Result of FASTA (omim) for pF1KB3021
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3021, 928 aa
  1>>>pF1KB3021 928 - 928 aa - 928 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7472+/-0.000375; mu= 6.9992+/- 0.024
 mean_var=198.6145+/-40.017, 0's: 0 Z-trim(120.0): 18  B-trim: 100 in 2/59
 Lambda= 0.091006
 statistics sampled from 34727 (34745) to 34727 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.698), E-opt: 0.2 (0.407), width:  16
 Scan time: 10.960

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_000312 (OMIM: 109800,180200,182280,259500,61404 ( 928) 6084 811.9       0
XP_011533473 (OMIM: 109800,180200,182280,259500,61 ( 841) 5479 732.4 2.2e-210
XP_011527260 (OMIM: 116957) PREDICTED: retinoblast ( 733)  346 58.4 1.5e-07
XP_006723905 (OMIM: 116957) PREDICTED: retinoblast ( 896)  346 58.5 1.7e-07
XP_016883481 (OMIM: 116957) PREDICTED: retinoblast ( 964)  346 58.5 1.9e-07
XP_011527257 (OMIM: 116957) PREDICTED: retinoblast (1013)  346 58.5 1.9e-07
NP_899662 (OMIM: 116957) retinoblastoma-like prote (1014)  346 58.5 1.9e-07
NP_002886 (OMIM: 116957) retinoblastoma-like prote (1068)  346 58.5   2e-07
XP_011521555 (OMIM: 180203) PREDICTED: retinoblast ( 923)  308 53.5 5.7e-06
XP_016879002 (OMIM: 180203) PREDICTED: retinoblast ( 923)  308 53.5 5.7e-06
NP_001310540 (OMIM: 180203) retinoblastoma-like pr (1065)  308 53.6 6.4e-06
NP_001310539 (OMIM: 180203) retinoblastoma-like pr (1090)  308 53.6 6.5e-06
NP_001310538 (OMIM: 180203) retinoblastoma-like pr (1115)  308 53.6 6.6e-06
NP_005602 (OMIM: 180203) retinoblastoma-like prote (1139)  308 53.6 6.7e-06
NP_001310537 (OMIM: 180203) retinoblastoma-like pr (1139)  308 53.6 6.7e-06
NP_001310211 (OMIM: 116957) retinoblastoma-like pr ( 641)  253 46.2 0.00063
NP_001310210 (OMIM: 116957) retinoblastoma-like pr ( 641)  253 46.2 0.00063


>>NP_000312 (OMIM: 109800,180200,182280,259500,614041) r  (928 aa)
 initn: 6084 init1: 6084 opt: 6084  Z-score: 4326.6  bits: 811.9 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 6084; 99.9% identity (99.9% similar) in 928 aa overlap (1-928:1-928)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MPPKTPRKTAATAAAAAAEPPAPPPPPPPEEDPEQDSGPEDLPLVRLEFEETEEPDFTAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MPPKTPRKTAATAAAAAAEPPAPPPPPPPEEDPEQDSGPEDLPLVRLEFEETEEPDFTAL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 CQKLKIPDHVRERAWLTWEKVSSVDEVLGGYIQKKKELWGICIFIAAVDLDEMSFTFTEL
       ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 CQKLKIPDHVRERAWLTWEKVSSVDGVLGGYIQKKKELWGICIFIAAVDLDEMSFTFTEL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 QKNIEISVHKFFNLLKEIDTSTKVDNAMSRLLKKYDVLFALFSKLERTCELIYLTQPSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QKNIEISVHKFFNLLKEIDTSTKVDNAMSRLLKKYDVLFALFSKLERTCELIYLTQPSSS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 ISTEINSALVLKVSWITFLLAKGEVLQMEDDLVISFQLMLCVLDYFIKLSPPMLLKEPYK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ISTEINSALVLKVSWITFLLAKGEVLQMEDDLVISFQLMLCVLDYFIKLSPPMLLKEPYK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 TAVIPINGSPRTPRRGQNRSARIAKQLENDTRIIEVLCKEHECNIDEVKNVYFKNFIPFM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TAVIPINGSPRTPRRGQNRSARIAKQLENDTRIIEVLCKEHECNIDEVKNVYFKNFIPFM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 NSLGLVTSNGLPEVENLSKRYEEIYLKNKDLDARLFLDHDKTLQTDSIDSFETQRTPRKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NSLGLVTSNGLPEVENLSKRYEEIYLKNKDLDARLFLDHDKTLQTDSIDSFETQRTPRKS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 NLDEEVNVIPPHTPVRTVMNTIQQLMMILNSASDQPSENLISYFNNCTVNPKESILKRVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NLDEEVNVIPPHTPVRTVMNTIQQLMMILNSASDQPSENLISYFNNCTVNPKESILKRVK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 DIGYIFKEKFAKAVGQGCVEIGSQRYKLGVRLYYRVMESMLKSEEERLSIQNFSKLLNDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DIGYIFKEKFAKAVGQGCVEIGSQRYKLGVRLYYRVMESMLKSEEERLSIQNFSKLLNDN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 IFHMSLLACALEVVMATYSRSTSQNLDSGTDLSFPWILNVLNLKAFDFYKVIESFIKAEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IFHMSLLACALEVVMATYSRSTSQNLDSGTDLSFPWILNVLNLKAFDFYKVIESFIKAEG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 NLTREMIKHLERCEHRIMESLAWLSDSPLFDLIKQSKDREGPTDHLESACPLNLPLQNNH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NLTREMIKHLERCEHRIMESLAWLSDSPLFDLIKQSKDREGPTDHLESACPLNLPLQNNH
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 TAADMYLSPVRSPKKKGSTTRVNSTANAETQATSAFQTQKPLKSTSLSLFYKKVYRLAYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TAADMYLSPVRSPKKKGSTTRVNSTANAETQATSAFQTQKPLKSTSLSLFYKKVYRLAYL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 RLNTLCERLLSEHPELEHIIWTLFQHTLQNEYELMRDRHLDQIMMCSMYGICKVKNIDLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RLNTLCERLLSEHPELEHIIWTLFQHTLQNEYELMRDRHLDQIMMCSMYGICKVKNIDLK
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 FKIIVTAYKDLPHAVQETFKRVLIKEEEYDSIIVFYNSVFMQRLKTNILQYASTRPPTLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FKIIVTAYKDLPHAVQETFKRVLIKEEEYDSIIVFYNSVFMQRLKTNILQYASTRPPTLS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB3 PIPHIPRSPYKFPSSPLRIPGGNIYISPLKSPYKISEGLPTPTKMTPRSRILVSIGESFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PIPHIPRSPYKFPSSPLRIPGGNIYISPLKSPYKISEGLPTPTKMTPRSRILVSIGESFG
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB3 TSEKFQKINQMVCNSDRVLKRSAEGSNPPKPLKKLRFDIEGSDEADGSKHLPGESKFQQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TSEKFQKINQMVCNSDRVLKRSAEGSNPPKPLKKLRFDIEGSDEADGSKHLPGESKFQQK
              850       860       870       880       890       900

