Result of FASTA (omim) for pF1KB3348
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3348, 703 aa
  1>>>pF1KB3348 703 - 703 aa - 703 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8063+/-0.000404; mu= 17.5702+/- 0.025
 mean_var=84.9217+/-17.424, 0's: 0 Z-trim(113.4): 301  B-trim: 415 in 1/53
 Lambda= 0.139176
 statistics sampled from 22366 (22674) to 22366 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.624), E-opt: 0.2 (0.266), width:  16
 Scan time: 12.120

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_000535 (OMIM: 170261,604571) antigen peptide tr ( 703) 4630 940.1       0
NP_001276972 (OMIM: 170261,604571) antigen peptide ( 686) 4513 916.6       0
NP_061313 (OMIM: 170261,604571) antigen peptide tr ( 653) 4256 865.0       0
XP_011536398 (OMIM: 605453) PREDICTED: ATP-binding ( 766) 1602 332.2 4.6e-90
XP_016874592 (OMIM: 605453) PREDICTED: ATP-binding ( 766) 1602 332.2 4.6e-90
NP_062571 (OMIM: 605453) ATP-binding cassette sub- ( 766) 1602 332.2 4.6e-90
XP_011536397 (OMIM: 605453) PREDICTED: ATP-binding ( 766) 1602 332.2 4.6e-90
NP_001229943 (OMIM: 605453) ATP-binding cassette s ( 681) 1491 309.9 2.2e-83
NP_982269 (OMIM: 605453) ATP-binding cassette sub- ( 683) 1491 309.9 2.2e-83
NP_000584 (OMIM: 170260,604571) antigen peptide tr ( 808) 1415 294.6 9.7e-79
XP_011536400 (OMIM: 605453) PREDICTED: ATP-binding ( 548) 1384 288.3 5.3e-77
XP_005253615 (OMIM: 605453) PREDICTED: ATP-binding ( 548) 1384 288.3 5.3e-77
NP_001278951 (OMIM: 170260,604571) antigen peptide ( 547) 1347 280.9 9.2e-75
NP_036221 (OMIM: 605454) ATP-binding cassette sub- ( 738) 1147 240.8 1.4e-62
NP_009119 (OMIM: 605464) ATP-binding cassette sub- ( 718) 1105 232.4 4.8e-60
NP_001269220 (OMIM: 605464) ATP-binding cassette s ( 735) 1105 232.4 4.9e-60
NP_001269222 (OMIM: 605464) ATP-binding cassette s ( 630) 1085 228.3   7e-59
XP_011542437 (OMIM: 605454) PREDICTED: ATP-binding ( 559) 1069 225.1 5.9e-58
NP_001269221 (OMIM: 605464) ATP-binding cassette s ( 693) 1014 214.1 1.5e-54
NP_001157413 (OMIM: 611785) ATP-binding cassette s (1257)  937 198.8 1.1e-49
XP_011542438 (OMIM: 605454) PREDICTED: ATP-binding ( 442)  893 189.7 2.1e-47
NP_062570 (OMIM: 605453) ATP-binding cassette sub- ( 723)  895 190.2 2.4e-47
NP_000918 (OMIM: 120080,171050,612244) multidrug r (1280)  850 181.3   2e-44
NP_061338 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) phos (1232)  843 179.9 5.1e-44
XP_011514615 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) P (1232)  843 179.9 5.1e-44
XP_011514614 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) P (1247)  843 179.9 5.2e-44
XP_011514613 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) P (1251)  843 179.9 5.2e-44
XP_011514612 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) P (1259)  843 179.9 5.2e-44
NP_000434 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) phos (1279)  843 179.9 5.3e-44
NP_061337 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) phos (1286)  843 179.9 5.3e-44
XP_011514611 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) P (1287)  843 179.9 5.3e-44
XP_016867812 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) P (1294)  843 179.9 5.3e-44
XP_011514610 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) P (1294)  843 179.9 5.3e-44
XP_011510382 (OMIM: 601847,603201,605479) PREDICTE ( 936)  791 169.4 5.7e-41
XP_016860654 (OMIM: 601847,603201,605479) PREDICTE (1314)  791 169.5 7.5e-41
