seq1 = pF1KA0720.tfa, 3186 bp seq2 = pF1KA0720/gi568815597r_6367824.tfa (gi568815597r:6367824_6596570), 228747 bp >pF1KA0720 3186 >gi568815597r:6367824_6596570 (Chr1) (complement) 1-81 (100000-100078) 97% -> 82-211 (118913-119042) 100% -> 212-317 (120535-120640) 100% -> 318-378 (121049-121109) 100% -> 379-470 (121433-121524) 100% -> 471-607 (121984-122120) 100% -> 608-759 (122407-122558) 100% -> 760-963 (123117-123320) 99% -> 964-1152 (123397-123585) 100% -> 1153-1248 (123949-124044) 100% -> 1249-1299 (124763-124813) 100% -> 1300-1449 (124934-125083) 100% -> 1450-1560 (125471-125581) 100% -> 1561-1710 (125687-125836) 100% -> 1711-1848 (125928-126065) 100% -> 1849-1968 (126216-126335) 100% -> 1969-2101 (126895-127027) 100% -> 2102-2217 (127121-127236) 100% -> 2218-2417 (127330-127529) 100% -> 2418-3186 (127985-128752) 99% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGACGACCAGAGCCCCGCTGAAAAGAAGGGACTGCGCTGTCAGAACCC |-|-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100000 A G ACGACCAGAGCCCCGCTGAAAAGAAGGGACTGCGCTGTCAGAACCC 50 . : . : . : . : . : 51 CGCCTGCATGGACAAGGGGCGGGCGGCCAAG GTATGTCACC |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||| 100048 CGCCTGCATGGACAAGGGGCGGGCGGCCAAGGTA...CAGGTATGTCACC 100 . : . : . : . : . : 92 ACGCCGACTGCCAGCAGCTGCACCGCCGGGGGCCCCTCAACCTCTGCGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118923 ACGCCGACTGCCAGCAGCTGCACCGCCGGGGGCCCCTCAACCTCTGCGAG 150 . : . : . : . : . : 142 GCCTGTGACAGCAAGTTCCACAGCACCATGCATTATGATGGGCATGTCCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118973 GCCTGTGACAGCAAGTTCCACAGCACCATGCATTATGATGGGCATGTCCG 200 . : . : . : . : . : 192 CTTCGACCTTCCCCCACAAG GCTCTGTGCTGGCCCGGAACG ||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||| 119023 CTTCGACCTTCCCCCACAAGGTG...AAGGCTCTGTGCTGGCCCGGAACG 250 . : . : . : . : . : 233 TGTCCACCCGGTCATGCCCGCCGCGCACCAGCCCCGCAGTGGACTTGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 120556 TGTCCACCCGGTCATGCCCGCCGCGCACCAGCCCCGCAGTGGACTTGGAG 300 . : . : . : . : . : 283 GAGGAGGAGGAGGAGAGCTCTGTGGATGGCAAAGG GGACCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||| 120606 GAGGAGGAGGAGGAGAGCTCTGTGGATGGCAAAGGGTA...CAGGGACCG 350 . : . : . : . : . : 324 GAAGAGCACAGGCCTGAAACTCTCCAAGAAGAAAGCAAGGAGGAGACACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121055 GAAGAGCACAGGCCTGAAACTCTCCAAGAAGAAAGCAAGGAGGAGACACA 400 . : . : . : . : . : 374 CGGAT GACCCAAGCAAGGAATGCTTCACTCTGAAATTTGAC |||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121105 CGGATGTG...CAGGACCCAAGCAAGGAATGCTTCACTCTGAAATTTGAC 450 . : . : . : . : . : 415 CTGAATGTGGACATTGAGACAGAGATCGTCCCAGCCATGAAGAAGAAGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121469 CTGAATGTGGACATTGAGACAGAGATCGTCCCAGCCATGAAGAAGAAGTC 