Result of FASTA (omim) for
pF1KB2497
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB2497, 803 aa
1>>>pF1KB2497 803 - 803 aa - 803 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3563+/-0.000462; mu= 0.6259+/- 0.029
mean_var=488.4519+/-107.902, 0's: 0 Z-trim(122.3): 1457 B-trim: 2715 in 2/60
Lambda= 0.058031
statistics sampled from 38371 (40203) to 38371 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.763), E-opt: 0.2 (0.471), width: 16
Scan time: 15.230
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_009088 (OMIM: 300236) zinc finger X-linked prot ( 803) 5555 480.4 1.3e-134
NP_009087 (OMIM: 300235) zinc finger X-linked prot ( 799) 5297 458.8 4.1e-128
NP_001035743 (OMIM: 615746) zinc finger protein ZX ( 710) 2591 232.2 6.1e-60
XP_005247814 (OMIM: 615746) PREDICTED: zinc finger ( 738) 2586 231.8 8.3e-60
XP_006713804 (OMIM: 615746) PREDICTED: zinc finger ( 769) 2586 231.8 8.5e-60
NP_079388 (OMIM: 615746) zinc finger protein ZXDC ( 858) 2586 231.9 9.1e-60
XP_011511421 (OMIM: 615746) PREDICTED: zinc finger ( 801) 1728 160.0 3.7e-38
XP_005253184 (OMIM: 603433) PREDICTED: zinc finger ( 435) 549 61.0 1.3e-08
XP_016866746 (OMIM: 194549) PREDICTED: zinc finger ( 462) 548 60.9 1.4e-08
XP_016866745 (OMIM: 194549) PREDICTED: zinc finger ( 515) 548 61.0 1.5e-08
NP_001278961 (OMIM: 194549) zinc finger protein 76 ( 515) 548 61.0 1.5e-08
XP_016866743 (OMIM: 194549) PREDICTED: zinc finger ( 524) 548 61.0 1.6e-08
XP_016866742 (OMIM: 194549) PREDICTED: zinc finger ( 524) 548 61.0 1.6e-08
XP_016866741 (OMIM: 194549) PREDICTED: zinc finger ( 527) 548 61.0 1.6e-08
XP_016866740 (OMIM: 194549) PREDICTED: zinc finger ( 536) 548 61.0 1.6e-08
XP_016873745 (OMIM: 603433) PREDICTED: zinc finger ( 606) 549 61.2 1.6e-08
NP_001269586 (OMIM: 603433) zinc finger protein 14 ( 607) 549 61.2 1.6e-08
XP_016873742 (OMIM: 603433) PREDICTED: zinc finger ( 621) 549 61.2 1.6e-08
XP_016873741 (OMIM: 603433) PREDICTED: zinc finger ( 622) 549 61.2 1.6e-08
NP_001269585 (OMIM: 603433) zinc finger protein 14 ( 637) 549 61.2 1.7e-08
XP_016873743 (OMIM: 603433) PREDICTED: zinc finger ( 637) 549 61.2 1.7e-08
XP_016873744 (OMIM: 603433) PREDICTED: zinc finger ( 637) 549 61.2 1.7e-08
XP_011518651 (OMIM: 603433) PREDICTED: zinc finger ( 638) 549 61.2 1.7e-08
NP_003433 (OMIM: 603433) zinc finger protein 143 i ( 638) 549 61.2 1.7e-08
XP_005253179 (OMIM: 603433) PREDICTED: zinc finger ( 652) 549 61.2 1.7e-08
XP_005253178 (OMIM: 603433) PREDICTED: zinc finger ( 653) 549 61.2 1.7e-08
XP_016866744 (OMIM: 194549) PREDICTED: zinc finger ( 517) 542 60.5 2.2e-08
XP_011513158 (OMIM: 194549) PREDICTED: zinc finger ( 519) 542 60.5 2.2e-08
XP_011513156 (OMIM: 194549) PREDICTED: zinc finger ( 526) 542 60.5 2.2e-08
XP_011513157 (OMIM: 194549) PREDICTED: zinc finger ( 526) 542 60.5 2.2e-08
XP_016866738 (OMIM: 194549) PREDICTED: zinc finger ( 570) 542 60.5 2.3e-08
NP_003418 (OMIM: 194549) zinc finger protein 76 is ( 570) 542 60.5 2.3e-08
XP_011513151 (OMIM: 194549) PREDICTED: zinc finger ( 579) 542 60.6 2.3e-08
XP_011513152 (OMIM: 194549) PREDICTED: zinc finger ( 579) 542 60.6 2.3e-08
XP_016866737 (OMIM: 194549) PREDICTED: zinc finger ( 582) 542 60.6 2.4e-08
XP_011513149 (OMIM: 194549) PREDICTED: zinc finger ( 591) 542 60.6 2.4e-08
XP_011513148 (OMIM: 194549) PREDICTED: zinc finger ( 591) 542 60.6 2.4e-08
