Result of FASTA (ccds) for pF1KA1825
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1825, 1204 aa
  1>>>pF1KA1825 1204 - 1204 aa - 1204 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9766+/-0.00095; mu= 19.2498+/- 0.057
 mean_var=76.3894+/-15.209, 0's: 0 Z-trim(105.4): 68  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.146743
 statistics sampled from 8358 (8425) to 8358 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.614), E-opt: 0.2 (0.259), width:  16
 Scan time:  5.380

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS32970.2 ATP13A1 gene_id:57130|Hs108|chr19      (1204) 7957 1694.7       0
CCDS44072.1 ATP13A2 gene_id:23400|Hs108|chr1       (1158)  426 100.4 2.8e-20
CCDS44073.1 ATP13A2 gene_id:23400|Hs108|chr1       (1175)  339 82.0 9.8e-15
CCDS175.1 ATP13A2 gene_id:23400|Hs108|chr1         (1180)  339 82.0 9.8e-15


>>CCDS32970.2 ATP13A1 gene_id:57130|Hs108|chr19           (1204 aa)
 initn: 7957 init1: 7957 opt: 7957  Z-score: 9094.0  bits: 1694.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7957; 100.0% identity (100.0% similar) in 1204 aa overlap (1-1204:1-1204)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MAAAAAVGNAVPCGARPCGVRPDGQPKPGPQPRALLAAGPALIANGDELVAAVWPYRRLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MAAAAAVGNAVPCGARPCGVRPDGQPKPGPQPRALLAAGPALIANGDELVAAVWPYRRLA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 LLRRLTVLPFAGLLYPAWLGAAAAGCWGWGSSWVQIPEAALLVLATICLAHALTVLSGHW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLRRLTVLPFAGLLYPAWLGAAAAGCWGWGSSWVQIPEAALLVLATICLAHALTVLSGHW
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 SVHAHCALTCTPEYDPSKATFVKVVPTPNNGSTELVALHRNEGEDGLEVLSFEFQKIKYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SVHAHCALTCTPEYDPSKATFVKVVPTPNNGSTELVALHRNEGEDGLEVLSFEFQKIKYS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 YDALEKKQFLPVAFPVGNAFSYYQSNRGFQEDSEIRAAEKKFGSNKAEMVVPDFSELFKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YDALEKKQFLPVAFPVGNAFSYYQSNRGFQEDSEIRAAEKKFGSNKAEMVVPDFSELFKE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 RATAPFFVFQVFCVGLWCLDEYWYYSVFTLSMLVAFEASLVQQQMRNMSEIRKMGNKPHM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RATAPFFVFQVFCVGLWCLDEYWYYSVFTLSMLVAFEASLVQQQMRNMSEIRKMGNKPHM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 IQVYRSRKWRPIASDEIVPGDIVSIGRSPQENLVPCDVLLLRGRCIVDEAMLTGESVPQM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IQVYRSRKWRPIASDEIVPGDIVSIGRSPQENLVPCDVLLLRGRCIVDEAMLTGESVPQM
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 KEPIEDLSPDRVLDLQADSRLHVIFGGTKVVQHIPPQKATTGLKPVDSGCVAYVLRTGFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KEPIEDLSPDRVLDLQADSRLHVIFGGTKVVQHIPPQKATTGLKPVDSGCVAYVLRTGFN
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 TSQGKLLRTILFGVKRVTANNLETFIFILFLLVFAIAAAAYVWIEGTKDPSRNRYKLFLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TSQGKLLRTILFGVKRVTANNLETFIFILFLLVFAIAAAAYVWIEGTKDPSRNRYKLFLE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 CTLILTSVVPPELPIELSLAVNTSLIALAKLYMYCTEPFRIPFAGKVEVCCFDKTGTLTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CTLILTSVVPPELPIELSLAVNTSLIALAKLYMYCTEPFRIPFAGKVEVCCFDKTGTLTS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 DSLVVRGVAGLRDGKEVTPVSSIPVETHRALASCHSLMQLDDGTLVGDPLEKAMLTAVDW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DSLVVRGVAGLRDGKEVTPVSSIPVETHRALASCHSLMQLDDGTLVGDPLEKAMLTAVDW