500 . : . : . : . : . : 465 ACTGGG GGAGGTGCTGCTGCCTGTATTTGAAAGGAAGGGCA ||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121519 ACTGGGGTA...CAGGGAGGTGCTGCTGCCTGTATTTGAAAGGAAGGGCA 550 . : . : . : . : . : 506 TTGCGCTGGGCAAAGTGGACATCTACCTGGACCAGTCCAACACACCCCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122019 TTGCGCTGGGCAAAGTGGACATCTACCTGGACCAGTCCAACACACCCCTG 600 . : . : . : . : . : 556 TCCCTCACCTTCGAGGCCTACAGGTTCGGGGGACACTACCTTCGTGTCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122069 TCCCTCACCTTCGAGGCCTACAGGTTCGGGGGACACTACCTTCGTGTCAA 650 . : . : . : . : . : 606 AG CCCCAGCCAAGCCTGGAGATGAGGGCAAGGTGGAGCAGG ||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122119 AGGTG...CAGCCCCAGCCAAGCCTGGAGATGAGGGCAAGGTGGAGCAGG 700 . : . : . : . : . : 647 GCATGAAGGACTCCAAGTCCCTGAGTTTGCCGATTCTGCGGCCAGCTGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122446 GCATGAAGGACTCCAAGTCCCTGAGTTTGCCGATTCTGCGGCCAGCTGGG 750 . : . : . : . : . : 697 ACCGGGCCCCCCGCCCTGGAGCGTGTGGACGCCCAGAGCCGCCGGGAGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122496 ACCGGGCCCCCCGCCCTGGAGCGTGTGGACGCCCAGAGCCGCCGGGAGAG 800 . : . : . : . : . : 747 CCTGGACATCTTG GCCCCTGGCCGCCGCCGCAAGAACATGT |||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||| 122546 CCTGGACATCTTGGTG...CAGGCCCCTGGCCGCCGCCGCAAGAACATGT 850 . : . : . : . : . : 788 CGGAGTTCCTGGGGGAGGCGAGCATCCCCGGGCAGGAGCCCCCCACGCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123145 CGGAGTTCCTGGGGGAGGCGAGCATCCCCGGGCAGGAGCCCCCCACGCCC 900 . : . : . : . : . : 838 TCCAGCTGCTCTCTGCCCAGCGGCAGCAGTGGCAGCACCAACAGTGGCGA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| 123195 TCCAGCTGCTCTCTGCCCAGCGGCAGCAGTGGCAGCACCAACACTGGCGA 950 . : . : . : . : . : 888 CAGCTGGAAGAACCGGGCGGCCAGTCGCTTCAGCGGCTTTTTCAGCTCCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123245 CAGCTGGAAGAACCGGGCGGCCAGTCGCTTCAGCGGCTTTTTCAGCTCCG 1000 . : . : . : . : . : 938 GCCCCAGCACCAGCGCCTTTGGCCGG GAGGTAGACAAGATG ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| 123295 GCCCCAGCACCAGCGCCTTTGGCCGGGTA...CAGGAGGTAGACAAGATG 1050 . : . : . : . : . : 979 GAGCAGCTGGAGGGCAAGCTGCACACCTACAGCCTCTTCGGGCTGCCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123412 GAGCAGCTGGAGGGCAAGCTGCACACCTACAGCCTCTTCGGGCTGCCCAG 1100 . : . : . : . : . : 1029 GCTGCCCCGGGGGCTGCGCTTCGACCATGACTCCTGGGAGGAGGAGTACG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123462 GCTGCCCCGGGGGCTGCGCTTCGACCATGACTCCTGGGAGGAGGAGTACG 1150 . : . : . : . : . : 1079 ATGAAGACGAGGATGAGGACAATGCCTGCCTGAGGCTGGAGGACAGCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123512 ATGAAGACGAGGATGAGGACAATGCCTGCCTGAGGCTGGAGGACAGCTGG 1200 . : . : . : . : . : 1129 CGGGAGCTCATTGATGGGCATGAG