Result of FASTA (ccds) for pF1KB3017
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3017, 798 aa
  1>>>pF1KB3017 798 - 798 aa - 798 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5143+/-0.00121; mu= 10.7805+/- 0.073
 mean_var=200.4305+/-38.350, 0's: 0 Z-trim(109.7): 121  B-trim: 48 in 2/48
 Lambda= 0.090593
 statistics sampled from 10937 (11060) to 10937 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.688), E-opt: 0.2 (0.34), width:  16
 Scan time:  4.020

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS8849.1 ITGB7 gene_id:3695|Hs108|chr12          ( 798) 5618 748.0 1.4e-215
CCDS13716.1 ITGB2 gene_id:3689|Hs108|chr21         ( 769) 2524 343.6 7.5e-94
CCDS7174.1 ITGB1 gene_id:3688|Hs108|chr10          ( 798) 2226 304.6 4.1e-82
CCDS11511.1 ITGB3 gene_id:3690|Hs108|chr17         ( 788) 2065 283.6 8.8e-76
CCDS2212.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2           ( 788) 2054 282.1 2.4e-75
CCDS3030.1 ITGB5 gene_id:3693|Hs108|chr3           ( 799) 2043 280.7 6.5e-75
CCDS74596.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2          ( 746) 1946 268.0 4.1e-71
CCDS74597.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2          ( 693) 1786 247.1 7.6e-65
CCDS63040.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2          ( 681) 1568 218.6 2.8e-56
CCDS58599.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17         (1752) 1376 193.9 1.9e-48
CCDS32736.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17         (1805) 1376 193.9   2e-48
CCDS11727.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17         (1822) 1376 193.9   2e-48
CCDS5370.1 ITGB8 gene_id:3696|Hs108|chr7           ( 769) 1339 188.7 3.2e-47


>>CCDS8849.1 ITGB7 gene_id:3695|Hs108|chr12               (798 aa)
 initn: 5618 init1: 5618 opt: 5618  Z-score: 3983.6  bits: 748.0 E(32554): 1.4e-215
Smith-Waterman score: 5618; 100.0% identity (100.0% similar) in 798 aa overlap (1-798:1-798)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MVALPMVLVLLLVLSRGESELDAKIPSTGDATEWRNPHLSMLGSCQPAPSCQKCILSHPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 MVALPMVLVLLLVLSRGESELDAKIPSTGDATEWRNPHLSMLGSCQPAPSCQKCILSHPS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 CAWCKQLNFTASGEAEARRCARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQGARGEGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 CAWCKQLNFTASGEAEARRCARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQGARGEGA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 TQLAPQRVRVTLRPGEPQQLQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 TQLAPQRVRVTLRPGEPQQLQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALLV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 RLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGDAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 RLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGDAQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 AFEREVGRQSVSGNLDSPEGGFDAILQAALCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 AFEREVGRQSVSGNLDSPEGGFDAILQAALCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 GGIFMPSDGHCHLDSNGLYSRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQELS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 GGIFMPSDGHCHLDSNGLYSRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQELS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 KLIPKSAVGELSEDSSNVVQLIMDAYNSLSSTVTLEHSSLPPGVHISYESQCEGPEKREG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 KLIPKSAVGELSEDSSNVVQLIMDAYNSLSSTVTLEHSSLPPGVHISYESQCEGPEKREG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 KAEDRGQCNHVRINQTVTFWVSLQATHCLPEPHLLRLRALGFSEELIVELHTLCDCNCSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 KAEDRGQCNHVRINQTVTFWVSLQATHCLPEPHLLRLRALGFSEELIVELHTLCDCNCSD
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 TQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 TQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 GHCQCGRCSCSGQSSGHLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 GHCQCGRCSCSGQSSGHLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 DMDSCISPEGGLCSGHGRCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 DMDSCISPEGGLCSGHGRCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 PLATNCSTACAHTNVTLALAPILDDGWCKERTLDNQLFFFLVEDDARGTVVLRVRPQEKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 PLATNCSTACAHTNVTLALAPILDDGWCKERTLDNQLFFFLVEDDARGTVVLRVRPQEKG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 ADHTQAIVLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDSNPLYKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 ADHTQAIVLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDSNPLYKS
              730       740       750       760       770       780

