Result of FASTA (omim) for pF1KB3109
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3109, 1786 aa
  1>>>pF1KB3109 1786 - 1786 aa - 1786 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8544+/-0.000646; mu= 9.9441+/- 0.040
 mean_var=423.8418+/-88.398, 0's: 0 Z-trim(115.1): 396  B-trim: 381 in 2/53
 Lambda= 0.062298
 statistics sampled from 24975 (25419) to 24975 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.298), width:  16
 Scan time: 14.550

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_002282 (OMIM: 150240,615191) laminin subunit be (1786) 12583 1148.2       0
XP_016867690 (OMIM: 150240,615191) PREDICTED: lami (1810) 12510 1141.7       0
XP_016867691 (OMIM: 150240,615191) PREDICTED: lami (1212) 8367 769.1       0
NP_002283 (OMIM: 150325,609049,614199) laminin sub (1798) 6774 626.2 8.8e-178
XP_005265184 (OMIM: 150325,609049,614199) PREDICTE (1798) 6774 626.2 8.8e-178
NP_031382 (OMIM: 616380) laminin subunit beta-4 is (1761) 4457 417.9 4.2e-115
NP_001304975 (OMIM: 616380) laminin subunit beta-4 (1761) 4457 417.9 4.2e-115
XP_011514280 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1723) 4448 417.1 7.3e-115
XP_016867368 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1753) 4438 416.2 1.4e-114
XP_011514277 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1772) 4438 416.2 1.4e-114
XP_011514281 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1703) 4434 415.8 1.7e-114
XP_011514282 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1564) 4407 413.3 8.9e-114
XP_016867369 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1567) 4407 413.3  9e-114
NP_001304976 (OMIM: 616380) laminin subunit beta-4 (1101) 3866 364.5 3.2e-99
NP_001304977 (OMIM: 616380) laminin subunit beta-4 ( 772) 2428 235.0 2.1e-60
NP_001316629 (OMIM: 610401) netrin-4 isoform 2 pre ( 605) 1284 132.0 1.7e-29
NP_067052 (OMIM: 610401) netrin-4 isoform 1 precur ( 628) 1284 132.1 1.7e-29
NP_001316631 (OMIM: 610401) netrin-4 isoform 3 [Ho ( 591) 1260 129.9 7.3e-29
NP_001316630 (OMIM: 610401) netrin-4 isoform 3 [Ho ( 591) 1260 129.9 7.3e-29
NP_002284 (OMIM: 150290) laminin subunit gamma-1 p (1609) 1210 126.0 2.9e-27
NP_006050 (OMIM: 604349,614115) laminin subunit ga (1575) 1143 120.0 1.8e-25
XP_011516423 (OMIM: 604349,614115) PREDICTED: lami (1581) 1127 118.5   5e-25
NP_000219 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) lami (1172) 1119 117.6 6.9e-25
NP_001017402 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) l (1172) 1119 117.6 6.9e-25
XP_005273181 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) P (1172) 1119 117.6 6.9e-25
NP_001121113 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) l (1172) 1119 117.6 6.9e-25
XP_006716984 (OMIM: 604349,614115) PREDICTED: lami (1259) 1097 115.7 2.8e-24
NP_001073291 (OMIM: 156225,607855) laminin subunit (3118) 1054 112.4 6.8e-23
NP_000417 (OMIM: 156225,607855) laminin subunit al (3122) 1054 112.4 6.8e-23
XP_011523959 (OMIM: 150320,615960) PREDICTED: lami (2489) 1004 107.8 1.4e-21
XP_011523958 (OMIM: 150320,615960) PREDICTED: lami (2561) 1004 107.8 1.4e-21
NP_005550 (OMIM: 150320,615960) laminin subunit al (3075) 1004 107.9 1.5e-21
XP_011523957 (OMIM: 150320,615960) PREDICTED: lami (3085) 1004 107.9 1.5e-21
XP_016866342 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (1916)  972 104.7 8.6e-21
XP_016866341 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (2587)  972 104.9   1e-20
XP_005267039 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (3206)  972 105.1 1.1e-20
XP_011534122 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (3208)  972 105.1 1.1e-20
XP_005267038 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (3210)  972 105.1 1.1e-20
XP_016866340 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (3212)  972 105.1 1.1e-20
NP_009054 (OMIM: 276901,608400,613809) usherin iso (1546)  833 92.1 4.4e-17
XP_006721658 (OMIM: 601614) PREDICTED: netrin-1 is ( 604)  816 90.0 7.6e-17
NP_004813 (OMIM: 601614) netrin-1 precursor [Homo  ( 604)  816 90.0 7.6e-17
NP_996816 (OMIM: 276901,608400,613809) usherin iso (5202)  833 92.9 8.6e-17
XP_016856761 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) P (1108)  813 90.1 1.3e-16
NP_001289925 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) l ( 488)  655 75.4 1.5e-12
XP_016878162 (OMIM: 612454) PREDICTED: multiple ep (1021)  660 76.3 1.7e-12
NP_115821 (OMIM: 612454) multiple epidermal growth (1044)  660 76.3 1.7e-12
XP_016878161 (OMIM: 612454) PREDICTED: multiple ep (1044)  660 76.3 1.7e-12
XP_016878160 (OMIM: 612454) PREDICTED: multiple ep (1092)  660 76.3 1.7e-12
XP_016878159 (OMIM: 612454) PREDICTED: multiple ep (1097)  660 76.3 1.8e-12


