Result of FASTA (ccds) for pF1KB3467
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3467, 662 aa
  1>>>pF1KB3467 662 - 662 aa - 662 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6868+/-0.00113; mu= 8.8188+/- 0.068
 mean_var=165.3866+/-34.602, 0's: 0 Z-trim(108.1): 92  B-trim: 59 in 1/49
 Lambda= 0.099730
 statistics sampled from 9910 (10001) to 9910 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.657), E-opt: 0.2 (0.307), width:  16
 Scan time:  3.890

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX          ( 662) 4462 654.8 1.1e-187
CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY          ( 660) 4131 607.2 2.3e-173
CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX          ( 646) 4128 606.8 3.1e-173
CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5          ( 575) 1160 179.7   1e-44
CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5          ( 690) 1160 179.7 1.2e-44
CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5          ( 704) 1160 179.7 1.2e-44
CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5           ( 724) 1160 179.8 1.2e-44
CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17          ( 614)  990 155.2 2.5e-37
CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17          ( 614)  989 155.1 2.7e-37
CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22        ( 731)  989 155.2 3.1e-37
CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22        ( 729)  983 154.3 5.6e-37
CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5          ( 622)  851 135.2 2.6e-31
CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5          (1031)  834 133.0 2.1e-30
CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5          (1032)  834 133.0 2.1e-30
CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6          ( 648)  814 129.9 1.1e-29
CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17        ( 938)  767 123.3 1.5e-27
CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX        ( 631)  756 121.6 3.4e-27
CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17        ( 411)  655 106.9 5.8e-23
CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1         ( 619)  648 106.0 1.6e-22
CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12         ( 455)  606 99.9 8.4e-21
CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20        ( 796)  599 99.1 2.6e-20
CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3          ( 407)  573 95.1 2.1e-19
CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10         ( 737)  575 95.6 2.7e-19
CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17        ( 406)  569 94.5 3.1e-19
CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10         ( 715)  566 94.3 6.4e-19
CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10         ( 783)  566 94.3 6.8e-19
CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17        ( 599)  553 92.4   2e-18
CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6          ( 428)  522 87.8 3.5e-17
CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19       ( 427)  519 87.4 4.7e-17
CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11          ( 483)  519 87.4 5.1e-17
CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12        ( 881)  516 87.2 1.1e-16
CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12        ( 882)  516 87.2 1.1e-16
CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19        ( 483)  504 85.2 2.3e-16
CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2           ( 670)  475 81.2 5.3e-15
CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11          ( 875)  471 80.7 9.7e-15
CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1           ( 824)  432 75.1 4.5e-13
CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 370)  423 73.5   6e-13
CCDS32475.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 448)  423 73.6   7e-13
CCDS58478.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 453)  423 73.6   7e-13
CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 479)  423 73.6 7.3e-13
CCDS82009.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16       ( 447)  422 73.4 7.7e-13
CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16       ( 478)  422 73.4 8.1e-13
CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11        ( 369)  420 73.1 8.1e-13
CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11        ( 483)  420 73.1 9.9e-13
CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17        ( 347)  384 67.9 2.8e-11


>>CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX               (662 aa)
 initn: 4462 init1: 4462 opt: 4462  Z-score: 3483.1  bits: 654.8 E(32554): 1.1e-187
Smith-Waterman score: 4462; 100.0% identity (100.0% similar) in 662 aa overlap (1-662:1-662)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MSHVAVENALGLDQQFAGLDLNSSDNQSGGSTASKGRYIPPHLRNREATKGFYDKDSSGW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MSHVAVENALGLDQQFAGLDLNSSDNQSGGSTASKGRYIPPHLRNREATKGFYDKDSSGW
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 SSSKDKDAYSSFGSRSDSRGKSSFFSDRGSGSRGRFDDRGRSDYDGIGSRGDRSGFGKFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSSKDKDAYSSFGSRSDSRGKSSFFSDRGSGSRGRFDDRGRSDYDGIGSRGDRSGFGKFE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 RGGNSRWCDKSDEDDWSKPLPPSERLEQELFSGGNTGINFEKYDDIPVEATGNNCPPHIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RGGNSRWCDKSDEDDWSKPLPPSERLEQELFSGGNTGINFEKYDDIPVEATGNNCPPHIE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 SFSDVEMGEIIMGNIELTRYTRPTPVQKHAIPIIKEKRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SFSDVEMGEIIMGNIELTRYTRPTPVQKHAIPIIKEKRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 QIYSDGPGEALRAMKENGRYGRRKQYPISLVLAPTRELAVQIYEEARKFSYRSRVRPCVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QIYSDGPGEALRAMKENGRYGRRKQYPISLVLAPTRELAVQIYEEARKFSYRSRVRPCVV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 YGGADIGQQIRDLERGCHLLVATPGRLVDMMERGKIGLDFCKYLVLDEADRMLDMGFEPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YGGADIGQQIRDLERGCHLLVATPGRLVDMMERGKIGLDFCKYLVLDEADRMLDMGFEPQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 IRRIVEQDTMPPKGVRHTMMFSATFPKEIQMLARDFLDEYIFLAVGRVGSTSENITQKVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IRRIVEQDTMPPKGVRHTMMFSATFPKEIQMLARDFLDEYIFLAVGRVGSTSENITQKVV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 WVEESDKRSFLLDLLNATGKDSLTLVFVETKKGADSLEDFLYHEGYACTSIHGDRSQRDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 WVEESDKRSFLLDLLNATGKDSLTLVFVETKKGADSLEDFLYHEGYACTSIHGDRSQRDR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 EEALHQFRSGKSPILVATAVAARGLDISNVKHVINFDLPSDIEEYVHRIGRTGRVGNLGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EEALHQFRSGKSPILVATAVAARGLDISNVKHVINFDLPSDIEEYVHRIGRTGRVGNLGL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 ATSFFNERNINITKDLLDLLVEAKQEVPSWLENMAYEHHYKGSSRGRSKSSRFSGGFGAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ATSFFNERNINITKDLLDLLVEAKQEVPSWLENMAYEHHYKGSSRGRSKSSRFSGGFGAR
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 DYRQSSGASSSSFSSSRASSSRSGGGGHGSSRGFGGGGYGGFYNSDGYGGNYNSQGVDWW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DYRQSSGASSSSFSSSRASSSRSGGGGHGSSRGFGGGGYGGFYNSDGYGGNYNSQGVDWW
              610       620       630       640       650       660

         
pF1KB3 GN
       ::
CCDS43 GN
         

>>CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY               (660 aa)
 initn: 4132 init1: 3554 opt: 4131  Z-score: 3225.8  bits: 607.2 E(32554): 2.3e-173
Smith-Waterman score: 4131; 92.2% identity (98.0% similar) in 663 aa overlap (1-662:1-660)

