Result of SIM4 for
pF1KA0966
seq1 = pF1KA0966.tfa, 3396 bp
seq2 = pF1KA0966/gi568815588f_119626263.tfa (gi568815588f:119626263_119927777), 301515 bp
>pF1KA0966 3396
>gi568815588f:119626263_119927777 (Chr10)
1-97 (100001-100097) 100% ->
98-178 (124814-124894) 100% ->
179-315 (155373-155509) 100% ->
316-444 (165255-165383) 100% ->
445-612 (165607-165774) 100% ->
613-669 (165895-165951) 100% ->
670-868 (170453-170651) 100% ->
869-1048 (171199-171378) 100% ->
1049-1116 (172281-172348) 100% ->
1117-1241 (177911-178035) 100% ->
1242-1319 (179122-179199) 100% ->
1320-1440 (180098-180218) 100% ->
1441-1569 (181670-181798) 100% ->
1570-1687 (183838-183955) 100% ->
1688-1886 (185495-185693) 100% ->
1887-1958 (194584-194655) 100% ->
1959-2032 (196169-196242) 100% ->
2033-2161 (196809-196937) 100% ->
2162-2249 (197553-197640) 100% ->
2250-3396 (200369-201515) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGAGCTCTTCCAAGCCAAGGACCACTACATCCTGCAGCAGGGCGAGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGAGCTCTTCCAAGCCAAGGACCACTACATCCTGCAGCAGGGCGAGCG
50 . : . : . : . : . :
51 CGCGCTGTGGTGCAGCCGCCGCGACGGCGGCCTCCAGCTCCGACCCG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
100051 CGCGCTGTGGTGCAGCCGCCGCGACGGCGGCCTCCAGCTCCGACCCGGTG
100 . : . : . : . : . :
98 CTACTGATCTACTTCTTGCCTGGAATCCCATTTGTTTGGGGTTG
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 ...TAGCTACTGATCTACTTCTTGCCTGGAATCCCATTTGTTTGGGGTTG
150 . : . : . : . : . :
142 GTAGAAGGTGTTATTGGGAAAATTCAACTTCATTCAG ATCT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
124858 GTAGAAGGTGTTATTGGGAAAATTCAACTTCATTCAGGTA...CAGATCT
200 . : . : . : . : . :
183 TCCATGGTGGCTTATTCTAATTCGGCAGAAAGCATTGGTGGGCAAACTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
155377 TCCATGGTGGCTTATTCTAATTCGGCAGAAAGCATTGGTGGGCAAACTCC
250 . : . : . : . : . :
233 CAGGAGACCATGAGGTCTGTAAAGTTACCAAAATTGCTGTGCTCTCACTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
155427 CAGGAGACCATGAGGTCTGTAAAGTTACCAAAATTGCTGTGCTCTCACTT
300 . : . : . : . : . :
283 TCTGAAATGGAACCTCAGGATCTTGAGCTAGAG CTCTGTAA
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
155477 TCTGAAATGGAACCTCAGGATCTTGAGCTAGAGGTA...TAGCTCTGTAA
350 . : . : . : . : . :
324 GAAGCATCATTTTGGTATTAACAAACCAGAGAAGATCATACCATCTCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165263 GAAGCATCATTTTGGTATTAACAAACCAGAGAAGATCATACCATCTCCTG
400 . : . : . : . : . :
374 ATGACTCAAAGTTTCTACTGAAGACCTTTACGCATATTAAATCCAATGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165313 ATGACTCAAAGTTTCTACTGAAGACCTTTACGCATATTAAATCCAATGTG
450 . : . : . : . : . :
424 TCTGCTCCTAATAAAAAGAAA GTTAAGGAAAGTAAAGAGAA
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
165363 TCTGCTCCTAATAAAAAGAAAGTA...TAGGTTAAGGAAAGTAAAGAGAA
500 . : . : . : . : . :
465 GGAGAAGTTGGAGAGGAGATTACTTGAAGAGTTGCTGAAGATGTTCATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165627 GGAGAAGTTGGAGAGGAGATTACTTGAAGAGTTGCTGAAGATGTTCATGG
