Result of FASTA (omim) for
pF1KA1119
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1119, 1849 aa
1>>>pF1KA1119 1849 - 1849 aa - 1849 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9212+/-0.000725; mu= -0.5959+/- 0.044
mean_var=525.4062+/-114.245, 0's: 0 Z-trim(112.3): 398 B-trim: 40 in 1/56
Lambda= 0.055953
statistics sampled from 20837 (21215) to 20837 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.553), E-opt: 0.2 (0.249), width: 16
Scan time: 17.850
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001073936 (OMIM: 251850,606540) unconventional (1848) 12048 990.5 0
NP_000250 (OMIM: 160777,214450) unconventional myo (1855) 7519 624.9 2.2e-177
XP_011519910 (OMIM: 160777,214450) PREDICTED: unco (1879) 7492 622.8 1e-176
XP_011519912 (OMIM: 160777,214450) PREDICTED: unco (1876) 7486 622.3 1.4e-176
XP_011519911 (OMIM: 160777,214450) PREDICTED: unco (1877) 7153 595.4 1.7e-168
XP_005254454 (OMIM: 160777,214450) PREDICTED: unco (1880) 5523 463.8 7.1e-129
XP_011519909 (OMIM: 160777,214450) PREDICTED: unco (1901) 5502 462.1 2.3e-128
XP_011519908 (OMIM: 160777,214450) PREDICTED: unco (1904) 5494 461.5 3.6e-128
NP_001135967 (OMIM: 160777,214450) unconventional (1828) 5178 435.9 1.7e-120
XP_011519914 (OMIM: 160777,214450) PREDICTED: unco (1849) 5158 434.3 5.2e-120
XP_011519913 (OMIM: 160777,214450) PREDICTED: unco (1852) 5151 433.8 7.7e-120
NP_061198 (OMIM: 610022) unconventional myosin-Vc (1742) 3968 338.2 4.2e-91
XP_011520083 (OMIM: 610022) PREDICTED: unconventio (1714) 3761 321.5 4.4e-86
XP_016877716 (OMIM: 160777,214450) PREDICTED: unco (1868) 3464 297.6 7.7e-79
XP_016877897 (OMIM: 610022) PREDICTED: unconventio (1697) 2917 253.4 1.4e-65
XP_016877898 (OMIM: 610022) PREDICTED: unconventio (1455) 2561 224.6 5.8e-57
XP_011520804 (OMIM: 132900,160745) PREDICTED: myos (1929) 2044 183.0 2.5e-44
NP_074035 (OMIM: 132900,160745) myosin-11 isoform (1938) 2044 183.0 2.5e-44
NP_002465 (OMIM: 132900,160745) myosin-11 isoform (1972) 2044 183.0 2.5e-44
XP_016880171 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (1976) 2014 180.6 1.4e-43
XP_016880170 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (1976) 2014 180.6 1.4e-43
NP_005955 (OMIM: 160776) myosin-10 isoform 2 [Homo (1976) 2014 180.6 1.4e-43
XP_011522182 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (2006) 2014 180.6 1.4e-43
XP_016884292 (OMIM: 153640,153650,155100,160775,60 (1960) 1972 177.2 1.4e-42
XP_016884294 (OMIM: 153640,153650,155100,160775,60 (1960) 1972 177.2 1.4e-42
XP_016884293 (OMIM: 153640,153650,155100,160775,60 (1960) 1972 177.2 1.4e-42
XP_016884295 (OMIM: 153640,153650,155100,160775,60 (1960) 1972 177.2 1.4e-42
XP_011528499 (OMIM: 153640,153650,155100,160775,60 (1960) 1972 177.2 1.4e-42
NP_002464 (OMIM: 153640,153650,155100,160775,60020 (1960) 1972 177.2 1.4e-42
XP_016876829 (OMIM: 160500,160760,181430,192600,25 (1935) 1948 175.2 5.4e-42
NP_000248 (OMIM: 160500,160760,181430,192600,25516 (1935) 1948 175.2 5.4e-42
NP_002463 (OMIM: 158300,160741,608837) myosin-8 [H (1937) 1907 171.9 5.4e-41
NP_079005 (OMIM: 600652,608568,614369) myosin-14 i (1995) 1903 171.6 6.8e-41
XP_011525623 (OMIM: 600652,608568,614369) PREDICTE (2035) 1903 171.6 6.9e-41
XP_011522172 (OMIM: 160720,178110,193700,601680) P (1940) 1877 169.5 2.9e-40
NP_002461 (OMIM: 160720,178110,193700,601680) myos (1940) 1877 169.5 2.9e-40
XP_011522173 (OMIM: 160720,178110,193700,601680) P (1940) 1877 169.5 2.9e-40
NP_001073996 (OMIM: 606541) unconventional myosin- (2116) 1862 168.3 7e-40
XP_006712602 (OMIM: 606541) PREDICTED: unconventio (2142) 1862 168.4 7.1e-40
XP_011509520 (OMIM: 606541) PREDICTED: unconventio (2145) 1855 167.8 1e-39
