Result of FASTA (omim) for pF1KB3283
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3283, 1189 aa
  1>>>pF1KB3283 1189 - 1189 aa - 1189 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9629+/-0.000357; mu= 12.3302+/- 0.022
 mean_var=214.5285+/-44.268, 0's: 0 Z-trim(121.9): 93  B-trim: 671 in 1/52
 Lambda= 0.087565
 statistics sampled from 39025 (39136) to 39025 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.769), E-opt: 0.2 (0.459), width:  16
 Scan time: 17.010

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_005135 (OMIM: 146550,203655,209500,602302) lysi (1189) 8569 1096.2       0
XP_005273626 (OMIM: 146550,203655,209500,602302) P (1190) 8557 1094.7       0
NP_060881 (OMIM: 146550,203655,209500,602302) lysi (1134) 7754 993.2       0
XP_006716430 (OMIM: 146550,203655,209500,602302) P (1135) 7742 991.7       0
XP_016865073 (OMIM: 609373) PREDICTED: lysine-spec (1512)  301 51.8 3.8e-05
XP_005272075 (OMIM: 609373) PREDICTED: lysine-spec (1561)  301 51.9 3.9e-05
XP_011541791 (OMIM: 609373) PREDICTED: lysine-spec (1713)  301 51.9 4.2e-05
XP_011541790 (OMIM: 609373) PREDICTED: lysine-spec (1717)  301 51.9 4.2e-05
NP_057688 (OMIM: 609373) lysine-specific demethyla (1761)  301 51.9 4.2e-05
XP_006712114 (OMIM: 611512) PREDICTED: lysine-spec ( 661)  291 50.2 5.1e-05
XP_016859983 (OMIM: 611512) PREDICTED: lysine-spec (1036)  291 50.4   7e-05
NP_001140160 (OMIM: 611512) lysine-specific demeth (1321)  291 50.5 8.3e-05
NP_060903 (OMIM: 611512) lysine-specific demethyla (1321)  291 50.5 8.3e-05
XP_016859982 (OMIM: 611512) PREDICTED: lysine-spec (1321)  291 50.5 8.3e-05
XP_016871388 (OMIM: 604503) PREDICTED: probable Jm (2252)  246 45.1  0.0062
XP_016871392 (OMIM: 604503) PREDICTED: probable Jm (2252)  246 45.1  0.0062
NP_001305082 (OMIM: 604503) probable JmjC domain-c (2252)  246 45.1  0.0062
XP_016871391 (OMIM: 604503) PREDICTED: probable Jm (2252)  246 45.1  0.0062
XP_016871389 (OMIM: 604503) PREDICTED: probable Jm (2252)  246 45.1  0.0062
XP_016871390 (OMIM: 604503) PREDICTED: probable Jm (2252)  246 45.1  0.0062
XP_011537805 (OMIM: 604503) PREDICTED: probable Jm (2317)  246 45.1  0.0063
NP_001309187 (OMIM: 604503) probable JmjC domain-c (2321)  246 45.1  0.0063
NP_001309183 (OMIM: 604503) probable JmjC domain-c (2321)  246 45.1  0.0063
NP_001269877 (OMIM: 604503) probable JmjC domain-c (2358)  246 45.1  0.0064
XP_016871386 (OMIM: 604503) PREDICTED: probable Jm (2358)  246 45.1  0.0064
XP_016871387 (OMIM: 604503) PREDICTED: probable Jm (2358)  246 45.1  0.0064
NP_001305083 (OMIM: 604503) probable JmjC domain-c (2358)  246 45.1  0.0064
NP_001309181 (OMIM: 604503) probable JmjC domain-c (2502)  246 45.1  0.0067
NP_116165 (OMIM: 604503) probable JmjC domain-cont (2540)  246 45.1  0.0068