550 . : . : . : . : . :
515 ACTCAGAATCCTTTTATTATAGCTTGACCTATGACCTGACCAATTCCGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165677 ACTCAGAATCCTTTTATTATAGCTTGACCTATGACCTGACCAATTCCGTG
600 . : . : . : . : . :
565 CAGAGGCAGAGCACTGGGGAGAGGGACGGTCGGCCCCTCTGGCAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
165727 CAGAGGCAGAGCACTGGGGAGAGGGACGGTCGGCCCCTCTGGCAGAAGGT
650 . : . : . : . : . :
613 GTTGATGACCGATTTTTTTGGAATAAATACATGATACAAGATC
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165777 A...TAGGTTGATGACCGATTTTTTTGGAATAAATACATGATACAAGATC
700 . : . : . : . : . :
656 TTACTGAGATTGGT ACTCCAGATGTGGACTTTTGGATTATC
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
165938 TTACTGAGATTGGTGTG...CAGACTCCAGATGTGGACTTTTGGATTATC
750 . : . : . : . : . :
697 CCCATGATCCAAGGTTTTGTGCAGATTGAAGAACTTGTGGTTAATTATAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170480 CCCATGATCCAAGGTTTTGTGCAGATTGAAGAACTTGTGGTTAATTATAC
800 . : . : . : . : . :
747 CGAATCATCTGATGATGAGAAAAGCAGCCCAGAGACCCCCCCTCAGGAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170530 CGAATCATCTGATGATGAGAAAAGCAGCCCAGAGACCCCCCCTCAGGAGT
850 . : . : . : . : . :
797 CCACCTGTGTAGATGATATTCACCCACGATTTCTAGTGGCTCTCATTTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170580 CCACCTGTGTAGATGATATTCACCCACGATTTCTAGTGGCTCTCATTTCA
900 . : . : . : . : . :
847 CGCCGAAGTAGGCACAGAGCAG GAATGCGCTATAAACGAAG
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
170630 CGCCGAAGTAGGCACAGAGCAGGTG...CAGGAATGCGCTATAAACGAAG
950 . : . : . : . : . :
888 AGGAGTGGATAAAAATGGAAATGTTGCCAATTATGTGGAGACTGAGCAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
171218 AGGAGTGGATAAAAATGGAAATGTTGCCAATTATGTGGAGACTGAGCAGT
1000 . : . : . : . : . :
938 TGATTCATGTTCATAATCATACCCTGTCATTTGTTCAAACACGAGGCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
171268 TGATTCATGTTCATAATCATACCCTGTCATTTGTTCAAACACGAGGCTCT
1050 . : . : . : . : . :
988 GTGCCTGTCTTTTGGAGCCAGGTTGGGTATCGATATAACCCAAGACCGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
171318 GTGCCTGTCTTTTGGAGCCAGGTTGGGTATCGATATAACCCAAGACCGCG
1100 . : . : . : . : . :
1038 GCTGGACAGAA GTGAAAAGGAAACTGTTGCCTATTTCTGTG
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
171368 GCTGGACAGAAGTA...TAGGTGAAAAGGAAACTGTTGCCTATTTCTGTG
1150 . : . : . : . : . :
1079 CCCATTTCGAAGAACAACTGAACATTTACAAAAAACAG GTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
172311 CCCATTTCGAAGAACAACTGAACATTTACAAAAAACAGGTG...TAGGTT
1200 . : . : . : . : . :
1120 ATTATTAACTTGGTAGACCAGGCAGGAAGAGAGAAGATTATTGGCGATGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
177914 ATTATTAACTTGGTAGACCAGGCAGGAAGAGAGAAGATTATTGGCGATGC
1250 . : . : . : . : . :
1170 TTACCTGAAGCAAGTGTTGCTTTTCAACAACTCACACCTCACTTACGTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
177964 TTACCTGAAGCAAGTGTTGCTTTTCAACAACTCACACCTCACTTACGTTT
