAPSPSVLNVTGVTQSTMFSCEAHNLKGLASSRTATVHLQALPAAPFNITVTKLSSSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GGPAPSPSVLNVTGVTQSTMFSCEAHNLKGLASSRTATVHLQALPAAPFNITVTKLSSSN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 ASVAWMPGADGRALLQSCTVQVTQAPGGWEVLAVVVPVPPFTCLLRDLVPATNYSLRVRC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ASVAWMPGADGRALLQSCTVQVTQAPGGWEVLAVVVPVPPFTCLLRDLVPATNYSLRVRC
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 ANALGPSPYADWVPFQTKGLAPASAPQNLHAIRTDSGLILEWEEVNPEAPLEGPLGPYKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
NP_006 ANALGPSPYADWVPFQTKGLAPASAPQNLHAIRTDSGLILEWEEVIPEAPLEGPLGPYKL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 SWVQDNGTQDELTVEGTRANLTGWDPQKDLIVRVCVSNAVGCGPWSQPLVVSSHDRAGQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SWVQDNGTQDELTVEGTRANLTGWDPQKDLIVRVCVSNAVGCGPWSQPLVVSSHDRAGQQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 GPPHSRTSWVPVVLGVLTALVTAAALALILLRKRRKETRFGQAFDSVMARGEPAVHFRAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GPPHSRTSWVPVVLGVLTALVTAAALALILLRKRRKETRFGQAFDSVMARGEPAVHFRAA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 RSFNRERPERIEATLDSLGISDELKEKLEDVLIPEQQFTLGRMLGKGEFGSVREAQLKQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 RSFNRERPERIEATLDSLGISDELKEKLEDVLIPEQQFTLGRMLGKGEFGSVREAQLKQE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 DGSFVKVAVKMLKADIIASSDIEEFLREAACMKEFDHPHVAKLVGVSLRSRAKGRLPIPM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 DGSFVKVAVKMLKADIIASSDIEEFLREAACMKEFDHPHVAKLVGVSLRSRAKGRLPIPM
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 VILPFMKHGDLHAFLLASRIGENPFNLPLQTLIRFMVDIACGMEYLSSRNFIHRDLAARN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VILPFMKHGDLHAFLLASRIGENPFNLPLQTLIRFMVDIACGMEYLSSRNFIHRDLAARN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 CMLAEDMTVCVADFGLSRKIYSGDYYRQGCASKLPVKWLALESLADNLYTVQSDVWAFGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 CMLAEDMTVCVADFGLSRKIYSGDYYRQGCASKLPVKWLALESLADNLYTVQSDVWAFGV
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB4 TMWEIMTRGQTPYAGIENAEIYNYLIGGNRLKQPPECMEDVYDLMYQCWSADPKQRPSFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TMWEIMTRGQTPYAGIENAEIYNYLIGGNRLKQPPECMEDVYDLMYQCWSADPKQRPSFT
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB4 CLRMELENILGQLSVLSASQDPLYINIERAEEPTAGGSLELPGRDQPYSGAGDGSGMGAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 CLRMELENILGQLSVLSASQDPLYINIERAEEPTAGGSLELPGRDQPYSGAGDGSGMGAV
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890
pF1KB4 GGTPSDCRYILTPGGLAEQPGQAEHQPESPLNETQRLLLLQQGLLPHSSC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GGTPSDCRYILTPGGLAEQPGQAEHQPESPLNETQRLLLLQQGLLPHSSC
              850       860       870       880       890

>>NP_001317193 (OMIM: 600341) tyrosine-protein kinase re  (845 aa)
 initn: 5735 init1: 5735 opt: 5735  Z-score: 2165.1  bits: 411.7 E(85289): 7.4e-114
Smith-Waterman score: 5735; 99.9% identity (99.9% similar) in 845 aa overlap (46-890:1-845)

          20        30        40        50        60        70     
pF1KB4 PLPPPPRLGLLLAALASLLLPESAAAGLKLMGAPVKLTVSQGQPVKLNCSVEGMEEPDIQ
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001                               MGAPVKLTVSQGQPVKLNCSVEGMEEPDIQ
                                             10        20        30

