Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1450
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1450, 1114 aa
1>>>pF1KA1450 1114 - 1114 aa - 1114 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0469+/-0.000942; mu= 14.3391+/- 0.057
mean_var=115.0726+/-22.366, 0's: 0 Z-trim(108.9): 21 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.119561
statistics sampled from 10520 (10524) to 10520 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.323), width: 16
Scan time: 3.850
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47155.1 FNIP2 gene_id:57600|Hs108|chr4 (1114) 7440 1295.0 0
CCDS34226.1 FNIP1 gene_id:96459|Hs108|chr5 (1138) 2225 395.5 3.6e-109
CCDS34227.1 FNIP1 gene_id:96459|Hs108|chr5 (1166) 1608 289.1 4e-77
>>CCDS47155.1 FNIP2 gene_id:57600|Hs108|chr4 (1114 aa)
initn: 7440 init1: 7440 opt: 7440 Z-score: 6935.0 bits: 1295.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7440; 100.0% identity (100.0% similar) in 1114 aa overlap (1-1114:1-1114)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MAPTLLQKLFNKRGSSGSSAAASAQGRAPKEGPAFSWSCSEFDLNEIRLIVYQDCDRRGR
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CCDS47 MAPTLLQKLFNKRGSSGSSAAASAQGRAPKEGPAFSWSCSEFDLNEIRLIVYQDCDRRGR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 QVLFDSKAVQKIEEVTAQKTEDVPIKISAKCCQGSSSVSSSSSSSISSHSSSGGSSHHAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QVLFDSKAVQKIEEVTAQKTEDVPIKISAKCCQGSSSVSSSSSSSISSHSSSGGSSHHAK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 EQLPKYQYTRPASDVNMLGEMMFGSVAMSYKGSTLKIHYIRSPPQLMISKVFSARMGSFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EQLPKYQYTRPASDVNMLGEMMFGSVAMSYKGSTLKIHYIRSPPQLMISKVFSARMGSFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 GSTNNLQDSFEYINQDPNLGKLNTNQNSLGPCRTGSNLAHSTPVDMPSRGQNEDRDSGIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GSTNNLQDSFEYINQDPNLGKLNTNQNSLGPCRTGSNLAHSTPVDMPSRGQNEDRDSGIA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 RSASLSSLLITPFPSPSSSTSSSSSYQRRWLRSQTTSLENGIIPRRSTDETFSLAEETCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RSASLSSLLITPFPSPSSSTSSSSSYQRRWLRSQTTSLENGIIPRRSTDETFSLAEETCS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 SNPAMVRRKKIAISIIFSLCEKEEAQRNFQDFFFSHFPLFESHMNRLKSAIEKAMISCRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SNPAMVRRKKIAISIIFSLCEKEEAQRNFQDFFFSHFPLFESHMNRLKSAIEKAMISCRK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 IAESSLRVQFYVSRLMEALGEFRGTIWNLYSVPRIAEPVWLTMMSGTLEKNQLCQRFLKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IAESSLRVQFYVSRLMEALGEFRGTIWNLYSVPRIAEPVWLTMMSGTLEKNQLCQRFLKE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 FTLLIEQINKNQFFAALLTAVLTYHLAWVPTVMPVDHPPIKAFSEKRTSQSVNMLAKTHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FTLLIEQINKNQFFAALLTAVLTYHLAWVPTVMPVDHPPIKAFSEKRTSQSVNMLAKTHP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 