              790        
pF1KB3 AITTTINPRFQEADSPTL
       ::::::::::::::::::
CCDS88 AITTTINPRFQEADSPTL
              790        

>>CCDS13716.1 ITGB2 gene_id:3689|Hs108|chr21              (769 aa)
 initn: 1666 init1: 896 opt: 2524  Z-score: 1798.4  bits: 343.6 E(32554): 7.5e-94
Smith-Waterman score: 2524; 48.3% identity (73.9% similar) in 756 aa overlap (50-793:32-769)

      20        30        40        50        60        70         
pF1KB3 ELDAKIPSTGDATEWRNPHLSMLGSCQPAPSCQKCILSHPSCAWCKQLNFTASGEAEARR
                                     ::..:: : :.:.::..::::. :. .. :
CCDS13 LGLRPPLLALVGLLSLGCVLSQECTKFKVSSCRECIESGPGCTWCQKLNFTGPGDPDSIR
              10        20        30        40        50        60 

      80        90       100       110       120       130         
pF1KB3 CARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQGARGEGATQLAPQRVRVTLRPGEPQQ
       :  : .:: :::  ... .: .  :. .:.   .:    :  ::.::.: . ::::.   
CCDS13 CDTRPQLLMRGCAADDIMDPTSLAETQEDH---NG----GQKQLSPQKVTLYLRPGQAAA
              70        80        90              100       110    

     140       150       160       170       180       190         
pF1KB3 LQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALLVRLQEVTHSVRIGFGSFVDK
       ..: : ::.:::.:::::::::::: :::. :..::  ::  :.:.:.: ::::::::::
CCDS13 FNVTFRRAKGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLRNVKKLGGDLLRALNEITESGRIGFGSFVDK
          120       130       140       150       160       170    

     200       210       220       230       240       250         
pF1KB3 TVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGDAQAFEREVGRQSVSGNLDSPE
       ::::::.: :.:::.:::.. ..:: ::.:.:::.::.... :. :::.: .:::::.::
CCDS13 TVLPFVNTHPDKLRNPCPNKEKECQPPFAFRHVLKLTNNSNQFQTEVGKQLISGNLDAPE
          180       190       200       210       220       230    

     260       270       280       290       300       310         
pF1KB3 GGFDAILQAALCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFMPSDGHCHLDSNGLY
       ::.::..:.: : :.::::::.:::::..:: :: :::::::.:. :.::.:::..: ::
CCDS13 GGLDAMMQVAACPEEIGWRNVTRLLVFATDDGFHFAGDGKLGAILTPNDGRCHLEDN-LY
          240       250       260       270       280       290    

     320       330       340       350       360       370         
pF1KB3 SRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQELSKLIPKSAVGELSEDSSNVV
       .::.:::::::::.:. :.  ::::::::::  . .:..:...:::::::::::::::::
CCDS13 KRSNEFDYPSVGQLAHKLAENNIQPIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVV
           300       310       320       330       340       350   

     380       390       400       410        420       430        
pF1KB3 QLIMDAYNSLSSTVTLEHSSLPPGVHISYESQC-EGPEKREGKAEDRGQCNHVRINQTVT
       .:: .:::.::: : :.:..::  ....:.: : .:  .:.   . ::.:. :.::  .:
CCDS13 HLIKNAYNKLSSRVFLDHNALPDTLKVTYDSFCSNGVTHRN---QPRGDCDGVQINVPIT
           360       370       380       390          400       410

      440       450       460       470       480       490        
pF1KB3 FWVSLQATHCLPEPHLLRLRALGFSEELIVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCG
       : :.. ::.:. :  .. .:::::.. . :..   :.: : : . .   :  :.: :.::
CCDS13 FQVKVTATECIQEQSFV-IRALGFTDIVTVQVLPQCECRCRDQSRDRSLCH-GKGFLECG
              420        430       440       450       460         

      500       510       520       530       540       550        
pF1KB3 VCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGHCQCGRCSCSGQSS---
       .: :  : .:. :::..   :: .::..::  :..  .::: : : ::.: :  ..    
CCDS13 ICRCDTGYIGKNCECQTQGRSSQELEGSCRKDNNS-IICSGLGDCVCGQCLCHTSDVPGK
      470       480       490       500        510       520       

