Result of FASTA (ccds) for pF1KB3761
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3761, 1068 aa
  1>>>pF1KB3761 1068 - 1068 aa - 1068 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7820+/-0.00107; mu= 13.8528+/- 0.064
 mean_var=79.8799+/-16.248, 0's: 0 Z-trim(104.2): 24  B-trim: 223 in 1/50
 Lambda= 0.143501
 statistics sampled from 7755 (7761) to 7755 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.593), E-opt: 0.2 (0.238), width:  16
 Scan time:  4.710

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13289.1 RBL1 gene_id:5933|Hs108|chr20          (1068) 7085 1477.2       0
CCDS13290.1 RBL1 gene_id:5933|Hs108|chr20          (1014) 6727 1403.0       0
CCDS10748.1 RBL2 gene_id:5934|Hs108|chr16          (1139) 2568 542.0 2.7e-153
CCDS31973.1 RB1 gene_id:5925|Hs108|chr13           ( 928)  346 82.0 6.7e-15


>>CCDS13289.1 RBL1 gene_id:5933|Hs108|chr20               (1068 aa)
 initn: 7085 init1: 7085 opt: 7085  Z-score: 7920.0  bits: 1477.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7085; 100.0% identity (100.0% similar) in 1068 aa overlap (1-1068:1-1068)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MFEDKPHAEGAAVVAAAGEALQALCQELNLDEGSAAEALDDFTAIRGNYSLEGEVTHWLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MFEDKPHAEGAAVVAAAGEALQALCQELNLDEGSAAEALDDFTAIRGNYSLEGEVTHWLA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 CSLYVACRKSIIPTVGKGIMEGNCVSLTRILRSAKLSLIQFFSKMKKWMDMSNLPQEFRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CSLYVACRKSIIPTVGKGIMEGNCVSLTRILRSAKLSLIQFFSKMKKWMDMSNLPQEFRE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 RIERLERNFEVSTVIFKKYEPIFLDIFQNPYEEPPKLPRSRKQRRIPCSVKDLFNFCWTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RIERLERNFEVSTVIFKKYEPIFLDIFQNPYEEPPKLPRSRKQRRIPCSVKDLFNFCWTL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 FVYTKGNFRMIGDDLVNSYHLLLCCLDLIFANAIMCPNRQDLLNPSFKGLPSDFHTADFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FVYTKGNFRMIGDDLVNSYHLLLCCLDLIFANAIMCPNRQDLLNPSFKGLPSDFHTADFT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 ASEEPPCIIAVLCELHDGLLVEAKGIKEHYFKPYISKLFDRKILKGECLLDLSSFTDNSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ASEEPPCIIAVLCELHDGLLVEAKGIKEHYFKPYISKLFDRKILKGECLLDLSSFTDNSK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 AVNKEYEEYVLTVGDFDERIFLGADAEEEIGTPRKFTRDTPLGKLTAQANVEYNLQQHFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AVNKEYEEYVLTVGDFDERIFLGADAEEEIGTPRKFTRDTPLGKLTAQANVEYNLQQHFE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 KKRSFAPSTPLTGRRYLREKEAVITPVASATQSVSRLQSIVAGLKNAPSDQLINIFESCV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KKRSFAPSTPLTGRRYLREKEAVITPVASATQSVSRLQSIVAGLKNAPSDQLINIFESCV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 RNPVENIMKILKGIGETFCQHYTQSTDEQPGSHIDFAVNRLKLAEILYYKILETVMVQET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RNPVENIMKILKGIGETFCQHYTQSTDEQPGSHIDFAVNRLKLAEILYYKILETVMVQET
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 RRLHGMDMSVLLEQDIFHRSLMACCLEIVLFAYSSPRTFPWIIEVLNLQPFYFYKVIEVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RRLHGMDMSVLLEQDIFHRSLMACCLEIVLFAYSSPRTFPWIIEVLNLQPFYFYKVIEVV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 IRSEEGLSRDMVKHLNSIEEQILESLAWSHDSALWEALQVSANKVPTCEEVIFPNNFETG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IRSEEGLSRDMVKHLNSIEEQILESLAWSHDSALWEALQVSANKVPTCEEVIFPNNFETG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 NGGNVQGHLPLMPMSPLMHPRVKEVRTDSGSLRRDMQPLSPISVHERYSSPTAGSAKRRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NGGNVQGHLPLMPMSPLMHPRVKEVRTDSGSLRRDMQPLSPISVHERYSSPTAGSAKRRL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 FGEDPPKEMLMDKIITEGTKLKIAPSSSITAENVSILPGQTLLTMATAPVTGTTGHKVTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FGEDPPKEMLMDKIITEGTKLKIAPSSSITAENVSILPGQTLLTMATAPVTGTTGHKVTI
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 PLHGVANDAGEITLIPLSMNTNQESKVKSPVSLTAHSLIGASPKQTNLTKAQEVHSTGIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PLHGVANDAGEITLIPLSMNTNQESKVKSPVSLTAHSLIGASPKQTNLTKAQEVHSTGIN
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB3 RPKRTGSLALFYRKVYHLASVRLRDLCLKLDVSNELRRKIWTCFEFTLVHCPDLMKDRHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RPKRTGSLALFYRKVYHLASVRLRDLCLKLDVSNELRRKIWTCFEFTLVHCPDLMKDRHL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB3 DQLLLCAFYIMAKVTKEERTFQEIMKSYRNQPQANSHVYRSVLLKSIPREVVAYNKNIND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DQLLLCAFYIMAKVTKEERTFQEIMKSYRNQPQANSHVYRSVLLKSIPREVVAYNKNIND
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB3 DFEMIDCDLEDATKTPDCSSGPVKEERGDLIKFYNTIYVGRVKSFALKYDLANQDHMMDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DFEMIDCDLEDATKTPDCSSGPVKEERGDLIKFYNTIYVGRVKSFALKYDLANQDHMMDA
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB3 PPLSPFPHIKQQPGSPRRISQQHSIYISPHKNGSGLTPRSALLYKFNGSPSKSLKDINNM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PPLSPFPHIKQQPGSPRRISQQHSIYISPHKNGSGLTPRSALLYKFNGSPSKSLKDINNM
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060        
pF1KB3 IRQGEQRTKKRVIAIDSDAESPAKRVCQENDDVLLKRLQDVVSERANH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IRQGEQRTKKRVIAIDSDAESPAKRVCQENDDVLLKRLQDVVSERANH
             1030      1040      1050      1060        