              910       920        
pF1KB3 LAEMTSTRTRMQKQKMNDSMDTSNKEEK
       ::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LAEMTSTRTRMQKQKMNDSMDTSNKEEK
              910       920        

>>XP_011533473 (OMIM: 109800,180200,182280,259500,614041  (841 aa)
 initn: 5479 init1: 5479 opt: 5479  Z-score: 3898.0  bits: 732.4 E(85289): 2.2e-210
Smith-Waterman score: 5479; 99.9% identity (100.0% similar) in 841 aa overlap (88-928:1-841)

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB3 TALCQKLKIPDHVRERAWLTWEKVSSVDEVLGGYIQKKKELWGICIFIAAVDLDEMSFTF
                                     .:::::::::::::::::::::::::::::
XP_011                               MGGYIQKKKELWGICIFIAAVDLDEMSFTF
                                             10        20        30

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB3 TELQKNIEISVHKFFNLLKEIDTSTKVDNAMSRLLKKYDVLFALFSKLERTCELIYLTQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TELQKNIEISVHKFFNLLKEIDTSTKVDNAMSRLLKKYDVLFALFSKLERTCELIYLTQP
               40        50        60        70        80        90

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB3 SSSISTEINSALVLKVSWITFLLAKGEVLQMEDDLVISFQLMLCVLDYFIKLSPPMLLKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSSISTEINSALVLKVSWITFLLAKGEVLQMEDDLVISFQLMLCVLDYFIKLSPPMLLKE
              100       110       120       130       140       150

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB3 PYKTAVIPINGSPRTPRRGQNRSARIAKQLENDTRIIEVLCKEHECNIDEVKNVYFKNFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PYKTAVIPINGSPRTPRRGQNRSARIAKQLENDTRIIEVLCKEHECNIDEVKNVYFKNFI
              160       170       180       190       200       210

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB3 PFMNSLGLVTSNGLPEVENLSKRYEEIYLKNKDLDARLFLDHDKTLQTDSIDSFETQRTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PFMNSLGLVTSNGLPEVENLSKRYEEIYLKNKDLDARLFLDHDKTLQTDSIDSFETQRTP
              220       230       240       250       260       270

       360       370       380       390       400       410       
pF1KB3 RKSNLDEEVNVIPPHTPVRTVMNTIQQLMMILNSASDQPSENLISYFNNCTVNPKESILK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RKSNLDEEVNVIPPHTPVRTVMNTIQQLMMILNSASDQPSENLISYFNNCTVNPKESILK
              280       290       300       310       320       330

       420       430       440       450       460       470       
pF1KB3 RVKDIGYIFKEKFAKAVGQGCVEIGSQRYKLGVRLYYRVMESMLKSEEERLSIQNFSKLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RVKDIGYIFKEKFAKAVGQGCVEIGSQRYKLGVRLYYRVMESMLKSEEERLSIQNFSKLL
              340       350       360       370       380       390

       480       490       500       510       520       530       
pF1KB3 NDNIFHMSLLACALEVVMATYSRSTSQNLDSGTDLSFPWILNVLNLKAFDFYKVIESFIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NDNIFHMSLLACALEVVMATYSRSTSQNLDSGTDLSFPWILNVLNLKAFDFYKVIESFIK
              400       410       420       430       440       450

       540       550       560       570       580       590       
pF1KB3 AEGNLTREMIKHLERCEHRIMESLAWLSDSPLFDLIKQSKDREGPTDHLESACPLNLPLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AEGNLTREMIKHLERCEHRIMESLAWLSDSPLFDLIKQSKDREGPTDHLESACPLNLPLQ
              460       470       480       490       500       510

       600       610       620       630       640       650       
pF1KB3 NNHTAADMYLSPVRSPKKKGSTTRVNSTANAETQATSAFQTQKPLKSTSLSLFYKKVYRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NNHTAADMYLSPVRSPKKKGSTTRVNSTANAETQATSAFQTQKPLKSTSLSLFYKKVYRL
              520       530       540       550       560       570

