Result of FASTA (ccds) for pF1KB3104
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3104, 803 aa
  1>>>pF1KB3104 803 - 803 aa - 803 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4408+/-0.000952; mu= 19.1283+/- 0.058
 mean_var=63.8480+/-12.880, 0's: 0 Z-trim(103.6): 26  B-trim: 2 in 1/52
 Lambda= 0.160509
 statistics sampled from 7460 (7483) to 7460 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.23), width:  16
 Scan time:  3.150

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS75684.1 DPP6 gene_id:1804|Hs108|chr7           ( 803) 5350 1248.3       0
CCDS75683.1 DPP6 gene_id:1804|Hs108|chr7           ( 865) 5243 1223.5       0
CCDS75682.1 DPP6 gene_id:1804|Hs108|chr7           ( 801) 5236 1221.9       0
CCDS78291.1 DPP6 gene_id:1804|Hs108|chr7           ( 758) 4092 957.0       0
CCDS54388.1 DPP10 gene_id:57628|Hs108|chr2         ( 800) 2901 681.2 1.9e-195
CCDS33278.1 DPP10 gene_id:57628|Hs108|chr2         ( 789) 2872 674.5 1.9e-193
CCDS46400.1 DPP10 gene_id:57628|Hs108|chr2         ( 796) 2870 674.0 2.7e-193
CCDS54389.1 DPP10 gene_id:57628|Hs108|chr2         ( 746) 2708 636.5  5e-182
CCDS33311.1 FAP gene_id:2191|Hs108|chr2            ( 760) 1536 365.1 2.5e-100
CCDS2216.1 DPP4 gene_id:1803|Hs108|chr2            ( 766) 1535 364.8  3e-100
CCDS77480.1 FAP gene_id:2191|Hs108|chr2            ( 735) 1384 329.9 9.6e-90
CCDS78290.1 DPP6 gene_id:1804|Hs108|chr7           ( 353)  832 201.9 1.5e-51
CCDS45928.1 DPP9 gene_id:91039|Hs108|chr19         ( 892)  475 119.4 2.6e-26
CCDS10210.1 DPP8 gene_id:54878|Hs108|chr15         ( 882)  470 118.2 5.8e-26
CCDS10207.1 DPP8 gene_id:54878|Hs108|chr15         ( 898)  470 118.3 5.9e-26


>>CCDS75684.1 DPP6 gene_id:1804|Hs108|chr7                (803 aa)
 initn: 5350 init1: 5350 opt: 5350  Z-score: 6687.4  bits: 1248.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5350; 99.9% identity (99.9% similar) in 803 aa overlap (1-803:1-803)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MTTAKEPSASGKSVQQQEQELVGSNPPQRNWKGIAIALLVILVICSLIVTSVILLTPAED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MTTAKEPSASGKSVQQQEQELVGSNPPQRNWKGIAIALLVILVICSLIVTSVILLTPAED
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 NSLSQKKKVTVEDLFSEDFKIHDPEAKWISDTEFIYREQKGTVRLWNVETNTSTVLIEGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NSLSQKKKVTVEDLFSEDFKIHDPEAKWISDTEFIYREQKGTVRLWNVETNTSTVLIEGK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 KIESLRAIRYEISPDREYALFSYNVEPIYQHSYTGYYVLSKIPHGDPQSLDPPEVSNAKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KIESLRAIRYEISPDREYALFSYNVEPIYQHSYTGYYVLSKIPHGDPQSLDPPEVSNAKL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 QYAGWGPKGQQLIFIFENNIYYCAHVGKQAIRVVSTGKEGVIYNGLSDWLYEEEILKTHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QYAGWGPKGQQLIFIFENNIYYCAHVGKQAIRVVSTGKEGVIYNGLSDWLYEEEILKTHI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 AHWWSPDGTRLAYAAINDSRVPIMELPTYTGSIYPTVKPYHYPKAGSENPSISLHVIGLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AHWWSPDGTRLAYAAINDSRVPIMELPTYTGSIYPTVKPYHYPKAGSENPSISLHVIGLN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 GPTHDLEMMPPDDPRMREYYITMVKWATSTKVAVTWLNRAQNVSILTLCDATTGVCTKKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GPTHDLEMMPPDDPRMREYYITMVKWATSTKVAVTWLNRAQNVSILTLCDATTGVCTKKH
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 EDESEAWLHRQNEEPVFSKDGRKFFFIRAIPQGGRGKFYHITVSSSQPNSSNDNIQSITS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EDESEAWLHRQNEEPVFSKDGRKFFFIRAIPQGGRGKFYHITVSSSQPNSSNDNIQSITS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 GDWDVTKILAYDEKGNKIYFLSTEDLPRRRQLYSANTVGNFNRQCLSCDLVENCTYFSAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GDWDVTKILAYDEKGNKIYFLSTEDLPRRRQLYSANTVGNFNRQCLSCDLVENCTYFSAS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 FSHSMDFFLLKCEGPGVPMVTVHNTTDKKKMFDLETNEHVKKAINDRQMPKVEYRDIEID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FSHSMDFFLLKCEGPGVPMVTVHNTTDKKKMFDLETNEHVKKAINDRQMPKVEYRDIEID
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 DYNLPMQILKPATFTDTTHYPLLLVVDGTPGSQSVAEKFEVSWETVMVSSHGAVVVKCDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DYNLPMQILKPATFTDTTHYPLLLVVDGTPGSQSVAEKFEVSWETVMVSSHGAVVVKCDG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 RGSGFQGTKLLHEVRRRLGLLEEKDQMEAVRTMLKEQYIDRTRVAVFGKDYGGYLSTYIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RGSGFQGTKLLHEVRRRLGLLEEKDQMEAVRTMLKEQYIDRTRVAVFGKDYGGYLSTYIL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 PAKGENQGQTFTCGSALSPITDFKLYASAFSERYLGLHGLDNRAYEMTKVAHRVSALEEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PAKGENQGQTFTCGSALSPITDFKLYASAFSERYLGLHGLDNRAYEMTKVAHRVSALEEQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 QFLIIHPTADEKIHFQHTAELITQLIRGKANYSLQIYPDESHYFTSSSLKQHLYRSIINF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QFLIIHPTADEKIHFQHTAELITQLIRGKANYSLQIYPDESHYFTSSSLKQHLYRSIINF
              730       740       750       760       770       780