1300 . : . : . : . : . :
1220 CGTTTGACTTCCATGAGCACTG CCGAGGAATGAAGTTTGAG
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
178014 CGTTTGACTTCCATGAGCACTGGTA...TAGCCGAGGAATGAAGTTTGAG
1350 . : . : . : . : . :
1261 AATGTTCAGACACTAACAGATGCCATTTATGACATTATTCTTGATATGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
179141 AATGTTCAGACACTAACAGATGCCATTTATGACATTATTCTTGATATGAA
1400 . : . : . : . : . :
1311 GTGGTGTTG GGTTGATGAAGCTGGGGTAATATGTAAGCAGG
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
179191 GTGGTGTTGGTA...AAGGGTTGATGAAGCTGGGGTAATATGTAAGCAGG
1450 . : . : . : . : . :
1352 AAGGGATTTTTCGTGTTAATTGTATGGACTGCCTGGATCGCACCAACGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
180130 AAGGGATTTTTCGTGTTAATTGTATGGACTGCCTGGATCGCACCAACGTG
1500 . : . : . : . : . :
1402 GTCCAAGCTGCCATCGCGAGAGTGGTCATGGAACAGCAG CT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
180180 GTCCAAGCTGCCATCGCGAGAGTGGTCATGGAACAGCAGGTA...TAGCT
1550 . : . : . : . : . :
1443 GAAAAAATTAGGTGTGATGCCCCCGGAACAGCCATTACCTGTGAAATGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181672 GAAAAAATTAGGTGTGATGCCCCCGGAACAGCCATTACCTGTGAAATGTA
1600 . : . : . : . : . :
1493 ATCGCATCTACCAGATAATGTGGGCCAATAATGGTGACTCCATTAGCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181722 ATCGCATCTACCAGATAATGTGGGCCAATAATGGTGACTCCATTAGCAGA
1650 . : . : . : . : . :
1543 CAGTATGCTGGGACAGCTGCTCTGAAG GGTGACTTTACAAG
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
181772 CAGTATGCTGGGACAGCTGCTCTGAAGGTA...CAGGGTGACTTTACAAG
1700 . : . : . : . : . :
1584 GACAGGAGAAAGGAAGTTAGCAGGAGTTATGAAAGATGGAGTGAACTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
183852 GACAGGAGAAAGGAAGTTAGCAGGAGTTATGAAAGATGGAGTGAACTCAG
1750 . : . : . : . : . :
1634 CAAACAGATATTACCTCAACCGATTTAAGGATGCTTATAGGCAAGCTGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
183902 CAAACAGATATTACCTCAACCGATTTAAGGATGCTTATAGGCAAGCTGTT
1800 . : . : . : . : . :
1684 ATAG ATTTGATGCAAGGCATTCCAGTGACAGAAGATCTTTA
||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
183952 ATAGGTA...TAGATTTGATGCAAGGCATTCCAGTGACAGAAGATCTTTA
1850 . : . : . : . : . :
1725 TTCCATATTTACCAAGGAGAAAGAACATGAAGCTTTGCATAAGGAAAATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
185532 TTCCATATTTACCAAGGAGAAAGAACATGAAGCTTTGCATAAGGAAAATC
1900 . : . : . : . : . :
1775 AGAGAAGCCACCAGGAACTAATTAGCCAGCTCTTACAAAGTTACATGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
185582 AGAGAAGCCACCAGGAACTAATTAGCCAGCTCTTACAAAGTTACATGAAG
1950 . : . : . : . : . :
1825 TTACTACTGCCTGATGATGAGAAGTTCCATGGGGGCTGGGCCCTCATTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
185632 TTACTACTGCCTGATGATGAGAAGTTCCATGGGGGCTGGGCCCTCATTGA
2000 . : . : . : . : . :
1875 CTGTGACCCTAG CCTCATTGATGCTACTCACAGAGACGTGG
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
185682 CTGTGACCCTAGGTG...TAGCCTCATTGATGCTACTCACAGAGACGTGG
2050 . : . : . : . : . :