XP_016882739 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 525 58.8 4.6e-08
NP_001275689 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 349) 525 58.8 4.6e-08
XP_016882745 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 525 58.8 4.6e-08
NP_001275690 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 349) 525 58.8 4.6e-08
XP_016882740 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 525 58.8 4.6e-08
XP_016882741 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 525 58.8 4.6e-08
XP_016882743 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 525 58.8 4.6e-08
XP_016882742 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 525 58.8 4.6e-08
XP_016882744 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 525 58.8 4.6e-08
NP_001275691 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 349) 525 58.8 4.6e-08
NP_001278562 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 665) 525 59.2 6.8e-08
NP_001265438 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 665) 525 59.2 6.8e-08
NP_001265437 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 667) 525 59.2 6.8e-08
>>NP_009088 (OMIM: 300236) zinc finger X-linked protein (803 aa)
initn: 5555 init1: 5555 opt: 5555 Z-score: 2537.7 bits: 480.4 E(85289): 1.3e-134
Smith-Waterman score: 5555; 100.0% identity (100.0% similar) in 803 aa overlap (1-803:1-803)
10 20 30 40 50 60
pF1KB2 MEIPKLLPARGTLQGGGGGGIPAGGGRVHRGPDSPAGQVPTRRLLLLRGPQDGGPGRRRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 MEIPKLLPARGTLQGGGGGGIPAGGGRVHRGPDSPAGQVPTRRLLLLRGPQDGGPGRRRE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB2 EASTASRGPGPSLLAPRTDQPSGGGGGGGDDFFLVLLDPVGGDVETAGSGQAAGPVLREE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 EASTASRGPGPSLLAPRTDQPSGGGGGGGDDFFLVLLDPVGGDVETAGSGQAAGPVLREE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB2 AEEGPGLQGGESGANPAGPTALGPRCLSAVPTPAPISAPGPAAAFAGTVTIHNQDLLLRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 AEEGPGLQGGESGANPAGPTALGPRCLSAVPTPAPISAPGPAAAFAGTVTIHNQDLLLRF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB2 ENGVLTLATPPPHAWEPGAAPAQQPGCLIAPQAGFPHAAHPGDCPELPPDLLLAEPAEPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 ENGVLTLATPPPHAWEPGAAPAQQPGCLIAPQAGFPHAAHPGDCPELPPDLLLAEPAEPA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB2 PAPAPEEEAEGPAAALGPRGPLGSGPGVVLYLCPEAQCGQTFAKKHQLKVHLLTHSSSQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 PAPAPEEEAEGPAAALGPRGPLGSGPGVVLYLCPEAQCGQTFAKKHQLKVHLLTHSSSQG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB2 QRPFKCPLGGCGWTFTTSYKLKRHLQSHDKLRPFGCPAEGCGKSFTTVYNLKAHMKGHEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 QRPFKCPLGGCGWTFTTSYKLKRHLQSHDKLRPFGCPAEGCGKSFTTVYNLKAHMKGHEQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB2 ENSFKCEVCEESFPTQAKLSAHQRSHFEPERPYQCAFSGCKKTFITVSALFSHNRAHFRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 ENSFKCEVCEESFPTQAKLSAHQRSHFEPERPYQCAFSGCKKTFITVSALFSHNRAHFRE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB2 QELFSCSFPGCSKQYDKACRLKIHLRSHTGERPFLCDFDGCGWNFTSMSKLLRHKRKHDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 QELFSCSFPGCSKQYDKACRLKIHLRSHTGERPFLCDFDGCGWNFTSMSKLLRHKRKHDD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB2 DRRFMCPVEGCGKSFTRAEHLKGHSITHLGTKPFVCPVAGCCARFSARSSLYIHSKKHLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 