Result of SIM4 for pF1KB3312

seq1 = pF1KB3312.tfa, 2472 bp
seq2 = pF1KB3312/gi568815581r_47020938.tfa (gi568815581r:47020938_47281640), 260703 bp

>pF1KB3312 2472
>gi568815581r:47020938_47281640 (Chr17)

(complement)

1-27  (92469-92495)   100% ->
28-103  (100004-100079)   100% ->
104-251  (109577-109724)   100% ->
252-377  (111599-111724)   100% ->
378-475  (123338-123435)   100% ->
476-630  (124257-124411)   100% ->
631-842  (124517-124728)   100% ->
843-957  (126855-126969)   100% ->
958-1070  (129723-129835)   100% ->
1071-1170  (137659-137758)   100% ->
1171-1378  (139205-139412)   100% ->
1379-1551  (139616-139788)   100% ->
1552-1704  (142750-142902)   100% ->
1705-1913  (144281-144489)   100% ->
1914-2031  (149267-149384)   100% ->
2032-2160  (152120-152248)   100% ->
2161-2235  (157681-157755)   100% ->
2236-2392  (159041-159197)   100% ->
2393-2472  (160624-160703)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACGGTGCTGCAGGAACCCGTCCAG         GCTGCTATATGGCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
  92469 ATGACGGTGCTGCAGGAACCCGTCCAGGTA...CAGGCTGCTATATGGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AGCACTAAACCACTATGCTTACCGAGATGCGGTTTTCCTCGCAGAACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100018 AGCACTAAACCACTATGCTTACCGAGATGCGGTTTTCCTCGCAGAACGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTTATGCAGAAG         TACACTCAGAAGAAGCCTTGTTTTTACTG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100068 TTTATGCAGAAGGTT...TAGTACACTCAGAAGAAGCCTTGTTTTTACTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GCAACCTGTTATTACCGCTCAGGAAAGGCATATAAAGCATATAGACTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109606 GCAACCTGTTATTACCGCTCAGGAAAGGCATATAAAGCATATAGACTCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GAAAGGACACAGTTGTACTACACCGCAATGCAAATACCTGCTTGCAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109656 GAAAGGACACAGTTGTACTACACCGCAATGCAAATACCTGCTTGCAAAAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTTGTGTTGATCTCAGCAA         GCTTGCAGAAGGGGAACAAATC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 109706 GTTGTGTTGATCTCAGCAAGTA...AAGGCTTGCAGAAGGGGAACAAATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTATCTGGTGGAGTGTTTAATAAGCAGAAAAGCCATGATGATATTGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111621 TTATCTGGTGGAGTGTTTAATAAGCAGAAAAGCCATGATGATATTGTTAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGAGTTTGGTGATTCAGCTTGCTTTACTCTTTCATTGTTGGGACATGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111671 TGAGTTTGGTGATTCAGCTTGCTTTACTCTTTCATTGTTGGGACATGTAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATTG         CAAGACAGATCGGCTTGCCAAAGGATCAGAATGTTAC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111721 ATTGGTA...CAGCAAGACAGATCGGCTTGCCAAAGGATCAGAATGTTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CAAAAGAGCCTTAGTTTAAATCCTTTCCTCTGGTCTCCCTTTGAATCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123375 CAAAAGAGCCTTAGTTTAAATCCTTTCCTCTGGTCTCCCTTTGAATCATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 ATGTGAAATAG         GTGAAAAGCCAGATCCTGACCAAACATTTA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 123425 ATGTGAAATAGGTA...CAGGTGAAAAGCCAGATCCTGACCAAACATTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AATTCACATCTTTACAGAACTTTAGCAACTGTCTGCCCAACTCTTGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124287 AATTCACATCTTTACAGAACTTTAGCAACTGTCTGCCCAACTCTTGCACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ACACAAGTACCTAATCATAGTTTATCTCACAGACAGCCTGAGACAGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124337 ACACAAGTACCTAATCATAGTTTATCTCACAGACAGCCTGAGACAGTTCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TACGGAAACACCCCAGGACACAATT         GAATTAAACAGATTGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 124387 TACGGAAACACCCCAGGACACAATTGTA...CAGGAATTAAACAGATTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ATTTAGAATCTTCCAATTCAAAGTACTCCTTGAATACAGATTCCTCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124533 ATTTAGAATCTTCCAATTCAAAGTACTCCTTGAATACAGATTCCTCAGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TCTTATATTGATTCAGCTGTAATTTCACCTGATACTGTCCCACTGGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124583 TCTTATATTGATTCAGCTGTAATTTCACCTGATACTGTCCCACTGGGAAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AGGAACTTCCATATTATCTAAACAGGTTCAAAATAAACCAAAAACTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124633 AGGAACTTCCATATTATCTAAACAGGTTCAAAATAAACCAAAAACTGGTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GAAGTTTATTAGGAGGACCAGCAGCTCTTAGTCCATTAACCCCAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 124683 GAAGTTTATTAGGAGGACCAGCAGCTCTTAGTCCATTAACCCCAAGGTA.

