seq1 = pF1KB3104.tfa, 2409 bp seq2 = pF1KB3104/gi568815591f_154205495.tfa (gi568815591f:154205495_154992477), 786983 bp >pF1KB3104 2409 >gi568815591f:154205495_154992477 (Chr7) 56-172 (240718-240834) 100% -> 173-271 (269445-269543) 100% == 567-697 (522264-522393) 96% -> 698-852 (563923-564077) 100% -> 853-950 (567351-567448) 100% -> 951-1074 (588585-588708) 100% -> 1075-1113 (590351-590389) 100% -> 1114-1221 (595861-595968) 100% -> 1222-1313 (598370-598461) 100% -> 1314-1361 (599423-599470) 100% -> 1362-1480 (601500-601618) 100% -> 1481-1528 (648286-648333) 100% -> 1529-1627 (662501-662599) 100% -> 1628-1697 (667130-667199) 100% -> 1698-1892 (670412-670606) 98% -> 1893-1947 (675394-675448) 100% -> 1948-2059 (680139-680250) 100% -> 2060-2118 (682182-682240) 100% -> 2119-2191 (683778-683850) 98% -> 2192-2265 (683963-684036) 98% -> 2266-2409 (686840-686983) 99% 0 . : . : . : . : . : 56 AGGAGCTGGTGGGGAGTAACCCTCCGCAGAGGAATTGGAAAGGAATAGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 240718 AGGAGCTGGTGGGGAGTAACCCTCCGCAGAGGAATTGGAAAGGAATAGCA 50 . : . : . : . : . : 106 ATTGCACTGCTTGTCATTCTGGTCATCTGCTCCTTGATCGTCACCTCGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 240768 ATTGCACTGCTTGTCATTCTGGTCATCTGCTCCTTGATCGTCACCTCGGT 100 . : . : . : . : . : 156 CATACTTCTGACACCAG CGGAAGATAATAGTCTGTCTCAAA |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||| 240818 CATACTTCTGACACCAGGTA...TAGCGGAAGATAATAGTCTGTCTCAAA 150 . : . : . : . : . : 197 AGAAGAAGGTCACTGTAGAAGATCTCTTCAGTGAAGACTTCAAAATTCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 269469 AGAAGAAGGTCACTGTAGAAGATCTCTTCAGTGAAGACTTCAAAATTCAT 200 . : . : . 247 GACCCCGAGGCTAAGTGGATAAGTG ||||||||||||||||||||||||| 269519 GACCCCGAGGCTAAGTGGATAAGTG 0 . : . : . : . : . : 567 CCAACAGCTGATATTTATTTTTGAAAACAATATCTACTACTGTGCACATG ||||-| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 522264 CCAA ATTAGATATTTATTTTTGAAAACAATATCTACTACTGTGCACATG 50 . : . : . : . : . : 617 TCGGGAAACAGGCCATCCGTGTGGTCTCCACTGGCAAGGAAGGTGTGATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 522313 TCGGGAAACAGGCCATCCGTGTGGTCTCCACTGGCAAGGAAGGTGTGATT 100 . : . : . : . : . : 667 TACAATGGCCTCAGTGACTGGCTGTATGAAG AGGAGATTTT |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||| 522363 TACAATGGCCTCAGTGACTGGCTGTATGAAGGTA...TAGAGGAGATTTT 150 . : . : . : . : . : 708 GAAGACACACATCGCACACTGGTGGTCTCCGGATGGCACGAGACTCGCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 563933 GAAGACACACATCGCACACTGGTGGTCTCCGGATGGCACGAGACTCGCCT 200 . : . : . : . : . : 758 ACGCCGCCATCAATGATTCCCGTGTCCCCATCATGGAGCTCCCAACTTAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 563983 ACGCCGCCATCAATGATTCCCGTGTCCCCATCATGGAGCTCCCAACTTAC 250 . : . : . : . : . : 808 ACCGGCTCCATCTACCCCACCGTGAAGCCCTACCACTATCCCAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 564033 ACCGGCTCCATCTACCCCACCGTGAAGCCCTACCACTATCCCAAGGTA.. 300 . : . : . : . : . : 853 GCTGGAAGTGAGAACCCCAGCATTTCCCTACACGTTATTGGCTTAA .