Result of SIM4 for pF1KB3100

seq1 = pF1KB3100.tfa, 2568 bp
seq2 = pF1KB3100/gi568815579f_41164504.tfa (gi568815579f:41164504_41406562), 242059 bp

>pF1KB3100 2568
>gi568815579f:41164504_41406562 (Chr19)

1-295  (100001-100295)   100% ->
296-418  (103720-103842)   100% ->
419-572  (107579-107732)   100% ->
573-646  (109479-109552)   100% ->
647-786  (111656-111795)   100% ->
787-886  (114574-114673)   100% ->
887-999  (116660-116772)   100% ->
1000-1266  (127742-128008)   100% ->
1267-1389  (129835-129957)   100% ->
1390-1518  (130055-130183)   100% ->
1519-1687  (137033-137201)   100% ->
1688-1972  (138162-138446)   100% ->
1973-2262  (139469-139758)   100% ->
2263-2454  (141173-141364)   99% ->
2455-2568  (141946-142059)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGTGCGCCGTCTGAAGGTGAACGAACTTCGCGAGGAGCTGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGTGCGCCGTCTGAAGGTGAACGAACTTCGCGAGGAGCTGCAGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGCGGCCTGGACACTCGAGGCCTCAAGGCCGAGCTTGCTGAGCGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGCGGCCTGGACACTCGAGGCCTCAAGGCCGAGCTTGCTGAGCGGCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGCGGCGTTGGAGGCCGAGGAGCCTGACGACGAGCGGGAGCTCGACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGCGGCGTTGGAGGCCGAGGAGCCTGACGACGAGCGGGAGCTCGACGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACGACGAACCGGGGCGACCCGGGCACATCAACGAGGAGGTCGAGACCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACGACGAACCGGGGCGACCCGGGCACATCAACGAGGAGGTCGAGACCGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGGGGCTCCGAGCTGGAGGGGACCGCGCAGCCACCGCCGCCCGGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGGGGGCTCCGAGCTGGAGGGGACCGCGCAGCCACCGCCGCCCGGGCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCCGCACGCGGAGCCCGGCGGCTACTCGGGGCCGGACGGACATT     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100251 AGCCGCACGCGGAGCCCGGCGGCTACTCGGGGCCGGACGGACATTGTG..

