Result of FASTA (omim) for pF1KB3644
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3644, 379 aa
  1>>>pF1KB3644 379 - 379 aa - 379 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9905+/-0.000403; mu= 17.8083+/- 0.025
 mean_var=59.7922+/-11.851, 0's: 0 Z-trim(110.5): 77  B-trim: 98 in 1/48
 Lambda= 0.165864
 statistics sampled from 18838 (18915) to 18838 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.592), E-opt: 0.2 (0.222), width:  16
 Scan time:  8.020

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_002232 (OMIM: 274600,600791,602208,612780) ATP- ( 379) 2452 595.5 6.6e-170
XP_011527863 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensiti ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
XP_011527862 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensiti ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
NP_733933 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward rect ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
NP_001263366 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward r ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
XP_016883833 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensiti ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
NP_733932 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward rect ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
XP_016883832 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensiti ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
NP_001263365 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward r ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
NP_002234 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward rect ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
XP_006724065 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensiti ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
XP_005261032 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensiti ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
XP_016883834 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensiti ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
NP_001263364 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward r ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
NP_001263368 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward r ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
NP_001263367 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward r ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
NP_722448 (OMIM: 241200,600359) ATP-sensitive inwa ( 372) 1181 291.4 2.3e-78
NP_722451 (OMIM: 241200,600359) ATP-sensitive inwa ( 372) 1181 291.4 2.3e-78
NP_722450 (OMIM: 241200,600359) ATP-sensitive inwa ( 372) 1181 291.4 2.3e-78
NP_722449 (OMIM: 241200,600359) ATP-sensitive inwa ( 389) 1181 291.4 2.4e-78
NP_000211 (OMIM: 241200,600359) ATP-sensitive inwa ( 391) 1181 291.4 2.4e-78
XP_011522133 (OMIM: 602323) PREDICTED: ATP-sensiti ( 433)  946 235.2 2.2e-61
NP_066292 (OMIM: 602323) ATP-sensitive inward rect ( 433)  946 235.2 2.2e-61
XP_005256682 (OMIM: 602323) PREDICTED: ATP-sensiti ( 433)  946 235.2 2.2e-61
NP_001181887 (OMIM: 613236,613239) inward rectifie ( 433)  938 233.3 8.4e-61
XP_005276976 (OMIM: 613236,613239) PREDICTED: inwa ( 535)  938 233.3   1e-60
NP_004974 (OMIM: 600932) G protein-activated inwar ( 393)  922 229.4 1.1e-59
XP_016856736 (OMIM: 600932) PREDICTED: G protein-a ( 450)  922 229.5 1.2e-59
NP_002230 (OMIM: 601534) G protein-activated inwar ( 501)  914 227.6 5.1e-59
NP_002231 (OMIM: 600877,614098) G protein-activate ( 423)  903 224.9 2.7e-58
NP_000882 (OMIM: 170390,600681,609622,613980) inwa ( 427)  901 224.4 3.8e-58
NP_000881 (OMIM: 600734,613485,613677) G protein-a ( 419)  896 223.2 8.7e-58
XP_011541111 (OMIM: 600734,613485,613677) PREDICTE ( 419)  896 223.2 8.7e-58
XP_011541112 (OMIM: 600734,613485,613677) PREDICTE ( 419)  896 223.2 8.7e-58
NP_037480 (OMIM: 603953) ATP-sensitive inward rect ( 436)  894 222.7 1.2e-57
NP_000516 (OMIM: 125853,600937,601820,606176,61058 ( 390)  888 221.3 3.1e-57
NP_002233 (OMIM: 193230,603208,614186) inward rect ( 360)  881 219.6 9.2e-57
XP_016874773 (OMIM: 600935) PREDICTED: ATP-sensiti ( 424)  828 206.9 6.9e-53
NP_004973 (OMIM: 600935) ATP-sensitive inward rect ( 424)  828 206.9 6.9e-53
XP_016874772 (OMIM: 600935) PREDICTED: ATP-sensiti ( 424)  828 206.9 6.9e-53
XP_005253415 (OMIM: 600935) PREDICTED: ATP-sensiti ( 424)  828 206.9 6.9e-53
XP_011523083 (OMIM: 605722) PREDICTED: inward rect ( 418)  775 194.3 4.5e-49
NP_001257351 (OMIM: 605722) inward rectifier potas ( 418)  775 194.3 4.5e-49
NP_001278554 (OMIM: 605722) inward rectifier potas ( 418)  775 194.3 4.5e-49
NP_001278553 (OMIM: 605722) inward rectifier potas ( 418)  775 194.3 4.5e-49
XP_016880102 (OMIM: 605722) PREDICTED: inward rect ( 418)  775 194.3 4.5e-49
XP_006721949 (OMIM: 605722) PREDICTED: inward rect ( 453)  775 194.3 4.8e-49
XP_005257394 (OMIM: 605722) PREDICTED: inward rect ( 453)  775 194.3 4.8e-49
NP_733938 (OMIM: 605722) inward rectifier potassiu ( 453)  775 194.3 4.8e-49
XP_016880101 (OMIM: 605722) PREDICTED: inward rect ( 453)  775 194.3 4.8e-49


