Result of FASTA (ccds) for pF1KB3279
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3279, 950 aa
  1>>>pF1KB3279 950 - 950 aa - 950 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5785+/-0.00102; mu= 11.1216+/- 0.061
 mean_var=131.2900+/-25.691, 0's: 0 Z-trim(108.0): 194  B-trim: 90 in 1/50
 Lambda= 0.111933
 statistics sampled from 9717 (9914) to 9717 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.654), E-opt: 0.2 (0.305), width:  16
 Scan time:  4.210

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS54920.1 PCDHA9 gene_id:9752|Hs108|chr5         ( 950) 6201 1013.5       0
CCDS54916.1 PCDHA4 gene_id:56144|Hs108|chr5        ( 947) 5205 852.7       0
CCDS54915.1 PCDHA3 gene_id:56145|Hs108|chr5        ( 950) 5120 838.9       0
CCDS4240.1 PCDHA13 gene_id:56136|Hs108|chr5        ( 950) 5011 821.3       0
CCDS54913.1 PCDHA1 gene_id:56147|Hs108|chr5        ( 950) 5006 820.5       0
CCDS47281.1 PCDHA6 gene_id:56142|Hs108|chr5        ( 950) 4986 817.3       0
CCDS54919.1 PCDHA8 gene_id:56140|Hs108|chr5        ( 950) 4959 813.0       0
CCDS54921.1 PCDHA10 gene_id:56139|Hs108|chr5       ( 948) 4952 811.8       0
CCDS54914.1 PCDHA2 gene_id:56146|Hs108|chr5        ( 948) 4910 805.0       0
CCDS47284.1 PCDHA11 gene_id:56138|Hs108|chr5       ( 949) 4876 799.5       0
CCDS54918.1 PCDHA7 gene_id:56141|Hs108|chr5        ( 937) 4505 739.6 6.5e-213
CCDS54917.1 PCDHA5 gene_id:56143|Hs108|chr5        ( 936) 3916 644.5 2.8e-184
CCDS75325.1 PCDHA10 gene_id:56139|Hs108|chr5       ( 844) 3907 643.0 6.9e-184
CCDS64269.1 PCDHA2 gene_id:56146|Hs108|chr5        ( 808) 3865 636.2 7.4e-182
CCDS75326.1 PCDHA11 gene_id:56138|Hs108|chr5       ( 810) 3831 630.8 3.3e-180
CCDS47285.1 PCDHA12 gene_id:56137|Hs108|chr5       ( 941) 3823 629.5 9.2e-180
CCDS75327.1 PCDHA12 gene_id:56137|Hs108|chr5       ( 792) 3803 626.2 7.5e-179
CCDS34255.1 PCDHA10 gene_id:56139|Hs108|chr5       ( 685) 2614 434.2 4.2e-121
CCDS54912.1 PCDHA1 gene_id:56147|Hs108|chr5        ( 686) 2605 432.7 1.1e-120
CCDS47282.1 PCDHA6 gene_id:56142|Hs108|chr5        ( 686) 2575 427.9 3.3e-119
CCDS4261.1 PCDHGC3 gene_id:5098|Hs108|chr5         ( 934) 2031 340.1 1.2e-92
CCDS75348.1 PCDHGC3 gene_id:5098|Hs108|chr5        ( 863) 1993 334.0 7.8e-91
CCDS75350.1 PCDHGC5 gene_id:56097|Hs108|chr5       ( 878) 1953 327.5   7e-89
CCDS54928.1 PCDHGB4 gene_id:8641|Hs108|chr5        ( 923) 1947 326.6 1.4e-88
CCDS4263.1 PCDHGC5 gene_id:56097|Hs108|chr5        ( 944) 1947 326.6 1.5e-88
CCDS47292.1 PCDHGA10 gene_id:56106|Hs108|chr5      ( 936) 1938 325.1   4e-88
CCDS75343.1 PCDHGA10 gene_id:56106|Hs108|chr5      ( 850) 1937 324.9 4.1e-88
CCDS75336.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5       ( 817) 1925 323.0 1.5e-87
CCDS54927.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5       ( 932) 1925 323.0 1.7e-87
CCDS75346.1 PCDHGA12 gene_id:26025|Hs108|chr5      ( 820) 1912 320.9 6.5e-87
CCDS75331.1 PCDHGA4 gene_id:56111|Hs108|chr5       ( 851) 1912 320.9 6.7e-87
CCDS4260.1 PCDHGA12 gene_id:26025|Hs108|chr5       ( 932) 1912 320.9 7.2e-87
CCDS58980.1 PCDHGB3 gene_id:56102|Hs108|chr5       ( 929) 1907 320.1 1.3e-86
CCDS58979.2 PCDHGA4 gene_id:56111|Hs108|chr5       ( 962) 1904 319.6 1.8e-86
CCDS54923.1 PCDHGB1 gene_id:56104|Hs108|chr5       ( 927) 1896 318.3 4.3e-86
CCDS75330.1 PCDHGB1 gene_id:56104|Hs108|chr5       ( 810) 1892 317.6   6e-86
CCDS47289.1 PCDHGA2 gene_id:56113|Hs108|chr5       ( 932) 1889 317.2 9.5e-86
CCDS47294.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5      ( 935) 1888 317.0 1.1e-85
CCDS75345.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5      ( 837) 1881 315.9 2.1e-85
CCDS75338.1 PCDHGA8 gene_id:9708|Hs108|chr5        ( 820) 1862 312.8 1.7e-84
CCDS47291.1 PCDHGA8 gene_id:9708|Hs108|chr5        ( 932) 1862 312.8 1.9e-84
CCDS75333.1 PCDHGA5 gene_id:56110|Hs108|chr5       ( 813) 1858 312.2 2.7e-84
CCDS54925.1 PCDHGA5 gene_id:56110|Hs108|chr5       ( 931) 1858 312.2   3e-84
CCDS75334.1 PCDHGB3 gene_id:56102|Hs108|chr5       ( 814) 1856 311.8 3.4e-84
CCDS47293.1 PCDHGB7 gene_id:56099|Hs108|chr5       ( 929) 1857 312.0 3.4e-84
CCDS58981.1 PCDHGA9 gene_id:56107|Hs108|chr5       ( 932) 1837 308.8 3.2e-83
CCDS75335.1 PCDHGA6 gene_id:56109|Hs108|chr5       ( 818) 1836 308.6 3.2e-83
CCDS75341.1 PCDHGA9 gene_id:56107|Hs108|chr5       ( 828) 1836 308.6 3.2e-83
CCDS54926.1 PCDHGA6 gene_id:56109|Hs108|chr5       ( 932) 1836 308.6 3.6e-83
CCDS4257.1 PCDHB15 gene_id:56121|Hs108|chr5        ( 787) 1833 308.1 4.3e-83