          80        90       100       110       120       130     
pF1KB4 WVKDGAVVQNLDQLYIPVSEQHWIGFLSLKSVERSDAGRYWCQVEDGGETEISQPVWLTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WVKDGAVVQNLDQLYIPVSEQHWIGFLSLKSVERSDAGRYWCQVEDGGETEISQPVWLTV
               40        50        60        70        80        90

         140       150       160       170       180       190     
pF1KB4 EGVPFFTVEPKDLAVPPNAPFQLSCEAVGPPEPVTIVWWRGTTKIGGPAPSPSVLNVTGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EGVPFFTVEPKDLAVPPNAPFQLSCEAVGPPEPVTIVWWRGTTKIGGPAPSPSVLNVTGV
              100       110       120       130       140       150

         200       210       220       230       240       250     
pF1KB4 TQSTMFSCEAHNLKGLASSRTATVHLQALPAAPFNITVTKLSSSNASVAWMPGADGRALL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TQSTMFSCEAHNLKGLASSRTATVHLQALPAAPFNITVTKLSSSNASVAWMPGADGRALL
              160       170       180       190       200       210

         260       270       280       290       300       310     
pF1KB4 QSCTVQVTQAPGGWEVLAVVVPVPPFTCLLRDLVPATNYSLRVRCANALGPSPYADWVPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSCTVQVTQAPGGWEVLAVVVPVPPFTCLLRDLVPATNYSLRVRCANALGPSPYADWVPF
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         320       330       340       350       360       370     
pF1KB4 QTKGLAPASAPQNLHAIRTDSGLILEWEEVNPEAPLEGPLGPYKLSWVQDNGTQDELTVE
       :::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QTKGLAPASAPQNLHAIRTDSGLILEWEEVIPEAPLEGPLGPYKLSWVQDNGTQDELTVE
              280       290       300       310       320       330

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pF1KB4 GTRANLTGWDPQKDLIVRVCVSNAVGCGPWSQPLVVSSHDRAGQQGPPHSRTSWVPVVLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GTRANLTGWDPQKDLIVRVCVSNAVGCGPWSQPLVVSSHDRAGQQGPPHSRTSWVPVVLG
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pF1KB4 VLTALVTAAALALILLRKRRKETRFGQAFDSVMARGEPAVHFRAARSFNRERPERIEATL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLTALVTAAALALILLRKRRKETRFGQAFDSVMARGEPAVHFRAARSFNRERPERIEATL
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pF1KB4 DSLGISDELKEKLEDVLIPEQQFTLGRMLGKGEFGSVREAQLKQEDGSFVKVAVKMLKAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DSLGISDELKEKLEDVLIPEQQFTLGRMLGKGEFGSVREAQLKQEDGSFVKVAVKMLKAD
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pF1KB4 IIASSDIEEFLREAACMKEFDHPHVAKLVGVSLRSRAKGRLPIPMVILPFMKHGDLHAFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IIASSDIEEFLREAACMKEFDHPHVAKLVGVSLRSRAKGRLPIPMVILPFMKHGDLHAFL
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pF1KB4 LASRIGENPFNLPLQTLIRFMVDIACGMEYLSSRNFIHRDLAARNCMLAEDMTVCVADFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LASRIGENPFNLPLQTLIRFMVDIACGMEYLSSRNFIHRDLAARNCMLAEDMTVCVADFG
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pF1KB4 LSRKIYSGDYYRQGCASKLPVKWLALESLADNLYTVQSDVWAFGVTMWEIMTRGQTPYAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSRKIYSGDYYRQGCASKLPVKWLALESLADNLYTVQSDVWAFGVTMWEIMTRGQTPYAG
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pF1KB4 IENAEIYNYLIGGNRLKQPPECMEDVYDLMYQCWSADPKQRPSFTCLRMELENILGQLSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IENAEIYNYLIGGNRLKQPPECMEDVYDLMYQCWSADPKQRPSFTCLRMELENILGQLSV
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pF1KB4 LSASQDPLYINIERAEEPTAGGSLELPGRDQPYSGAGDGSGMGAVGGTPSDCRYILTPGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSASQDPLYINIERAEEPTAGGSLELPGRDQPYSGAGDGSGMGAVGGTPSDCRYILTPGG
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pF1KB4 LAEQPGQAEHQPESPLNETQRLLLLQQGLLPHSSC
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAEQPGQAEHQPESPLNETQRLLLLQQGLLPHSSC
              820       830       840     