              790       800   
pF1KB3 FVECFRIQDKLPTVTAKEDEEED
       ::::::::::: :::::::::::
CCDS75 FVECFRIQDKLLTVTAKEDEEED
              790       800   

>>CCDS75683.1 DPP6 gene_id:1804|Hs108|chr7                (865 aa)
 initn: 5241 init1: 5241 opt: 5243  Z-score: 6553.0  bits: 1223.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5243; 99.1% identity (99.6% similar) in 792 aa overlap (12-803:74-865)

                                  10        20        30        40 
pF1KB3                    MTTAKEPSASGKSVQQQEQELVGSNPPQRNWKGIAIALLVI
                                     .:  ..:.::::::::::::::::::::::
CCDS75 LGPRAQAAAPRERGGGGGGAGGRPRFQYQARSDGDEEDELVGSNPPQRNWKGIAIALLVI
            50        60        70        80        90       100   

              50        60        70        80        90       100 
pF1KB3 LVICSLIVTSVILLTPAEDNSLSQKKKVTVEDLFSEDFKIHDPEAKWISDTEFIYREQKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LVICSLIVTSVILLTPAEDNSLSQKKKVTVEDLFSEDFKIHDPEAKWISDTEFIYREQKG
           110       120       130       140       150       160   

             110       120       130       140       150       160 
pF1KB3 TVRLWNVETNTSTVLIEGKKIESLRAIRYEISPDREYALFSYNVEPIYQHSYTGYYVLSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TVRLWNVETNTSTVLIEGKKIESLRAIRYEISPDREYALFSYNVEPIYQHSYTGYYVLSK
           170       180       190       200       210       220   

             170       180       190       200       210       220 
pF1KB3 IPHGDPQSLDPPEVSNAKLQYAGWGPKGQQLIFIFENNIYYCAHVGKQAIRVVSTGKEGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IPHGDPQSLDPPEVSNAKLQYAGWGPKGQQLIFIFENNIYYCAHVGKQAIRVVSTGKEGV
           230       240       250       260       270       280   

             230       240       250       260       270       280 
pF1KB3 IYNGLSDWLYEEEILKTHIAHWWSPDGTRLAYAAINDSRVPIMELPTYTGSIYPTVKPYH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IYNGLSDWLYEEEILKTHIAHWWSPDGTRLAYAAINDSRVPIMELPTYTGSIYPTVKPYH
           290       300       310       320       330       340   

             290       300       310       320       330       340 
pF1KB3 YPKAGSENPSISLHVIGLNGPTHDLEMMPPDDPRMREYYITMVKWATSTKVAVTWLNRAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 YPKAGSENPSISLHVIGLNGPTHDLEMMPPDDPRMREYYITMVKWATSTKVAVTWLNRAQ
           350       360       370       380       390       400   

             350       360       370       380       390       400 
pF1KB3 NVSILTLCDATTGVCTKKHEDESEAWLHRQNEEPVFSKDGRKFFFIRAIPQGGRGKFYHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NVSILTLCDATTGVCTKKHEDESEAWLHRQNEEPVFSKDGRKFFFIRAIPQGGRGKFYHI
           410       420       430       440       450       460   

             410       420       430       440       450       460 
pF1KB3 TVSSSQPNSSNDNIQSITSGDWDVTKILAYDEKGNKIYFLSTEDLPRRRQLYSANTVGNF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TVSSSQPNSSNDNIQSITSGDWDVTKILAYDEKGNKIYFLSTEDLPRRRQLYSANTVGNF
           470       480       490       500       510       520   

             470       480       490       500       510       520 
pF1KB3 NRQCLSCDLVENCTYFSASFSHSMDFFLLKCEGPGVPMVTVHNTTDKKKMFDLETNEHVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NRQCLSCDLVENCTYFSASFSHSMDFFLLKCEGPGVPMVTVHNTTDKKKMFDLETNEHVK
           530       540       550       560       570       580   