               10        20        30         40        50         
pF1KB3 MSHVAVENALGLDQQFAGLDLNSSDNQSGG-STASKGRYIPPHLRNREATKGFYDKDSSG
       ::::.:.:   ::::.:.::::: ..:::: ::::::::::::::::::.:::.::::::
CCDS14 MSHVVVKNDPELDQQLANLDLNS-EKQSGGASTASKGRYIPPHLRNREASKGFHDKDSSG
               10        20         30        40        50         

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB3 WSSSKDKDAYSSFGSRSDSRGKSSFFSDRGSGSRGRFDDRGRSDYDGIGSRGDRSGFGKF
       :: ::::::::::::: ::::: ..::.:::::::::::::::::::::.: .: :::.:
CCDS14 WSCSKDKDAYSSFGSR-DSRGKPGYFSERGSGSRGRFDDRGRSDYDGIGNR-ERPGFGRF
      60        70         80        90       100        110       

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB3 ERGGNSRWCDKSDEDDWSKPLPPSERLEQELFSGGNTGINFEKYDDIPVEATGNNCPPHI
       ::.:.::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS14 ERSGHSRWCDKSVEDDWSKPLPPSERLEQELFSGGNTGINFEKYDDIPVEATGSNCPPHI
       120       130       140       150       160       170       

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB3 ESFSDVEMGEIIMGNIELTRYTRPTPVQKHAIPIIKEKRDLMACAQTGSGKTAAFLLPIL
       :.:::..::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS14 ENFSDIDMGEIIMGNIELTRYTRPTPVQKHAIPIIKGKRDLMACAQTGSGKTAAFLLPIL
       180       190       200       210       220       230       

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB3 SQIYSDGPGEALRAMKENGRYGRRKQYPISLVLAPTRELAVQIYEEARKFSYRSRVRPCV
       ::::.:::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SQIYTDGPGEALKAVKENGRYGRRKQYPISLVLAPTRELAVQIYEEARKFSYRSRVRPCV
       240       250       260       270       280       290       

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB3 VYGGADIGQQIRDLERGCHLLVATPGRLVDMMERGKIGLDFCKYLVLDEADRMLDMGFEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VYGGADIGQQIRDLERGCHLLVATPGRLVDMMERGKIGLDFCKYLVLDEADRMLDMGFEP
       300       310       320       330       340       350       

     360       370       380       390       400       410         
pF1KB3 QIRRIVEQDTMPPKGVRHTMMFSATFPKEIQMLARDFLDEYIFLAVGRVGSTSENITQKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QIRRIVEQDTMPPKGVRHTMMFSATFPKEIQMLARDFLDEYIFLAVGRVGSTSENITQKV
       360       370       380       390       400       410       

     420       430       440       450       460       470         
pF1KB3 VWVEESDKRSFLLDLLNATGKDSLTLVFVETKKGADSLEDFLYHEGYACTSIHGDRSQRD
       ::::. ::::::::.:.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VWVEDLDKRSFLLDILGATGSDSLTLVFVETKKGADSLEDFLYHEGYACTSIHGDRSQRD
       420       430       440       450       460       470       

     480       490       500       510       520       530         
pF1KB3 REEALHQFRSGKSPILVATAVAARGLDISNVKHVINFDLPSDIEEYVHRIGRTGRVGNLG
       :::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 REEALHQFRSGKSPILVATAVAARGLDISNVRHVINFDLPSDIEEYVHRIGRTGRVGNLG
       480       490       500       510       520       530       

     540       550       560       570       580       590         
pF1KB3 LATSFFNERNINITKDLLDLLVEAKQEVPSWLENMAYEHHYKGSSRGRSKSSRFSGGFGA
       ::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::::::
CCDS14 LATSFFNEKNMNITKDLLDLLVEAKQEVPSWLENMAYEHHYKGGSRGRSKSNRFSGGFGA
       540       550       560       570       580       590       

     600       610       620       630       640       650         
pF1KB3 RDYRQSSGASSSSFSSSRASSSRSGGGGHGSSRGFGGGGYGGFYNSDGYGGNYNSQGVDW
       ::::::::.:::.:..::.:::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RDYRQSSGSSSSGFGASRGSSSRSGGGGYGNSRGFGGGGYGGFYNSDGYGGNYNSQGVDW
       600       610       620       630       640       650       

     660  
pF1KB3 WGN
       :::
CCDS14 WGN
       660

>>CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX               (646 aa)
 initn: 4128 init1: 4128 opt: 4128  Z-score: 3223.6  bits: 606.8 E(32554): 3.1e-173
Smith-Waterman score: 4300; 97.4% identity (97.6% similar) in 662 aa overlap (1-662:1-646)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MSHVAVENALGLDQQFAGLDLNSSDNQSGGSTASKGRYIPPHLRNREATKGFYDKDSSGW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::.                :::::::::
CCDS55 MSHVAVENALGLDQQFAGLDLNSSDNQSGGSTASS----------------FYDKDSSGW
               10        20        30                        40    

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 SSSKDKDAYSSFGSRSDSRGKSSFFSDRGSGSRGRFDDRGRSDYDGIGSRGDRSGFGKFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SSSKDKDAYSSFGSRSDSRGKSSFFSDRGSGSRGRFDDRGRSDYDGIGSRGDRSGFGKFE
           50        60        70        80        90       100    

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 RGGNSRWCDKSDEDDWSKPLPPSERLEQELFSGGNTGINFEKYDDIPVEATGNNCPPHIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RGGNSRWCDKSDEDDWSKPLPPSERLEQELFSGGNTGINFEKYDDIPVEATGNNCPPHIE
          110       120       130       140       150       160    