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    296     ATGCCATGGACAATATTACCAGGCAGAACCAATTCTACGATACCCA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 .AAGATGCCATGGACAATATTACCAGGCAGAACCAATTCTACGATACCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGTCATCAAACAAGAAAACGAGTCAGGCTACGAGAGGAGACCACTGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103766 AGTCATCAAACAAGAAAACGAGTCAGGCTACGAGAGGAGACCACTGGAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGGAGCAGCAGCAGGCCTATCGTCCAG         AAATGAAGACAGAG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 103816 TGGAGCAGCAGCAGGCCTATCGTCCAGGTA...TAGAAATGAAGACAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATGAAGCAAGGAGCACCCACCAGCTTCCTCCCGCCTGAAGCTTCTCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107593 ATGAAGCAAGGAGCACCCACCAGCTTCCTCCCGCCTGAAGCTTCTCAACT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CAAGCCAGACAGGCAGCAATTCCAGAGTCGAAAGAGGCCTTATGAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107643 CAAGCCAGACAGGCAGCAATTCCAGAGTCGAAAGAGGCCTTATGAAGAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ACCGGGGACGGGGGTACTTTGAGCACCGAGAGGATAGGAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 107693 ACCGGGGACGGGGGTACTTTGAGCACCGAGAGGATAGGAGGTG...CAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GGCCGCTCTCCTCAGCCTCCTGCTGAAGAGGATGAAGATGACTTTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109480 GGCCGCTCTCCTCAGCCTCCTGCTGAAGAGGATGAAGATGACTTTGATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TACCCTTGTTGCTATTGACACCT         ATAACTGCGACCTCCACT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 109530 TACCCTTGTTGCTATTGACACCTGTA...CAGATAACTGCGACCTCCACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TCAAGGTGGCCCGAGATCGGAGTAGTGGCTATCCGCTCACAATTGAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111674 TCAAGGTGGCCCGAGATCGGAGTAGTGGCTATCCGCTCACAATTGAGGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TTTGCATACCTGTGGTCAGGAGCCCGTGCCAGCTATGGGGTCAGAAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111724 TTTGCATACCTGTGGTCAGGAGCCCGTGCCAGCTATGGGGTCAGAAGGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CCGTGTATGCTTCGAGATGAAG         ATCAATGAGGAAATCTCCG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 111774 CCGTGTATGCTTCGAGATGAAGGTG...CAGATCAATGAGGAAATCTCCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGAAGCACCTTCCGTCTACAGAGCCTGACCCCCACGTGGTCCGTATCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114593 TGAAGCACCTTCCGTCTACAGAGCCTGACCCCCACGTGGTCCGTATCGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TGGTCCCTGGACTCCTGCAGCACCCAGCTAG         GCGAAGAGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 114643 TGGTCCCTGGACTCCTGCAGCACCCAGCTAGGTA...CAGGCGAAGAGCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TTTCTCCTATGGCTATGGAGGCACTGGGAAGAAGTCCACCAATAGCCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116670 TTTCTCCTATGGCTATGGAGGCACTGGGAAGAAGTCCACCAATAGCCGGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TTGAAAACTACGGAGACAAGTTTGCAGAGAACGATGTGATTGGCTGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116720 TTGAAAACTACGGAGACAAGTTTGCAGAGAACGATGTGATTGGCTGCTTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GCG         GATTTTGAATGTGGAAATGACGTGGAACTGTCTTTTAC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116770 GCGGTG...TAGGATTTTGAATGTGGAAATGACGTGGAACTGTCTTTTAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CAAGAATGGAAAGTGGATGGGCATTGCTTTCCGAATCCAGAAGGAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127780 CAAGAATGGAAAGTGGATGGGCATTGCTTTCCGAATCCAGAAGGAAGCCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TGGGGGGTCAGGCCCTCTATCCTCATGTCCTGGTGAAGAATTGCGCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127830 TGGGGGGTCAGGCCCTCTATCCTCATGTCCTGGTGAAGAATTGCGCAGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GAGTTCAACTTCGGACAGAGAGCAGAGCCCTACTGTTCTGTCCTCCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127880 GAGTTCAACTTCGGACAGAGAGCAGAGCCCTACTGTTCTGTCCTCCCGGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GTTTACCTTCATCCAGCACCTTCCCCTTAGTGAGCGTATCCGGGGCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127930 GTTTACCTTCATCCAGCACCTTCCCCTTAGTGAGCGTATCCGGGGCACCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TTGGACCAAAGAGCAAGGCAGAATGTGAG         ATTCTGATGATG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 127980 TTGGACCAAAGAGCAAGGCAGAATGTGAGGTG...TAGATTCTGATGATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GTGGGCCTGCCTGCTGCTGGCAAGACCACATGGGCCATCAAACATGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129847 GTGGGCCTGCCTGCTGCTGGCAAGACCACATGGGCCATCAAACATGCAGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CTCCAACCCTTCCAAGAAGTACAACATCCTGGGTACCAATGCCATCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129897 CTCCAACCCTTCCAAGAAGTACAACATCCTGGGTACCAATGCCATCATGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 ATAAGATGCGG         GTGATGGGCCTACGCCGGCAGCGGAACTAT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 129947 ATAAGATGCGGGTA...CAGGTGATGGGCCTACGCCGGCAGCGGAACTAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GCTGGCCGCTGGGATGTCCTGATCCAGCAGGCCACCCAGTGCCTCAACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130085 