Result of FASTA (omim) for pF1KA0606
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0606, 1205 aa
  1>>>pF1KA0606 1205 - 1205 aa - 1205 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3505+/-0.000402; mu= 9.6807+/- 0.025
 mean_var=227.8158+/-50.972, 0's: 0 Z-trim(118.9): 189  B-trim: 1560 in 1/58
 Lambda= 0.084973
 statistics sampled from 32040 (32293) to 32040 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.703), E-opt: 0.2 (0.379), width:  16
 Scan time: 14.300

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_919431 (OMIM: 609396) PH domain leucine-rich re (1717) 8031 998.9       0
NP_055835 (OMIM: 611066) PH domain leucine-rich re (1323) 4113 518.5 1.1e-145
XP_011524188 (OMIM: 609396) PREDICTED: PH domain l (1109) 3928 495.8 6.6e-139
NP_001275932 (OMIM: 611066) PH domain leucine-rich (1256) 1838 239.6 9.7e-62
NP_001255968 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich re ( 536)  511 76.6 4.9e-13
NP_001311265 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich re ( 582)  421 65.6 1.1e-09
XP_016872191 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582)  421 65.6 1.1e-09
NP_001311266 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich re ( 582)  421 65.6 1.1e-09
NP_031399 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich repea ( 582)  421 65.6 1.1e-09
XP_016872193 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582)  421 65.6 1.1e-09
XP_016872192 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leuc ( 582)  421 65.6 1.1e-09
NP_060684 (OMIM: 608195) leucine-rich repeat-conta ( 524)  409 64.0 2.8e-09
XP_011513028 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 524)  409 64.0 2.8e-09
XP_016866486 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 331)  350 56.6 3.1e-07
NP_056171 (OMIM: 607733) protein scribble homolog  (1630)  334 55.3 3.7e-06
NP_874365 (OMIM: 607733) protein scribble homolog  (1655)  334 55.3 3.7e-06
XP_011513029 (OMIM: 608195) PREDICTED: leucine-ric ( 465)  302 50.9 2.3e-05
NP_001073982 (OMIM: 603104) carboxypeptidase N sub ( 545)  275 47.6 0.00026
XP_005269337 (OMIM: 603104) PREDICTED: carboxypept ( 545)  275 47.6 0.00026
NP_001278917 (OMIM: 603104) carboxypeptidase N sub ( 545)  275 47.6 0.00026
NP_443204 (OMIM: 611289) leucine-rich alpha-2-glyc ( 347)  266 46.3  0.0004
NP_963844 (OMIM: 610846) leucine-rich repeat-conta ( 277)  264 46.0  0.0004
NP_001304841 (OMIM: 611931) protein phosphatase 1L ( 181)  256 44.8 0.00059
NP_001304840 (OMIM: 611931) protein phosphatase 1L ( 233)  256 44.9 0.00071
NP_001017403 (OMIM: 606653) leucine-rich repeat-co ( 967)  266 46.8 0.00083
NP_640338 (OMIM: 611931) protein phosphatase 1L is ( 360)  256 45.1 0.00096
NP_002014 (OMIM: 600245) fibromodulin precursor [H ( 376)  256 45.1 0.00099
NP_001258 (OMIM: 602178) chondroadherin precursor  ( 359)  252 44.6  0.0013
XP_011522516 (OMIM: 602178) PREDICTED: chondroadhe ( 440)  252 44.7  0.0016
NP_002336 (OMIM: 600616) lumican precursor [Homo s ( 338)  245 43.8  0.0023
NP_067649 (OMIM: 606653) leucine-rich repeat-conta ( 915)  253 45.2  0.0024
NP_036557 (OMIM: 179555) ras suppressor protein 1  ( 277)  240 43.1  0.0031
XP_005252609 (OMIM: 179555) PREDICTED: ras suppres ( 277)  240 43.1  0.0031
XP_016857485 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 876)  249 44.6  0.0033
XP_011508141 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 900)  249 44.7  0.0033
XP_005245461 (OMIM: 606653) PREDICTED: leucine-ric ( 924)  249 44.7  0.0034
XP_016857384 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1255)  250 44.9  0.0039
NP_003658 (OMIM: 606667) leucine-rich repeat-conta ( 907)  247 44.4   0.004
XP_016857383 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1438)  250 45.0  0.0043
XP_016857382 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1472)  250 45.0  0.0043
XP_016857381 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1490)  250 45.0  0.0044
NP_001317564 (OMIM: 614453) leucine-rich repeat-co (1495)  250 45.0  0.0044
XP_016857379 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1528)  250 45.0  0.0045
XP_016857378 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1537)  250 45.0  0.0045
NP_065845 (OMIM: 614453) leucine-rich repeat-conta (1537)  250 45.0  0.0045
XP_016857377 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1541)  250 45.0  0.0045
XP_016857376 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1547)  250 45.0  0.0045
XP_016857374 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1594)  250 45.0  0.0046
XP_016857375 (OMIM: 614453) PREDICTED: leucine-ric (1594)  250 45.0  0.0046
NP_056379 (OMIM: 610868) leucine-rich repeat trans ( 516)  240 43.3  0.0048