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 SFSDVEMGEIIMGNIELTRYTRPTPVQKHAIPIIKEKRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SFSDVEMGEIIMGNIELTRYTRPTPVQKHAIPIIKEKRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILS
          170       180       190       200       210       220    

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 QIYSDGPGEALRAMKENGRYGRRKQYPISLVLAPTRELAVQIYEEARKFSYRSRVRPCVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QIYSDGPGEALRAMKENGRYGRRKQYPISLVLAPTRELAVQIYEEARKFSYRSRVRPCVV
          230       240       250       260       270       280    

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 YGGADIGQQIRDLERGCHLLVATPGRLVDMMERGKIGLDFCKYLVLDEADRMLDMGFEPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YGGADIGQQIRDLERGCHLLVATPGRLVDMMERGKIGLDFCKYLVLDEADRMLDMGFEPQ
          290       300       310       320       330       340    

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 IRRIVEQDTMPPKGVRHTMMFSATFPKEIQMLARDFLDEYIFLAVGRVGSTSENITQKVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IRRIVEQDTMPPKGVRHTMMFSATFPKEIQMLARDFLDEYIFLAVGRVGSTSENITQKVV
          350       360       370       380       390       400    

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 WVEESDKRSFLLDLLNATGKDSLTLVFVETKKGADSLEDFLYHEGYACTSIHGDRSQRDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 WVEESDKRSFLLDLLNATGKDSLTLVFVETKKGADSLEDFLYHEGYACTSIHGDRSQRDR
          410       420       430       440       450       460    

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 EEALHQFRSGKSPILVATAVAARGLDISNVKHVINFDLPSDIEEYVHRIGRTGRVGNLGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EEALHQFRSGKSPILVATAVAARGLDISNVKHVINFDLPSDIEEYVHRIGRTGRVGNLGL
          470       480       490       500       510       520    

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 ATSFFNERNINITKDLLDLLVEAKQEVPSWLENMAYEHHYKGSSRGRSKSSRFSGGFGAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ATSFFNERNINITKDLLDLLVEAKQEVPSWLENMAYEHHYKGSSRGRSKSSRFSGGFGAR
          530       540       550       560       570       580    

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 DYRQSSGASSSSFSSSRASSSRSGGGGHGSSRGFGGGGYGGFYNSDGYGGNYNSQGVDWW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DYRQSSGASSSSFSSSRASSSRSGGGGHGSSRGFGGGGYGGFYNSDGYGGNYNSQGVDWW
          590       600       610       620       630       640    

         
pF1KB3 GN
       ::
CCDS55 GN
         

>>CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5               (575 aa)
 initn: 1283 init1: 927 opt: 1160  Z-score: 916.4  bits: 179.7 E(32554): 1e-44
Smith-Waterman score: 1519; 47.2% identity (72.1% similar) in 570 aa overlap (62-618:14-565)

              40        50        60        70        80         90
pF1KB3 TASKGRYIPPHLRNREATKGFYDKDSSGWSSSKDKDAYSSFGSRSDSRGKSSFFSDRG-S
                                     ::.: .   . .   ..:: ...  :.  .
CCDS54                  MGSRNLFLTNSPESSNDCEDNPTRNRGFSKRGDNDLDPDECMQ
                                10        20        30        40   

              100       110           120       130       140      
pF1KB3 GSRGRFDDRGRSDYDGIGSRGD----RSGFGKFERGGNSRWCDKSDEDDWSKPL-----P
        . : : .: :   .: :. ::    ::: :. :: . .   . .. .: . :      :
CCDS54 RTGGLFGSR-RPVLSGTGN-GDTSQSRSGSGS-ERDSWKSEAEGGESSDTQGPKVTYIPP
            50         60         70         80        90       100

             150       160       170       180       190       200 
pF1KB3 PSERLEQELFSGGNTGINFEKYDDIPVEATGNNCPPHIESFSDVEMGEIIMGNIELTRYT
       :  . :. .:.  .:::::.::: : ::..:.. :: : .: .... . . .::  . ::
CCDS54 PPPEDEDSIFAHYQTGINFDKYDTILVEVSGHDAPPAILTFEEANLCQTLNNNIAKAGYT
              110       120       130       140       150       160

             210       220       230       240       250       260 
pF1KB3 RPTPVQKHAIPIIKEKRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILSQIYSDGPGEALRAMKENGRYG
       . :::::..::::   ::::::::::::::::::::::.... ::    . :    .:. 
CCDS54 KLTPVQKYSIPIILAGRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILAHMMHDG----ITA----SRF-
              170       180       190       200               210  

             270       280       290       300       310       320 
pF1KB3 RRKQYPISLVLAPTRELAVQIYEEARKFSYRSRVRPCVVYGGADIGQQIRDLERGCHLLV
       .. : :  ...::::::. ::: ::::::. . ::  :.:::...:..::.. .::..: 
CCDS54 KELQEPECIIVAPTRELVNQIYLEARKFSFGTCVRAVVIYGGTQLGHSIRQIVQGCNILC
             220       230       240       250       260       270 

             330       340       350       360       370       380 
pF1KB3 ATPGRLVDMMERGKIGLDFCKYLVLDEADRMLDMGFEPQIRRIVEQDTMPPKGVRHTMMF
       ::::::.:.. . ::::   :::::::::::::::: :......    :: :  :.:.::
CCDS54 ATPGRLMDIIGKEKIGLKQIKYLVLDEADRMLDMGFGPEMKKLISCPGMPSKEQRQTLMF
             280       290       300       310       320       330 

             390        400       410       420       430       440
pF1KB3 SATFPKEIQMLARDFL-DEYIFLAVGRVGSTSENITQKVVWVEESDKRSFLLDLLNATGK
       :::::.::: :: .:: ..:.:.:::.::.. ... : :. : . .::  :...:   : 
CCDS54 SATFPEEIQRLAAEFLKSNYLFVAVGQVGGACRDVQQTVLQVGQFSKREKLVEILRNIG-
             340       350       360       370       380       390 