>>NP_002282 (OMIM: 150240,615191) laminin subunit beta-1  (1786 aa)
 initn: 12583 init1: 12583 opt: 12583  Z-score: 6134.4  bits: 1148.2 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 12583; 99.9% identity (100.0% similar) in 1786 aa overlap (1-1786:1-1786)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MGLLQLLAFSFLALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDLLIGRAQKLSVTSTCGLHK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MGLLQLLAFSFLALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDLLIGRAQKLSVTSTCGLHK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 PEPYCIVSHLQEDKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTTFAPNRLKIWWQSENGVEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PEPYCIVSHLQEDKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTTFAPNRLKIWWQSENGVEN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 VTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGVYRYFAYDCEASFPGISTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGVYRYFAYDCEASFPGISTG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 PMKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIEDPYSPRIQNLLKITNLRIKFVKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PMKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIEDPYSPRIQNLLKITNLRIKFVKL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 HTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAPVDGFNEEVEGMVHGHCMC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 HTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAPVDGFNEEVEGMVHGHCMC
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 RHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSISCHFDMAVYLATGNVSGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 RHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSISCHFDMAVYLATGNVSGG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 VCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERDIRDPNFCERCTCDPAGSQNEGICDSYTDFSTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERDIRDPNFCERCTCDPAGSQNEGICDSYTDFSTG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 LIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACNPLGTIPGGNPCDSETGHCY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACNPLGTIPGGNPCDSETGHCY
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 CKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNSCFAESGQCSCRPHMIGRQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 CKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNSCFAESGQCSCRPHMIGRQC
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 NEVEPGYYFATLDHYLYEAEEANLGPGVSIVERQYIQDRIPSWTGAGFVRVPEGAYLEFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 NEVEPGYYFATLDHYLYEAEEANLGPGVSIVERQYIQDRIPSWTGAGFVRVPEGAYLEFF
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 IDNIPYSMEYDILIRYEPQLPDHWEKAVITVQRPGRIPTSSRCGNTIPDDDNQVVSLSPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 IDNIPYSMEYDILIRYEPQLPDHWEKAVITVQRPGRIPTSSRCGNTIPDDDNQVVSLSPG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 SRYVVLPRPVCFEKGTNYTVRLELPQYTSSDSDVESPYTLIDSLVLMPYCKSLDIFTVGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SRYVVLPRPVCFEKGTNYTVRLELPQYTSSDSDVESPYTLIDSLVLMPYCKSLDIFTVGG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 SGDGVVTNSAWETFQRYRCLENSRSVVKTPMTDVCRNIIFSISALLHQTGLACECDPQGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SGDGVVTNSAWETFQRYRCLENSRSVVKTPMTDVCRNIIFSISALLHQTGLACECDPQGS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB3 LSSVCDPNGGQCQCRPNVVGRTCNRCAPGTFGFGPSGCKPCECHLQGSVNAFCNPVTGQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LSSVCDPNGGQCQCRPNVVGRTCNRCAPGTFGFGPSGCKPCECHLQGSVNAFCNPVTGQC
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB3 HCFQGVYARQCDRCLPGHWGFPSCQPCQCNGHADDCDPVTGECLNCQDYTMGHNCERCLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 HCFQGVYARQCDRCLPGHWGFPSCQPCQCNGHADDCDPVTGECLNCQDYTMGHNCERCLA
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB3 GYYGDPIIGSGDHCRPCPCPDGPDSGRQFARSCYQDPVTLQLACVCDPGYIGSRCDDCAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GYYGDPIIGSGDHCRPCPCPDGPDSGRQFARSCYQDPVTLQLACVCDPGYIGSRCDDCAS
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB3 GYFGNPSEVGGSCQPCQCHNNIDTTDPEACDKETGRCLKCLYHTEGEHCQFCRFGYYGDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GYFGNPSEVGGSCQPCQCHNNIDTTDPEACDKETGRCLKCLYHTEGEHCQFCRFGYYGDA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB3 LRQDCRKCVCNYLGTVQEHCNGSDCQCDKATGQCLCLPNVIGQNCDRCAPNTWQLASGTG
       :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LQQDCRKCVCNYLGTVQEHCNGSDCQCDKATGQCLCLPNVIGQNCDRCAPNTWQLASGTG
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB3 CDPCNCNAAHSFGPSCNEFTGQCQCMPGFGGRTCSECQELFWGDPDVECRACDCDPRGIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 CDPCNCNAAHSFGPSCNEFTGQCQCMPGFGGRTCSECQELFWGDPDVECRACDCDPRGIE
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB3 TPQCDQSTGQCVCVEGVEGPRCDKCTRGYSGVFPDCTPCHQCFALWDVIIAELTNRTHRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TPQCDQSTGQCVCVEGVEGPRCDKCTRGYSGVFPDCTPCHQCFALWDVIIAELTNRTHRF
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LEKAKALKISGVIGPYRETVDSVERKVSEIKDILAQSPAAEPLKNIGNLFEEAEKLIKDV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TEMMAQVEVKLSDTTSQSNSTAKELDSLQTEAESLDNTVKELAEQLEFIKNSDIRGALDS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 ITKYFQMSLEAEERVNASTTEPNSTVEQSALMRDRVEDVMMERESQFKEKQEEQARLLDE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LAGKLQSLDLSAAAEMTCGTPPGASCSETECGGPNCRTDEGERKCGGPGCGGLVTVAHNA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 WQKAMDLDQDVLSALAEVEQLSKMVSEAKLRADEAKQSAEDILLKTNATKEKMDKSNEEL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 RNLIKQIRNFLTQDSADLDSIEAVANEVLKMEMPSTPQQLQNLTEDIRERVESLSQVEVI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LQHSAADIARAEMLLEEAKRASKSATDVKVTADMVKEALEEAEKAQVAAEKAIKQADEDI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QGTQNLLTSIESETAASEETLFNASQRISELERNVEELKRKAAQNSGEAEYIEKVVYTVK
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pF1KB3 QSAEDVKKTLDGELDEKYKKVENLIAKKTEESADARRKAEMLQNEAKTLLAQANSKLQLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QSAEDVKKTLDGELDEKYKKVENLIAKKTEESADARRKAEMLQNEAKTLLAQANSKLQLL
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pF1KB3 KDLERKYEDNQRYLEDKAQELARLEGEVRSLLKDISQKVAVYSTCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KDLERKYEDNQRYLEDKAQELARLEGEVRSLLKDISQKVAVYSTCL
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>>XP_016867690 (OMIM: 150240,615191) PREDICTED: laminin   (1810 aa)
 initn: 12510 init1: 12510 opt: 12510  Z-score: 6098.9  bits: 1141.7 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 12510; 99.9% identity (100.0% similar) in 1774 aa overlap (13-1786:37-1810)

