Result of SIM4 for pF1KB3226

seq1 = pF1KB3226.tfa, 1860 bp
seq2 = pF1KB3226/gi568815586f_112958193.tfa (gi568815586f:112958193_113196936), 238744 bp

>pF1KB3226 1860
>gi568815586f:112958193_113196936 (Chr12)

1-259  (100001-100259)   100% ->
260-941  (119232-119913)   100% ->
942-1003  (134970-135031)   100% ->
1004-1165  (135347-135508)   100% ->
1166-1227  (135846-135907)   100% ->
1228-1386  (136597-136755)   100% ->
1387-1548  (136850-137011)   100% ->
1549-1638  (137133-137222)   100% ->
1639-1860  (138523-138744)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCACGGCCAGGCCACGGTGGGCTGATGCCTGTGAATGGTCTGGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCACGGCCAGGCCACGGTGGGCTGATGCCTGTGAATGGTCTGGGCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCACCGCAGAACGTGGCCCGGGTGGTGGTGTGGGAGTGGCTGAATGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCACCGCAGAACGTGGCCCGGGTGGTGGTGTGGGAGTGGCTGAATGAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAGCCGCTGGCGGCCCTACACGGCCACCGTGTGCCACCACATTGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACAGCCGCTGGCGGCCCTACACGGCCACCGTGTGCCACCACATTGAGAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGCTGAAGGAGGACGCTCGCGGTTCCGTGGTCCTGGGGCAGGTGGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGCTGAAGGAGGACGCTCGCGGTTCCGTGGTCCTGGGGCAGGTGGACGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCAGCTTGTGCCCTACATCATCGACCTGCAGTCCATGCACCAGTTTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCAGCTTGTGCCCTACATCATCGACCTGCAGTCCATGCACCAGTTTCGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGACACAG         GCACCATGCGGCCCGTGCGGCGCAACTTCTAC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGACACAGGTG...CAGGCACCATGCGGCCCGTGCGGCGCAACTTCTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GACCCGTCGTCGGCGCCGGGCAAGGGCATCGTGTGGGAGTGGGAGAACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119264 GACCCGTCGTCGGCGCCGGGCAAGGGCATCGTGTGGGAGTGGGAGAACGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CGGCGGCGCATGGACGGCCTACGATATGGACATCTGCATCACCATCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119314 CGGCGGCGCATGGACGGCCTACGATATGGACATCTGCATCACCATCCAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACGCCTACGAGAAGCAGCACCCGTGGCTCGACCTCTCATCGCTAGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119364 ACGCCTACGAGAAGCAGCACCCGTGGCTCGACCTCTCATCGCTAGGCTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TGCTACCTCATCTACTTCAACAGCATGTCGCAGATGAACCGCCAGACGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119414 TGCTACCTCATCTACTTCAACAGCATGTCGCAGATGAACCGCCAGACGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CCGGCGCCGCCGCCTGCGCCGCCGCCTGGACCTCGCCTACCCGCTCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119464 CCGGCGCCGCCGCCTGCGCCGCCGCCTGGACCTCGCCTACCCGCTCACCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TGGGCTCCATCCCTAAGTCGCAGTCGTGGCCCGTGGGCGCCAGCTCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119514 TGGGCTCCATCCCTAAGTCGCAGTCGTGGCCCGTGGGCGCCAGCTCGGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CAGCCCTGCTCCTGCCAGCAGTGCCTGCTGGTCAACAGCACGCGCGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119564 CAGCCCTGCTCCTGCCAGCAGTGCCTGCTGGTCAACAGCACGCGCGCCGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CTCCAACGCCATCCTGGCCTCGCAGCGCCGCAAGGCGCCCCCCGCGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119614 CTCCAACGCCATCCTGGCCTCGCAGCGCCGCAAGGCGCCCCCCGCGCCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CGCTGCCGCCGCCGCCGCCACCTGGAGGGCCTCCAGGCGCGCTTGCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119664 CGCTGCCGCCGCCGCCGCCACCTGGAGGGCCTCCAGGCGCGCTTGCCGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CGCCCCAGCGCCACCTTCACAGGCGCCGCGCTCTGGGCAGCGCCCGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119714 CGCCCCAGCGCCACCTTCACAGGCGCCGCGCTCTGGGCAGCGCCCGCCGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CGGCCCCGCCGAGCCCGCGCCGCCTCCCGGGGCGCCCCCACGGAGCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119764 CGGCCCCGCCGAGCCCGCGCCGCCTCCCGGGGCGCCCCCACGGAGCCCGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GCGCCCCCGGCGGAGCGCGCACCCCGGGGCAGAACAACCTCAACCGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119814 GCGCCCCCGGCGGAGCGCGCACCCCGGGGCAGAACAACCTCAACCGGCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GGGCCCCAGCGCACCACCAGCGTGAGCGCGCGCGCCTCCATCCCGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119864 