             530       540       550       560       570       580 
pF1KB3 KAINDRQMPKVEYRDIEIDDYNLPMQILKPATFTDTTHYPLLLVVDGTPGSQSVAEKFEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KAINDRQMPKVEYRDIEIDDYNLPMQILKPATFTDTTHYPLLLVVDGTPGSQSVAEKFEV
           590       600       610       620       630       640   

             590       600       610       620       630       640 
pF1KB3 SWETVMVSSHGAVVVKCDGRGSGFQGTKLLHEVRRRLGLLEEKDQMEAVRTMLKEQYIDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SWETVMVSSHGAVVVKCDGRGSGFQGTKLLHEVRRRLGLLEEKDQMEAVRTMLKEQYIDR
           650       660       670       680       690       700   

             650       660       670       680       690       700 
pF1KB3 TRVAVFGKDYGGYLSTYILPAKGENQGQTFTCGSALSPITDFKLYASAFSERYLGLHGLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TRVAVFGKDYGGYLSTYILPAKGENQGQTFTCGSALSPITDFKLYASAFSERYLGLHGLD
           710       720       730       740       750       760   

             710       720       730       740       750       760 
pF1KB3 NRAYEMTKVAHRVSALEEQQFLIIHPTADEKIHFQHTAELITQLIRGKANYSLQIYPDES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NRAYEMTKVAHRVSALEEQQFLIIHPTADEKIHFQHTAELITQLIRGKANYSLQIYPDES
           770       780       790       800       810       820   

             770       780       790       800   
pF1KB3 HYFTSSSLKQHLYRSIINFFVECFRIQDKLPTVTAKEDEEED
       :::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS75 HYFTSSSLKQHLYRSIINFFVECFRIQDKLLTVTAKEDEEED
           830       840       850       860     

>>CCDS75682.1 DPP6 gene_id:1804|Hs108|chr7                (801 aa)
 initn: 5233 init1: 5233 opt: 5236  Z-score: 6544.8  bits: 1221.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5236; 99.2% identity (99.6% similar) in 790 aa overlap (14-803:12-801)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MTTAKEPSASGKSVQQQEQELVGSNPPQRNWKGIAIALLVILVICSLIVTSVILLTPAED
                    .: . .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75   MKEKAMIKTAKMQGNVMELVGSNPPQRNWKGIAIALLVILVICSLIVTSVILLTPAED
                 10        20        30        40        50        

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NSLSQKKKVTVEDLFSEDFKIHDPEAKWISDTEFIYREQKGTVRLWNVETNTSTVLIEGK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KIESLRAIRYEISPDREYALFSYNVEPIYQHSYTGYYVLSKIPHGDPQSLDPPEVSNAKL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QYAGWGPKGQQLIFIFENNIYYCAHVGKQAIRVVSTGKEGVIYNGLSDWLYEEEILKTHI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AHWWSPDGTRLAYAAINDSRVPIMELPTYTGSIYPTVKPYHYPKAGSENPSISLHVIGLN
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GPTHDLEMMPPDDPRMREYYITMVKWATSTKVAVTWLNRAQNVSILTLCDATTGVCTKKH
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RGSGFQGTKLLHEVRRRLGLLEEKDQMEAVRTMLKEQYIDRTRVAVFGKDYGGYLSTYIL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB3 FVECFRIQDKLPTVTAKEDEEED
       ::::::::::: :::::::::::
CCDS75 FVECFRIQDKLLTVTAKEDEEED
      780       790       800 

>>CCDS78291.1 DPP6 gene_id:1804|Hs108|chr7                (758 aa)
 initn: 4092 init1: 4092 opt: 4092  Z-score: 5113.5  bits: 957.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4928; 94.3% identity (94.3% similar) in 803 aa overlap (1-803:1-758)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MTTAKEPSASGKSVQQQEQELVGSNPPQRNWKGIAIALLVILVICSLIVTSVILLTPAED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MTTAKEPSASGKSVQQQEQELVGSNPPQRNWKGIAIALLVILVICSLIVTSVILLTPAED
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB3 NSLSQKKKVTVEDLFSEDFKIHDPEAKWISDTEFIYREQKGTVRLWNVETNTSTVLIEGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 NSLSQKKKVTVEDLFSEDFKIHDPEAKWISDTEFIYREQKGTVRLWNVETNTSTVLIEGK
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pF1KB3 KIESLRAIRYEISPDREYALFSYNVEPIYQHSYTGYYVLSKIPHGDPQSLDPPEVSNAKL
       ::::::::::::::::::::::::::::                                
CCDS78 KIESLRAIRYEISPDREYALFSYNVEPI--------------------------------
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pF1KB3 QYAGWGPKGQQLIFIFENNIYYCAHVGKQAIRVVSTGKEGVIYNGLSDWLYEEEILKTHI
                    :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 -------------FIFENNIYYCAHVGKQAIRVVSTGKEGVIYNGLSDWLYEEEILKTHI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 AHWWSPDGTRLAYAAINDSRVPIMELPTYTGSIYPTVKPYHYPKAGSENPSISLHVIGLN
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 EDESEAWLHRQNEEPVFSKDGRKFFFIRAIPQGGRGKFYHITVSSSQPNSSNDNIQSITS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GDWDVTKILAYDEKGNKIYFLSTEDLPRRRQLYSANTVGNFNRQCLSCDLVENCTYFSAS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 FSHSMDFFLLKCEGPGVPMVTVHNTTDKKKMFDLETNEHVKKAINDRQMPKVEYRDIEID
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pF1KB3 DYNLPMQILKPATFTDTTHYPLLLVVDGTPGSQSVAEKFEVSWETVMVSSHGAVVVKCDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DYNLPMQILKPATFTDTTHYPLLLVVDGTPGSQSVAEKFEVSWETVMVSSHGAVVVKCDG
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pF1KB3 RGSGFQGTKLLHEVRRRLGLLEEKDQMEAVRTMLKEQYIDRTRVAVFGKDYGGYLSTYIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 RGSGFQGTKLLHEVRRRLGLLEEKDQMEAVRTMLKEQYIDRTRVAVFGKDYGGYLSTYIL
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pF1KB3 PAKGENQGQTFTCGSALSPITDFKLYASAFSERYLGLHGLDNRAYEMTKVAHRVSALEEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PAKGENQGQTFTCGSALSPITDFKLYASAFSERYLGLHGLDNRAYEMTKVAHRVSALEEQ
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pF1KB3 QFLIIHPTADEKIHFQHTAELITQLIRGKANYSLQIYPDESHYFTSSSLKQHLYRSIINF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 QFLIIHPTADEKIHFQHTAELITQLIRGKANYSLQIYPDESHYFTSSSLKQHLYRSIINF
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pF1KB3 FVECFRIQDKLPTVTAKEDEEED
       ::::::::::: :::::::::::
CCDS78 FVECFRIQDKLLTVTAKEDEEED
         740       750        