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 564083 .CAGGCTGGAAGTGAGAACCCCAGCATTTCCCTACACGTTATTGGCTTAA 350 . : . : . : . : . : 899 ATGGACCCACCCATGATCTGGAGATGATGCCGCCTGATGATCCACGGATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 567397 ATGGACCCACCCATGATCTGGAGATGATGCCGCCTGATGATCCACGGATG 400 . : . : . : . : . : 949 AG GGAGTACTACATCACCATGGTGAAGTGGGCCACCAGCAC ||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 567447 AGGTT...CAGGGAGTACTACATCACCATGGTGAAGTGGGCCACCAGCAC 450 . : . : . : . : . : 990 CAAGGTCGCCGTGACCTGGCTGAACCGGGCGCAGAACGTGTCCATCCTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 588624 CAAGGTCGCCGTGACCTGGCTGAACCGGGCGCAGAACGTGTCCATCCTCA 500 . : . : . : . : . : 1040 CCCTCTGCGACGCCACCACGGGGGTCTGCACGAAG AAACAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||| 588674 CCCTCTGCGACGCCACCACGGGGGTCTGCACGAAGGTA...CAGAAACAC 550 . : . : . : . : . : 1081 GAGGATGAAAGTGAGGCCTGGCTCCACAGACAG AATGAAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||| 590357 GAGGATGAAAGTGAGGCCTGGCTCCACAGACAGGTA...CAGAATGAAGA 600 . : . : . : . : . : 1122 ACCTGTGTTCTCCAAGGATGGCCGAAAGTTTTTCTTCATCAGAGCCATCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 595869 ACCTGTGTTCTCCAAGGATGGCCGAAAGTTTTTCTTCATCAGAGCCATCC 650 . : . : . : . : . : 1172 CCCAGGGAGGACGAGGGAAATTCTATCACATCACGGTGTCCTCGTCCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 595919 CCCAGGGAGGACGAGGGAAATTCTATCACATCACGGTGTCCTCGTCCCAG 700 . : . : . : . : . : 1222 CCCAACAGCAGCAACGACAACATCCAGTCCATCACCTCCGG >>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 595969 GTA...CAGCCCAACAGCAGCAACGACAACATCCAGTCCATCACCTCCGG 750 . : . : . : . : . : 1263 GGACTGGGACGTGACCAAGATCCTAGCCTACGATGAGAAGGGGAATAAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 598411 GGACTGGGACGTGACCAAGATCCTAGCCTACGATGAGAAGGGGAATAAGA 800 . : . : . : . : . : 1313 T CTACTTCCTGAGCACGGAGGACCTGCCTCGGAGACGACAA |>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 598461 TGTG...CAGCTACTTCCTGAGCACGGAGGACCTGCCTCGGAGACGACAA 850 . : . : . : . : . : 1354 CTCTACAG TGCCAACACGGTGGGCAACTTCAACAGGCAGTG ||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||| 599463 CTCTACAGGTA...CAGTGCCAACACGGTGGGCAACTTCAACAGGCAGTG 900 . : . : . : . : . : 1395 CCTCTCCTGTGACCTGGTTGAGAACTGCACCTACTTCAGCGCTTCCTTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 601533 CCTCTCCTGTGACCTGGTTGAGAACTGCACCTACTTCAGCGCTTCCTTCA 950 . : . : . : . : . : 1445 GCCATAGCATGGACTTCTTCCTGCTCAAGTGCGAAG GTCCT ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||| 601583 GCCATAGCATGGACTTCTTCCTGCTCAAGTGCGAAGGTC...CAGGTCCT 1000 . : . : . : . : . : 1486 GGTGTTCCTATGGTGACGGTGCACAACACAACAGATAAGAAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...> 648291 GGTGTTCCTATGGTGACGGTGCACAACACAACAGATAAGAAAAGTA...C 1050 . : . : . : . : . : 1529 AAATGTTTGACCTAGAAACAAATGAACATGTCAAGAAGGCCATAAATG >>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 662499 AGAAATGTTTGACCTAGAAACAAATGAACATGTCAAGAAGGCCATAAATG 1100 . : . : . : . : . : 1577 ACCGACAGATGCCTAAAGTGGAATACAGGGACATTGAGATTGATGATTAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 662549 ACCGACAGATGCCTAAAGTGGAATACAGGGACATTGAGATTGATGATTAC 1150 . : . : . : . : . : 1627 A ACCTGCCCATGCAGATACTGAAGCCAGCAACCTTCACCGA |>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 662599 AGTA...CAGACCTGCCCATGCAGATACTGAAGCCAGCAACCTTCACCGA 