       660       670       680       690       700       710       
pF1KB3 AYLRLNTLCERLLSEHPELEHIIWTLFQHTLQNEYELMRDRHLDQIMMCSMYGICKVKNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AYLRLNTLCERLLSEHPELEHIIWTLFQHTLQNEYELMRDRHLDQIMMCSMYGICKVKNI
              580       590       600       610       620       630

       720       730       740       750       760       770       
pF1KB3 DLKFKIIVTAYKDLPHAVQETFKRVLIKEEEYDSIIVFYNSVFMQRLKTNILQYASTRPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DLKFKIIVTAYKDLPHAVQETFKRVLIKEEEYDSIIVFYNSVFMQRLKTNILQYASTRPP
              640       650       660       670       680       690

       780       790       800       810       820       830       
pF1KB3 TLSPIPHIPRSPYKFPSSPLRIPGGNIYISPLKSPYKISEGLPTPTKMTPRSRILVSIGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TLSPIPHIPRSPYKFPSSPLRIPGGNIYISPLKSPYKISEGLPTPTKMTPRSRILVSIGE
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pF1KB3 SFGTSEKFQKINQMVCNSDRVLKRSAEGSNPPKPLKKLRFDIEGSDEADGSKHLPGESKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SFGTSEKFQKINQMVCNSDRVLKRSAEGSNPPKPLKKLRFDIEGSDEADGSKHLPGESKF
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pF1KB3 QQKLAEMTSTRTRMQKQKMNDSMDTSNKEEK
       :::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QQKLAEMTSTRTRMQKQKMNDSMDTSNKEEK
              820       830       840 

>>XP_011527260 (OMIM: 116957) PREDICTED: retinoblastoma-  (733 aa)
 initn: 664 init1: 235 opt: 346  Z-score: 256.6  bits: 58.4 E(85289): 1.5e-07
Smith-Waterman score: 644; 27.1% identity (56.7% similar) in 630 aa overlap (59-616:23-623)

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pF1KB3 PEEDPEQDSGPEDLPLVRLEFEETEEPDFTALCQKLKIPDHVRERAWLTWEKVSSVDEVL
                                     ::::.:.. .    .:      ...   . 
XP_011         MFEDKPHAEGAAVVAAAGEALQALCQELNLDEGSAAEA------LDDFTAIR
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pF1KB3 GGY-IQKKKELWGIC-IFIAAVD----------LDEMSFTFTELQKNIEISVHKFFNLLK
       :.: .. .   :  : ...:             ..    ..:.. .. ..:. .::. .:
XP_011 GNYSLEGEVTHWLACSLYVACRKSIIPTVGKGIMEGNCVSLTRILRSAKLSLIQFFSKMK
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pF1KB3 E-IDTST---KVDNAMSRLLKKYDVLFALFSKLERTCELIYLTQ-------PSSSISTEI
       . .: :.   .  . . :: ....:  ..:.: :     :. .        : :  . .:
XP_011 KWMDMSNLPQEFRERIERLERNFEVSTVIFKKYEPIFLDIFQNPYEEPPKLPRSRKQRRI
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pF1KB3 NSAL--VLKVSWITFLLAKGEVLQMEDDLVISFQLMLCVLDYFIKLSPPMLLKEPYKTAV
         ..  ...  :  :. .::.  .. :::: :..:.:: :: ..      ..    .  .
XP_011 PCSVKDLFNFCWTLFVYTKGNFRMIGDDLVNSYHLLLCCLDLIFA---NAIMCPNRQDLL
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pF1KB3 IP-INGSPRTPRRGQNRSARIAKQLENDTRIIEVLCKEHECNIDEVKNVYFKNFIPFMNS
        : ..: :     .. ..: .. . :.   :: :::. :.  . :.:..  . : :....
XP_011 NPSFKGLP-----SDFHTADFTAS-EEPPCIIAVLCELHDGLLVEAKGIKEHYFKPYISK
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pF1KB3 L-------G---LVTSNGLPEVENLSKRYEEIYLKNKDLDARLFLDHDKTLQTDSIDSFE
       :       :   :  :.   . . ..:.:::  :   :.: :.::  :   .  .  .: 
XP_011 LFDRKILKGECLLDLSSFTDNSKAVNKEYEEYVLTVGDFDERIFLGADAEEEIGTPRKF-
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pF1KB3 TQRTPRKSNLDEEVNV---IPPH--------------------------TPVRTVMNTIQ
       :. ::  ..:  ..::   .  :                          ::: .. ....
XP_011 TRDTPL-GKLTAQANVEYNLQQHFEKKRSFAPSTPLTGRRYLREKEAVITPVASATQSVS
        340        350       360       370       380       390     