GGGCCCCAGCGCACCACCAGCGTGAGCGCGCGCGCCTCCATCCCGCCGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942          GGTCCCCGCACTCCCGGTGAAGAACTTGAATGGTACTGGGC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119914 GTA...CAGGGTCCCCGCACTCCCGGTGAAGAACTTGAATGGTACTGGGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 CGGTCCATCCGGCCCTGGCAG         GGATGACCGGGATACTGCTG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 135011 CGGTCCATCCGGCCCTGGCAGGTG...CAGGGATGACCGGGATACTGCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 TGCGCGGCCGGGCTGCCCGTGTGCCTGACGCGGGCCCCCAAGCCCATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135367 TGCGCGGCCGGGCTGCCCGTGTGCCTGACGCGGGCCCCCAAGCCCATCCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GCACCCGCCGCCCGTGAGCAAGAGCGACGTGAAGCCCGTGCCTGGCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135417 GCACCCGCCGCCCGTGAGCAAGAGCGACGTGAAGCCCGTGCCTGGCGTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 CCGGGGTGTGCCGCAAGACCAAGAAGAAGCACCTTAAAAAGA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 135467 CCGGGGTGTGCCGCAAGACCAAGAAGAAGCACCTTAAAAAGAGTA...CA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1166  GTAAGAATCCCGAGGATGTGGTTCGAAGATACATGCAGAAGGTGAAAAA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135845 GGTAAGAATCCCGAGGATGTGGTTCGAAGATACATGCAGAAGGTGAAAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 CCCACCTGATGAG         GACTGCACCATCTGCATGGAGCGACTGG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 135895 CCCACCTGATGAGGTG...CAGGACTGCACCATCTGCATGGAGCGACTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 TCACAGCATCAGGCTACGAGGGCGTGCTTCGGCACAAGGGCGTGCGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136625 TCACAGCATCAGGCTACGAGGGCGTGCTTCGGCACAAGGGCGTGCGGCCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 GAGCTCGTGGGCCGCCTGGGCCGCTGTGGCCACATGTACCACCTGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136675 GAGCTCGTGGGCCGCCTGGGCCGCTGTGGCCACATGTACCACCTGCTGTG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 CCTCGTGGCCATGTACTCCAATGGCAACAAG         GATGGCAGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 136725 CCTCGTGGCCATGTACTCCAATGGCAACAAGGTG...CAGGATGGCAGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 TGCAGTGCCCCACCTGCAAGGCCATCTACGGGGAGAAGACGGGTACGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136860 TGCAGTGCCCCACCTGCAAGGCCATCTACGGGGAGAAGACGGGTACGCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 CCGCCTGGGAAGATGGAGTTCCACCTCATCCCCCACTCGCTGCCCGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136910 CCGCCTGGGAAGATGGAGTTCCACCTCATCCCCCACTCGCTGCCCGGCTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 CCCTGATACCCAGACCATCCGCATCGTCTATGACATCCCCACAGGCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136960 CCCTGATACCCAGACCATCCGCATCGTCTATGACATCCCCACAGGCATCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 AG         GGCCCTGAGCACCCCAACCCCGGGAAGAAGTTCACCGCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137010 AGGTG...CAGGGCCCTGAGCACCCCAACCCCGGGAAGAAGTTCACCGCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 AGAGGATTCCCTCGCCACTGCTATCTACCCAACAACGAGAAAGGCCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137172 AGAGGATTCCCTCGCCACTGCTATCTACCCAACAACGAGAAAGGCCGGAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 G         GTGCTGCGGCTGCTCATCACGGCCTGGGAGAGAAGACTCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137222 GGTG...CAGGTGCTGCGGCTGCTCATCACGGCCTGGGAGAGAAGACTCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 TCTTCACTATCGGCACGTCCAACACCACGGGCGAGTCGGACACCGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138563 TCTTCACTATCGGCACGTCCAACACCACGGGCGAGTCGGACACCGTGGTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 TGGAACGAGATCCACCACAAGACCGAGTTTGGATCCAACCTCACGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138613 TGGAACGAGATCCACCACAAGACCGAGTTTGGATCCAACCTCACGGGCCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 CGGCTACCCGGACGCTAGCTACCTAGACAACGTGCTGGCTGAGCTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138663 CGGCTACCCGGACGCTAGCTACCTAGACAACGTGCTGGCTGAGCTCACAG

   1900     .    :    .    :    .    :
   1829 CCCAGGGCGTATCCGAGGCTGCAGCCAAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 138713 CCCAGGGCGTATCCGAGGCTGCAGCCAAGGCT

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