>>XP_016878032 (OMIM: 600341) PREDICTED: tyrosine-protei  (771 aa)
 initn: 5136 init1: 5136 opt: 5141  Z-score: 1944.4  bits: 370.8 E(85289): 1.4e-101
Smith-Waterman score: 5141; 98.8% identity (99.1% similar) in 774 aa overlap (1-773:1-770)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MALRRSMGRPGLPPLPLPPPPRLGLLLAALASLLLPESAAAGLKLMGAPVKLTVSQGQPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MALRRSMGRPGLPPLPLPPPPRLGLLLAALASLLLPESAAAGLKLMGAPVKLTVSQGQPV
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               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 KLNCSVEGMEEPDIQWVKDGAVVQNLDQLYIPVSEQHWIGFLSLKSVERSDAGRYWCQVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KLNCSVEGMEEPDIQWVKDGAVVQNLDQLYIPVSEQHWIGFLSLKSVERSDAGRYWCQVE
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pF1KB4 DGGETEISQPVWLTVEGVPFFTVEPKDLAVPPNAPFQLSCEAVGPPEPVTIVWWRGTTKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DGGETEISQPVWLTVEGVPFFTVEPKDLAVPPNAPFQLSCEAVGPPEPVTIVWWRGTTKI
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pF1KB4 GGPAPSPSVLNVTGVTQSTMFSCEAHNLKGLASSRTATVHLQALPAAPFNITVTKLSSSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GGPAPSPSVLNVTGVTQSTMFSCEAHNLKGLASSRTATVHLQALPAAPFNITVTKLSSSN
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pF1KB4 ASVAWMPGADGRALLQSCTVQVTQAPGGWEVLAVVVPVPPFTCLLRDLVPATNYSLRVRC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASVAWMPGADGRALLQSCTVQVTQAPGGWEVLAVVVPVPPFTCLLRDLVPATNYSLRVRC
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pF1KB4 ANALGPSPYADWVPFQTKGLAPASAPQNLHAIRTDSGLILEWEEVNPEAPLEGPLGPYKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
XP_016 ANALGPSPYADWVPFQTKGLAPASAPQNLHAIRTDSGLILEWEEVIPEAPLEGPLGPYKL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SWVQDNGTQDELTVEGTRANLTGWDPQKDLIVRVCVSNAVGCGPWSQPLVVSSHDRAGQQ
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pF1KB4 GPPHSRTSWVPVVLGVLTALVTAAALALILLRKRRKETRFGQAFDSVMARGEPAVHFRAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GPPHSRTSWVPVVLGVLTALVTAAALALILLRKRRKETRFGQAFDSVMARGEPAVHFRAA
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pF1KB4 RSFNRERPERIEATLDSLGISDELKEKLEDVLIPEQQFTLGRMLGKGEFGSVREAQLKQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RSFNRERPERIEATLDSLGISDELKEKLEDVLIPEQQFTLGRMLGKGEFGSVREAQLKQE
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pF1KB4 DGSFVKVAVKMLKADIIASSDIEEFLREAACMKEFDHPHVAKLVGVSLRSRAKGRLPIPM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DGSFVKVAVKMLKADIIASSDIEEFLREAACMKEFDHPHVAKLVGVSLRSRAKGRLPIPM
              550       560       570       580       590       600

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pF1KB4 VILPFMKHGDLHAFLLASRIGENPFNLPLQTLIRFMVDIACGMEYLSSRNFIHRDLAARN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VILPFMKHGDLHAFLLASRIGENPFNLPLQTLIRFMVDIACGMEYLSSRNFIHRDLAARN
              610       620       630       640       650       660