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 TLTKDEKVFPRSIKTQGLKIHQRFHFASALKRMSVLASYEKLGSTDLCYIAAVKGAPETL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TLTKDEKVFPRSIKTQGLKIHQRFHFASALKRMSVLASYEKLGSTDLCYIAAVKGAPETL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 HSMFSQCPPDYHHIHTEISREGARVLALGYKELGHLTHQQAREVKREALECSLKFVGFIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HSMFSQCPPDYHHIHTEISREGARVLALGYKELGHLTHQQAREVKREALECSLKFVGFIV
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA1 VSCPLKADSKAVIREIQNASHRVVMITGDNPLTACHVAQELHFIEKAHTLILQPPSEKGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VSCPLKADSKAVIREIQNASHRVVMITGDNPLTACHVAQELHFIEKAHTLILQPPSEKGR
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA1 QCEWRSIDGSIVLPLARGSPKALALEYALCLTGDGLAHLQATDPQQLLRLIPHVQVFARV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QCEWRSIDGSIVLPLARGSPKALALEYALCLTGDGLAHLQATDPQQLLRLIPHVQVFARV
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA1 APKQKEFVITSLKELGYVTLMCGDGTNDVGALKHADVGVALLANAPERVVERRRRPRDSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 APKQKEFVITSLKELGYVTLMCGDGTNDVGALKHADVGVALLANAPERVVERRRRPRDSP
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA1 TLSNSGIRATSRTAKQRSGLPPSEEQPTSQRDRLSQVLRDLEDESTPIVKLGDASIAAPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TLSNSGIRATSRTAKQRSGLPPSEEQPTSQRDRLSQVLRDLEDESTPIVKLGDASIAAPF
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA1 TSKLSSIQCICHVIKQGRCTLVTTLQMFKILALNALILAYSQSVLYLEGVKFSDFQATLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TSKLSSIQCICHVIKQGRCTLVTTLQMFKILALNALILAYSQSVLYLEGVKFSDFQATLQ
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA1 GLLLAGCFLFISRSKPLKTLSRERPLPNIFNLYTILTVMLQFFVHFLSLVYLYREAQARS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GLLLAGCFLFISRSKPLKTLSRERPLPNIFNLYTILTVMLQFFVHFLSLVYLYREAQARS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA1 PEKQEQFVDLYKEFEPSLVNSTVYIMAMAMQMATFAINYKGPPFMESLPENKPLVWSLAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PEKQEQFVDLYKEFEPSLVNSTVYIMAMAMQMATFAINYKGPPFMESLPENKPLVWSLAV
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA1 SLLAIIGLLLGSSPDFNSQFGLVDIPVEFKLVIAQVLLLDFCLALLADRVLQFFLGTPKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SLLAIIGLLLGSSPDFNSQFGLVDIPVEFKLVIAQVLLLDFCLALLADRVLQFFLGTPKL
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

           
pF1KA1 KVPS
       ::::
CCDS32 KVPS
           

>>CCDS44072.1 ATP13A2 gene_id:23400|Hs108|chr1            (1158 aa)
 initn: 834 init1: 186 opt: 426  Z-score: 477.7  bits: 100.4 E(32554): 2.8e-20
Smith-Waterman score: 1033; 27.9% identity (55.1% similar) in 1037 aa overlap (148-1132:138-1035)

       120       130       140       150       160       170       
pF1KA1 GHWSVHAHCALTCTPEYDPSKATFVKVVPTPNNGSTELVALHRNEGEDGLEVLSFE-FQK
                                     :...  . . ::..:  .. .:: .  :: 
CCDS44 QTEAIGEGSLEPSPQSQAEDGRSQAAVGAVPEGAWKDTAQLHKSE--EAKRVLRYYLFQG
       110       120       130       140       150         160     