XP_016859658 (OMIM: 606541) PREDICTED: unconventio (2164) 1855 167.8 1.1e-39
NP_055796 (OMIM: 609929) myosin-15 precursor [Homo (1946) 1835 166.1 3e-39
XP_011510861 (OMIM: 609929) PREDICTED: myosin-15 i (1946) 1835 166.1 3e-39
XP_016877899 (OMIM: 610022) PREDICTED: unconventio (1278) 1803 163.3 1.4e-38
XP_016878739 (OMIM: 132900,160745) PREDICTED: myos (1945) 1705 155.6 4.4e-36
NP_001035202 (OMIM: 132900,160745) myosin-11 isofo (1945) 1705 155.6 4.4e-36
NP_001035203 (OMIM: 132900,160745) myosin-11 isofo (1979) 1705 155.6 4.4e-36
NP_001123630 (OMIM: 606537) unconventional myosin- (1136) 1666 152.2 2.8e-35
NP_001155291 (OMIM: 606537) unconventional myosin- (1136) 1666 152.2 2.8e-35
XP_005246629 (OMIM: 606537) PREDICTED: unconventio (1136) 1666 152.2 2.8e-35
>>NP_001073936 (OMIM: 251850,606540) unconventional myos (1848 aa)
initn: 6942 init1: 6942 opt: 12048 Z-score: 5281.4 bits: 990.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 12048; 99.9% identity (99.9% similar) in 1849 aa overlap (1-1849:1-1848)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSVGELYSQCTRVWIPDPDEVWRSAELTKDYKEGDKSLQLRLEDETILEYPIDVQRNQLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSVGELYSQCTRVWIPDPDEVWRSAELTKDYKEGDKSLQLRLEDETILEYPIDVQRNQLP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 FLRNPDILVGENDLTALSYLHEPAVLHNLKVRFLESNHIYTYCGIVLVAINPYEQLPIYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLRNPDILVGENDLTALSYLHEPAVLHNLKVRFLESNHIYTYCGIVLVAINPYEQLPIYG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 QDVIYAYSGQNMGDMDPHIFAVAEEAYKQMARDEKNQSIIVSGESGAGKTVSAKYAMRYF
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QDVIYTYSGQNMGDMDPHIFAVAEEAYKQMARDEKNQSIIVSGESGAGKTVSAKYAMRYF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 ATVGGSASETNIEEKVLASSPIMEAIGNAKTTRNDNSSRFGKYIQIGFDKRYHIIGANMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATVGGSASETNIEEKVLASSPIMEAIGNAKTTRNDNSSRFGKYIQIGFDKRYHIIGANMR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 TYLLEKSRVVFQADDERNYHIFYQLCAAAGLPEFKELALTSAEDFFYTSQGGDTSIEGVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TYLLEKSRVVFQADDERNYHIFYQLCAAAGLPEFKELALTSAEDFFYTSQGGDTSIEGVD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 DAEDFEKTRQAFTLLGVKESHQMSIFKIIASILHLGSVAIQAERDGDSCSISPQDVYLSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DAEDFEKTRQAFTLLGVKESHQMSIFKIIASILHLGSVAIQAERDGDSCSISPQDVYLSN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 FCRLLGVEHSQMEHWLCHRKLVTTSETYVKTMSLQQVINARNALAKHIYAQLFGWIVEHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FCRLLGVEHSQMEHWLCHRKLVTTSETYVKTMSLQQVINARNALAKHIYAQLFGWIVEHI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NKALHTSLKQHSFIGVLDIYGFETFEVNSFEQFCINYANEKLQQQFNSHVFKLEQEEYMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NKALHTSLKQHSFIGVLDIYGFETFEVNSFEQFCINYANEKLQQQFNSHVFKLEQEEYMK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 EQIPWTLIDFYDNQPCIDLIEAKLGILDLLDEECKVPKGTDQNWAQKLYDRHSSSQHFQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EQIPWTLIDFYDNQPCIDLIEAKLGILDLLDEECKVPKGTDQNWAQKLYDRHSSSQHFQK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 PRMSNTAFIIVHFADKVEYLSDGFLEKNRDTVYEEQINILKASKFPLVADLFHDDKDPVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PRMSNTAFIIVHFADKVEYLSDGFLEKNRDTVYEEQINILKASKFPLVADLFHDDKDPVP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 ATTPGKGSSSKISVRSARPPMKVSNKEHKKTVGHQFRTSLHLLMETLNATTPHYVRCIKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATTPGKGSSSKISVRSARPPMKVSNKEHKKTVGHQFRTSLHLLMETLNATTPHYVRCIKP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 NDEKLPFHFDPKRAVQQLRACGVLETIRISAAGYPSRWAYHDFFNRYRVLVKKRELANTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NDEKLPFHFDPKRAVQQLRACGVLETIRISAAGYPSRWAYHDFFNRYRVLVKKRELANTD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 