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pF1KB4 CMLAEDMTVCVADFGLSRKIYSGDYYRQGCASKLPVKWLALESLADNLYTVQSDVWAFGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CMLAEDMTVCVADFGLSRKIYSGDYYRQGCASKLPVKWLALESLADNLYTVQSDVWAFGV
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pF1KB4 TMWEIMTRGQTPYAGIENAEIYNYLIGGNRLKQPPECMEDV-YDLMYQCWSADPKQRPSF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.:   :  .::      
XP_016 TMWEIMTRGQTPYAGIENAEIYNYLIGGNRLKQPPECMEDVEYNL---C-PGDPS     
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pF1KB4 TCLRMELENILGQLSVLSASQDPLYINIERAEEPTAGGSLELPGRDQPYSGAGDGSGMGA

>>NP_001690 (OMIM: 109135) tyrosine-protein kinase recep  (885 aa)
 initn: 1847 init1: 1194 opt: 2244  Z-score: 866.0  bits: 171.4 E(85289): 1.7e-41
Smith-Waterman score: 2335; 43.2% identity (69.2% similar) in 892 aa overlap (21-873:6-882)

               10        20               30        40        50   
pF1KB4 MALRRSMGRPGLPPLPLPPPPRLG-------LLLAALASLLLPESAAAGLKLMGAPVKLT
                           ::.:       : : . : .    . :    ..: : ..:
NP_001                MAWRCPRMGRVPLAWCLALCGWACMAPRGTQAEESPFVGNPGNIT
                              10        20        30        40     

            60          70        80          90            100    
pF1KB4 VSQGQPVKLNCS--VEGMEEPDIQWVKDGAVVQNLD--QLYIPVSEQH---WI--GFLSL
        ..:    : :.  :.: : :...:..:: ...  :  :  .:..:..   ::  . : .
NP_001 GARGLTGTLRCQLQVQG-EPPEVHWLRDGQILELADSTQTQVPLGEDEQDDWIVVSQLRI
          50        60         70        80        90       100    

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pF1KB4 KSVERSDAGRYWCQVEDGGETEISQPVWLTVEGVPFFTVEPKDLAVPPNAPFQLSCEAVG
        :.. ::.:.: : :  : .: .::: .. .::.:.:  ::.: .:  :.::.:::.: :
NP_001 TSLQLSDTGQYQCLVFLGHQTFVSQPGYVGLEGLPYFLEEPEDRTVAANTPFNLSCQAQG
          110       120       130       140       150       160    

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pF1KB4 PPEPVTIVWWRGTTKIG-GPAPSPS-VLNVTGVTQSTMFSCEAHNLKGLASSRTATVHLQ
       ::::: ..: . .. .. .:. .:.  :.: :..... ::::::: ::...:::::.   
NP_001 PPEPVDLLWLQDAVPLATAPGHGPQRSLHVPGLNKTSSFSCEAHNAKGVTTSRTATI--T
          170       180       190       200       210       220    

            230       240       250       260                  270 
pF1KB4 ALPAAPFNITVTKLSSSNASVAWMPGADGRALLQSCTVQVTQAPGGW-----------EV
       .::  : :. ... . ..  ::: :: .:   :  ::.:.. .  :            : 
NP_001 VLPQQPRNLHLVSRQPTELEVAWTPGLSGIYPLTHCTLQAVLSDDGMGIQAGEPDPPEEP
            230       240       250       260       270       280  

             280       290       300       310       320       330 
pF1KB4 LAVVVPVPPFTCLLRDLVPATNYSLRVRCANALGPSPYADWVPFQTKGLAPASAPQNLHA
       :.  . :::    : .: : : : .:: :... ::: .. :.: .:   .: . :.:. :
NP_001 LTSQASVPPHQLRLGSLHPHTPYHIRVACTSSQGPSSWTHWLPVETPEGVPLGPPENISA
            290       300       310       320       330       340  

             340       350       360       370       380           
pF1KB4 IRTDSGLILEWEEVNPEAPLEGPLGPYKLSWVQDNGTQDELTVEGTRANLT----GWDPQ
        :. :  ...:.:  :.:::.: :  :.:.. : . : . :   : : ..:    :    
NP_001 TRNGSQAFVHWQE--PRAPLQGTLLGYRLAY-QGQDTPEVLMDIGLRQEVTLELQGDGSV
            350         360       370        380       390         