>>NP_005135 (OMIM: 146550,203655,209500,602302) lysine-s  (1189 aa)
 initn: 8569 init1: 8569 opt: 8569  Z-score: 5859.6  bits: 1096.2 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 8569; 99.9% identity (99.9% similar) in 1189 aa overlap (1-1189:1-1189)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MESTPSFLKGTPTWEKTAPENGIVRQEPGSPPRDGLHHGPLCLGEPAPFWRGVLSTPDSW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MESTPSFLKGTPTWEKTAPENGIVRQEPGSPPRDGLHHGPLCLGEPAPFWRGVLSTPDSW
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 LPPGFPQGPKDMLPLVEGEGPQNGERKVNWLGSKEGLRWKEAMLTHPLAFCGPACPPRCG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LPPGFPQGPKDMLPLVEGEGPQNGERKVNWLGSKEGLRWKEAMLTHPLAFCGPACPPRCG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 PLMPEHSGGHLKSDPVAFRPWHCPFLLETKILERAPFWVPTCLPPYLVSGLPPEHPCDWP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PLMPEHSGGHLKSDPVAFRPWHCPFLLETKILERAPFWVPTCLPPYLVSGLPPEHPCDWP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 LTPHPWVYSGGQPKVPSAFSLGSKGFYYKDPSIPRLAKEPLAAAEPGLFGLNSGGHLQRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LTPHPWVYSGGQPKVPSAFSLGSKGFYYKDPSIPRLAKEPLAAAEPGLFGLNSGGHLQRA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 GEAERPSLHQRDGEMGAGRQQNPCPLFLGQPDTVPWTSWPACPPGLVHTLGNVWAGPGDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GEAERPSLHQRDGEMGAGRQQNPCPLFLGQPDTVPWTSWPACPPGLVHTLGNVWAGPGDG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 NLGYQLGPPATPRCPSPEPPVTQRGCCSSYPPTKGGDLGPCGKCQEGLEGGASGASEPSE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
NP_005 NLGYQLGPPATPRCPSPEPPVTQRGCCSSYPPTKGGGLGPCGKCQEGLEGGASGASEPSE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 EVNKASGPRACPPSHHTKLKKTWLTRHSEQFECPRGCPEVEERPVARLRALKRAGSPEVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EVNKASGPRACPPSHHTKLKKTWLTRHSEQFECPRGCPEVEERPVARLRALKRAGSPEVQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 GAMGSPAPKRPPDPFPGTAEQGAGGWQEVRDTSIGNKDVDSGQHDEQKGPQDGQASLQDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GAMGSPAPKRPPDPFPGTAEQGAGGWQEVRDTSIGNKDVDSGQHDEQKGPQDGQASLQDP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 GLQDIPCLALPAKLAQCQSCAQAAGEGGGHACHSQQVRRSPLGGELQQEEDTATNSSSEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GLQDIPCLALPAKLAQCQSCAQAAGEGGGHACHSQQVRRSPLGGELQQEEDTATNSSSEE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 GPGSGPDSRLSTGLAKHLLSGLGDRLCRLLRREREALAWAQREGQGPAVTEDSPGIPRCC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GPGSGPDSRLSTGLAKHLLSGLGDRLCRLLRREREALAWAQREGQGPAVTEDSPGIPRCC
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 SRCHHGLFNTHWRCPRCSHRLCVACGRVAGTGRAREKAGFQEQSAEECTQEAGHAACSLM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SRCHHGLFNTHWRCPRCSHRLCVACGRVAGTGRAREKAGFQEQSAEECTQEAGHAACSLM
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 LTQFVSSQALAELSTAMHQVWVKFDIRGHCPCQADARVWAPGDAGQQKESTQKTPPTPQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LTQFVSSQALAELSTAMHQVWVKFDIRGHCPCQADARVWAPGDAGQQKESTQKTPPTPQP
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 SCNGDTHRTKSIKEETPDSAETPAEDRAGRGPLPCPSLCELLASTAVKLCLGHERIHMAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SCNGDTHRTKSIKEETPDSAETPAEDRAGRGPLPCPSLCELLASTAVKLCLGHERIHMAF
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB3 APVTPALPSDDRITNILDSIIAQVVERKIQEKALGPGLRAGPGLRKGLGLPLSPVRPRLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 APVTPALPSDDRITNILDSIIAQVVERKIQEKALGPGLRAGPGLRKGLGLPLSPVRPRLP
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB3 PPGALLWLQEPQPCPRRGFHLFQEHWRQGQPVLVSGIQRTLQGNLWGTEALGALGGQVQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PPGALLWLQEPQPCPRRGFHLFQEHWRQGQPVLVSGIQRTLQGNLWGTEALGALGGQVQA
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB3 LSPLGPPQPSSLGSTTFWEGFSWPELRPKSDEGSVLLLHRALGDEDTSRVENLAASLPLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LSPLGPPQPSSLGSTTFWEGFSWPELRPKSDEGSVLLLHRALGDEDTSRVENLAASLPLP
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB3 EYCALHGKLNLASYLPPGLALRPLEPQLWAAYGVSPHRGHLGTKNLCVEVADLVSILVHA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EYCALHGKLNLASYLPPGLALRPLEPQLWAAYGVSPHRGHLGTKNLCVEVADLVSILVHA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB3 DTPLPAWHRAQKDFLSGLDGEGLWSPGSQVSTVWHVFRAQDAQRIRRFLQMVCPAGAGAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DTPLPAWHRAQKDFLSGLDGEGLWSPGSQVSTVWHVFRAQDAQRIRRFLQMVCPAGAGAL
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB3 EPGAPGSCYLDAGLRRRLREEWGVSCWTLLQAPGEAVLVPAGAPHQVQGLVSTVSVTQHF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EPGAPGSCYLDAGLRRRLREEWGVSCWTLLQAPGEAVLVPAGAPHQVQGLVSTVSVTQHF
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180         
pF1KB3 LSPETSALSAQLCHQGPSLPPDCHLLYAQMDWAVFQAVKVAVGTLQEAK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LSPETSALSAQLCHQGPSLPPDCHLLYAQMDWAVFQAVKVAVGTLQEAK
             1150      1160      1170      1180         