DRRFMCPVEGCGKSFTRAEHLKGHSITHLGTKPFVCPVAGCCARFSARSSLYIHSKKHLQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB2 DVDTWKSRCPISSCNKLFTSKHSMKTHMVKRHKVGQDLLAQLEAANSLTPSSELTSQRQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 DVDTWKSRCPISSCNKLFTSKHSMKTHMVKRHKVGQDLLAQLEAANSLTPSSELTSQRQN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB2 DLSDAEIVSLFSDVPDSTSAALLDTALVNSGILTIDVASVSSTLAGHLPANNNNSVGQAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 DLSDAEIVSLFSDVPDSTSAALLDTALVNSGILTIDVASVSSTLAGHLPANNNNSVGQAV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB2 DPPSLMATSDPPQSLDTSLFFGTAATGFQQSSLNMDEVSSVSVGPLGSLDSLAMKNSSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 DPPSLMATSDPPQSLDTSLFFGTAATGFQQSSLNMDEVSSVSVGPLGSLDSLAMKNSSPE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB2 PQALTPSSKLTVDTDALTPSSTLCENSVSELLTPTKAEWNVHPDSDFFGQEGETQFGFPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 PQALTPSSKLTVDTDALTPSSTLCENSVSELLTPTKAEWNVHPDSDFFGQEGETQFGFPN
730 740 750 760 770 780
790 800
pF1KB2 AAGNHGSQKETDLITVTGSSFLV
:::::::::::::::::::::::
NP_009 AAGNHGSQKETDLITVTGSSFLV
790 800
>>NP_009087 (OMIM: 300235) zinc finger X-linked protein (799 aa)
initn: 4769 init1: 4769 opt: 5297 Z-score: 2421.0 bits: 458.8 E(85289): 4.1e-128
Smith-Waterman score: 5297; 96.1% identity (97.8% similar) in 803 aa overlap (1-803:1-799)
10 20 30 40 50 60
pF1KB2 MEIPKLLPARGTLQGGGGGGIPAGGGRVHRGPDSPAGQVPTRRLLLLRGPQDGGPGRRRE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
NP_009 MEIPKLLPARGTLQGGGGGGIPAGGGRVHRGPDSPAGQVPTRRLLLPRGPQDGGPGRRRE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB2 EASTASRGPGPSLLAPRTDQPSGGGGGGGDDFFLVLLDPVGGDVETAGSGQAAGPVLREE
:::::::::::::.::: :::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 EASTASRGPGPSLFAPRPHQPSG----GGDDFFLVLLDPVGGDVETAGSGQAAGPVLREE
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB2 AEEGPGLQGGESGANPAGPTALGPRCLSAVPTPAPISAPGPAAAFAGTVTIHNQDLLLRF
:. :::::: :::::::: .: ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 AKAGPGLQGDESGANPAGCSAQGPHCLSAVPTPAPISAPGPAAAFAGTVTIHNQDLLLRF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB2 ENGVLTLATPPPHAWEPGAAPAQQPGCLIAPQAGFPHAAHPGDCPELPPDLLLAEPAEPA
::::::::::::::::::::::::: ::::::::::.:::::::::: :::::::::::
NP_009 ENGVLTLATPPPHAWEPGAAPAQQPRCLIAPQAGFPQAAHPGDCPELRSDLLLAEPAEPA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB2 PAPAPEEEAEGPAAALGPRGPLGSGPGVVLYLCPEAQCGQTFAKKHQLKVHLLTHSSSQG
:::::.::::: :::::::: ::::::::::::::: ::::::::::::.::::::::::
NP_009 PAPAPQEEAEGLAAALGPRGLLGSGPGVVLYLCPEALCGQTFAKKHQLKMHLLTHSSSQG
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB2 QRPFKCPLGGCGWTFTTSYKLKRHLQSHDKLRPFGCPAEGCGKSFTTVYNLKAHMKGHEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 QRPFKCPLGGCGWTFTTSYKLKRHLQSHDKLRPFGCPAEGCGKSFTTVYNLKAHMKGHEQ
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB2 ENSFKCEVCEESFPTQAKLSAHQRSHFEPERPYQCAFSGCKKTFITVSALFSHNRAHFRE
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 ENSFKCEVCEESFPTQAKLGAHQRSHFEPERPYQCAFSGCKKTFITVSALFSHNRAHFRE
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB2 QELFSCSFPGCSKQYDKACRLKIHLRSHTGERPFLCDFDGCGWNFTSMSKLLRHKRKHDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 QELFSCSFPGCSKQYDKACRLKIHLRSHTGERPFLCDFDGCGWNFTSMSKLLRHKRKHDD
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB2 DRRFMCPVEGCGKSFTRAEHLKGHSITHLGTKPFVCPVAGCCARFSARSSLYIHSKKHLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 DRRFMCPVEGCGKSFTRAEHLKGHSITHLGTKPFVCPVAGCCARFSARSSLYIHSKKHLQ