        180        190        200        210        220       230  
pF1KA1 IKYSYDALEKKQ-FLPVAF-PVGNAFS-YYQSNRGFQ-EDSEIRAAEKKFGSNKAEMVVP
        .: .  .: .: :  :..   : . .  ..: .:.. .:. .: :   .: :   . : 
CCDS44 QRYIW--IETQQAFYQVSLLDHGRSCDDVHRSRHGLSLQDQMVRKA--IYGPNVISIPVK
         170         180       190       200         210       220 

            240       250       260         270        280         
pF1KA1 DFSELFKERATAPFFVFQVFCVGLWCLDEYWYYS--VFTLSML-VAFEASLVQQQMRNMS
       .. .:. ..:  :.. ::.: ..::  :.:..:.  .: .: . . .    ...: ... 
CCDS44 SYPQLLVDEALNPYYGFQAFSIALWLADHYYWYALCIFLISSISICLSLYKTRKQSQTLR
             230       240       250       260       270       280 

     290       300       310       320       330        340        
pF1KA1 EIRKMGNKPHMIQVYRSRKWRPIASDEIVPGDIVSIGRSPQEN-LVPCDVLLLRGRCIVD
       .. :.. .  . .    ..:  . :.:.:::: . .   :::. :.:::. :. :.:.:.
CCDS44 DMVKLSMRVCVCRPGGEEEW--VDSSELVPGDCLVL---PQEGGLMPCDAALVAGECMVN
             290       300         310          320       330      

      350       360        370        380       390       400      
pF1KA1 EAMLTGESVPQMKEPI-EDLSPDRVLDLQADS-RLHVIFGGTKVVQHIPPQKATTGLKPV
       :. :::::.: .:  . : :.:       :.. : :..: :: ..:     .: .:  : 
CCDS44 ESSLTGESIPVLKTALPEGLGP-----YCAETHRRHTLFCGTLILQ----ARAYVG--P-
        340       350            360       370           380       

        410       420       430       440       450       460      
pF1KA1 DSGCVAYVLRTGFNTSQGKLLRTILFGVKRVTANNLETFIFILFLLVFAIAAAAY-VWIE
           .: : :::: :..: :. .::           ... :.  : :.:. .. : ..: 
CCDS44 --HVLAVVTRTGFCTAKGGLVSSILHPRPINFKFYKHSMKFVAALSVLALLGTIYSIFIL
            390       400       410       420       430       440  

         470          480       490       500       510       520  
pF1KA1 GTKDPSRNRYKL---FLECTLILTSVVPPELPIELSLAVNTSLIALAKLYMYCTEPFRIP
             :::  :    ..   ..: :::: ::  ... .  .   : .  ..: .:.:: 
CCDS44 -----YRNRVPLNEIVIRALDLVTVVVPPALPAAMTVCTLYAQSRLRRQGIFCIHPLRIN
                 450       460       470       480       490       

            530       540       550       560            570       
pF1KA1 FAGKVEVCCFDKTGTLTSDSLVVRGVAGLRDGKEVTPV----SSIPV-ETHRALASCHSL
       ..::... ::::::::: :.: : ::. :. :.   :.      .::    ::::.::.:
CCDS44 LGGKLQLVCFDKTGTLTEDGLDVMGVVPLK-GQAFLPLVPEPRRLPVGPLLRALATCHAL
       500       510       520        530       540       550      

       580       590       600          610                        
pF1KA1 MQLDDGTLVGDPLEKAMLTAVDWTLTKD---EKVFPRSI-----------KTQGLK----
        .:.: : ::::..  :. .. :.: ..   ...:  ..           . :...    
CCDS44 SRLQD-TPVGDPMDLKMVESTGWVLEEEPAADSAFGTQVLAVMRPPLWEPQLQAMEEPPV
        560        570       580       590       600       610     