>>NP_919431 (OMIM: 609396) PH domain leucine-rich repeat  (1717 aa)
 initn: 8031 init1: 8031 opt: 8031  Z-score: 5330.8  bits: 998.9 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 8031; 99.9% identity (99.9% similar) in 1205 aa overlap (1-1205:513-1717)

                                             10        20        30
pF1KA0                               MDSEIGCLIRFYAGKPHSTGSSERIQLSGM
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 LEAEEKPLQIQNDYLFQLGFGELWRVQEEGMDSEIGCLIRFYAGKPHSTGSSERIQLSGM
            490       500       510       520       530       540  

               40        50        60        70        80        90
pF1KA0 YNVRKGKMQLPVNRWTRRQVILCGTCLIVSSVKDSLTGKMHVLPLIGGKVEEVKKHQHCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 YNVRKGKMQLPVNRWTRRQVILCGTCLIVSSVKDSLTGKMHVLPLIGGKVEEVKKHQHCL
            550       560       570       580       590       600  

              100       110       120       130       140       150
pF1KA0 AFSSSGPQSQTYYICFDTFTEYLRWLRQVSKVASQRISSVDLSCCSLEHLPANLFYSQDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 AFSSSGPQSQTYYICFDTFTEYLRWLRQVSKVASQRISSVDLSCCSLEHLPANLFYSQDL
            610       620       630       640       650       660  

              160       170       180       190       200       210
pF1KA0 THLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNHLGDFPLAVCSIPTLAELNVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 THLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNHLGDFPLAVCSIPTLAELNVS
            670       680       690       700       710       720  

              220       230       240       250       260       270
pF1KA0 CNALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQLSYLGLSFNEFTDIPEVLEKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 CNALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQLSYLGLSFNEFTDIPEVLEKL
            730       740       750       760       770       780  

              280       290       300       310       320       330
pF1KA0 TAVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 TAVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNK
            790       800       810       820       830       840  

              340       350       360       370       380       390
pF1KA0 LGDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSNELVQLDVYPVPNYLSYMDVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 LGDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSNELVQLDVYPVPNYLSYMDVS
            850       860       870       880       890       900  

              400       410       420       430       440       450
pF1KA0 RNRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLERT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 RNRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLERT
            910       920       930       940       950       960  

              460       470       480       490       500       510
pF1KA0 SVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLSEETNSILQELYLTNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 SVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLSEETNSILQELYLTNN
            970       980       990      1000      1010      1020  

              520       530       540       550       560       570
pF1KA0 SLTDKCVPLLTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 SLTDKCVPLLTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNC
           1030      1040      1050      1060      1070      1080  