>>XP_005273626 (OMIM: 146550,203655,209500,602302) PREDI  (1190 aa)
 initn: 8555 init1: 4294 opt: 8557  Z-score: 5851.4  bits: 1094.7 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 8557; 99.8% identity (99.8% similar) in 1190 aa overlap (1-1189:1-1190)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MESTPSFLKGTPTWEKTAPENGIVRQEPGSPPRDGLHHGPLCLGEPAPFWRGVLSTPDSW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MESTPSFLKGTPTWEKTAPENGIVRQEPGSPPRDGLHHGPLCLGEPAPFWRGVLSTPDSW
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 LPPGFPQGPKDMLPLVEGEGPQNGERKVNWLGSKEGLRWKEAMLTHPLAFCGPACPPRCG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LPPGFPQGPKDMLPLVEGEGPQNGERKVNWLGSKEGLRWKEAMLTHPLAFCGPACPPRCG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 PLMPEHSGGHLKSDPVAFRPWHCPFLLETKILERAPFWVPTCLPPYLVSGLPPEHPCDWP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PLMPEHSGGHLKSDPVAFRPWHCPFLLETKILERAPFWVPTCLPPYLVSGLPPEHPCDWP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 LTPHPWVYSGGQPKVPSAFSLGSKGFYYKDPSIPRLAKEPLAAAEPGLFGLNSGGHLQRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LTPHPWVYSGGQPKVPSAFSLGSKGFYYKDPSIPRLAKEPLAAAEPGLFGLNSGGHLQRA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 GEAERPSLHQRDGEMGAGRQQNPCPLFLGQPDTVPWTSWPACPPGLVHTLGNVWAGPGDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GEAERPSLHQRDGEMGAGRQQNPCPLFLGQPDTVPWTSWPACPPGLVHTLGNVWAGPGDG
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              310       320       330       340       350       360
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FLSPETSALSAQLCHQGPSLPPDCHLLYAQMDWAVFQAVKVAVGTLQEAK
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>>NP_060881 (OMIM: 146550,203655,209500,602302) lysine-s  (1134 aa)
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Smith-Waterman score: 8049; 95.3% identity (95.3% similar) in 1189 aa overlap (1-1189:1-1134)