              450       460       470       480       490       500
pF1KB3 DSLTLVFVETKKGADSLEDFLYHEGYACTSIHGDRSQRDREEALHQFRSGKSPILVATAV
       :  :.::::::: :: .  :: .:  . ::::::: ::.::.:: .:: :: :.::::.:
CCDS54 DERTMVFVETKKKADFIATFLCQEKISTTSIHGDREQREREQALGDFRFGKCPVLVATSV
              400       410       420       430       440       450

              510       520       530       540        550         
pF1KB3 AARGLDISNVKHVINFDLPSDIEEYVHRIGRTGRVGNLGLATSFFN-ERNINITKDLLDL
       ::::::: ::.::::::::: :.::::::::::: :: : : :::. : . .... :. .
CCDS54 AARGLDIENVQHVINFDLPSTIDEYVHRIGRTGRCGNTGRAISFFDLESDNHLAQPLVKV
              460       470       480       490       500       510

     560       570       580       590       600        610        
pF1KB3 LVEAKQEVPSWLENMAYEHHYKGSSRGRSKSSRFSGGFGARDYRQS-SGASSSSFSSSRA
       :..:.:.::.:::..:.  .  : : : .... :.    . : :.. :  ....::::.:
CCDS54 LTDAQQDVPAWLEEIAFSTYIPGFS-GSTRGNVFA----SVDTRKGKSTLNTAGFSSSQA
              520       530        540           550       560     

      620       630       640       650       660  
pF1KB3 SSSRSGGGGHGSSRGFGGGGYGGFYNSDGYGGNYNSQGVDWWGN
                                                   
CCDS54 PNPVDDESWD                                  
         570                                       

>>CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5               (690 aa)
 initn: 1283 init1: 927 opt: 1160  Z-score: 915.3  bits: 179.7 E(32554): 1.2e-44
Smith-Waterman score: 1547; 45.1% identity (69.6% similar) in 638 aa overlap (14-618:63-680)

                                10        20        30        40   
pF1KB3                  MSHVAVENALGLDQQFAGLDLNSSDNQSGGSTASKGRYIPPHL
                                     ..:.. : .  ..... :: . :  .   .
CCDS47 NFNRTPASSSEMDDGPSRRDHFMKSGFASGRNFGNRDAGECNKRDNTSTMG-GFGVGKSF
             40        50        60        70        80         90 

            50          60         70        80         90         
pF1KB3 RNREATKG-FYDKDSSG-WS-SSKDKDAYSSFGSRSDSRGKSSFFSDRG-SGSRGRFDDR
        ::  ... : : :::: :  ::.: .   . .   ..:: ...  :.  . . : : .:
CCDS47 GNRGFSNSRFEDGDSSGFWRESSNDCEDNPTRNRGFSKRGDNDLDPDECMQRTGGLFGSR
             100       110       120       130       140       150 

     100       110           120           130                     
pF1KB3 GRSDYDGIGSRGD----RSGFGKFERGG----NSRWCDKSDEDDWSK-------------
        :   .: :. ::    ::: :. ::::    : .    : ...:..             
CCDS47 -RPVLSGTGN-GDTSQSRSGSGS-ERGGYKGLNEEVITGSGKNSWKSEAEGGESSDTQGP
              160        170        180       190       200        

           140       150       160       170       180       190   
pF1KB3 -----PLPPSERLEQELFSGGNTGINFEKYDDIPVEATGNNCPPHIESFSDVEMGEIIMG
            : :: :  :. .:.  .:::::.::: : ::..:.. :: : .: .... . . .
CCDS47 KVTYIPPPPPED-EDSIFAHYQTGINFDKYDTILVEVSGHDAPPAILTFEEANLCQTLNN
      210       220        230       240       250       260       

           200       210       220       230       240       250   
pF1KB3 NIELTRYTRPTPVQKHAIPIIKEKRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILSQIYSDGPGEALRA
       ::  . ::. :::::..::::   ::::::::::::::::::::::.... ::    . :
CCDS47 NIAKAGYTKLTPVQKYSIPIILAGRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILAHMMHDG----ITA
       270       280       290       300       310       320       

           260       270       280       290       300       310   
pF1KB3 MKENGRYGRRKQYPISLVLAPTRELAVQIYEEARKFSYRSRVRPCVVYGGADIGQQIRDL
           .:. .. : :  ...::::::. ::: ::::::. . ::  :.:::...:..::..
CCDS47 ----SRF-KELQEPECIIVAPTRELVNQIYLEARKFSFGTCVRAVVIYGGTQLGHSIRQI
                330       340       350       360       370        

           320       330       340       350       360       370   
pF1KB3 ERGCHLLVATPGRLVDMMERGKIGLDFCKYLVLDEADRMLDMGFEPQIRRIVEQDTMPPK
        .::..: ::::::.:.. . ::::   :::::::::::::::: :......    :: :
CCDS47 VQGCNILCATPGRLMDIIGKEKIGLKQIKYLVLDEADRMLDMGFGPEMKKLISCPGMPSK
      380       390       400       410       420       430        

           380       390        400       410       420       430  
pF1KB3 GVRHTMMFSATFPKEIQMLARDFL-DEYIFLAVGRVGSTSENITQKVVWVEESDKRSFLL
         :.:.:::::::.::: :: .:: ..:.:.:::.::.. ... : :. : . .::  :.
CCDS47 EQRQTLMFSATFPEEIQRLAAEFLKSNYLFVAVGQVGGACRDVQQTVLQVGQFSKREKLV
      440       450       460       470       480       490        

            440       450       460       470       480       490  
pF1KB3 DLLNATGKDSLTLVFVETKKGADSLEDFLYHEGYACTSIHGDRSQRDREEALHQFRSGKS
       ..:   : :  :.::::::: :: .  :: .:  . ::::::: ::.::.:: .:: :: 
CCDS47 EILRNIG-DERTMVFVETKKKADFIATFLCQEKISTTSIHGDREQREREQALGDFRFGKC
      500        510       520       530       540       550       

