Result of FASTA (omim) for pF1KB3017
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3017, 798 aa
  1>>>pF1KB3017 798 - 798 aa - 798 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9452+/-0.000522; mu= 8.0610+/- 0.032
 mean_var=230.8990+/-44.450, 0's: 0 Z-trim(116.1): 276  B-trim: 101 in 1/49
 Lambda= 0.084404
 statistics sampled from 26582 (26942) to 26582 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.671), E-opt: 0.2 (0.316), width:  16
 Scan time: 13.030

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
XP_005268909 (OMIM: 147559) PREDICTED: integrin be ( 798) 5618 698.4 3.1e-200
XP_005268908 (OMIM: 147559) PREDICTED: integrin be ( 798) 5618 698.4 3.1e-200
NP_000880 (OMIM: 147559) integrin beta-7 precursor ( 798) 5618 698.4 3.1e-200
XP_006719439 (OMIM: 147559) PREDICTED: integrin be ( 782) 5451 678.1  4e-194
NP_001120963 (OMIM: 116920,600065) integrin beta-2 ( 769) 2524 321.7 7.8e-87
NP_000202 (OMIM: 116920,600065) integrin beta-2 is ( 769) 2524 321.7 7.8e-87
NP_001290167 (OMIM: 116920,600065) integrin beta-2 ( 700) 2365 302.3 4.9e-81
XP_006724064 (OMIM: 116920,600065) PREDICTED: inte ( 700) 2365 302.3 4.9e-81
XP_016883830 (OMIM: 116920,600065) PREDICTED: inte ( 700) 2365 302.3 4.9e-81
NP_002202 (OMIM: 135630) integrin beta-1 isoform 1 ( 798) 2226 285.4 6.7e-76
NP_596867 (OMIM: 135630) integrin beta-1 isoform 1 ( 798) 2226 285.4 6.7e-76
NP_391988 (OMIM: 135630) integrin beta-1 isoform 1 ( 801) 2226 285.4 6.7e-76
NP_000203 (OMIM: 173470,187800,273800,608446) inte ( 788) 2065 265.8 5.3e-70
NP_000879 (OMIM: 147558,616221) integrin beta-6 is ( 788) 2054 264.4 1.3e-69
NP_001269282 (OMIM: 147558,616221) integrin beta-6 ( 788) 2054 264.4 1.3e-69
NP_002204 (OMIM: 147561) integrin beta-5 precursor ( 799) 2043 263.1 3.4e-69
NP_001269317 (OMIM: 147558,616221) integrin beta-6 ( 746) 1946 251.3 1.2e-65
XP_016861841 (OMIM: 147561) PREDICTED: integrin be ( 691) 1851 239.7 3.4e-62
XP_016861842 (OMIM: 147561) PREDICTED: integrin be ( 691) 1851 239.7 3.4e-62
XP_016861840 (OMIM: 147561) PREDICTED: integrin be ( 691) 1851 239.7 3.4e-62
NP_001269318 (OMIM: 147558,616221) integrin beta-6 ( 715) 1792 232.5   5e-60
NP_001269283 (OMIM: 147558,616221) integrin beta-6 ( 693) 1786 231.7 8.2e-60
NP_001269319 (OMIM: 147558,616221) integrin beta-6 ( 650) 1700 221.2 1.1e-56
NP_001269284 (OMIM: 147558,616221) integrin beta-6 ( 681) 1568 205.2 7.9e-52
NP_001308052 (OMIM: 131800,147557,226650,226730) i (1752) 1376 182.3 1.6e-44
NP_001005731 (OMIM: 131800,147557,226650,226730) i (1752) 1376 182.3 1.6e-44
XP_006721933 (OMIM: 131800,147557,226650,226730) P (1787) 1376 182.3 1.6e-44
NP_001005619 (OMIM: 131800,147557,226650,226730) i (1805) 1376 182.3 1.7e-44
XP_011523053 (OMIM: 131800,147557,226650,226730) P (1807) 1376 182.3 1.7e-44
NP_000204 (OMIM: 131800,147557,226650,226730) inte (1822) 1376 182.3 1.7e-44
XP_006721931 (OMIM: 131800,147557,226650,226730) P (1840) 1376 182.3 1.7e-44
XP_006721930 (OMIM: 131800,147557,226650,226730) P (1857) 1376 182.3 1.7e-44
XP_005257366 (OMIM: 131800,147557,226650,226730) P (1875) 1376 182.3 1.7e-44
XP_005257368 (OMIM: 131800,147557,226650,226730) P (1875) 1376 182.3 1.7e-44
XP_006721929 (OMIM: 131800,147557,226650,226730) P (1910) 1376 182.3 1.7e-44
XP_011513696 (OMIM: 604160) PREDICTED: integrin be ( 758) 1347 178.3 1.1e-43
XP_011513695 (OMIM: 604160) PREDICTED: integrin be ( 761) 1347 178.3 1.1e-43
XP_016867668 (OMIM: 604160) PREDICTED: integrin be ( 769) 1339 177.4 2.1e-43
NP_002205 (OMIM: 604160) integrin beta-8 precursor ( 769) 1339 177.4 2.1e-43
XP_016867667 (OMIM: 604160) PREDICTED: integrin be ( 769) 1339 177.4 2.1e-43
XP_006713693 (OMIM: 147561) PREDICTED: integrin be ( 754) 1300 172.6 5.6e-42
XP_016867672 (OMIM: 604160) PREDICTED: integrin be ( 634) 1246 165.9 4.8e-40
XP_016867670 (OMIM: 604160) PREDICTED: integrin be ( 634) 1246 165.9 4.8e-40
XP_016867671 (OMIM: 604160) PREDICTED: integrin be ( 634) 1246 165.9 4.8e-40
XP_016867669 (OMIM: 604160) PREDICTED: integrin be ( 634) 1246 165.9 4.8e-40
XP_011513698 (OMIM: 604160) PREDICTED: integrin be ( 634) 1246 165.9 4.8e-40
XP_005247493 (OMIM: 147561) PREDICTED: integrin be ( 769) 1051 142.3 7.7e-33
XP_016861844 (OMIM: 147561) PREDICTED: integrin be ( 661)  859 118.8 7.6e-26
XP_016861843 (OMIM: 147561) PREDICTED: integrin be ( 683)  693 98.6 9.4e-20
NP_001258683 (OMIM: 604234) integrin beta-like pro ( 353)  398 62.4 3.9e-09