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    843      TTTTGGGATTTTGCCATTAGAAACCCCAAGTCCTGGAGATGGATC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124733 ..CAGTTTTGGGATTTTGCCATTAGAAACCCCAAGTCCTGGAGATGGATC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CTATTTACAAAACTACACTAATACACCTCCTGTAATTGATGTGCCATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126900 CTATTTACAAAACTACACTAATACACCTCCTGTAATTGATGTGCCATCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CCGGAGCCCCTTCAAAAAAG         TCTGTTGCCAGAATCGGCCAA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 126950 CCGGAGCCCCTTCAAAAAAGGTA...CAGTCTGTTGCCAGAATCGGCCAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 ACTGGAACAAAGTCTGTCTTCTCACAGAGTGGAAATAGCCGAGAGGTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129744 ACTGGAACAAAGTCTGTCTTCTCACAGAGTGGAAATAGCCGAGAGGTAAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TCCAATTCTTGCACAAACACAAAGTTCTGGTCCACAAACAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 129794 TCCAATTCTTGCACAAACACAAAGTTCTGGTCCACAAACAAGGTA...TA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1071  TACAACACCTCAGGTATTGAGCCCCACTATTACATCTCCCCCAAACGCA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137658 GTACAACACCTCAGGTATTGAGCCCCACTATTACATCTCCCCCAAACGCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CTGCCTCGAAGAAGTTCACGACTCTTTACTAGTGACAGCTCCACAACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137708 CTGCCTCGAAGAAGTTCACGACTCTTTACTAGTGACAGCTCCACAACCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 G         GAGAATAGCAAAAAATTAAAAATGAAGTTTCCACCTAAAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137758 GGTA...CAGGAGAATAGCAAAAAATTAAAAATGAAGTTTCCACCTAAAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 TCCCAAACAGAAAAACAAAAAGTAAAACTAATAAAGGAGGAATAACTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139245 TCCCAAACAGAAAAACAAAAAGTAAAACTAATAAAGGAGGAATAACTCAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 CCTAACATAAATGATAGCCTGGAAATTACAAAATTGGACTCTTCCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139295 CCTAACATAAATGATAGCCTGGAAATTACAAAATTGGACTCTTCCATCAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TTCAGAAGGGAAAATATCCACAATCACACCTCAGATTCAGGCCTTTAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139345 TTCAGAAGGGAAAATATCCACAATCACACCTCAGATTCAGGCCTTTAATC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TACAAAAAGCAGCAGCAG         AAGGTTTGATGAGCCTTCTTCGT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 139395 TACAAAAAGCAGCAGCAGGTC...TAGAAGGTTTGATGAGCCTTCTTCGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GAAATGGGGAAAGGTTATTTAGCTTTGTGTTCATACAACTGCAAAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139639 GAAATGGGGAAAGGTTATTTAGCTTTGTGTTCATACAACTGCAAAGAAGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 TATAAATATTTTGAGCCATCTACCTTCTCACCACTACAATACTGGTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139689 TATAAATATTTTGAGCCATCTACCTTCTCACCACTACAATACTGGTTGGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 TACTGTGCCAAATTGGAAGGGCCTATTTTGAACTTTCAGAGTACATGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139739 TACTGTGCCAAATTGGAAGGGCCTATTTTGAACTTTCAGAGTACATGCAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552          GCTGAAAGAATATTCTCAGAGGTTAGAAGGATTGAGAATTA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139789 GTA...CAGGCTGAAAGAATATTCTCAGAGGTTAGAAGGATTGAGAATTA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 TAGAGTTGAAGGCATGGAGATCTACTCTACAACACTTTGGCATCTTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142791 TAGAGTTGAAGGCATGGAGATCTACTCTACAACACTTTGGCATCTTCAAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 AAGATGTTGCTCTTTCAGTTCTGTCAAAAGACTTAACAGACATGGATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142841 AAGATGTTGCTCTTTCAGTTCTGTCAAAAGACTTAACAGACATGGATAAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 AATTCGCCAGAG         GCCTGGTGTGCTGCAGGGAACTGTTTCAG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 142891 AATTCGCCAGAGGTA...AAGGCCTGGTGTGCTGCAGGGAACTGTTTCAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 TCTGCAACGGGAACATGATATTGCAATTAAATTCTTCCAGAGAGCTATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144310 TCTGCAACGGGAACATGATATTGCAATTAAATTCTTCCAGAGAGCTATCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 AAGTTGATCCAAATTACGCTTATGCCTATACTCTATTAGGGCATGAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144360 AAGTTGATCCAAATTACGCTTATGCCTATACTCTATTAGGGCATGAGTTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 GTCTTAACTGAAGAATTGGACAAAGCATTAGCTTGTTTTCGAAATGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144410 GTCTTAACTGAAGAATTGGACAAAGCATTAGCTTGTTTTCGAAATGCTAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 CAGAGTCAATCCTAGACATTATAATGCATG         GTATGGTTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 144460 CAGAGTCAATCCTAGACATTATAATGCATGGTA...CAGGTATGGTTTAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 GAATGATTTATTACAAGCAAGAAAAATTCAGCCTTGCAGAAATGCATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149278 GAATGATTTATTACAAGCAAGAAAAATTCAGCCTTGCAGAAATGCATTTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 CAAAAAGCGCTTGATATCAACCCTCAAAGTTCAGTTTTACTTTGCCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149328 CAAAAAGCGCTTGATATCAACCCTCAAAGTTCAGTTTTACTTTGCCACAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 TGGAGTA         GTTCAACATGCACTGAAAAAATCAGAGAAGGCTT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149378 TGGAGTAGTA...CAGGTTCAACATGCACTGAAAAAATCAGAGAAGGCTT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 TGGATACCCTAAACAAAGCCATTGTCATTGATCCCAAGAACCCTCTATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152154 TGGATACCCTAAACAAAGCCATTGTCATTGATCCCAAGAACCCTCTATGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 AAATTTCACAGAGCCTCAGTTTTATTTGCAAATGAAAAATATAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 152204 AAATTTCACAGAGCCTCAGTTTTATTTGCAAATGAAAAATATAAGGTA..