            500       510       520       530       540        550 
pF1KB3 PILVATAVAARGLDISNVKHVINFDLPSDIEEYVHRIGRTGRVGNLGLATSFFN-ERNIN
       :.::::.:::::::: ::.::::::::: :.::::::::::: :: : : :::. : . .
CCDS47 PVLVATSVAARGLDIENVQHVINFDLPSTIDEYVHRIGRTGRCGNTGRAISFFDLESDNH
       560       570       580       590       600       610       

             560       570       580       590       600        610
pF1KB3 ITKDLLDLLVEAKQEVPSWLENMAYEHHYKGSSRGRSKSSRFSGGFGARDYRQS-SGASS
       ... :. .:..:.:.::.:::..:.  .  : : : .... :.    . : :.. :  ..
CCDS47 LAQPLVKVLTDAQQDVPAWLEEIAFSTYIPGFS-GSTRGNVFA----SVDTRKGKSTLNT
       620       630       640       650            660       670  

              620       630       640       650       660  
pF1KB3 SSFSSSRASSSRSGGGGHGSSRGFGGGGYGGFYNSDGYGGNYNSQGVDWWGN
       ..::::.:                                            
CCDS47 AGFSSSQAPNPVDDESWD                                  
            680       690                                  

>>CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5               (704 aa)
 initn: 1321 init1: 927 opt: 1160  Z-score: 915.2  bits: 179.7 E(32554): 1.2e-44
Smith-Waterman score: 1538; 44.6% identity (68.0% similar) in 653 aa overlap (14-618:63-694)

                                10        20        30        40   
pF1KB3                  MSHVAVENALGLDQQFAGLDLNSSDNQSGGSTASKGRYIPPHL
                                     ..:.. : .  ..... :: . :  .   .
CCDS54 NFNRTPASSSEMDDGPSRRDHFMKSGFASGRNFGNRDAGECNKRDNTSTMG-GFGVGKSF
             40        50        60        70        80         90 

            50          60        70        80        90           
pF1KB3 RNREATKG-FYDKDSSG-WSSSKDKDAYSSFGSRSDSRGKSSFFSDRGS---GSR-----
        ::  ... : : :::: : . .: .   . :    . :..:: . ::.   ::      
CCDS54 GNRGFSNSRFEDGDSSGFWRGYRDGNNSEASGPYRRG-GRGSFRGCRGGFGLGSPNNDLD
             100       110       120        130       140       150

                    100       110           120           130      
pF1KB3 ---------GRFDDRGRSDYDGIGSRGD----RSGFGKFERGG----NSRWCDKSDEDDW
                : : .: :   .: :. ::    ::: :. ::::    : .    : ...:
CCDS54 PDECMQRTGGLFGSR-RPVLSGTGN-GDTSQSRSGSGS-ERGGYKGLNEEVITGSGKNSW
              160        170        180        190       200       

                          140       150       160       170        
pF1KB3 SK------------------PLPPSERLEQELFSGGNTGINFEKYDDIPVEATGNNCPPH
       ..                  : :: :  :. .:.  .:::::.::: : ::..:.. :: 
CCDS54 KSEAEGGESSDTQGPKVTYIPPPPPED-EDSIFAHYQTGINFDKYDTILVEVSGHDAPPA
       210       220       230        240       250       260      

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB3 IESFSDVEMGEIIMGNIELTRYTRPTPVQKHAIPIIKEKRDLMACAQTGSGKTAAFLLPI
       : .: .... . . .::  . ::. :::::..::::   :::::::::::::::::::::
CCDS54 ILTFEEANLCQTLNNNIAKAGYTKLTPVQKYSIPIILAGRDLMACAQTGSGKTAAFLLPI
        270       280       290       300       310       320      

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB3 LSQIYSDGPGEALRAMKENGRYGRRKQYPISLVLAPTRELAVQIYEEARKFSYRSRVRPC
       :.... ::    . :    .:. .. : :  ...::::::. ::: ::::::. . ::  
CCDS54 LAHMMHDG----ITA----SRF-KELQEPECIIVAPTRELVNQIYLEARKFSFGTCVRAV
        330               340        350       360       370       

      300       310       320       330       340       350        
pF1KB3 VVYGGADIGQQIRDLERGCHLLVATPGRLVDMMERGKIGLDFCKYLVLDEADRMLDMGFE
       :.:::...:..::.. .::..: ::::::.:.. . ::::   :::::::::::::::: 
CCDS54 VIYGGTQLGHSIRQIVQGCNILCATPGRLMDIIGKEKIGLKQIKYLVLDEADRMLDMGFG
       380       390       400       410       420       430       

      360       370       380       390        400       410       
pF1KB3 PQIRRIVEQDTMPPKGVRHTMMFSATFPKEIQMLARDFL-DEYIFLAVGRVGSTSENITQ
       :......    :: :  :.:.:::::::.::: :: .:: ..:.:.:::.::.. ... :
CCDS54 PEMKKLISCPGMPSKEQRQTLMFSATFPEEIQRLAAEFLKSNYLFVAVGQVGGACRDVQQ
       440       450       460       470       480       490       

       420       430       440       450       460       470       
pF1KB3 KVVWVEESDKRSFLLDLLNATGKDSLTLVFVETKKGADSLEDFLYHEGYACTSIHGDRSQ
        :. : . .::  :...:   : :  :.::::::: :: .  :: .:  . ::::::: :
CCDS54 TVLQVGQFSKREKLVEILRNIG-DERTMVFVETKKKADFIATFLCQEKISTTSIHGDREQ
       500       510        520       530       540       550      

       480       490       500       510       520       530       
pF1KB3 RDREEALHQFRSGKSPILVATAVAARGLDISNVKHVINFDLPSDIEEYVHRIGRTGRVGN
       :.::.:: .:: :: :.::::.:::::::: ::.::::::::: :.::::::::::: ::
CCDS54 REREQALGDFRFGKCPVLVATSVAARGLDIENVQHVINFDLPSTIDEYVHRIGRTGRCGN
        560       570       580       590       600       610      