NP_003733 (OMIM: 601847,603201,605479) bile salt e (1321)  791 169.5 7.6e-41
XP_006712880 (OMIM: 601847,603201,605479) PREDICTE (1335)  791 169.5 7.6e-41
XP_011510379 (OMIM: 601847,603201,605479) PREDICTE (1355)  791 169.5 7.7e-41
XP_011510380 (OMIM: 601847,603201,605479) PREDICTE (1355)  791 169.5 7.7e-41
XP_011510383 (OMIM: 601847,603201,605479) PREDICTE ( 763)  782 167.5 1.7e-40
XP_011514617 (OMIM: 171060,600803,602347,614972) P (1074)  743 159.8 5.1e-38
NP_005680 (OMIM: 111600,605452,609153,614497,61540 ( 842)  724 155.9 5.9e-37
NP_001229942 (OMIM: 605453) ATP-binding cassette s ( 703)  719 154.9   1e-36
XP_016860655 (OMIM: 601847,603201,605479) PREDICTE (1098)  704 152.0 1.2e-35
XP_016874593 (OMIM: 605453) PREDICTED: ATP-binding ( 485)  692 149.3 3.2e-35
XP_011513288 (OMIM: 612509) PREDICTED: multidrug r ( 841)  675 146.1 5.4e-34
XP_016866945 (OMIM: 612509) PREDICTED: multidrug r ( 841)  675 146.1 5.4e-34
XP_011513287 (OMIM: 612509) PREDICTED: multidrug r ( 841)  675 146.1 5.4e-34
XP_011513285 (OMIM: 612509) PREDICTED: multidrug r (1048)  675 146.1 6.4e-34
XP_016866944 (OMIM: 612509) PREDICTED: multidrug r (1063)  675 146.1 6.5e-34


>>NP_000535 (OMIM: 170261,604571) antigen peptide transp  (703 aa)
 initn: 4630 init1: 4630 opt: 4630  Z-score: 5024.2  bits: 940.1 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4630; 100.0% identity (100.0% similar) in 703 aa overlap (1-703:1-703)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MRLPDLRPWTSLLLVDAALLWLLQGPLGTLLPQGLPGLWLEGTLRLGGLWGLLKLRGLLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MRLPDLRPWTSLLLVDAALLWLLQGPLGTLLPQGLPGLWLEGTLRLGGLWGLLKLRGLLG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 FVGTLLLPLCLATPLTVSLRALVAGASRAPPARVASAPWSWLLVGYGAAGLSWSLWAVLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FVGTLLLPLCLATPLTVSLRALVAGASRAPPARVASAPWSWLLVGYGAAGLSWSLWAVLS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 PPGAQEKEQDQVNNKVLMWRLLKLSRPDLPLLVAAFFFLVLAVLGETLIPHYSGRVIDIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PPGAQEKEQDQVNNKVLMWRLLKLSRPDLPLLVAAFFFLVLAVLGETLIPHYSGRVIDIL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 GGDFDPHAFASAIFFMCLFSFGSSLSAGCRGGCFTYTMSRINLRIREQLFSSLLRQDLGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GGDFDPHAFASAIFFMCLFSFGSSLSAGCRGGCFTYTMSRINLRIREQLFSSLLRQDLGF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 FQETKTGELNSRLSSDTTLMSNWLPLNANVLLRSLVKVVGLYGFMLSISPRLTLLSLLHM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FQETKTGELNSRLSSDTTLMSNWLPLNANVLLRSLVKVVGLYGFMLSISPRLTLLSLLHM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 PFTIAAEKVYNTRHQEVLREIQDAVARAGQVVREAVGGLQTVRSFGAEEHEVCRYKEALE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PFTIAAEKVYNTRHQEVLREIQDAVARAGQVVREAVGGLQTVRSFGAEEHEVCRYKEALE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 QCRQLYWRRDLERALYLLVRRVLHLGVQMLMLSCGLQQMQDGELTQGSLLSFMIYQESVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QCRQLYWRRDLERALYLLVRRVLHLGVQMLMLSCGLQQMQDGELTQGSLLSFMIYQESVG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 SYVQTLVYIYGDMLSNVGAAEKVFSYMDRQPNLPSPGTLAPTTLQGVVKFQDVSFAYPNR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SYVQTLVYIYGDMLSNVGAAEKVFSYMDRQPNLPSPGTLAPTTLQGVVKFQDVSFAYPNR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 PDRPVLKGLTFTLRPGEVTALVGPNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQVLLDEKPISQYEHC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PDRPVLKGLTFTLRPGEVTALVGPNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQVLLDEKPISQYEHC
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 YLHSQVVSVGQEPVLFSGSVRNNIAYGLQSCEDDKVMAAAQAAHADDFIQEMEHGIYTDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YLHSQVVSVGQEPVLFSGSVRNNIAYGLQSCEDDKVMAAAQAAHADDFIQEMEHGIYTDV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 GEKGSQLAAGQKQRLAIARALVRDPRVLILDEATSALDVQCEQALQDWNSRGDRTVLVIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GEKGSQLAAGQKQRLAIARALVRDPRVLILDEATSALDVQCEQALQDWNSRGDRTVLVIA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700   
pF1KB3 HRLQAVQRAHQILVLQEGKLQKLAQLQEGQDLYSRLVQQRLMD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 HRLQAVQRAHQILVLQEGKLQKLAQLQEGQDLYSRLVQQRLMD
              670       680       690       700   

>>NP_001276972 (OMIM: 170261,604571) antigen peptide tra  (686 aa)
 initn: 4513 init1: 4513 opt: 4513  Z-score: 4897.4  bits: 916.6 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4513; 99.9% identity (100.0% similar) in 686 aa overlap (1-686:1-686)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MRLPDLRPWTSLLLVDAALLWLLQGPLGTLLPQGLPGLWLEGTLRLGGLWGLLKLRGLLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MRLPDLRPWTSLLLVDAALLWLLQGPLGTLLPQGLPGLWLEGTLRLGGLWGLLKLRGLLG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 FVGTLLLPLCLATPLTVSLRALVAGASRAPPARVASAPWSWLLVGYGAAGLSWSLWAVLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FVGTLLLPLCLATPLTVSLRALVAGASRAPPARVASAPWSWLLVGYGAAGLSWSLWAVLS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 PPGAQEKEQDQVNNKVLMWRLLKLSRPDLPLLVAAFFFLVLAVLGETLIPHYSGRVIDIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PPGAQEKEQDQVNNKVLMWRLLKLSRPDLPLLVAAFFFLVLAVLGETLIPHYSGRVIDIL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 GGDFDPHAFASAIFFMCLFSFGSSLSAGCRGGCFTYTMSRINLRIREQLFSSLLRQDLGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGDFDPHAFASAIFFMCLFSFGSSLSAGCRGGCFTYTMSRINLRIREQLFSSLLRQDLGF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 FQETKTGELNSRLSSDTTLMSNWLPLNANVLLRSLVKVVGLYGFMLSISPRLTLLSLLHM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FQETKTGELNSRLSSDTTLMSNWLPLNANVLLRSLVKVVGLYGFMLSISPRLTLLSLLHM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 PFTIAAEKVYNTRHQEVLREIQDAVARAGQVVREAVGGLQTVRSFGAEEHEVCRYKEALE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PFTIAAEKVYNTRHQEVLREIQDAVARAGQVVREAVGGLQTVRSFGAEEHEVCRYKEALE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 QCRQLYWRRDLERALYLLVRRVLHLGVQMLMLSCGLQQMQDGELTQGSLLSFMIYQESVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QCRQLYWRRDLERALYLLVRRVLHLGVQMLMLSCGLQQMQDGELTQGSLLSFMIYQESVG
              370       380       390       400       410       420

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SYVQTLVYIYGDMLSNVGAAEKVFSYMDRQPNLPSPGTLAPTTLQGVVKFQDVSFAYPNR
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PDRPVLKGLTFTLRPGEVTALVGPNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQVLLDEKPISQYEHC
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLHSQVVSVGQEPVLFSGSVRNNIAYGLQSCEDDKVMAAAQAAHADDFIQEMEHGIYTDV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GEKGSQLAAGQKQRLAIARALVRDPRVLILDEATSALDVQCEQALQDWNSRGDRTVLVIA
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       ::::.:::::::::::::::::::::                 
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>>NP_061313 (OMIM: 170261,604571) antigen peptide transp  (653 aa)