>>NP_002232 (OMIM: 274600,600791,602208,612780) ATP-sens  (379 aa)
 initn: 2452 init1: 2452 opt: 2452  Z-score: 3171.4  bits: 595.5 E(85289): 6.6e-170
Smith-Waterman score: 2452; 100.0% identity (100.0% similar) in 379 aa overlap (1-379:1-379)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MTSVAKVYYSQTTQTESRPLMGPGIRRRRVLTKDGRSNVRMEHIADKRFLYLKDLWTTFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MTSVAKVYYSQTTQTESRPLMGPGIRRRRVLTKDGRSNVRMEHIADKRFLYLKDLWTTFI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 DMQWRYKLLLFSATFAGTWFLFGVVWYLVAVAHGDLLELDPPANHTPCVVQVHTLTGAFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 DMQWRYKLLLFSATFAGTWFLFGVVWYLVAVAHGDLLELDPPANHTPCVVQVHTLTGAFL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 FSLESQTTIGYGFRYISEECPLAIVLLIAQLVLTTILEIFITGTFLAKIARPKKRAETIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FSLESQTTIGYGFRYISEECPLAIVLLIAQLVLTTILEIFITGTFLAKIARPKKRAETIR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 FSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGENIRLNQVNVTFQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGENIRLNQVNVTFQV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 DTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDLPLRSGEGDFELVLILSGTVESTSATCQVRTSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 DTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDLPLRSGEGDFELVLILSGTVESTSATCQVRTSY
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 LPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPSGLRDSTVRYGDPEKLKLEES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPSGLRDSTVRYGDPEKLKLEES
              310       320       330       340       350       360

              370         
pF1KB3 LREQAEKEGSALSVRISNV
       :::::::::::::::::::
NP_002 LREQAEKEGSALSVRISNV
              370         

>>XP_011527863 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensitive i  (375 aa)
 initn: 1453 init1: 1143 opt: 1484  Z-score: 1919.6  bits: 363.9 E(85289): 3.5e-100
Smith-Waterman score: 1484; 62.9% identity (82.3% similar) in 372 aa overlap (17-379:10-375)

               10        20              30        40        50    
pF1KB3 MTSVAKVYYSQTTQTESRPLM----GPGIR--RRRVLTKDGRSNVRMEHIADKRFLYLKD
                       : ::.    : :..  : ::..:.:.::::....    .:::.:
XP_011        MDAIHIGMSSTPLVKHTAGAGLKANRPRVMSKSGHSNVRIDKVDGIYLLYLQD
                      10        20        30        40        50   

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB3 LWTTFIDMQWRYKLLLFSATFAGTWFLFGVVWYLVAVAHGDLLELDPPANHTPCVVQVHT
       :::: :::.::::: ::.:::. :::::::..: .:  ::::   .: .:::::...: .
XP_011 LWTTVIDMKWRYKLTLFAATFVMTWFLFGVIYYAIAFIHGDLEPGEPISNHTPCIMKVDS
            60        70        80        90       100       110   