       540        550       560       570       580       590      
pF1KB3 LGLATSFFN-ERNINITKDLLDLLVEAKQEVPSWLENMAYEHHYKGSSRGRSKSSRFSGG
        : : :::. : . .... :. .:..:.:.::.:::..:.  .  : : : .... :.  
CCDS54 TGRAISFFDLESDNHLAQPLVKVLTDAQQDVPAWLEEIAFSTYIPGFS-GSTRGNVFA--
        620       630       640       650       660        670     

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pF1KB3 FGARDYRQS-SGASSSSFSSSRASSSRSGGGGHGSSRGFGGGGYGGFYNSDGYGGNYNSQ
         . : :.. :  ....::::.:                                     
CCDS54 --SVDTRKGKSTLNTAGFSSSQAPNPVDDESWD                           
             680       690       700                               

>>CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5                (724 aa)
 initn: 1283 init1: 927 opt: 1160  Z-score: 915.0  bits: 179.8 E(32554): 1.2e-44
Smith-Waterman score: 1529; 44.2% identity (67.9% similar) in 652 aa overlap (10-618:85-714)

                                    10        20        30         
pF1KB3                      MSHVAVENALGLDQQFAGLDLNSSDNQSGGSTA----SK
                                     .:. ..:..  ...:  ..: :..    :.
CCDS39 MKSGFASGRNFGNRDAGECNKRDNTSTMGGFGVGKSFGNRGFSNSRFEDGDSSGFWRESS
           60        70        80        90       100       110    

          40        50          60        70        80        90   
pF1KB3 GRYIPPHLRNREATK--GFYDKDSSGWSSSKDKDAYSSFGSRSDSRGKSSFFSDRGSG--
       .       :::  .:  :. : ..:  :.   . . .:: .   . : .:  .:      
CCDS39 NDCEDNPTRNRGFSKRGGYRDGNNSEASGPYRRGGRGSFRGCRGGFGLGSPNNDLDPDEC
          120       130       140       150       160       170    

                100       110           120           130          
pF1KB3 ---SRGRFDDRGRSDYDGIGSRGD----RSGFGKFERGG----NSRWCDKSDEDDWSK--
          . : : .: :   .: :. ::    ::: :. ::::    : .    : ...:..  
CCDS39 MQRTGGLFGSR-RPVLSGTGN-GDTSQSRSGSGS-ERGGYKGLNEEVITGSGKNSWKSEA
          180        190        200        210       220       230 

                      140       150       160       170       180  
pF1KB3 ----------------PLPPSERLEQELFSGGNTGINFEKYDDIPVEATGNNCPPHIESF
                       : :: :  :. .:.  .:::::.::: : ::..:.. :: : .:
CCDS39 EGGESSDTQGPKVTYIPPPPPED-EDSIFAHYQTGINFDKYDTILVEVSGHDAPPAILTF
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pF1KB3 SDVEMGEIIMGNIELTRYTRPTPVQKHAIPIIKEKRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILSQI
        .... . . .::  . ::. :::::..::::   ::::::::::::::::::::::...
CCDS39 EEANLCQTLNNNIAKAGYTKLTPVQKYSIPIILAGRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILAHM
              300       310       320       330       340       350

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pF1KB3 YSDGPGEALRAMKENGRYGRRKQYPISLVLAPTRELAVQIYEEARKFSYRSRVRPCVVYG
       . ::    . :    .:. .. : :  ...::::::. ::: ::::::. . ::  :.::
CCDS39 MHDG----ITA----SRF-KELQEPECIIVAPTRELVNQIYLEARKFSFGTCVRAVVIYG
                      360        370       380       390       400 

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pF1KB3 GADIGQQIRDLERGCHLLVATPGRLVDMMERGKIGLDFCKYLVLDEADRMLDMGFEPQIR
       :...:..::.. .::..: ::::::.:.. . ::::   :::::::::::::::: :...
CCDS39 GTQLGHSIRQIVQGCNILCATPGRLMDIIGKEKIGLKQIKYLVLDEADRMLDMGFGPEMK
             410       420       430       440       450       460 

            370       380       390        400       410       420 
pF1KB3 RIVEQDTMPPKGVRHTMMFSATFPKEIQMLARDFL-DEYIFLAVGRVGSTSENITQKVVW
       ...    :: :  :.:.:::::::.::: :: .:: ..:.:.:::.::.. ... : :. 
CCDS39 KLISCPGMPSKEQRQTLMFSATFPEEIQRLAAEFLKSNYLFVAVGQVGGACRDVQQTVLQ
             470       480       490       500       510       520 

             430       440       450       460       470       480 
pF1KB3 VEESDKRSFLLDLLNATGKDSLTLVFVETKKGADSLEDFLYHEGYACTSIHGDRSQRDRE
       : . .::  :...:   : :  :.::::::: :: .  :: .:  . ::::::: ::.::
CCDS39 VGQFSKREKLVEILRNIG-DERTMVFVETKKKADFIATFLCQEKISTTSIHGDREQRERE
             530        540       550       560       570       580

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pF1KB3 EALHQFRSGKSPILVATAVAARGLDISNVKHVINFDLPSDIEEYVHRIGRTGRVGNLGLA
       .:: .:: :: :.::::.:::::::: ::.::::::::: :.::::::::::: :: : :
CCDS39 QALGDFRFGKCPVLVATSVAARGLDIENVQHVINFDLPSTIDEYVHRIGRTGRCGNTGRA
              590       600       610       620       630       640

              550       560       570          580       590       
pF1KB3 TSFFN-ERNINITKDLLDLLVEAKQEVPSWLENMAYEHH---YKGSSRGRSKSSRFSGGF
        :::. : . .... :. .:..:.:.::.:::..:.  .   ..::.::          :
CCDS39 ISFFDLESDNHLAQPLVKVLTDAQQDVPAWLEEIAFSTYIPGFSGSTRGNV--------F
              650       660       670       680       690          

       600        610       620       630       640       650      
pF1KB3 GARDYRQS-SGASSSSFSSSRASSSRSGGGGHGSSRGFGGGGYGGFYNSDGYGGNYNSQG
       .. : :.. :  ....::::.:                                      
CCDS39 ASVDTRKGKSTLNTAGFSSSQAPNPVDDESWD                            
            700       710       720                                