>>CCDS54920.1 PCDHA9 gene_id:9752|Hs108|chr5              (950 aa)
 initn: 6201 init1: 6201 opt: 6201  Z-score: 5416.1  bits: 1013.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6201; 100.0% identity (100.0% similar) in 950 aa overlap (1-950:1-950)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MLYSSRGDPEGQPLLLSLLILAMWVVGSGQLHYSVPEEAEHGTFVGRIAQDLGLELAELV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MLYSSRGDPEGQPLLLSLLILAMWVVGSGQLHYSVPEEAEHGTFVGRIAQDLGLELAELV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 PRLFQLDSKGRGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREELCGRSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PRLFQLDSKGRGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREELCGRSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 VEVKDINDNPPVFPATQKNLFIAESRPLDSRFPLEGASDADIGENALLTYRLSPNEYFFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VEVKDINDNPPVFPATQKNLFIAESRPLDSRFPLEGASDADIGENALLTYRLSPNEYFFL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 DVPTSNQQVKPLGLVLRKLLDREETPELHLLLTATDGGKPELTGTVQLLITVLDNNDNAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DVPTSNQQVKPLGLVLRKLLDREETPELHLLLTATDGGKPELTGTVQLLITVLDNNDNAP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 VFDRTLYTVKLPENVSIGTLVIHPNASDLDEGLNGDIIYSFSSDVSPDIKSKFHMDPLSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VFDRTLYTVKLPENVSIGTLVIHPNASDLDEGLNGDIIYSFSSDVSPDIKSKFHMDPLSG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 AITVIGHMDFEESRAHKIPVEAVDKGFPPLAGHCTLLVEVVDVNDNAPQLTIKTLSVPVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AITVIGHMDFEESRAHKIPVEAVDKGFPPLAGHCTLLVEVVDVNDNAPQLTIKTLSVPVK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 EDAQLGTVIALISVIDLDADANGQVTCSLTPHVPFKLVSTYKNYYSLVLDRALDRESVSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EDAQLGTVIALISVIDLDADANGQVTCSLTPHVPFKLVSTYKNYYSLVLDRALDRESVSA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 YELVVTARDGGSPSLWATARVSVEVADVNDNAPAFAQSEYTVFVKENNPPGCHIFTVSAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YELVVTARDGGSPSLWATARVSVEVADVNDNAPAFAQSEYTVFVKENNPPGCHIFTVSAR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 DADAQENALVSYSLVERRLGERSLSSYVSVHAESGKVYALQPLDHEELELLQFQVSARDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DADAQENALVSYSLVERRLGERSLSSYVSVHAESGKVYALQPLDHEELELLQFQVSARDA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 GVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLTPRMRGTDGAVSEMVLRSVGAGVVVGKVRAVDAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLTPRMRGTDGAVSEMVLRSVGAGVVVGKVRAVDAD
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 SGYNAWLSYELQPETASASIPFRVGLYTGEISTTRALDETDAPRQRLLVLVKDHGEPALT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SGYNAWLSYELQPETASASIPFRVGLYTGEISTTRALDETDAPRQRLLVLVKDHGEPALT
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 ATATVLVSLVESGQAPKSSSRASVGATGPEVTLVDVNVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ATATVLVSLVESGQAPKSSSRASVGATGPEVTLVDVNVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYTV
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 LRCSAMPTEGECAPGKPTLVCSSAVGSWSYSQQRRQRVCSGEGKQKTDLMAFSPGLSPCA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LRCSAMPTEGECAPGKPTLVCSSAVGSWSYSQQRRQRVCSGEGKQKTDLMAFSPGLSPCA
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB3 GSTERTGEPSASSDSTGKPRQPNPDWRYSASLRAGMHSSVHLEEAGILRAGPGGPDQQWP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GSTERTGEPSASSDSTGKPRQPNPDWRYSASLRAGMHSSVHLEEAGILRAGPGGPDQQWP
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB3 TVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQSGPGELPDKFIIPGSPAIISIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQSGPGELPDKFIIPGSPAIISIR
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950
pF1KB3 QEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKEKGNSTTDNSDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKEKGNSTTDNSDQ
              910       920       930       940       950