       390       400       410       420       430       440       
pF1KB4 KDLIVRVCVSNAVGCGPWSQPLVVSSHDRAGQQGPPHSRTSWVPVVLGVLTALVTAAALA
       ..: : : . .:.: :::: :. . .   . . . :     :  :.::...: . .  ::
NP_001 SNLTVCVAAYTAAGDGPWSLPVPLEAWRPVKEPSTPAFSWPWWYVLLGAVVAAACVLILA
     400       410       420       430       440       450         

       450       460       470       480       490       500       
pF1KB4 LILLRKRRKETRFGQAFDSVMARGEPAVHFRAARSFNRERPERIEATLDSLGISDELKEK
       :.:...:.::::.:..:. .. ::: .:..:. .:..:.  :   :::.:::::.:::::
NP_001 LFLVHRRKKETRYGEVFEPTVERGELVVRYRVRKSYSRRTTE---ATLNSLGISEELKEK
     460       470       480       490       500          510      

       510       520       530       540       550       560       
pF1KB4 LEDVLIPEQQFTLGRMLGKGEFGSVREAQLKQEDGSFVKVAVKMLKADIIASSDIEEFLR
       :.::.. ... .::. ::.::::.: :.::.:.: :..::::: .:  : . :..:.:: 
NP_001 LRDVMVDRHKVALGKTLGEGEFGAVMEGQLNQDD-SILKVAVKTMKIAICTRSELEDFLS
        520       530       540       550        560       570     

       570       580       590       600       610       620       
pF1KB4 EAACMKEFDHPHVAKLVGVSLRSRAKGRLPIPMVILPFMKHGDLHAFLLASRIGENPFNL
       ::.::::::::.: .:.:: ...  .  .: :.::::::::::::.::: ::.:..:  :
NP_001 EAVCMKEFDHPNVMRLIGVCFQGSERESFPAPVVILPFMKHGDLHSFLLYSRLGDQPVYL
         580       590       600       610       620       630     

       630       640       650       660       670       680       
pF1KB4 PLQTLIRFMVDIACGMEYLSSRNFIHRDLAARNCMLAEDMTVCVADFGLSRKIYSGDYYR
       : : :..::.::: ::::::.. ::::::::::::: :.:.:::::::::.:::.:::::
NP_001 PTQMLVKFMADIASGMEYLSTKRFIHRDLAARNCMLNENMSVCVADFGLSKKIYNGDYYR
         640       650       660       670       680       690     

       690       700       710       720       730       740       
pF1KB4 QGCASKLPVKWLALESLADNLYTVQSDVWAFGVTMWEIMTRGQTPYAGIENAEIYNYLIG
       ::  .:.::::.:.::::: .:: .::::.:::::::: ::::::: :.::.:::.::  
NP_001 QGRIAKMPVKWIAIESLADRVYTSKSDVWSFGVTMWEIATRGQTPYPGVENSEIYDYLRQ
         700       710       720       730       740       750     

       750       760       770       780       790       800       
pF1KB4 GNRLKQPPECMEDVYDLMYQCWSADPKQRPSFTCLRMELENILGQLSVLSASQDPLYINI
       ::::::: .:.. .: :: .::  .:..::::: :: .::: :  :   .  .. ::.:.
NP_001 GNRLKQPADCLDGLYALMSRCWELNPQDRPSFTELREDLENTLKALPPAQEPDEILYVNM
         760       770       780       790       800       810     

       810           820       830       840       850       860   
pF1KB4 ERA----EEPTAGGSLELPGRDQPYSGAGDGSGMGAVGGTPSDCRYILTPGGLAEQPGQA
       ...    : : :.:. . : . .: ..    : . :.   :.  ::.: :.  . .:.: 
NP_001 DEGGGYPEPPGAAGGADPPTQPDPKDSC---SCLTAAEVHPAG-RYVLCPS-TTPSPAQP
         820       830       840          850        860        870

             870       880       890
pF1KB4 EHQ--PESPLNETQRLLLLQQGLLPHSSC
         .  : .: .:                 
NP_001 ADRGSPAAPGQEDGA              
              880                   