KKAICRSVLENLIKDPDKFQFGRTKIFFRAGQVAYLEKLRADKFRTATIMIQKTVRGWLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KKAICRSVLENLIKDPDKFQFGRTKIFFRAGQVAYLEKLRADKFRTATIMIQKTVRGWLQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 KVKYHRLKGATLTLQRYCRGHLARRLAEHLRRIRAAVVLQKHYRMQRARQAYQRVRRAAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KVKYHRLKGATLTLQRYCRGHLARRLAEHLRRIRAAVVLQKHYRMQRARQAYQRVRRAAV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 VIQAFTRAMFVRRTYRQVLMEHKATTIQKHVRGWMARRHFQRLRDAAIVIQCAFRMLKAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VIQAFTRAMFVRRTYRQVLMEHKATTIQKHVRGWMARRHFQRLRDAAIVIQCAFRMLKAR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 RELKALRIEARSAEHLKRLNVGMENKVVQLQRKIDEQNKEFKTLSEQLSVTTSTYTMEVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RELKALRIEARSAEHLKRLNVGMENKVVQLQRKIDEQNKEFKTLSEQLSVTTSTYTMEVE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 RLKKELVHYQQSPGEDTSLRLQEEVESLRTELQRAHSERKILEDAHSREKDELRKRVADL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLKKELVHYQQSPGEDTSLRLQEEVESLRTELQRAHSERKILEDAHSREKDELRKRVADL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 EQENALLKDEKEQLNNQILCQSKDEFAQNSVKENLLMKKELEEERSRYQNLVKEYSQLEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
NP_001 EQENALLKDEKEQLNNQILCQSKDEFAQNSVKENL-MKKELEEERSRYQNLVKEYSQLEQ
1030 1040 1050 1060 1070
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 RYDNLRDEMTIIKQTPGHRRNPSNQSSLESDSNYPSISTSEIGDTEDALQQVEEIGLEKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RYDNLRDEMTIIKQTPGHRRNPSNQSSLESDSNYPSISTSEIGDTEDALQQVEEIGLEKA
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 AMDMTVFLKLQKRVRELEQERKKLQVQLEKREQQDSKKVQAEPPQTDIDLDPNADLAYNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AMDMTVFLKLQKRVRELEQERKKLQVQLEKREQQDSKKVQAEPPQTDIDLDPNADLAYNS
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 LKRQELESENKKLKNDLNELRKAVADQATQNNSSHGSPDSYSLLLNQLKLAHEELEVRKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKRQELESENKKLKNDLNELRKAVADQATQNNSSHGSPDSYSLLLNQLKLAHEELEVRKE
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 EVLILRTQIVSADQRRLAGRNAEPNINARSSWPNSEKHVDQEDAIEAYHGVCQTNSKTED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVLILRTQIVSADQRRLAGRNAEPNINARSSWPNSEKHVDQEDAIEAYHGVCQTNSKTED
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 WGYLNEDGELGLAYQGLKQVARLLEAQLQAQSLEHEEEVEHLKAQLEALKEEMDKQQQTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WGYLNEDGELGLAYQGLKQVARLLEAQLQAQSLEHEEEVEHLKAQLEALKEEMDKQQQTF
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA1 CQTLLLSPEAQVEFGVQQEISRLTNENLDLKELVEKLEKNERKLKKQLKIYMKKAQDLEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CQTLLLSPEAQVEFGVQQEISRLTNENLDLKELVEKLEKNERKLKKQLKIYMKKAQDLEA
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA1 AQALAQSERKRHELNRQVTVQRKEKDFQGMLEYHKEDEALLIRNLVTDLKPQMLSGTVPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AQALAQSERKRHELNRQVTVQRKEKDFQGMLEYHKEDEALLIRNLVTDLKPQMLSGTVPC
1440 1450 1460 1470 1480 1490
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA1 LPAYILYMCIRHADYTNDDLKVHSLLTSTINGIKKVLKKHNDDFEMTSFWLSNTCRLLHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPAYILYMCIRHADYTNDDLKVHSLLTSTINGIKKVLKKHNDDFEMTSFWLSNTCRLLHC
1500 1510 1520 1530 1540 1550
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA1 LKQYSGDEGFMTQNTAKQNEHCLKNFDLTEYRQVLSDLSIQIYQQLIKIAEGVLQPMIVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKQYSGDEGFMTQNTAKQNEHCLKNFDLTEYRQVLSDLSIQIYQQLIKIAEGVLQPMIVS
1560 1570 1580 1590 1600 1610