              580       590       600       610       620       630
pF1KA0 SRMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPEIKCVDLSCNELSEVTLPENLPPKLQELDLTGNPRLV
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 RRMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPEIKCVDLSCNELSEVTLPENLPPKLQELDLTGNPRLV
           1090      1100      1110      1120      1130      1140  

              640       650       660       670       680       690
pF1KA0 LDHKTLELLNNIRCFKIDQPSTGDASGAPAVWSHGYTEASGVKNKLCVAALSVNNFCDNR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 LDHKTLELLNNIRCFKIDQPSTGDASGAPAVWSHGYTEASGVKNKLCVAALSVNNFCDNR
           1150      1160      1170      1180      1190      1200  

              700       710       720       730       740       750
pF1KA0 EALYGVFDGDRNVEVPYLLQCTMSDILAEELQKTKNEEEYMVNTFIVMQRKLGTAGQKLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 EALYGVFDGDRNVEVPYLLQCTMSDILAEELQKTKNEEEYMVNTFIVMQRKLGTAGQKLG
           1210      1220      1230      1240      1250      1260  

              760       770       780       790       800       810
pF1KA0 GAAVLCHIKHDPVDPGGSFTLTSANVGKCQTVLCRNGKPLPLSRSYIMSCEEELKRIKQH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 GAAVLCHIKHDPVDPGGSFTLTSANVGKCQTVLCRNGKPLPLSRSYIMSCEEELKRIKQH
           1270      1280      1290      1300      1310      1320  

              820       830       840       850       860       870
pF1KA0 KAIITEDGKVNGVTESTRILGYTFLHPSVVPRPHVQSVLLTPQDEFFILGSKGLWDSLSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 KAIITEDGKVNGVTESTRILGYTFLHPSVVPRPHVQSVLLTPQDEFFILGSKGLWDSLSV
           1330      1340      1350      1360      1370      1380  

              880       890       900       910       920       930
pF1KA0 EEAVEAVRNVPDALAAAKKLCTLAQSYGCHDSISAVVVQLSVTEDSFCCCELSAGGAVPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 EEAVEAVRNVPDALAAAKKLCTLAQSYGCHDSISAVVVQLSVTEDSFCCCELSAGGAVPP
           1390      1400      1410      1420      1430      1440  

              940       950       960       970       980       990
pF1KA0 PSPGIFPPSVNMVIKDRPSDGLGVPSSSSGMASEISSELSTSEMSSEVGSTASDEPPPGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 PSPGIFPPSVNMVIKDRPSDGLGVPSSSSGMASEISSELSTSEMSSEVGSTASDEPPPGA
           1450      1460      1470      1480      1490      1500  

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KA0 LSENSPAYPSEQRCMLHPICLSNSFQRQLSSATFSSAFSDNGLDSDDEEPIEGVFTNGSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 LSENSPAYPSEQRCMLHPICLSNSFQRQLSSATFSSAFSDNGLDSDDEEPIEGVFTNGSR
           1510      1520      1530      1540      1550      1560  

             1060      1070      1080      1090      1100      1110
pF1KA0 VEVEVDIHCSRAKEKEKQQHLLQVPAEASDEGIVISANEDEPGLPRKADFSAVGTIGRRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 VEVEVDIHCSRAKEKEKQQHLLQVPAEASDEGIVISANEDEPGLPRKADFSAVGTIGRRR
           1570      1580      1590      1600      1610      1620  

             1120      1130      1140      1150      1160      1170
pF1KA0 ANGSVAPQERSHNVIEVATDAPLRKPGGYFAAPAQPDPDDQFIIPPELEEEVKEIMKHHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 ANGSVAPQERSHNVIEVATDAPLRKPGGYFAAPAQPDPDDQFIIPPELEEEVKEIMKHHQ
           1630      1640      1650      1660      1670      1680  

             1180      1190      1200     
pF1KA0 EQQQQQQPPPPPQLQPQLPRHYQLDQLPDYYDTPL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_919 EQQQQQQPPPPPQLQPQLPRHYQLDQLPDYYDTPL
           1690      1700      1710       