>>NP_001265528 (OMIM: 109135) tyrosine-protein kinase re  (626 aa)
 initn: 1505 init1: 1194 opt: 1822  Z-score: 710.3  bits: 142.1 E(85289): 7.9e-33
Smith-Waterman score: 1824; 46.5% identity (71.5% similar) in 634 aa overlap (260-873:3-623)

     230       240       250       260       270       280         
pF1KB4 NITVTKLSSSNASVAWMPGADGRALLQSCTVQVTQAPGGWEVLAVVVPVPPFTCLLRDLV
                                     .:. .     : :.  . :::    : .: 
NP_001                             MGIQAGEPDPPEEPLTSQASVPPHQLRLGSLH
                                           10        20        30  

     290       300       310       320       330       340         
pF1KB4 PATNYSLRVRCANALGPSPYADWVPFQTKGLAPASAPQNLHAIRTDSGLILEWEEVNPEA
       : : : .:: :... ::: .. :.: .:   .: . :.:. : :. :  ...:.:  :.:
NP_001 PHTPYHIRVACTSSQGPSSWTHWLPVETPEGVPLGPPENISATRNGSQAFVHWQE--PRA
             40        50        60        70        80          90

     350       360       370       380           390       400     
pF1KB4 PLEGPLGPYKLSWVQDNGTQDELTVEGTRANLT----GWDPQKDLIVRVCVSNAVGCGPW
       ::.: :  :.:.. : . : . :   : : ..:    :    ..: : : . .:.: :::
NP_001 PLQGTLLGYRLAY-QGQDTPEVLMDIGLRQEVTLELQGDGSVSNLTVCVAAYTAAGDGPW
              100        110       120       130       140         

         410       420                 430       440       450     
pF1KB4 SQPLVVSSHDRAGQQGPPHSRTS----------WVPVVLGVLTALVTAAALALILLRKRR
       : :. . .  : ::  : :. ..          :  :.::...: . .  :::.:...:.
NP_001 SLPVPLEAW-RPGQAQPVHQLVKEPSTPAFSWPWWYVLLGAVVAAACVLILALFLVHRRK
     150        160       170       180       190       200        

         460       470       480       490       500       510     
pF1KB4 KETRFGQAFDSVMARGEPAVHFRAARSFNRERPERIEATLDSLGISDELKEKLEDVLIPE
       ::::.:..:. .. ::: .:..:. .:..:.  :   :::.:::::.::::::.::.. .
NP_001 KETRYGEVFEPTVERGELVVRYRVRKSYSRRTTE---ATLNSLGISEELKEKLRDVMVDR
      210       220       230       240          250       260     

         520       530       540       550       560       570     
pF1KB4 QQFTLGRMLGKGEFGSVREAQLKQEDGSFVKVAVKMLKADIIASSDIEEFLREAACMKEF
       .. .::. ::.::::.: :.::.:.: :..::::: .:  : . :..:.:: ::.:::::
NP_001 HKVALGKTLGEGEFGAVMEGQLNQDD-SILKVAVKTMKIAICTRSELEDFLSEAVCMKEF
         270       280       290        300       310       320    

         580       590       600       610       620       630     
pF1KB4 DHPHVAKLVGVSLRSRAKGRLPIPMVILPFMKHGDLHAFLLASRIGENPFNLPLQTLIRF
       :::.: .:.:: ...  .  .: :.::::::::::::.::: ::.:..:  :: : :..:
NP_001 DHPNVMRLIGVCFQGSERESFPAPVVILPFMKHGDLHSFLLYSRLGDQPVYLPTQMLVKF
          330       340       350       360       370       380    

         640       650       660       670       680       690     
pF1KB4 MVDIACGMEYLSSRNFIHRDLAARNCMLAEDMTVCVADFGLSRKIYSGDYYRQGCASKLP
       :.::: ::::::.. ::::::::::::: :.:.:::::::::.:::.:::::::  .:.:
NP_001 MADIASGMEYLSTKRFIHRDLAARNCMLNENMSVCVADFGLSKKIYNGDYYRQGRIAKMP
          390       400       410       420       430       440    