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_060 -----------------------------------------------QGLVSTVSVTQHF
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 LSPETSALSAQLCHQGPSLPPDCHLLYAQMDWAVFQAVKVAVGTLQEAK
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>>XP_006716430 (OMIM: 146550,203655,209500,602302) PREDI  (1135 aa)
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           :. : :..  :  .. :  :  . .  :. . :. .. .  :.    : : :.. :
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         .   ::  .  .. ..    :.   ::..   :   . :. ...:      :   .. 
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        .:.   :. :   : ::   .:  : :       :::.. .. .:.:         .: 
XP_016 LLGKSKGKQAPKGRPRTAPLKVG--QSVL------KDVSKVKKLKQSG---------EPF
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pF1KB3 LQDIPCLALPAKLAQCQSC--------AQAAGEGGGHACHSQQVRRSPLG--GELQQEED
       :::  :. .  .: .:. :         .   . .  ::.  . ::  .   : :. :  
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pF1KB3 TATNSSSEEGPGSG-PDSRLSTGL----AKHLLSGLGDRLCRLLRREREALAWAQREGQG
        . ..:. .. .   :.: :. :.    .:..:...::..:.:.  :.::.  ..   : 
XP_016 LSPQQSDPDAMNLWIPSSSLAEGIDLETSKYILANVGDQFCQLVMSEKEAMMMVE-PHQK
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pF1KB3 PAVTEDSPGIPRCCSRCHHGLFNTHWRCPRCSHRLCVACGRVAGTGRAREKAGFQEQSAE
        :  .   :. . :. :.  ::: :: : .:.  .:. : :.    ..: ..  .:.. :
XP_016 VAWKRAVRGVREMCDVCETTLFNIHWVCRKCGFGVCLDCYRLR---KSRPRSETEEMGDE
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pF1KB3 E------CTQEAGHAACSLMLTQFVSSQALAELSTAMHQVWVKFDIRGHCPC--QADARV
       :      :..  .:   .:: ::.. . :: ...  .: .  :. :...:::  . .  :
XP_016 EVFSWLKCAKGQSHEPENLMPTQIIPGTALYNIGDMVHAARGKWGIKANCPCISRQNKSV
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pF1KB3 WAPG-------------DAGQQKESTQKTPPTPQPSCNGDT-HRTKS----IKEETP---
         :.             .:.. .:.: .    : :  . .  :  :.    :. : :   
XP_016 LRPAVTNGMSQLPSINPSASSGNETTFSGGGGPAPVTTPEPDHVPKADSTDIRSEEPLKT
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pF1KB3 DSA--ETPAEDRAGRGPLPC---PS-----LCELLASTA---------VKLCLGHERIHM
       ::.  .. .: .: : : :    ::     : .: .. :         ..  :..:  : 
XP_016 DSSASNSNSELKAIRPPCPDTAPPSSALHWLADLATQKAKEETKEAGSLRSVLNKES-HS
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pF1KB3 AF-----------APVTPAL----------------------------------PSDDRI
        :           .:.:: :                                  : :  :
XP_016 PFGLDSFNSTAKVSPLTPKLFNSLLLGPTASNNKTEGSSLRDLLHSGPGKLPQTPLDTGI
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       . . :.        : :: :..:.   . ....:.: :.:::::::::... :...::  
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       ::..  .: : :. ..  .    :..    ::.::     : .:..:. ..:.       
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       . . :   .: :.:  .::::::    :.::::: ::  . .:: : :... ::: .. .
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         ..:: :: ..:.: :...:..  :.    . ... :. .: :.           :  .
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       ::.    .::.. :.::..::..:. :    .    :   :    : :::  ::.:: ::
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       .::. :...:  :.::..::::::::..: : ..:.. :.:::      .: ..   :  
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           :    :.   ...::: :::::.         
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           :. : :..  :  .. :  :  . .  :. . :. .. .  :.    : : :.. :
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pF1KB3 AMGSPAPKRPPDPFPGTAEQGAGGWQEVRDTSIGNKDVDSGQHDEQKGPQDGQASLQDPG
        .:.   :. :   : ::   .:  : :       :::.. .. .:.:         .: 
XP_005 LLGKSKGKQAPKGRPRTAPLKVG--QSVL------KDVSKVKKLKQSG---------EPF
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pF1KB3 LQDIPCLALPAKLAQCQSC--------AQAAGEGGGHACHSQQVRRSPLG--GELQQEED
       :::  :. .  .: .:. :         .   . .  ::.  . ::  .   : :. :  
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pF1KB3 TATNSSSEEGPGSG-PDSRLSTGL----AKHLLSGLGDRLCRLLRREREALAWAQREGQG
        . ..:. .. .   :.: :. :.    .:..:...::..:.:.  :.::.  ..   : 
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pF1KB3 PAVTEDSPGIPRCCSRCHHGLFNTHWRCPRCSHRLCVACGRVAGTGRAREKAGFQEQSAE