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB3 LTGAFLFSLESQTTIGYGFRYISEECPLAIVLLIAQLVLTTILEIFITGTFLAKIARPKK
       :::::::::::::::::: : :.:::: :: ::.::::.::..:::::::::::::::::
XP_011 LTGAFLFSLESQTTIGYGVRSITEECPHAIFLLVAQLVITTLIEIFITGTFLAKIARPKK
           120       130       140       150       160       170   

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB3 RAETIRFSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGENIRLNQV
       :::::.::. ::....::: ::.:.:::::::::: ::..::::::: ::::: : :::.
XP_011 RAETIKFSHCAVITKQNGKLCLVIQVANMRKSLLIQCQLSGKLLQTHVTKEGERILLNQA
           180       190       200       210       220       230   

          240       250       260        270       280       290   
pF1KB3 NVTFQVDTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDL-PLRSGEGDFELVLILSGTVESTSAT
       .: :.::..:.:::::::.:::::.::::::.:: :    : .::::..:..:::::::.
XP_011 TVKFHVDSSSESPFLILPMTFYHVLDETSPLRDLTPQNLKEKEFELVVLLNATVESTSAV
           240       250       260       270       280       290   

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB3 CQVRTSYLPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPSGLRDSTVRYGDPE
       :: ::::.:::: ::.::.:..::: .:::.:::: :.:. :  ::    : :   .: :
XP_011 CQSRTSYIPEEIYWGFEFVPVVSLSKNGKYVADFSQFEQIRK--SP----DCTFYCADSE
           300       310       320       330             340       

           360         370         
pF1KB3 KLKLEESLRE--QAEKEGSALSVRISNV
       : .:::. :.  : :.:  .: .. :::
XP_011 KQQLEEKYRQEDQRERELRTLLLQQSNV
       350       360       370     

>>XP_011527862 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensitive i  (375 aa)
 initn: 1453 init1: 1143 opt: 1484  Z-score: 1919.6  bits: 363.9 E(85289): 3.5e-100
Smith-Waterman score: 1484; 62.9% identity (82.3% similar) in 372 aa overlap (17-379:10-375)

               10        20              30        40        50    
pF1KB3 MTSVAKVYYSQTTQTESRPLM----GPGIR--RRRVLTKDGRSNVRMEHIADKRFLYLKD
                       : ::.    : :..  : ::..:.:.::::....    .:::.:
XP_011        MDAIHIGMSSTPLVKHTAGAGLKANRPRVMSKSGHSNVRIDKVDGIYLLYLQD
                      10        20        30        40        50   

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB3 LWTTFIDMQWRYKLLLFSATFAGTWFLFGVVWYLVAVAHGDLLELDPPANHTPCVVQVHT
       :::: :::.::::: ::.:::. :::::::..: .:  ::::   .: .:::::...: .
XP_011 LWTTVIDMKWRYKLTLFAATFVMTWFLFGVIYYAIAFIHGDLEPGEPISNHTPCIMKVDS
            60        70        80        90       100       110   

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB3 LTGAFLFSLESQTTIGYGFRYISEECPLAIVLLIAQLVLTTILEIFITGTFLAKIARPKK
       :::::::::::::::::: : :.:::: :: ::.::::.::..:::::::::::::::::
XP_011 LTGAFLFSLESQTTIGYGVRSITEECPHAIFLLVAQLVITTLIEIFITGTFLAKIARPKK
           120       130       140       150       160       170   

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB3 RAETIRFSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGENIRLNQV
       :::::.::. ::....::: ::.:.:::::::::: ::..::::::: ::::: : :::.
XP_011 RAETIKFSHCAVITKQNGKLCLVIQVANMRKSLLIQCQLSGKLLQTHVTKEGERILLNQA
           180       190       200       210       220       230   

          240       250       260        270       280       290   
pF1KB3 NVTFQVDTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDL-PLRSGEGDFELVLILSGTVESTSAT
       .: :.::..:.:::::::.:::::.::::::.:: :    : .::::..:..:::::::.
XP_011 TVKFHVDSSSESPFLILPMTFYHVLDETSPLRDLTPQNLKEKEFELVVLLNATVESTSAV
           240       250       260       270       280       290   