>>CCDS54388.1 DPP10 gene_id:57628|Hs108|chr2              (800 aa)
 initn: 1986 init1: 1620 opt: 2901  Z-score: 3622.6  bits: 681.2 E(32554): 1.9e-195
Smith-Waterman score: 2901; 52.0% identity (80.3% similar) in 809 aa overlap (1-803:1-800)

                    10        20        30        40        50     
pF1KB3 MTTAKE-----PSASGKSVQQQEQELVGSNPPQRNWKGIAIALLVILVICSLIVTSVILL
       ::.::.     :.: ....:  .::: ...::::::::::::::::::.::::. :::::
CCDS54 MTAAKQEPQPTPGARASQAQPADQELGSNSPPQRNWKGIAIALLVILVVCSLITMSVILL
               10        20        30        40        50        60

          60        70        80        90       100       110     
pF1KB3 TPAEDNSLSQKKKVTVEDLFSEDFKIHDPEAKWISDTEFIYREQKGTVRLWNVETNTSTV
       :: : .. :.. ....:::: .:: .:::::.::.::. .:. ..: :   :.:::..:.
CCDS54 TPDELTN-SSETRLSLEDLFRKDFVLHDPEARWINDTDVVYKSENGHVIKLNIETNATTL
                70        80        90       100       110         

         120       130       140       150       160       170     
pF1KB3 LIEGKKIESLRAIRYEISPDREYALFSYNVEPIYQHSYTGYYVLSKIPHGDPQSLDPPEV
       :.:.  . ...: :. .::: .:.:..:.:. :...:::. ::. .:   .   :.::::
CCDS54 LLENTTFVTFKASRHSVSPDLKYVLLAYDVKQIFHYSYTASYVIYNIHTREVWELNPPEV
     120       130       140       150       160       170         

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB3 SNAKLQYAGWGPKGQQLIFIFENNIYYCAHVGKQAIRVVSTGKEGVIYNGLSDWLYEEEI
        .. ::::.:: .:::::.::::::::   . ....:..:.::: .:.::..:::::::.
CCDS54 EDSVLQYAAWGVQGQQLIYIFENNIYYQPDIKSSSLRLTSSGKEEIIFNGIADWLYEEEL
     180       190       200       210       220       230         

         240       250       260       270       280       290     
pF1KB3 LKTHIAHWWSPDGTRLAYAAINDSRVPIMELPTYTGSIYPTVKPYHYPKAGSENPSISLH
       :..:::::::::: :::.  :::: :: : .: .::..::  : : :::::. ::.:.:.
CCDS54 LHSHIAHWWSPDGERLAFLMINDSLVPTMVIPRFTGALYPKGKQYPYPKAGQVNPTIKLY
     240       250       260       270       280       290         

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pF1KB3 VIGLNGPTHDLEMMPPDDPRMREYYITMVKWATSTKVAVTWLNRAQNVSILTLCDATTGV
       :..: :::: ::.::::. . ::::::::::...::..: :::::::.::::.:..:::.
CCDS54 VVNLYGPTHTLELMPPDSFKSREYYITMVKWVSNTKTVVRWLNRAQNISILTVCETTTGA
     300       310       320       330       340       350         

