Result of FASTA (ccds) for pF1KB3644
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3644, 379 aa
  1>>>pF1KB3644 379 - 379 aa - 379 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5936+/-0.000907; mu= 14.3579+/- 0.054
 mean_var=57.8867+/-11.560, 0's: 0 Z-trim(103.9): 27  B-trim: 16 in 1/49
 Lambda= 0.168572
 statistics sampled from 7631 (7656) to 7631 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.614), E-opt: 0.2 (0.235), width:  16
 Scan time:  2.770

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1193.1 KCNJ10 gene_id:3766|Hs108|chr1          ( 379) 2452 604.8  4e-173
CCDS13656.1 KCNJ15 gene_id:3772|Hs108|chr21        ( 375) 1484 369.4 2.9e-102
CCDS8477.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11          ( 372) 1181 295.7 4.4e-80
CCDS8476.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11          ( 391) 1181 295.7 4.7e-80
CCDS11219.1 KCNJ12 gene_id:3768|Hs108|chr17        ( 433)  946 238.6 8.2e-63
CCDS74015.1 KCNJ18 gene_id:100134444|Hs108|chr17   ( 433)  938 236.6 3.2e-62
CCDS1194.1 KCNJ9 gene_id:3765|Hs108|chr1           ( 393)  922 232.7 4.3e-61
CCDS2200.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2           ( 501)  914 230.8 2.1e-60
CCDS42927.1 KCNJ6 gene_id:3763|Hs108|chr21         ( 423)  903 228.1 1.1e-59
CCDS11688.1 KCNJ2 gene_id:3759|Hs108|chr17         ( 427)  901 227.6 1.6e-59
CCDS8479.1 KCNJ5 gene_id:3762|Hs108|chr11          ( 419)  896 226.4 3.6e-59
CCDS12721.1 KCNJ14 gene_id:3770|Hs108|chr19        ( 436)  894 225.9 5.3e-59
CCDS31436.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11        ( 390)  888 224.4 1.3e-58
CCDS2498.1 KCNJ13 gene_id:3769|Hs108|chr2          ( 360)  881 222.7   4e-58
CCDS8692.1 KCNJ8 gene_id:3764|Hs108|chr12          ( 424)  828 209.9 3.5e-54
CCDS11687.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17        ( 418)  775 197.0 2.6e-50
CCDS74141.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17        ( 453)  775 197.0 2.8e-50
CCDS53606.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11        ( 303)  731 186.2 3.2e-47
CCDS13971.1 KCNJ4 gene_id:3761|Hs108|chr22         ( 445)  716 182.6 5.8e-46
CCDS58733.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2          ( 235)  582 150.0 2.1e-36


>>CCDS1193.1 KCNJ10 gene_id:3766|Hs108|chr1               (379 aa)
 initn: 2452 init1: 2452 opt: 2452  Z-score: 3221.5  bits: 604.8 E(32554): 4e-173
Smith-Waterman score: 2452; 100.0% identity (100.0% similar) in 379 aa overlap (1-379:1-379)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MTSVAKVYYSQTTQTESRPLMGPGIRRRRVLTKDGRSNVRMEHIADKRFLYLKDLWTTFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MTSVAKVYYSQTTQTESRPLMGPGIRRRRVLTKDGRSNVRMEHIADKRFLYLKDLWTTFI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 DMQWRYKLLLFSATFAGTWFLFGVVWYLVAVAHGDLLELDPPANHTPCVVQVHTLTGAFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DMQWRYKLLLFSATFAGTWFLFGVVWYLVAVAHGDLLELDPPANHTPCVVQVHTLTGAFL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 FSLESQTTIGYGFRYISEECPLAIVLLIAQLVLTTILEIFITGTFLAKIARPKKRAETIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FSLESQTTIGYGFRYISEECPLAIVLLIAQLVLTTILEIFITGTFLAKIARPKKRAETIR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 FSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGENIRLNQVNVTFQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGENIRLNQVNVTFQV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 DTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDLPLRSGEGDFELVLILSGTVESTSATCQVRTSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDLPLRSGEGDFELVLILSGTVESTSATCQVRTSY
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 LPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPSGLRDSTVRYGDPEKLKLEES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPSGLRDSTVRYGDPEKLKLEES
              310       320       330       340       350       360

