seq1 = pF1KA1042.tfa, 2859 bp seq2 = pF1KA1042/gi568815595f_41991470.tfa (gi568815595f:41991470_42323734), 332265 bp >pF1KA1042 2859 >gi568815595f:41991470_42323734 (Chr3) 1-91 (100001-100091) 100% -> 92-286 (133951-134145) 100% -> 287-363 (185345-185421) 100% -> 364-480 (193216-193332) 100% -> 481-581 (196576-196676) 100% -> 582-690 (197547-197655) 100% -> 691-769 (200089-200167) 100% -> 770-900 (201606-201736) 100% -> 901-975 (202355-202429) 100% -> 976-1113 (203335-203472) 99% -> 1114-1190 (207708-207784) 100% -> 1191-1427 (209349-209585) 100% -> 1428-1744 (210967-211283) 100% -> 1745-1963 (218298-218516) 99% -> 1964-2066 (228025-228127) 100% -> 2067-2859 (231473-232265) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGCATTGGTTTTTCAATTCGGGCAGCCCGTCAGGGCTCAGCCTCTGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGCATTGGTTTTTCAATTCGGGCAGCCCGTCAGGGCTCAGCCTCTGCC 50 . : . : . : . : . : 51 AGGACTCTGCCACGGCAAGCTCATTCGGACAAACGCCTGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>> 100051 AGGACTCTGCCACGGCAAGCTCATTCGGACAAACGCCTGTGGTA...TAG 100 . : . : . : . : . : 92 ATGTGTGCAACAGCACCGATCTTCCGGAAGTCGAGATCATTAGCCTGCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 133951 ATGTGTGCAACAGCACCGATCTTCCGGAAGTCGAGATCATTAGCCTGCTG 150 . : . : . : . : . : 142 GAGGAGCAGCTGCCCCATTATAAGTTAAGAGCCGACACCATCTACGGTTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 134001 GAGGAGCAGCTGCCCCATTATAAGTTAAGAGCCGACACCATCTACGGTTA 200 . : . : . : . : . : 192 TGACCACGACGACTGGCTCCATACACCTCTCATTTCTCCAGATGCCAACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 134051 TGACCACGACGACTGGCTCCATACACCTCTCATTTCTCCAGATGCCAACA 250 . : . : . : . : . : 242 TTGACCTCACAACCGAGCAAATTGAAGAGACGTTAAAATACTTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 134101 TTGACCTCACAACCGAGCAAATTGAAGAGACGTTAAAATACTTCCGTA.. 300 . : . : . : . : . : 287 TTTTATGTGCTGAAAGAGTTGGCCAGATGACTAAGACATATAATGA .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 134151 .CAGTTTTATGTGCTGAAAGAGTTGGCCAGATGACTAAGACATATAATGA 350 . : . : . : . : . : 333 CATAGATGCTGTCACTCGGCTTCTTGAGGAG AAAGAGCGGG |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||| 185391 CATAGATGCTGTCACTCGGCTTCTTGAGGAGGTA...TAGAAAGAGCGGG 400 . : . : . : . : . : 374 ATTTAGAATTGGCCGCTCGCATCGGCCAGTCGTTGTTGAAGAAGAACAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 193226 ATTTAGAATTGGCCGCTCGCATCGGCCAGTCGTTGTTGAAGAAGAACAAG 450 . : . : . : . : . : 424 ACCCTAACCGAGAGGAACGAGCTGCTGGAGGAGCAGGTGGAACACATCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 193276 ACCCTAACCGAGAGGAACGAGCTGCTGGAGGAGCAGGTGGAACACATCAG 500 . : . : . : . : . : 474 GGAGGAG GTGTCTCAGCTCCGGCATGAGCTGTCCATGAAGG |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| 193326 GGAGGAGGTA...CAGGTGTCTCAGCTCCGGCATGAGCTGTCCATGAAGG 550 . : . : . : . : . : 515 ATGAGCTGCTTCAGTTCTACACCAGCGCTGCGGAGGAGAGTGAGCCCGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 196610 ATGAGCTGCTTCAGTTCTACACCAGCGCTGCGGAGGAGAGTGAGCCCGAG 600 . : . : . : . : . : 565 TCCGTTTGCTCAACCCC GTTGAAGAGGAATGAGTCGTCCTC |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||| 196660 TCCGTTTGCTCAACCCCGTA...CAGGTTGAAGAGGAATGAGTCGTCCTC 650 . : . : . : . : . : 606 CTCAGTCCAGAATTACTTTCATTTGGATTCTCTTCAAAAGAAGCTGAAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 197571 CTCAGTCCAGAATTACTTTCATTTGGATTCTCTTCAAAAGAAGCTGAAAG 700 . : . : . : . : . : 656 ACCTTGAAGAGGAGAATGTTGTACTTCGATCCGAG GCCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||| 197621 ACCTTGAAGAGGAGAATGTTGTACTTCGATCCGAGGTG...CAGGCCAGC 750 . : . : . : . : . : 697 CAGCTGAAGACAGAGACCATCACCTATGAGGAGAAGGAGCAGCAGCTGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 200095 CAGCTGAAGACAGAGACCATCACCTATGAGGAGAAGGAGCAGCAGCTGGT 800 . : . : . : . : . : 747 CAATGACTGCGTGAAGGAGCTGA GGGATGCCAATGTCCAGA |||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||| 200145 CAATGACTGCGTGAAGGAGCTGAGTA...AAGGGGATGCCAATGTCCAGA 850 . : . : . : . : . : 788 TTGCTAGTATCTCAGAGGAACTGGCCAAGAAGACGGAAGATGCTGCCCGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 201624 TTGCTAGTATCTCAGAGGAACTGGCCAAGAAGACGGAAGATGCTGCCCGC 900 . : . : . : . : . : 838 CAGCAAGAGGAGATCACACACCTGCTATCGCAAATAGTTGATTTGCAGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 201674 CAGCAAGAGGAGATCACACACCTGCTATCGCAAATAGTTGATTTGCAGAA 950 . : . : . : . : . : 888 AAAGGCAAAAGCT TGCGCAGTGGAAAATGAAGAACTTGTCC |||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||| 201724 AAAGGCAAAAGCTGTA...TAGTGCGCAGTGGAAAATGAAGAACTTGTCC 1000 . : . : . : . : . : 929 AGCATCTGGGGGCTGCTAAGGATGCCCAGCGGCAGCTCACAGCCGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>> 202383 AGCATCTGGGGGCTGCTAAGGATGCCCAGCGGCAGCTCACAGCCGAGGTG 1050 . : . : . : . : . : 976 CTGCGTGAGCTGGAGGACAAGTACGCAGAGTGCATGGAGATGCT ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 202433 ...CAGCTGCGTGAGCTGGAGGACAAGTACGCAGAGTGCATGGAGATGCT 1100 . : . : . : . : . : 1020 GCATGAGGCGCAGGAGGAGCTGAAGAACCTCCGGAACAAAACCATGCCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 203379 GCATGAGGCGCAGGAGGAGCTGAAGAACCTCCGGAACAAAACCATGCCCA 1150 . : . : . : . : . : 1070 ATACCACGTCTCGGCGCTACCACTCGCTGGGCCTGTTTCCCATG ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||>>>... 203429 ATACCACGTCTCGGCGCTACCACTCACTGGGCCTGTTTCCCATGGTG... 1200 . : . : . : . : . : 1114 GATTCCTTGGCAGCAGAGATTGAGGGAACGATGCGCAAGGAGCTGCA >>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 207705 CAGGATTCCTTGGCAGCAGAGATTGAGGGAACGATGCGCAAGGAGCTGCA 1250 . : . : . : . : . : 1161 GTTGGAAGAGGCCGAGTCTCCAGACATCAC TCACCAGAAGC ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 207755 GTTGGAAGAGGCCGAGTCTCCAGACATCACGTA...TAGTCACCAGAAGC 1300 . : . : . : . : . : 1202 GTGTCTTTGAGACAGTAAGAAACATCAACCAGGTTGTCAAGCAGAGATCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 209360 GTGTCTTTGAGACAGTAAGAAACATCAACCAGGTTGTCAAGCAGAGATCT 1350 . : . : . : . : . : 1252 CTGACCCCTTCTCCCATGAACATCCCCGGCTCCAACCAGTCCTCGGCCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 209410 CTGACCCCTTCTCCCATGAACATCCCCGGCTCCAACCAGTCCTCGGCCAT 1400 . : . : . : . : . : 1302 