        :  .   :. . :. :.  ::: :: : .:.  .:. : :.    ..: ..  .:.. :
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pF1KB3 E------CTQEAGHAACSLMLTQFVSSQALAELSTAMHQVWVKFDIRGHCPC--QADARV
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         :.             .:.. .:.: .    : :  . .  :  :.    :. : :   
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       ::.  .. .: .: : : :    ::     : .: .. :         ..  :..:  : 
XP_005 DSSASNSNSELKAIRPPCPDTAPPSSALHWLADLATQKAKEETKEAGSLRSVLNKES-HS
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        :           .:.:: :                                  : :  :
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pF1KB3 T-------------------NILDSIIAQVVERKIQEKAL--GPGLRAGPGLRKGLGLPL
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pF1KB3 SPVRPRLPPP----GALLWLQEPQPCPRRGFHLFQEHWRQGQPVLVSGIQRTLQGNLWGT
       . . :.        : :: :..:.   . ....:.: :.:::::::::... :...::  
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pF1KB3 EALGA-LGGQ-VQALSPLGPPQPSSLGSTTFWEGFSWPELRPKSDEGSVLLLH-------
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XP_005 EAFSQEFGDQDVDLVNCRNCAIISDVKVRDFWDGFEIICKRLRSEDGQPMVLKLKDWPPG
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pF1KB3 RALGDEDTSRVENLAASLPLPEYCALHGKLNLASYLPPGLALRP-LEPQLWAAYG-VSPH
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pF1KB3 RGHLGTKNLCVEVADLVSILVHADTPLPAWHRAQKDFLSGLD-GE-----------GLWS
         ..:: :: ..:.: :...:..  :.    . ... :. .: :.           :  .
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pF1KB3 PGSQVSTVWHVFRAQDAQRIRRFLQMVCPAGAGALEPGA-P---GSCYLDAGLRRRLREE
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pF1KB3 WGVSCWTLLQAPGEAVLVPAGAPHQVQGLVSTVSVTQHFLSPETSALSAQLCHQGPSLPP
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XP_005 YGVQGWAIVQFLGDAVFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFRLTQEFRHLSN
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pF1KB3 D--CHLLYAQMDWAVFQAVKVAVGTLQEAK      
           :    :.   ...::: :::::.         
XP_005 THTNHEDKLQVKNIIYHAVKDAVGTLKAHESKLARS
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pF1KB3 WHCPFLLETKILERAPFWVPTCLPPYLVSGLPPEH-PCDWPLTPHPWVYSGGQPKVPSAF
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pF1KB3 SLGSKGFYYKDPSIPRLA-KEPLAAAEPGLFGLNSGGHLQRAGEAER---PSLHQRDGEM
        :    .  ..:: : ::  : .  .  . :. ...:  . :  .     ::  .  .  
XP_011 FLQPPKLSREEPSNPFLAFVEKVEHSPFSSFASQASGSSSSATTVTSKVAPSWPESHSSA
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        ..   .  :::.   ..     :  ..  .  :.:  ..::  ..   ..:   .  :.
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           :. : :..  :  .. :  :  . .  :. . :. .. .  :.    : : :.. :
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         .   ::  .  .. ..    :.   ::..   :   . :. ...:      :   .. 
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        .:.   :. :   : ::   .:  : :       :::.. .. .:.:         .: 
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       :::  :. .  .: .:. :         .   . .  ::.  . ::  .   : :. :  
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        . ..:. .. .   :.: :. :.    .:..:...::..:.:.  :.::.  ..   : 
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       :      :..  .:   .:: ::.. . :: ...  .: .  :. :...:::  . .  :
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         ..:: :: ..:.: :...:..  :.    . ... :. .: :.           :  .
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       ::.    .::.. :.::..::..:. :    .    :   :    : :::  ::.:: ::
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       .::. :...:  :.::..::::::::..: : ..:.. :.:::      .: ..   :  
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       ::.  .. .: .: : : :    ::     : .: .. :         ..  :..:  : 
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pF1KB3 AF-----------APVTPAL----------------------------------PSDDRI
        :           .:.:: :                                  : :  :
XP_011 PFGLDSFNSTAKVSPLTPKLFNSLLLGPTASNNKTEGSSLRDLLHSGPGKLPQTPLDTGI
    1210      1220      1230      1240      1250      1260         