         700       710       720       730       740       750     
pF1KB4 VKWLALESLADNLYTVQSDVWAFGVTMWEIMTRGQTPYAGIENAEIYNYLIGGNRLKQPP
       :::.:.::::: .:: .::::.:::::::: ::::::: :.::.:::.::  ::::::: 
NP_001 VKWIAIESLADRVYTSKSDVWSFGVTMWEIATRGQTPYPGVENSEIYDYLRQGNRLKQPA
          450       460       470       480       490       500    

         760       770       780       790       800       810     
pF1KB4 ECMEDVYDLMYQCWSADPKQRPSFTCLRMELENILGQLSVLSASQDPLYINIERA----E
       .:.. .: :: .::  .:..::::: :: .::: :  :   .  .. ::.:....    :
NP_001 DCLDGLYALMSRCWELNPQDRPSFTELREDLENTLKALPPAQEPDEILYVNMDEGGGYPE
          510       520       530       540       550       560    

             820       830       840       850       860           
pF1KB4 EPTAGGSLELPGRDQPYSGAGDGSGMGAVGGTPSDCRYILTPGGLAEQPGQAEHQ--PES
        : :.:. . : . .: ..    : . :.   :.  ::.: :.  . .:.:   .  : .
NP_001 PPGAAGGADPPTQPDPKDSC---SCLTAAEVHPAG-RYVLCPS-TTPSPAQPADRGSPAA
          570       580          590        600        610         

     870       880       890
pF1KB4 PLNETQRLLLLQQGLLPHSSC
       : .:                 
NP_001 PGQEDGA              
     620                    

>>NP_068713 (OMIM: 109135) tyrosine-protein kinase recep  (894 aa)
 initn: 1779 init1: 1194 opt: 1822  Z-score: 708.9  bits: 142.4 E(85289): 9.5e-33
Smith-Waterman score: 2332; 43.1% identity (68.8% similar) in 902 aa overlap (21-873:6-891)

               10        20               30        40        50   
pF1KB4 MALRRSMGRPGLPPLPLPPPPRLG-------LLLAALASLLLPESAAAGLKLMGAPVKLT
                           ::.:       : : . : .    . :    ..: : ..:
NP_068                MAWRCPRMGRVPLAWCLALCGWACMAPRGTQAEESPFVGNPGNIT
                              10        20        30        40     

            60          70        80          90            100    
pF1KB4 VSQGQPVKLNCS--VEGMEEPDIQWVKDGAVVQNLD--QLYIPVSEQH---WI--GFLSL
        ..:    : :.  :.: : :...:..:: ...  :  :  .:..:..   ::  . : .
NP_068 GARGLTGTLRCQLQVQG-EPPEVHWLRDGQILELADSTQTQVPLGEDEQDDWIVVSQLRI
          50        60         70        80        90       100    

          110       120       130       140       150       160    
pF1KB4 KSVERSDAGRYWCQVEDGGETEISQPVWLTVEGVPFFTVEPKDLAVPPNAPFQLSCEAVG
        :.. ::.:.: : :  : .: .::: .. .::.:.:  ::.: .:  :.::.:::.: :
NP_068 TSLQLSDTGQYQCLVFLGHQTFVSQPGYVGLEGLPYFLEEPEDRTVAANTPFNLSCQAQG
          110       120       130       140       150       160    

          170       180         190       200       210       220  
pF1KB4 PPEPVTIVWWRGTTKIG-GPAPSPS-VLNVTGVTQSTMFSCEAHNLKGLASSRTATVHLQ
       ::::: ..: . .. .. .:. .:.  :.: :..... ::::::: ::...:::::.   
NP_068 PPEPVDLLWLQDAVPLATAPGHGPQRSLHVPGLNKTSSFSCEAHNAKGVTTSRTATI--T
          170       180       190       200       210       220    

            230       240       250       260                  270 
pF1KB4 ALPAAPFNITVTKLSSSNASVAWMPGADGRALLQSCTVQVTQAPGGW-----------EV
       .::  : :. ... . ..  ::: :: .:   :  ::.:.. .  :            : 
NP_068 VLPQQPRNLHLVSRQPTELEVAWTPGLSGIYPLTHCTLQAVLSDDGMGIQAGEPDPPEEP
            230       240       250       260       270       280  