YNPLWAQLGDLYGAIGSPVRLTRTVVVGKQKDLVQRILYVLTYFLRCSELQENQLTWSGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YNPLWAQLGDLYGAIGSPVRLTRTVVVGKQKDLVQRILYVLTYFLRCSELQENQLTWSGN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 HGEGDQVLNGSKIITALEKGEVEESEYVVITVRNEPALVPPILPPTAAERHNPWPTGFPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HGEGDQVLNGSKIITALEKGEVEESEYVVITVRNEPALVPPILPPTAAERHNPWPTGFPE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 CPEGTDSRDLGLKPDKEANRRPEQGSEACSAGCLGPASDASWKPQNAFCGDEKNKEAPQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 CPEGTDSRDLGLKPDKEANRRPEQGSEACSAGCLGPASDASWKPQNAFCGDEKNKEAPQD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 GSSRLPSCEVLGAGMKMDQQAVCELLKVEMPTRLPDRSVAWPCPDRHLREKPSLEKVTFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GSSRLPSCEVLGAGMKMDQQAVCELLKVEMPTRLPDRSVAWPCPDRHLREKPSLEKVTFQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 IGSFASPESDFESRMKKMEERVKACGPSLEASEAADVAQDPQVSRSPFKPGFQENVCCPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IGSFASPESDFESRMKKMEERVKACGPSLEASEAADVAQDPQVSRSPFKPGFQENVCCPQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 NRLSEGDEGESDKGFAEDRGSRNDMAADIAGQLSHAADLGTASHGAGGTGGRRLEATRGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NRLSEGDEGESDKGFAEDRGSRNDMAADIAGQLSHAADLGTASHGAGGTGGRRLEATRGL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 YVKAAEGPVLEPVAPRCVQRGPGLVAGANIPCGDDNKKANFRTEGDIPRNESSDSALGDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YVKAAEGPVLEPVAPRCVQRGPGLVAGANIPCGDDNKKANFRTEGDIPRNESSDSALGDS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 DDEACASAMLDLGHGGDRTGGSLEVELPLPRSQSISTQNVRNFGRSLLAGYCPTYMPDLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DDEACASAMLDLGHGGDRTGGSLEVELPLPRSQSISTQNVRNFGRSLLAGYCPTYMPDLV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 LHGTGSDEKLKQCLVADLVHTVHHPVLDEPIAEAVCIIADTDKWSVQVATSQRKVTDNMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LHGTGSDEKLKQCLVADLVHTVHHPVLDEPIAEAVCIIADTDKWSVQVATSQRKVTDNMK
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 LGQDVLVSSQVSSLLQSILQLYKLHLPADFCIMHLEDRLQEMYLKSKMLSEYLRGHTRVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LGQDVLVSSQVSSLLQSILQLYKLHLPADFCIMHLEDRLQEMYLKSKMLSEYLRGHTRVH
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110
pF1KA1 VKELGVVLGIESNDLPLLTAIASTHSPYVAQILL
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VKELGVVLGIESNDLPLLTAIASTHSPYVAQILL
1090 1100 1110
>>CCDS34226.1 FNIP1 gene_id:96459|Hs108|chr5 (1138 aa)
initn: 2230 init1: 843 opt: 2225 Z-score: 2073.4 bits: 395.5 E(32554): 3.6e-109
Smith-Waterman score: 3305; 51.1% identity (71.2% similar) in 1157 aa overlap (1-1112:1-1136)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MAPTLLQKLFNKRGSSGSSAAASAQGRAPKEGPAFSWSCSEFDLNEIRLIVYQDCDRRGR
:::::.::::.:: . : : . ..: : : ::: ::: ..:::::::::.::::
CCDS34 MAPTLFQKLFSKRTGLG---APGRDARDPDCG--FSWPLPEFDPSQIRLIVYQDCERRGR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KA1 QVLFDSKAVQKIEEVTAQKT-EDVPIKISAKCCQGSSSVSSSSSSSISSHSSSGGSSHHA