>>XP_005268909 (OMIM: 147559) PREDICTED: integrin beta-7  (798 aa)
 initn: 5618 init1: 5618 opt: 5618  Z-score: 3715.9  bits: 698.4 E(85289): 3.1e-200
Smith-Waterman score: 5618; 100.0% identity (100.0% similar) in 798 aa overlap (1-798:1-798)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MVALPMVLVLLLVLSRGESELDAKIPSTGDATEWRNPHLSMLGSCQPAPSCQKCILSHPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MVALPMVLVLLLVLSRGESELDAKIPSTGDATEWRNPHLSMLGSCQPAPSCQKCILSHPS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 CAWCKQLNFTASGEAEARRCARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQGARGEGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CAWCKQLNFTASGEAEARRCARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQGARGEGA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 TQLAPQRVRVTLRPGEPQQLQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TQLAPQRVRVTLRPGEPQQLQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALLV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 RLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGDAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGDAQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 AFEREVGRQSVSGNLDSPEGGFDAILQAALCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AFEREVGRQSVSGNLDSPEGGFDAILQAALCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 GGIFMPSDGHCHLDSNGLYSRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQELS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GGIFMPSDGHCHLDSNGLYSRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQELS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 KLIPKSAVGELSEDSSNVVQLIMDAYNSLSSTVTLEHSSLPPGVHISYESQCEGPEKREG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KLIPKSAVGELSEDSSNVVQLIMDAYNSLSSTVTLEHSSLPPGVHISYESQCEGPEKREG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 KAEDRGQCNHVRINQTVTFWVSLQATHCLPEPHLLRLRALGFSEELIVELHTLCDCNCSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KAEDRGQCNHVRINQTVTFWVSLQATHCLPEPHLLRLRALGFSEELIVELHTLCDCNCSD
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 TQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 GHCQCGRCSCSGQSSGHLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GHCQCGRCSCSGQSSGHLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 DMDSCISPEGGLCSGHGRCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DMDSCISPEGGLCSGHGRCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 PLATNCSTACAHTNVTLALAPILDDGWCKERTLDNQLFFFLVEDDARGTVVLRVRPQEKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PLATNCSTACAHTNVTLALAPILDDGWCKERTLDNQLFFFLVEDDARGTVVLRVRPQEKG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 ADHTQAIVLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDSNPLYKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ADHTQAIVLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDSNPLYKS
              730       740       750       760       770       780