            560       570         580       590       600       610
pF1KB3 ---GHLCECDDASCERHEGILCGGFGR--CQCGVCHCHANRTGRACECSGDMDSCISPEG
          :. ::::  .:::..: .::: ::  : :: :.:: .  : ::.:    ..:..:. 
CCDS13 LIYGQYCECDTINCERYNGQVCGGPGRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCERTTEGCLNPRR
       530       540       550       560       570       580       

              620       630       640       650       660       670
pF1KB3 GLCSGHGRCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGPLATNCSTAC
         :::.:::.:: :.: .::   ::..:::: .:: .. .::::  :. ::.. :::.::
CCDS13 VECSGRGRCRCNVCECHSGYQLPLCQECPGCPSPCGKYISCAECLKFEKGPFGKNCSAAC
       590       600       610       620       630       640       

              680       690        700       710         720       
pF1KB3 AHTNVTLALAPILDDGWCKERTLDN-QLFFFLVEDDARGTVVLRVRPQEK--GADHTQAI
          .. :.  :.     ::::  ..  . . : ..:.    .. :  ...  .. .  ::
CCDS13 P--GLQLSNNPV-KGRTCKERDSEGCWVAYTLEQQDGMDRYLIYVDESRECVAGPNIAAI
         650        660       670       680       690       700    

       730       740       750       760       770       780       
pF1KB3 VLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDSNPLYKSAITTTIN
       : : :.::: .:. :.. ..  ... : ::: :::::. . .:..: :::.::: ::..:
CCDS13 VGGTVAGIVLIGILLLVIWKALIHLSDLREYRRFEKEKLKSQWNND-NPLFKSATTTVMN
          710       720       730       740       750        760   

       790        
pF1KB3 PRFQEADSPTL
       :.: :.     
CCDS13 PKFAES     
                  

>>CCDS7174.1 ITGB1 gene_id:3688|Hs108|chr10               (798 aa)
 initn: 1601 init1: 506 opt: 2226  Z-score: 1587.7  bits: 304.6 E(32554): 4.1e-82
Smith-Waterman score: 2477; 45.1% identity (72.8% similar) in 771 aa overlap (48-791:32-796)

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        ::   : :  .::: ...:.:::.... ... ... ..:       :  ::. ::.. .
CCDS71 ARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKNKNVTNRSKGTAEKLKPEDITQIQPQQLVL
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        :: :::: . ..: ::: ::.::::::::::::::::: :..::  :. .....: . :
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       .::::::::::::::.:.:.:   ::::::.:::::..:  :: ::::::::: .:.::.
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       :::..: .:. :  .::::.....: ::  ::: :::::    :::.::..:::::::: 
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       . :.. : : .:. ...: :  .   ...: :::.::. : :. .:.:.: :.  :..:.
CCDS71 ISIGDEVQFEISITSNKC-PKKDSDSFKIRPLGFTEEVEVILQYICECECQSEGIPESPK
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       : .:.: ..::.: :  ::.:: ::::. :..: :... ::  : .. .::..:.: ::.
CCDS71 CHEGNGTFECGACRCNEGRVGRHCECSTDEVNSEDMDAYCRKEN-SSEICSNNGECVCGQ
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       : :  ..      ::..::::. .:.: .:..::: : :.: ::.:. : :: ::.:: :
CCDS71 CVCRKRDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGLICGGNGVCKCRVCECNPNYTGSACDCSLD
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        ..: . .: .:.:.: :.:. :.: :  . :  :..:  :   : .:..:..: ::  :
CCDS71 TSTCEASNGQICNGRGICECGVCKCTDPKFQGQTCEMCQTCLGVCAEHKECVQCRAFNKG
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CCDS71 EKKDTCTQECSYFNITKVESRDKLPQPVQPDPVSHCKEKDVDDCWFYFTYSVNGNNEVMV
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CCDS71 HVVENPECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALLLIWKLLMIIHDRREFAKFEKEKMNAKW
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pF1KB3 KQDSNPLYKSAITTTINPRFQEADSPTL
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CCDS71 DTGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK     
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>>CCDS11511.1 ITGB3 gene_id:3690|Hs108|chr17              (788 aa)
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CCDS11 RPLWATVLALGALAGVGVGGPNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDEALPLGSP----R
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CCDS11 CDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIALRLRPDDS
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CCDS11 KNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTSNLRIGFGAFV
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       :: : :..   : . :..::      :   :...:::.:: ..  :..:: .:::: : :
CCDS11 DKPVSPYMYISPPEALENPCYDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKKQSVSRNRD
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pF1KB3 SPEGGFDAILQAALCQEQIGWRN-VSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFMPSDGHCHLDS
       .::::::::.::..:.:.::::: .:.:::::.:   : : ::.:.:: .:.::.::. :
CCDS11 APEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGIVQPNDGQCHVGS
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pF1KB3 NGLYSRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQELSKLIPKSAVGELSEDS
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CCDS11 DNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELIPGTTVGVLSMDS
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CCDS11 SNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLK----SCMGLKIGD
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CCDS11 TVSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPNSHRCNNGNG
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CCDS11 TFECGVCRCGPGWLGSQCECS-EEDYRPSQQDEC-SPREGQPVCSQRGECLCGQCVCHSS
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         :. .:. ::::: :: :..: .:.: :.:.:: : : .. ::  :.:.   :.:.: .
CCDS11 DFGKITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGDCLCDSDWTGYYCNCTTRTDTCMSSN
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CCDS11 GLLCSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKKFDRGALHDENTC
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pF1KB3 STACAHTNVTLALAPILDDGW----CKERTLDNQLFFFLVEDDARGTVVLRV--RPQ-EK
       .  :   .   ..  . : :     :  .. :. .  :   .:. :  .: :  .:.  :
CCDS11 NRYC--RDEIESVKELKDTGKDAVNCTYKNEDDCVVRFQYYEDSSGKSILYVVEEPECPK
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pF1KB3 GADHTQAIVLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDSNPLYK
       : :   ...:. .:.:. .::. .: ..: . :.::.:...::.:. . .:   .:::::
CCDS11 GPD-ILVVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWDTANNPLYK
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pF1KB3 SAITTTINPRFQEADSPTL
        : .:  :  ..       
CCDS11 EATSTFTNITYRGT     
          780             