.:::::.. .. :.....: :. .:. .:::: . . .:::: . : :::
CCDS34 NVLFDSSVKRRNEDISVSKLGSDAQVKVFGKCCQLKPGGDSSSSLDSSVTSSSD-----I
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 KEQLPKYQYTRPASDVNMLGEMMFGSVAMSYKGSTLKIHYIRSPPQLMISKVFSARMGS-
:.: ::: .: .::.::::::::::::::::::::::: ::::::::.::::.:: ::
CCDS34 KDQCLKYQGSRCSSDANMLGEMMFGSVAMSYKGSTLKIHQIRSPPQLMLSKVFTARTGSS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 FCGSTNNLQDSFEYINQDPNLGKLNTNQNSLGPCRTGSNLAHSTPVDMPSRGQNEDRDSG
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CCDS34 ICGSLNTLQDSLEFINQDNNT--LKADNNTVINGLLG-NIVHSNPMDMPGRELNEDRDSG
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 IARSASLSSLLITPFPSPSSSTSSS--SSYQRRWLRSQTTSLENGIIPRRSTDETFSLAE
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CCDS34 IARSASLSSLLITPFPSPNSSLTRSCASSYQRRWRRSQTTSLENGVFPRWSIEESFNLSD
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 ETCSSNPAMVRRKKIAISIIFSLCEKEEAQRNFQDFFFSHFPLFESHMNRLKSAIEKAMI
:.:. ::..::.:::::..:::: . :. . .:..::::::::::::::.::::::.::
CCDS34 ESCGPNPGIVRKKKIAIGVIFSLSKDEDENNKFNEFFFSHFPLFESHMNKLKSAIEQAMK
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 SCRKIAESSLRVQFYVSRLMEALGEFRGTIWNLYSVPRIAEPVWLTMMSGTLEKNQLCQR
:. :..: : : .:...::.::: :: :::..:::.::::::::::: :::.:: :
CCDS34 MSRRSADASQRSLAY-NRIVDALNEFRTTICNLYTMPRIGEPVWLTMMSGTPEKNHLCYR
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 FLKEFTLLIEQINKNQFFAALLTAVLTYHLAWVPTVMPVDHPPIKAFSEKRTSQSVNMLA
:.::::.:.:. .::::. ::.::::: :::::::::: .:::: : ::..::::.:::
CCDS34 FMKEFTFLMENASKNQFLPALITAVLTNHLAWVPTVMPNGQPPIKIFLEKHSSQSVDMLA
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 KTHPYNPLWAQLGDLYGAIGSPVRLTRTVVVGKQKDLVQRILYVLTYFLRCSELQENQLT
:::::::::::::::::::::::::.:::::::..:.:::.:: ::::.:::::::..:
CCDS34 KTHPYNPLWAQLGDLYGAIGSPVRLARTVVVGKRQDMVQRLLYFLTYFIRCSELQETHLL
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 WSGNHGEGDQ-VLNGSKIITALEKGEVEESEYVVITV-RNEPALVPPILPPTAAERHNPW
..:: . :. :. : :.:::::.::::::..:. ::. .:. . :
CCDS34 ---ENGEDEAIVMPGTVITTTLEKGEIEESEYVLVTMHRNKSSLLFKESEEIRTPNCNCK
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640
pF1KA1 PTGFPECPEGTDSRDLGLKPDKEANRRPEQG-SEACS----AGCLGP-ASDAS-WKPQNA
. : ..... . . : . . . : :. :. . : : :.. .. .
CCDS34 YCSHPLLGQNVENISQQEREDIQNSSKELLGISDECQMISPSDCQEENAVDVKQYRDKLR
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KA1 FCGDEKNKEAPQDGSSRLPSCEVLGAGMKMDQQA--VCELLKVEMPTRLPDRS----VAW
: : : . . :: . .: . .:.. ... .:: . : :: :
CCDS34 TCFDAKLETVVCTGSVPVDKCALSESGLESTEETWQSEKLLDSDSHTGKAMRSTGMVVEK
650 660 670 680 690 700
710 720 730 740 750
pF1KA1 PCPDRHLREKPSLE----KVTFQIGSFASPESDFESRMKKMEERV--KACGPSLEASEAA
::. . . : : :::: ::. ::.:: : : . . ... . : : :
CCDS34 KPPDKIVPASFSCEAAQTKVTFLIGDSMSPDSDTELRSQAVVDQITRHHTKPLKEERGAI
710 720 730 740 750 760
760 770 780 790 800
pF1KA1 DVAQDP------QVSRSPFKPGFQENVC---CPQNRLSEGDEGESDKGFAEDRGSRNDMA
: :. : ..: . .:. : : :. . . . :. : .: . ..