1916 ATGTGCTGTTACTGCTTTCTAACTCTGCCTACTACGTGGCCTA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
194613 ATGTGCTGTTACTGCTTTCTAACTCTGCCTACTACGTGGCCTAGTA...T
2100 . : . : . : . : . :
1959 TTATGATGATGAAGTTGATAAAGTAAACCAGTATCAACGACTAAGTCT
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
196167 AGTTATGATGATGAAGTTGATAAAGTAAACCAGTATCAACGACTAAGTCT
2150 . : . : . : . : . :
2007 AGAAAACCTGGAAAAAATTGAAATAG GCCCTGAACCCACTC
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
196217 AGAAAACCTGGAAAAAATTGAAATAGGTA...TAGGCCCTGAACCCACTC
2200 . : . : . : . : . :
2048 TTTTTGGTAAGCCAAAGTTCTCCTGCATGCGACTGCACTACAGATACAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
196824 TTTTTGGTAAGCCAAAGTTCTCCTGCATGCGACTGCACTACAGATACAAA
2250 . : . : . : . : . :
2098 GAAGCGAGTGGCTATTTCCACACATTGCGAGCTGTAATGCGTAATCCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
196874 GAAGCGAGTGGCTATTTCCACACATTGCGAGCTGTAATGCGTAATCCTGA
2300 . : . : . : . : . :
2148 AGAGGATGGAAAAG ATACCCTTCAGTGCATTGCAGAGATGC
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
196924 AGAGGATGGAAAAGGTA...CAGATACCCTTCAGTGCATTGCAGAGATGC
2350 . : . : . : . : . :
2189 TGCAGATCACCAAGCAAGCCATGGGATCGGATTTACCCATAATTGAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
197580 TGCAGATCACCAAGCAAGCCATGGGATCGGATTTACCCATAATTGAGAAG
2400 . : . : . : . : . :
2239 AAACTTGAGAG GAAGAGCAGTAAACCTCACGAAGACATCAT
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
197630 AAACTTGAGAGGTG...TAGGAAGAGCAGTAAACCTCACGAAGACATCAT
2450 . : . : . : . : . :
2280 TGGTATCAGGTCTCAAAACCAAGGTTCTTTGGCCCAGGGAAAGAATTTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200399 TGGTATCAGGTCTCAAAACCAAGGTTCTTTGGCCCAGGGAAAGAATTTTT
2500 . : . : . : . : . :
2330 TAATGAGCAAATTTTCATCTCTAAATCAAAAAGTGAAGCAGACCAAATCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200449 TAATGAGCAAATTTTCATCTCTAAATCAAAAAGTGAAGCAGACCAAATCC
2550 . : . : . : . : . :
2380 AATGTAAATATTGGCAACCTCCGAAAGCTAGGAAACTTTACCAAACCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200499 AATGTAAATATTGGCAACCTCCGAAAGCTAGGAAACTTTACCAAACCTGA
2600 . : . : . : . : . :
2430 AATGAAAGTTAACTTTCTAAAACCAAACTTAAAAGTAAATCTTTGGAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200549 AATGAAAGTTAACTTTCTAAAACCAAACTTAAAAGTAAATCTTTGGAAAT
2650 . : . : . : . : . :
2480 CAGATAGTAGTCTTGAAACTATGGAAAACACAGGAGTGATGGATAAGGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200599 CAGATAGTAGTCTTGAAACTATGGAAAACACAGGAGTGATGGATAAGGTT
2700 . : . : . : . : . :
2530 CAGGCAGAGTCTGATGGGGACATGTCTTCAGATAATGACTCATACCACTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200649 CAGGCAGAGTCTGATGGGGACATGTCTTCAGATAATGACTCATACCACTC
2750 . : . : . : . : . :
2580 TGATGAATTCCTTACAAATTCTAAGTCTGATGAAGACAGGCAGCTAGCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200699 TGATGAATTCCTTACAAATTCTAAGTCTGATGAAGACAGGCAGCTAGCTA
2800 . : . : . : . : . :