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Smith-Waterman score: 4256; 99.5% identity (99.5% similar) in 648 aa overlap (1-648:1-648)

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 MRLPDLRPWTSLLLVDAALLWLLQGPLGTLLPQGLPGLWLEGTLRLGGLWGLLKLRGLLG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 FVGTLLLPLCLATPLTVSLRALVAGASRAPPARVASAPWSWLLVGYGAAGLSWSLWAVLS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 PFTIAAEKVYNTRHQEVLREIQDAVARAGQVVREAVGGLQTVRSFGAEEHEVCRYKEALE
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pF1KB3 QCRQLYWRRDLERALYLLVRRVLHLGVQMLMLSCGLQQMQDGELTQGSLLSFMIYQESVG
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NP_061 QCRQLYWRRDLERALYLLVRRVLHLGVQMLMLSCGLQQMQDGELTQGSLLSFMIYQESVG
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pF1KB3 SYVQTLVYIYGDMLSNVGAAEKVFSYMDRQPNLPSPGTLAPTTLQGVVKFQDVSFAYPNR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 SYVQTLVYIYGDMLSNVGAAEKVFSYMDRQPNLPSPGTLAPTTLQGVVKFQDVSFAYPNR
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pF1KB3 PDRPVLKGLTFTLRPGEVTALVGPNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQVLLDEKPISQYEHC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 PDRPVLKGLTFTLRPGEVTALVGPNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQVLLDEKPISQYEHC
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pF1KB3 YLHSQVVSVGQEPVLFSGSVRNNIAYGLQSCEDDKVMAAAQAAHADDFIQEMEHGIYTDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 YLHSQVVSVGQEPVLFSGSVRNNIAYGLQSCEDDKVMAAAQAAHADDFIQEMEHGIYTDV
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pF1KB3 GEKGSQLAAGQKQRLAIARALVRDPRVLILDEATSALDVQCEQALQDWNSRGDRTVLVIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::   :            
NP_061 GEKGSQLAAGQKQRLAIARALVRDPRVLILDEATSALDVQCEQAKTLWKFMIF       
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pF1KB3 HRLQAVQRAHQILVLQEGKLQKLAQLQEGQDLYSRLVQQRLMD

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Smith-Waterman score: 1627; 40.9% identity (72.9% similar) in 663 aa overlap (69-702:89-743)

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XP_011 CLLLGATIGVAKNSALGPRRLRASWLVITLVCLFVGIYAMVKLLLFSEVRRP----IRDP
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pF1KB3 WSWLL-----VGYGAAGLSWSLWAVLSP----------------PGAQEKEQDQVNNKVL
       : : :     .. ::. : : : ... :                ::. .   .:... .:
XP_011 WFWALFVWTYISLGASFLLWWLLSTVRPGTQALEPGAATEAEGFPGSGRPPPEQASGATL
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pF1KB3 MWRLLKLSRPDLPLLVAAFFFLVLAVLGETLIPHYSGRVID--ILGGDFDPHAFASAIFF
       . .::. ..::. .:::: :::..:.::::..:.:.::.::  ..  ..:   :..:. .
XP_011 Q-KLLSYTKPDVAFLVAASFFLIVAALGETFLPYYTGRAIDGIVIQKSMDQ--FSTAVVI
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pF1KB3 MCLFSFGSSLSAGCRGGCFTYTMSRINLRIREQLFSSLLRQDLGFFQETKTGELNSRLSS
       .::...:::..:: ::: ::  ..:.:.:.:. :: ::. :. .::.:..::.: :::.:
XP_011 VCLLAIGSSFAAGIRGGIFTLIFARLNIRLRNCLFRSLVSQETSFFDENRTGDLISRLTS
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pF1KB3 DTTLMSNWLPLNANVLLRSLVKVVGLYGFMLSISPRLTLLSLLHMPFTIAAEKVYNTRHQ
       :::..:. .  : ::.::. :::.:.  ::.:.: .:.:.... .:. . . ..:.  ..
XP_011 DTTMVSDLVSQNINVFLRNTVKVTGVVVFMFSLSWQLSLVTFMGFPIIMMVSNIYGKYYK
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pF1KB3 EVLREIQDAVARAGQVVREAVGGLQTVRSFGAEEHEVCRYKEALEQCRQLYWRRDLERAL
       .. .:.:.:.:::.....:......:::::. ::.:.  : . :.:  .:  ..      