>>NP_055835 (OMIM: 611066) PH domain leucine-rich repeat  (1323 aa)
 initn: 3627 init1: 1880 opt: 4113  Z-score: 2736.4  bits: 518.5 E(85289): 1.1e-145
Smith-Waterman score: 4343; 54.8% identity (80.1% similar) in 1207 aa overlap (2-1186:128-1315)

                                            10        20        30 
pF1KA0                              MDSEIGCLIRFYAGKPHSTGSSERIQLSGMY
                                     . ..::.::::. ::      .:: :::.:
NP_055 EPTERPLQIVYDYLSRLGFDDPVRIQEEATNPDLGCMIRFYGEKPCHMDRLDRILLSGIY
       100       110       120       130       140       150       

              40        50        60        70        80        90 
pF1KA0 NVRKGKMQLPVNRWTRRQVILCGTCLIVSSVKDSLTGKMHVLPLIGGKVEEVKKHQHCLA
       :::::: ::  ..:..: :.:::::::::::::  :::::.:::.:::.::::..:. ::
NP_055 NVRKGKTQL--HKWAERLVVLCGTCLIVSSVKDCQTGKMHILPLVGGKIEEVKRRQYSLA
       160         170       180       190       200       210     

             100       110       120       130       140       150 
pF1KA0 FSSSGPQSQTYYICFDTFTEYLRWLRQVSKVASQRISSVDLSCCSLEHLPANLFYSQDLT
       :::.: :.:::.. :.:..:: :: ::.:::.:::::.::::: :::..: .::::::.:
NP_055 FSSAGAQAQTYHVSFETLAEYQRWQRQASKVVSQRISTVDLSCYSLEEVPEHLFYSQDIT
         220       230       240       250       260       270     

             160       170       180       190       200       210 
pF1KA0 HLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNHLGDFPLAVCSIPTLAELNVSC
       .:::..::..    :    ::. : .:..::.::::.:.:: ::. .: : ::.:::.::
NP_055 YLNLRHNFMQ----LERPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTLTELNLSC
         280           290       300       310       320       330 

             220       230       240       250       260       270 
pF1KA0 NALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQLSYLGLSFNEFTDIPEVLEKLT
       :.....:. .: . ::::. :::::: .:: :: :..::: ::.:::.:..:::: ::::
NP_055 NGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIPEVYEKLT
             340       350       360       370       380       390 

             280       290       300       310       320       330 
pF1KA0 AVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNKL
        .:.. :.:::.:.: : .: .: ::::::::.: .. .. ....  .:.:..:::::.:
NP_055 MLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHVDLRDNRL
             400       410       420       430       440       450 

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pF1KA0 GDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSNELVQLDVYPVPNYLSYMDVSR
        :::   . ..: ::: ::::  : . :. :..::::::.:. ..:::::. :...:.::
NP_055 TDLDLSSLCSLEQLHCGRNQLRELTLSGFSLRTLYASSNRLTAVNVYPVPSLLTFLDLSR
             460       470       480       490       500       510 

             400       410       420       430       440       450 
pF1KA0 NRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLERTS
       : :: ::.:.::..:.::::...: . :.:.:.. . :::::. :::..  ::  .:.  
NP_055 NLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLGHNHVQNLPTLVEHIP
             520       530       540       550       560       570 

             460       470       480       490       500       510 
pF1KA0 VEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLSEETNSILQELYLTNNS
       .::::.::: : .:: .:. :: .::.::::::.::::: :  .::. :.:: :::::: 
NP_055 LEVLDLQHNALTRLPDTLFSKALNLRYLNASANSLESLPSACTGEESLSMLQLLYLTNNL
             580       590       600       610       620       630 