CCDS34 DQHQETKQTTKDQSGESDTQNMVSEEPCELPC-WNHSDPESMSLFDEYFNDD-SIETRTI
770 780 790 800 810 820
810 820 830 840 850 860
pF1KA1 ADIAGQLSHAADLGTASHGAGGTGGRRLEATRGLYVKAAEGPVLEPVAPRCV-QRGPGLV
:. . : . . . . . . : : : . : :. .
CCDS34 DDVPFKTSTDSKDHCCMLEFSKILCTKNNKQNNEFCKCIE-TVPQDSCKTCFPQQDQRDT
830 840 850 860 870 880
870 880 890 900 910
pF1KA1 AGANIPCGD---DNKKANFRTEGDIPRNESSDSALGDSDDEACASAM---LDLGHGGDRT
. .: :: ..:: :: :::::::::::::::..: . : .. .::..
CCDS34 LSILVPHGDKESSDKKIAVGTEWDIPRNESSDSALGDSESEDTGHDMTRQVSSYYGGEQE
890 900 910 920 930 940
920 930 940 950 960 970
pF1KA1 GGSLEVELPLPRSQSISTQ----NVRNFGRSLLAGYCPTYMPDLVLHGTGSDEKLKQCLV
. : :.:.: :. : .. :. :::::::.::: .:.::.::.: ::::...:::.
CCDS34 DWAEEDEIPFPGSKLIEVSAVQPNIANFGRSLLGGYCSSYVPDFVLQGIGSDERFRQCLM
950 960 970 980 990 1000
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KA1 ADLVHTVHHPVLDEPIAEAVCIIADTDKWSVQVATSQRKVTDNMKLGQDVLVSSQVSSLL
.:: :.:.::::::::::::::::: :::.::::.:::.:::: :::..::::: ::.::
CCDS34 SDLSHAVQHPVLDEPIAEAVCIIADMDKWTVQVASSQRRVTDN-KLGKEVLVSSLVSNLL
1010 1020 1030 1040 1050
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KA1 QSILQLYKLHLPADFCIMHLEDRLQEMYLKSKMLSEYLRGHTRVHVKELGVVLGIESNDL
.: ::::: .: .::.:::::::::.:.:::::::::::. :::::::::::::::.::
CCDS34 HSTLQLYKHNLSPNFCVMHLEDRLQELYFKSKMLSEYLRGQMRVHVKELGVVLGIESSDL
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1100 1110
pF1KA1 PLLTAIASTHSPYVAQILL
:::.:.:::::::::::
CCDS34 PLLAAVASTHSPYVAQILL
1120 1130
>>CCDS34227.1 FNIP1 gene_id:96459|Hs108|chr5 (1166 aa)
initn: 2352 init1: 843 opt: 1608 Z-score: 1498.0 bits: 289.1 E(32554): 4e-77
Smith-Waterman score: 3273; 50.3% identity (70.1% similar) in 1182 aa overlap (1-1112:1-1164)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MAPTLLQKLFNKRGSSGSSAAASAQGRAPKEGPAFSWSCSEFDLNEIRLIVYQDCDRRGR
:::::.::::.:: . : : . ..: : : ::: ::: ..:::::::::.::::
CCDS34 MAPTLFQKLFSKRTGLG---APGRDARDPDCG--FSWPLPEFDPSQIRLIVYQDCERRGR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KA1 QVLFDSKAVQKIEEVTAQKT-EDVPIKISAKCCQGSSSVSSSSSSSISSHSSSGGSSHHA
.:::::.. .. :.....: :. .:. .:::: . . .:::: . : :::
CCDS34 NVLFDSSVKRRNEDISVSKLGSDAQVKVFGKCCQLKPGGDSSSSLDSSVTSSSD-----I
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 KEQLPKYQYTRPASDVNMLGEMMFGSVAMSYKGSTLKIHYIRSPPQLMISKVFSARMGS-
:.: ::: .: .::.::::::::::::::::::::::: ::::::::.::::.:: ::
CCDS34 KDQCLKYQGSRCSSDANMLGEMMFGSVAMSYKGSTLKIHQIRSPPQLMLSKVFTARTGSS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210
pF1KA1 FCGSTNNLQDSFEYINQDPN-------------LGKLNTNQ--------NSLGPCR---T
.::: :.::::.:.:::: : ::... .: . :: : .