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pF1KB3                   MGLLQLLAFSFLALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDL
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XP_016 APTPPPPLVRFFRAPLPACVPPTLLPVLPAALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LIGRAQKLSVTSTCGLHKPEPYCIVSHLQEDKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTT
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pF1KB3 FAPNRLKIWWQSENGVENVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FAPNRLKIWWQSENGVENVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YRYFAYDCEASFPGISTGPMKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIEDPYSP
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pF1KB3 RIQNLLKITNLRIKFVKLHTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RIQNLLKITNLRIKFVKLHTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VDGFNEEVEGMVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB3 AGSQNEGICDSYTDFSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AGSQNEGICDSYTDFSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACNP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGTIPGGNPCDSETGHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNSC
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pF1KB3 FAESGQCSCRPHMIGRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEANLGPGVSIVERQYIQDRIPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FAESGQCSCRPHMIGRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEANLGPGVSIVERQYIQDRIPS
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pF1KB3 WTGAGFVRVPEGAYLEFFIDNIPYSMEYDILIRYEPQLPDHWEKAVITVQRPGRIPTSSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WTGAGFVRVPEGAYLEFFIDNIPYSMEYDILIRYEPQLPDHWEKAVITVQRPGRIPTSSR
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pF1KB3 CGNTIPDDDNQVVSLSPGSRYVVLPRPVCFEKGTNYTVRLELPQYTSSDSDVESPYTLID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CGNTIPDDDNQVVSLSPGSRYVVLPRPVCFEKGTNYTVRLELPQYTSSDSDVESPYTLID
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pF1KB3 SLVLMPYCKSLDIFTVGGSGDGVVTNSAWETFQRYRCLENSRSVVKTPMTDVCRNIIFSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SLVLMPYCKSLDIFTVGGSGDGVVTNSAWETFQRYRCLENSRSVVKTPMTDVCRNIIFSI
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pF1KB3 SALLHQTGLACECDPQGSLSSVCDPNGGQCQCRPNVVGRTCNRCAPGTFGFGPSGCKPCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SALLHQTGLACECDPQGSLSSVCDPNGGQCQCRPNVVGRTCNRCAPGTFGFGPSGCKPCE
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pF1KB3 CHLQGSVNAFCNPVTGQCHCFQGVYARQCDRCLPGHWGFPSCQPCQCNGHADDCDPVTGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CHLQGSVNAFCNPVTGQCHCFQGVYARQCDRCLPGHWGFPSCQPCQCNGHADDCDPVTGE
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pF1KB3 CLNCQDYTMGHNCERCLAGYYGDPIIGSGDHCRPCPCPDGPDSGRQFARSCYQDPVTLQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CLNCQDYTMGHNCERCLAGYYGDPIIGSGDHCRPCPCPDGPDSGRQFARSCYQDPVTLQL
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pF1KB3 ACVCDPGYIGSRCDDCASGYFGNPSEVGGSCQPCQCHNNIDTTDPEACDKETGRCLKCLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ACVCDPGYIGSRCDDCASGYFGNPSEVGGSCQPCQCHNNIDTTDPEACDKETGRCLKCLY
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pF1KB3 HTEGEHCQFCRFGYYGDALRQDCRKCVCNYLGTVQEHCNGSDCQCDKATGQCLCLPNVIG
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XP_016 HTEGEHCQFCRFGYYGDALQQDCRKCVCNYLGTVQEHCNGSDCQCDKATGQCLCLPNVIG
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pF1KB3 QNCDRCAPNTWQLASGTGCDPCNCNAAHSFGPSCNEFTGQCQCMPGFGGRTCSECQELFW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QNCDRCAPNTWQLASGTGCDPCNCNAAHSFGPSCNEFTGQCQCMPGFGGRTCSECQELFW
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XP_016 GDPDVECRACDCDPRGIETPQCDQSTGQCVCVEGVEGPRCDKCTRGYSGVFPDCTPCHQC
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XP_016 FALWDVIIAELTNRTHRFLEKAKALKISGVIGPYRETVDSVERKVSEIKDILAQSPAAEP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LKNIGNLFEEAEKLIKDVTEMMAQVEVKLSDTTSQSNSTAKELDSLQTEAESLDNTVKEL
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pF1KB3 AEQLEFIKNSDIRGALDSITKYFQMSLEAEERVNASTTEPNSTVEQSALMRDRVEDVMME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AEQLEFIKNSDIRGALDSITKYFQMSLEAEERVNASTTEPNSTVEQSALMRDRVEDVMME
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pF1KB3 RESQFKEKQEEQARLLDELAGKLQSLDLSAAAEMTCGTPPGASCSETECGGPNCRTDEGE
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XP_016 RESQFKEKQEEQARLLDELAGKLQSLDLSAAAEMTCGTPPGASCSETECGGPNCRTDEGE
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pF1KB3 RKCGGPGCGGLVTVAHNAWQKAMDLDQDVLSALAEVEQLSKMVSEAKLRADEAKQSAEDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RKCGGPGCGGLVTVAHNAWQKAMDLDQDVLSALAEVEQLSKMVSEAKLRADEAKQSAEDI
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           1490      1500      1510      1520      1530      1540  
pF1KB3 LLKTNATKEKMDKSNEELRNLIKQIRNFLTQDSADLDSIEAVANEVLKMEMPSTPQQLQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLKTNATKEKMDKSNEELRNLIKQIRNFLTQDSADLDSIEAVANEVLKMEMPSTPQQLQN
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pF1KB3 LTEDIRERVESLSQVEVILQHSAADIARAEMLLEEAKRASKSATDVKVTADMVKEALEEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LTEDIRERVESLSQVEVILQHSAADIARAEMLLEEAKRASKSATDVKVTADMVKEALEEA
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pF1KB3 EKAQVAAEKAIKQADEDIQGTQNLLTSIESETAASEETLFNASQRISELERNVEELKRKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EKAQVAAEKAIKQADEDIQGTQNLLTSIESETAASEETLFNASQRISELERNVEELKRKA
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pF1KB3 AQNSGEAEYIEKVVYTVKQSAEDVKKTLDGELDEKYKKVENLIAKKTEESADARRKAEML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AQNSGEAEYIEKVVYTVKQSAEDVKKTLDGELDEKYKKVENLIAKKTEESADARRKAEML
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pF1KB3 QNEAKTLLAQANSKLQLLKDLERKYEDNQRYLEDKAQELARLEGEVRSLLKDISQKVAVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QNEAKTLLAQANSKLQLLKDLERKYEDNQRYLEDKAQELARLEGEVRSLLKDISQKVAVY
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pF1KB3 STCL
       ::::
XP_016 STCL
       1810

>>XP_016867691 (OMIM: 150240,615191) PREDICTED: laminin   (1212 aa)
 initn: 8366 init1: 8366 opt: 8367  Z-score: 4088.2  bits: 769.1 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 8367; 98.1% identity (98.7% similar) in 1145 aa overlap (13-1156:37-1175)