>>CCDS54916.1 PCDHA4 gene_id:56144|Hs108|chr5             (947 aa)
 initn: 5204 init1: 4152 opt: 5205  Z-score: 4546.8  bits: 852.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5205; 84.5% identity (92.5% similar) in 950 aa overlap (1-950:1-947)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MLYSSRGDPEGQPLLLSLLILAMWVVGSGQLHYSVPEEAEHGTFVGRIAQDLGLELAELV
       : .:  .  :.. ::: ::.:: : .:.::::::: :::.::::::::::::::::::::
CCDS54 MEFSWGSGQESRRLLLLLLLLAAWEAGNGQLHYSVSEEAKHGTFVGRIAQDLGLELAELV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 PRLFQLDSKGRGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREELCGRSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVD
       ::::.. ::::: ::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS54 PRLFRVASKGRGGLLEVNLQNGILFVNSRIDREELCRRSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 VEVKDINDNPPVFPATQKNLFIAESRPLDSRFPLEGASDADIGENALLTYRLSPNEYFFL
       :::.:::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS54 VEVRDINDNPPVFPATQKNLSIAESRPLDSRFPLEGASDADIGENALLTYRLSPNEYFSL
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pF1KB3 DVPTSNQQVKPLGLVLRKLLDREETPELHLLLTATDGGKPELTGTVQLLITVLDNNDNAP
       . : ... :: :::.::: :::::.::. :.::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS54 EKPPDDELVKGLGLILRKSLDREEAPEIFLVLTATDGGKPELTGTVQLLITVLDANDNAP
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pF1KB3 VFDRTLYTVKLPENVSIGTLVIHPNASDLDEGLNGDIIYSFSSDVSPDIKSKFHMDPLSG
       .::::.: :.: :::  :::::. :::::::::::::.::::.:.::..:::::.::..:
CCDS54 AFDRTIYKVRLLENVPNGTLVIKLNASDLDEGLNGDIVYSFSNDISPNVKSKFHIDPITG
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pF1KB3 AITVIGHMDFEESRAHKIPVEAVDKGFPPLAGHCTLLVEVVDVNDNAPQLTIKTLSVPVK
        : : :..:::::....: ::..:::  ::.::: ..::: : :::.:.: .:.::.:..
CCDS54 QIIVKGYIDFEESKSYEIIVEGIDKGQLPLSGHCRVIVEVEDNNDNVPDLEFKSLSLPIR
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pF1KB3 EDAQLGTVIALISVIDLDADANGQVTCSLTPHVPFKLVSTYKNYYSLVLDRALDRESVSA
       ::: :::::::::: : :  .:: :::::: :::::::::.::::::::: :::::::::
CCDS54 EDAPLGTVIALISVSDKDMGVNGLVTCSLTSHVPFKLVSTFKNYYSLVLDSALDRESVSA
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       ::::::::::::::::::: ::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::: 
CCDS54 YELVVTARDGGSPSLWATASVSVEVADVNDNAPAFAQPEYTVFVKENNPPGCHIFTVSAW
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pF1KB3 DADAQENALVSYSLVERRLGERSLSSYVSVHAESGKVYALQPLDHEELELLQFQVSARDA
       ::::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS54 DADAQENALVSYSLVERRVGERALSSYVSVHAESGKVYALQPLDHEELELLQFQVTARDA
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       ::::::::::::::::::::::::::.::  :: :::::.:  :::.: ::.::::::::
CCDS54 GVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLAPRAGGTGGAVSELVPWSVGVGHVVAKVRAVDAD
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       ::::::::::::: :..: :::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS54 SGYNAWLSYELQPGTGGARIPFRVGLYTGEISTTRALDETDAPRHRLLVLVKDHGEPALT
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       :::::::::::::::::.:::: :::.::...:::::::::::::::::::::::::::.
CCDS54 ATATVLVSLVESGQAPKASSRALVGAVGPDAALVDVNVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYTA
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pF1KB3 LRCSAMPTEGECAPGKPTLVCSSAVGSWSYSQQRRQRVCSGEGKQKTDLMAFSPGLSPCA
       :::::.:::: :::::::::::::::::::::::: :::::::  :::::::::.: :  
CCDS54 LRCSALPTEGACAPGKPTLVCSSAVGSWSYSQQRRPRVCSGEGPPKTDLMAFSPSL-P--
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pF1KB3 GSTERTGEPSASSDSTGKPRQPNPDWRYSASLRAGMHSSVHLEEAGILRAGPGGPDQQWP
        : .:  . ... .: .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DSRDREDQLQTTEESFAKPRQPNPDWRYSASLRAGMHSSVHLEEAGILRAGPGGPDQQWP
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pF1KB3 TVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQSGPGELPDKFIIPGSPAIISIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQSGPGELPDKFIIPGSPAIISIR
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pF1KB3 QEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKEKGNSTTDNSDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKEKGNSTTDNSDQ
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>>CCDS54915.1 PCDHA3 gene_id:56145|Hs108|chr5             (950 aa)
 initn: 5120 init1: 5120 opt: 5120  Z-score: 4472.6  bits: 838.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5120; 82.6% identity (92.4% similar) in 950 aa overlap (1-950:1-950)

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pF1KB3 MLYSSRGDPEGQPLLLSLLILAMWVVGSGQLHYSVPEEAEHGTFVGRIAQDLGLELAELV
       ::.: : :: .: ::::::.::   :::::::::: :::.::::::::::::::::::::
CCDS54 MLFSWREDPGAQCLLLSLLLLAASEVGSGQLHYSVSEEAKHGTFVGRIAQDLGLELAELV
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pF1KB3 PRLFQLDSKGRGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREELCGRSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVD
       ::::.. :: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
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pF1KB3 VEVKDINDNPPVFPATQKNLFIAESRPLDSRFPLEGASDADIGENALLTYRLSPNEYFFL
       ::::::::: :::: . :::::.:::   ::: :::::::::: :.:::: :. .::: :
CCDS54 VEVKDINDNAPVFPMAVKNLFISESRQPGSRFSLEGASDADIGTNSLLTYSLDSTEYFTL
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pF1KB3 DVPTSNQQVKPLGLVLRKLLDREETPELHLLLTATDGGKPELTGTVQLLITVLDNNDNAP
       ::  .....: :::::.: :.::.::. .::.:: ::::::::::.:: ::::: :::::
CCDS54 DVKRNDEEIKSLGLVLKKNLNREDTPKHYLLITAIDGGKPELTGTTQLKITVLDVNDNAP
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pF1KB3 VFDRTLYTVKLPENVSIGTLVIHPNASDLDEGLNGDIIYSFSSDVSPDIKSKFHMDPLSG
       .:.::.: :.: ::.  ::::.  ::.:::::.: :: :::..:.: :: ::::.::..:
CCDS54 AFERTIYKVRLLENAPNGTLVVTVNATDLDEGVNKDIAYSFNTDMSADILSKFHLDPVNG
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pF1KB3 AITVIGHMDFEESRAHKIPVEAVDKGFPPLAGHCTLLVEVVDVNDNAPQLTIKTLSVPVK
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CCDS54 QISVKGNIDFEESKSYEIQVEATDKGNPPMSDHCTVLLEIVDINDNVPELVIQSLSLPVL
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       ::. :.:::::::: : :. .:::::::::::::::::::.:::::::::  ::::::::
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       ::::::::::::::::::: :::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YELVVTARDGGSPSLWATASVSVEVADVNDNAPAFSQSEYTVFVKENNPPGCHIFTVSAR
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       ::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DADAQENALVSYSLVERRVGERALSSYVSVHAESGKVYALQPLDHEELELLQFQVSARDA
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pF1KB3 GVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLTPRMRGTDGAVSEMVLRSVGAGVVVGKVRAVDAD
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CCDS54 GVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLMPRVGGIGGAVSELVPRSVGAGHVVAKVRAVDAD
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pF1KB3 SGYNAWLSYELQPETASASIPFRVGLYTGEISTTRALDETDAPRQRLLVLVKDHGEPALT
       ::::::::::::: :..: ::::::::::::::::::::.::::.::::::::::::.::
CCDS54 SGYNAWLSYELQPGTGGARIPFRVGLYTGEISTTRALDEVDAPRHRLLVLVKDHGEPSLT
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pF1KB3 ATATVLVSLVESGQAPKSSSRASVGATGPEVTLVDVNVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYTV
       :::::::::::::::::.::.::.::::::..:::::::::.:::::::::::::::::.
CCDS54 ATATVLVSLVESGQAPKASSQASAGATGPEAALVDVNVYLIVAICAVSSLLVLTLLLYTA
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pF1KB3 LRCSAMPTEGECAPGKPTLVCSSAVGSWSYSQQRRQRVCSGEGKQKTDLMAFSPGLSPCA
       ::::: ::::.:.:::::::::::::::::::::.::::::::  :::::::::.: :: 
CCDS54 LRCSAPPTEGDCGPGKPTLVCSSAVGSWSYSQQRQQRVCSGEGLPKTDLMAFSPSLPPCP
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pF1KB3 GSTERTGEPSASSDSTGKPRQPNPDWRYSASLRAGMHSSVHLEEAGILRAGPGGPDQQWP
        : .:  . ... : ..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ISRDREEKQDVDVDLSAKPRQPNPDWRYSASLRAGMHSSVHLEEAGILRAGPGGPDQQWP
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pF1KB3 TVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQSGPGELPDKFIIPGSPAIISIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQSGPGELPDKFIIPGSPAIISIR
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pF1KB3 QEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKEKGNSTTDNSDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKEKGNSTTDNSDQ
              910       920       930       940       950