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       :: ::::.:::: ::.::.:..::: .:::.:::: :.:. :  ::    : :   .: :
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       : .:::. :.  : :.:  .: .. :::
XP_011 KQQLEEKYRQEDQRERELRTLLLQQSNV
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>>NP_733933 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward rectifie  (375 aa)
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       .: :.::..:.:::::::.:::::.::::::.:: :    : .::::..:..:::::::.
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       : .:::. :.  : :.:  .: .. :::
NP_733 KQQLEEKYRQEDQRERELRTLLLQQSNV
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>>NP_001263366 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward recti  (375 aa)
 initn: 1453 init1: 1143 opt: 1484  Z-score: 1919.6  bits: 363.9 E(85289): 3.5e-100
Smith-Waterman score: 1484; 62.9% identity (82.3% similar) in 372 aa overlap (17-379:10-375)

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NP_001 TVKFHVDSSSESPFLILPMTFYHVLDETSPLRDLTPQNLKEKEFELVVLLNATVESTSAV
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pF1KB3 CQVRTSYLPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPSGLRDSTVRYGDPE
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NP_001 CQSRTSYIPEEIYWGFEFVPVVSLSKNGKYVADFSQFEQIRK--SP----DCTFYCADSE
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pF1KB3 KLKLEESLRE--QAEKEGSALSVRISNV
       : .:::. :.  : :.:  .: .. :::
NP_001 KQQLEEKYRQEDQRERELRTLLLQQSNV
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 initn: 1453 init1: 1143 opt: 1484  Z-score: 1919.6  bits: 363.9 E(85289): 3.5e-100
Smith-Waterman score: 1484; 62.9% identity (82.3% similar) in 372 aa overlap (17-379:10-375)

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pF1KB3 MTSVAKVYYSQTTQTESRPLM----GPGIR--RRRVLTKDGRSNVRMEHIADKRFLYLKD
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XP_016        MDAIHIGMSSTPLVKHTAGAGLKANRPRVMSKSGHSNVRIDKVDGIYLLYLQD
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pF1KB3 RAETIRFSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGENIRLNQV
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pF1KB3 NVTFQVDTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDL-PLRSGEGDFELVLILSGTVESTSAT
       .: :.::..:.:::::::.:::::.::::::.:: :    : .::::..:..:::::::.
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pF1KB3 CQVRTSYLPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPSGLRDSTVRYGDPE
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XP_016 CQSRTSYIPEEIYWGFEFVPVVSLSKNGKYVADFSQFEQIRK--SP----DCTFYCADSE
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pF1KB3 KLKLEESLRE--QAEKEGSALSVRISNV
       : .:::. :.  : :.:  .: .. :::
XP_016 KQQLEEKYRQEDQRERELRTLLLQQSNV
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>>NP_733932 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward rectifie  (375 aa)
 initn: 1453 init1: 1143 opt: 1484  Z-score: 1919.6  bits: 363.9 E(85289): 3.5e-100
Smith-Waterman score: 1484; 62.9% identity (82.3% similar) in 372 aa overlap (17-379:10-375)

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pF1KB3 MTSVAKVYYSQTTQTESRPLM----GPGIR--RRRVLTKDGRSNVRMEHIADKRFLYLKD
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NP_733        MDAIHIGMSSTPLVKHTAGAGLKANRPRVMSKSGHSNVRIDKVDGIYLLYLQD
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NP_733 LWTTVIDMKWRYKLTLFAATFVMTWFLFGVIYYAIAFIHGDLEPGEPISNHTPCIMKVDS
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NP_733 LTGAFLFSLESQTTIGYGVRSITEECPHAIFLLVAQLVITTLIEIFITGTFLAKIARPKK
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NP_733 RAETIKFSHCAVITKQNGKLCLVIQVANMRKSLLIQCQLSGKLLQTHVTKEGERILLNQA
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pF1KB3 NVTFQVDTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDL-PLRSGEGDFELVLILSGTVESTSAT
       .: :.::..:.:::::::.:::::.::::::.:: :    : .::::..:..:::::::.
NP_733 TVKFHVDSSSESPFLILPMTFYHVLDETSPLRDLTPQNLKEKEFELVVLLNATVESTSAV
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pF1KB3 CQVRTSYLPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPSGLRDSTVRYGDPE
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NP_733 CQSRTSYIPEEIYWGFEFVPVVSLSKNGKYVADFSQFEQIRK--SP----DCTFYCADSE
           300       310       320       330             340       