                                 10        20        30        40  
pF1KB3                   MGLLQLLAFSFLALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDL
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XP_016 APTPPPPLVRFFRAPLPACVPPTLLPVLPAALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDL
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pF1KB3 LIGRAQKLSVTSTCGLHKPEPYCIVSHLQEDKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LIGRAQKLSVTSTCGLHKPEPYCIVSHLQEDKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTT
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pF1KB3 FAPNRLKIWWQSENGVENVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FAPNRLKIWWQSENGVENVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YRYFAYDCEASFPGISTGPMKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIEDPYSP
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pF1KB3 RIQNLLKITNLRIKFVKLHTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RIQNLLKITNLRIKFVKLHTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAP
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pF1KB3 VDGFNEEVEGMVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VDGFNEEVEGMVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SCHFDMAVYLATGNVSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERDIRDPNFCERCTCDP
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pF1KB3 AGSQNEGICDSYTDFSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AGSQNEGICDSYTDFSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACNP
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pF1KB3 LGTIPGGNPCDSETGHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNSC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGTIPGGNPCDSETGHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNSC
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pF1KB3 FAESGQCSCRPHMIGRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEANLGPGVSIVERQYIQDRIPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FAESGQCSCRPHMIGRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEANLGPGVSIVERQYIQDRIPS
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pF1KB3 WTGAGFVRVPEGAYLEFFIDNIPYSMEYDILIRYEPQLPDHWEKAVITVQRPGRIPTSSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WTGAGFVRVPEGAYLEFFIDNIPYSMEYDILIRYEPQLPDHWEKAVITVQRPGRIPTSSR
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CGNTIPDDDNQVVSLSPGSRYVVLPRPVCFEKGTNYTVRLELPQYTSSDSDVESPYTLID
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pF1KB3 SLVLMPYCKSLDIFTVGGSGDGVVTNSAWETFQRYRCLENSRSVVKTPMTDVCRNIIFSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SLVLMPYCKSLDIFTVGGSGDGVVTNSAWETFQRYRCLENSRSVVKTPMTDVCRNIIFSI
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pF1KB3 SALLHQTGLACECDPQGSLSSVCDPNGGQCQCRPNVVGRTCNRCAPGTFGFGPSGCKPCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SALLHQTGLACECDPQGSLSSVCDPNGGQCQCRPNVVGRTCNRCAPGTFGFGPSGCKPCE
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pF1KB3 CHLQGSVNAFCNPVTGQCHCFQGVYARQCDRCLPGHWGFPSCQPCQCNGHADDCDPVTGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CHLQGSVNAFCNPVTGQCHCFQGVYARQCDRCLPGHWGFPSCQPCQCNGHADDCDPVTGE
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pF1KB3 CLNCQDYTMGHNCERCLAGYYGDPIIGSGDHCRPCPCPDGPDSGRQFARSCYQDPVTLQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CLNCQDYTMGHNCERCLAGYYGDPIIGSGDHCRPCPCPDGPDSGRQFARSCYQDPVTLQL
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pF1KB3 ACVCDPGYIGSRCDDCASGYFGNPSEVGGSCQPCQCHNNIDTTDPEACDKETGRCLKCLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ACVCDPGYIGSRCDDCASGYFGNPSEVGGSCQPCQCHNNIDTTDPEACDKETGRCLKCLY
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pF1KB3 HTEGEHCQFCRFGYYGDALRQDCRKCVCNYLGTVQEHCNGSDCQCDKATGQCLCLPNVIG
       :::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HTEGEHCQFCRFGYYGDALQQDCRKCVCNYLGTVQEHCNGSDCQCDKATGQCLCLPNVIG
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pF1KB3 QNCDRCAPNTWQLASGTGCDPCNCNAAHSFGPSCNEFTGQCQCMPGFGGRTCSECQELFW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QNCDRCAPNTWQLASGTGCDPCNCNAAHSFGPSCNEFTGQCQCMPGFGGRTCSECQELFW
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pF1KB3 GDPDVECRACDCDPRGI-ETPQCDQSTGQCVCVEGVEGPRCDKCTRGYSGVFPDCTPCHQ
       ::::::::    : . . . :  :   .. .: ::                         
XP_016 GDPDVECR----DVEDVTQFP--DYPGSHNMCGEGRIYHLSPQFMLLTIMLYSSNLPLES
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            1190      1200      1210      1220      1230      1240 
pF1KB3 CFALWDVIIAELTNRTHRFLEKAKALKISGVIGPYRETVDSVERKVSEIKDILAQSPAAE
                                                                   
XP_016 LECRGRTKTIKR                                                
             1210                                                  

>>NP_002283 (OMIM: 150325,609049,614199) laminin subunit  (1798 aa)