              790        
pF1KB3 AITTTINPRFQEADSPTL
       ::::::::::::::::::
XP_005 AITTTINPRFQEADSPTL
              790        

>>XP_005268908 (OMIM: 147559) PREDICTED: integrin beta-7  (798 aa)
 initn: 5618 init1: 5618 opt: 5618  Z-score: 3715.9  bits: 698.4 E(85289): 3.1e-200
Smith-Waterman score: 5618; 100.0% identity (100.0% similar) in 798 aa overlap (1-798:1-798)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MVALPMVLVLLLVLSRGESELDAKIPSTGDATEWRNPHLSMLGSCQPAPSCQKCILSHPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MVALPMVLVLLLVLSRGESELDAKIPSTGDATEWRNPHLSMLGSCQPAPSCQKCILSHPS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 CAWCKQLNFTASGEAEARRCARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQGARGEGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CAWCKQLNFTASGEAEARRCARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQGARGEGA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 TQLAPQRVRVTLRPGEPQQLQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TQLAPQRVRVTLRPGEPQQLQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALLV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 RLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGDAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGDAQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 AFEREVGRQSVSGNLDSPEGGFDAILQAALCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AFEREVGRQSVSGNLDSPEGGFDAILQAALCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 GGIFMPSDGHCHLDSNGLYSRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQELS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GGIFMPSDGHCHLDSNGLYSRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQELS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 KLIPKSAVGELSEDSSNVVQLIMDAYNSLSSTVTLEHSSLPPGVHISYESQCEGPEKREG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KLIPKSAVGELSEDSSNVVQLIMDAYNSLSSTVTLEHSSLPPGVHISYESQCEGPEKREG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 KAEDRGQCNHVRINQTVTFWVSLQATHCLPEPHLLRLRALGFSEELIVELHTLCDCNCSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KAEDRGQCNHVRINQTVTFWVSLQATHCLPEPHLLRLRALGFSEELIVELHTLCDCNCSD
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 TQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 GHCQCGRCSCSGQSSGHLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GHCQCGRCSCSGQSSGHLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSG
              550       560       570       580       590       600

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pF1KB3 DMDSCISPEGGLCSGHGRCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DMDSCISPEGGLCSGHGRCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 PLATNCSTACAHTNVTLALAPILDDGWCKERTLDNQLFFFLVEDDARGTVVLRVRPQEKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PLATNCSTACAHTNVTLALAPILDDGWCKERTLDNQLFFFLVEDDARGTVVLRVRPQEKG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 ADHTQAIVLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDSNPLYKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ADHTQAIVLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDSNPLYKS
              730       740       750       760       770       780

              790        
pF1KB3 AITTTINPRFQEADSPTL
       ::::::::::::::::::
XP_005 AITTTINPRFQEADSPTL
              790        

>>NP_000880 (OMIM: 147559) integrin beta-7 precursor [Ho  (798 aa)
 initn: 5618 init1: 5618 opt: 5618  Z-score: 3715.9  bits: 698.4 E(85289): 3.1e-200
Smith-Waterman score: 5618; 100.0% identity (100.0% similar) in 798 aa overlap (1-798:1-798)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MVALPMVLVLLLVLSRGESELDAKIPSTGDATEWRNPHLSMLGSCQPAPSCQKCILSHPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MVALPMVLVLLLVLSRGESELDAKIPSTGDATEWRNPHLSMLGSCQPAPSCQKCILSHPS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 CAWCKQLNFTASGEAEARRCARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQGARGEGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 CAWCKQLNFTASGEAEARRCARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQGARGEGA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 TQLAPQRVRVTLRPGEPQQLQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TQLAPQRVRVTLRPGEPQQLQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALLV
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pF1KB3 RLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGDAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGDAQ
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pF1KB3 AFEREVGRQSVSGNLDSPEGGFDAILQAALCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AFEREVGRQSVSGNLDSPEGGFDAILQAALCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKL
              250       260       270       280       290       300

