Result of FASTA (ccds) for pF1KB3338
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3338, 1161 aa
  1>>>pF1KB3338 1161 - 1161 aa - 1161 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8540+/-0.00106; mu= 18.6936+/- 0.064
 mean_var=71.7161+/-14.292, 0's: 0 Z-trim(102.7): 62  B-trim: 10 in 1/49
 Lambda= 0.151449
 statistics sampled from 7001 (7063) to 7001 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.57), E-opt: 0.2 (0.217), width:  16
 Scan time:  5.200

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS32438.1 ITGAD gene_id:3681|Hs108|chr16         (1161) 7665 1685.0       0
CCDS67014.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16         (1169) 4978 1098.0       0
CCDS10711.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16         (1163) 4975 1097.3       0
CCDS45470.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16         (1152) 4479 988.9       0
CCDS54004.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16         (1153) 4467 986.3       0
CCDS32433.1 ITGAL gene_id:3683|Hs108|chr16         (1170) 1799 403.4 1.7e-111
CCDS45461.1 ITGAL gene_id:3683|Hs108|chr16         (1086) 1506 339.3 2.9e-92
CCDS32531.1 ITGAE gene_id:3682|Hs108|chr17         (1179) 1255 284.5   1e-75
CCDS45291.1 ITGA11 gene_id:22801|Hs108|chr15       (1188) 1101 250.9 1.4e-65
CCDS76204.1 ITGA10 gene_id:8515|Hs108|chr1         (1024) 1062 242.3 4.4e-63
CCDS72869.1 ITGA10 gene_id:8515|Hs108|chr1         (1167) 1062 242.3   5e-63
CCDS3957.1 ITGA2 gene_id:3673|Hs108|chr5           (1181)  741 172.2 6.5e-42
CCDS42788.1 ITGA4 gene_id:3676|Hs108|chr2          (1032)  658 154.0 1.7e-36
CCDS2669.1 ITGA9 gene_id:3680|Hs108|chr3           (1035)  635 149.0 5.4e-35
CCDS3955.1 ITGA1 gene_id:3672|Hs108|chr5           (1179)  591 139.4 4.8e-32
CCDS11558.1 ITGA3 gene_id:3675|Hs108|chr17         (1051)  573 135.5 6.6e-31
CCDS8880.1 ITGA5 gene_id:3678|Hs108|chr12          (1049)  564 133.5 2.6e-30
CCDS46471.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2          (1002)  556 131.7 8.3e-30
CCDS46470.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2          (1012)  556 131.7 8.4e-30
CCDS2292.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2           (1048)  556 131.8 8.6e-30
CCDS31155.1 ITGA8 gene_id:8516|Hs108|chr10         (1063)  535 127.2 2.1e-28
CCDS32665.1 ITGA2B gene_id:3674|Hs108|chr17        (1039)  528 125.6 5.9e-28
CCDS82534.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs108|chr2          ( 954)  441 106.6 2.9e-22
CCDS8888.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12          (1137)  434 105.1 9.8e-22
CCDS44914.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12         (1044)  430 104.2 1.7e-21
CCDS55832.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12         (1141)  430 104.2 1.8e-21
CCDS2249.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs108|chr2           (1073)  424 102.9 4.2e-21
CCDS46451.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs108|chr2          (1091)  424 102.9 4.3e-21
CCDS336.1 MATN1 gene_id:4146|Hs108|chr1            ( 496)  317 79.4 2.3e-14
CCDS34938.1 COL14A1 gene_id:7373|Hs108|chr8        (1796)  311 78.3 1.8e-13
CCDS83309.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8          ( 915)  292 74.1 1.8e-12
CCDS55265.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8          ( 937)  292 74.1 1.8e-12
CCDS55264.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8          ( 956)  292 74.1 1.8e-12
CCDS46226.1 MATN3 gene_id:4148|Hs108|chr2          ( 486)  275 70.2 1.3e-11


>>CCDS32438.1 ITGAD gene_id:3681|Hs108|chr16              (1161 aa)
 initn: 7665 init1: 7665 opt: 7665  Z-score: 9042.2  bits: 1685.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7665; 100.0% identity (100.0% similar) in 1161 aa overlap (1-1161:1-1161)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 KGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 EGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQLFH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQLFH
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 HKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQEL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 NTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTALT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTALT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 MDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQNLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQNLV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 LGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIGAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIGAP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 HYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDVAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDVAI
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 GAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGLMD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGLMD
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 LAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTIQKS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 SLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLLPDCV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLLPDCV
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 EDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEGDLGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEGDLGV
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB3 TLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQPHQSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQPHQSA
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB3 LRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRASASSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRASASSE
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB3 NNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEAEHRYRVNNLSQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEAEHRYRVNNLSQR
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB3 DLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHSDFLTQISRSPMLDCSIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLPCVSERKPPQHSDFLTQISRSPMLDCSIA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB3 DCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEITFDTSVYSQLPGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEITFDTSVYSQLPGQ
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB3 EAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFFKRHYKEMLEDKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFFKRHYKEMLEDKP
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160 
pF1KB3 EDTATFSGDDFSCVAPNVPLS
       :::::::::::::::::::::
CCDS32 EDTATFSGDDFSCVAPNVPLS
             1150      1160 

>>CCDS67014.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16              (1169 aa)
 initn: 4949 init1: 2496 opt: 4978  Z-score: 5869.2  bits: 1098.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4978; 65.3% identity (84.6% similar) in 1163 aa overlap (2-1159:4-1165)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB3   MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAA
          : ...::...::.  :::::.:: : :. :..:::.::::...: .::::: ...::
CCDS67 MTRTRAALLLFTALATSLGFNLDTEELTAFRVDSAGFGDSVVQYANSWVVVGAPQKITAA
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB3 NQTGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENS
       :::: ::.:. .:: :.:: :.. ::::::::::.::..:. :.:::::::.:. ::.: 
CCDS67 NQTGGLYQCGYSTGACEPIGLQVPPEAVNMSLGLSLASTTSPSQLLACGPTVHHECGRNM
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB3 YSKGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMG
       :  : :.:::   .. : .: .  :::.::.::::::::::::.. .:  : .::.::..
CCDS67 YLTGLCFLLGPT-QLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLIDGSGSISSRNFATMMNFVRAVIS
              130        140       150       160       170         

      180       190       200       210       220       230        
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CCDS10 LGQRDLPVSINFWVPVELNQEAVWMDVEVSHPQNPSLRCSSEKIAPPASDFLAHIQKNPV
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       :::::::::::::   :::. .:.:  :.:.:::.:.:::::::::.:::.:::::.:::
CCDS10 SQLPGQEAFMRAQTTTVLEKYKVHNPTPLIVGSSIGGLLLLALITAVLYKVGFFKRQYKE
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CCDS10 MMEEANGQIAPENGTQTPSPPSEK   
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>>CCDS45470.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16              (1152 aa)
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       :::::::::::::::::::::..::::::: ::::.:::::::::::::::: ::: :::
CCDS45 PHYYEQTRGGQVSVCPLPRGRARWQCDAVLYGEQGQPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVA
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CCDS45 IGAPGEEDNRGAVYLFHGTSGSGISPSHSQRIAGSKLSPRLQYFGQSLSGGQDLTMDGLV
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CCDS45 STRDRLREGQIQSVVTYDLALDSGRPHSRAVFNETKNSTRRQTQVLGLTQTCETLKLQLP
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CCDS45 QRSWRLACESASSTEVSGALKSTSCSINHPIFPENSEVTFNITFDVDSKASLGNKLLLKA
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CCDS45 NVTSENNMPRTNKTEFQLELPVKYAVYMVVTSHGVSTKYLNF-TASENTSRVMQHQYQVS
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pF1KB3 NLSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVWDVVMEAPSQSLP--CVSERKPPQHSDFLTQISRSP
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CCDS45 NLGQRSLPISLVFLVPVRLNQTVIWDRPQVTFSENLSSTCHTKERLPSHSDFLAELRKAP
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CCDS45 VVNCSIAVCQRIQCDIPFFGIQEEFNATLKGNLSFDWYIKTSHNHLLIVSTAEILFNDSV
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CCDS45 FTLLPGQGAFVRSQTETKVEPFEVPNPLPLIVGSSVGGLLLLALITAALYKLGFFKRQYK
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pF1KB3 EMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS
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CCDS45 DMMSEGGPPGAEPQ              
     1140      1150                

>>CCDS54004.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16              (1153 aa)
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pF1KB3 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAANQ
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CCDS54  MALRVLLLTALTLCHGFNLDTENAMTFQENARGFGQSVVQLQGSRVVVGAPQEIVAANQ
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pF1KB3 TGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENSYS
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CCDS54 RGSLYQCDYSTGSCEPIRLQVPVEAVNMSLGLSLAATTSPPQLLACGPTVHQTCSENTYV
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pF1KB3 KGSCLLLGSRW-EIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMGQ
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CCDS54 KGLCFLFGSNLRQQPQKFPEALRGCPQEDSDIAFLIDGSGSIIPHDFRRMKEFVSTVMEQ
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CCDS54 NITNGARKNAFKILVVITDGEKFGDPLGYEDVIPEADREGVIRYVIGVGDAFRSEKSRQE
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CCDS54 TSNGPLLSTVGSYDWAGGVFLYTSKEKSTFINMTRVDSDMNDAYLGYAAAIILRNRVQSL
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CCDS32 CLKPLHEKDSESGGGKD
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CCDS45 KHVKHMLLLTNTFGAINYVATEVFREELGARPDATKVLIIITDG-------EATDSGNID
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           :::: ::.:. ::   ... :. ..: : .. :  .:.:  : ..  .::.:::..