>>CCDS2212.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2                (788 aa)
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CCDS22                 MGIELLCLFFLFLGRNDHVQ--GGCALGGAETCEDCLLIGPQCA
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pF1KB3 WCKQLNFT-ASGEAEARRCARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQGARGEGA-
       :: : :::  :: .:  ::    .:::.:: :. .:.: .: :.:...::: : . ... 
CCDS22 WCAQENFTHPSGVGE--RCDTPANLLAKGCQLNFIENPVSQVEILKNKPLSVGRQKNSSD
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pF1KB3 -TQLAPQRVRVTLRPGEPQQLQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALL
        .:.::: . . ::::  : :::.  ..: :::::::::::: :: :::. ...::  : 
CCDS22 IVQIAPQSLILKLRPGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDLSASMDDDLNTIKELGSRLS
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pF1KB3 VRLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGDA
        .....: . :.::::::.: : :::.:.: .. .:: .    :   :.:.:.: ::.::
CCDS22 KEMSKLTSNFRLGFGSFVEKPVSPFVKTTPEEIANPCSSIPYFCLPTFGFKHILPLTNDA
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       . :.. :  :..:.:.:.::::::::.:::.:.:.::::: : .::::.::   : . :.
CCDS22 ERFNEIVKNQKISANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRNDSLHLLVFVSDADSHFGMDS
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pF1KB3 KLGGIFMPSDGHCHLDSNGLYSRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQE
       ::.:: .:.:: :::::.. :: :: ..::..::. . :   :.  :::::.  . .:..
CCDS22 KLAGIVIPNDGLCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQNNVLLIFAVTQEQVHLYEN
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        .:::: ..:: :..::.:..:::..::. : : : ::  .   :...:. . :..    
CCDS22 YAKLIPGATVGLLQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELEVLGDTEGLNLSFTAICNNGTLF
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pF1KB3 EGKAEDRGQCNHVRINQTVTFWVSLQATHCLPEPHLLRLRALGFSEELIVELHTLCDCNC
       . .     .:.:.....:..: :...  ::  . . . .. .:... : . .   :.:.:
CCDS22 QHQK----KCSHMKVGDTASFSVTVNIPHCERRSRHIIIKPVGLGDALELLVSPECNCDC
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pF1KB3 S-DTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPDLESGCR-APNGTGPL
       . ... .. .:  :.: .:::::.: ::..:  :::.   ::.    ..:. ::.   : 
CCDS22 QKEVEVNSSKCHHGNGSFQCGVCACHPGHMGPRCECGEDMLST----DSCKEAPDH--PS
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pF1KB3 CSGKGHCQCGRCSCS----GQSSGHLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRT
       :::.: : ::.: :     :.  :  :.::. :: ::.:.:::: : :.:: : :... :
CCDS22 CSGRGDCYCGQCICHLSPYGNIYGPYCQCDNFSCVRHKGLLCGGNGDCDCGECVCRSGWT
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       :. :.:. . :::.: .: ::::.: : :..: : . :  :  :..:: :  ::. .:.:
CCDS22 GEYCNCTTSTDSCVSEDGVLCSGRGDCVCGKCVCTNPGASGPTCERCPTCGDPCNSKRSC
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pF1KB3 AECGAFRTGPLATNCSTACAHTNVTLALAPILD-DGW--CKERTLDNQLFFFLVEDDARG
        ::    .:    .:   :  ...:..    .. ::   :. .  .. :. ::.  : .:
CCDS22 IECHLSAAGQAREECVDKCKLAGATISEEEDFSKDGSVSCSLQGENECLITFLITTDNEG
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pF1KB3 -TVVLRVRPQE-KGADHTQAIVLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFEKEQQ
        :..  .  ..     .   :.::   .:. .:. :.  ..: : ..::.: ..:: :..
CCDS22 KTIIHSINEKDCPKPPNIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWKLLVSFHDRKEVAKFEAERS
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pF1KB3 QLNWKQDSNPLYKSAITTTINPRFQEADSPTL      
       . .:.  .::::... .:  :  ..             