>>CCDS13290.1 RBL1 gene_id:5933|Hs108|chr20               (1014 aa)
 initn: 6727 init1: 6727 opt: 6727  Z-score: 7519.8  bits: 1403.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6727; 100.0% identity (100.0% similar) in 1012 aa overlap (1-1012:1-1012)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MFEDKPHAEGAAVVAAAGEALQALCQELNLDEGSAAEALDDFTAIRGNYSLEGEVTHWLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MFEDKPHAEGAAVVAAAGEALQALCQELNLDEGSAAEALDDFTAIRGNYSLEGEVTHWLA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 CSLYVACRKSIIPTVGKGIMEGNCVSLTRILRSAKLSLIQFFSKMKKWMDMSNLPQEFRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CSLYVACRKSIIPTVGKGIMEGNCVSLTRILRSAKLSLIQFFSKMKKWMDMSNLPQEFRE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 RIERLERNFEVSTVIFKKYEPIFLDIFQNPYEEPPKLPRSRKQRRIPCSVKDLFNFCWTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RIERLERNFEVSTVIFKKYEPIFLDIFQNPYEEPPKLPRSRKQRRIPCSVKDLFNFCWTL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 FVYTKGNFRMIGDDLVNSYHLLLCCLDLIFANAIMCPNRQDLLNPSFKGLPSDFHTADFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FVYTKGNFRMIGDDLVNSYHLLLCCLDLIFANAIMCPNRQDLLNPSFKGLPSDFHTADFT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 ASEEPPCIIAVLCELHDGLLVEAKGIKEHYFKPYISKLFDRKILKGECLLDLSSFTDNSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ASEEPPCIIAVLCELHDGLLVEAKGIKEHYFKPYISKLFDRKILKGECLLDLSSFTDNSK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 AVNKEYEEYVLTVGDFDERIFLGADAEEEIGTPRKFTRDTPLGKLTAQANVEYNLQQHFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AVNKEYEEYVLTVGDFDERIFLGADAEEEIGTPRKFTRDTPLGKLTAQANVEYNLQQHFE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 KKRSFAPSTPLTGRRYLREKEAVITPVASATQSVSRLQSIVAGLKNAPSDQLINIFESCV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KKRSFAPSTPLTGRRYLREKEAVITPVASATQSVSRLQSIVAGLKNAPSDQLINIFESCV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 RNPVENIMKILKGIGETFCQHYTQSTDEQPGSHIDFAVNRLKLAEILYYKILETVMVQET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RNPVENIMKILKGIGETFCQHYTQSTDEQPGSHIDFAVNRLKLAEILYYKILETVMVQET
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 RRLHGMDMSVLLEQDIFHRSLMACCLEIVLFAYSSPRTFPWIIEVLNLQPFYFYKVIEVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RRLHGMDMSVLLEQDIFHRSLMACCLEIVLFAYSSPRTFPWIIEVLNLQPFYFYKVIEVV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 IRSEEGLSRDMVKHLNSIEEQILESLAWSHDSALWEALQVSANKVPTCEEVIFPNNFETG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IRSEEGLSRDMVKHLNSIEEQILESLAWSHDSALWEALQVSANKVPTCEEVIFPNNFETG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 NGGNVQGHLPLMPMSPLMHPRVKEVRTDSGSLRRDMQPLSPISVHERYSSPTAGSAKRRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NGGNVQGHLPLMPMSPLMHPRVKEVRTDSGSLRRDMQPLSPISVHERYSSPTAGSAKRRL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 FGEDPPKEMLMDKIITEGTKLKIAPSSSITAENVSILPGQTLLTMATAPVTGTTGHKVTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FGEDPPKEMLMDKIITEGTKLKIAPSSSITAENVSILPGQTLLTMATAPVTGTTGHKVTI
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 PLHGVANDAGEITLIPLSMNTNQESKVKSPVSLTAHSLIGASPKQTNLTKAQEVHSTGIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PLHGVANDAGEITLIPLSMNTNQESKVKSPVSLTAHSLIGASPKQTNLTKAQEVHSTGIN
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB3 RPKRTGSLALFYRKVYHLASVRLRDLCLKLDVSNELRRKIWTCFEFTLVHCPDLMKDRHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RPKRTGSLALFYRKVYHLASVRLRDLCLKLDVSNELRRKIWTCFEFTLVHCPDLMKDRHL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB3 DQLLLCAFYIMAKVTKEERTFQEIMKSYRNQPQANSHVYRSVLLKSIPREVVAYNKNIND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DQLLLCAFYIMAKVTKEERTFQEIMKSYRNQPQANSHVYRSVLLKSIPREVVAYNKNIND
              850       860       870       880       890       900