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pF1KB3 GGIFMPSDGHCHLDSNGLYSRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQELS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GGIFMPSDGHCHLDSNGLYSRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQELS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 KLIPKSAVGELSEDSSNVVQLIMDAYNSLSSTVTLEHSSLPPGVHISYESQCEGPEKREG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KLIPKSAVGELSEDSSNVVQLIMDAYNSLSSTVTLEHSSLPPGVHISYESQCEGPEKREG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 KAEDRGQCNHVRINQTVTFWVSLQATHCLPEPHLLRLRALGFSEELIVELHTLCDCNCSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KAEDRGQCNHVRINQTVTFWVSLQATHCLPEPHLLRLRALGFSEELIVELHTLCDCNCSD
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              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 TQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGK
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              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 GHCQCGRCSCSGQSSGHLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GHCQCGRCSCSGQSSGHLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 DMDSCISPEGGLCSGHGRCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DMDSCISPEGGLCSGHGRCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 PLATNCSTACAHTNVTLALAPILDDGWCKERTLDNQLFFFLVEDDARGTVVLRVRPQEKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PLATNCSTACAHTNVTLALAPILDDGWCKERTLDNQLFFFLVEDDARGTVVLRVRPQEKG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 ADHTQAIVLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDSNPLYKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ADHTQAIVLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDSNPLYKS
              730       740       750       760       770       780

              790        
pF1KB3 AITTTINPRFQEADSPTL
       ::::::::::::::::::
NP_000 AITTTINPRFQEADSPTL
              790        

>>XP_006719439 (OMIM: 147559) PREDICTED: integrin beta-7  (782 aa)
 initn: 5451 init1: 5451 opt: 5451  Z-score: 3606.1  bits: 678.1 E(85289): 4e-194
Smith-Waterman score: 5451; 100.0% identity (100.0% similar) in 772 aa overlap (1-772:1-772)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MVALPMVLVLLLVLSRGESELDAKIPSTGDATEWRNPHLSMLGSCQPAPSCQKCILSHPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MVALPMVLVLLLVLSRGESELDAKIPSTGDATEWRNPHLSMLGSCQPAPSCQKCILSHPS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 CAWCKQLNFTASGEAEARRCARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQGARGEGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 CAWCKQLNFTASGEAEARRCARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQGARGEGA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 TQLAPQRVRVTLRPGEPQQLQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TQLAPQRVRVTLRPGEPQQLQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALLV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 RLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGDAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGDAQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 AFEREVGRQSVSGNLDSPEGGFDAILQAALCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AFEREVGRQSVSGNLDSPEGGFDAILQAALCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 GGIFMPSDGHCHLDSNGLYSRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQELS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GGIFMPSDGHCHLDSNGLYSRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQELS
              310       320       330       340       350       360

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pF1KB3 KLIPKSAVGELSEDSSNVVQLIMDAYNSLSSTVTLEHSSLPPGVHISYESQCEGPEKREG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KLIPKSAVGELSEDSSNVVQLIMDAYNSLSSTVTLEHSSLPPGVHISYESQCEGPEKREG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 KAEDRGQCNHVRINQTVTFWVSLQATHCLPEPHLLRLRALGFSEELIVELHTLCDCNCSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KAEDRGQCNHVRINQTVTFWVSLQATHCLPEPHLLRLRALGFSEELIVELHTLCDCNCSD
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 TQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 GHCQCGRCSCSGQSSGHLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GHCQCGRCSCSGQSSGHLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 DMDSCISPEGGLCSGHGRCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DMDSCISPEGGLCSGHGRCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTG
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pF1KB3 PLATNCSTACAHTNVTLALAPILDDGWCKERTLDNQLFFFLVEDDARGTVVLRVRPQEKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PLATNCSTACAHTNVTLALAPILDDGWCKERTLDNQLFFFLVEDDARGTVVLRVRPQEKG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 ADHTQAIVLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDSNPLYKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::        
XP_006 ADHTQAIVLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQLLGFGSRL
              730       740       750       760       770       780

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pF1KB3 AITTTINPRFQEADSPTL
                         
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pF1KB3 VLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDSNPLYKSAITTTIN
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       . .:..: :::.::: ::..::.: :.     
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       . .:..: :::.::: ::..::.: :.     
XP_006 KSQWNND-NPLFKSATTTVMNPKFAES     
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pF1KB3 PSCAWCKQLNFTASGEAEARRCARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQGARGE
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pF1KB3 LVRLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGD
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XP_016 LRALNEITESGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPDKLRNPCPNKEKECQPPFAFRHVLKLTNN
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XP_016 KLGAILTPNDGRCHLEDN-LYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAENNIQPIFAVTSRMVKTYEK
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