CCDS22 KAKWQTGTNPLYRGSTSTFKNVTYKHREKQKVDLSTDC
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>>CCDS3030.1 ITGB5 gene_id:3693|Hs108|chr3                (799 aa)
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CCDS30            MPRAPAPLYACLLGLCALLPRLAGLNICTSGSATSCEECLLIHPKCAWC
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CCDS30 SKEDF-GSPRSITSRCDLRANLVKNGCG-GEIESPASSFHVLRSLPLSSKGSGSAGWDVI
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       :..::.. :.::::.   .:..  ..: :::::::::::: ::::::. .:.::  :  .
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       ....: . :.:::::::: . ::  :.:    .::     .  :   :.:.:.: ::  .
CCDS30 MRKLTSNFRLGFGSFVDKDISPFSYTAPRYQTNPCIGYKLFPNCVPSFGFRHLLPLTDRV
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pF1KB3 QAFEREVGRQSVSGNLDSPEGGFDAILQAALCQEQIGWR-NVSRLLVFTSDDTFHTAGDG
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CCDS30 DSFNEEVRKQRVSRNRDAPEGGFDAVLQAAVCKEKIGWRKDALHLLVFTTDDVPHIALDG
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pF1KB3 KLGGIFMPSDGHCHLDSNGLYSRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQE
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CCDS30 KLGGLVQPHDGQCHLNEANEYTASNQMDYPSLALLGEKLAENNINLIFAVTKNHYMLYKN
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pF1KB3 LSKLIPKSAVGELSEDSSNVVQLIMDAYNSLSSTVTLEHSSLPPGVHISYESQCEGPEKR
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CCDS30 FTALIPGTTVEILDGDSKNIIQLIINAYNSIRSKVELSVWDQPEDLNLFFTATCQDGVSY
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pF1KB3 EGKAEDRGQCNHVRINQTVTFWVSLQATHCLPE---PHLLRLRALGFSEELIVELHTLCD
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CCDS30 PGQR----KCEGLKIGDTASFEVSLEARSC-PSRHTEHVFALRPVGFRDSLEVGVTYNCT
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pF1KB3 CNCS-DTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPDLESGCRAPNGTG
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CCDS30 CGCSVGLEPNSARC-NGSGTYVCGLCECSPGYLGTRCECQDGENQSV-YQNLCREAEGK-
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pF1KB3 PLCSGKGHCQCGRCSCS----GQSSGHLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHAN
       :::::.: :.:..:::     :.  : .::::. :: :..:.::.: :.:.:: :.:::.
CCDS30 PLCSGRGDCSCNQCSCFESEFGKIYGPFCECDNFSCARNKGVLCSGHGECHCGECKCHAG
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pF1KB3 RTGRACECSGDMDSCISPEGGLCSGHGRCKCNRCQCLD-GYYGALCDQCPGCKTPCERHR
         :  :.:: :...: . .: .:: .:.: :..::: . : .: .:..:: :   :  .:
CCDS30 YIGDNCNCSTDISTCRGRDGQICSERGHCLCGQCQCTEPGAFGEMCEKCPTCPDACSTKR
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pF1KB3 DCAECGAFRTG-PLATNCSTACAHTNVTLALAPILDDG---WCKERTL-DNQLFFFLVE-
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CCDS30 DCVECLLLHSGKPDNQTCHSLCRDEVITWVDTIVKDDQEAVLCFYKTAKDCVMMFTYVEL
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pF1KB3 -DDARGTVVLRVRPQEKGADHTQAIVLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFE
        .   . .::: .:.  .. ....:.:. ::.:. :::.:.  ..: : :.::::...:.
CCDS30 PSGKSNLTVLR-EPECGNTPNAMTILLAVVGSILLVGLALLAIWKLLVTIHDRREFAKFQ
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pF1KB3 KEQQQLNWKQDSNPLYKSAITT-TINPRFQEADSPTL    
       .:...  ... :::::.. :.: :..  :..          
CCDS30 SERSRARYEMASNPLYRKPISTHTVDFTFNKFNKSYNGTVD
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>>CCDS74596.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2               (746 aa)
 initn: 1389 init1: 581 opt: 1946  Z-score: 1390.2  bits: 268.0 E(32554): 4.1e-71
Smith-Waterman score: 1946; 39.5% identity (68.4% similar) in 740 aa overlap (68-791:6-733)