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pF1KB3 QLMMILNSASDQPSENLISYFNNCTVNPKESILKRVKDIGYIFKEKFAKAVGQ--GC-VE
       .:. :. . .. ::..::. :..:. :: :.:.: .: ::  : ....... .  :  ..
XP_011 RLQSIVAGLKNAPSDQLINIFESCVRNPVENIMKILKGIGETFCQHYTQSTDEQPGSHID
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pF1KB3 IGSQRYKLGVRLYYRVMESMLKSEEERLSIQNFSKLLNDNIFHMSLLACALEVVMATYSR
       .. .: ::.  :::...:... .: .::  ...: ::...::: ::.:: ::.:. .:: 
XP_011 FAVNRLKLAEILYYKILETVMVQETRRLHGMDMSVLLEQDIFHRSLMACCLEIVLFAYS-
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pF1KB3 STSQNLDSGTDLSFPWILNVLNLKAFDFYKVIESFIKAEGNLTREMIKHLERCEHRIMES
                .  .::::..::::. : ::::::  :..: .:.:.:.:::.  :..:.::
XP_011 ---------SPRTFPWIIEVLNLQPFYFYKVIEVVIRSEEGLSRDMVKHLNSIEEQILES
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pF1KB3 LAWLSDSPLFDLIKQSKDREGPTDHLESACPLNLPLQNNHTAAD----MYLSPVRSPKKK
       :::  :: :.. .. : ..  :: . :   : :.   :. ..      : .::.  :. :
XP_011 LAWSHDSALWEALQVSANKV-PTCE-EVIFPNNFETGNGGNVQGHLPLMPMSPLMHPRVK
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pF1KB3 GSTTRVNSTANAETQATSAFQTQKPLKSTSLSLFYKKVYRLAYLRLNTLCERLLSEHPEL
                                                                   
XP_011 EVRTDSGSLRRDMQPLSPISVHERYSSPTAGSAKRRLFGEDPPKEMLMDKIITEGTKLKI
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>>XP_006723905 (OMIM: 116957) PREDICTED: retinoblastoma-  (896 aa)
 initn: 905 init1: 237 opt: 346  Z-score: 255.4  bits: 58.5 E(85289): 1.7e-07
Smith-Waterman score: 624; 27.2% identity (51.8% similar) in 736 aa overlap (201-757:12-723)

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pF1KB3 LIYLTQPSSSISTEINSALVLKVSWITFLLAKGEVLQMEDDLVISFQLMLCVLDYFIKLS
                                     ..:.  .. :::: :..:.:: :: ..  .
XP_006                    MKNHQSYHEAGSRGNFRMIGDDLVNSYHLLLCCLDLIFANA
                                  10        20        30        40 

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pF1KB3 PPMLLKEPYKTAVIP-INGSPRTPRRGQNRSARIAKQLENDTRIIEVLCKEHECNIDEVK
          ..    .  . : ..: : .  .  . .:      :.   :: :::. :.  . :.:
XP_006 ---IMCPNRQDLLNPSFKGLP-SDFHTADFTAS-----EEPPCIIAVLCELHDGLLVEAK
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pF1KB3 NVYFKNFIPFMNSL-------G---LVTSNGLPEVENLSKRYEEIYLKNKDLDARLFLDH
       ..  . : :....:       :   :  :.   . . ..:.:::  :   :.: :.::  
XP_006 GIKEHYFKPYISKLFDRKILKGECLLDLSSFTDNSKAVNKEYEEYVLTVGDFDERIFLGA
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pF1KB3 DKTLQTDSIDSFETQRTP-----RKSNLD-------EEVNVIPPHTP-------------
       :   .  .  .: :. ::      ..:..       :.   . : ::             
XP_006 DAEEEIGTPRKF-TRDTPLGKLTAQANVEYNLQQHFEKKRSFAPSTPLTGRRYLREKEAV
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pF1KB3 ---VRTVMNTIQQLMMILNSASDQPSENLISYFNNCTVNPKESILKRVKDIGYIFKEKFA
          : .. .....:. :. . .. ::..::. :..:. :: :.:.: .: ::  : ....
XP_006 ITPVASATQSVSRLQSIVAGLKNAPSDQLINIFESCVRNPVENIMKILKGIGETFCQHYT
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pF1KB3 KAVGQ--GC-VEIGSQRYKLGVRLYYRVMESMLKSEEERLSIQNFSKLLNDNIFHMSLLA
       ... .  :  .... .: ::.  :::...:... .: .::  ...: ::...::: ::.:
XP_006 QSTDEQPGSHIDFAVNRLKLAEILYYKILETVMVQETRRLHGMDMSVLLEQDIFHRSLMA
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pF1KB3 CALEVVMATYSRSTSQNLDSGTDLSFPWILNVLNLKAFDFYKVIESFIKAEGNLTREMIK
       : ::.:. .::          .  .::::..::::. : ::::::  :..: .:.:.:.:
XP_006 CCLEIVLFAYS----------SPRTFPWIIEVLNLQPFYFYKVIEVVIRSEEGLSRDMVK
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pF1KB3 HLERCEHRIMESLAWLSDSPLFDLIKQSKDREGPT-------DHLESACPLN----LPLQ
       ::.  :..:.:::::  :: :.. .. : ..  ::       ...:..   :    :::.
XP_006 HLNSIEEQILESLAWSHDSALWEALQVSANKV-PTCEEVIFPNNFETGNGGNVQGHLPLM
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pF1KB3 ----------------NNHTAADMY-LSPVR------SP-----KKK-------------
                       ..    ::  :::.       ::     :..             
XP_006 PMSPLMHPRVKEVRTDSGSLRRDMQPLSPISVHERYSSPTAGSAKRRLFGEDPPKEMLMD
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pF1KB3 -----GSTTRV--NSTANAE-----------TQAT-------------------------
            :.  ..  .:. .::           :.::                         
XP_006 KIITEGTKLKIAPSSSITAENVSILPGQTLLTMATAPVTGTTGHKVTIPLHGVANDAGEI
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                                                     640       650 
pF1KB3 -----------------------------SAFQTQ-------------KPLKSTSLSLFY
                                    :  ::.             .: .. ::.:::
XP_006 TLIPLSMNTNQESKVKSPVSLTAHSLIGASPKQTNLTKAQEVHSTGINRPKRTGSLALFY
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pF1KB3 KKVYRLAYLRLNTLCERLLSEHPELEHIIWTLFQHTLQNEYELMRDRHLDQIMMCSMYGI
       .:::.:: .::  :: .:   . ::.. ::: :. :: .  .::.::::::...:..: .
XP_006 RKVYHLASVRLRDLCLKLDVSN-ELRRKIWTCFEFTLVHCPDLMKDRHLDQLLLCAFYIM
              630       640        650       660       670         