                              800       810         820       830  
pF1KB3 T-------------------NILDSIIAQVVERKIQEKAL--GPGLRAGPGLRKGLGLPL
                           :.:: :::.::: :    :   . .:       : . . :
XP_011 PFPPVFSTSSAGVKSKASLPNFLDHIIASVVENKKTSDASKRACNLTDTQKEVKEMVMGL
    1270      1280      1290      1300      1310      1320         

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pF1KB3 SPVRPRLPPP----GALLWLQEPQPCPRRGFHLFQEHWRQGQPVLVSGIQRTLQGNLWGT
       . . :.        : :: :..:.   . ....:.: :.:::::::::... :...::  
XP_011 NVLDPHTSHSWLCDGRLLCLHDPS--NKNNWKIFRECWKQGQPVLVSGVHKKLKSELWKP
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pF1KB3 EALGA-LGGQ-VQALSPLGPPQPSSLGSTTFWEGFSWPELRPKSDEGSVLLLH-------
       ::..  .: : :. ..  .    :..    ::.::     : .:..:. ..:.       
XP_011 EAFSQEFGDQDVDLVNCRNCAIISDVKVRDFWDGFEIICKRLRSEDGQPMVLKLKDWPPG
      1390      1400      1410      1420      1430      1440       

     940       950       960       970       980        990        
pF1KB3 RALGDEDTSRVENLAASLPLPEYCALHGKLNLASYLPPGLALRP-LEPQLWAAYG-VSPH
       . . :   .: :.:  .::::::    :.::::: ::  . .:: : :... ::: .. .
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pF1KB3 RGHLGTKNLCVEVADLVSILVHADTPLPAWHRAQKDFLSGLD-GE-----------GLWS
         ..:: :: ..:.: :...:..  :.    . ... :. .: :.           :  .
XP_011 DRRVGTTNLHLDVSDAVNVMVYVGIPIGEGAH-DEEVLKTIDEGDADEVTKQRIHDGKEK
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pF1KB3 PGSQVSTVWHVFRAQDAQRIRRFLQMVCPAGAGALEPGA-P---GSCYLDAGLRRRLREE
       ::.    .::.. :.::..::..:. :    .    :   :    : :::  ::.:: ::
XP_011 PGA----LWHIYAAKDAEKIRELLRKVGEEQGQENPPDHDPIHDQSWYLDQTLRKRLYEE
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pF1KB3 WGVSCWTLLQAPGEAVLVPAGAPHQVQGLVSTVSVTQHFLSPETSALSAQLCHQGPSLPP
       .::. :...:  :.::..::::::::..: : ..:.. :.:::      .: ..   :  
XP_011 YGVQGWAIVQFLGDAVFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFRLTQEFRHLSN
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pF1KB3 D--CHLLYAQMDWAVFQAVKVAVGTLQEAK      
           :    :.   ...::: :::::.         
XP_011 THTNHEDKLQVKNIIYHAVKDAVGTLKAHESKLARS
            1690      1700      1710       

>>NP_057688 (OMIM: 609373) lysine-specific demethylase 3  (1761 aa)
 initn: 519 init1: 220 opt: 301  Z-score: 212.5  bits: 51.9 E(85289): 4.2e-05
Smith-Waterman score: 825; 25.5% identity (49.5% similar) in 1197 aa overlap (171-1186:593-1752)

              150       160       170        180       190         
pF1KB3 WHCPFLLETKILERAPFWVPTCLPPYLVSGLPPEH-PCDWPLTPHPWVYSGGQPKVPSAF
                                     .: :  :   :  :.  . ..  :.    .
NP_057 SLSSGLCKGRSVLGTDTKPGSKAGSSVDRKVPAESMPTLTPAFPRS-LLNARTPENHENL
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pF1KB3 SLGSKGFYYKDPSIPRLA-KEPLAAAEPGLFGLNSGGHLQRAGEAER---PSLHQRDGEM
        :    .  ..:: : ::  : .  .  . :. ...:  . :  .     ::  .  .  
NP_057 FLQPPKLSREEPSNPFLAFVEKVEHSPFSSFASQASGSSSSATTVTSKVAPSWPESHSSA
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pF1KB3 GAGRQQNPCPLFLGQPDT-----VPWTSWPACPPGLVHTLGNVWAGPGDGNLGYQLGPPA
        ..   .  :::.   ..     :  ..  .  :.:  ..::  ..   ..:   .  :.
NP_057 DSASLAKKKPLFITTDSSKLVSGVLGSALTSGGPSL-SAMGNGRSSSPTSSLTQPIEMPT
             690       700       710        720       730       740