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CCDS74                          MITYKNFTHPSGVGE--RCDTPANLLAKGCQLNFI
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pF1KB3 EEPRGQQEVLQDQPLSQGARGEGA--TQLAPQRVRVTLRPGEPQQLQVRFLRAEGYPVDL
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CCDS74 ENPVSQVEILKNKPLSVGRQKNSSDIVQIAPQSLILKLRPGGAQTLQVHVRQTEDYPVDL
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pF1KB3 YYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALLVRLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRH
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CCDS74 YYLMDLSASMDDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRLGFGSFVEKPVSPFVKTTPEEIAN
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pF1KB3 PCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGDAQAFEREVGRQSVSGNLDSPEGGFDAILQAALCQEQ
       :: .    :   :.:.:.: ::.::. :.. :  :..:.:.:.::::::::.:::.:.:.
CCDS74 PCSSIPYFCLPTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQKISANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEK
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pF1KB3 IGWRNVS-RLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFMPSDGHCHLDSNGLYSRSTEFDYPSVGQV
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CCDS74 IGWRNDSLHLLVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDGLCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQL
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pF1KB3 AQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQELSKLIPKSAVGELSEDSSNVVQLIMDAYNSLSSTV
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CCDS74 IDKLVQNNVLLIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVGLLQKDSGNILQLIISAYEELRSEV
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pF1KB3 TLEHSSLPPGVHISYESQCEGPEKREGKAEDRGQCNHVRINQTVTFWVSLQATHCLPEPH
        ::  .   :...:. . :..    . .     .:.:.....:..: :...  ::  . .
CCDS74 ELEVLGDTEGLNLSFTAICNNGTLFQHQK----KCSHMKVGDTASFSVTVNIPHCERRSR
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pF1KB3 LLRLRALGFSEELIVELHTLCDCNCS-DTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRLGRLCE
        . .. .:... : . .   :.:.:. ... .. .:  :.: .:::::.: ::..:  ::
CCDS74 HIIIKPVGLGDALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHGNGSFQCGVCACHPGHMGPRCE
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pF1KB3 CSVAELSSPDLESGCR-APNGTGPLCSGKGHCQCGRCSCS----GQSSGHLCECDDASCE
       :.   ::.    ..:. ::.   : :::.: : ::.: :     :.  :  :.::. :: 
CCDS74 CGEDMLST----DSCKEAPDH--PSCSGRGDCYCGQCICHLSPYGNIYGPYCQCDNFSCV
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pF1KB3 RHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSGDMDSCISPEGGLCSGHGRCKCNRCQCL
       ::.:.:::: : :.:: : :... ::. :.:. . :::.: .: ::::.: : :..: : 
CCDS74 RHKGLLCGGNGDCDCGECVCRSGWTGEYCNCTTSTDSCVSEDGVLCSGRGDCVCGKCVCT
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pF1KB3 D-GYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGPLATNCSTACAHTNVTLALAPILD-D
       . :  :  :..:: :  ::. .:.: ::    .:    .:   :  ...:..    .. :
CCDS74 NPGASGPTCERCPTCGDPCNSKRSCIECHLSAAGQAREECVDKCKLAGATISEEEDFSKD
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pF1KB3 GW--CKERTLDNQLFFFLVEDDARG-TVVLRVRPQE-KGADHTQAIVLGCVGGIVAVGLG
       :   :. .  .. :. ::.  : .: :..  .  ..     .   :.::   .:. .:. 
CCDS74 GSVSCSLQGENECLITFLITTDNEGKTIIHSINEKDCPKPPNIPMIMLGVSLAILLIGVV
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pF1KB3 LVLAYRLSVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDSNPLYKSAITTTINPRFQEADSPTL   
       :.  ..: : ..::.: ..:: :... .:.  .::::... .:  :  ..          
CCDS74 LLCIWKLLVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGSTSTFKNVTYKHREKQKVDLS
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CCDS74 TDC
          

