seq1 = pF1KB4122.tfa, 1842 bp
seq2 = pF1KB4122/gi568815581r_64399926.tfa (gi568815581r:64399926_64606119), 206194 bp

>pF1KB4122 1842
>gi568815581r:64399926_64606119 (Chr17)

(complement)

1-44  (100001-100044)   100% ->
45-210  (101278-101443)   100% ->
211-307  (101802-101898)   100% ->
308-441  (102004-102137)   100% ->
442-507  (102252-102317)   100% ->
508-649  (102549-102690)   100% ->
650-810  (102772-102932)   100% ->
811-983  (103022-103194)   100% ->
984-1094  (103571-103681)   100% ->
1095-1156  (103897-103958)   100% ->
1157-1216  (104051-104110)   100% ->
1217-1441  (105347-105571)   100% ->
1442-1842  (105794-106194)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGGTTATTCGAGTGACCGAGACCGCGGCCGGGACCGAGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100001 ATGTCGGGTTATTCGAGTGACCGAGACCGCGGCCGGGACCGAGGGTG...

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     45    GTTTGGTGCACCTCGATTTGGAGGAAGTAGGGCAGGGCCCTTATCTG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101275 CAGGTTTGGTGCACCTCGATTTGGAGGAAGTAGGGCAGGGCCCTTATCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GAAAGAAGTTTGGAAACCCTGGGGAGAAATTAGTTAAAAAGAAGTGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101325 GAAAGAAGTTTGGAAACCCTGGGGAGAAATTAGTTAAAAAGAAGTGGAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTTGATGAGCTGCCTAAATTTGAGAAGAATTTTTATCAAGAGCACCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101375 CTTGATGAGCTGCCTAAATTTGAGAAGAATTTTTATCAAGAGCACCCTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTTGGCTAGGCGCACAGCA         CAAGAGGTGGAAACATACAGAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 101425 TTTGGCTAGGCGCACAGCAGTG...CAGCAAGAGGTGGAAACATACAGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GAAGCAAGGAAATTACAGTTAGAGGTCACAACTGCCCGAAGCCAGTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101824 GAAGCAAGGAAATTACAGTTAGAGGTCACAACTGCCCGAAGCCAGTTCTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AATTTTTATGAAGCCAATTTCCCTG         CAAATGTCATGGATGT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 101874 AATTTTTATGAAGCCAATTTCCCTGGTA...TAGCAAATGTCATGGATGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TATTGCAAGACAGAATTTCACTGAACCCACTGCTATTCAAGCTCAGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102020 TATTGCAAGACAGAATTTCACTGAACCCACTGCTATTCAAGCTCAGGGAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGCCAGTTGCTCTAAGTGGATTGGATATGGTTGGAGTGGCACAGACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102070 GGCCAGTTGCTCTAAGTGGATTGGATATGGTTGGAGTGGCACAGACTGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCTGGGAAAACATTGTCT         TATTTGCTTCCTGCCATTGTCCA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 102120 TCTGGGAAAACATTGTCTGTA...TAGTATTTGCTTCCTGCCATTGTCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CATCAATCATCAGCCATTCCTAGAGAGAGGCGATGGGCCTATT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 102275 CATCAATCATCAGCCATTCCTAGAGAGAGGCGATGGGCCTATTGTA...T

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    508   TGTTTGGTGCTGGCACCAACTCGGGAACTGGCCCAACAGGTGCAGCAA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102547 AGTGTTTGGTGCTGGCACCAACTCGGGAACTGGCCCAACAGGTGCAGCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GTAGCTGCTGAATATTGTAGAGCATGTCGCTTGAAGTCTACTTGTATCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102597 GTAGCTGCTGAATATTGTAGAGCATGTCGCTTGAAGTCTACTTGTATCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CGGTGGTGCTCCTAAGGGACCACAAATACGTGATTTGGAGAGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 102647 CGGTGGTGCTCCTAAGGGACCACAAATACGTGATTTGGAGAGAGGTA...

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    650    GTGTGGAAATCTGTATTGCAACACCTGGAAGACTGATTGACTTTTTA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102769 AAGGTGTGGAAATCTGTATTGCAACACCTGGAAGACTGATTGACTTTTTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GAGTGTGGAAAAACCAATCTGAGAAGAACAACCTACCTTGTCCTTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102819 GAGTGTGGAAAAACCAATCTGAGAAGAACAACCTACCTTGTCCTTGATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AGCAGATAGAATGCTTGATATGGGCTTTGAACCCCAAATAAGGAAGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102869 AGCAGATAGAATGCTTGATATGGGCTTTGAACCCCAAATAAGGAAGATTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGGATCAAATAAGA         CCTGATAGGCAAACTCTAATGTGGAGT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 102919 TGGATCAAATAAGAGTA...TAGCCTGATAGGCAAACTCTAATGTGGAGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GCGACTTGGCCAAAAGAAGTAAGACAGCTTGCTGAAGATTTCCTGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103049 GCGACTTGGCCAAAAGAAGTAAGACAGCTTGCTGAAGATTTCCTGAAAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CTATATTCATATAAACATTGGTGCACTTGAACTGAGTGCAAACCACAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103099 CTATATTCATATAAACATTGGTGCACTTGAACTGAGTGCAAACCACAACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TTCTTCAGATTGTGGATGTGTGTCATGACGTAGAAAAGGATGAAAA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 103149 TTCTTCAGATTGTGGATGTGTGTCATGACGTAGAAAAGGATGAAAAGTA.