         360       370       380       390       400       410     
pF1KB3 CTKKHEDESEAWLHRQNEEPVFSKDGRKFFFIRAIPQGGRGKFYHITVSSSQPNSSNDNI
       :.::.:  :..:: .::::::::.:: :::.   . :::::.:.:...   : .: . ..
CCDS54 CSKKYEMTSDTWLSQQNEEPVFSRDGSKFFMTVPVKQGGRGEFHHVAMFLIQSKSEQITV
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pF1KB3 QSITSGDWDVTKILAYDEKGNKIYFLSTEDLPRRRQLYSANTVGNFNRQCLSCDLV-ENC
       . .:::.:.: :::::::  .::::::::. :: ::::::.: : .::::.::... :.:
CCDS54 RHLTSGNWEVIKILAYDETTQKIYFLSTESSPRGRQLYSASTEGLLNRQCISCNFMKEQC
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       :::.::::   . ::: :::: ::.:..:.: .  :.: ::.:  .:.::  ... : : 
CCDS54 TYFDASFSPMNQHFLLFCEGPRVPVVSLHSTDNPAKYFILESNSMLKEAILKKKIGKPEI
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pF1KB3 RDIEIDDYNLPMQILKPATFTDTTHYPLLLVVDGTPGSQSVAEKFEVSWETVMVSSHGAV
       . ..::::.::.:.  :  : : ..: :::..:  ::.: :..::...:..:...  ...
CCDS54 KILHIDDYELPLQLSLPKDFMDRNQYALLLIMDEEPGGQLVTDKFHIDWDSVLIDMDNVI
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pF1KB3 VVKCDGRGSGFQGTKLLHEVRRRLGLLEEKDQMEAVRTMLKEQYIDRTRVAVFGKDYGGY
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CCDS54 VARFDGRGSGFQGLKILQEIHRRLGSVEVKDQITAVKFLLKLPYIDSKRLSIFGKGYGGY
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pF1KB3 LSTYILPAKGENQGQTFTCGSALSPITDFKLYASAFSERYLGLHGLDNRAYEMTKVAHRV
       ....::    ... . : :::...::::.:::::::::::::. . .. .:. ..: : :
CCDS54 IASMIL----KSDEKLFKCGSVVAPITDLKLYASAFSERYLGMPSKEESTYQAASVLHNV
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pF1KB3 SALEEQQFLIIHPTADEKIHFQHTAELITQLIRGKANYSLQIYPDESHYFTSSSLKQHLY
        .:.:...:::: ::: :.::::.:::: .::.. .::..:.::::.:  . .: : :::
CCDS54 HGLKEENILIIHGTADTKVHFQHSAELIKHLIKAGVNYTMQVYPDEGHNVSEKS-KYHLY
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pF1KB3 RSIINFFVECFRIQDKLPTVTAKEDEEED
        .:..:: .:..   .  .:  .: ::..
CCDS54 STILKFFSDCLK---EEISVLPQEPEEDE
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>>CCDS33278.1 DPP10 gene_id:57628|Hs108|chr2              (789 aa)
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CCDS33        MRKVESRGEGGREELGSNSPPQRNWKGIAIALLVILVVCSLITMSVILLTPDE
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pF1KB3 IAHWWSPDGTRLAYAAINDSRVPIMELPTYTGSIYPTVKPYHYPKAGSENPSISLHVIGL
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pF1KB3 SGDWDVTKILAYDEKGNKIYFLSTEDLPRRRQLYSANTVGNFNRQCLSCDLV-ENCTYFS
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pF1KB3 ASFSHSMDFFLLKCEGPGVPMVTVHNTTDKKKMFDLETNEHVKKAINDRQMPKVEYRDIE
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CCDS33 ASFSPMNQHFLLFCEGPRVPVVSLHSTDNPAKYFILESNSMLKEAILKKKIGKPEIKILH
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pF1KB3 IDDYNLPMQILKPATFTDTTHYPLLLVVDGTPGSQSVAEKFEVSWETVMVSSHGAVVVKC
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pF1KB3 ILPAKGENQGQTFTCGSALSPITDFKLYASAFSERYLGLHGLDNRAYEMTKVAHRVSALE
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CCDS33 IL----KSDEKLFKCGSVVAPITDLKLYASAFSERYLGMPSKEESTYQAASVLHNVHGLK
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pF1KB3 EQQFLIIHPTADEKIHFQHTAELITQLIRGKANYSLQIYPDESHYFTSSSLKQHLYRSII
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pF1KB3 NFFVECFRIQDKLPTVTAKEDEEED
       .:: .:..   .  .:  .: ::..
CCDS33 KFFSDCLK---EEISVLPQEPEEDE
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>>CCDS46400.1 DPP10 gene_id:57628|Hs108|chr2              (796 aa)
 initn: 1986 init1: 1620 opt: 2870  Z-score: 3583.8  bits: 674.0 E(32554): 2.7e-193
Smith-Waterman score: 2870; 52.5% identity (80.8% similar) in 786 aa overlap (19-803:20-796)