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pF1KB3 CKVKNIDLKFKIIVTAYKDLPHAVQETFKRVLIKEEEYDSIIVFYNSVFMQRLKTNILQY
        :: . .  :. :. .:.. :.: ..... ::.:    .  .: ::              
XP_006 AKVTKEERTFQEIMKSYRNQPQANSHVYRSVLLKSIPRE--VVAYNKNINDDFEMIDCDL
     680       690       700       710         720       730       

             780       790       800       810       820       830 
pF1KB3 ASTRPPTLSPIPHIPRSPYKFPSSPLRIPGGNIYISPLKSPYKISEGLPTPTKMTPRSRI
                                                                   
XP_006 EDATKTPDCSSGPVKEERGDLIKFYNTIYVGRVKSFALKYDLANQDHMMDAPPLSPFPHI
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>>XP_016883481 (OMIM: 116957) PREDICTED: retinoblastoma-  (964 aa)
 initn: 935 init1: 237 opt: 346  Z-score: 254.9  bits: 58.5 E(85289): 1.9e-07
Smith-Waterman score: 655; 26.7% identity (51.3% similar) in 799 aa overlap (148-757:18-791)

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pF1KB3 TELQKNIEISVHKFFNLLKEIDTSTKVDNAMSRLLKKYDVLFALFSKLERTCELIYLTQ-
                                     . :: ....:  ..:.: :     :. .  
XP_016              MKKWMDMSNLPQEFRERIERLERNFEVSTVIFKKYEPIFLDIFQNPY
                            10        20        30        40       

              180         190       200       210       220        
pF1KB3 ------PSSSISTEINSAL--VLKVSWITFLLAKGEVLQMEDDLVISFQLMLCVLDYFIK
             : :  . .:  ..  ...  :  :. .::.  .. :::: :..:.:: :: .. 
XP_016 EEPPKLPRSRKQRRIPCSVKDLFNFCWTLFVYTKGNFRMIGDDLVNSYHLLLCCLDLIFA
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            ..    .  . : ..: :   . ..  ..      :.   :: :::. :.  . :
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pF1KB3 VKNVYFKNFIPFMNSL-------G---LVTSNGLPEVENLSKRYEEIYLKNKDLDARLFL
       .:..  . : :....:       :   :  :.   . . ..:.:::  :   :.: :.::
XP_016 AKGIKEHYFKPYISKLFDRKILKGECLLDLSSFTDNSKAVNKEYEEYVLTVGDFDERIFL
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           ::: .. .....:. :. . .. ::..::. :..:. :: :.:.: .: ::  : .
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       ...... .  :  .... .: ::.  :::...:... .: .::  ...: ::...::: :
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       :.:: ::.:. .::          .  .::::..::::. : ::::::  :..: .:.:.
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       :.:::.  :..:.:::::  :: :.. .. : ..  ::       ...:..   :    :
XP_016 MVKHLNSIEEQILESLAWSHDSALWEALQVSANKV-PTCEEVIFPNNFETGNGGNVQGHL
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pF1KB3 LFYKKVYRLAYLRLNTLCERLLSEHPELEHIIWTLFQHTLQNEYELMRDRHLDQIMMCSM
       :::.:::.:: .::  :: .: .   ::.. ::: :. :: .  .::.::::::...:..
XP_016 LFYRKVYHLASVRLRDLCLKL-DVSNELRRKIWTCFEFTLVHCPDLMKDRHLDQLLLCAF
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pF1KB3 YGICKVKNIDLKFKIIVTAYKDLPHAVQETFKRVLIKEEEYDSIIVFYNSVFMQRLKTNI
       : . :: . .  :. :. .:.. :.: ..... ::.:    .  .: ::           
XP_016 YIMAKVTKEERTFQEIMKSYRNQPQANSHVYRSVLLKSIPRE--VVAYNKNINDDFEMID
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XP_016 CDLEDATKTPDCSSGPVKEERGDLIKFYNTIYVGRVKSFALKYDLANQDHMMDAPPLSPF
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       :.: .. .   :  : ...:             ..    ..:.. .. ..:. .::. .:
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pF1KB3 E-IDTST---KVDNAMSRLLKKYDVLFALFSKLERTCELIYLTQ-------PSSSISTEI
       . .: :.   .  . . :: ....:  ..:.: :     :. .        : :  . .:
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        : ..: : .  .  . .:      :.   :: :::. :.  . :.:..  . : :....
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       :       :   :  :.   . . ..:.:::  :   :.: :.::  :   .  .  .: 
XP_011 LFDRKILKGECLLDLSSFTDNSKAVNKEYEEYVLTVGDFDERIFLGADAEEEIGTPRKF-
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       :. ::  ..:  ..::   .  :                          ::: .. ....
XP_011 TRDTPL-GKLTAQANVEYNLQQHFEKKRSFAPSTPLTGRRYLREKEAVITPVASATQSVS
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       .:. :. . .. ::..::. :..:. :: :.:.: .: ::  : ....... .  :  ..
XP_011 RLQSIVAGLKNAPSDQLINIFESCVRNPVENIMKILKGIGETFCQHYTQSTDEQPGSHID
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pF1KB3 IGSQRYKLGVRLYYRVMESMLKSEEERLSIQNFSKLLNDNIFHMSLLACALEVVMATYSR
       .. .: ::.  :::...:... .: .::  ...: ::...::: ::.:: ::.:. .:: 
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pF1KB3 STSQNLDSGTDLSFPWILNVLNLKAFDFYKVIESFIKAEGNLTREMIKHLERCEHRIMES
                .  .::::..::::. : ::::::  :..: .:.:.:.:::.  :..:.::
XP_011 ---------SPRTFPWIIEVLNLQPFYFYKVIEVVIRSEEGLSRDMVKHLNSIEEQILES
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       :::  :: :.. .. : ..  ::       ...:..   :    :::.            
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XP_011 VRTDSGSLRRDMQPLSPISVHERYSSPTAGSAKRRLFGEDPPKEMLMDKIITEGTKLKIA
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pF1KB3 -NSTANAE-----------TQAT-------------------------------------
        .:. .::           :.::                                     
XP_011 PSSSITAENVSILPGQTLLTMATAPVTGTTGHKVTIPLHGVANDAGEITLIPLSMNTNQE
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pF1KB3 -----------------SAFQTQ-------------KPLKSTSLSLFYKKVYRLAYLRLN
                        :  ::.             .: .. ::.:::.:::.:: .:: 
XP_011 SKVKSPVSLTAHSLIGASPKQTNLTKAQEVHSTGINRPKRTGSLALFYRKVYHLASVRLR
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pF1KB3 TLCERLLSEHPELEHIIWTLFQHTLQNEYELMRDRHLDQIMMCSMYGICKVKNIDLKFKI
        :: .: .   ::.. ::: :. :: .  .::.::::::...:..: . :: . .  :. 
XP_011 DLCLKL-DVSNELRRKIWTCFEFTLVHCPDLMKDRHLDQLLLCAFYIMAKVTKEERTFQE
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pF1KB3 IVTAYKDLPHAVQETFKRVLIKEEEYDSIIVFYNSVFMQRLKTNILQYASTRPPTLSPIP
       :. .:.. :.: ..... ::.:    .  .: ::                          
XP_011 IMKSYRNQPQANSHVYRSVLLKSIPRE--VVAYNKNINDDFEMIDCDLEDATKTPDCSSG
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pF1KB3 HIPRSPYKFPSSPLRIPGGNIYISPLKSPYKISEGLPTPTKMTPRSRILVSIGESFGTSE
                                                                   