AAGCTGACCCGGCGGCA ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||| 123562 CGGGAGCTCATTGATGGGCATGAGGTG...TAGAAGCTGACCCGGCGGCA 1250 . : . : . : . : . : 1170 GTGCCACCAGCAGGAGGCGGTGTGGGAGCTGCTGCACACGGAGGCCTCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 123966 GTGCCACCAGCAGGAGGCGGTGTGGGAGCTGCTGCACACGGAGGCCTCCT 1300 . : . : . : . : . : 1220 ACATCAGGAAACTGCGGGTGATCATCAAC CTGTTCCTGTGC |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||| 124016 ACATCAGGAAACTGCGGGTGATCATCAACGTG...CAGCTGTTCCTGTGC 1350 . : . : . : . : . : 1261 TGCCTCCTGAACCTGCAAGAGTCAGGGCTGCTGTGTGAG GT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|| 124775 TGCCTCCTGAACCTGCAAGAGTCAGGGCTGCTGTGTGAGGTG...CAGGT 1400 . : . : . : . : . : 1302 GGAGGCGGAGCGCCTGTTCAGCAACATCCCGGAGATCGCGCAGCTGCACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 124936 GGAGGCGGAGCGCCTGTTCAGCAACATCCCGGAGATCGCGCAGCTGCACC 1450 . : . : . : . : . : 1352 GCAGGCTGTGGGCTAGCGTGATGGCGCCGGTGCTGGAGAAGGCGCGGCGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 124986 GCAGGCTGTGGGCTAGCGTGATGGCGCCGGTGCTGGAGAAGGCGCGGCGC 1500 . : . : . : . : . : 1402 ACGCGAGCGCTGCTACAGCCCGGGGACTTCCTCAAAGGCTTCAAGATG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>> 125036 ACGCGAGCGCTGCTACAGCCCGGGGACTTCCTCAAAGGCTTCAAGATGGT 1550 . : . : . : . : . : 1450 TTCGGCTCGCTCTTCAAGCCCTACATCCGCTACTGCATGGAGG >...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125086 A...CAGTTCGGCTCGCTCTTCAAGCCCTACATCCGCTACTGCATGGAGG 1600 . : . : . : . : . : 1493 AGGAGGGCTGCATGGAGTACATGCGCGGCCTGCTGCGCGACAACGACCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125514 AGGAGGGCTGCATGGAGTACATGCGCGGCCTGCTGCGCGACAACGACCTC 1650 . : . : . : . : . : 1543 TTCCGGGCCTACATCACG TGGGCGGAGAAGCACCCACAGTG ||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||| 125564 TTCCGGGCCTACATCACGGTG...CAGTGGGCGGAGAAGCACCCACAGTG 1700 . : . : . : . : . : 1584 CCAGAGGCTGAAGCTGAGCGACATGCTGGCCAAACCCCACCAGCGGCTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125710 CCAGAGGCTGAAGCTGAGCGACATGCTGGCCAAACCCCACCAGCGGCTCA 1750 . : . : . : . : . : 1634 CCAAGTACCCGCTGCTGCTCAAGTCGGTGCTGAGGAAGACCGAGGAGCCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125760 CCAAGTACCCGCTGCTGCTCAAGTCGGTGCTGAGGAAGACCGAGGAGCCG 1800 . : . : . : . : . : 1684 CGCGCCAAGGAGGCCGTCGTCGCCATG ATCGGCTCCGTGGA |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||| 125810 CGCGCCAAGGAGGCCGTCGTCGCCATGGTA...TAGATCGGCTCCGTGGA 1850 . : . : . : . : . : 1725 GCGCTTCATCCACCACGTGAACGCGTGCATGCGGCAGCGGCAGGAGCGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125942 GCGCTTCATCCACCACGTGAACGCGTGCATGCGGCAGCGGCAGGAGCGGC 1900 . : . : . : . : . : 1775 AGCGGCTGGCGGCCGTGGTGAGCCGCATCGACGCCTACGAGGTGGTGGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 