GAACTCCCTCCTGTCCAGCTGCGTCAGCACCCCCCGGTCCAGCTTCTACG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 209460 GAACTCCCTCCTGTCCAGCTGCGTCAGCACCCCCCGGTCCAGCTTCTACG 1450 . : . : . : . : . : 1352 GCAGCGACATAGGCAACGTCGTCCTCGACAACAAGACCAACAGCATCATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 209510 GCAGCGACATAGGCAACGTCGTCCTCGACAACAAGACCAACAGCATCATT 1500 . : . : . : . : . : 1402 CTGGAAACAGAGGCAGCCGACCTGGG AAACGATGAGCGGAG ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| 209560 CTGGAAACAGAGGCAGCCGACCTGGGGTG...CAGAAACGATGAGCGGAG 1550 . : . : . : . : . : 1443 TAAGAAGCCGGGGACGCCGGGCACCCCAGGCTCCCACGACCTGGAGACGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 210982 TAAGAAGCCGGGGACGCCGGGCACCCCAGGCTCCCACGACCTGGAGACGG 1600 . : . : . : . : . : 1493 CGCTGAGGCGGCTGTCCCTGCGCCGGGAGAACTACCTCTCGGAGAGGAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 211032 CGCTGAGGCGGCTGTCCCTGCGCCGGGAGAACTACCTCTCGGAGAGGAGG 1650 . : . : . : . : . : 1543 TTCTTTGAGGAGGAGCAAGAGAGGAAGCTCCAGGAGCTGGCGGAGAAGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 211082 TTCTTTGAGGAGGAGCAAGAGAGGAAGCTCCAGGAGCTGGCGGAGAAGGG 1700 . : . : . : . : . : 1593 CGAGCTGCGCAGCGGCTCCCTCACACCCACTGAGAGCATCATGTCCCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 211132 CGAGCTGCGCAGCGGCTCCCTCACACCCACTGAGAGCATCATGTCCCTGG 1750 . : . : . : . : . : 1643 GCACGCACTCCCGCTTCTCCGAGTTCACCGGCTTCTCTGGCATGTCCTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 211182 GCACGCACTCCCGCTTCTCCGAGTTCACCGGCTTCTCTGGCATGTCCTTC 1800 . : . : . : . : . : 1693 AGCAGCCGCTCCTACCTGCCTGAGAAGCTCCAGATCGTGAAGCCGCTGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 211232 AGCAGCCGCTCCTACCTGCCTGAGAAGCTCCAGATCGTGAAGCCGCTGGA 1850 . : . : . : . : . : 1743 AG GTTCTGCCACACTTCACCACTGGCAGCAGTTGGCCCAAC ||>>>...>>>|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| 211282 AGGTG...AAGGTTCCGCCACACTTCACCACTGGCAGCAGTTGGCCCAAC 1900 . : . : . : . : . : 1784 CTCACCTTGGGGGCATCCTGGACCCCCGGCCTGGTGTGGTCACCAAGGGC ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| 218337 CTCACCTTGGGGGCATCCTGGACCCCCGGCCCGGTGTGGTCACCAAGGGC 1950 . : . : . : . : . : 1834 TTCCGGACGCTGGATGTTGACCTGGACGAAGTGTACTGCCTTAACGACTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 218387 TTCCGGACGCTGGATGTTGACCTGGACGAAGTGTACTGCCTTAACGACTT 2000 . : . : . : . : . : 1884 TGAAGAAGATGACACAGGTGACCACATTTCTCTCCCACGCCTAGCTACCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 218437 TGAAGAAGATGACACAGGTGACCACATTTCTCTCCCACGCCTAGCTACCT 2050 . : . : . : . : . : 1934 CCACTCCAGTTCAGCACCCAGAGACCTCAG CGCACCATCCT ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 218487 CCACTCCAGTTCAGCACCCAGAGACCTCAGGTG...TAGCGCACCATCCT 2100 . : . : . : . : . : 1975 GGGAAGTGCATGTCTCAGACCAACTCCACCTTCACCTTCACCACCTGTCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 228036 GGGAAGTGCATGTCTCAGACCAACTCCACCTTCACCTTCACCACCTGTCG 2150 . : . : . : . : . : 2025 CATCCTGCATCCTTCAGATGAGCTCACTCGGGTCACACCAAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>> 228086 CATCCTGCATCCTTCAGATGAGCTCACTCGGGTCACACCAAGGTA...CA 2200 . : . : . : . : . : 