              370         
pF1KB3 LREQAEKEGSALSVRISNV
       :::::::::::::::::::
CCDS11 LREQAEKEGSALSVRISNV
              370         

>>CCDS13656.1 KCNJ15 gene_id:3772|Hs108|chr21             (375 aa)
 initn: 1453 init1: 1143 opt: 1484  Z-score: 1949.3  bits: 369.4 E(32554): 2.9e-102
Smith-Waterman score: 1484; 62.9% identity (82.3% similar) in 372 aa overlap (17-379:10-375)

               10        20              30        40        50    
pF1KB3 MTSVAKVYYSQTTQTESRPLM----GPGIR--RRRVLTKDGRSNVRMEHIADKRFLYLKD
                       : ::.    : :..  : ::..:.:.::::....    .:::.:
CCDS13        MDAIHIGMSSTPLVKHTAGAGLKANRPRVMSKSGHSNVRIDKVDGIYLLYLQD
                      10        20        30        40        50   

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB3 LWTTFIDMQWRYKLLLFSATFAGTWFLFGVVWYLVAVAHGDLLELDPPANHTPCVVQVHT
       :::: :::.::::: ::.:::. :::::::..: .:  ::::   .: .:::::...: .
CCDS13 LWTTVIDMKWRYKLTLFAATFVMTWFLFGVIYYAIAFIHGDLEPGEPISNHTPCIMKVDS
            60        70        80        90       100       110   

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB3 LTGAFLFSLESQTTIGYGFRYISEECPLAIVLLIAQLVLTTILEIFITGTFLAKIARPKK
       :::::::::::::::::: : :.:::: :: ::.::::.::..:::::::::::::::::
CCDS13 LTGAFLFSLESQTTIGYGVRSITEECPHAIFLLVAQLVITTLIEIFITGTFLAKIARPKK
           120       130       140       150       160       170   

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB3 RAETIRFSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGENIRLNQV
       :::::.::. ::....::: ::.:.:::::::::: ::..::::::: ::::: : :::.
CCDS13 RAETIKFSHCAVITKQNGKLCLVIQVANMRKSLLIQCQLSGKLLQTHVTKEGERILLNQA
           180       190       200       210       220       230   

          240       250       260        270       280       290   
pF1KB3 NVTFQVDTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDL-PLRSGEGDFELVLILSGTVESTSAT
       .: :.::..:.:::::::.:::::.::::::.:: :    : .::::..:..:::::::.
CCDS13 TVKFHVDSSSESPFLILPMTFYHVLDETSPLRDLTPQNLKEKEFELVVLLNATVESTSAV
           240       250       260       270       280       290   

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB3 CQVRTSYLPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPSGLRDSTVRYGDPE
       :: ::::.:::: ::.::.:..::: .:::.:::: :.:. :  ::    : :   .: :
CCDS13 CQSRTSYIPEEIYWGFEFVPVVSLSKNGKYVADFSQFEQIRK--SP----DCTFYCADSE
           300       310       320       330             340       

           360         370         
pF1KB3 KLKLEESLRE--QAEKEGSALSVRISNV
       : .:::. :.  : :.:  .: .. :::
CCDS13 KQQLEEKYRQEDQRERELRTLLLQQSNV
       350       360       370     

>>CCDS8477.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11               (372 aa)
 initn: 1132 init1: 862 opt: 1181  Z-score: 1551.1  bits: 295.7 E(32554): 4.4e-80
Smith-Waterman score: 1181; 53.4% identity (82.9% similar) in 322 aa overlap (20-339:13-334)

               10        20        30        40         50         
pF1KB3 MTSVAKVYYSQTTQTESRPLMGPGIRRRRVLTKDGRSNVRMEHI-ADKRFLYLKDLWTTF
                          ..: . .: :...:::: :... .. :..::... :.::: 
CCDS84        MFKHLRKWVVTRFFGHSRQRARLVSKDGRCNIEFGNVEAQSRFIFFVDIWTTV
                      10        20        30        40        50   

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB3 IDMQWRYKLLLFSATFAGTWFLFGVVWYLVAVAHGDLLELDPPANHTPCVVQVHTLTGAF
       .:..::::. .: ..: :.::.::..:: ::  : :: :. : ::::::: ... ::.::
CCDS84 LDLKWRYKMTIFITAFLGSWFFFGLLWYAVAYIHKDLPEFHPSANHTPCVENINGLTSAF
            60        70        80        90       100       110   