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>>NP_899662 (OMIM: 116957) retinoblastoma-like protein 1  (1014 aa)
 initn: 935 init1: 237 opt: 346  Z-score: 254.6  bits: 58.5 E(85289): 1.9e-07
Smith-Waterman score: 682; 25.7% identity (51.1% similar) in 904 aa overlap (59-757:23-895)

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pF1KB3 PEEDPEQDSGPEDLPLVRLEFEETEEPDFTALCQKLKIPDHVRERAWLTWEKVSSVDEVL
                                     ::::.:.. .          : ...   . 
NP_899         MFEDKPHAEGAAVVAAAGEALQALCQELNLDEGSAA------EALDDFTAIR
                       10        20        30              40      

       90        100                  110       120       130      
pF1KB3 GGY-IQKKKELWGIC-IFIAAVD----------LDEMSFTFTELQKNIEISVHKFFNLLK
       :.: .. .   :  : ...:             ..    ..:.. .. ..:. .::. .:
NP_899 GNYSLEGEVTHWLACSLYVACRKSIIPTVGKGIMEGNCVSLTRILRSAKLSLIQFFSKMK
         50        60        70        80        90       100      

         140          150       160       170              180     
pF1KB3 E-IDTST---KVDNAMSRLLKKYDVLFALFSKLERTCELIYLTQ-------PSSSISTEI
       . .: :.   .  . . :: ....:  ..:.: :     :. .        : :  . .:
NP_899 KWMDMSNLPQEFRERIERLERNFEVSTVIFKKYEPIFLDIFQNPYEEPPKLPRSRKQRRI
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           190       200       210       220       230       240   
pF1KB3 NSAL--VLKVSWITFLLAKGEVLQMEDDLVISFQLMLCVLDYFIKLSPPMLLKEPYKTAV
         ..  ...  :  :. .::.  .. :::: :..:.:: :: ..      ..    .  .
NP_899 PCSVKDLFNFCWTLFVYTKGNFRMIGDDLVNSYHLLLCCLDLIFA---NAIMCPNRQDLL
        170       180       190       200       210          220   

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pF1KB3 IP-INGSPRTPRRGQNRSARIAKQLENDTRIIEVLCKEHECNIDEVKNVYFKNFIPFMNS
        : ..: : .  .  . .:      :.   :: :::. :.  . :.:..  . : :....
NP_899 NPSFKGLP-SDFHTADFTAS-----EEPPCIIAVLCELHDGLLVEAKGIKEHYFKPYISK
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pF1KB3 L-------G---LVTSNGLPEVENLSKRYEEIYLKNKDLDARLFLDHDKTLQTDSIDSFE
       :       :   :  :.   . . ..:.:::  :   :.: :.::  :   .  .  .: 
NP_899 LFDRKILKGECLLDLSSFTDNSKAVNKEYEEYVLTVGDFDERIFLGADAEEEIGTPRKF-
       280       290       300       310       320       330       