1200 . : . : . : . : . : 1668 CACCACCCACTACCCTCTGCTCCTGGTGGT GGATGGCACCC ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 667170 CACCACCCACTACCCTCTGCTCCTGGTGGTGTA...CAGGGATGGCACCC 1250 . : . : . : . : . : 1709 CGGGCAGCCAGAGTGTAGCTGAGAAGTTCGAGGTGAGCTGGGAGACGGTG | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| 670423 CAGGCAGCCAGAGTGTGGCTGAGAAGTTCGAGGTGAGCTGGGAGACGGTG 1300 . : . : . : . : . : 1759 ATGGTGAGCAGCCACGGCGCGGTGGTGGTAAAGTGTGACGGCCGTGGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 670473 ATGGTGAGCAGCCACGGCGCGGTGGTGGTAAAGTGTGACGGCCGTGGCAG 1350 . : . : . : . : . : 1809 CGGCTTCCAAGGGACCAAGCTCCTGCACGAAGTGAGGCGGCGGCTGGGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 670523 CGGCTTCCAAGGGACCAAGCTCCTGCACGAAGTGAGGCGGCGGCTGGGCT 1400 . : . : . : . : . : 1859 TGCTGGAGGAGAAGGACCAGATGGAGGCCGTGCG GACGATG ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||| 670573 TGCTGGAGGAGAAGGACCAGATGGAGGCCGTGCGGTG...CAGGACGATG 1450 . : . : . : . : . : 1900 CTGAAGGAGCAGTACATTGACAGGACGCGCGTGGCCGTGTTTGGGAAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>> 675401 CTGAAGGAGCAGTACATTGACAGGACGCGCGTGGCCGTGTTTGGGAAGGT 1500 . : . : . : . : . : 1948 GATTACGGTGGCTACCTGAGCACCTACATCCTCCCAGCAAAGG >...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 675451 G...CAGGATTACGGTGGCTACCTGAGCACCTACATCCTCCCAGCAAAGG 1550 . : . : . : . : . : 1991 GAGAAAATCAAGGCCAGACATTCACCTGCGGCTCTGCTCTCTCTCCAATA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 680182 GAGAAAATCAAGGCCAGACATTCACCTGCGGCTCTGCTCTCTCTCCAATA 1600 . : . : . : . : . : 2041 ACAGACTTCAAACTCTATG CCTCTGCGTTTTCCGAGAGGTA |||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||| 680232 ACAGACTTCAAACTCTATGGTA...CAGCCTCTGCGTTTTCCGAGAGGTA 1650 . : . : . : . : . : 2082 CTTGGGCCTCCATGGACTTGACAACAGAGCATACGAG ATGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||| 682204 CTTGGGCCTCCATGGACTTGACAACAGAGCATACGAGGTG...CAGATGA 1700 . : . : . : . : . : 2123 CCAAGGTAGCCCATCGAGTCTCCGCGCTGGAAGAACAGCAGTTCCTGATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 683782 CCAAGGTAGCCCATCGAGTCTCCGCGCTGGAAGAACAGCAGTTCCTGATC 1750 . : . : . : . : . : 2173 ATTCATCCCACTGCTGATG AAAAAATTCATTTCCAGCACAC |||||||||||||| ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||| 683832 ATTCATCCCACTGCCGATGGTA...CAGAAAAAATTCATTTCCAGCACAC 1800 . : . : . : . : . : 2214 AGCAGAACTCATTACACAACTAATTAGAGGAAAGGCTAATTACAGCTTAC ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| 683985 AGCAGAACTCATTACACAACTAATTAGGGGAAAGGCTAATTACAGCTTAC 1850 . : . : . : . : . : 2264 AG ATTTACCCGGACGAAAGCCATTACTTTACCAGCTCCAGC ||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 684035 AGGTA...CAGATTTACCCGGACGAAAGCCATTACTTTACCAGCTCCAGC 1900 . : . : . : . : . : 2305 CTCAAACAGCATCTGTACCGGTCCATCATCAACTTCTTCGTGGAATGCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 686879 CTCAAACAGCATCTGTACCGGTCCATCATCAACTTCTTCGTGGAATGCTT 1950 . : . : . : . : . : 2355 CAGGATCCAGGACAAACTGCCGACAGTCACAGCGAAAGAGGACGAGGAGG |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| 686929 CAGGATCCAGGACAAACTGCTGACAGTCACAGCGAAAGAGGACGAGGAGG 2000 . 2405 AGGAC ||||| 686979 AGGAC