 initn: 3037 init1: 3037 opt: 6774  Z-score: 3312.7  bits: 626.2 E(85289): 8.8e-178
Smith-Waterman score: 6774; 50.5% identity (77.6% similar) in 1785 aa overlap (7-1785:22-1797)

                              10        20        30        40     
pF1KB3                MGLLQLLAFSFLALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDLLIG
                            : .: ::   :  .:  :.   ::..:::::::::::.:
NP_002 MELTSRERGRGQPLPWELRLGLLLSVLAATLA--QAPAPDVP-GCSRGSCYPATGDLLVG
               10        20        30          40         50       

          50        60        70        80        90       100     
pF1KB3 RAQKLSVTSTCGLHKPEPYCIVSHLQEDKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTTFAP
       ::..:...:::::. :.:::::::::..::::.:.:. :.    :: :: :.::::.:::
NP_002 RADRLTASSTCGLNGPQPYCIVSHLQDEKKCFLCDSRRPFSARDNPHSHRIQNVVTSFAP
        60        70        80        90       100       110       

         110       120       130       140       150       160     
pF1KB3 NRLKIWWQSENGVENVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGVYRY
       .:   :::::::.  :::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::.:: ::::
NP_002 QRRAAWWQSENGIPAVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLVERSADFGRTWHVYRY
       120       130       140       150       160       170       

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pF1KB3 FAYDCEASFPGISTGPMKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIEDPYSPRIQ
       :.::: :.:::.  .: .. ::..:.::::.::::::::::.:.::::. : :::: :::
NP_002 FSYDCGADFPGVPLAPPRHWDDVVCESRYSEIEPSTEGEVIYRVLDPAIPIPDPYSSRIQ
       180       190       200       210       220       230       

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pF1KB3 NLLKITNLRIKFVKLHTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAPVDG
       :::::::::.....:::::::::: : :::::::::.:..:::::::::::::::::. :
NP_002 NLLKITNLRVNLTRLHTLGDNLLDPRREIREKYYYALYELVVRGNCFCYGHASECAPAPG
       240       250       260       270       280       290       

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pF1KB3 FNEEVEGMVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSISCH
          ..:::::: :.:.:::.::::: :.:::.::::::::  .:.::.::.:. :. :::
NP_002 APAHAEGMVHGACICKHNTRGLNCEQCQDFYRDLPWRPAEDGHSHACRKCECHGHTHSCH
       300       310       320       330       340       350       

         350       360       370       380       390       400     
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pF1KB3 QCFALWDVIIAELTNRTHRFLEKAKALKISGVIGPYRETVDSVERKVSEIKDIL-AQSPA
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XP_005 ACFGDWDRVVQDLAARTQRLEQRAQELQQTGVLGAFESSFWHMQEKLGIVQGIVGARNTS
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pF1KB3 AEPLKNIGNLFEEAEKLIKDVTEMMAQVEVKLSDTTSQSNSTAKELDSLQTEAESLDNTV
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XP_005 AASTAQLVEATEELRREIGEATEHLTQLEADLTDVQDENFNANHALSGLERDRLALNLTL
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pF1KB3 KELAEQLEFIKNSDIRGALDSITKYFQMSLEAEERVNASTTEPNSTVEQSALMRDRVEDV
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XP_005 RQLDQHLDLLKHSNFLGAYDSIRHAHSQSAEAERRANTSALAVPSPVSNSASARHRTEAL
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pF1KB3 MMERESQFKEKQEEQARLLDELAGKLQSLDLSAAAEMTCGTPPGASCSETECGGPNCRTD
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XP_005 MDAQKEDFNSKHMANQRALGKLSAHTHTLSLTDINELVCGAPGDAPCATSPCGGAGCRDE
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pF1KB3 EGERKCGGPGCGGLVTVAHNAWQKAMDLDQDVLSALAEVEQLSKMVSEAKLRADEAKQSA
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XP_005 DGQPRCGGLSCNGAAATADLALGRARHTQAELQRALAEGGSILSRVAETRRQASEAQQRA
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pF1KB3 EDILLKTNATKEKMDKSNEELRNLIKQIRNFLTQDSADLDSIEAVANEVLKMEMPSTPQQ
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XP_005 QAALDKANASRGQVEQANQELQELIQSVKDFLNQEGADPDSIEMVATRVLELSIPASAEQ
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XP_005 IQHLAGAIAERVRSLADVDAILARTVGDVRRAEQLLQDARRARSWAEDEKQKAETVQAAL
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XP_005 EEAQRAQGIAQGAIRGAVADTRDTEQTLYQVQERMAGAERALSSAGERARQLDALLEALK
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pF1KB3 RKAAQNSGEAEYIEKVVYTVKQSAEDVKKTLDGELDEKYKKVENLIAKKTEESADARRKA
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XP_005 LKRAGNSLAASTAEETAGSAQGRAQEAEQLLRGPLGDQYQTVKALAERKAQGVLAAQARA
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pF1KB3 EMLQNEAKTLLAQANSKLQLLKDLERKYEDNQRYLEDKAQELARLEGEVRSLLKDISQKV
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XP_005 EQLRDEARDLLQAAQDKLQRLQELEGTYEENERALESKAAQLDGLEARMRSVLQAINLQV
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pF1KB3 AVYSTCL
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XP_005 QIYNTCQ
              