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pF1KB3 TQRTPRKSNLDEEVNV---IPPH--------------------------TPVRTVMNTIQ
       :. ::  ..:  ..::   .  :                          ::: .. ....
NP_899 TRDTPL-GKLTAQANVEYNLQQHFEKKRSFAPSTPLTGRRYLREKEAVITPVASATQSVS
        340        350       360       370       380       390     

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pF1KB3 QLMMILNSASDQPSENLISYFNNCTVNPKESILKRVKDIGYIFKEKFAKAVGQ--GC-VE
       .:. :. . .. ::..::. :..:. :: :.:.: .: ::  : ....... .  :  ..
NP_899 RLQSIVAGLKNAPSDQLINIFESCVRNPVENIMKILKGIGETFCQHYTQSTDEQPGSHID
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pF1KB3 IGSQRYKLGVRLYYRVMESMLKSEEERLSIQNFSKLLNDNIFHMSLLACALEVVMATYSR
       .. .: ::.  :::...:... .: .::  ...: ::...::: ::.:: ::.:. .:: 
NP_899 FAVNRLKLAEILYYKILETVMVQETRRLHGMDMSVLLEQDIFHRSLMACCLEIVLFAYS-
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pF1KB3 STSQNLDSGTDLSFPWILNVLNLKAFDFYKVIESFIKAEGNLTREMIKHLERCEHRIMES
                .  .::::..::::. : ::::::  :..: .:.:.:.:::.  :..:.::
NP_899 ---------SPRTFPWIIEVLNLQPFYFYKVIEVVIRSEEGLSRDMVKHLNSIEEQILES
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       :::  :: :.. .. : ..  ::       ...:..   :    :::.            
NP_899 LAWSHDSALWEALQVSANKV-PTCEEVIFPNNFETGNGGNVQGHLPLMPMSPLMHPRVKE
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pF1KB3 ----NNHTAADMY-LSPVR------SP-----KKK------------------GSTTRV-
           ..    ::  :::.       ::     :..                  :.  .. 
NP_899 VRTDSGSLRRDMQPLSPISVHERYSSPTAGSAKRRLFGEDPPKEMLMDKIITEGTKLKIA
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                        630                                        
pF1KB3 -NSTANAE-----------TQAT-------------------------------------
        .:. .::           :.::                                     
NP_899 PSSSITAENVSILPGQTLLTMATAPVTGTTGHKVTIPLHGVANDAGEITLIPLSMNTNQE
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pF1KB3 -----------------SAFQTQ-------------KPLKSTSLSLFYKKVYRLAYLRLN
                        :  ::.             .: .. ::.:::.:::.:: .:: 
NP_899 SKVKSPVSLTAHSLIGASPKQTNLTKAQEVHSTGINRPKRTGSLALFYRKVYHLASVRLR
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pF1KB3 TLCERLLSEHPELEHIIWTLFQHTLQNEYELMRDRHLDQIMMCSMYGICKVKNIDLKFKI
        :: .: .   ::.. ::: :. :: .  .::.::::::...:..: . :: . .  :. 
NP_899 DLCLKL-DVSNELRRKIWTCFEFTLVHCPDLMKDRHLDQLLLCAFYIMAKVTKEERTFQE
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pF1KB3 IVTAYKDLPHAVQETFKRVLIKEEEYDSIIVFYNSVFMQRLKTNILQYASTRPPTLSPIP
       :. .:.. :.: ..... ::.:    .  .: ::                          
NP_899 IMKSYRNQPQANSHVYRSVLLKSIPRE--VVAYNKNINDDFEMIDCDLEDATKTPDCSSG
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pF1KB3 HIPRSPYKFPSSPLRIPGGNIYISPLKSPYKISEGLPTPTKMTPRSRILVSIGESFGTSE
                                                                   
NP_899 PVKEERGDLIKFYNTIYVGRVKSFALKYDLANQDHMMDAPPLSPFPHIKQQPGSPRRISQ
             930       940       950       960       970       980 

>>NP_002886 (OMIM: 116957) retinoblastoma-like protein 1  (1068 aa)
 initn: 935 init1: 237 opt: 346  Z-score: 254.3  bits: 58.5 E(85289): 2e-07
Smith-Waterman score: 682; 25.7% identity (51.1% similar) in 904 aa overlap (59-757:23-895)

       30        40        50        60        70        80        
pF1KB3 PEEDPEQDSGPEDLPLVRLEFEETEEPDFTALCQKLKIPDHVRERAWLTWEKVSSVDEVL
                                     ::::.:.. .          : ...   . 
NP_002         MFEDKPHAEGAAVVAAAGEALQALCQELNLDEGSAA------EALDDFTAIR
                       10        20        30              40      

       90        100                  110       120       130      
pF1KB3 GGY-IQKKKELWGIC-IFIAAVD----------LDEMSFTFTELQKNIEISVHKFFNLLK
       :.: .. .   :  : ...:             ..    ..:.. .. ..:. .::. .:
NP_002 GNYSLEGEVTHWLACSLYVACRKSIIPTVGKGIMEGNCVSLTRILRSAKLSLIQFFSKMK
         50        60        70        80        90       100      