GCTGGCCGCTGGGATGTCCTGATCCAGCAGGCCACCCAGTGCCTCAACCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CCTCATCCAGATTGCTGCCCGCAAGAAACGCAACTATATCCTAGATCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 130135 CCTCATCCAGATTGCTGCCCGCAAGAAACGCAACTATATCCTAGATCAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1519         ACAAATGTTTATGGGTCAGCCCAGAGACGAAAAATGAGACCA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130185 TA...TAGACAAATGTTTATGGGTCAGCCCAGAGACGAAAAATGAGACCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 TTTGAAGGCTTCCAGCGCAAAGCTATTGTAATTTGTCCCACTGACGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137075 TTTGAAGGCTTCCAGCGCAAAGCTATTGTAATTTGTCCCACTGACGAGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 CCTAAAAGACCGAACAATAAAGCGAACCGACGAGGAAGGGAAGGATGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137125 CCTAAAAGACCGAACAATAAAGCGAACCGACGAGGAAGGGAAGGATGTCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 CAGATCATGCGGTCTTAGAAATGAAAG         CCAACTTCACGTTG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 137175 CAGATCATGCGGTCTTAGAAATGAAAGGTA...TAGCCAACTTCACGTTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 CCAGATGTTGGGGACTTCCTGGATGAGGTTCTGTTCATTGAGCTGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138176 CCAGATGTTGGGGACTTCCTGGATGAGGTTCTGTTCATTGAGCTGCAGCG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 GGAGGAAGCGGACAAGCTAGTGAGGCAGTACAACGAGGAAGGCCGCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138226 GGAGGAAGCGGACAAGCTAGTGAGGCAGTACAACGAGGAAGGCCGCAAGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 CTGGGCCACCCCCTGAAAAGCGCTTTGACAACCGAGGTGGTGGTGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138276 CTGGGCCACCCCCTGAAAAGCGCTTTGACAACCGAGGTGGTGGTGGCTTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 CGGGGCCGCGGGGGTGGTGGTGGCTTCCAGCGCTATGAAAACCGAGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138326 CGGGGCCGCGGGGGTGGTGGTGGCTTCCAGCGCTATGAAAACCGAGGACC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 CCCTGGAGGCAACCGTGGCGGCTTCCAGAACCGAGGGGGAGGCAGCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138376 CCCTGGAGGCAACCGTGGCGGCTTCCAGAACCGAGGGGGAGGCAGCGGTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 GAGGAGGCAACTACCGAGGAG         GTTTCAACCGCAGCGGAGGT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 138426 GAGGAGGCAACTACCGAGGAGGTG...CAGGTTTCAACCGCAGCGGAGGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 GGTGGCTATAGCCAGAACCGCTGGGGTAACAACAACCGGGATAACAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139489 GGTGGCTATAGCCAGAACCGCTGGGGTAACAACAACCGGGATAACAACAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 CTCCAACAACAGAGGCAGCTACAACCGGGCTCCCCAGCAACAGCCGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139539 CTCCAACAACAGAGGCAGCTACAACCGGGCTCCCCAGCAACAGCCGCCAC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 CACAGCAGCCTCCGCCACCACAGCCACCACCCCAGCAGCCACCGCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139589 CACAGCAGCCTCCGCCACCACAGCCACCACCCCAGCAGCCACCGCCACCA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2143 CCCAGCTACAGCCCTGCTCGGAACCCCCCAGGGGCCAGCACCTACAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139639 CCCAGCTACAGCCCTGCTCGGAACCCCCCAGGGGCCAGCACCTACAATAA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2193 GAACAGCAACATCCCTGGCTCAAGCGCCAATACCAGCACCCCCACCGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139689 GAACAGCAACATCCCTGGCTCAAGCGCCAATACCAGCACCCCCACCGTCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2243 GCAGCTACAGCCCTCCACAG         CCGAGTTACAGCCAGCCACCC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 139739 GCAGCTACAGCCCTCCACAGGTG...CAGCCGAGTTACAGCCAGCCACCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2284 TACAACCAGGGAGGTTACAGCCAGGGCTACACAGCCCCACCGCCTCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141194 TACAACCAGGGAGGTTACAGCCAGGGCTACACAGCCCCACCGCCTCCACC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2334 TCCACCACCACCTGCCTACAACTATGGGAGCTACGGCGGTTACAACCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141244 TCCACCACCACCTGCCTACAACTATGGGAGCTACGGCGGTTACAACCCGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2384 CCCCCTATACCCCACCGCCACCCCCCACCGCACAGACCTACCCTCAGCCC
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 141294 CCCCCTATACCCCACCGCCACCCCCCACTGCACAGACCTACCCTCAGCCC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2434 AGCTATAACCAGTATCAGCAG         TATGCCCAGCAGTGGAACCA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 141344 AGCTATAACCAGTATCAGCAGGTA...CAGTATGCCCAGCAGTGGAACCA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2475 GTACTATCAGAACCAGGGCCAGTGGCCGCCATACTACGGGAACTACGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141966 GTACTATCAGAACCAGGGCCAGTGGCCGCCATACTACGGGAACTACGACT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :
   2525 ACGGGAGCTACTCCGGGAACACACAGGGTGGCACAAGTACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142016 ACGGGAGCTACTCCGGGAACACACAGGGTGGCACAAGTACACAG

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