        620       630       640       650       660         670    
pF1KA1 ---IHQRFHFASALKRMSVLASYEKLGSTDLCYIAAVKGAPETLHSMFSQ--CPPDYHHI
          . .:: :.:::.::::....   :.:.    : :::.:: . .. .    : :. ..
CCDS44 PVSVLHRFPFSSALQRMSVVVAWP--GATQPE--AYVKGSPELVAGLCNPETVPTDFAQM
         620       630         640         650       660       670 

          680       690        700       710       720       730   
pF1KA1 HTEISREGARVLALGYKELGHL-THQQAREVKREALECSLKFVGFIVVSCPLKADSKAVI
           .  : ::.::. : :  . . . :... :...: .:...:..:.   :: ..  ::
CCDS44 LQSYTAAGYRVVALASKPLPTVPSLEAAQQLTRDTVEGDLSLLGLLVMRNLLKPQTTPVI
             680       690       700       710       720       730 

           740       750       760        770        780       790 
pF1KA1 REIQNASHRVVMITGDNPLTACHVAQELHFIE-KAHTLILQPPS-EKGRQCEWRSIDGSI
       . .. .  :.::.::::  ::  ::.   ..  . : .:..    :.:.     :..   
CCDS44 QALRRTRIRAVMVTGDNLQTAVTVARGCGMVAPQEHLIIVHATHPERGQPA---SLE---
             740       750       760       770       780           

             800       810       820       830       840       850 
pF1KA1 VLPLARGSPKALALEYALCLTGDGLAHLQATDPQQLLRLIPHVQVFARVAPKQKEFVITS
        ::.   :: :.          .:.            ... .  ::::.::.::  ..  
CCDS44 FLPME--SPTAV----------NGV------------KVLVQGTVFARMAPEQKTELVCE
         790                               800       810       820 

             860       870       880       890       900       910 
pF1KA1 LKELGYVTLMCGDGTNDVGALKHADVGVALLANAPERVVERRRRPRDSPTLSNSGIRATS
       :..: : . :::::.:: :::: ::::..:                              
CCDS44 LQKLQYCVGMCGDGANDCGALKAADVGISL------------------------------
             830       840       850                               

             920       930       940       950       960       970 
pF1KA1 RTAKQRSGLPPSEEQPTSQRDRLSQVLRDLEDESTPIVKLGDASIAAPFTSKLSSIQCIC
                              ::.               .::...::::...::.:. 
CCDS44 -----------------------SQA---------------EASVVSPFTSSMASIECVP
                                                   860       870   

             980       990      1000      1010      1020       1030
pF1KA1 HVIKQGRCTLVTTLQMFKILALNALILAYSQSVLYLEGVKFSDFQATLQGLLLAGCF-LF
        ::..:::.: :....:: .:: .:    :  .::  .....:.:     :...    ..
CCDS44 MVIREGRCSLDTSFSVFKYMALYSLTQFISVLILYTINTNLGDLQFLAIDLVITTTVAVL
           880       890       900       910       920       930   

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pF1KA1 ISRSKPLKTLSRERPLPNIFNLYTILTVMLQFFVHFLSLVYLYREAQARSPEKQEQFVDL
       .::. :  .:.: ::   .... .. ...::     . ::   . .       :  :: :
CCDS44 MSRTGPALVLGRVRPPGALLSVPVLSSLLLQ-----MVLVTGVQLGGYFLTLAQPWFVPL
           940       950       960            970       980        

                  1100      1110      1120      1130      1140     
pF1KA1 YKEFE-----PSLVNSTVYIMAMAMQMATFAINYKGPPFMESLPENKPLVWSLAVSLLAI
        .        :.  :..:. ..  . .   :   :: :: . :  :.             
CCDS44 NRTVAAPDNLPNYENTVVFSLSSFQYLILAAAVSKGAPFRRPLYTNERARPVPPRLPAPP
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pF1KA1 IGLLLGSSPDFNSQFGLVDIPVEFKLVIAQVLLLDFCLALLADRVLQFFLGTPKLKVPS 
                                                                   
CCDS44 PAQAGLQEALQAAGTRAGRAALAAAARRPPEVVQAHGHPRHWNSLPLSHQLDPSPATPPP
     1050      1060      1070      1080      1090      1100        