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pF1KB3 DFEMIDCDLEDATKTPDCSSGPVKEERGDLIKFYNTIYVGRVKSFALKYDLANQDHMMDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DFEMIDCDLEDATKTPDCSSGPVKEERGDLIKFYNTIYVGRVKSFALKYDLANQDHMMDA
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB3 PPLSPFPHIKQQPGSPRRISQQHSIYISPHKNGSGLTPRSALLYKFNGSPSKSLKDINNM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::        
CCDS13 PPLSPFPHIKQQPGSPRRISQQHSIYISPHKNGSGLTPRSALLYKFNGSPSKVR      
              970       980       990      1000      1010          

             1030      1040      1050      1060        
pF1KB3 IRQGEQRTKKRVIAIDSDAESPAKRVCQENDDVLLKRLQDVVSERANH

>>CCDS10748.1 RBL2 gene_id:5934|Hs108|chr16               (1139 aa)
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Smith-Waterman score: 3545; 50.6% identity (75.3% similar) in 1121 aa overlap (3-1056:26-1127)

                                      10             20        30  
pF1KB3                        MFEDKPHAEGAAVVAAAG-----EALQALCQELNLDE
                                ::  .:: ::  : .      . .. ::..::.::
CCDS10 MPSGGDQSPPPPPPPPAAAASDEEEEDDGEAEDAAPPAESPTPQIQQRFDELCSRLNMDE
               10        20        30        40        50        60