CCDS34 ICGSLNTLQDSLEFINQDNNTLKADNNTVINGLLGNIGLSQFCSPRRAFSEQGPLRLIRS
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 GSNLA-HSTPVDMPSRGQNEDRDSGIARSASLSSLLITPFPSPSSSTSSS--SSYQRRWL
.: .: ::.:.:::.: :::::::::::::::::::::::::.:: . : :::::::
CCDS34 ASFFAVHSNPMDMPGRELNEDRDSGIARSASLSSLLITPFPSPNSSLTRSCASSYQRRWR
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 RSQTTSLENGIIPRRSTDETFSLAEETCSSNPAMVRRKKIAISIIFSLCEKEEAQRNFQD
::::::::::..:: : .:.:.:..:.:. ::..::.:::::..:::: . :. . .:..
CCDS34 RSQTTSLENGVFPRWSIEESFNLSDESCGPNPGIVRKKKIAIGVIFSLSKDEDENNKFNE
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 FFFSHFPLFESHMNRLKSAIEKAMISCRKIAESSLRVQFYVSRLMEALGEFRGTIWNLYS
::::::::::::::.::::::.:: :. :..: : : .:...::.::: :: :::.
CCDS34 FFFSHFPLFESHMNKLKSAIEQAMKMSRRSADASQRSLAY-NRIVDALNEFRTTICNLYT
360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 VPRIAEPVWLTMMSGTLEKNQLCQRFLKEFTLLIEQINKNQFFAALLTAVLTYHLAWVPT
.:::.::::::::::: :::.:: ::.::::.:.:. .::::. ::.::::: :::::::
CCDS34 MPRIGEPVWLTMMSGTPEKNHLCYRFMKEFTFLMENASKNQFLPALITAVLTNHLAWVPT
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 VMPVDHPPIKAFSEKRTSQSVNMLAKTHPYNPLWAQLGDLYGAIGSPVRLTRTVVVGKQK
::: .:::: : ::..::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::::::..
CCDS34 VMPNGQPPIKIFLEKHSSQSVDMLAKTHPYNPLWAQLGDLYGAIGSPVRLARTVVVGKRQ
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 DLVQRILYVLTYFLRCSELQENQLTWSGNHGEGDQ-VLNGSKIITALEKGEVEESEYVVI
:.:::.:: ::::.:::::::..: ..:: . :. :. : :.:::::.::::::..
CCDS34 DMVQRLLYFLTYFIRCSELQETHLL---ENGEDEAIVMPGTVITTTLEKGEIEESEYVLV
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620
pF1KA1 TV-RNEPALVPPILPPTAAERHNPWPTGFPECPEGTDSRDLGLKPDKEANRRPEQG-SEA
:. ::. .:. . : . : ..... . . : . . . : :.
CCDS34 TMHRNKSSLLFKESEEIRTPNCNCKYCSHPLLGQNVENISQQEREDIQNSSKELLGISDE
590 600 610 620 630 640
630 640 650 660 670 680
pF1KA1 CS----AGCLGP-ASDAS-WKPQNAFCGDEKNKEAPQDGSSRLPSCEVLGAGMKMDQQA-
:. . : : :.. .. . : : : . . :: . .: . .:.. ...
CCDS34 CQMISPSDCQEENAVDVKQYRDKLRTCFDAKLETVVCTGSVPVDKCALSESGLESTEETW
650 660 670 680 690 700
690 700 710 720 730
pF1KA1 -VCELLKVEMPTRLPDRS----VAWPCPDRHLREKPSLE----KVTFQIGSFASPESDFE
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