CCDS45 AAKDIIRYIIGIGKHFQTKESQETLHKFASKPASEFVKILDTFEKLKDLFTELQKKIYVI
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       :::...  .::. :.:. :.:. :.     .::::. .:.:: .    ...  :::.   
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        . ..: .::::. : :   . .. :. ::::::: :....:   : . .: .   . ::
CCDS45 LTPEVRAGYLGYTVTWLPSRQKTSLLASGAPRYQHMGRVLLFQEPQGGGHWSQVQTIHGT
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       :::::::. ::.::::.:: :.:.::::: .: . :::.: .    : .. ..  . :.:
CCDS45 QIGSYFGGELCGVDVDQDGETELLLIGAPLFYGEQRGGRVFI--YQRRQLGFEEVSELQG
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pF1KB3 EQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDVAIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQRI
       . :.: :::: :.:.: :.: : :.:::.::: :..  ::::.:.:  ..:.::. ::::
CCDS45 DPGYPLGRFGEAITALTDINGDGLVDVAVGAPLEEQ--GAVYIFNG-RHGGLSPQPSQRI
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        ..:.   .:.::... : .::  ::: :.::::..:...: : ::. . . : :::.:.
CCDS45 EGTQVLSGIQWFGRSIHGVKDLEGDGLADVAVGAESQMIVLSSRPVVDMVTLMSFSPAEI
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pF1KB3 AKAVYRCWEEKPSALEAG-DATVCLTIQKSSLDQL-GDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIF
            .:     . .. : . :.:. : :: . :. : . ... . : ::  :   :..:
CCDS45 PVHEVECSYSTSNKMKEGVNITICFQI-KSLIPQFQGRLVANLTYTLQLDGHRTRRRGLF
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pF1KB3 NETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLLLPDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLR--
          ..  : :  ..  .. :  ... .: ::.:..::: . ::::: .:   .:.. :  
CCDS45 PGGRHE-LRRNIAVTTSMSCTDFSFHFPVCVQDLISPINVSLNFSLWEEE-GTPRDQRAG
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pF1KB3 ---PVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEGDLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTV
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CCDS45 KDIPPILRPSLHSETWEIPFEKNCGEDKKCEANLRVSFSPARSRALRLTAFASLSVELSL
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pF1KB3 WNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQPHQSALRLACETVPTEDEGL-RSSRCSVN
        :  ::.: . ..:..: ::: :.:   . .:: : . ..:: .: :.. : :.  :.:.
CCDS45 SNLEEDAYWVQLDLHFPPGLSFRKV--EMLKPH-SQIPVSCEELPEESRLLSRALSCNVS
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pF1KB3 HPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRASASSENNKAS---SSKATFQLELPVKYA
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CCDS45 SPIFKAGHSVALQMMFNTLVNSSWGDSVELHANVTCNNEDSDLLEDNSATTII--PILYP
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pF1KB3 VYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEAEHRYRVNNLSQRDLAISI-NFWVPVLLNGVAV
       .  .:. ::.:: : .: :    :.....: :.:       .  :: .  .:.:   :.:
CCDS45 INILIQDQEDSTLYVSF-TPKGPKIHQVKHMYQVR------IQPSIHDHNIPTLEAVVGV
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pF1KB3 WDVVMEAPSQSLPCVSERKP-PQHSDFLTQISRSPMLDCSIADCLQ---FRCDVPSFSVQ
        .   :.:      :. . : : : .   .. : :  : .   ::    ::: :     .