XP_011 RLSKEVQNALARASNTAEETISAMKTVRSFANEEEEAEVYLRKLQQVYKLNRKEAAAYMY
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pF1KB3 YLLVRRVLHLGVQMLMLSCGLQQMQDGELTQGSLLSFMIYQESVGSYVQTLVYIYGDMLS
       :.    .  : ::. .:  : . . .:..:.:.:..:.::.  .:. ....  .:. ...
XP_011 YVWGSGLTLLVVQVSILYYGGHLVISGQMTSGNLIAFIIYEFVLGDCMESVGSVYSGLMQ
             420       430       440       450       460       470 

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pF1KB3 NVGAAEKVFSYMDRQPNLPSPGTLAPTTLQGVVKFQDVSFAYPNRPDRPVLKGLTFTLRP
       .:::::::: ..::::..   :.:::  :.: : :..:.:.: .::   ::....:.: :
XP_011 GVGAAEKVFEFIDRQPTMVHDGSLAPDHLEGRVDFENVTFTYRTRPHTQVLQNVSFSLSP
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pF1KB3 GEVTALVGPNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQVLLDEKPISQYEHCYLHSQVVSVGQEPVL
       :.:::::::.:::::. . .:.:.:   ::.:::: :::: :.: :::  .  :.:::::
XP_011 GKVTALVGPSGSGKSSCVNILENFYPLEGGRVLLDGKPISAYDHKYLHRVISLVSQEPVL
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pF1KB3 FSGSVRNNIAYGLQSCEDDKVMAAAQAAHADDFIQEMEHGIYTDVGEKGSQLAAGQKQRL
       :. :. .::.::: .   . :. ::: :.:  ::.:.. :  :..::::.::..:::::.
XP_011 FARSITDNISYGLPTVPFEMVVEAAQKANAHGFIMELQDGYSTETGEKGAQLSGGQKQRV
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pF1KB3 AIARALVRDPRVLILDEATSALDVQCEQALQDWNSRGD---RTVLVIAHRLQAVQRAHQI
       :.::::::.: ::::::::::::.. :  .:.   .:.   .:::.:::::..:..:: :
XP_011 AMARALVRNPPVLILDEATSALDAESEYLIQQ-AIHGNLQKHTVLIIAHRLSTVEHAHLI
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pF1KB3 LVLQEGKLQKLA---QLQEGQDLYSRLVQQRLMD                      
       .::..:.. . .   ::     ::..:::....                       
XP_011 VVLDKGRVVQQGTHQQLLAQGGLYAKLVQRQMLGLQPAADFTAGHNEPVANGSHKA
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>>XP_016874592 (OMIM: 605453) PREDICTED: ATP-binding cas  (766 aa)
 initn: 1652 init1: 1478 opt: 1602  Z-score: 1737.8  bits: 332.2 E(85289): 4.6e-90
Smith-Waterman score: 1627; 40.9% identity (72.9% similar) in 663 aa overlap (69-702:89-743)

       40        50        60        70        80        90        
pF1KB3 WLEGTLRLGGLWGLLKLRGLLGFVGTLLLPLCLATPLTVSLRALVAGASRAPPARVASAP
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XP_016 CLLLGATIGVAKNSALGPRRLRASWLVITLVCLFVGIYAMVKLLLFSEVRRP----IRDP
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pF1KB3 WSWLL-----VGYGAAGLSWSLWAVLSP----------------PGAQEKEQDQVNNKVL
       : : :     .. ::. : : : ... :                ::. .   .:... .:
XP_016 WFWALFVWTYISLGASFLLWWLLSTVRPGTQALEPGAATEAEGFPGSGRPPPEQASGATL
          120       130       140       150       160       170    

       140       150       160       170         180       190     
pF1KB3 MWRLLKLSRPDLPLLVAAFFFLVLAVLGETLIPHYSGRVID--ILGGDFDPHAFASAIFF
       . .::. ..::. .:::: :::..:.::::..:.:.::.::  ..  ..:   :..:. .
XP_016 Q-KLLSYTKPDVAFLVAASFFLIVAALGETFLPYYTGRAIDGIVIQKSMDQ--FSTAVVI
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       :::..:. .  : ::.::. :::.:.  ::.:.: .:.:.... .:. . . ..:.  ..