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pF1KB3 E-IDTST---KVDNAMSRLLKKYDVLFALFSKLERTCELIYLTQ-------PSSSISTEI
       . .: :.   .  . . :: ....:  ..:.: :     :. .        : :  . .:
NP_002 KWMDMSNLPQEFRERIERLERNFEVSTVIFKKYEPIFLDIFQNPYEEPPKLPRSRKQRRI
        110       120       130       140       150       160      

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pF1KB3 NSAL--VLKVSWITFLLAKGEVLQMEDDLVISFQLMLCVLDYFIKLSPPMLLKEPYKTAV
         ..  ...  :  :. .::.  .. :::: :..:.:: :: ..      ..    .  .
NP_002 PCSVKDLFNFCWTLFVYTKGNFRMIGDDLVNSYHLLLCCLDLIFA---NAIMCPNRQDLL
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pF1KB3 IP-INGSPRTPRRGQNRSARIAKQLENDTRIIEVLCKEHECNIDEVKNVYFKNFIPFMNS
        : ..: : .  .  . .:      :.   :: :::. :.  . :.:..  . : :....
NP_002 NPSFKGLP-SDFHTADFTAS-----EEPPCIIAVLCELHDGLLVEAKGIKEHYFKPYISK
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pF1KB3 L-------G---LVTSNGLPEVENLSKRYEEIYLKNKDLDARLFLDHDKTLQTDSIDSFE
       :       :   :  :.   . . ..:.:::  :   :.: :.::  :   .  .  .: 
NP_002 LFDRKILKGECLLDLSSFTDNSKAVNKEYEEYVLTVGDFDERIFLGADAEEEIGTPRKF-
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pF1KB3 TQRTPRKSNLDEEVNV---IPPH--------------------------TPVRTVMNTIQ
       :. ::  ..:  ..::   .  :                          ::: .. ....
NP_002 TRDTPL-GKLTAQANVEYNLQQHFEKKRSFAPSTPLTGRRYLREKEAVITPVASATQSVS
        340        350       360       370       380       390     

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pF1KB3 QLMMILNSASDQPSENLISYFNNCTVNPKESILKRVKDIGYIFKEKFAKAVGQ--GC-VE
       .:. :. . .. ::..::. :..:. :: :.:.: .: ::  : ....... .  :  ..
NP_002 RLQSIVAGLKNAPSDQLINIFESCVRNPVENIMKILKGIGETFCQHYTQSTDEQPGSHID
         400       410       420       430       440       450     

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pF1KB3 IGSQRYKLGVRLYYRVMESMLKSEEERLSIQNFSKLLNDNIFHMSLLACALEVVMATYSR
       .. .: ::.  :::...:... .: .::  ...: ::...::: ::.:: ::.:. .:: 
NP_002 FAVNRLKLAEILYYKILETVMVQETRRLHGMDMSVLLEQDIFHRSLMACCLEIVLFAYS-
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pF1KB3 STSQNLDSGTDLSFPWILNVLNLKAFDFYKVIESFIKAEGNLTREMIKHLERCEHRIMES
                .  .::::..::::. : ::::::  :..: .:.:.:.:::.  :..:.::
NP_002 ---------SPRTFPWIIEVLNLQPFYFYKVIEVVIRSEEGLSRDMVKHLNSIEEQILES
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pF1KB3 LAWLSDSPLFDLIKQSKDREGPT-------DHLESACPLN----LPLQ------------
       :::  :: :.. .. : ..  ::       ...:..   :    :::.            
NP_002 LAWSHDSALWEALQVSANKV-PTCEEVIFPNNFETGNGGNVQGHLPLMPMSPLMHPRVKE
         570       580        590       600       610       620    

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pF1KB3 ----NNHTAADMY-LSPVR------SP-----KKK------------------GSTTRV-
           ..    ::  :::.       ::     :..                  :.  .. 
NP_002 VRTDSGSLRRDMQPLSPISVHERYSSPTAGSAKRRLFGEDPPKEMLMDKIITEGTKLKIA
          630       640       650       660       670       680    

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pF1KB3 -NSTANAE-----------TQAT-------------------------------------
        .:. .::           :.::                                     
NP_002 PSSSITAENVSILPGQTLLTMATAPVTGTTGHKVTIPLHGVANDAGEITLIPLSMNTNQE
          690       700       710       720       730       740    

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pF1KB3 -----------------SAFQTQ-------------KPLKSTSLSLFYKKVYRLAYLRLN
                        :  ::.             .: .. ::.:::.:::.:: .:: 
NP_002 SKVKSPVSLTAHSLIGASPKQTNLTKAQEVHSTGINRPKRTGSLALFYRKVYHLASVRLR
          750       760       770       780       790       800    

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pF1KB3 TLCERLLSEHPELEHIIWTLFQHTLQNEYELMRDRHLDQIMMCSMYGICKVKNIDLKFKI
        :: .: .   ::.. ::: :. :: .  .::.::::::...:..: . :: . .  :. 
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       :. .:.. :.: ..... ::.:    .  .: ::                          
NP_002 IMKSYRNQPQANSHVYRSVLLKSIPRE--VVAYNKNINDDFEMIDCDLEDATKTPDCSSG
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       :  :.: .   :        ::.: .....  . :::::: ::.:: .: ::..:::.. 
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XP_016 STATHSLSRLHTMLTGLRNAPSEKLEQILRTCSRDPTQAIANRLKEMFEIYSQHFQPDED
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pF1KB3 -QGCV-EIGSQRYKLGVRLYYRVMESMLKSEEERLSIQNFSKLLNDNIFHMSLLACALEV
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