>>CCDS4240.1 PCDHA13 gene_id:56136|Hs108|chr5             (950 aa)
 initn: 5011 init1: 5011 opt: 5011  Z-score: 4377.5  bits: 821.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5011; 80.9% identity (91.2% similar) in 950 aa overlap (1-950:1-950)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MLYSSRGDPEGQPLLLSLLILAMWVVGSGQLHYSVPEEAEHGTFVGRIAQDLGLELAELV
       :: : .: :. . ::: ::::: : .:::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS42 MLSSWQGGPRPRQLLLWLLILAAWETGSGQLHYSVPEEAKHGTFVGRIAQDLGLELAELV
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB3 PRLFQLDSKGRGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREELCGRSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVD
       ::::.. :: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS42 PRLFRVASKRHGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREELCGRSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 VEVKDINDNPPVFPATQKNLFIAESRPLDSRFPLEGASDADIGENALLTYRLSPNEYFFL
       :.:.:::::::.:: ..: ..:::::: ..::::.:::::::: :. :::::.::.:: :
CCDS42 VKVRDINDNPPIFPESKKRIIIAESRPPETRFPLDGASDADIGVNSALTYRLDPNDYFTL
              130       140       150       160       170       180

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pF1KB3 DVPTSNQQVKPLGLVLRKLLDREETPELHLLLTATDGGKPELTGTVQLLITVLDNNDNAP
       :. .: .:.. :.::::: :::::  :  :::::.::::::::::::::::.:: :::::
CCDS42 DAQNSLEQMSSLSLVLRKTLDREEIQEHSLLLTASDGGKPELTGTVQLLITILDVNDNAP
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        : ...: : . ::.  :::::. ::.: :.: ::::.:::   : : .   : ..: .:
CCDS42 EFYQSVYKVTVLENAFNGTLVIKLNATDPDDGTNGDIVYSFRRPVWPAVVYAFTINPNNG
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        : . :..::::.. ..: :::::::  :.::::::::::.:::::::..:: .::.:..
CCDS42 EIRTKGKLDFEEKKLYEISVEAVDKGNIPMAGHCTLLVEVLDVNDNAPEVTITSLSLPIR
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       ::.: ...:::::: : :. .::::::.:::::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS42 EDTQPSAIIALISVSDRDSGSNGQVTCTLTPHVPFKLVSTYKNYYSLVLDSALDRESVSA
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       ::::::::::::::::::: ::: ::::::::::::: :::::::::::::::::::::.
CCDS42 YELVVTARDGGSPSLWATASVSVGVADVNDNAPAFAQPEYTVFVKENNPPGCHIFTVSAQ
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       ::::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
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       ::::::.:::::::::..:::::.::.:::..:::::::::::::::::::::::::::.
CCDS42 ATATVLLSLVESGQAPQASSRASAGAVGPEAALVDVNVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYTA
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CCDS42 LRCSAPPTEGACAPGKPTLVCSSAAGSWSYSQQRRPRVCSGEGPHKTDLMAFSPSLPPCL
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CCDS42 GSAEGTGQREEDSECLKEPRQPNPDWRYSASLRAGMHSSVHLEEAGILRAGPGGPDQQWP
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pF1KB3 TVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQSGPGELPDKFIIPGSPAIISIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQSGPGELPDKFIIPGSPAIISIR
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKEKGNSTTDNSDQ
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>>CCDS54913.1 PCDHA1 gene_id:56147|Hs108|chr5             (950 aa)
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       :..: ::   .. ::: ::.:: : :::::::::.::::.:::::::.::::::::::::
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       :.::::::::::: . .. .:: ::: :.::::.:::.::::: :::::: :::..:: :
CCDS54 VKVKDINDNPPVFRGREQIIFIPESRLLNSRFPIEGAADADIGANALLTYTLSPSDYFSL
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CCDS54 LFDQAVYRVHLLETTANGTLVTTLNASDADEGVNGEVVFSFDSGISRDIQEKFKVDSSSG
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pF1KB3 AITVIGHMDFEESRAHKIPVEAVDKGFPPLAGHCTLLVEVVDVNDNAPQLTIKTLSVPVK
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CCDS54 EIRLIDKLDYEETKSYEIQVKAVDKGSPPMSNHCKVLVKVLDVNDNAPELAVTSLYLPIR
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
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CCDS54 GVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLAPRVGGTIGAVSELVPRLVGAGHVVAKVRAVDAD
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       ::::::::::::: ...: ::::::::::::::::.:::.:  : :::::::::::::::
CCDS54 SGYNAWLSYELQPAAGGARIPFRVGLYTGEISTTRVLDEADLSRYRLLVLVKDHGEPALT
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       :::::::::::::::::.:::::::..:::..:::::::::::::::::::::::::::.
CCDS54 ATATVLVSLVESGQAPKASSRASVGVAGPEAALVDVNVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYTA
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CCDS54 LRCSVPPTEGAYVPGKPTLVCSSALGSWSNSQQRRQRVCSSEGPPKTDLMAFSPGLSPSL
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       ...::. .: :. : .:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NTSERNEQPEANLDLSGNPRQPNPDWRYSASLRAGMHSSVHLEEAGILRAGPGGPDQQWP
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pF1KB3 TVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQSGPGELPDKFIIPGSPAIISIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQSGPGELPDKFIIPGSPAIISIR
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pF1KB3 QEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKEKGNSTTDNSDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKEKGNSTTDNSDQ
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>>CCDS47281.1 PCDHA6 gene_id:56142|Hs108|chr5             (950 aa)
 initn: 4985 init1: 4985 opt: 4986  Z-score: 4355.7  bits: 817.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4986; 80.2% identity (91.1% similar) in 950 aa overlap (1-950:1-950)