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pF1KB3 TPRCPSPEPPVTQRGCCSSYPPTKGGDLGPCGKCQEGLEGGASGASE----PSEEVNKAS
           :. : :..  :  .. :  :  . .  :. . :. .. .  :.    : : :.. :
NP_057 LSSSPTEERPTVGPGQ-QDNPLLKTFS-NVFGRHSGGFLSSPADFSQENKAPFEAVKRFS
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           370       380         390       400       410       420 
pF1KB3 GPR---ACPPSHHTKLKKTW--LTRHSEQFECPRGCPEVEERPVARLRALKRAGSPEVQG
         .   ::  .  .. ..    :.   ::..   :   . :. ...:      :   .. 
NP_057 LDERSLACRQDSDSSTNSDLSDLSDSEEQLQAKTGLKGIPEHLMGKLGP---NGERSAEL
      800       810       820       830       840          850     

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pF1KB3 AMGSPAPKRPPDPFPGTAEQGAGGWQEVRDTSIGNKDVDSGQHDEQKGPQDGQASLQDPG
        .:.   :. :   : ::   .:  : :       :::.. .. .:.:         .: 
NP_057 LLGKSKGKQAPKGRPRTAPLKVG--QSVL------KDVSKVKKLKQSG---------EPF
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pF1KB3 LQDIPCLALPAKLAQCQSC--------AQAAGEGGGHACHSQQVRRSPLG--GELQQEED
       :::  :. .  .: .:. :         .   . .  ::.  . ::  .   : :. :  
NP_057 LQDGSCINVAPHLHKCRECRLERYRKFKEQEQDDSTVACRFFHFRRLIFTRKGVLRVEGF
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pF1KB3 TATNSSSEEGPGSG-PDSRLSTGL----AKHLLSGLGDRLCRLLRREREALAWAQREGQG
        . ..:. .. .   :.: :. :.    .:..:...::..:.:.  :.::.  ..   : 
NP_057 LSPQQSDPDAMNLWIPSSSLAEGIDLETSKYILANVGDQFCQLVMSEKEAMMMVE-PHQK
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pF1KB3 PAVTEDSPGIPRCCSRCHHGLFNTHWRCPRCSHRLCVACGRVAGTGRAREKAGFQEQSAE
        :  .   :. . :. :.  ::: :: : .:.  .:. : :.    ..: ..  .:.. :
NP_057 VAWKRAVRGVREMCDVCETTLFNIHWVCRKCGFGVCLDCYRLR---KSRPRSETEEMGDE
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pF1KB3 E------CTQEAGHAACSLMLTQFVSSQALAELSTAMHQVWVKFDIRGHCPC--QADARV
       :      :..  .:   .:: ::.. . :: ...  .: .  :. :...:::  . .  :
NP_057 EVFSWLKCAKGQSHEPENLMPTQIIPGTALYNIGDMVHAARGKWGIKANCPCISRQNKSV
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      700                    710       720        730              
pF1KB3 WAPG-------------DAGQQKESTQKTPPTPQPSCNGDT-HRTKS----IKEETP---
         :.             .:.. .:.: .    : :  . .  :  :.    :. : :   
NP_057 LRPAVTNGMSQLPSINPSASSGNETTFSGGGGPAPVTTPEPDHVPKADSTDIRSEEPLKT
         1140      1150      1160      1170      1180      1190    

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pF1KB3 DSA--ETPAEDRAGRGPLPC---PS-----LCELLASTA---------VKLCLGHERIHM
       ::.  .. .: .: : : :    ::     : .: .. :         ..  :..:  : 
NP_057 DSSASNSNSELKAIRPPCPDTAPPSSALHWLADLATQKAKEETKEAGSLRSVLNKES-HS
         1200      1210      1220      1230      1240      1250    