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    984      ACTTATTCGTCTAATGGAAGAGATCATGAGTGAGAAGGAGAATAA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103199 ..TAGACTTATTCGTCTAATGGAAGAGATCATGAGTGAGAAGGAGAATAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 AACCATTGTTTTTGTGGAAACCAAAAGAAGATGTGATGAGCTTACCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103616 AACCATTGTTTTTGTGGAAACCAAAAGAAGATGTGATGAGCTTACCAGAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AAATGAGGAGAGATGG         GTGGCCTGCCATGGGTATCCATGGT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 103666 AAATGAGGAGAGATGGGTA...TAGGTGGCCTGCCATGGGTATCCATGGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GACAAGAGTCAACAAGAGCGTGACTGGGTTCTAAATG         AATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 103922 GACAAGAGTCAACAAGAGCGTGACTGGGTTCTAAATGGTA...TAGAATT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 CAAACATGGAAAAGCTCCTATTCTGATTGCTACAGATGTGGCCTCCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104055 CAAACATGGAAAAGCTCCTATTCTGATTGCTACAGATGTGGCCTCCAGAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 GGCTAG         ATGTGGAAGATGTGAAATTTGTCATCAATTATGAC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104105 GGCTAGGTT...CAGATGTGGAAGATGTGAAATTTGTCATCAATTATGAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 TACCCTAACTCCTCAGAGGATTATATTCATCGAATTGGAAGAACTGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105382 TACCCTAACTCCTCAGAGGATTATATTCATCGAATTGGAAGAACTGCTCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 CAGTACCAAAACAGGCACAGCATACACTTTCTTTACACCTAATAACATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105432 CAGTACCAAAACAGGCACAGCATACACTTTCTTTACACCTAATAACATAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 AGCAAGTGAGCGACCTTATCTCTGTGCTTCGTGAAGCTAATCAAGCAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105482 AGCAAGTGAGCGACCTTATCTCTGTGCTTCGTGAAGCTAATCAAGCAATT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 AATCCCAAGTTGCTTCAGTTGGTCGAAGACAGAGGTTCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 105532 AATCCCAAGTTGCTTCAGTTGGTCGAAGACAGAGGTTCAGGTA...CAGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 TCGTTCCAGGGGTAGAGGAGGCATGAAGGATGACCGTCGGGACAGATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105795 TCGTTCCAGGGGTAGAGGAGGCATGAAGGATGACCGTCGGGACAGATACT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 CTGCGGGCAAAAGGGGTGGATTTAATACCTTTAGAGACAGGGAAAATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105845 CTGCGGGCAAAAGGGGTGGATTTAATACCTTTAGAGACAGGGAAAATTAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 GACAGAGGTTACTCTAGCCTGCTTAAAAGAGATTTTGGGGCAAAAACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105895 GACAGAGGTTACTCTAGCCTGCTTAAAAGAGATTTTGGGGCAAAAACTCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 GAATGGTGTTTACAGTGCTGCAAATTACACCAATGGGAGCTTTGGAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105945 GAATGGTGTTTACAGTGCTGCAAATTACACCAATGGGAGCTTTGGAAGTA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 ATTTTGTGTCTGCTGGTATACAGACCAGTTTTAGGACTGGTAATCCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105995 ATTTTGTGTCTGCTGGTATACAGACCAGTTTTAGGACTGGTAATCCAACA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 GGGACTTACCAGAATGGTTATGATAGCACTCAGCAATACGGAAGTAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106045 GGGACTTACCAGAATGGTTATGATAGCACTCAGCAATACGGAAGTAATGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 TCCAAATATGCACAATGGTATGAACCAACAGGCATATGCATATCCTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106095 TCCAAATATGCACAATGGTATGAACCAACAGGCATATGCATATCCTGCTA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 CTGCAGCTGCACCTATGATTGGTTATCCAATGCCAACAGGATATTCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106145 CTGCAGCTGCACCTATGATTGGTTATCCAATGCCAACAGGATATTCCCAA