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pF1KB3 MLYSSRGDPEGQPLLLSLLILAMWVVGSGQLHYSVPEEAEHGTFVGRIAQDLGLELAELV
       :... .     : ::: ::.:: : ::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS47 MVFTPEDRLGKQCLLLPLLLLAAWKVGSGQLHYSVPEEAKHGTFVGRIAQDLGLELAELV
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pF1KB3 PRLFQLDSKGRGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREELCGRSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVD
       ::::.. :: : ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PRLFRMASKDREDLLEVNLQNGILFVNSRIDREELCGRSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVD
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pF1KB3 VEVKDINDNPPVFPATQKNLFIAESRPLDSRFPLEGASDADIGENALLTYRLSPNEYFFL
       :::.:::::::.::. .. ..: :::  :: ::::::::::.: :..:::.:: .::: :
CCDS47 VEVRDINDNPPLFPVEEQRVLIYESRLPDSVFPLEGASDADVGSNSILTYKLSSSEYFGL
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pF1KB3 DVPTSNQQVKPLGLVLRKLLDREETPELHLLLTATDGGKPELTGTVQLLITVLDNNDNAP
       ::  .... : .::.:.: :::::.:  .:.::::::::::::::::::.:::: :::::
CCDS47 DVKINSDDNKQIGLLLKKSLDREEAPAHNLFLTATDGGKPELTGTVQLLVTVLDVNDNAP
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pF1KB3 VFDRTLYTVKLPENVSIGTLVIHPNASDLDEGLNGDIIYSFSSDVSPDIKSKFHMDPLSG
       .:... : :.. ::.. :: ::. :::: ::: :: : :::.: :.  . ..: .:  .:
CCDS47 TFEQSEYEVRIFENADNGTTVIRLNASDRDEGANGAISYSFNSLVAAMVIDHFSIDRNTG
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pF1KB3 AITVIGHMDFEESRAHKIPVEAVDKGFPPLAGHCTLLVEVVDVNDNAPQLTIKTLSVPVK
        :.. :..:::.   .:: ..:.::: ::.:::::.::...: :::.:.... .::.::.
CCDS47 EIVIRGNLDFEQENLYKILIDATDKGHPPMAGHCTVLVRILDKNDNVPEIALTSLSLPVR
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pF1KB3 EDAQLGTVIALISVIDLDADANGQVTCSLTPHVPFKLVSTYKNYYSLVLDRALDRESVSA
       ::::.::::::::: :::. :::::.::::::::::::::.::::::::: :::::::::
CCDS47 EDAQFGTVIALISVNDLDSGANGQVNCSLTPHVPFKLVSTFKNYYSLVLDSALDRESVSA
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pF1KB3 YELVVTARDGGSPSLWATARVSVEVADVNDNAPAFAQSEYTVFVKENNPPGCHIFTVSAR
       ::::::::::::::::::: .::::::.::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS47 YELVVTARDGGSPSLWATASLSVEVADMNDNAPAFAQPEYTVFVKENNPPGCHIFTVSAR
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pF1KB3 DADAQENALVSYSLVERRLGERSLSSYVSVHAESGKVYALQPLDHEELELLQFQVSARDA
       ::::::::::::::::::.:::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DADAQENALVSYSLVERRVGERALSSYISVHAESGKVYALQPLDHEELELLQFQVSARDA
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       ::::::::::::::::::::::::::.::. :: :::::.: ::.::: ::.::::::::
CCDS47 GVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLAPRVGGTGGAVSELVPRSLGAGQVVAKVRAVDAD
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pF1KB3 SGYNAWLSYELQPETASASIPFRVGLYTGEISTTRALDETDAPRQRLLVLVKDHGEPALT
       ::::::::::::: ..:: .:::::::::::::::.:::.:.::.:::::::::::::::
CCDS47 SGYNAWLSYELQPPASSARFPFRVGLYTGEISTTRVLDEADSPRHRLLVLVKDHGEPALT
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       :::::::::::::::::.::::::::.:::..:::::::::::::::::::::::::::.
CCDS47 ATATVLVSLVESGQAPKASSRASVGAAGPEAALVDVNVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYTA
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pF1KB3 LRCSAMPTEGECAPGKPTLVCSSAVGSWSYSQQRRQRVCSGEGKQKTDLMAFSPGLSPCA
       ::::: :::: :.  ::::::::::::::::::::::::::::  : :::::::.:::: 
CCDS47 LRCSAPPTEGACTADKPTLVCSSAVGSWSYSQQRRQRVCSGEGPPKMDLMAFSPSLSPCP
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pF1KB3 GSTERTGEPSASSDSTGKPRQPNPDWRYSASLRAGMHSSVHLEEAGILRAGPGGPDQQWP
           .. . . . :  .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IMMGKAENQDLNEDHDAKPRQPNPDWRYSASLRAGMHSSVHLEEAGILRAGPGGPDQQWP
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pF1KB3 TVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQSGPGELPDKFIIPGSPAIISIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQSGPGELPDKFIIPGSPAIISIR
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pF1KB3 QEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKEKGNSTTDNSDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKEKGNSTTDNSDQ
              910       920       930       940       950