>>NP_031382 (OMIM: 616380) laminin subunit beta-4 isofor  (1761 aa)
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Smith-Waterman score: 5145; 41.5% identity (68.4% similar) in 1784 aa overlap (30-1785:23-1759)

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pF1KB3 MGLLQLLAFSFLALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDLLIGRAQKLSVTSTCGLHK
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NP_031        MQFQLTLFLHLGWLSYSKAQDDCNRGACHPTTGDLLVGRNTQLMASSTCGLSR
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pF1KB3 PEPYCIVSHLQEDKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTTFAPNRLKIWWQSENGVEN
        . :::.:.:. ..:::::.:. ::    .:.:: ::::...: :.: : :::::::...
NP_031 AQKYCILSYLEGEQKCFICDSRFPYDPYDQPNSHTIENVIVSFEPDREKKWWQSENGLDH
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pF1KB3 VTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGVYRYFAYDCEASFPGISTG
       :.:.::::: :.:.:::.:::::::::::.:::.:.:..: :..::: :: .:::.:..:
NP_031 VSIRLDLEALFRFSHLILTFKTFRPAAMLVERSTDYGHNWKVFKYFAKDCATSFPNITSG
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pF1KB3 PMKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIEDPYSPRIQNLLKITNLRIKFVKL
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NP_031 QAQGVGDIVCDSKYSDIEPSTGGEVVLKVLDPSFEIENPYSPYIQDLVTLTNLRINFTKL
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pF1KB3 HTLGDNLLDSRM-EIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAPVDGFNEEV---EGMVHG
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NP_031 HTLGDALLGRRQNDSLDKYYYALYEMIVRGSCFCNGHASECRPMQKMRGDVFSPPGMVHG
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pF1KB3 HCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSISCHFDMAVYLATGN
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NP_031 QCVCQHNTDGPNCERCKDFFQDAPWRPAADLQDNACRSCSCNSHSSRCHFDMTTYLASGG
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pF1KB3 VSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERDIRDPNFCERCTCDPAGSQNEGICDSYTD
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NP_031 LSGGVCEDCQHNTEGQHCDRCRPLFYRDPLKTISDPYACIPCECDPDGTISGGICVSHSD
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pF1KB3 FSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACNPLGTIPGGNPCDSET
        . : .:::: :: :::: .:: :: . : ::. ::.::. : :::::..:  . :: .:
NP_031 PALGSVAGQCLCKENVEGAKCDQCKPNHYGLSATDPLGCQPCDCNPLGSLPFLT-CDVDT
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pF1KB3 GHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNSCFAESGQCSCRPHMI
       :.: :   ::: ::..:   .:::.: : :: :::::.::: .: :  ..::: ::::. 
NP_031 GQCLCLSYVTGAHCEECTVGYWGLGNHLHGCSPCDCDIGGAYSNVCSPKNGQCECRPHVT
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pF1KB3 GRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEAN-------LG-------PGVSIVERQYIQDRIPS
       ::.:.:  :::.:: :. ::::::::.       ::       :.: .:  . .     .
NP_031 GRSCSEPAPGYFFAPLNFYLYEAEEATTLQGLAPLGSETFGQSPAVHVVLGEPVPGNPVT
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pF1KB3 WTGAGFVRVPEGAYLEFFIDNIPYSMEYDILIRYEPQLPDHWEKAVITVQRPGRIPTSSR
       ::: ::.::  :: :.: ..:::. ... : :.:: :    :   .. :. ::    : .
NP_031 WTGPGFARVLPGAGLRFAVNNIPFPVDFTIAIHYETQSAADWTVQIV-VNPPG---GSEH
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pF1KB3 CGNTIPDDDNQVVSLSPGSRYVVLPRPVCFEKGTNYTVRLELPQYTSSDSDVESPYTLID
       :     ..  :  .:  ..: ..:: :.:.:  ..:.. . . :  ...: ..: ..:.:
NP_031 CIPKTLQSKPQSFALPAATRIMLLPTPICLEPDVQYSIDVYFSQPLQGESHAHS-HVLVD
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pF1KB3 SLVLMPYCKSLDIFTVGGSGDGVVTNSAWETFQRYRCLENSRSVVKTPMTDVCRNIIFSI
       :: :.:  .::. :          ...  . .: . :.: . ..    .  .:. .:.:.
NP_031 SLGLIPQINSLENFC---------SKQDLDEYQLHNCVEIASAMGPQVLPGACERLIISM
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       :: ::. ..::.: ::::..: :.  ::::::.: :::: :.::. :.. .:  ::.::.
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       :: ::: .. :. ::::: :   : .:.::::: :..:::::.:: ::  :. ::: :: 
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       :.::  .: :.:::::. ::::.:  .::. :::: ::: :.:.. ::.::::.  . ..
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        : :  :: :..: .:..:..:::   :. :::: :.::::.::::.:.. ::.::.::.
NP_031 ICNCLQGYTGTQCGECSTGFYGNPRISGAPCQPCACNNNIDVTDPESCSRVTGECLRCLH
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       .:.: .::.:. :.::.:: : ::.: :.  :.   .:  .:. : :: .:: : :::::
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pF1KB3 FWGDPDVECRACDCDPRGIETPQCDQSTGQCVCVEGVEGPRCDKCTRGYSGVFPDCTPCH
       ..:::  .:  :::.  : . : :: .::.: : ::: : :::.:.::.:  :: :  ::
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pF1KB3 QCFALWDVIIAELTNRTHRFLEKAKALKISGVIGPYRET-VDSVERKVSEIKDILAQS--
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NP_031 LCFDQWDHTISSLSKAVQGLMRLAANMEDKRETLPVCEADFKDLRGNVSEIERILKHPVF
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pF1KB3 PAAEPLKNIGNLFEEAEKLIKDVTEMMAQV-EVK-LSDTTSQSNSTAKELDSLQTEAESL
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NP_031 PSGKFLK-VKDYHDSVRRQIMQLNEQLKAVYEFQDLKDT----------IERAKNEADLL
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pF1KB3 DNTVKELAEQLEFIKNSDIRGALDSITKYFQMSLEAEERVNASTTEPNSTVEQSALMRDR
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NP_031 LEDLQEEIDLQSSVLNASIADSSENIKKYYHISSSAEKKIN----ETSSTINTSANTRND
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pF1KB3 VEDVMMERESQFKEKQEEQARLLDELAGKLQSLDLSAAAEMTCGTPPGASCSETECGGPN
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NP_031 LLTIL--------DTLTSKGNLSLERLKQIKIPDIQILNEKVCGDPGNVPCVPLPCGGAL
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pF1KB3 CRTDEGERKCGGPGCGGLVTVAHNAWQKAMDLDQDVLSALAEVEQLSKMVSEAKLRADEA
       :   .:.::: :::: : .:.. :: :::..  . . .   .:. :....   . .:. .
NP_031 CTGRKGHRKCRGPGCHGSLTLSTNALQKAQEAKSIIRNLDKQVRGLKNQIESISEQAEVS
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pF1KB3 KQSAEDILLKTNATKEKMDKSNEELRNLIKQIRNFLTQDSADLDSIEAVANEVLKMEMPS
       :..: ..  : .  ... :. .:..  .::...::: ....  ..:: ::: :: ...: 
NP_031 KNNALQLREKLGNIRNQSDSEEENINLFIKKVKNFLLEENVPPEDIEKVANGVLDIHLPI
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pF1KB3 TPQQLQNLTEDIRERVESLSQVEVILQHSAADIARAEMLLEEAKRASKSATDVKVTADMV
         :.: .    :.....   . ..  ..   .   :. :: .:: : :.: .. .. : .
NP_031 PSQNLTDELVKIQKHMQLCEDYRTDENRLNEEADGAQKLLVKAKAAEKAA-NILLNLDKT
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pF1KB3 KEALEEAEKAQVAAEKAIKQADEDIQGTQNLLTSIESETAASEETLFNASQRISELERNV
        . :..:. .:  :...: :   .:   .. . . :..:   .  :  :.:: : :: ..
NP_031 LNQLQQAQITQGRANSTITQLTANITKIKKNVLQAENQTREMKSELELAKQR-SGLEDGL
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pF1KB3 EELKRKAAQNSGEAEYIEKVVYTVKQSAEDVKKTLDGELDEKYKKVENLIAKKTEESADA
         :. :  ... .:  ..  : .  .::.    .:. :. :  ::   .. .::  .. .
NP_031 SLLQTKLQRHQDHA--VNAKVQA--ESAQHQAGSLEKEFVE-LKKQYAILQRKTSTTGLT
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pF1KB3 RR---KAEMLQNEAKTLLAQANSKLQLLKDLERKYEDNQRYLEDKAQELARLEGEVRSLL
       ..   :...:.. :. : .....:.. . ::::: .: .   . ::..:  :: .: .. 
NP_031 KETLGKVKQLKDAAEKLAGDTEAKIRRITDLERKIQDLNLSRQAKADQLRILEDQVVAIK
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pF1KB3 KDISQKVAVYSTCL 
       ..: ..   :. :  
NP_031 NEIVEQEKKYARCYS
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>>NP_001304975 (OMIM: 616380) laminin subunit beta-4 iso  (1761 aa)
 initn: 3854 init1: 1567 opt: 4457  Z-score: 2187.4  bits: 417.9 E(85289): 4.2e-115
Smith-Waterman score: 5145; 41.5% identity (68.4% similar) in 1784 aa overlap (30-1785:23-1759)