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pF1KB3  MTTAKEPSASGKSVQQQEQELVGSNPPQRNWKGIAIALLVILVICSLIVTSVILLTPAE
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CCDS46 MNQTASVSHHIKCQPSKTIKELGSNSPPQRNWKGIAIALLVILVVCSLITMSVILLTPDE
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pF1KB3 DNSLSQKKKVTVEDLFSEDFKIHDPEAKWISDTEFIYREQKGTVRLWNVETNTSTVLIEG
        .. :.. ....:::: .:: .:::::.::.::. .:. ..: :   :.:::..:.:.:.
CCDS46 LTN-SSETRLSLEDLFRKDFVLHDPEARWINDTDVVYKSENGHVIKLNIETNATTLLLEN
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pF1KB3 KKIESLRAIRYEISPDREYALFSYNVEPIYQHSYTGYYVLSKIPHGDPQSLDPPEVSNAK
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CCDS46 TTFVTFKASRHSVSPDLKYVLLAYDVKQIFHYSYTASYVIYNIHTREVWELNPPEVEDSV
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pF1KB3 IAHWWSPDGTRLAYAAINDSRVPIMELPTYTGSIYPTVKPYHYPKAGSENPSISLHVIGL
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CCDS46 IAHWWSPDGERLAFLMINDSLVPTMVIPRFTGALYPKGKQYPYPKAGQVNPTIKLYVVNL
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pF1KB3 NGPTHDLEMMPPDDPRMREYYITMVKWATSTKVAVTWLNRAQNVSILTLCDATTGVCTKK
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CCDS46 YGPTHTLELMPPDSFKSREYYITMVKWVSNTKTVVRWLNRAQNISILTVCETTTGACSKK
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pF1KB3 HEDESEAWLHRQNEEPVFSKDGRKFFFIRAIPQGGRGKFYHITVSSSQPNSSNDNIQSIT
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CCDS46 YEMTSDTWLSQQNEEPVFSRDGSKFFMTVPVKQGGRGEFHHVAMFLIQSKSEQITVRHLT
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pF1KB3 SGDWDVTKILAYDEKGNKIYFLSTEDLPRRRQLYSANTVGNFNRQCLSCDLV-ENCTYFS
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pF1KB3 ASFSHSMDFFLLKCEGPGVPMVTVHNTTDKKKMFDLETNEHVKKAINDRQMPKVEYRDIE
       ::::   . ::: :::: ::.:..:.: .  :.: ::.:  .:.::  ... : : . ..
CCDS46 ASFSPMNQHFLLFCEGPRVPVVSLHSTDNPAKYFILESNSMLKEAILKKKIGKPEIKILH
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pF1KB3 IDDYNLPMQILKPATFTDTTHYPLLLVVDGTPGSQSVAEKFEVSWETVMVSSHGAVVVKC
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CCDS46 IDDYELPLQLSLPKDFMDRNQYALLLIMDEEPGGQLVTDKFHIDWDSVLIDMDNVIVARF
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CCDS46 DGRGSGFQGLKILQEIHRRLGSVEVKDQITAVKFLLKLPYIDSKRLSIFGKGYGGYIASM
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pF1KB3 ILPAKGENQGQTFTCGSALSPITDFKLYASAFSERYLGLHGLDNRAYEMTKVAHRVSALE
       ::    ... . : :::...::::.:::::::::::::. . .. .:. ..: : : .:.
CCDS46 IL----KSDEKLFKCGSVVAPITDLKLYASAFSERYLGMPSKEESTYQAASVLHNVHGLK
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pF1KB3 EQQFLIIHPTADEKIHFQHTAELITQLIRGKANYSLQIYPDESHYFTSSSLKQHLYRSII
       :...:::: ::: :.::::.:::: .::.. .::..:.::::.:  . .: : ::: .:.
CCDS46 EENILIIHGTADTKVHFQHSAELIKHLIKAGVNYTMQVYPDEGHNVSEKS-KYHLYSTIL
         720       730       740       750       760        770    

      780       790       800   
pF1KB3 NFFVECFRIQDKLPTVTAKEDEEED
       .:: .:..   .  .:  .: ::..
CCDS46 KFFSDCLK---EEISVLPQEPEEDE
          780          790      