2630 ACTCATTAGAGAGTGTAGGGCCAATAGATTACGTTCTTCCTAGTTGTGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200749 ACTCATTAGAGAGTGTAGGGCCAATAGATTACGTTCTTCCTAGTTGTGGT
2850 . : . : . : . : . :
2680 ATTATTGCCTCAGCGCCTCGATTGGGCAGTCGGTCCCAGTCTCTTAGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200799 ATTATTGCCTCAGCGCCTCGATTGGGCAGTCGGTCCCAGTCTCTTAGCAG
2900 . : . : . : . : . :
2730 CACAGATAGTAGCGTTCATGCTCCTTCAGAGATTACTGTTGCTCATGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200849 CACAGATAGTAGCGTTCATGCTCCTTCAGAGATTACTGTTGCTCATGGGA
2950 . : . : . : . : . :
2780 GTGGGCTTGGAAAAGGCCAGGAGTCTCCTTTGAAGAAAAGTCCTTCTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200899 GTGGGCTTGGAAAAGGCCAGGAGTCTCCTTTGAAGAAAAGTCCTTCTGCT
3000 . : . : . : . : . :
2830 GGCGACGTACACATATTGACTGGCTTTGCCAAGCCTATGGATATTTACTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200949 GGCGACGTACACATATTGACTGGCTTTGCCAAGCCTATGGATATTTACTG
3050 . : . : . : . : . :
2880 CCACAGATTTGTGCAAGATGCACAGAACAAAGTGACCCACCTATCAGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200999 CCACAGATTTGTGCAAGATGCACAGAACAAAGTGACCCACCTATCAGAGA
3100 . : . : . : . : . :
2930 CCAGATCTGTGTCTCAGCAGGCTAGTCAGGAAAGAAATCAAATGACCAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201049 CCAGATCTGTGTCTCAGCAGGCTAGTCAGGAAAGAAATCAAATGACCAAT
3150 . : . : . : . : . :
2980 CAAGTTTCAAATGAAACCCAATCAGAATCAACAGAACAGACACCTTCTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201099 CAAGTTTCAAATGAAACCCAATCAGAATCAACAGAACAGACACCTTCTCG
3200 . : . : . : . : . :
3030 GCCATCGCAATTAGATGTCTCTCTTTCTGCAACAGGCCCACAGTTTTTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201149 GCCATCGCAATTAGATGTCTCTCTTTCTGCAACAGGCCCACAGTTTTTGT
3250 . : . : . : . : . :
3080 CAGTTGAGCCAGCGCATTCAGTTGCATCTCAAAAAACCCCCACCTCCGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201199 CAGTTGAGCCAGCGCATTCAGTTGCATCTCAAAAAACCCCCACCTCCGCT
3300 . : . : . : . : . :
3130 TCCAGCATGCTTGAACTTGAGACAGGGCTTCATGTAACTCCTTCTCCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201249 TCCAGCATGCTTGAACTTGAGACAGGGCTTCATGTAACTCCTTCTCCTTC
3350 . : . : . : . : . :
3180 AGAGAGCAGTAGCAGCAGAGCAGTCTCTCCCTTTGCCAAGATTCGAAGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201299 AGAGAGCAGTAGCAGCAGAGCAGTCTCTCCCTTTGCCAAGATTCGAAGTT
3400 . : . : . : . : . :
3230 CCATGGTCCAGGTTGCTAGTATTACCCAAGCTGGATTAACCCATGGGATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201349 CCATGGTCCAGGTTGCTAGTATTACCCAAGCTGGATTAACCCATGGGATA
3450 . : . : . : . : . :
3280 AACTTTGCAGTGTCAAAAGTTCAGAAGAGTCCTCCAGAACCTGAAATCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201399 AACTTTGCAGTGTCAAAAGTTCAGAAGAGTCCTCCAGAACCTGAAATCAT
3500 . : . : . : . : . :
3330 TAATCAAGTCCAGCAAAATGAACTTAAAAAGATGTTTATACAATGCCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201449 TAATCAAGTCCAGCAAAATGAACTTAAAAAGATGTTTATACAATGCCAGA
3550 . : .
3380 CACGGATAATTCAGATT
|||||||||||||||||
201499 CACGGATAATTCAGATT