           360         370         
pF1KB3 KLKLEESLRE--QAEKEGSALSVRISNV
       : .:::. :.  : :.:  .: .. :::
NP_733 KQQLEEKYRQEDQRERELRTLLLQQSNV
       350       360       370     

>>XP_016883832 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensitive i  (375 aa)
 initn: 1453 init1: 1143 opt: 1484  Z-score: 1919.6  bits: 363.9 E(85289): 3.5e-100
Smith-Waterman score: 1484; 62.9% identity (82.3% similar) in 372 aa overlap (17-379:10-375)

               10        20              30        40        50    
pF1KB3 MTSVAKVYYSQTTQTESRPLM----GPGIR--RRRVLTKDGRSNVRMEHIADKRFLYLKD
                       : ::.    : :..  : ::..:.:.::::....    .:::.:
XP_016        MDAIHIGMSSTPLVKHTAGAGLKANRPRVMSKSGHSNVRIDKVDGIYLLYLQD
                      10        20        30        40        50   

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pF1KB3 LTGAFLFSLESQTTIGYGFRYISEECPLAIVLLIAQLVLTTILEIFITGTFLAKIARPKK
       :::::::::::::::::: : :.:::: :: ::.::::.::..:::::::::::::::::
XP_016 LTGAFLFSLESQTTIGYGVRSITEECPHAIFLLVAQLVITTLIEIFITGTFLAKIARPKK
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pF1KB3 RAETIRFSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGENIRLNQV
       :::::.::. ::....::: ::.:.:::::::::: ::..::::::: ::::: : :::.
XP_016 RAETIKFSHCAVITKQNGKLCLVIQVANMRKSLLIQCQLSGKLLQTHVTKEGERILLNQA
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pF1KB3 NVTFQVDTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDL-PLRSGEGDFELVLILSGTVESTSAT
       .: :.::..:.:::::::.:::::.::::::.:: :    : .::::..:..:::::::.
XP_016 TVKFHVDSSSESPFLILPMTFYHVLDETSPLRDLTPQNLKEKEFELVVLLNATVESTSAV
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pF1KB3 CQVRTSYLPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPSGLRDSTVRYGDPE
       :: ::::.:::: ::.::.:..::: .:::.:::: :.:. :  ::    : :   .: :
XP_016 CQSRTSYIPEEIYWGFEFVPVVSLSKNGKYVADFSQFEQIRK--SP----DCTFYCADSE
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pF1KB3 KLKLEESLRE--QAEKEGSALSVRISNV
       : .:::. :.  : :.:  .: .. :::
XP_016 KQQLEEKYRQEDQRERELRTLLLQQSNV
       350       360       370     

>>NP_001263365 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward recti  (375 aa)
 initn: 1453 init1: 1143 opt: 1484  Z-score: 1919.6  bits: 363.9 E(85289): 3.5e-100
Smith-Waterman score: 1484; 62.9% identity (82.3% similar) in 372 aa overlap (17-379:10-375)

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                       : ::.    : :..  : ::..:.:.::::....    .:::.:
NP_001        MDAIHIGMSSTPLVKHTAGAGLKANRPRVMSKSGHSNVRIDKVDGIYLLYLQD
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pF1KB3 LWTTFIDMQWRYKLLLFSATFAGTWFLFGVVWYLVAVAHGDLLELDPPANHTPCVVQVHT
       :::: :::.::::: ::.:::. :::::::..: .:  ::::   .: .:::::...: .
NP_001 LWTTVIDMKWRYKLTLFAATFVMTWFLFGVIYYAIAFIHGDLEPGEPISNHTPCIMKVDS
            60        70        80        90       100       110   