>>CCDS54919.1 PCDHA8 gene_id:56140|Hs108|chr5             (950 aa)
 initn: 4953 init1: 4953 opt: 4959  Z-score: 4332.1  bits: 813.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4959; 80.3% identity (90.5% similar) in 950 aa overlap (1-950:1-950)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MLYSSRGDPEGQPLLLSLLILAMWVVGSGQLHYSVPEEAEHGTFVGRIAQDLGLELAELV
       : :  ::.  .  ::: ::.:: : ::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS54 MDYHWRGELGSWRLLLLLLLLAAWKVGSGQLHYSVPEEAKHGTFVGRIAQDLGLELAELV
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pF1KB3 PRLFQLDSKGRGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREELCGRSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVD
       ::::.. :: . :::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PRLFRVASKRHRDLLEVSLQNGILFVNSRIDREELCGRSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVD
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pF1KB3 VEVKDINDNPPVFPATQKNLFIAESRPLDSRFPLEGASDADIGENALLTYRLSPNEYFFL
       :::::.::::::: . ...::..:::  :::::::::::::.: :..:::::: ..::.:
CCDS54 VEVKDVNDNPPVFRVKDQKLFVSESRMPDSRFPLEGASDADVGANSVLTYRLSSHDYFML
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pF1KB3 DVPTSNQQVKPLGLVLRKLLDREETPELHLLLTATDGGKPELTGTVQLLITVLDNNDNAP
       :: ..:.. : . ::::: ::::..:  ::.::::::::::::::::::.:::: :::::
CCDS54 DVNSKNDENKLVELVLRKSLDREDAPAHHLFLTATDGGKPELTGTVQLLVTVLDVNDNAP
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pF1KB3 VFDRTLYTVKLPENVSIGTLVIHPNASDLDEGLNGDIIYSFSSDVSPDIKSKFHMDPLSG
       .:... : :.. ::.. :: ::. :::: ::: :: : :::.: :   . ..: .:  .:
CCDS54 TFEQSEYEVRIFENADNGTTVIKLNASDPDEGANGAISYSFNSLVETMVIDHFSIDRNTG
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pF1KB3 AITVIGHMDFEESRAHKIPVEAVDKGFPPLAGHCTLLVEVVDVNDNAPQLTIKTLSVPVK
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CCDS54 EIVIRGNLDFEQENLYKILIDATDKGHPPMAGHCTVLVRILDKNDNVPEIALTSLSLPVR
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pF1KB3 EDAQLGTVIALISVIDLDADANGQVTCSLTPHVPFKLVSTYKNYYSLVLDRALDRESVSA
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       ::::::::::::::::::: .:::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS54 YELVVTARDGGSPSLWATASLSVEVADVNDNAPAFAQPEYTVFVKENNPPGCHIFTVSAR
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       ::::::::::::::::::.::::::::.:::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DADAQENALVSYSLVERRVGERSLSSYISVHTESGKVYALQPLDHEELELLQFQVSARDA
              490       500       510       520       530       540

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pF1KB3 GVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLTPRMRGTDGAVSEMVLRSVGAGVVVGKVRAVDAD
       :::::::::::::::::::::::::: ::. :: ::.:..: :::::: ::.::::::::
CCDS54 GVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLEPRVGGTGGAASKLVPRSVGAGHVVAKVRAVDAD
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pF1KB3 SGYNAWLSYELQPETASASIPFRVGLYTGEISTTRALDETDAPRQRLLVLVKDHGEPALT
       ::::::::::::: ..:  ::::::::::::::::.:::.:.::.:::::::::::::::
CCDS54 SGYNAWLSYELQPAASSPRIPFRVGLYTGEISTTRVLDEADSPRHRLLVLVKDHGEPALT
              610       620       630       640       650       660

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pF1KB3 ATATVLVSLVESGQAPKSSSRASVGATGPEVTLVDVNVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYTV
       :::::::::::::::::.::: :.:. :::..:::::::::::::::::::::::::::.
CCDS54 ATATVLVSLVESGQAPKASSRQSAGVLGPEAALVDVNVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYTA
              670       680       690       700       710       720

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pF1KB3 LRCSAMPTEGECAPGKPTLVCSSAVGSWSYSQQRRQRVCSGEGKQKTDLMAFSPGLSPCA
       :::::.:::: :  :::::::::::::::::::. ::::::::  ::::::::: : :  
CCDS54 LRCSALPTEGGCRAGKPTLVCSSAVGSWSYSQQQPQRVCSGEGPPKTDLMAFSPCLPPDL
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pF1KB3 GSTERTGEPSASSDSTGKPRQPNPDWRYSASLRAGMHSSVHLEEAGILRAGPGGPDQQWP
       ::..   : . . :   :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GSVDVGEEQDLNVDHGLKPRQPNPDWRYSASLRAGMHSSVHLEEAGILRAGPGGPDQQWP
              790       800       810       820       830       840

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pF1KB3 TVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQSGPGELPDKFIIPGSPAIISIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQSGPGELPDKFIIPGSPAIISIR
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pF1KB3 QEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKEKGNSTTDNSDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKEKGNSTTDNSDQ
              910       920       930       940       950