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pF1KB3 MGLLQLLAFSFLALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDLLIGRAQKLSVTSTCGLHK
                                    : .:.:.:.:::::.::  .: ..::::: .
NP_001        MQFQLTLFLHLGWLSYSKAQDDCNRGACHPTTGDLLVGRNTQLMASSTCGLSR
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pF1KB3 PEPYCIVSHLQEDKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTTFAPNRLKIWWQSENGVEN
        . :::.:.:. ..:::::.:. ::    .:.:: ::::...: :.: : :::::::...
NP_001 AQKYCILSYLEGEQKCFICDSRFPYDPYDQPNSHTIENVIVSFEPDREKKWWQSENGLDH
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pF1KB3 VTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGVYRYFAYDCEASFPGISTG
       :.:.::::: :.:.:::.:::::::::::.:::.:.:..: :..::: :: .:::.:..:
NP_001 VSIRLDLEALFRFSHLILTFKTFRPAAMLVERSTDYGHNWKVFKYFAKDCATSFPNITSG
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pF1KB3 PMKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIEDPYSPRIQNLLKITNLRIKFVKL
         . : ::.:::.:::::::: :::....:::.:.::.:::: ::.:. .:::::.:.::
NP_001 QAQGVGDIVCDSKYSDIEPSTGGEVVLKVLDPSFEIENPYSPYIQDLVTLTNLRINFTKL
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pF1KB3 HTLGDNLLDSRM-EIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAPVDGFNEEV---EGMVHG
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NP_001 HTLGDALLGRRQNDSLDKYYYALYEMIVRGSCFCNGHASECRPMQKMRGDVFSPPGMVHG
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pF1KB3 HCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSISCHFDMAVYLATGN
       .:.:.::: : ::: : ::..: :::::   ..:::..:.:: ::  :::::..:::.:.
NP_001 QCVCQHNTDGPNCERCKDFFQDAPWRPAADLQDNACRSCSCNSHSSRCHFDMTTYLASGG
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pF1KB3 VSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERDIRDPNFCERCTCDPAGSQNEGICDSYTD
       .:::::.:::::: :..:..:.:..:. : . : ::  :  : ::: :. . ::: :..:
NP_001 LSGGVCEDCQHNTEGQHCDRCRPLFYRDPLKTISDPYACIPCECDPDGTISGGICVSHSD
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pF1KB3 FSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACNPLGTIPGGNPCDSET
        . : .:::: :: :::: .:: :: . : ::. ::.::. : :::::..:  . :: .:
NP_001 PALGSVAGQCLCKENVEGAKCDQCKPNHYGLSATDPLGCQPCDCNPLGSLPFLT-CDVDT
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pF1KB3 GHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNSCFAESGQCSCRPHMI
       :.: :   ::: ::..:   .:::.: : :: :::::.::: .: :  ..::: ::::. 
NP_001 GQCLCLSYVTGAHCEECTVGYWGLGNHLHGCSPCDCDIGGAYSNVCSPKNGQCECRPHVT
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pF1KB3 GRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEAN-------LG-------PGVSIVERQYIQDRIPS
       ::.:.:  :::.:: :. ::::::::.       ::       :.: .:  . .     .
NP_001 GRSCSEPAPGYFFAPLNFYLYEAEEATTLQGLAPLGSETFGQSPAVHVVLGEPVPGNPVT
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pF1KB3 WTGAGFVRVPEGAYLEFFIDNIPYSMEYDILIRYEPQLPDHWEKAVITVQRPGRIPTSSR
       ::: ::.::  :: :.: ..:::. ... : :.:: :    :   .. :. ::    : .
NP_001 WTGPGFARVLPGAGLRFAVNNIPFPVDFTIAIHYETQSAADWTVQIV-VNPPG---GSEH
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       :     ..  :  .:  ..: ..:: :.:.:  ..:.. . . :  ...: ..: ..:.:
NP_001 CIPKTLQSKPQSFALPAATRIMLLPTPICLEPDVQYSIDVYFSQPLQGESHAHS-HVLVD
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pF1KB3 SLVLMPYCKSLDIFTVGGSGDGVVTNSAWETFQRYRCLENSRSVVKTPMTDVCRNIIFSI
       :: :.:  .::. :          ...  . .: . :.: . ..    .  .:. .:.:.
NP_001 SLGLIPQINSLENFC---------SKQDLDEYQLHNCVEIASAMGPQVLPGACERLIISM
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       :: ::. ..::.: ::::..: :.  ::::::.: :::: :.::. :.. .:  ::.::.
NP_001 SAKLHDGAVACKCHPQGSVGSSCSRLGGQCQCKPLVVGRCCDRCSTGSYDLGHHGCHPCH
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NP_001 ICNCLQGYTGTQCGECSTGFYGNPRISGAPCQPCACNNNIDVTDPESCSRVTGECLRCLH
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       ..:::  .:  :::.  : . : :: .::.: : ::: : :::.:.::.:  :: :  ::
NP_001 YYGDPPGRCIPCDCNRAGTQKPICDPDTGMCRCREGVSGQRCDRCARGHSQEFPTCLQCH
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pF1KB3 QCFALWDVIIAELTNRTHRFLEKAKALKISGVIGPYRET-VDSVERKVSEIKDILAQS--
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NP_001 LCFDQWDHTISSLSKAVQGLMRLAANMEDKRETLPVCEADFKDLRGNVSEIERILKHPVF
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pF1KB3 PAAEPLKNIGNLFEEAEKLIKDVTEMMAQV-EVK-LSDTTSQSNSTAKELDSLQTEAESL
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NP_001 PSGKFLK-VKDYHDSVRRQIMQLNEQLKAVYEFQDLKDT----------IERAKNEADLL
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pF1KB3 DNTVKELAEQLEFIKNSDIRGALDSITKYFQMSLEAEERVNASTTEPNSTVEQSALMRDR
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NP_001 LEDLQEEIDLQSSVLNASIADSSENIKKYYHISSSAEKKIN----ETSSTINTSANTRND
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pF1KB3 VEDVMMERESQFKEKQEEQARLLDELAGKLQSLDLSAAAEMTCGTPPGASCSETECGGPN
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NP_001 LLTIL--------DTLTSKGNLSLERLKQIKIPDIQILNEKVCGDPGNVPCVPLPCGGAL
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NP_001 CTGRKGHRKCRGPGCHGSLTLSTNALQKAQEAKSIIRNLDKQVRGLKNQIESISEQAEVS
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pF1KB3 KQSAEDILLKTNATKEKMDKSNEELRNLIKQIRNFLTQDSADLDSIEAVANEVLKMEMPS
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NP_001 KNNALQLREKLGNIRNQSDSEEENINLFIKKVKNFLLEENVPPEDIEKVANGVLDIHLPI
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pF1KB3 TPQQLQNLTEDIRERVESLSQVEVILQHSAADIARAEMLLEEAKRASKSATDVKVTADMV
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NP_001 PSQNLTDELVKIQKHMQLCEDYRTDENRLNEEADGAQKLLVKAKAAEKAA-NILLNLDKT
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pF1KB3 KEALEEAEKAQVAAEKAIKQADEDIQGTQNLLTSIESETAASEETLFNASQRISELERNV
        . :..:. .:  :...: :   .:   .. . . :..:   .  :  :.:: : :: ..
NP_001 LNQLQQAQITQGRANSTITQLTANITKIKKNVLQAENQTREMKSELELAKQR-SGLEDGL
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pF1KB3 EELKRKAAQNSGEAEYIEKVVYTVKQSAEDVKKTLDGELDEKYKKVENLIAKKTEESADA
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NP_001 SLLQTKLQRHQDHA--VNAKVQA--ESAQHQAGSLEKEFVE-LKKQYAILQRKTSTTGLT
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pF1KB3 RR---KAEMLQNEAKTLLAQANSKLQLLKDLERKYEDNQRYLEDKAQELARLEGEVRSLL
       ..   :...:.. :. : .....:.. . ::::: .: .   . ::..:  :: .: .. 
NP_001 KETLGKVKQLKDAAEKLAGDTEAKIRRITDLERKIQDLNLSRQAKADQLRILEDQVVAIK
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pF1KB3 KDISQKVAVYSTCL 
       ..: ..   :. :  
NP_001 NEIVEQEKKYARCYS
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>>XP_011514280 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin subunit  (1723 aa)
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Smith-Waterman score: 5069; 41.9% identity (68.7% similar) in 1737 aa overlap (30-1738:23-1712)