125992 AGCGGCTGGCGGCCGTGGTGAGCCGCATCGACGCCTACGAGGTGGTGGAA 1950 . : . : . : . : . : 1825 AGCAGCAGCGACGAAGTGGACAAG CTCCTGAAGGAATTTCT ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||| 126042 AGCAGCAGCGACGAAGTGGACAAGGTG...CAGCTCCTGAAGGAATTTCT 2000 . : . : . : . : . : 1866 GCACCTGGACTTGACAGCGCCCATCCCTGGCGCCTCCCCGGAGGAGACGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126233 GCACCTGGACTTGACAGCGCCCATCCCTGGCGCCTCCCCGGAGGAGACGC 2050 . : . : . : . : . : 1916 GGCAGCTGCTGCTGGAGGGGAGCCTGAGGATGAAGGAGGGGAAGGACAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126283 GGCAGCTGCTGCTGGAGGGGAGCCTGAGGATGAAGGAGGGGAAGGACAGC 2100 . : . : . : . : . : 1966 AAG ATGGATGTGTACTGCTTCCTCTTCACGGATCTGCTGTT |||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126333 AAGGTG...CAGATGGATGTGTACTGCTTCCTCTTCACGGATCTGCTGTT 2150 . : . : . : . : . : 2007 GGTGACCAAAGCAGTGAAGAAGGCAGAGAGGACCAGGGTCATCAGGCCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126933 GGTGACCAAAGCAGTGAAGAAGGCAGAGAGGACCAGGGTCATCAGGCCAC 2200 . : . : . : . : . : 2057 CCCTGCTCGTGGACAAGATTGTGTGCCGGGAGCTACGGGACCCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 126983 CCCTGCTCGTGGACAAGATTGTGTGCCGGGAGCTACGGGACCCTGGTA.. 2250 . : . : . : . : . : 2102 GGTCCTTCCTCCTTATCTACCTGAATGAGTTTCACAGTGCTGTAGG .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 127033 .CAGGGTCCTTCCTCCTTATCTACCTGAATGAGTTTCACAGTGCTGTAGG 2300 . : . : . : . : . : 2148 GGCCTACACGTTCCAGGCCAGTGGCCAGGCCTTGTGCCGTGGCTGGGTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 127167 GGCCTACACGTTCCAGGCCAGTGGCCAGGCCTTGTGCCGTGGCTGGGTGG 2350 . : . : . : . : . : 2198 ACACCATTTACAATGCCCAG AACCAGCTGCAACAGCTGCGT ||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||| 127217 ACACCATTTACAATGCCCAGGTG...CAGAACCAGCTGCAACAGCTGCGT 2400 . : . : . : . : . : 2239 GCACAGGAGCCCCCAGGCAGTCAGCAGCCCCTGCAGAGCCTGGAAGAGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 127351 GCACAGGAGCCCCCAGGCAGTCAGCAGCCCCTGCAGAGCCTGGAAGAGGA 2450 . : . : . : . : . : 2289 GGAGGATGAGCAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 127401 GGAGGATGAGCAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAG 2500 . : . : . : . : . : 2339 GCGAGGACAGTGGCACTTCAGCTGCCAGCTCCCCTACCATCATGCGGAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 127451 GCGAGGACAGTGGCACTTCAGCTGCCAGCTCCCCTACCATCATGCGGAAA 2550 . : . : . : . : . : 2389 AGCAGCGGCAGCCCCGACTCTCAGCACTG TGCCTCAGATGG |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||| 127501 AGCAGCGGCAGCCCCGACTCTCAGCACTGGTA...CAGTGCCTCAGATGG 2600 . : . : . : . : . : 2430 CTCCACGGAGACCCTGGCCATGGTTGTGGTAGAGCCTGGGGACACGCTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 127997 CTCCACGGAGACCCTGGCCATGGTTGTGGTAGAGCCTGGGGACACGCTGT 