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB2 DVDTWKSRCPISSCNKLFTSKHSMKTHMVKRHKVGQDLLAQLEAANSLTPSSELTSQRQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 DVDTWKSRCPISSCNKLFTSKHSMKTHMVKRHKVGQDLLAQLEAANSLTPSSELTSQRQN
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB2 DLSDAEIVSLFSDVPDSTSAALLDTALVNSGILTIDVASVSSTLAGHLPANNNNSVGQAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 DLSDAEIVSLFSDVPDSTSAALLDTALVNSGILTIDVASVSSTLAGHLPANNNNSVGQAV
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB2 DPPSLMATSDPPQSLDTSLFFGTAATGFQQSSLNMDEVSSVSVGPLGSLDSLAMKNSSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 DPPSLMATSDPPQSLDTSLFFGTAATGFQQSSLNMDEVSSVSVGPLGSLDSLAMKNSSPE
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KB2 PQALTPSSKLTVDTDALTPSSTLCENSVSELLTPTKAEWNVHPDSDFFGQEGETQFGFPN
:::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::.:::.::::::::::::::::
NP_009 PQALTPSSKLTVDTDTLTPSSTLCENSVSELLTPAKAEWSVHPNSDFFGQEGETQFGFPN
720 730 740 750 760 770
790 800
pF1KB2 AAGNHGSQKETDLITVTGSSFLV
:::::::::: .:::::::::::
NP_009 AAGNHGSQKERNLITVTGSSFLV
780 790
>>NP_001035743 (OMIM: 615746) zinc finger protein ZXDC i (710 aa)
initn: 2485 init1: 2121 opt: 2591 Z-score: 1197.2 bits: 232.2 E(85289): 6.1e-60
Smith-Waterman score: 2785; 58.4% identity (72.4% similar) in 812 aa overlap (1-803:1-710)
10 20 30 40 50
pF1KB2 MEIPKLLPARGTLQGGGGGGIPAGGGRVHRGPDSPAGQVPTRR-LLLLRGPQDGGPGRRR
:..: :::: : .:: :: : : ..:.: .: : :.:: :::.:::.::::: :
NP_001 MDLPALLPA-PTARGGQHGGGP---GPLRRAP-APLGASPARRRLLLVRGPEDGGPGARP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB2 EEASTASRGPGPSLLAPRTDQPSGGGGGGGDDFFLVLLD-PVGGDVETAGSGQAAGPVLR
::: ::.: : :. .: : :::::. : :: . :...: : : :
NP_001 GEAS----GPSPP---PAEDDSDG-------DSFLVLLEVPHGGAAAEAAGSQEAEPGSR
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB2 EEAEEGPGLQGGESGANPAGPTALGPRCLSAVPTPAPISAPGPAAAFAGTVTIHNQDLLL
. : :.: :.::.: : :::..: ::.::: .::::.
NP_001 VNLASRP-----EQG--PSGPAA---------P-------PGPGVAPAGAVTISSQDLLV
110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KB2 RFENGVLTLATPPPHAWEPGAAPAQQPGCLIAPQAGFPHAAHPGDCPELPPDLLLAEPAE
:.. :::.:..:: : .::: . ::::.
NP_001 RLDRGVLALSAPPGPATAGAAAPRR------APQAS------------------------
140 150 160
240 250 260 270 280 290
pF1KB2 PAPAPAPEEEAEGPAAALGPRGPLGSGPGVVLYLCPEAQCGQTFAKKHQLKVHLLTHSSS
:: : :: : ::: ::. .::::::::::::::...
NP_001 ------------GP-----------STPG---YRCPEPQCALAFAKKHQLKVHLLTHGGG
170 180 190 200
300 310 320 330 340 350
pF1KB2 QGQRPFKCPLGGCGWTFTTSYKLKRHLQSHDKLRPFGCPAEGCGKSFTTVYNLKAHMKGH
::.::::::: ::::.:::::::::::::::::::::::. ::::.::::::::::::::
NP_001 QGRRPFKCPLEGCGWAFTTSYKLKRHLQSHDKLRPFGCPVGGCGKKFTTVYNLKAHMKGH
210 220 230 240 250 260
360 370 380 390 400 410
pF1KB2 EQENSFKCEVCEESFPTQAKLSAHQRSHFEPERPYQCAFSGCKKTFITVSALFSHNRAHF
:::. :::::: : :::.::::.::::::::::::.: : ::.:::::::::::::::::
NP_001 EQESLFKCEVCAERFPTHAKLSSHQRSHFEPERPYKCDFPGCEKTFITVSALFSHNRAHF
270 280 290 300 310 320
420 430 440 450 460 470
pF1KB2 REQELFSCSFPGCSKQYDKACRLKIHLRSHTGERPFLCDFDGCGWNFTSMSKLLRHKRKH
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NP_079 ------------GP-----------STPG---YRCPEPQCALAFAKKHQLKVHLLTHGGG
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:
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]