>>CCDS74597.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2               (693 aa)
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CCDS74           MGIELLCLFFLFLGRNDHVQGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDLSASM
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pF1KB3 KDDLERVRQLGHALLVRLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLERCQ
        :::. ...::  :  .....: . :.::::::.: : :::.:.: .. .:: .    : 
CCDS74 DDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRLGFGSFVEKPVSPFVKTTPEEIANPCSSIPYFCL
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pF1KB3 SPFSFHHVLSLTGDAQAFEREVGRQSVSGNLDSPEGGFDAILQAALCQEQIGWRNVS-RL
         :.:.:.: ::.::. :.. :  :..:.:.:.::::::::.:::.:.:.::::: : .:
CCDS74 PTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQKISANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRNDSLHL
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pF1KB3 LVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFMPSDGHCHLDSNGLYSRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQ
       :::.::   : . :.::.:: .:.:: :::::.. :: :: ..::..::. . :   :. 
CCDS74 LVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDGLCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQNNVL
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pF1KB3 PIFAVTSAALPVYQELSKLIPKSAVGELSEDSSNVVQLIMDAYNSLSSTVTLEHSSLPPG
        :::::.  . .:.. .:::: ..:: :..::.:..:::..::. : : : ::  .   :
CCDS74 LIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVGLLQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELEVLGDTEG
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pF1KB3 VHISYESQCEGPEKREGKAEDRGQCNHVRINQTVTFWVSLQATHCLPEPHLLRLRALGFS
       ...:. . :..    . .     .:.:.....:..: :...  ::  . . . .. .:..
CCDS74 LNLSFTAICNNGTLFQHQK----KCSHMKVGDTASFSVTVNIPHCERRSRHIIIKPVGLG
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pF1KB3 EELIVELHTLCDCNCS-DTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPD
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CCDS74 DALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHGNGSFQCGVCACHPGHMGPRCECGEDMLST--
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pF1KB3 LESGCR-APNGTGPLCSGKGHCQCGRCSCS----GQSSGHLCECDDASCERHEGILCGGF
         ..:. ::.   : :::.: : ::.: :     :.  :  :.::. :: ::.:.:::: 
CCDS74 --DSCKEAPDH--PSCSGRGDCYCGQCICHLSPYGNIYGPYCQCDNFSCVRHKGLLCGGN
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pF1KB3 GRCQCGVCHCHANRTGRACECSGDMDSCISPEGGLCSGHGRCKCNRCQCLD-GYYGALCD
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CCDS74 GDCDCGECVCRSGWTGEYCNCTTSTDSCVSEDGVLCSGRGDCVCGKCVCTNPGASGPTCE
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pF1KB3 QCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGPLATNCSTACAHTNVTLALAPILD-DGW--CKERTL
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CCDS74 RCPTCGDPCNSKRSCIECHLSAAGQAREECVDKCKLAGATISEEEDFSKDGSVSCSLQGE
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pF1KB3 DNQLFFFLVEDDARG-TVVLRVRPQE-KGADHTQAIVLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVE
       .. :. ::.  : .: :..  .  ..     .   :.::   .:. .:. :.  ..: : 
CCDS74 NECLITFLITTDNEGKTIIHSINEKDCPKPPNIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWKLLVS
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pF1KB3 IYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDSNPLYKSAITTTINPRFQEADSPTL      
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CCDS74 FHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGSTSTFKNVTYKHREKQKVDLSTDC
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>>CCDS63040.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2               (681 aa)