CCDS45 PQPPSEGPITHQWSVQMEPPVPCHYE---DLERLP--DAA-EPCLPGALFRCPV---VFR
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pF1KB3 EELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVL-VVSVAEITFDTSVYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEE
       .:.   . :.: .  : :   .... . :   :.:..: . .: :..: . ::.  :.. 
CCDS45 QEILVQVIGTLEL--VGEIEASSMFSLCSSLSISFNSSKHFHLYGSNASL-AQV--VMKV
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pF1KB3 DEVYNA--IPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFFKRHYKEMLEDKPEDTATFSGDDFS
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CCDS45 DVVYEKQMLYLYVLSGIGGLLLLLLIFIVLYKVGFFKRNLKEKMEAGRGVPNGIPAEDSE
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CCDS45 QLASGQEAGDPGCLKPLHEKDSESGGGKD
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CCDS32 NTARQRRALEKEEEEDKEEEEDEEEEEAGTEIAIILDGSGSIDPPDFQRAKDFISNMMRN
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pF1KB3 F--EGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQ
       :  .  .  :::.::..... .: . . .   .. . :. :.:. ..: ::...  :. .
CCDS32 FYEKCFECNFALVQYGGVIQTEFDLRDSQDVMASLARVQNITQVGSVTKTASAMQHVLDS
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pF1KB3 LFHHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTAR
       .:  ..:.:..:.:...:.:::  ..:::. . :: . .  :. :.:::::. :..  . 
CCDS32 IFTSSHGSRRKASKVMVVLTDGGIFEDPLNLTTVINSPKMQGVERFAIGVGEEFKSARTA
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pF1KB3 QELNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFST
       .::: :.: : . :.::: :. :: .. ..:. .: ..:::   ..........: ::: 
CCDS32 RELNLIASDPDETHAFKVTNYMALDGLLSKLRYNIISMEGT---VGDALHYQLAQIGFS-
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pF1KB3 ALTMD--GLFLGAVGSFSWSGGAFLYPP-NMSPTFINMSQENVD----MRDSYLGYSTEL
       :  .:   ..:::::.:.:::::.::   .    :.:..   .      . :::::.. .
CCDS32 AQILDERQVLLGAVGAFDWSGGALLYDTRSRRGRFLNQTAAAAADAEAAQYSYLGYAVAV
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pF1KB3 ALWKGVQNLVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDG
              . . :::::.: : .  . . .:.      . : :.:::::. :: ::.: ::
CCDS32 LHKTCSLSYIAGAPRYKHHGAVFELQKEGREASFLPVLEGEQMGSYFGSELCPVDIDMDG
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pF1KB3 STDLILIGAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDV
       :::..:..:: :. . . :.: :  : .   ...   .: :. :   .::: :....::.
CCDS32 STDFLLVAAPFYHVHGEEGRVYVYRLSEQDGSFSLARILSGHPGFTNARFGFAMAAMGDL
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pF1KB3 NEDKLIDVAIGAP----GEQENR--GAVYLFHGASESGISPSHSQRIASSQLSPRLQYFG
       ..::: :::::::    : ...   :.::...:  . :.: : :::: .: ..: :::::
CCDS32 SQDKLTDVAIGAPLEGFGADDGASFGSVYIYNGHWD-GLSASPSQRIRASTVAPGLQYFG
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pF1KB3 QALSGGQDLTQDGLMDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPS
       ....:: :.. ::: :..::. ::....:: ::... :.: :.               ::
CCDS32 MSMAGGFDISGDGLADITVGTLGQAVVFRSRPVVRLKVSMAFT---------------PS
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pF1KB3 ALEAG-----DATVCLTIQK-SSLDQLGDIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLT
       ::  :     .. .:. :.. .. .. :  .. . : : .: :.   :   .....    
CCDS32 ALPIGFNGVVNVRLCFEISSVTTASESGLREALLNFTLDVDVGKQRRRLQCSDVRSCLGC
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pF1KB3 RRKTLGLGIHCETLKLLLPD----CVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGS
        :.  . .  :: : ::.:     : ::  :   ......: . :  . .. .:.:   .
CCDS32 LREWSSGSQLCEDL-LLMPTEGELCEEDCFSNASVKVSYQL-QTPEGQTDHPQPILDRYT
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pF1KB3 QDLFTASLPFEKNCGQDGLCEGDLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGT
       . .   .::.:: : .  .: ..: .. . :  : :.:: . ::.. ... :.::::: :
CCDS32 EPFAIFQLPYEKACKNKLFCVAELQLATTVSQ-QELVVGLTKELTLNINLTNSGEDSYMT
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pF1KB3 VVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQPHQSALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGT
        ..: :: .:. .:.   :: :  .   . :.  :    ..    : ..::.....:  .