>>CCDS44073.1 ATP13A2 gene_id:23400|Hs108|chr1            (1175 aa)
 initn: 925 init1: 186 opt: 339  Z-score: 378.0  bits: 82.0 E(32554): 9.8e-15
Smith-Waterman score: 1121; 27.6% identity (55.9% similar) in 1107 aa overlap (148-1191:138-1133)

       120       130       140       150       160       170       
pF1KA1 GHWSVHAHCALTCTPEYDPSKATFVKVVPTPNNGSTELVALHRNEGEDGLEVLSFE-FQK
                                     :...  . . ::..  :.. .:: .  :: 
CCDS44 QTEAIGEGSLEPSPQSQAEDGRSQAAVGAVPEGAWKDTAQLHKS--EEAKRVLRYYLFQG
       110       120       130       140       150         160     

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pF1KA1 IKYSYDALEKKQ-FLPVAF-PVGNAFS-YYQSNRGFQ-EDSEIRAAEKKFGSNKAEMVVP
        .: .  .: .: :  :..   : . .  ..: .:.. .:. .: :   .: :   . : 
CCDS44 QRYIW--IETQQAFYQVSLLDHGRSCDDVHRSRHGLSLQDQMVRKA--IYGPNVISIPVK
         170         180       190       200         210       220 

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pF1KA1 DFSELFKERATAPFFVFQVFCVGLWCLDEYWYYS--VFTLSML-VAFEASLVQQQMRNMS
       .. .:. ..:  :.. ::.: ..::  :.:..:.  .: .: . . .    ...: ... 
CCDS44 SYPQLLVDEALNPYYGFQAFSIALWLADHYYWYALCIFLISSISICLSLYKTRKQSQTLR
             230       240       250       260       270       280 

     290       300       310       320       330        340        
pF1KA1 EIRKMGNKPHMIQVYRSRKWRPIASDEIVPGDIVSIGRSPQEN-LVPCDVLLLRGRCIVD
       .. :.. .  . .    ..:  . :.:.:::: . .   :::. :.:::. :. :.:.:.
CCDS44 DMVKLSMRVCVCRPGGEEEW--VDSSELVPGDCLVL---PQEGGLMPCDAALVAGECMVN
             290       300         310          320       330      

      350       360        370        380       390       400      
pF1KA1 EAMLTGESVPQMKEPI-EDLSPDRVLDLQADS-RLHVIFGGTKVVQHIPPQKATTGLKPV
       :. :::::.: .:  . : :.:       :.. : :..: :: ..:     .: .:  : 
CCDS44 ESSLTGESIPVLKTALPEGLGP-----YCAETHRRHTLFCGTLILQ----ARAYVG--P-
        340       350            360       370           380       

        410       420       430       440       450       460      
pF1KA1 DSGCVAYVLRTGFNTSQGKLLRTILFGVKRVTANNLETFIFILFLLVFAIAAAAY-VWIE
           .: : :::: :..: :. .::           ... :.  : :.:. .. : ..: 
CCDS44 --HVLAVVTRTGFCTAKGGLVSSILHPRPINFKFYKHSMKFVAALSVLALLGTIYSIFIL
            390       400       410       420       430       440  

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pF1KA1 GTKDPSRNRYKL---FLECTLILTSVVPPELPIELSLAVNTSLIALAKLYMYCTEPFRIP
             :::  :    ..   ..: :::: ::  ... .  .   : .  ..: .:.:: 
CCDS44 -----YRNRVPLNEIVIRALDLVTVVVPPALPAAMTVCTLYAQSRLRRQGIFCIHPLRIN
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            530       540       550       560            570       
pF1KA1 FAGKVEVCCFDKTGTLTSDSLVVRGVAGLRDGKEVTPV----SSIPV-ETHRALASCHSL
       ..::... ::::::::: :.: : ::. :. :.   :.      .::    ::::.::.:
CCDS44 LGGKLQLVCFDKTGTLTEDGLDVMGVVPLK-GQAFLPLVPEPRRLPVGPLLRALATCHAL
       500       510       520        530       540       550      