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pF1KB3 LTGAFLFSLESQTTIGYGFRYISEECPLAIVLLIAQLVLTTILEIFITGTFLAKIARPKK
       :::::::::::::::::: : :.:::: :: ::.::::.::..:::::::::::::::::
NP_001 LTGAFLFSLESQTTIGYGVRSITEECPHAIFLLVAQLVITTLIEIFITGTFLAKIARPKK
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pF1KB3 RAETIRFSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGENIRLNQV
       :::::.::. ::....::: ::.:.:::::::::: ::..::::::: ::::: : :::.
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pF1KB3 NVTFQVDTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDL-PLRSGEGDFELVLILSGTVESTSAT
       .: :.::..:.:::::::.:::::.::::::.:: :    : .::::..:..:::::::.
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       :: ::::.:::: ::.::.:..::: .:::.:::: :.:. :  ::    : :   .: :
NP_001 CQSRTSYIPEEIYWGFEFVPVVSLSKNGKYVADFSQFEQIRK--SP----DCTFYCADSE
           300       310       320       330             340       

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pF1KB3 KLKLEESLRE--QAEKEGSALSVRISNV
       : .:::. :.  : :.:  .: .. :::
NP_001 KQQLEEKYRQEDQRERELRTLLLQQSNV
       350       360       370     

>>NP_002234 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward rectifie  (375 aa)
 initn: 1453 init1: 1143 opt: 1484  Z-score: 1919.6  bits: 363.9 E(85289): 3.5e-100
Smith-Waterman score: 1484; 62.9% identity (82.3% similar) in 372 aa overlap (17-379:10-375)

               10        20              30        40        50    
pF1KB3 MTSVAKVYYSQTTQTESRPLM----GPGIR--RRRVLTKDGRSNVRMEHIADKRFLYLKD
                       : ::.    : :..  : ::..:.:.::::....    .:::.:
NP_002        MDAIHIGMSSTPLVKHTAGAGLKANRPRVMSKSGHSNVRIDKVDGIYLLYLQD
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pF1KB3 LWTTFIDMQWRYKLLLFSATFAGTWFLFGVVWYLVAVAHGDLLELDPPANHTPCVVQVHT
       :::: :::.::::: ::.:::. :::::::..: .:  ::::   .: .:::::...: .
NP_002 LWTTVIDMKWRYKLTLFAATFVMTWFLFGVIYYAIAFIHGDLEPGEPISNHTPCIMKVDS
            60        70        80        90       100       110   

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB3 LTGAFLFSLESQTTIGYGFRYISEECPLAIVLLIAQLVLTTILEIFITGTFLAKIARPKK
       :::::::::::::::::: : :.:::: :: ::.::::.::..:::::::::::::::::
NP_002 LTGAFLFSLESQTTIGYGVRSITEECPHAIFLLVAQLVITTLIEIFITGTFLAKIARPKK
           120       130       140       150       160       170   

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB3 RAETIRFSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGENIRLNQV
       :::::.::. ::....::: ::.:.:::::::::: ::..::::::: ::::: : :::.
NP_002 RAETIKFSHCAVITKQNGKLCLVIQVANMRKSLLIQCQLSGKLLQTHVTKEGERILLNQA
           180       190       200       210       220       230   

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pF1KB3 NVTFQVDTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDL-PLRSGEGDFELVLILSGTVESTSAT
       .: :.::..:.:::::::.:::::.::::::.:: :    : .::::..:..:::::::.
NP_002 TVKFHVDSSSESPFLILPMTFYHVLDETSPLRDLTPQNLKEKEFELVVLLNATVESTSAV
           240       250       260       270       280       290   

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pF1KB3 CQVRTSYLPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPSGLRDSTVRYGDPE
       :: ::::.:::: ::.::.:..::: .:::.:::: :.:. :  ::    : :   .: :
NP_002 CQSRTSYIPEEIYWGFEFVPVVSLSKNGKYVADFSQFEQIRK--SP----DCTFYCADSE
           300       310       320       330             340       

           360         370         
pF1KB3 KLKLEESLRE--QAEKEGSALSVRISNV
       : .:::. :.  : :.:  .: .. :::
NP_002 KQQLEEKYRQEDQRERELRTLLLQQSNV
       350       360       370     




379 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 13:33:10 2016 done: Thu Nov  3 13:33:12 2016
 Total Scan time:  8.020 Total Display time:  0.040

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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