             40        50        60        70        80        90  
pF1KB3 GSAAEALDDFTAIRGNYSLEGEVTHWLACSLYVACRKSIIPTVGKGIMEGNCVSLTRILR
       .. ::: :.. ..  .:.:::.  :::::.::::::::. :::.:: .::: :::::::.
CCDS10 AARAEAWDSYRSMSESYTLEGNDLHWLACALYVACRKSV-PTVSKGTVEGNYVSLTRILK
               70        80        90        100       110         

            100       110       120       130       140       150  
pF1KB3 SAKLSLIQFFSKMKKWMDMSNLPQEFRERIERLERNFEVSTVIFKKYEPIFLDIFQNPYE
        .. :::.::.::::: ::.::: .:::: ::::::: ::.:::::::::: :::. : :
CCDS10 CSEQSLIEFFNKMKKWEDMANLPPHFRERTERLERNFTVSAVIFKKYEPIFQDIFKYPQE
     120       130       140       150       160       170         

            160       170       180       190       200       210  
pF1KB3 EPPKLPRSRKQRRIPCSVKDLFNFCWTLFVYTKGNFRMIGDDLVNSYHLLLCCLDLIFAN
       : :.  :.::::: ::.:...:.:::.::.:.:::: ::.:::::::::::: :::...:
CCDS10 EQPRQQRGRKQRRQPCTVSEIFHFCWVLFIYAKGNFPMISDDLVNSYHLLLCALDLVYGN
     180       190       200       210       220       230         

            220       230       240       250       260       270  
pF1KB3 AIMCPNRQDLLNPSFKGLPSDFHTADFTASEEPPCIIAVLCELHDGLLVEAKGIKEHYFK
       :..: ::..:.::.::::  :::. :   : .:::::  :: :::::..::::::::..:
CCDS10 ALQCSNRKELVNPNFKGLSEDFHAKDSKPSSDPPCIIEKLCSLHDGLVLEAKGIKEHFWK
     240       250       260       270       280       290         

            280            290       300       310       320       
pF1KB3 PYISKLFDRKILKG--ECL---LDLSSFTDNSKAVNKEYEEYVLTVGDFDERIFLGADAE
       ::: ::...:.:::  : :   :. ..: .. ::.:: ::::::.::..::::::: :::
CCDS10 PYIRKLYEKKLLKGKEENLTGFLEPGNFGESFKAINKAYEEYVLSVGNLDERIFLGEDAE
     300       310       320       330       340       350         

       330       340        350       360       370       380      
pF1KB3 EEIGTPRKFTRDTPLGKLTAQ-ANVEYNLQQHFEKKRSFAPSTPLTGRRYLREKEAVITP
       :::::  .   ..  :  ::. ....  :::::.:....  :::::: ::..:.   .::
CCDS10 EEIGTLSRCL-NAGSGTETAERVQMKNILQQHFDKSKALRISTPLTGVRYIKENSPCVTP
     360        370       380       390       400       410        

        390       400       410       420       430       440      
pF1KB3 VASATQSVSRLQSIVAGLKNAPSDQLINIFESCVRNPVENIMKILKGIGETFCQHYTQST
       :..::.:.:::.....::.::::..: .:...: :.:.. : . :: . : . ::. :  
CCDS10 VSTATHSLSRLHTMLTGLRNAPSEKLEQILRTCSRDPTQAIANRLKEMFEIYSQHF-QPD
      420       430       440       450       460       470        

        450       460       470       480       490       500      
pF1KB3 DEQPGSHIDFAVNRLKLAEILYYKILETVMVQETRRLHGMDMSVLLEQDIFHRSLMACCL
       ..  .   ..: .....::.::::.::.:. :: .::  ::.: .:::: :::::.::::
CCDS10 EDFSNCAKEIASKHFRFAEMLYYKVLESVIEQEQKRLGDMDLSGILEQDAFHRSLLACCL
       480       490       500       510       520       530       