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB3 LFSLESQTTIGYGFRYISEECPLAIVLLIAQLVLTTILEIFITGTFLAKIARPKKRAETI
       :::::.:.::::::: ..:.:  :: ::: : .: .:.. :. :..::::.::::::.::
CCDS84 LFSLETQVTIGYGFRCVTEQCATAIFLLIFQSILGVIINSFMCGAILAKISRPKKRAKTI
           120       130       140       150       160       170   

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB3 RFSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGENIRLNQVNVTFQ
        ::..::.....:: ::.:::::.::::::: .. ::::.:  : :::.: :.:.:..: 
CCDS84 TFSKNAVISKRGGKLCLLIRVANLRKSLLIGSHIYGKLLKTTVTPEGETIILDQININFV
           180       190       200       210       220       230   

     240       250       260       270        280       290        
pF1KB3 VDTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDLPLRSG-EGDFELVLILSGTVESTSATCQVRT
       ::..... :.: :::.:::.:..::.  .  ..  . :::::..:.::::::::::::::
CCDS84 VDAGNENLFFISPLTIYHVIDHNSPFFHMAAETLLQQDFELVVFLDGTVESTSATCQVRT
           240       250       260       270       280       290   

      300       310       320       330       340       350        
pF1KB3 SYLPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPSGLRDSTVRYGDPEKLKLE
       ::.:::.::::.:.: .: .  ::: .::  :...:.: .:                   
CCDS84 SYVPEEVLWGYRFAPIVSKTKEGKYRVDFHNFSKTVEVETPHCAMCLYNEKDVRARMKRG
           300       310       320       330       340       350   

      360       370         
pF1KB3 ESLREQAEKEGSALSVRISNV
                            
CCDS84 YDNPNFILSEVNETDDTKM  
           360       370    

>>CCDS8476.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11               (391 aa)
 initn: 1132 init1: 862 opt: 1181  Z-score: 1550.8  bits: 295.7 E(32554): 4.7e-80
Smith-Waterman score: 1181; 53.4% identity (82.9% similar) in 322 aa overlap (20-339:32-353)

                          10        20        30        40         
pF1KB3            MTSVAKVYYSQTTQTESRPLMGPGIRRRRVLTKDGRSNVRMEHI-ADKR
                                     ..: . .: :...:::: :... .. :..:
CCDS84 NASSRNVFDTLIRVLTESMFKHLRKWVVTRFFGHSRQRARLVSKDGRCNIEFGNVEAQSR
              10        20        30        40        50        60 

       50        60        70        80        90       100        
pF1KB3 FLYLKDLWTTFIDMQWRYKLLLFSATFAGTWFLFGVVWYLVAVAHGDLLELDPPANHTPC
       :... :.::: .:..::::. .: ..: :.::.::..:: ::  : :: :. : ::::::
CCDS84 FIFFVDIWTTVLDLKWRYKMTIFITAFLGSWFFFGLLWYAVAYIHKDLPEFHPSANHTPC
              70        80        90       100       110       120 

      110       120       130       140       150       160        
pF1KB3 VVQVHTLTGAFLFSLESQTTIGYGFRYISEECPLAIVLLIAQLVLTTILEIFITGTFLAK
       : ... ::.:::::::.:.::::::: ..:.:  :: ::: : .: .:.. :. :..:::
CCDS84 VENINGLTSAFLFSLETQVTIGYGFRCVTEQCATAIFLLIFQSILGVIINSFMCGAILAK
             130       140       150       160       170       180 

      170       180       190       200       210       220        
pF1KB3 IARPKKRAETIRFSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGEN
       :.::::::.:: ::..::.....:: ::.:::::.::::::: .. ::::.:  : :::.
CCDS84 ISRPKKRAKTITFSKNAVISKRGGKLCLLIRVANLRKSLLIGSHIYGKLLKTTVTPEGET
             190       200       210       220       230       240 

      230       240       250       260       270        280       
pF1KB3 IRLNQVNVTFQVDTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDLPLRSG-EGDFELVLILSGTV
       : :.:.:..: ::..... :.: :::.:::.:..::.  .  ..  . :::::..:.:::
CCDS84 IILDQININFVVDAGNENLFFISPLTIYHVIDHNSPFFHMAAETLLQQDFELVVFLDGTV
             250       260       270       280       290       300 