       580       590       600          610                        
pF1KA1 MQLDDGTLVGDPLEKAMLTAVDWTLTKD---EKVFPRSI-----------KTQGLK----
        .:.: : ::::..  :. .. :.: ..   ...:  ..           . :...    
CCDS44 SRLQD-TPVGDPMDLKMVESTGWVLEEEPAADSAFGTQVLAVMRPPLWEPQLQAMEEPPV
        560        570       580       590       600       610     

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pF1KA1 ---IHQRFHFASALKRMSVLASYEKLGSTDLCYIAAVKGAPETLHSMFSQ--CPPDYHHI
          . .:: :.:::.::::....   :.:.    : :::.:: . .. .    : :. ..
CCDS44 PVSVLHRFPFSSALQRMSVVVAWP--GATQPE--AYVKGSPELVAGLCNPETVPTDFAQM
         620       630         640         650       660       670 

          680       690        700       710       720       730   
pF1KA1 HTEISREGARVLALGYKELGHL-THQQAREVKREALECSLKFVGFIVVSCPLKADSKAVI
           .  : ::.::. : :  . . . :... :...: .:...:..:.   :: ..  ::
CCDS44 LQSYTAAGYRVVALASKPLPTVPSLEAAQQLTRDTVEGDLSLLGLLVMRNLLKPQTTPVI
             680       690       700       710       720       730 

           740       750       760        770        780           
pF1KA1 REIQNASHRVVMITGDNPLTACHVAQELHFIE-KAHTLILQPPS-EKGRQC--EWRSIDG
       . .. .  :.::.::::  ::  ::.   ..  . : .:..    :.:.    :.  ...
CCDS44 QALRRTRIRAVMVTGDNLQTAVTVARGCGMVAPQEHLIIVHATHPERGQPASLEFLPMES
             740       750       760       770       780       790 

     790       800              810       820       830       840  
pF1KA1 SIVLPLARGSPKALALEYA-------LCLTGDGLAHLQATDPQQLLRLIPHVQVFARVAP
         ..  ..   .: .           : :.:  .. .    :. : ... .  ::::.::
CCDS44 PTAVNGVKDPDQAASYTVEPDPRSRHLALSGPTFGIIVKHFPKLLPKVLVQGTVFARMAP
             800       810       820       830       840       850 

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pF1KA1 KQKEFVITSLKELGYVTLMCGDGTNDVGALKHADVGVALLANAPERVVERRRRPRDSPTL
       .::  ..  :..: : . :::::.:: :::: ::::..:                     
CCDS44 EQKTELVCELQKLQYCVGMCGDGANDCGALKAADVGISL---------------------
             860       870       880       890                     

            910       920       930       940       950       960  
pF1KA1 SNSGIRATSRTAKQRSGLPPSEEQPTSQRDRLSQVLRDLEDESTPIVKLGDASIAAPFTS
                                 ::                     ..::...::::
CCDS44 --------------------------SQ---------------------AEASVVSPFTS
                                                             900   

            970       980       990      1000      1010      1020  
pF1KA1 KLSSIQCICHVIKQGRCTLVTTLQMFKILALNALILAYSQSVLYLEGVKFSDFQATLQGL
       ...::.:.  ::..:::.: :....:: .:: .:    :  .::  .....:.:     :
CCDS44 SMASIECVPMVIREGRCSLDTSFSVFKYMALYSLTQFISVLILYTINTNLGDLQFLAIDL
           910       920       930       940       950       960   

            1030      1040      1050      1060      1070      1080 
pF1KA1 LLAGCF-LFISRSKPLKTLSRERPLPNIFNLYTILTVMLQFFVHFLSLVYLYREAQARSP
       ...    ...::. :  .:.: ::   .... .. ...::     . ::   . .     
CCDS44 VITTTVAVLMSRTGPALVLGRVRPPGALLSVPVLSSLLLQ-----MVLVTGVQLGGYFLT
           970       980       990      1000           1010        