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CCDS63                 MGIELLCLFFLFLGRNDHVQ--GGCALGGAETCEDCLLIGPQCA
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pF1KB3 WCKQLNFT-ASGEAEARRCARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQGARGEGA-
       :: : :::  :: .:  ::    .:::.:: :. .:.: .: :.:...::: : . ... 
CCDS63 WCAQENFTHPSGVGE--RCDTPANLLAKGCQLNFIENPVSQVEILKNKPLSVGRQKNSSD
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pF1KB3 -TQLAPQRVRVTLRPGEPQQLQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALL
        .:.::: . . ::::  : :::.  ..: :::::::::::: :: :::. ...::  : 
CCDS63 IVQIAPQSLILKLRPGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDLSASMDDDLNTIKELGSRLS
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pF1KB3 VRLQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGDA
        .....: . :.::::::.: : :::.:.: .. .:: .    :   :.:.:.: ::.::
CCDS63 KEMSKLTSNFRLGFGSFVEKPVSPFVKTTPEEIANPCSSIPYFCLPTFGFKHILPLTNDA
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pF1KB3 QAFEREVGRQSVSGNLDSPEGGFDAILQAALCQEQIGWRNVS-RLLVFTSDDTFHTAGDG
       . :.. :  :..:.:.:.::::::::.:::.:.:.::::: : .::::.::   : . :.
CCDS63 ERFNEIVKNQKISANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRNDSLHLLVFVSDADSHFGMDS
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pF1KB3 KLGGIFMPSDGHCHLDSNGLYSRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQE
       ::.:: .:.:: :::::.. :: :: ..::..::. . :   :.  :::::.  . .:..
CCDS63 KLAGIVIPNDGLCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQNNVLLIFAVTQEQVHLYEN
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pF1KB3 LSKLIPKSAVGELSEDSSNVVQLIMDAYNSLSSTVTLEHSSLPPGVHISYESQCEGPEKR
        .:::: ..:: :..::.:..:::..::. : : : ::  .   :...:. . :..    
CCDS63 YAKLIPGATVGLLQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELEVLGDTEGLNLSFTAICNNGTLF
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pF1KB3 EGKAEDRGQCNHVRINQTVTFWVSLQATHCLPEPHLLRLRALGFSEELIVELHTLCDCNC
       . .     .:.:.....:..: :...  ::  . . . .. .:... : . .   :.:.:
CCDS63 QHQK----KCSHMKVGDTASFSVTVNIPHCERRSRHIIIKPVGLGDALELLVSPECNCDC
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pF1KB3 S-DTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPDLESGCR-APNGTGPL
       . ... .. .:  :.: .:::::.: ::..:  :::.   ::.    ..:. ::.   : 
CCDS63 QKEVEVNSSKCHHGNGSFQCGVCACHPGHMGPRCECGEDMLST----DSCKEAPDH--PS
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pF1KB3 CSGKGHCQCGRCSCS----GQSSGHLCECDDASCERHEGILCGGF---GRCQCGVCHCHA
       :::.: : ::.: :     :.  :  :.::. :: ::.:.::: :   :  .:..     
CCDS63 CSGRGDCYCGQCICHLSPYGNIYGPYCQCDNFSCVRHKGLLCGDFSKDGSVSCSLQGENE
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pF1KB3 NRTGRACECSGDMDSCISPEGGLCSGHGRCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHR
                                                                   
CCDS63 CLITFLITTDNEGKTIIHSINEKDCPKPPNIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWKLLVSFH
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>>CCDS58599.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17              (1752 aa)
 initn: 1131 init1: 496 opt: 1376  Z-score: 983.1  bits: 193.9 E(32554): 1.9e-48
Smith-Waterman score: 1420; 36.2% identity (64.1% similar) in 654 aa overlap (40-670:25-651)

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pF1KB3 LLLVLSRGESELDAKIPSTGDATEWRNPHLSMLGSCQPAP--SCQKCILSHPSCAWCKQL
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CCDS58       MAGPRPSPWARLLLAALISVSLSGTLANRCKKAPVKSCTECVRVDKDCAYCTDE
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