             520       530       540       550       560       570 
pF1KA0 LTDKCVPLLTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNCS
       :::.:.:.:.:: ::.:::.: :.::.:::::. :::.:::..:::::::.::::: ::.
NP_055 LTDQCIPVLVGHLHLRILHLANNQLQTFPASKLNKLEQLEELNLSGNKLKTIPTTIANCK
             640       650       660       670       680       690 

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pF1KA0 RMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPEIKCVDLSCNELSEVTLPENLPPKLQELDLTGNPRLVL
       :.::..:::: : .:::..:::.:. ::::::.:.:. .:: ::  ::.::::::  :::
NP_055 RLHTLVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDLTEILIPEALPATLQDLDLTGNTNLVL
             700       710       720       730       740       750 

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pF1KA0 DHKTLELLNNIRCFKIDQ---PSTGDASGAPAVWSHGYTEASGVKNKLCVAALSVNNFCD
       .::::.....:  .::::   :.: :.. . . :::: .: .: .:::::.::....: .
NP_055 EHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTT-DSTVTSTFWSHGLAEMAGQRNKLCVSALAMDSFAE
             760       770        780       790       800       810

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pF1KA0 NREALYGVFDGDRNVEVPYLLQCTMSDILAEELQKTKNEEEYMVNTFIVMQRKLGTAGQK
       .  :.::.:::::: :.: ::::::.:.: ::.:.. :.  .:.:::.: .:::: ::::
NP_055 GVGAVYGMFDGDRNEELPRLLQCTMADVLLEEVQQSTNDTVFMANTFLVSHRKLGMAGQK
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pF1KA0 LGGAAVLCHIKHDPVDPGGSFTLTSANVGKCQTVLCRNGKPLPLSRSYIMSCE-EELKRI
       ::..:.::.:. : .::..::.:: :::: ::.::::.:::.:::. . .  . :: .:.
NP_055 LGSSALLCYIRPDTADPASSFSLTVANVGTCQAVLCRGGKPVPLSKVFSLEQDPEEAQRV
              880       890       900       910       920       930

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pF1KA0 KQHKAIITEDGKVNGVTESTRILGYTFLHPSVVPRPHVQSVLLTPQDEFFILGSKGLWDS
       :..:::::::.::::::  ::.:: :.:.: ..:.::..:. :: :::..:::.:.::. 
NP_055 KDQKAIITEDNKVNGVTCCTRMLGCTYLYPWILPKPHISSTPLTIQDELLILGNKALWEH
              940       950       960       970       980       990

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pF1KA0 LSVEEAVEAVRNVPDALAAAKKLCTLAQSYGCHDSISAVVVQLSVTEDSFCCCELSAGGA
       ::  :::.:::.: : ::::::::::::::::.:...:.:: :.. :.. : ::.. : .
NP_055 LSYTEAVNAVRHVQDPLAAAKKLCTLAQSYGCQDNVGAMVVYLNIGEEG-CTCEMN-GLT
             1000      1010      1020      1030       1040         

       930       940       950       960       970       980       
pF1KA0 VPPPSPGIFPPSVNMVIKDRPSDGLGVPSSSSGMASEISSELSTSEMSSEVGSTASDEPP
       .: :  :.   . . .::: :. .  .::::::.:::.:::.::::.:::::::::::  
NP_055 LPGPV-GF---ASTTTIKDAPKPA--TPSSSSGIASEFSSEMSTSEVSSEVGSTASDEHN
     1050          1060        1070      1080      1090      1100  

       990      1000      1010      1020      1030      1040       
pF1KA0 PGALSENSPAYPSEQRCMLHPICLSNSFQRQLSSATFSSAFSDNGLDSDDEEPIEGVFTN
        :.:.      : :.:: :::   :. :::: :::::::  :::::::::..:.:::.::
NP_055 AGGLDTALLPRP-ERRCSLHPTPTSGLFQRQPSSATFSSNQSDNGLDSDDDQPVEGVITN
           1110       1120      1130      1140      1150      1160 