>>CCDS54389.1 DPP10 gene_id:57628|Hs108|chr2              (746 aa)
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                                     ::::::: : .. :.. ....:::: .:: 
CCDS54                              MSVILLTPDELTN-SSETRLSLEDLFRKDFV
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pF1KB3 IHDPEAKWISDTEFIYREQKGTVRLWNVETNTSTVLIEGKKIESLRAIRYEISPDREYAL
       .:::::.::.::. .:. ..: :   :.:::..:.:.:.  . ...: :. .::: .:.:
CCDS54 LHDPEARWINDTDVVYKSENGHVIKLNIETNATTLLLENTTFVTFKASRHSVSPDLKYVL
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pF1KB3 FSYNVEPIYQHSYTGYYVLSKIPHGDPQSLDPPEVSNAKLQYAGWGPKGQQLIFIFENNI
       ..:.:. :...:::. ::. .:   .   :.:::: .. ::::.:: .:::::.::::::
CCDS54 LAYDVKQIFHYSYTASYVIYNIHTREVWELNPPEVEDSVLQYAAWGVQGQQLIYIFENNI
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pF1KB3 YYCAHVGKQAIRVVSTGKEGVIYNGLSDWLYEEEILKTHIAHWWSPDGTRLAYAAINDSR
       ::   . ....:..:.::: .:.::..:::::::.:..:::::::::: :::.  :::: 
CCDS54 YYQPDIKSSSLRLTSSGKEEIIFNGIADWLYEEELLHSHIAHWWSPDGERLAFLMINDSL
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pF1KB3 VPIMELPTYTGSIYPTVKPYHYPKAGSENPSISLHVIGLNGPTHDLEMMPPDDPRMREYY
       :: : .: .::..::  : : :::::. ::.:.:.:..: :::: ::.::::. . ::::
CCDS54 VPTMVIPRFTGALYPKGKQYPYPKAGQVNPTIKLYVVNLYGPTHTLELMPPDSFKSREYY
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pF1KB3 ITMVKWATSTKVAVTWLNRAQNVSILTLCDATTGVCTKKHEDESEAWLHRQNEEPVFSKD
       ::::::...::..: :::::::.::::.:..:::.:.::.:  :..:: .::::::::.:
CCDS54 ITMVKWVSNTKTVVRWLNRAQNISILTVCETTTGACSKKYEMTSDTWLSQQNEEPVFSRD
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pF1KB3 GRKFFFIRAIPQGGRGKFYHITVSSSQPNSSNDNIQSITSGDWDVTKILAYDEKGNKIYF
       : :::.   . :::::.:.:...   : .: . ... .:::.:.: :::::::  .::::
CCDS54 GSKFFMTVPVKQGGRGEFHHVAMFLIQSKSEQITVRHLTSGNWEVIKILAYDETTQKIYF
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pF1KB3 LSTEDLPRRRQLYSANTVGNFNRQCLSCDLV-ENCTYFSASFSHSMDFFLLKCEGPGVPM
       ::::. :: ::::::.: : .::::.::... :.::::.::::   . ::: :::: ::.
CCDS54 LSTESSPRGRQLYSASTEGLLNRQCISCNFMKEQCTYFDASFSPMNQHFLLFCEGPRVPV
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pF1KB3 VTVHNTTDKKKMFDLETNEHVKKAINDRQMPKVEYRDIEIDDYNLPMQILKPATFTDTTH
       :..:.: .  :.: ::.:  .:.::  ... : : . ..::::.::.:.  :  : : ..
CCDS54 VSLHSTDNPAKYFILESNSMLKEAILKKKIGKPEIKILHIDDYELPLQLSLPKDFMDRNQ
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pF1KB3 YPLLLVVDGTPGSQSVAEKFEVSWETVMVSSHGAVVVKCDGRGSGFQGTKLLHEVRRRLG
       : :::..:  ::.: :..::...:..:...  ...:.. ::::::::: :.:.:..::::
CCDS54 YALLLIMDEEPGGQLVTDKFHIDWDSVLIDMDNVIVARFDGRGSGFQGLKILQEIHRRLG
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pF1KB3 LLEEKDQMEAVRTMLKEQYIDRTRVAVFGKDYGGYLSTYILPAKGENQGQTFTCGSALSP
        .: :::. ::. .::  :::  :...::: ::::....::    ... . : :::...:
CCDS54 SVEVKDQITAVKFLLKLPYIDSKRLSIFGKGYGGYIASMIL----KSDEKLFKCGSVVAP
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pF1KB3 ITDFKLYASAFSERYLGLHGLDNRAYEMTKVAHRVSALEEQQFLIIHPTADEKIHFQHTA
       :::.:::::::::::::. . .. .:. ..: : : .:.:...:::: ::: :.::::.:
CCDS54 ITDLKLYASAFSERYLGMPSKEESTYQAASVLHNVHGLKEENILIIHGTADTKVHFQHSA
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pF1KB3 ELITQLIRGKANYSLQIYPDESHYFTSSSLKQHLYRSIINFFVECFRIQDKLPTVTAKED
       ::: .::.. .::..:.::::.:  . .: : ::: .:..:: .:..  ... .:  .: 
CCDS54 ELIKHLIKAGVNYTMQVYPDEGHNVSEKS-KYHLYSTILKFFSDCLK--EEI-SVLPQEP
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     800   
pF1KB3 EEED
       ::..
CCDS54 EEDE
           

>>CCDS33311.1 FAP gene_id:2191|Hs108|chr2                 (760 aa)
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Smith-Waterman score: 1536; 32.2% identity (65.6% similar) in 776 aa overlap (33-789:10-760)