       290       300       310       320       330       340       
pF1KB3 ESTSATCQVRTSYLPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPSGLRDSTV
       :::::::::::::.:::.::::.:.: .: .  ::: .::  :...:.: .:        
CCDS84 ESTSATCQVRTSYVPEEVLWGYRFAPIVSKTKEGKYRVDFHNFSKTVEVETPHCAMCLYN
             310       320       330       340       350       360 

       350       360       370         
pF1KB3 RYGDPEKLKLEESLREQAEKEGSALSVRISNV
                                       
CCDS84 EKDVRARMKRGYDNPNFILSEVNETDDTKM  
             370       380       390   

>>CCDS11219.1 KCNJ12 gene_id:3768|Hs108|chr17             (433 aa)
 initn: 551 init1: 551 opt: 946  Z-score: 1241.2  bits: 238.6 E(32554): 8.2e-63
Smith-Waterman score: 946; 45.0% identity (76.4% similar) in 313 aa overlap (27-338:43-353)

                   10        20        30        40        50      
pF1KB3     MTSVAKVYYSQTTQTESRPLMGPGIRRRRVLTKDGRSNVRMEHIADKRFLYLKDLW
                                     : : . :.:. :... .. .:   :: :..
CCDS11 VSSEEDGLHLVTMSGANGFGNGKVHTRRRCRNRFVKKNGQCNIEFANMDEKSQRYLADMF
             20        30        40        50        60        70  

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB3 TTFIDMQWRYKLLLFSATFAGTWFLFGVVWYLVAVAHGDLLELDPPANHTPCVVQVHTLT
       :: .:..::: ::.:: .: ..:.:::......::::::: :     ..::::.::: . 
CCDS11 TTCVDIRWRYMLLIFSLAFLASWLLFGIIFWVIAVAHGDL-EPAEGRGRTPCVMQVHGFM
             80        90       100       110        120       130 

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB3 GAFLFSLESQTTIGYGFRYISEECPLAIVLLIAQLVLTTILEIFITGTFLAKIARPKKRA
       .:::::.:.:::::::.: ..::::.:. ...:: ..  :.. :. :...::.:::::::
CCDS11 AAFLFSIETQTTIGYGLRCVTEECPVAVFMVVAQSIVGCIIDSFMIGAIMAKMARPKKRA
             140       150       160       170       180       190 

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB3 ETIRFSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGENIRLNQVNV
       .:. ::..:::: ..:: ::: ::.:.::: ..  .: ..:.. . :.::: : :.:...
CCDS11 QTLLFSHNAVVALRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVEAHVRAQLIKPRVTEEGEYIPLDQIDI
             200       210       220       230       240       250 

        240       250       260       270        280       290     
pF1KB3 TFQVDTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDLPLRSGE-GDFELVLILSGTVESTSATCQ
           : . :  ::. :.:. : .::.:::  .  .. :  :::.:.:: : ::.:. : :
CCDS11 DVGFDKGLDRIFLVSPITILHEIDEASPLFGISRQDLETDDFEIVVILEGMVEATAMTTQ
             260       270       280       290       300       310 

         300       310       320       330       340       350     
pF1KB3 VRTSYLPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPSGLRDSTVRYGDPEKL
       .:.::: .:::::..: :.. .  ...:  :.: : .. .: :                 
CCDS11 ARSSYLANEILWGHRFEPVL-FEEKNQYKIDYSHFHKTYEVPSTPRCSAKDLVENKFLLP
             320       330        340       350       360       370

         360       370                                             
pF1KB3 KLEESLREQAEKEGSALSVRISNV                                    
                                                                   
CCDS11 SANSFCYENELAFLSRDEEDEADGDQDGRSRDGLSPQARHDFDRLQAGGGVLEQRPYRRE
              380       390       400       410       420       430

>>CCDS74015.1 KCNJ18 gene_id:100134444|Hs108|chr17        (433 aa)
 initn: 537 init1: 537 opt: 938  Z-score: 1230.6  bits: 236.6 E(32554): 3.2e-62
Smith-Waterman score: 938; 45.1% identity (75.6% similar) in 315 aa overlap (27-338:43-353)