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       .. .:.:.:.:::.....:......:::::. ::.:.  : . :.:  .:  ..      
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pF1KB3 FSGSVRNNIAYGLQSCEDDKVMAAAQAAHADDFIQEMEHGIYTDVGEKGSQLAAGQKQRL
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NP_062 FARSITDNISYGLPTVPFEMVVEAAQKANAHGFIMELQDGYSTETGEKGAQLSGGQKQRV
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NP_062 AMARALVRNPPVLILDEATSALDAESEYLIQQ-AIHGNLQKHTVLIIAHRLSTVEHAHLI
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NP_062 VVLDKGRVVQQGTHQQLLAQGGLYAKLVQRQMLGLQPAADFTAGHNEPVANGSHKA
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>>XP_011536397 (OMIM: 605453) PREDICTED: ATP-binding cas  (766 aa)
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pF1KB3 WSWLL-----VGYGAAGLSWSLWAVLSP----------------PGAQEKEQDQVNNKVL
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pF1KB3 EVLREIQDAVARAGQVVREAVGGLQTVRSFGAEEHEVCRYKEALEQCRQLYWRRDLERAL
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XP_011 GVGAAEKVFEFIDRQPTMVHDGSLAPDHLEGRVDFENVTFTYRTRPHTQVLQNVSFSLSP
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XP_011 FARSITDNISYGLPTVPFEMVVEAAQKANAHGFIMELQDGYSTETGEKGAQLSGGQKQRV
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pF1KB3 AIARALVRDPRVLILDEATSALDVQCEQALQDWNSRGD---RTVLVIAHRLQAVQRAHQI
       :.::::::.: ::::::::::::.. :  .:.   .:.   .:::.:::::..:..:: :
XP_011 AMARALVRNPPVLILDEATSALDAESEYLIQQ-AIHGNLQKHTVLIIAHRLSTVEHAHLI
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pF1KB3 LVLQEGKLQKLA---QLQEGQDLYSRLVQQRLMD                      
       .::..:.. . .   ::     ::..:::....                       
XP_011 VVLDKGRVVQQGTHQQLLAQGGLYAKLVQRQMLGLQPAADFTAGHNEPVANGSHKA
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       . .::. ..::. .:::: :::..:.::::..:.:.::.:: .  . .   :..:. ..:
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       :...:::..:: ::: ::  ..:.:.:.:. :: ::. :. .::.:..::.: :::.:::
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        .:.:.:.:::.....:......:::::. ::.:.  : . :.:  .:  ..      :.
NP_001 SKEVQNALARASNTAEETISAMKTVRSFANEEEEAEVYLRKLQQVYKLNRKEAAAYMYYV
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       ::::::: ..::::..   :.:::  :.: : :..:.:.: .::   ::....:.: ::.
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       :::::::.:::::. . .:.:.:   ::.:::: :::: :.: :::  .  :.::::::.
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NP_001 RSITDNISYGLPTVPFEMVVEAAQKANAHGFIMELQDGYSTETGEKGAQLSGGQKQRVAM
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pF1KB3 ARALVRDPRVLILDEATSALDVQCEQALQDWNSRGDRTVLVIAHRLQAVQRAHQILVLQE
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NP_001 ARALVRNPPVLILDEATSALDAESEYLI                                
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>>NP_982269 (OMIM: 605453) ATP-binding cassette sub-fami  (683 aa)
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pF1KB3 WLEGTLRLGGLWGLLKLRGLLGFVGTLLLPLCLATPLTVSLRALVAGASRAPPARVASAP
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pF1KB3 WSWLL-----VGYGAAGLSWSLWAVLSP----------------PGAQEKEQDQVNNKVL
       : : :     .. ::. : : : ... :                ::. .   .:... .:
NP_982 WFWALFVWTYISLGASFLLWWLLSTVRPGTQALEPGAATEAEGFPGSGRPPPEQASGATL