>>CCDS54921.1 PCDHA10 gene_id:56139|Hs108|chr5            (948 aa)
 initn: 4950 init1: 3389 opt: 4952  Z-score: 4326.0  bits: 811.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4952; 82.2% identity (91.2% similar) in 940 aa overlap (12-950:11-948)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MLYSSRGDPEGQPLLLSLLILAMWVVGSGQLHYSVPEEAEHGTFVGRIAQDLGLELAELV
                  : ::::::.:: : :::::::::: :::.::::::::::::::::::::
CCDS54  MVSRCSCLGVQCLLLSLLLLAAWEVGSGQLHYSVYEEARHGTFVGRIAQDLGLELAELV
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 PRLFQLDSKGRGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREELCGRSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVD
        :::.. :: .::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS54 QRLFRVASKRHGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREELCGRSVECSIHLEVIVDRPLQVFHVD
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 VEVKDINDNPPVFPATQKNLFIAESRPLDSRFPLEGASDADIGENALLTYRLSPNEYFFL
       ::::::::::: : .:...: : ::: ::::::::::::::.::::::::.::::::: :
CCDS54 VEVKDINDNPPRFSVTEQKLSIPESRLLDSRFPLEGASDADVGENALLTYKLSPNEYFVL
     120       130       140       150       160       170         

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pF1KB3 DVPTSNQQVKPLGLVLRKLLDREETPELHLLLTATDGGKPELTGTVQLLITVLDNNDNAP
       :. ..... :   :::::::::::.:.:.::::::::::::.::.:.::: ::: :::::
CCDS54 DIINKKDKDKFPVLVLRKLLDREENPQLKLLLTATDGGKPEFTGSVSLLILVLDANDNAP
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 VFDRTLYTVKLPENVSIGTLVIHPNASDLDEGLNGDIIYSFSSDVSPDIKSKFHMDPLSG
       .::: .: ::. ::    ::::. :::: :::.: ...::::: : : :. :: ..  .:
CCDS54 IFDRPVYEVKMYENQVNQTLVIRLNASDSDEGINKEMMYSFSSLVPPTIRRKFWINERTG
     240       250       260       270       280       290         

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 AITVIGHMDFEESRAHKIPVEAVDKGFPPLAGHCTLLVEVVDVNDNAPQLTIKTLSVPVK
        : :   .:::.: ...: :...::: ::..::::.:::..: :::.:.. . .::.:::
CCDS54 EIKVNDAIDFEDSNTYEIHVDVTDKGNPPMVGHCTVLVELLDENDNSPEVIVTSLSLPVK
     300       310       320       330       340       350         

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CCDS54 EDAQVGTVIALISVSDHDSGANGQVTCSLTPHVPFKLVSTYKNYYSLVLDSALDRERVSA
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       ::::::::::::: ::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: 
CCDS54 YELVVTARDGGSPPLWATASVSVEVADVNDNAPAFAQSEYTVFVKENNPPGCHIFTVSAW
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CCDS54 DADAQENALVSYSLVERRLGERSLSSYVSVHAESGKVYALQPLDHEELELLQFQVSARDG
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       ::::::::.:::::::::::::::::.    .. :::::.::::: :: ::.::::::::
CCDS54 GVPPLGSNLTLQVFVLDENDNAPALLASPAGSAGGAVSELVLRSVVAGHVVAKVRAVDAD
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       ::::::::::::  ...: ::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.::
CCDS54 SGYNAWLSYELQSAAVGARIPFRVGLYTGEISTTRALDETDSPRQRLLVLVKDHGEPSLT
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       :::::::::::..::::.:::::::.. :::.:::::::::::::::::::::::::::.
CCDS54 ATATVLVSLVEGSQAPKASSRASVGVA-PEVALVDVNVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYTA
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pF1KB3 LRCSAMPTEGECAPGKPTLVCSSAVGSWSYSQQRRQRVCSGEGKQKTDLMAFSPGLSPCA
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CCDS54 LRCSAAPTEGACGPVKPTLVCSSAVGSWSYSQQRRQRVCSGEGLPKADLMAFSPSLPPCP
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pF1KB3 GSTERTGEP-SASSDSTGKPRQPNPDWRYSASLRAGMHSSVHLEEAGILRAGPGGPDQQW
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CCDS54 -MVDVDGEDQSIGGDHSRKPRQPNPDWRYSASLRAGMHSSVHLEEAGILRAGPGGPDQQW
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pF1KB3 PTVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQSGPGELPDKFIIPGSPAIISI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PTVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQSGPGELPDKFIIPGSPAIISI
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pF1KB3 RQEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKEKGNSTTDNSDQ
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CCDS54 RQEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKEKGNSTTDNSDQ
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>>CCDS54914.1 PCDHA2 gene_id:56146|Hs108|chr5             (948 aa)
 initn: 4913 init1: 3863 opt: 4910  Z-score: 4289.4  bits: 805.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4910; 80.9% identity (91.8% similar) in 936 aa overlap (15-950:15-948)