                   10        20        30        40        50      
pF1KB3     MTSVAKVYYSQTTQTESRPLMGPGIRRRRVLTKDGRSNVRMEHIADKRFLYLKDLW
                                     : : . :.:. :. . .. .:   :: :..
CCDS74 VSLEEDGLHLVTMSGANGFGNGKVHTRRRCRNRFVKKNGQCNIAFANMDEKSQRYLADMF
             20        30        40        50        60        70  

         60        70        80        90       100         110    
pF1KB3 TTFIDMQWRYKLLLFSATFAGTWFLFGVVWYLVAVAHGDLLELDPPANH--TPCVVQVHT
       :: .:..::: ::.:: .: ..:.::::.....:::::::   .:  .:  ::::.::: 
CCDS74 TTCVDIRWRYMLLIFSLAFLASWLLFGVIFWVIAVAHGDL---EPAEGHGRTPCVMQVHG
             80        90       100       110          120         

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB3 LTGAFLFSLESQTTIGYGFRYISEECPLAIVLLIAQLVLTTILEIFITGTFLAKIARPKK
       . .:::::.:.:::::::.: ..::: .:. ...:: ..  :.. :. :...::.:::::
CCDS74 FMAAFLFSIETQTTIGYGLRCVTEECLVAVFMVVAQSIVGCIIDSFMIGAIMAKMARPKK
     130       140       150       160       170       180         

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB3 RAETIRFSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGENIRLNQV
       ::.:. ::..:::: ..:: ::: ::.:.::: ..  .: ..:.. . :.::: : :.:.
CCDS74 RAQTLLFSHNAVVALRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVEAHVRAQLIKPRVTEEGEYIPLDQI
     190       200       210       220       230       240         

          240       250       260       270        280       290   
pF1KB3 NVTFQVDTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDLPLRSGE-GDFELVLILSGTVESTSAT
       ..    : . :  ::. :.:. : .::.:::  .  .. :  :::.:.:: : ::.:. :
CCDS74 DIDVGFDKGLDRIFLVSPITILHEIDEASPLFGISRQDLETDDFEIVVILEGMVEATAMT
     250       260       270       280       290       300         

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB3 CQVRTSYLPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPSGLRDSTVRYGDPE
        :.:.::: .:::::..: :.. .  ...:  :.: : .. .: :               
CCDS74 TQARSSYLANEILWGHRFEPVL-FEEKNQYKIDYSHFHKTYEVPSTPRCSAKDLVENKFL
     310       320       330        340       350       360        

           360       370                                           
pF1KB3 KLKLEESLREQAEKEGSALSVRISNV                                  
                                                                   
CCDS74 LPSANSFCYENELAFLSRDEEDEADGDQDGRSRDGLSPQARHDFDRLQAGGGVLEQRPYR
      370       380       390       400       410       420        

>>CCDS1194.1 KCNJ9 gene_id:3765|Hs108|chr1                (393 aa)
 initn: 711 init1: 495 opt: 922  Z-score: 1210.3  bits: 232.7 E(32554): 4.3e-61
Smith-Waterman score: 922; 41.3% identity (75.4% similar) in 349 aa overlap (27-370:21-366)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MTSVAKVYYSQTTQTESRPLMGPGIRRRRVLTKDGRSNVRMEHIADKRFLYLKDLWTTFI
                                 :.: . :::: ::.. .. .  . :: ::.::..
CCDS11       MAQENAAFSPGQEEPPRRRGRQRYVEKDGRCNVQQGNVRET-YRYLTDLFTTLV
                     10        20        30        40         50   

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 DMQWRYKLLLFSATFAGTWFLFGVVWYLVAVAHGDLLELDPPANHTPCVVQVHTLTGAFL
       :.::: .::.:  ..: ::..::..:.:.: ..::: .:.  :  :::: ... ...:::
CCDS11 DLQWRLSLLFFVLAYALTWLFFGAIWWLIAYGRGDLEHLEDTA-WTPCVNNLNGFVAAFL
            60        70        80        90        100       110  