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2161     TCTGCTTTACAAGAACTTGAAGAATTGAAACAAATTGTTCCCAAAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152254 .CAGTCTGCTTTACAAGAACTTGAAGAATTGAAACAAATTGTTCCCAAAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 AATCCCTCGTTTACTTCTTAATAGGAAAG         GTTTACAAGAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 157727 AATCCCTCGTTTACTTCTTAATAGGAAAGGTA...TAGGTTTACAAGAAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 TTAGGTCAAACGCACCTCGCCCTGATGAATTTCTCTTGGGCTATGGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159053 TTAGGTCAAACGCACCTCGCCCTGATGAATTTCTCTTGGGCTATGGATTT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 AGATCCTAAAGGAGCCAATAACCAGATTAAAGAGGCAATTGATAAGCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159103 AGATCCTAAAGGAGCCAATAACCAGATTAAAGAGGCAATTGATAAGCGTT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 ATCTTCCAGATGATGAGGAGCCAATAACCCAAGAAGAACAGATCA     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 159153 ATCTTCCAGATGATGAGGAGCCAATAACCCAAGAAGAACAGATCAGTA..

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2393     TGGGAACAGATGAATCCCAGGAGAGCAGCATGACAGATGCGGATGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159203 .AAGTGGGAACAGATGAATCCCAGGAGAGCAGCATGACAGATGCGGATGA

   2600     .    :    .    :    .    :
   2439 CACACAACTTCATGCAGCTGAAAGTGATGAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160670 CACACAACTTCATGCAGCTGAAAGTGATGAATTT

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