2067 CCTTAACTCAGCCCCAACTCCAGCTTGTGGCAGCACCAGCCACTTGAAA >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 231472 GCCTTAACTCAGCCCCAACTCCAGCTTGTGGCAGCACCAGCCACTTGAAA 2250 . : . : . : . : . : 2116 TCCACGCCGGTGGCCACACCATGCACTCCACGGAGACTGAGCCTGGCTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 231522 TCCACGCCGGTGGCCACACCATGCACTCCACGGAGACTGAGCCTGGCTGA 2300 . : . : . : . : . : 2166 GTCCTTCACTAACACCCGTGAGTCCACGACCACCATGAGCACATCCCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 231572 GTCCTTCACTAACACCCGTGAGTCCACGACCACCATGAGCACATCCCTGG 2350 . : . : . : . : . : 2216 GGCTCGTGTGGCTGTTGAAGGAGCGGGGCATTTCTGCTGCCGTGTACGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 231622 GGCTCGTGTGGCTGTTGAAGGAGCGGGGCATTTCTGCTGCCGTGTACGAC 2400 . : . : . : . : . : 2266 CCCCAGAGCTGGGACAGGGCCGGCCGGGGCTCCCTCCTGCACTCCTACAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 231672 CCCCAGAGCTGGGACAGGGCCGGCCGGGGCTCCCTCCTGCACTCCTACAC 2450 . : . : . : . : . : 2316 GCCCAAGATGGCTGTGATCCCCTCTACTCCGCCGAACTCGCCTATGCAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 231722 GCCCAAGATGGCTGTGATCCCCTCTACTCCGCCGAACTCGCCTATGCAGA 2500 . : . : . : . : . : 2366 CACCCACATCCTCCCCACCCTCCTTTGAGTTCAAGTGCACGAGCCCTCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 231772 CACCCACATCCTCCCCACCCTCCTTTGAGTTCAAGTGCACGAGCCCTCCC 2550 . : . : . : . : . : 2416 TACGACAATTTCCTGGCTTCCAAGCCAGCCAGCTCCATCCTGAGGGAAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 231822 TACGACAATTTCCTGGCTTCCAAGCCAGCCAGCTCCATCCTGAGGGAAGT 2600 . : . : . : . : . : 2466 GAGAGAAAAGAACGTCCGCAGCAGCGAGAGCCAGACCGACGTGTCCGTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 231872 GAGAGAAAAGAACGTCCGCAGCAGCGAGAGCCAGACCGACGTGTCCGTCT 2650 . : . : . : . : . : 2516 CCAACCTCAACCTCGTGGACAAAGTCAGGAGGTTTGGGGTGGCCAAAGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 231922 CCAACCTCAACCTCGTGGACAAAGTCAGGAGGTTTGGGGTGGCCAAAGTG 2700 . : . : . : . : . : 2566 GTGAACTCAGGGCGAGCCCATGTCCCCACCTTGACTGAGGAGCAGGGACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 231972 GTGAACTCAGGGCGAGCCCATGTCCCCACCTTGACTGAGGAGCAGGGACC 2750 . : . : . : . : . : 2616 CCTCCTCTGTGGGCCCCCGGGGCCAGCACCAGCCCTTGTTCCCAGAGGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 232022 CCTCCTCTGTGGGCCCCCGGGGCCAGCACCAGCCCTTGTTCCCAGAGGCC 2800 . : . : . : . : . : 2666 TGGTACCTGAGGGCCTGCCCCTCAGATGCCCCACTGTCACCAGTGCCATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 232072 TGGTACCTGAGGGCCTGCCCCTCAGATGCCCCACTGTCACCAGTGCCATC 2850 . : . : . : . : . : 2716 GGTGGGCTGCAGCTCAATAGTGGCATCCGGCGGAATCGCAGCTTCCCCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 232122 GGTGGGCTGCAGCTCAATAGTGGCATCCGGCGGAATCGCAGCTTCCCCAC 2900 . : . : . : . : . : 2766 CATGGTGGGATCTAGCATGCAGATGAAAGCTCCTGTGACTCTCACCTCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 232172 CATGGTGGGATCTAGCATGCAGATGAAAGCTCCTGTGACTCTCACCTCGG 2950 . : . : . : . : 2816 GCATCTTGATGGGTGCTAAGCTCTCCAAACAAACTAGCTTACGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 232222 GCATCTTGATGGGTGCTAAGCTCTCCAAACAAACTAGCTTACGG