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pF1KB3 MWRLLKLSRPDLPLLVAAFFFLVLAVLGETLIPHYSGRVIDILGGDFDPHAFASAIFFMC
       . .::. ..::. .:::: :::..:.::::..:.:.::.:: .  . .   :..:. ..:
NP_982 Q-KLLSYTKPDVAFLVAASFFLIVAALGETFLPYYTGRAIDGIVIQKSMDQFSTAVVIVC
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pF1KB3 LFSFGSSLSAGCRGGCFTYTMSRINLRIREQLFSSLLRQDLGFFQETKTGELNSRLSSDT
       :...:::..:: ::: ::  ..:.:.:.:. :: ::. :. .::.:..::.: :::.:::
NP_982 LLAIGSSFAAGIRGGIFTLIFARLNIRLRNCLFRSLVSQETSFFDENRTGDLISRLTSDT
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pF1KB3 TLMSNWLPLNANVLLRSLVKVVGLYGFMLSISPRLTLLSLLHMPFTIAAEKVYNTRHQEV
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NP_982 TMVSDLVSQNINVFLRNTVKVTGVVVFMFSLSWQLSLVTFMGFPIIMMVSNIYGKYYKRL
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pF1KB3 LREIQDAVARAGQVVREAVGGLQTVRSFGAEEHEVCRYKEALEQCRQLYWRRDLERALYL
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NP_982 SKEVQNALARASNTAEETISAMKTVRSFANEEEEAEVYLRKLQQVYKLNRKEAAAYMYYV
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pF1KB3 LVRRVLHLGVQMLMLSCGLQQMQDGELTQGSLLSFMIYQESVGSYVQTLVYIYGDMLSNV
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NP_982 WGSGLTLLVVQVSILYYGGHLVISGQMTSGNLIAFIIYEFVLGDCMESVGSVYSGLMQGV
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pF1KB3 GAAEKVFSYMDRQPNLPSPGTLAPTTLQGVVKFQDVSFAYPNRPDRPVLKGLTFTLRPGE
       ::::::: ..::::..   :.:::  :.: : :..:.:.: .::   ::....:.: ::.
NP_982 GAAEKVFEFIDRQPTMVHDGSLAPDHLEGRVDFENVTFTYRTRPHTQVLQNVSFSLSPGK
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pF1KB3 VTALVGPNGSGKSTVAALLQNLYQPTGGQVLLDEKPISQYEHCYLHSQVVSVGQEPVLFS
       :::::::.:::::. . .:.:.:   ::.:::: :::: :.: :::  .  :.::::::.
NP_982 VTALVGPSGSGKSSCVNILENFYPLEGGRVLLDGKPISAYDHKYLHRVISLVSQEPVLFA
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pF1KB3 GSVRNNIAYGLQSCEDDKVMAAAQAAHADDFIQEMEHGIYTDVGEKGSQLAAGQKQRLAI
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NP_982 RSITDNISYGLPTVPFEMVVEAAQKANAHGFIMELQDGYSTETGEKGAQLSGGQKQRVAM
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pF1KB3 ARALVRDPRVLILDEATSALDVQCEQALQDWNSRGDRTVLVIAHRLQAVQRAHQILVLQE
       ::::::.: ::::::::::::.. :                                   
NP_982 ARALVRNPPVLILDEATSALDAESEYLCAG                              
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pF1KB3 WLEGTLRLGGLW----GLLKL-----------RGLLGFVGTLLLPLCLATPLTVSLRALV
       :  :  : . ::    :.:.            .: :. .  :   : :: :  . .: :.
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pF1KB3 A-GA-SRAPPARV---ASAPWSWLLVGYGAAGLSWSLWAVLSP---PGAQEKEQDQVNNK
       . :: . :  .:.   .: : . ..:.:.::  . .::  :.    ::.:    . :   
NP_000 SWGAPGSADSTRLLHWGSHP-TAFVVSYAAALPAAALWHKLGSLWVPGGQGGSGNPVR--
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pF1KB3 VLMWRLLKLSRPDLPLLVAAFFFLVLAVLGETLIPHYSGRVIDILGGDFDPHAFASAIFF
           :::     .   :   . ..::. :::  :: ..::. : .  : .  .:.  . .
NP_000 ----RLLGCLGSETRRLSLFLVLVVLSSLGEMAIPFFTGRLTDWILQDGSADTFTRNLTL
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pF1KB3 MCLFSFGSSLSAGCRGGCFTYTMSRINLRIREQLFSSLLRQDLGFFQETKTGELNSRLSS
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NP_000 MSILTIASAVLEFVGDGIYNNTMGHVHSHLQGEVFGAVLRQETEFFQQNQTGNIMSRVTE
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