             280       290       300       310       320       330 
pF1KB4 LAVVVPVPPFTCLLRDLVPATNYSLRVRCANALGPSPYADWVPFQTKGLAPASAPQNLHA
       :.  . :::    : .: : : : .:: :... ::: .. :.: .:   .: . :.:. :
NP_068 LTSQASVPPHQLRLGSLHPHTPYHIRVACTSSQGPSSWTHWLPVETPEGVPLGPPENISA
            290       300       310       320       330       340  

             340       350       360       370       380           
pF1KB4 IRTDSGLILEWEEVNPEAPLEGPLGPYKLSWVQDNGTQDELTVEGTRANLT----GWDPQ
        :. :  ...:.:  :.:::.: :  :.:.. : . : . :   : : ..:    :    
NP_068 TRNGSQAFVHWQE--PRAPLQGTLLGYRLAY-QGQDTPEVLMDIGLRQEVTLELQGDGSV
            350         360       370        380       390         

       390       400       410       420                 430       
pF1KB4 KDLIVRVCVSNAVGCGPWSQPLVVSSHDRAGQQGPPHSRTS----------WVPVVLGVL
       ..: : : . .:.: :::: :. . .  : ::  : :. ..          :  :.::..
NP_068 SNLTVCVAAYTAAGDGPWSLPVPLEAW-RPGQAQPVHQLVKEPSTPAFSWPWWYVLLGAV
     400       410       420        430       440       450        

       440       450       460       470       480       490       
pF1KB4 TALVTAAALALILLRKRRKETRFGQAFDSVMARGEPAVHFRAARSFNRERPERIEATLDS
       .: . .  :::.:...:.::::.:..:. .. ::: .:..:. .:..:.  :   :::.:
NP_068 VAAACVLILALFLVHRRKKETRYGEVFEPTVERGELVVRYRVRKSYSRRTTE---ATLNS
      460       470       480       490       500       510        

       500       510       520       530       540       550       
pF1KB4 LGISDELKEKLEDVLIPEQQFTLGRMLGKGEFGSVREAQLKQEDGSFVKVAVKMLKADII
       ::::.::::::.::.. ... .::. ::.::::.: :.::.:.: :..::::: .:  : 
NP_068 LGISEELKEKLRDVMVDRHKVALGKTLGEGEFGAVMEGQLNQDD-SILKVAVKTMKIAIC
         520       530       540       550        560       570    

       560       570       580       590       600       610       
pF1KB4 ASSDIEEFLREAACMKEFDHPHVAKLVGVSLRSRAKGRLPIPMVILPFMKHGDLHAFLLA
       . :..:.:: ::.::::::::.: .:.:: ...  .  .: :.::::::::::::.::: 
NP_068 TRSELEDFLSEAVCMKEFDHPNVMRLIGVCFQGSERESFPAPVVILPFMKHGDLHSFLLY
          580       590       600       610       620       630    

       620       630       640       650       660       670       
pF1KB4 SRIGENPFNLPLQTLIRFMVDIACGMEYLSSRNFIHRDLAARNCMLAEDMTVCVADFGLS
       ::.:..:  :: : :..::.::: ::::::.. ::::::::::::: :.:.:::::::::
NP_068 SRLGDQPVYLPTQMLVKFMADIASGMEYLSTKRFIHRDLAARNCMLNENMSVCVADFGLS
          640       650       660       670       680       690    

       680       690       700       710       720       730       
pF1KB4 RKIYSGDYYRQGCASKLPVKWLALESLADNLYTVQSDVWAFGVTMWEIMTRGQTPYAGIE
       .:::.:::::::  .:.::::.:.::::: .:: .::::.:::::::: ::::::: :.:
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pF1KB4 TQDELTVE----GTRANLTGWDPQKDLIVRVCVSNAVGCGPWSQP--LVVSSH---DRAG
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pF1KB4 GDGSGMGAVG--------GTPSDCRYILTPGG-----LAEQPGQAEHQPESPLNETQRLL
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890 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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 start: Thu Nov  3 15:01:22 2016 done: Thu Nov  3 15:01:24 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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