        510       520       530       540       550       560      
pF1KB3 EIVLFAYSSPRTFPWIIEVLNLQPFYFYKVIEVVIRSEEGLSRDMVKHLNSIEEQILESL
       :.: :.:. : .::.: :....  ..::::::: ::.:.:: :..:::::.::::::. :
CCDS10 EVVTFSYKPPGNFPFITEIFDVPLYHFYKVIEVFIRAEDGLCREVVKHLNQIEEQILDHL
       540       550       560       570       580       590       

        570       580       590       600       610       620      
pF1KB3 AWSHDSALWEALQVSANKVPTCEEVIFPNNFETGNGGNVQGHLPLMPMSPLMHPRVKEVR
       ::. .: ::: .. . :.:::::::. :.:.: ..   . :       :::   :: :::
CCDS10 AWKPESPLWEKIRDNENRVPTCEEVMPPQNLERADEICIAG-------SPLTPRRVTEVR
       600       610       620       630              640       650

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pF1KB3 TDSGSLRRDMQPLSPISVHERYSSPTAGSAKRRLFGE-DPPKEMLMDKIITEGTKLKIAP
       .:.:.: :..   :: ....::::: :....:::: : : :..      .     .. .:
CCDS10 ADTGGLGRSIT--SPTTLYDRYSSPPASTTRRRLFVENDSPSDGGTPGRMPPQPLVNAVP
              660         670       680       690       700        

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pF1KB3 SSSITAENVSI--LPGQTLLTMATAPVTGTTGHKVTIPLHGVANDAGEITLIPLSMNTN-
        .....:.::.  .:::::.::::: ::...:. ::::..:.::. : ::..:...:.. 
CCDS10 VQNVSGETVSVTPVPGQTLVTMATATVTANNGQTVTIPVQGIANENGGITFFPVQVNVGG
      710       720       730       740       750       760        

            750        760                             770         
pF1KB3 QESKVKSPVS-LTAHSLIGA----------------------SPKQTNLTKAQEVHSTGI
       : . : . .. :.:..: :.                      ::   .  ..: : :.. 
CCDS10 QAQAVTGSIQPLSAQALAGSLSSQQVTGTTLQVPGQVAIQQISPGGQQQKQGQSVTSSS-
      770       780       790       800       810       820        

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pF1KB3 NRPKRTGSLALFYRKVYHLASVRLRDLCLKLDVSNELRRKIWTCFEFTLVHCPDLMKDRH
       :::..:.::.::.:::::::.::::::: :::.:.:::.::::::::....::.:: :::
CCDS10 NRPRKTSSLSLFFRKVYHLAAVRLRDLCAKLDISDELRKKIWTCFEFSIIQCPELMMDRH
       830       840       850       860       870       880       

     840       850       860       870       880                   
pF1KB3 LDQLLLCAFYIMAKVTKEERTFQEIMKSYRNQPQANSHVYRSVLLK----------SIPR
       :::::.::.:.:::::::...::.::. ::.:::: :.::::::.:          :  :
CCDS10 LDQLLMCAIYVMAKVTKEDKSFQNIMRCYRTQPQARSQVYRSVLIKGKRKRRNSGSSDSR
       890       900       910       920       930       940       

     890       900        910          920                    930  
pF1KB3 EVVAYNKNINDDFEMIDCD-LEDATKT---PDCSSGPV-------------KEERGDLIK
              ..: :    : . .  ...:   :. ::.:              .:::::::.
CCDS10 SHQNSPTELNKDRTSRDSSPVMRSSSTLPVPQPSSAPPTPTRLTGANSDMEEEERGDLIQ
       950       960       970       980       990      1000       

            940       950       960       970         980       990
pF1KB3 FYNTIYVGRVKSFALKYDLANQDHMMDAPPLSPFPHIKQQPGSPRRI--SQQHSIYISPH
       :::.::. ..:.::.::. ::    ::::::::.: ..   ::::::  ::.: .:::::
CCDS10 FYNNIYIKQIKTFAMKYSQAN----MDAPPLSPYPFVRT--GSPRRIQLSQNHPVYISPH
      1010      1020          1030      1040        1050      1060 

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KB3 KNGSGLTPRSALLYKFNGSPSKSLKDINNMIRQGEQRTKKRVIAIDSDAESPAKRVCQEN
       :: . :.::  ..: :..:::: :..::.::: ::  :::: : ... .::::::.: ::
CCDS10 KNETMLSPREKIFYYFSNSPSKRLREINSMIRTGETPTKKRGILLEDGSESPAKRICPEN
            1070      1080      1090      1100      1110      1120 