2650 . : . : . : . : . : 2480 CCTCCCCCGAGTTCGACAGCGGTCCTTTCAGCTCCCAGTCTGATGAGACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128047 CCTCCCCCGAGTTCGACAGCGGTCCTTTCAGCTCCCAGTCTGATGAGACC 2700 . : . : . : . : . : 2530 TCTCTCAGCACCACTGCCTCATCTGCCACGCCCACCAGTGAGCTGCTGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128097 TCTCTCAGCACCACTGCCTCATCTGCCACGCCCACCAGTGAGCTGCTGCC 2750 . : . : . : . : . : 2580 CCTGGGTCCGGTGGACGGCCGCTCCTGCTCCATGGACTCTGCCTACGGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128147 CCTGGGTCCGGTGGACGGCCGCTCCTGCTCCATGGACTCTGCCTACGGCA 2800 . : . : . : . : . : 2630 CCCTCTCCCCAACCTCCTTACAAGACTTTGTGGCCCCAGGCCCAATGGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128197 CCCTCTCCCCAACCTCCTTACAAGACTTTGTGGCCCCAGGCCCAATGGCA 2850 . : . : . : . : . : 2680 GAGCTAGTGCCTCGGGCCCCAGAGTCCCCACGAGTTCCTTCCCCTCCACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128247 GAGCTAGTGCCTCGGGCCCCAGAGTCCCCACGAGTTCCTTCCCCTCCACC 2900 . : . : . : . : . : 2730 CTCGCCCCGTCTCCGCCGCCGCACCCCTGTCCAGCTGTTGAGCTGCCCGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128297 CTCGCCCCGTCTCCGCCGCCGCACCCCTGTCCAGCTGTTGAGCTGCCCGC 2950 . : . : . : . : . : 2780 CCCACCTGCTCAAGTCTAAGTCCGAGGCCAGCCTCCTCCAGCTGCTGGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128347 CCCACCTGCTCAAGTCTAAGTCCGAGGCCAGCCTCCTCCAGCTGCTGGCA 3000 . : . : . : . : . : 2830 GGGGCTGGCACCCATGGGACACCCTCTGCCCCCAGCCGCAGCCTGTCAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128397 GGGGCTGGCACCCATGGGACACCCTCTGCCCCCAGCCGCAGCCTGTCAGA 3050 . : . : . : . : . : 2880 GCTCTGCCTGGCTGTTCCAGCCCCAGGTATTAGGACTCAGGGCTCCCCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128447 GCTCTGCCTGGCTGTTCCAGCCCCAGGTATTAGGACTCAGGGCTCCCCTC 3100 . : . : . : . : . : 2930 AGGAAGCTGGGCCCAGCTGGGATTGCCGAGGGGCCCCTAGCCCTGGCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128497 AGGAAGCTGGGCCCAGCTGGGATTGCCGAGGGGCCCCTAGCCCTGGCAGC 3150 . : . : . : . : . : 2980 GGTCCTGGGCTAGTCGGCTGCCTGGCCGGGGAACCTGCAGGCTCCCACAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128547 GGTCCTGGGCTAGTCGGCTGCCTGGCCGGGGAACCTGCAGGCTCCCACAG 3200 . : . : . : . : . : 3030 GAAGAGGTGTGGAGACCTGCCCTCGGGGGCCTCTCCCAGGGTCCAGCCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128597 GAAGAGGTGTGGAGACCTGCCCTCGGGGGCCTCTCCCAGGGTCCAGCCTG 3250 . : . : . : . : . : 3080 AGCCCCCACCAGGGGTCTCTGCCCAGCACAGGAAGCTGACCCTGGCCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128647 AGCCCCCACCAGGGGTCTCTGCCCAGCACAGGAAGCTGACCCTGGCCCAG 3300 . : . : . : . : . : 3130 CTCTACCGAATCAGGACCACCCTGCTGCTTAACTCCACGCTCACTGCCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128697 CTCTACCGAATCAGGACCACCCTGCTGCTTAACTCCACGCTCACTGCCTC 3350 . 3180 G GAGGTC |-|||-|- 128747 GTGAG T