>>CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17               (614 aa)
 initn: 1035 init1: 411 opt: 990  Z-score: 783.8  bits: 155.2 E(32554): 2.5e-37
Smith-Waterman score: 1148; 39.2% identity (63.7% similar) in 589 aa overlap (82-657:2-554)

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB3 FYDKDSSGWSSSKDKDAYSSFGSRSDSRGKSSFFSDRGSGSRGRFDDRGRSDYDGIGSR-
                                     :.. :::   .:::  ::: .     ::: 
CCDS11                              MSGYSSDR---DRGR--DRGFGAPRFGGSRA
                                               10          20      

              120       130       140        150        160        
pF1KB3 GDRSGFGKFERGGNSRWCDKSDEDDWSKPLPPSER-LEQELFS-GGNTGINFEKYD-DIP
       :  ::  ::   :..    : . :.    ::  :. . ::  . .  :. . : :  .  
CCDS11 GPLSG-KKFGNPGEKLVKKKWNLDE----LPKFEKNFYQEHPDLARRTAQEVETYRRSKE
         30         40        50            60        70        80 

       170       180       190       200       210       220       
pF1KB3 VEATGNNCPPHIESFSDVEMGEIIMGNIELTRYTRPTPVQKHAIPIIKEKRDLMACAQTG
       . . :.:::  . .: ....   .:  :    .:.:: .: .. :.     :... ::::
CCDS11 ITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTG
              90       100       110       120       130       140 

       230       240       250       260       270       280       
pF1KB3 SGKTAAFLLPILSQIYSDGPGEALRAMKENGRYGRRKQYPISLVLAPTRELAVQIYEEAR
       :::: ..::: . .: .  :            . .: . :: :::::::::: :. . : 
CCDS11 SGKTLSYLLPAIVHI-NHQP------------FLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAA
             150        160                   170       180        

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pF1KB3 KFSYRSRVRPCVVYGGADIGQQIRDLERGCHLLVATPGRLVDMMERGKIGLDFCKYLVLD
       ..    :..   .::::  : :::::::: .. .::::::.:..: :: .:    :::::
CCDS11 EYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLD
      190       200       210       220       230       240        

       350       360       370       380       390       400       
pF1KB3 EADRMLDMGFEPQIRRIVEQDTMPPKGVRHTMMFSATFPKEIQMLARDFLDEYIFLAVGR
       :::::::::::::::.::.:  . :   :.:.:.:::.:::...::.::: .:: . .: 
CCDS11 EADRMLDMGFEPQIRKIVDQ--IRPD--RQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGA
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pF1KB3 VG-STSENITQKVVWVEESDKRSFLLDLLNA--TGKDSLTLVFVETKKGADSLEDFLYHE
       .  :...:: : :   .. .:   :. :..   . :.. :.::::::.  : :   . ..
CCDS11 LELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRD
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pF1KB3 GYACTSIHGDRSQRDREEALHQFRSGKSPILVATAVAARGLDISNVKHVINFDLPSDIEE
       :.   .::::.::..:. .:..:. ::.:::.:: ::.::::. .:: :::.: :.. :.
CCDS11 GWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSED
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pF1KB3 YVHRIGRTGRVGNLGLATSFFNERNINITKDLLDLLVEAKQEVPSWLENMAYEHHYKGSS
       :.::::::.:  . : : .::.  ::. ..::...: ::.: .   : ... : . .: :
CCDS11 YIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLV-EDRGSGRS
          430       440       450       460       470        480   

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pF1KB3 RGRSKSSRFSGGF-GARDYRQSSGASSSSFSSSRASSSRSGGGGHGSSRGFGGGGYGGFY
       :::       ::.   :  : :.: . ..:.. :   . . : .   .: ::.   .: :
CCDS11 RGR-------GGMKDDRRDRYSAG-KRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVY
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pF1KB3 NSDGY-----GGNYNSQGVDWWGN                                    
       .. .:     :.:. : :.                                         
CCDS11 SAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGSNVPNMHNGMNQQAYAY
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>>CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17               (614 aa)
 initn: 1068 init1: 411 opt: 989  Z-score: 783.0  bits: 155.1 E(32554): 2.7e-37
Smith-Waterman score: 1138; 38.7% identity (63.9% similar) in 579 aa overlap (94-657:4-554)

            70        80        90        100       110        120 
pF1KB3 KDKDAYSSFGSRSDSRGKSSFFSDRGSGSRGRFD-DRGRSDYDGIGSRG-DRSGFGKFER
                                     :::. :.: :   :    : .:.:  . ..
CCDS82                            MKAGRFEADEGTSVRFGAPRFGGSRAGPLSGKK
                                          10        20        30   

             130        140        150        160        170       
pF1KB3 GGNSRWCDKSDEDDWS-KPLPPSER-LEQELFS-GGNTGINFEKYD-DIPVEATGNNCPP
        ::    .:  .  :.   ::  :. . ::  . .  :. . : :  .  . . :.::: 
CCDS82 FGNPG--EKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQEVETYRRSKEITVRGHNCPK
              40        50        60        70        80        90 

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB3 HIESFSDVEMGEIIMGNIELTRYTRPTPVQKHAIPIIKEKRDLMACAQTGSGKTAAFLLP
        . .: ....   .:  :    .:.:: .: .. :.     :... :::::::: ..:::
CCDS82 PVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLP
             100       110       120       130       140       150 

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pF1KB3 ILSQIYSDGPGEALRAMKENGRYGRRKQYPISLVLAPTRELAVQIYEEARKFSYRSRVRP
        . .: .  :            . .: . :: :::::::::: :. . : ..    :.. 
CCDS82 AIVHI-NHQP------------FLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKS
              160                   170       180       190        

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pF1KB3 CVVYGGADIGQQIRDLERGCHLLVATPGRLVDMMERGKIGLDFCKYLVLDEADRMLDMGF
         .::::  : :::::::: .. .::::::.:..: :: .:    :::::::::::::::
CCDS82 TCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGF
      200       210       220       230       240       250        

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pF1KB3 EPQIRRIVEQDTMPPKGVRHTMMFSATFPKEIQMLARDFLDEYIFLAVGRVG-STSENIT
       :::::.::.:  . :   :.:.:.:::.:::...::.::: .:: . .: .  :...:: 
CCDS82 EPQIRKIVDQ--IRPD--RQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNIL
      260         270         280       290       300       310    