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pF1KB3 AF-----------APVTPAL----------------------------------PSDDRI
        :           .:.:: :                                  : :  :
NP_057 PFGLDSFNSTAKVSPLTPKLFNSLLLGPTASNNKTEGSSLRDLLHSGPGKLPQTPLDTGI
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                              800       810         820       830  
pF1KB3 T-------------------NILDSIIAQVVERKIQEKAL--GPGLRAGPGLRKGLGLPL
                           :.:: :::.::: :    :   . .:       : . . :
NP_057 PFPPVFSTSSAGVKSKASLPNFLDHIIASVVENKKTSDASKRACNLTDTQKEVKEMVMGL
          1320      1330      1340      1350      1360      1370   

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pF1KB3 SPVRPRLPPP----GALLWLQEPQPCPRRGFHLFQEHWRQGQPVLVSGIQRTLQGNLWGT
       . . :.        : :: :..:.   . ....:.: :.:::::::::... :...::  
NP_057 NVLDPHTSHSWLCDGRLLCLHDPS--NKNNWKIFRECWKQGQPVLVSGVHKKLKSELWKP
          1380      1390        1400      1410      1420      1430 

      890         900       910       920       930                
pF1KB3 EALGA-LGGQ-VQALSPLGPPQPSSLGSTTFWEGFSWPELRPKSDEGSVLLLH-------
       ::..  .: : :. ..  .    :..    ::.::     : .:..:. ..:.       
NP_057 EAFSQEFGDQDVDLVNCRNCAIISDVKVRDFWDGFEIICKRLRSEDGQPMVLKLKDWPPG
            1440      1450      1460      1470      1480      1490 

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pF1KB3 RALGDEDTSRVENLAASLPLPEYCALHGKLNLASYLPPGLALRP-LEPQLWAAYG-VSPH
       . . :   .: :.:  .::::::    :.::::: ::  . .:: : :... ::: .. .
NP_057 EDFRDMMPTRFEDLMENLPLPEYTKRDGRLNLASRLPSYF-VRPDLGPKMYNAYGLITAE
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pF1KB3 RGHLGTKNLCVEVADLVSILVHADTPLPAWHRAQKDFLSGLD-GE-----------GLWS
         ..:: :: ..:.: :...:..  :.    . ... :. .: :.           :  .
NP_057 DRRVGTTNLHLDVSDAVNVMVYVGIPIGEGAH-DEEVLKTIDEGDADEVTKQRIHDGKEK
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        1050      1060      1070      1080          1090      1100 
pF1KB3 PGSQVSTVWHVFRAQDAQRIRRFLQMVCPAGAGALEPGA-P---GSCYLDAGLRRRLREE
       ::.    .::.. :.::..::..:. :    .    :   :    : :::  ::.:: ::
NP_057 PGA----LWHIYAAKDAEKIRELLRKVGEEQGQENPPDHDPIHDQSWYLDQTLRKRLYEE
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pF1KB3 WGVSCWTLLQAPGEAVLVPAGAPHQVQGLVSTVSVTQHFLSPETSALSAQLCHQGPSLPP
       .::. :...:  :.::..::::::::..: : ..:.. :.:::      .: ..   :  
NP_057 YGVQGWAIVQFLGDAVFIPAGAPHQVHNLYSCIKVAEDFVSPEHVKHCFRLTQEFRHLSN
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              1170      1180               
pF1KB3 D--CHLLYAQMDWAVFQAVKVAVGTLQEAK      
           :    :.   ...::: :::::.         
NP_057 THTNHEDKLQVKNIIYHAVKDAVGTLKAHESKLARS
        1730      1740      1750      1760 

>>XP_006712114 (OMIM: 611512) PREDICTED: lysine-specific  (661 aa)
 initn: 674 init1: 216 opt: 291  Z-score: 211.0  bits: 50.2 E(85289): 5.1e-05
Smith-Waterman score: 771; 28.0% identity (55.2% similar) in 665 aa overlap (600-1189:2-655)

     570       580       590       600       610       620         
pF1KB3 LRREREALAWAQREGQGPAVTEDSPGIPRCCSRCHHGLFNTHWRCPRCSHRLCVACGRVA
                                     :. :   .:: :: ::::.  .:: : :. 
XP_006                              MCDVCDTTIFNLHWVCPRCGFGVCVDCYRMK
                                            10        20        30 

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