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                                     :.:  :.:..::.: ..  : .    .:.:
CCDS33                      MKTWVKIVFGVATSAVLALLVMCIVLRPSRV--HNSEEN
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pF1KB3 SLSQKKKVTVEDLFSEDFKIHDPEAKWISDTEFIYREQKGTVRLWNVETNTSTVLIEGKK
       ..   . .:..:...  :. .    .:::  :....   ... :.:.::. : ... .. 
CCDS33 TM---RALTLKDILNGTFSYKTFFPNWISGQEYLHQSADNNIVLYNIETGQSYTILSNRT
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pF1KB3 IESLRAIRYEISPDREYALFSYNVEPIYQHSYTGYYVLSKIPHGD-PQSLDPPEVSNAKL
       ..:. :  : .::::... .  .   ....:::. : .  . .:.  .. . :.     .
CCDS33 MKSVNASNYGLSPDRQFVYLESDYSKLWRYSYTATYYIYDLSNGEFVRGNELPR----PI
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pF1KB3 QYAGWGPKGQQLIFIFENNIYYCAHVGKQAIRVVSTGKEGVIYNGLSDWLYEEEILKTHI
       ::  :.: :..: ....::::   . :   .... .:.:. :.::. ::.::::.: :. 
CCDS33 QYLCWSPVGSKLAYVYQNNIYLKQRPGDPPFQITFNGRENKIFNGIPDWVYEEEMLATKY
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pF1KB3 AHWWSPDGTRLAYAAINDSRVPIMELPTYTGSIYPTVKPYHYPKAGSENPSISLHVIGLN
       : ::::.:  :::: .::. .:..    :    :: .    :::::..:: . . .:  .
CCDS33 ALWWSPNGKFLAYAEFNDTDIPVIAYSYYGDEQYPRTINIPYPKAGAKNPVVRIFIIDTT
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pF1KB3 GPTH--DLEMMPPDDPRMREYYITMVKWATSTKVAVTWLNRAQNVSILTLCDAT----TG
        :..    :.  :      .::.. . :.:. .: . ::.:.::::.:..::      : 
CCDS33 YPAYVGPQEVPVPAMIASSDYYFSWLTWVTDERVCLQWLKRVQNVSVLSICDFREDWQTW
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pF1KB3 VC--TKKHEDESEA-WLHRQ-NEEPVFSKDGRKFFFIRAIPQGGRGKFYHITVSSSQPNS
        :  :..: .::.. :        :::: :. ... : .  .:    . ::       ..
CCDS33 DCPKTQEHIEESRTGWAGGFFVSTPVFSYDAISYYKIFSDKDG----YKHI----HYIKD
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pF1KB3 SNDNIQSITSGDWDVTKILAYDEKGNKIYFLSTE--DLPRRRQLYSANTVGNF--NRQCL
       . .:  .:::: :.. .:.   .  ..... :.:  . : ::..:   ..:..  ...:.
CCDS33 TVENAIQITSGKWEAINIFRVTQ--DSLFYSSNEFEEYPGRRNIYRI-SIGSYPPSKKCV
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pF1KB3 SCDLV-ENCTYFSASFSHSMDFFLLKCEGPGVPMVTVHNTTDKKKMFDLETNEHVKKAIN
       .: :  : : :..::::    .. : : :::.:. :.:.    ...  :: :.....:..
CCDS33 TCHLRKERCQYYTASFSDYAKYYALVCYGPGIPISTLHDGRTDQEIKILEENKELENALK
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pF1KB3 DRQMPKVEYRDIEIDDYNLPMQILKPATFTDTTHYPLLLVVDGTPGSQSVAEKFEVSWET
       . :.:: : . .:.:. .: .... :  :  . .::::. : : : ::::   : :.: .
CCDS33 NIQLPKEEIKKLEVDEITLWYKMILPPQFDRSKKYPLLIQVYGGPCSQSVRSVFAVNWIS
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pF1KB3 VMVSSHGAVVVKCDGRGSGFQGTKLLHEVRRRLGLLEEKDQMEAVRTMLKEQYIDRTRVA
        ..:..: :..  ::::..::: :::. : :.::. : .::. ::: ...  .::. :.:
CCDS33 YLASKEGMVIALVDGRGTAFQGDKLLYAVYRKLGVYEVEDQITAVRKFIEMGFIDEKRIA
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pF1KB3 VFGKDYGGYLSTYILPAKGENQGQTFTCGSALSPITDFKLYASAFSERYLGLHGLDN--R
       ..: .::::.:.  : :.: .    : :: :..:..... :::...::..::   :.  .
CCDS33 IWGWSYGGYVSSLAL-ASGTG---LFKCGIAVAPVSSWEYYASVYTERFMGLPTKDDNLE
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pF1KB3 AYEMTKVAHRVSALEEQQFLIIHPTADEKIHFQHTAELITQLIRGKANYSLQIYPDESHY
        :. . :  :.  ... ..:.:: :::...:::..:..   :. ...... . : :..: 
CCDS33 HYKNSTVMARAEYFRNVDYLLIHGTADDNVHFQNSAQIAKALVNAQVDFQAMWYSDQNHG
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pF1KB3 FTSSSLKQHLYRSIINFFVECFRIQDKLPTVTAKEDEEED
       ... : . :::  . .:. .:: ..:              
CCDS33 LSGLSTN-HLYTHMTHFLKQCFSLSD              
         740        750       760              

>>CCDS2216.1 DPP4 gene_id:1803|Hs108|chr2                 (766 aa)
 initn: 1252 init1: 513 opt: 1535  Z-score: 1913.3  bits: 364.8 E(32554): 3e-100
Smith-Waterman score: 1535; 32.7% identity (67.1% similar) in 782 aa overlap (31-787:5-765)

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pF1KB3 MTTAKEPSASGKSVQQQEQELVGSNPPQRNWKGIAIALLVILVICSLIVTSVILLTPAED
                                     :: . ..::   .. ..:.. :.::. . :
CCDS22                           MKTPWK-VLLGLLGAAALVTIITVPVVLLNKGTD
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CCDS22 PEDNLDH--YRNSTVMSRAENFKQVEYLLIHGTADDNVHFQQSAQISKALVDVGVDFQAM
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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