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pF1KB3 QKVVWVEESDKRSFLLDLLNA--TGKDSLTLVFVETKKGADSLEDFLYHEGYACTSIHGD
       : :   .. .:   :. :..   . :.. :.::::::.  : :   . ..:.   .::::
CCDS82 QIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGD
          320       330       340       350       360       370    

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pF1KB3 RSQRDREEALHQFRSGKSPILVATAVAARGLDISNVKHVINFDLPSDIEEYVHRIGRTGR
       .::..:. .:..:. ::.:::.:: ::.::::. .:: :::.: :.. :.:.::::::.:
CCDS82 KSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTAR
          380       390       400       410       420       430    

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pF1KB3 VGNLGLATSFFNERNINITKDLLDLLVEAKQEVPSWLENMAYEHHYKGSSRGRSKSSRFS
         . : : .::.  ::. ..::...: ::.: .   : ... : . .: ::::       
CCDS82 STKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLV-EDRGSGRSRGR-------
          440       450       460       470        480             

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pF1KB3 GGF-GARDYRQSSGASSSSFSSSRASSSRSGGGGHGSSRGFGGGGYGGFYNSDGY-----
       ::.   :  : :.: . ..:.. :   . . : .   .: ::.   .: :.. .:     
CCDS82 GGMKDDRRDRYSAG-KRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAANYTNGSF
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pF1KB3 GGNYNSQGVDWWGN                                              
       :.:. : :.                                                   
CCDS82 GSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGSNVPNMHNGMNQQAYAYPATAAAPMIG
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>>CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22             (731 aa)
 initn: 1137 init1: 425 opt: 989  Z-score: 782.0  bits: 155.2 E(32554): 3.1e-37
Smith-Waterman score: 1181; 39.0% identity (64.5% similar) in 605 aa overlap (89-655:78-655)

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pF1KB3 GWSSSKDKDAYSSFGSRSDSRGKSSFFSDRGSGSRGRFDDRGRS-DYDGIGSRGDRSGFG
                                     :.   : : :: :. :  :.:.::  .:. 
CCDS46 APPPSVVTRPEPQALPSPAIRAPLPDLYPFGTMRGGGFGDRDRDRDRGGFGARGG-GGLP
        50        60        70        80        90       100       

             120       130       140           150       160       
pF1KB3 --KF----ERGGNSRWCDKSDEDDWSKPL----PPSERLEQELFSGGNTGINFEKYDDIP
         ::    ::  ...: : :.   . : .    :   ::     .      ....  .: 
CCDS46 PKKFGNPGERLRKKKW-DLSELPKFEKNFYVEHPEVARLTPYEVD------ELRRKKEIT
        110       120        130       140       150               

       170       180       190       200       210       220       
pF1KB3 VEATGNNCPPHIESFSDVEMGEIIMGNIELTRYTRPTPVQKHAIPIIKEKRDLMACAQTG
       :.. :. ::  . .:  ... . .:  .   ..:.:::.: ...:.    ::... ::::
CCDS46 VRG-GDVCPKPVFAFHHANFPQYVMDVLMDQHFTEPTPIQCQGFPLALSGRDMVGIAQTG
     160        170       180       190       200       210        

       230       240       250       260       270       280       
pF1KB3 SGKTAAFLLPILSQIYSDGPGEALRAMKENGRYGRRKQYPISLVLAPTRELAVQIYEEAR
       :::: :.::: . .: .  :            : .: . :: :::::::::: :. . : 
CCDS46 SGKTLAYLLPAIVHI-NHQP------------YLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAD
      220       230                    240       250       260     

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pF1KB3 KFSYRSRVRPCVVYGGADIGQQIRDLERGCHLLVATPGRLVDMMERGKIGLDFCKYLVLD
        ..  ::..   .::::  : :::::::: .. .::::::.:..: :: .:  : :::::
CCDS46 DYGKCSRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLESGKTNLRRCTYLVLD
         270       280       290       300       310       320     

       350       360       370       380       390       400       
pF1KB3 EADRMLDMGFEPQIRRIVEQDTMPPKGVRHTMMFSATFPKEIQMLARDFLDEYIFLAVGR
       :::::::::::::::.::.:  . :   :.:.:.:::.:::...::.::: .:  . :: 
CCDS46 EADRMLDMGFEPQIRKIVDQ--IRPD--RQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLRDYTQINVGN
         330       340           350       360       370       380 

        410       420       430         440       450       460    
pF1KB3 VG-STSENITQKVVWVEESDKRSFLLDLLNA--TGKDSLTLVFVETKKGADSLEDFLYHE
       .  :...:: : :    ::.:   :..:..   . :.. :..:::::.  :.:   . ..
CCDS46 LELSANHNILQIVDVCMESEKDHKLIQLMEEIMAEKENKTIIFVETKRRCDDLTRRMRRD
             390       400       410       420       430       440 

          470       480       490       500       510       520    
pF1KB3 GYACTSIHGDRSQRDREEALHQFRSGKSPILVATAVAARGLDISNVKHVINFDLPSDIEE
       :.    ::::.:: .:. .:..:::::.:::.:: ::.::::. .:: :::.: :.. :.
CCDS46 GWPAMCIHGDKSQPERDWVLNEFRSGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSED
             450       460       470       480       490       500 

          530       540       550       560       570       580    
pF1KB3 YVHRIGRTGRVGNLGLATSFFNERNINITKDLLDLLVEAKQEVPSWLENMAYEHHYKGSS
       ::::::::.:  : : : .::.  :.. ...:. .: ::.: .   : ... .:.  :..
CCDS46 YVHRIGRTARSTNKGTAYTFFTPGNLKQARELIKVLEEANQAINPKLMQLV-DHRGGGGG
             510       520       530       540       550        560

          590       600                     610       620          
pF1KB3 RGRSKSSRFSGGFGAR----------DYR----QSSGASSSSFSSSRASSSRSG---GGG
        :..  ::.    .:           : :    ...:  .:.   .:. ..:.:   :.:
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