CCDS32 SMALNYPRNLQLKRM---QKPPSPN---IQCDD-PQPVASVLIMNCRIGHPVLKRSSAHV
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CCDS32 LVLIVILVILFKCGFFKRKYQQLNLESIRKAQLKSENLLEEEN      
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CCDS45 WVEVQHFLINILKKFYIGPGQIQVGVVQYGEDVVHEFHLNDYRSVKDVVEAASHIEQRGG
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CCDS45 YAVAVLGYYNRRGINPETFLNEIKYIASDPDDKHFFNVTDEAALKDIVDALGDRIFSLEG
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CCDS45 T-NKNETSFGLEMSQTGFSSHVVEDGVLLGAVGAYDWNGAVLKETSAGKVIPLRESYLKE
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pF1KB3 TQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIGAPHYYEQTRG-GQVSVCPLPRGRVQWQCDAVL
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CCDS45 QQIGSYFGSEITSVDIDGDGVTDVLLVGAPMYFNEGRERGKVYVYELRQNLFVY--NGTL
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pF1KB3 RGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDVAIGAPGEQENRGAVYLFHGASESGISPSHSQ
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CCDS45 KDSHSYQNARFGSSIASVRDLNQDSYNDVVVGAPLEDNHAGAIYIFHGFRGS-ILKTPKQ
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pF1KB3 RIASSQLSPRLQYFGQALSGGQDLTQDGLMDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPV
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CCDS45 KINIFHRDCKRSGRDATCLA-AFLCFTPIFLAPHFQTTTV--GIRYNATMDERRYTPRAH
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pF1KB3 PVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEGDL---------------------------GV
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CCDS45 PMLDDGWPTTLRVSVPFWNGCNEDEHCVPDLVLDARSDLPTAMEYCQRVLRKPAQDCSAY
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pF1KB3 NNKASSSKA--TFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEAEHRY----RV
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CCDS45 SNERDSTKEDNVAPLRFHLKYEADVLFTRSSSLSHYEVKPNSSLERYDGIGPPFSCIFRI
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CCDS45 QNLGLFPIHGMMMKITIPIATRSGNRLLKLRDFLTDEANTS--CNIWGNSTEYRPTPVEE
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pF1KB3 DFLTQISRSPMLDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVR--ETLQKKVLV
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CCDS45 D----LRRAPQLNHSNSDVVSINCNI-RLVPNQEINFHLLGNL---WLRSLKALKYKSMK
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pF1KB3 VSVAEITFDTSVYSQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNA-IPIIMGSSVGALLLLALITA
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CCDS45 IMV-NAALQRQFHSPFIFREEDPSRQIVFEISKQEDWQVPIWIIVGSTLGGLLLLALLVL
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pF1KB3 TLYKLGFFK---RHYKEMLEDKPEDTATFSGDDFSCVAPNVPLS
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CCDS45 ALWKLGFFRSARRRREPGLDPTPKVLE                 
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>>CCDS76204.1 ITGA10 gene_id:8515|Hs108|chr1              (1024 aa)
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CCDS76             MELPFVTHLFLPLVFLTGCP-TYMDVVIVLDGSNSI--YPWSEVQTFL
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pF1KB3 QAVMGQF--EGTDTLFALMQYSNLLKIH-FTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGL-TFTAT
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CCDS76 RRLVGKLFIDPEQIQVGLVQYGES-PVHEWSLGDFRTKEEVVRAAKNLSRREGRETKTAQ
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pF1KB3 GILTVVTQLFHHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGV-G
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CCDS76 AIMVACTEGFSQSHGGRPEAARLLVVVTDGESH-DGEELPAALKACEAGRVTRYGIAVLG
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pF1KB3 HAFQ---GPTAR-QELNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASS
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CCDS76 HYLRRQRDPSSFLREIRTIASDPDERFFFNVTDEAALTDIVDALGDRIFGLEGSHAENES
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pF1KB3 SFQHEMSQEGFSTALTMDGLFLGAVGSFSWSG-------GAFLYPPNMSPTFINMSQENV
       ::  :::: ::::    ::...: ::...:.:       :  :.:: :.  . .     .
CCDS76 SFGLEMSQIGFSTHRLKDGILFGMVGAYDWGGSVLWLEGGHRLFPPRMA--LEDEFPPAL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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