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pF1KA1 EKQEQFVDLYKEFE-----PSLVNSTVYIMAMAMQMATFAINYKGPPFMESLPENKPLVW
         :  :: : .        :.  :..:. ..  . .   :   :: :: . :  : :.. 
CCDS44 LAQPWFVPLNRTVAAPDNLPNYENTVVFSLSSFQYLILAAAVSKGAPFRRPLYTNVPFLV
     1020      1030      1040      1050      1060      1070        

       1140      1150       1160       1170      1180      1190    
pF1KA1 SLAVSLLAIIGLLLGSSPDF-NSQFGLVDIP-VEFKLVIAQVLLLDFCLALLADRVLQFF
       .::.   ...::.:   : . .. ..: .:  . :::..  .. :.:  :.. . ::   
CCDS44 ALALLSSVLVGLVL--VPGLLQGPLALRNITDTGFKLLLLGLVTLNFVGAFMLESVLDQC
     1080      1090        1100      1110      1120      1130      

         1200                                 
pF1KA1 LGTPKLKVPS                             
                                              
CCDS44 LPACLRRLRPKRASKKRFKQLERELAEQPWPPLPAGPLR
       1140      1150      1160      1170     

>>CCDS175.1 ATP13A2 gene_id:23400|Hs108|chr1              (1180 aa)
 initn: 925 init1: 186 opt: 339  Z-score: 378.0  bits: 82.0 E(32554): 9.8e-15
Smith-Waterman score: 1113; 27.6% identity (55.8% similar) in 1110 aa overlap (148-1191:138-1138)

       120       130       140       150       160          170    
pF1KA1 GHWSVHAHCALTCTPEYDPSKATFVKVVPTPNNGSTELVALHRNEGEDGL---EVLSFE-
                                     :...  . . ::..:   ..   .:: .  
CCDS17 QTEAIGEGSLEPSPQSQAEDGRSQAAVGAVPEGAWKDTAQLHKSEEAVSVGQKRVLRYYL
       110       120       130       140       150       160       