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CCDS54 MASSIRRGRGAWTRLLSLLLLAAWEVGSGQLRYSVPEEAKHGTFVGRIAQDLGLELEELV
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pF1KB3 PRLFQLDSKGRGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREELCGRSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVD
       ::::.. :: .::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.
CCDS54 PRLFRVASKRHGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREELCGRSAECSIHVEVIVDRPLQVFHVE
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pF1KB3 VEVKDINDNPPVFPATQKNLFIAESRPLDSRFPLEGASDADIGENALLTYRLSPNEYFFL
       :::::::::::.:: : :.. . ::: :::::::::::::::: ::::.:.:: .:.:::
CCDS54 VEVKDINDNPPIFPMTVKTIRFPESRLLDSRFPLEGASDADIGVNALLSYKLSSSEFFFL
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pF1KB3 DVPTSNQQVKPLGLVLRKLLDREETPELHLLLTATDGGKPELTGTVQLLITVLDNNDNAP
       :. ....  . :.::: : :::::: :..:::.::::::::::::::.:: ::: ::: :
CCDS54 DIQANDELSESLSLVLGKSLDREETAEVNLLLVATDGGKPELTGTVQILIKVLDVNDNEP
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pF1KB3 VFDRTLYTVKLPENVSIGTLVIHPNASDLDEGLNGDIIYSFSSDVSPDIKSKFHMDPLSG
       .: ...: ::: ::.. ::::.. :::: ::: :..:.::..::::  :..:: .::.::
CCDS54 TFAQSVYKVKLLENTANGTLVVKLNASDADEGPNSEIVYSLGSDVSSTIQTKFTIDPISG
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pF1KB3 AITVIGHMDFEESRAHKIPVEAVDKGFPPLAGHCTLLVEVVDVNDNAPQLTIKTLSVPVK
        : . :..:.::.....: : :.::: : ..::: . ...::.:::.:...: .::.:..
CCDS54 EIRTKGKLDYEEAKSYEIQVTATDKGTPSMSGHCKISLKLVDINDNTPEVSITSLSLPIS
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pF1KB3 EDAQLGTVIALISVIDLDADANGQVTCSLTPHVPFKLVSTYKNYYSLVLDRALDRESVSA
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CCDS54 ENASLGTVIALITVSDRDSGTNGHVTCSLTPHVPFKLVSTFKNYYSLVLDSALDRESVSA
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pF1KB3 YELVVTARDGGSPSLWATARVSVEVADVNDNAPAFAQSEYTVFVKENNPPGCHIFTVSAR
       ::::::::::::::::::. ::.:::::::::::::: ::::::::::::::::::::: 
CCDS54 YELVVTARDGGSPSLWATTSVSIEVADVNDNAPAFAQPEYTVFVKENNPPGCHIFTVSAW
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CCDS54 DADAQENALVSYSLVERRVGERALSSYVSVHAESGKVYALQPLDHEEVELLQFQVSARDA
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pF1KB3 GVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLTPRMRGTDGAVSEMVLRSVGAGVVVGKVRAVDAD
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CCDS54 GVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLAPRAGTAAGAVSELVPWSVGAGHVVAKVRAVDAD
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pF1KB3 SGYNAWLSYELQPETASASIPFRVGLYTGEISTTRALDETDAPRQRLLVLVKDHGEPALT
       ::::::::::::  :.:: ::::::::::::::::::::.:.::.:::::::::::::::
CCDS54 SGYNAWLSYELQLGTGSARIPFRVGLYTGEISTTRALDEADSPRHRLLVLVKDHGEPALT
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       :::::::::::::::::.:::: :::.: :.:::::::::::::::::::::::.::::.
CCDS54 ATATVLVSLVESGQAPKASSRAWVGAAGSEATLVDVNVYLIIAICAVSSLLVLTVLLYTA
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pF1KB3 LRCSAMPTEGECAPGKPTLVCSSAVGSWSYSQQRRQRVCSGEGKQKTDLMAFSPGLSPCA
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CCDS54 LRCSVPPTEGARAPGKPTLVCSSAVGSWSYSQQRRQRVCSGEDPPKTDLMAFSPSLSQGP
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pF1KB3 GSTERTGEPSASSDSTGKPRQPNPDWRYSASLRAGMHSSVHLEEAGILRAGPGGPDQQWP
        :.:.  .  . :. .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DSAEE--KQLSESEYVGKPRQPNPDWRYSASLRAGMHSSVHLEEAGILRAGPGGPDQQWP
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pF1KB3 TVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQSGPGELPDKFIIPGSPAIISIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQSGPGELPDKFIIPGSPAIISIR
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pF1KB3 QEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKEKGNSTTDNSDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKEKGNSTTDNSDQ
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>>CCDS47284.1 PCDHA11 gene_id:56138|Hs108|chr5            (949 aa)
 initn: 4836 init1: 3564 opt: 4876  Z-score: 4259.7  bits: 799.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4876; 79.7% identity (90.6% similar) in 950 aa overlap (3-950:4-949)

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pF1KB3  MLYSSRGDPEGQP-LLLSLLILAMWVVGSGQLHYSVPEEAEHGTFVGRIAQDLGLELAE
          .. ::   : : : : ::.: .: :::::::::: :::.::::::::::::::::::
CCDS47 MFGFQRRG--LGTPRLQLWLLLLEFWEVGSGQLHYSVSEEAKHGTFVGRIAQDLGLELAE
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pF1KB3 LVPRLFQLDSKGRGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREELCGRSAECSIHLEVIVDRPLQVFH
       :: :::.. :: .::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS47 LVQRLFRVASKTHGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREELCGQSAECSIHLEVIVDRPLQVFH
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pF1KB3 VDVEVKDINDNPPVFPATQKNLFIAESRPLDSRFPLEGASDADIGENALLTYRLSPNEYF
       :.:::::::::::::   ...:.::::.  :::::::::::::: :::::::::: ::::
CCDS47 VNVEVKDINDNPPVFSLREQKLLIAESKQSDSRFPLEGASDADIEENALLTYRLSKNEYF
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pF1KB3 FLDVPTSNQQVKPLGLVLRKLLDREETPELHLLLTATDGGKPELTGTVQLLITVLDNNDN
        :: ::...:.: :.:.:.: ::::.::::.:::::::::::::::::.::. ::: :::
CCDS47 SLDSPTNGKQIKRLSLILKKSLDREKTPELNLLLTATDGGKPELTGTVRLLVQVLDVNDN
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pF1KB3 APVFDRTLYTVKLPENVSIGTLVIHPNASDLDEGLNGDIIYSFSSDVSPDIKSKFHMDPL
        : ::.. : :.: ::..  :::.. ::.: :::.::.. ::. : ..:. .  : .:  
CCDS47 DPEFDKSEYKVSLMENAAKETLVLKLNATDRDEGVNGEVTYSLMS-IKPNGRHLFTLDQN
      240       250       260       270       280        290       

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pF1KB3 SGAITVIGHMDFEESRAHKIPVEAVDKGFPPLAGHCTLLVEVVDVNDNAPQLTIKTLSVP
       .: . : : .:.::.. .:: :.:.::: ::.:::::. ::..:.:::.:.... .::.:
CCDS47 NGEVRVNGTLDYEENKFYKIEVQATDKGTPPMAGHCTVWVEILDTNDNSPEVAVTSLSLP
       300       310       320       330       340       350       

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pF1KB3 VKEDAQLGTVIALISVIDLDADANGQVTCSLTPHVPFKLVSTYKNYYSLVLDRALDRESV
       :.:::: .:::::::: : :. .:::::::::::::::::::.::::::::: :::::.:
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