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 FSLESQTTIGYGFRYISEECPLAIVLLIAQLVLTTILEIFITGTFLAKIARPKKRAETIR
       ::.:..:::::: : :...:: .::::. : .: .... :..: ...::..:.::: :. 
CCDS11 FSIETETTIGYGHRVITDQCPEGIVLLLLQAILGSMVNAFMVGCMFVKISQPNKRAATLV
            120       130       140       150       160       170  

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 FSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGENIRLNQVNVTFQV
       ::.::::. ..:. :::.::...:.: ..  .. .::....:: ::: : :.:....   
CCDS11 FSSHAVVSLRDGRLCLMFRVGDLRSSHIVEASIRAKLIRSRQTLEGEFIPLHQTDLSVGF
            180       190       200       210       220       230  

              250       260       270        280       290         
pF1KB3 DTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDLPLRSGE-GDFELVLILSGTVESTSATCQVRTS
       ::..:  ::. ::.. : .: .::. .   :. :  :::.:.:: : ::.:. :::.:.:
CCDS11 DTGDDRLFLVSPLVISHEIDAASPFWEASRRALERDDFEIVVILEGMVEATGMTCQARSS
            240       250       260       270       280       290  

     300       310       320       330       340           350     
pF1KB3 YLPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPSG----LRDSTVRYGDPEKL
       :: .:.:::..:: ...:  .: : .:.. : .. .: .::     : ....:       
CCDS11 YLVDEVLWGHRFTSVLTLE-DGFYEVDYASFHETFEVPTPSCSARELAEAAARLDAHLYW
            300       310        320       330       340       350 

         360       370                           
pF1KB3 KLEESLREQAEKEGSALSVRISNV                  
       ..   : :..:.::.                           
CCDS11 SIPSRLDEKVEEEGAGEGAGGEAGADKEQNGCLPPPESESKV
             360       370       380       390   

>>CCDS2200.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2                (501 aa)
 initn: 910 init1: 536 opt: 914  Z-score: 1198.0  bits: 230.8 E(32554): 2.1e-60
Smith-Waterman score: 914; 42.1% identity (77.4% similar) in 318 aa overlap (23-339:39-354)

                       10        20        30        40        50  
pF1KB3         MTSVAKVYYSQTTQTESRPLMGPGIRRRRVLTKDGRSNVRMEHIADKRFLYL
                                     :  .:.: . :.:: ::.  .....   ::
CCDS22 GDDYQVVTTSSSGSGLQPQGPGQDPQQQLVPKKKRQRFVDKNGRCNVQHGNLGSETSRYL
       10        20        30        40        50        60        

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB3 KDLWTTFIDMQWRYKLLLFSATFAGTWFLFGVVWYLVAVAHGDLLELDPPANHTPCVVQV
       .::.::..:..::..:..:  :.. .:.... .:...: ..::: .    .:.::::..:
CCDS22 SDLFTTLVDLKWRWNLFIFILTYTVAWLFMASMWWVIAYTRGDLNKAHV-GNYTPCVANV
       70        80        90       100       110        120       

            120       130       140       150       160       170  
pF1KB3 HTLTGAFLFSLESQTTIGYGFRYISEECPLAIVLLIAQLVLTTILEIFITGTFLAKIARP
       ... .:::: .:...:::::.:::...:: .:.:.. : .: .:.. :. : .. :...:
CCDS22 YNFPSAFLFFIETEATIGYGYRYITDKCPEGIILFLFQSILGSIVDAFLIGCMFIKMSQP
       130       140       150       160       170       180       

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB3 KKRAETIRFSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGENIRLN
       ::::::. ::.:::.. ..::  ::.::.:.:.: ... :.  :::...:: ::: . :.
CCDS22 KKRAETLMFSEHAVISMRDGKLTLMFRVGNLRNSHMVSAQIRCKLLKSRQTPEGEFLPLD
       190       200       210       220       230       240       

            240       250       260       270        280       290 
pF1KB3 QVNVTFQVDTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDLPLRSGEGD-FELVLILSGTVESTS
       :...    .:..:. ::. :::. ::.:  ::. ::  :: . . ::.:.:: : ::.:.
CCDS22 QLELDVGFSTGADQLFLVSPLTICHVIDAKSPFYDLSQRSMQTEQFEIVVILEGIVETTG
       250       260       270       280       290       300       