           180        190        200        210        220         
pF1KA1 FQKIKYSYDALEKKQ-FLPVAF-PVGNAFS-YYQSNRGFQ-EDSEIRAAEKKFGSNKAEM
       ::  .: .  .: .: :  :..   : . .  ..: .:.. .:. .: :   .: :   .
CCDS17 FQGQRYIW--IETQQAFYQVSLLDHGRSCDDVHRSRHGLSLQDQMVRKA--IYGPNVISI
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pF1KA1 VVPDFSELFKERATAPFFVFQVFCVGLWCLDEYWYYS--VFTLSML-VAFEASLVQQQMR
        : .. .:. ..:  :.. ::.: ..::  :.:..:.  .: .: . . .    ...: .
CCDS17 PVKSYPQLLVDEALNPYYGFQAFSIALWLADHYYWYALCIFLISSISICLSLYKTRKQSQ
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pF1KA1 NMSEIRKMGNKPHMIQVYRSRKWRPIASDEIVPGDIVSIGRSPQEN-LVPCDVLLLRGRC
       .. .. :.. .  . .    ..:  . :.:.:::: . .   :::. :.:::. :. :.:
CCDS17 TLRDMVKLSMRVCVCRPGGEEEW--VDSSELVPGDCLVL---PQEGGLMPCDAALVAGEC
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pF1KA1 IVDEAMLTGESVPQMKEPI-EDLSPDRVLDLQADS-RLHVIFGGTKVVQHIPPQKATTGL
       .:.:. :::::.: .:  . : :.:       :.. : :..: :: ..:     .: .: 
CCDS17 MVNESSLTGESIPVLKTALPEGLGP-----YCAETHRRHTLFCGTLILQ----ARAYVG-
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pF1KA1 KPVDSGCVAYVLRTGFNTSQGKLLRTILFGVKRVTANNLETFIFILFLLVFAIAAAAY-V
        :     .: : :::: :..: :. .::           ... :.  : :.:. .. : .
CCDS17 -P---HVLAVVTRTGFCTAKGGLVSSILHPRPINFKFYKHSMKFVAALSVLALLGTIYSI
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pF1KA1 WIEGTKDPSRNRYKL---FLECTLILTSVVPPELPIELSLAVNTSLIALAKLYMYCTEPF
       .:       :::  :    ..   ..: :::: ::  ... .  .   : .  ..: .:.
CCDS17 FIL-----YRNRVPLNEIVIRALDLVTVVVPPALPAAMTVCTLYAQSRLRRQGIFCIHPL
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pF1KA1 RIPFAGKVEVCCFDKTGTLTSDSLVVRGVAGLRDGKEVTPV----SSIPV-ETHRALASC
       :: ..::... ::::::::: :.: : ::. :. :.   :.      .::    ::::.:
CCDS17 RINLGGKLQLVCFDKTGTLTEDGLDVMGVVPLK-GQAFLPLVPEPRRLPVGPLLRALATC
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pF1KA1 HSLMQLDDGTLVGDPLEKAMLTAVDWTLTKD---EKVFPRSI-----------KTQGLK-
       :.: .:.: : ::::..  :. .. :.: ..   ...:  ..           . :... 
CCDS17 HALSRLQD-TPVGDPMDLKMVESTGWVLEEEPAADSAFGTQVLAVMRPPLWEPQLQAMEE
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pF1KA1 ------IHQRFHFASALKRMSVLASYEKLGSTDLCYIAAVKGAPETLHSMFSQ--CPPDY
             . .:: :.:::.::::....   :.:.    : :::.:: . .. .    : :.
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pF1KA1 HHIHTEISREGARVLALGYKELGHL-THQQAREVKREALECSLKFVGFIVVSCPLKADSK
        ..    .  : ::.::. : :  . . . :... :...: .:...:..:.   :: .. 
CCDS17 AQMLQSYTAAGYRVVALASKPLPTVPSLEAAQQLTRDTVEGDLSLLGLLVMRNLLKPQTT
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pF1KA1 AVIREIQNASHRVVMITGDNPLTACHVAQELHFIE-KAHTLILQPPS-EKGRQC--EWRS
        ::. .. .  :.::.::::  ::  ::.   ..  . : .:..    :.:.    :.  
CCDS17 PVIQALRRTRIRAVMVTGDNLQTAVTVARGCGMVAPQEHLIIVHATHPERGQPASLEFLP
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pF1KA1 IDGSIVLPLARGSPKALALEYA-------LCLTGDGLAHLQATDPQQLLRLIPHVQVFAR
       ...  ..  ..   .: .           : :.:  .. .    :. : ... .  ::::
CCDS17 MESPTAVNGVKDPDQAASYTVEPDPRSRHLALSGPTFGIIVKHFPKLLPKVLVQGTVFAR
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pF1KA1 VAPKQKEFVITSLKELGYVTLMCGDGTNDVGALKHADVGVALLANAPERVVERRRRPRDS
       .::.::  ..  :..: : . :::::.:: :::: ::::..:                  
CCDS17 MAPEQKTELVCELQKLQYCVGMCGDGANDCGALKAADVGISL------------------
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                                    ::                     ..::...:
CCDS17 -----------------------------SQ---------------------AEASVVSP
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pF1KA1 FTSKLSSIQCICHVIKQGRCTLVTTLQMFKILALNALILAYSQSVLYLEGVKFSDFQATL
       :::...::.:.  ::..:::.: :....:: .:: .:    :  .::  .....:.:   
CCDS17 FTSSMASIECVPMVIREGRCSLDTSFSVFKYMALYSLTQFISVLILYTINTNLGDLQFLA
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pF1KA1 QGLLLAGCF-LFISRSKPLKTLSRERPLPNIFNLYTILTVMLQFFVHFLSLVYLYREAQA
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CCDS17 IDLVITTTVAVLMSRTGPALVLGRVRPPGALLSVPVLSSLLLQ-----MVLVTGVQLGGY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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