             1060        
pF1KB3 DDVLLKRLQDVVSERANH
        ..::.            
CCDS10 HSALLRRLQDVANDRGSH
            1130         

>>CCDS31973.1 RB1 gene_id:5925|Hs108|chr13                (928 aa)
 initn: 935 init1: 237 opt: 346  Z-score: 381.0  bits: 82.0 E(32554): 6.7e-15
Smith-Waterman score: 764; 25.4% identity (50.6% similar) in 1069 aa overlap (23-1046:59-875)

                       10        20        30              40      
pF1KB3         MFEDKPHAEGAAVVAAAGEALQALCQELNLDEGSAAEA------LDDFTAIR
                                     ::::.:.. .    .:      ...  .. 
CCDS31 PEEDPEQDSGPEDLPLVRLEFEETEEPDFTALCQKLKIPDHVRERAWLTWEKVSSVDGVL
       30        40        50        60        70        80        

         50        60        70        80        90       100      
pF1KB3 GNYSLEGEVTHWLACSLYVACRKSIIPTVGKGIMEGNCVSLTRILRSAKLSLIQFFSKMK
       :.: .. .   :  : ...:             ..    ..:.. .. ..:. .::. .:
CCDS31 GGY-IQKKKELWGIC-IFIAAVD----------LDEMSFTFTELQKNIEISVHKFFNLLK
       90        100                  110       120       130      

        110       120       130       140       150       160      
pF1KB3 KWMDMSNLPQEFRERIERLERNFEVSTVIFKKYEPIFLDIFQNPYEEPPKLPRSRKQRRI
       . .: :.   .  . . :: ....:  ..:.: :     :. .        : :  . .:
CCDS31 E-IDTST---KVDNAMSRLLKKYDVLFALFSKLERTCELIYLTQ-------PSSSISTEI
         140          150       160       170              180     

        170       180       190       200       210          220   
pF1KB3 PCSVKDLFNFCWTLFVYTKGNFRMIGDDLVNSYHLLLCCLDLIFANA---IMCPNRQDLL
         ..  ...  :  :. .::.  .. :::: :..:.:: :: ..  .   ..    .  .
CCDS31 NSAL--VLKVSWITFLLAKGEVLQMEDDLVISFQLMLCVLDYFIKLSPPMLLKEPYKTAV
           190       200       210       220       230       240   

           230       240             250       260       270       
pF1KB3 NPSFKGLPSDFHTADFTAS------EEPPCIIAVLCELHDGLLVEAKGIKEHYFKPYISK
        : ..: :   . ..  ..      :.   :: :::. :.  . :.:..  . : :....
CCDS31 IP-INGSPRTPRRGQNRSARIAKQLENDTRIIEVLCKEHECNIDEVKNVYFKNFIPFMNS
            250       260       270       280       290       300  

       280       290       300       310       320       330       
pF1KB3 LFDRKILKGECLLDLSSFTDNSKAVNKEYEEYVLTVGDFDERIFLGADAEEEIGTPRKF-
       :       :   :  :.   . . ..:.:::  :   :.: :.::  :   .  .  .: 
CCDS31 L-------G---LVTSNGLPEVENLSKRYEEIYLKNKDLDARLFLDHDKTLQTDSIDSFE
                      310       320       330       340       350  

        340        350       360       370       380       390     
pF1KB3 TRDTPL-GKLTAQANVEYNLQQHFEKKRSFAPSTPLTGRRYLREKEAVITPVASATQSVS
       :. ::  ..:  ..::   .  :                          ::: .. ....
CCDS31 TQRTPRKSNLDEEVNV---IPPH--------------------------TPVRTVMNTIQ
            360          370                                 380   

         400       410       420       430       440       450     
pF1KB3 RLQSIVAGLKNAPSDQLINIFESCVRNPVENIMKILKGIGETFCQHYTQSTDEQPGSHID
       .:. :. . .. ::..::. :..:. :: :.:.: .: ::  : ....... .  :  ..
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