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA1 AMLENESIQGLSGVKPTGYRKRSSSMADGDNSYCLEAIIRQMNAFHTVMCDQGLDPEIIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AMLENESIQGLSGVKPTGYRKRSSSMADGDNSYCLEAIIRQMNAFHTVMCDQGLDPEIIL
1620 1630 1640 1650 1660 1670
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA1 QVFKQLFYMINAVTLNNLLLRKDVCSWSTGMQLRYNISQLEEWLRGRNLHQSGAVQTMEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QVFKQLFYMINAVTLNNLLLRKDVCSWSTGMQLRYNISQLEEWLRGRNLHQSGAVQTMEP
1680 1690 1700 1710 1720 1730
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA1 LIQAAQLLQLKKKTQEDAEAICSLCTSLSTQQIVKILNLYTPLNEFEERVTVAFIRTIQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LIQAAQLLQLKKKTQEDAEAICSLCTSLSTQQIVKILNLYTPLNEFEERVTVAFIRTIQA
1740 1750 1760 1770 1780 1790
1810 1820 1830 1840
pF1KA1 QLQERNDPQQLLLDAKHMFPVLFPFNPSSLTMDSIHIPACLNLEFLNEV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QLQERNDPQQLLLDAKHMFPVLFPFNPSSLTMDSIHIPACLNLEFLNEV
1800 1810 1820 1830 1840
>>NP_000250 (OMIM: 160777,214450) unconventional myosin- (1855 aa)
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.:...:.: :: . : :: .:.: :.::::::::::::::::.:::::::
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...... . .. :.: .: .:..:: . :::.::::::::::.:.:: :.. . .
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: . :. . .: :. . .:: :. .:: :.. :. ::::::: :.:.::::.
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.::::::::: : .:: .:. ::::::::.. :: .::..: : . : : :.
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XP_011 EQNKDYKCLVEKLTNLEGIYNSETEKLRSDLERLQLSEEEAKVATGRVLSLQEEIAKLRK
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pF1KA1 MSVGELYSQCTRVWIPDPDEVWRSAELTKDYKEGDKSLQLR
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XP_011 LQQQFNMHVFKLEQEEYMKEQIPWTLIDFYDNQPCINLIESKLGILDLLDEECKMPKGTD
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pF1KA1 QNWAQKLYDRH-SSSQHFQKPRMSNTAFIIVHFADKVEYLSDGFLEKNRDTVYEEQINIL
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XP_011 DTWAQKLYNTHLNKCALFEKPRLSNKAFIIQHFADKVEYQCEGFLEKNKDTVFEEQIKVL
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590 600 610 620 630
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XP_011 KSSKFKMLPELFQDDEKAISPTSATSSGRTPLTRTPAKPTKGRPGQMA-KEHKKTVGHQF
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...::..:: .:. : ..:::: .:.:.. :....: ::..: ::::. :::.::::.
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...... . .. :.: .: .:..:: . :::.::::::::::.:.:: .
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pF1KA1 MSVGELYSQCTRVWIPDPDEVWRSAELTKDYKEGDKSLQLRLEDETILEYPIDVQRNQLP
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pF1KA1 FLRNPDILVGENDLTALSYLHEPAVLHNLKVRFLESNHIYTYCGIVLVAINPYEQLPIYG
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XP_005 MEDIPSRTEEPSEKKVPLDMSLFLKLQKRVTELEQEKQVMQDELDRKEEQVLRSKAKEEE
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pF1KA1 QEDAIEAYHGVCQTN-SKTEDWGYLNEDGELGLAYQGLKQVARLLEAQLQAQSLEHEEEV
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1760 1770 1780 1790 1800 1810
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pF1KA1 LTNENL-------------------------DLKELVEKLEKNERKLKKQLKIYMKKAQD
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XP_011 SGESGAGKTVSAKYAMRYFATVSGSASEANVEEKVLASNPIMESIGNAKTTRNDNSSRFG
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230 240 250 260 270 280
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XP_011 KYIEIGFDKRYRIIGANMRTYLLEKSRVVFQAEEERNYHIFYQLCASAKLPEFKMLRLGN
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XP_011 LQQQFNMHVFKLEQEEYMKEQIPWTLIDFYDNQPCINLIESKLGILDLLDEECKMPKGTD
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XP_011 KEKDFQGMLEYKKEDEQKLVKNLILELKPRGVAVNLIPGLPAYILFMCVRHADYLNDDQK
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