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XP_011        MQFQLTLFLHLGWLSYSKAQDDCNRGACHPTTGDLLVGRNTQLMASSTCGLSR
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pF1KB3 PEPYCIVSHLQEDKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTTFAPNRLKIWWQSENGVEN
        . :::.:.:. ..:::::.:. ::    .:.:: ::::...: :.: : :::::::...
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pF1KB3 VTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGVYRYFAYDCEASFPGISTG
       :.:.::::: :.:.:::.:::::::::::.:::.:.:..: :..::: :: .:::.:..:
XP_011 VSIRLDLEALFRFSHLILTFKTFRPAAMLVERSTDYGHNWKVFKYFAKDCATSFPNITSG
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pF1KB3 PMKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIEDPYSPRIQNLLKITNLRIKFVKL
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XP_011 QAQGVGDIVCDSKYSDIEPSTGGEVVLKVLDPSFEIENPYSPYIQDLVTLTNLRINFTKL
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pF1KB3 HTLGDNLLDSRM-EIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAPVDGFNEEV---EGMVHG
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XP_011 HTLGDALLGRRQNDSLDKYYYALYEMIVRGSCFCNGHASECRPMQKMRGDVFSPPGMVHG
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pF1KB3 HCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSISCHFDMAVYLATGN
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XP_011 QCVCQHNTDGPNCERCKDFFQDAPWRPAADLQDNACRSCSCNSHSSRCHFDMTTYLASGG
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pF1KB3 VSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERDIRDPNFCERCTCDPAGSQNEGICDSYTD
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XP_011 LSGGVCEDCQHNTEGQHCDRCRPLFYRDPLKTISDPYACIPCECDPDGTISGGICVSHSD
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pF1KB3 FSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACNPLGTIPGGNPCDSET
        . : .:::: :: :::: .:: :: . : ::. ::.::. : :::::..:  . :: .:
XP_011 PALGSVAGQCLCKENVEGAKCDQCKPNHYGLSATDPLGCQPCDCNPLGSLPFLT-CDVDT
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pF1KB3 GHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNSCFAESGQCSCRPHMI
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XP_011 GQCLCLSYVTGAHCEECTVGYWGLGNHLHGCSPCDCDIGGAYSNVCSPKNGQCECRPHVT
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pF1KB3 GRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEAN-------LG-------PGVSIVERQYIQDRIPS
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XP_011 GRSCSEPAPGYFFAPLNFYLYEAEEATTLQGLAPLGSETFGQSPAVHVVLGEPVPGNPVT
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pF1KB3 WTGAGFVRVPEGAYLEFFIDNIPYSMEYDILIRYEPQLPDHWEKAVITVQRPGRIPTSSR
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XP_011 WTGPGFARVLPGAGLRFAVNNIPFPVDFTIAIHYETQSAADWTVQIV-VNPPG---GSEH
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pF1KB3 CGNTIPDDDNQVVSLSPGSRYVVLPRPVCFEKGTNYTVRLELPQYTSSDSDVESPYTLID
       :     ..  :  .:  ..: ..:: :.:.:  ..:.. . . :  ...: ..: ..:.:
XP_011 CIPKTLQSKPQSFALPAATRIMLLPTPICLEPDVQYSIDVYFSQPLQGESHAHS-HVLVD
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pF1KB3 SLVLMPYCKSLDIFTVGGSGDGVVTNSAWETFQRYRCLENSRSVVKTPMTDVCRNIIFSI
       :: :.:  .::. :          ...  . .: . :.: . ..    .  .:. .:.:.
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pF1KB3 SALLHQTGLACECDPQGSLSSVCDPNGGQCQCRPNVVGRTCNRCAPGTFGFGPSGCKPCE
       :: ::. ..::.: ::::..: :.  ::::::.: :::: :.::. :.. .:  ::.::.
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       ..:::  .:  :::.  : . : :: .::.: : ::: : :::.:.::.:  :: :  ::
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pF1KB3 DNTVKELAEQLEFIKNSDIRGALDSITKYFQMSLEAEERVNASTTEPNSTVEQSALMRDR
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XP_011 LEDLQEEIDLQSSVLNASIADSSENIKKYYHISSSAEKKIN----ETSSTINTSANTRND
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pF1KB3 VEDVMMERESQFKEKQEEQARLLDELAGKLQSLDLSAAAEMTCGTPPGASCSETECGGPN
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XP_011 LLTILDTLTSKGNLSLE---RL-----KQIKIPDIQILNEKVCGDPGNVPCVPLPCGGAL
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pF1KB3 CRTDEGERKCGGPGCGGLVTVAHNAWQKAMDLDQDVLSALAEVEQLSKMVSEAKLRADEA
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XP_011 CTGRKGHRKCRGPGCHGSLTLSTNALQKAQEAKSIIRNLDKQVRGLKNQIESISEQAEVS
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pF1KB3 KQSAEDILLKTNATKEKMDKSNEELRNLIKQIRNFLTQDSADLDSIEAVANEVLKMEMPS
       :..: ..  : .  ... :. .:..  .::...::: ....  ..:: ::: :: ...: 
XP_011 KNNALQLREKLGNIRNQSDSEEENINLFIKKVKNFLLEENVPPEDIEKVANGVLDIHLPI
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pF1KB3 TPQQLQNLTEDIRERVESLSQVEVILQHSAADIARAEMLLEEAKRASKSATDVKVTADMV
         :.: .    :.....   . ..  ..   .   :. :: .:: : :.: .. .. : .
XP_011 PSQNLTDELVKIQKHMQLCEDYRTDENRLNEEADGAQKLLVKAKAAEKAA-NILLNLDKT
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pF1KB3 KEALEEAEKAQVAAEKAIKQADEDIQGTQNLLTSIESETAASEETLFNASQRISELERNV
        . :..:. .:  :...: :   .:   .. . . :..:   .  :  :.:: : :: ..
XP_011 LNQLQQAQITQGRANSTITQLTANITKIKKNVLQAENQTREMKSELELAKQR-SGLEDGL
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pF1KB3 EELKRKAAQNSGEAEYIEKVVYTVKQSAEDVKKTLDGELDEKYKKVENLIAKKTEESADA
         :. :  ... .:  ..  : .  .::.    .:. :. :  ::   .. .::  .. .
XP_011 SLLQTKLQRHQDHA--VNAKVQA--ESAQHQAGSLEKEFVE-LKKQYAILQRKTSTTGLT
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pF1KB3 RR---KAEMLQNEAKTLLAQANSKLQLLKDLERKYEDNQRYLEDKAQELARLEGEVRSLL
       ..   :...:.. :. : .....:..                                  
XP_011 KETLGKVKQLKDAAEKLAGDTEAKIRRITGCFQNSAR                       
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>>XP_016867368 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin subunit  (1753 aa)
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        . :::.:.:. ..:::::.:. ::    .:.:: ::::...: :.: : :::::::...
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       :.:.::::: :.:.:::.:::::::::::.:::.:.:..: :..::: :: .:::.:..:
XP_016 VSIRLDLEALFRFSHLILTFKTFRPAAMLVERSTDYGHNWKVFKYFAKDCATSFPNITSG
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XP_016 QAQGVGDIVCDSKYSDIEPSTGGEVVLKVLDPSFEIENPYSPYIQDLVTLTNLRINFTKL
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pF1KB3 HTLGDNLLDSRM-EIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAPVDGFNEEV---EGMVHG
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pF1KB3 HCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSISCHFDMAVYLATGN
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pF1KB3 FSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACNPLGTIPGGNPCDSET
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pF1KB3 GHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNSCFAESGQCSCRPHMI
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XP_016 GQCLCLSYVTGAHCEECTVGYWGLGNHLHGCSPCDCDIGGAYSNVCSPKNGQCECRPHVT
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pF1KB3 GRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEAN-------LG-------PGVSIVERQYIQDRIPS
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pF1KB3 WTGAGFVRVPEGAYLEFFIDNIPYSMEYDILIRYEPQLPDHWEKAVITVQRPGRIPTSSR
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XP_016 WTGPGFARVLPGAGLRFAVNNIPFPVDFTIAIHYETQSAADWTVQIV-VNPPG---GSEH
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pF1KB3 CGNTIPDDDNQVVSLSPGSRYVVLPRPVCFEKGTNYTVRLELPQYTSSDSDVESPYTLID
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XP_016 CIPKTLQSKPQSFALPAATRIMLLPTPICLEPDVQYSIDVYFSQPLQGESHAHS-HVLVD
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pF1KB3 SLVLMPYCKSLDIFTVGGSGDGVVTNSAWETFQRYRCLENSRSVVKTPMTDVCRNIIFSI
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