             300       310       320       330       340       350 
pF1KB3 ATCQVRTSYLPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPSGLRDSTVRYGD
        :::.::::  .:.:::..: :.:::   : . .:.: :  . .: .:            
CCDS22 MTCQARTSYTEDEVLWGHRFFPVISLEE-GFFKVDYSQFHATFEVPTPPYSVKEQEEMLL
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CCDS22 MSSPLIAPAITNSKERHNSVECLDGLDDITTKLPSKLQKITGREDFPKKLLRMSSTTSEK
        370       380       390       400       410       420      

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                                     .: . :::. ::.  .. .  . :: :..:
CCDS42 PVAIHQPKLPKQARDDLPRHISRDRTKRKIQRYVRKDGKCNVHHGNVRET-YRYLTDIFT
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CCDS42 TLVDLKWRFNLLIFVMVYTVTWLFFGMIWWLIAYIRGDMDHIEDPS-WTPCVTNLNGFVS
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       :::::.:..::::::.: :...:: .:.::. : :: .:.. :..: ...::..::::::
CCDS42 AFLFSIETETTIGYGYRVITDKCPEGIILLLIQSVLGSIVNAFMVGCMFVKISQPKKRAE
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pF1KB3 TIRFSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGENIRLNQVNVT
       :. :: :::.. ..:: :::.::...:.: ..  .. .::....::.::: : :::....
CCDS42 TLVFSTHAVISMRDGKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIKSKQTSEGEFIPLNQTDIN
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pF1KB3 FQVDTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDLP-LRSGEGDFELVLILSGTVESTSATCQV
           :..:  ::. :: . : ... ::. ..   .  . ..:.:.:: : ::.:. :::.
CCDS42 VGYYTGDDRLFLVSPLIISHEINQQSPFWEISKAQLPKEELEIVVILEGMVEATGMTCQA
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pF1KB3 RTSYLPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPS----GLRDSTVRYGDP
       :.::.  ::::::.:::...:  .: : .:.. : .. ....::     : . . :   :
CCDS42 RSSYITSEILWGYRFTPVLTLE-DGFYEVDYNSFHETYETSTPSLSAKELAELASRAELP
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pF1KB3 EKLKLEESLREQAEKEGSALSVRISNV                
        . ..  .: ..:: :                           
CCDS42 LSWSVSSKLNQHAELETEEEEKNLEEQTERNGDVANLENESKV
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>>CCDS11688.1 KCNJ2 gene_id:3759|Hs108|chr17              (427 aa)
 initn: 694 init1: 553 opt: 901  Z-score: 1182.1  bits: 227.6 E(32554): 1.6e-59
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pF1KB3     MTSVAKVYYSQTTQTESRPLMGPGIRRRRVLTKDGRSNVRMEHIADKRFLYLKDLW
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CCDS11 SEEDGMKLATMAVANGFGNGKSKVHTRQQCRSRFVKKDGHCNVQFINVGEKGQRYLADIF
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pF1KB3 TTFIDMQWRYKLLLFSATFAGTWFLFGVVWYLVAVAHGDLLELDPPANHTPCVVQVHTLT
       :: .:..::. :..:  .:. .:..:: :..:.:. :::   ::   .   :: .:...:
CCDS11 TTCVDIRWRWMLVIFCLAFVLSWLFFGCVFWLIALLHGD---LDASKEGKACVSEVNSFT
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CCDS11 AAFLFSIETQTTIGYGFRCVTDECPIAVFMVVFQSIVGCIIDAFIIGAVMAKMAKPKKRN
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CCDS11 ETLVFSHNAVIAMRDGKLCLMWRVGNLRKSHLVEAHVRAQLLKSRITSEGEYIPLDQIDI
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pF1KB3 TFQVDTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDLPLRS-GEGDFELVLILSGTVESTSATCQ
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CCDS11 NVGFDSGIDRIFLVSPITIVHEIDEDSPLYDLSKQDIDNADFEIVVILEGMVEATAMTTQ
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CCDS11 CRSSYLANEILWGHRYEPVL-FEEKHYYKVDYSRFHKTYEVPNTPLCSARDLAEKKYILS
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pF1KB3 KLEESLREQAEKEGSALSVRISNV                                  
                                                                 
CCDS11 NANSFCYENEVALTSKEEDDSENGVPESTSTDTPPDIDLHNQASVPLEPRPLRRESEI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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