      1050      1060      1070       1080                          
pF1KA0 GSRVEVEVDIHCSRAKEKEKQQHLLQV-PAEASDE-----------------GIVISANE
       ::.::::::::: :... :..  :..  :.  :.:                 :...  ..
NP_055 GSKVEVEVDIHCCRGRDLENSPPLIESSPTLCSEEHARGSCFGIRRQNSVNSGMLLPMSK
            1170      1180      1190      1200      1210      1220 

    1090      1100      1110      1120      1130      1140         
pF1KA0 DEPGLPRKADFSAVGTIGRRRANGSVAPQERSHNVIEVATDAPLRKPGGYFAAPAQPDPD
       :.  : .. . : .   :.. .:::..: : : :.:::::..: :: : :::::.: .:.
NP_055 DRMELQKSPSTSCL--YGKKLSNGSIVPLEDSLNLIEVATEVPKRKTG-YFAAPTQMEPE
            1230        1240      1250      1260       1270        

    1150      1160      1170      1180      1190      1200     
pF1KA0 DQFIIPPELEEEVKEIMKHHQEQQQQQQPPPPPQLQPQLPRHYQLDQLPDYYDTPL
       :::..: .::::::: ::.::... . .:    . .:                   
NP_055 DQFVVPHDLEEEVKEQMKQHQDSRLEPEPHEEDRTEPPEEFDTAL           
     1280      1290      1300      1310      1320              

>>XP_011524188 (OMIM: 609396) PREDICTED: PH domain leuci  (1109 aa)
 initn: 3928 init1: 3928 opt: 3928  Z-score: 2614.8  bits: 495.8 E(85289): 6.6e-139
Smith-Waterman score: 3928; 99.8% identity (99.8% similar) in 596 aa overlap (1-596:513-1108)

                                             10        20        30
pF1KA0                               MDSEIGCLIRFYAGKPHSTGSSERIQLSGM
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LEAEEKPLQIQNDYLFQLGFGELWRVQEEGMDSEIGCLIRFYAGKPHSTGSSERIQLSGM
            490       500       510       520       530       540  

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pF1KA0 YNVRKGKMQLPVNRWTRRQVILCGTCLIVSSVKDSLTGKMHVLPLIGGKVEEVKKHQHCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YNVRKGKMQLPVNRWTRRQVILCGTCLIVSSVKDSLTGKMHVLPLIGGKVEEVKKHQHCL
            550       560       570       580       590       600  

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pF1KA0 AFSSSGPQSQTYYICFDTFTEYLRWLRQVSKVASQRISSVDLSCCSLEHLPANLFYSQDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AFSSSGPQSQTYYICFDTFTEYLRWLRQVSKVASQRISSVDLSCCSLEHLPANLFYSQDL
            610       620       630       640       650       660  

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pF1KA0 THLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNHLGDFPLAVCSIPTLAELNVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 THLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNHLGDFPLAVCSIPTLAELNVS
            670       680       690       700       710       720  

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pF1KA0 CNALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQLSYLGLSFNEFTDIPEVLEKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CNALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQLSYLGLSFNEFTDIPEVLEKL
            730       740       750       760       770       780  

              280       290       300       310       320       330
pF1KA0 TAVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TAVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNK
            790       800       810       820       830       840  

              340       350       360       370       380       390
pF1KA0 LGDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSNELVQLDVYPVPNYLSYMDVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LGDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSNELVQLDVYPVPNYLSYMDVS
            850       860       870       880       890       900  

              400       410       420       430       440       450
pF1KA0 RNRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLERT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RNRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLERT
            910       920       930       940       950       960  

              460       470       480       490       500       510
pF1KA0 SVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLSEETNSILQELYLTNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLSEETNSILQELYLTNN
            970       980       990      1000      1010      1020  

              520       530       540       550       560       570
pF1KA0 SLTDKCVPLLTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLTDKCVPLLTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNC
           1030      1040      1050      1060      1070      1080  

              580       590       600       610       620       630
pF1KA0 SRMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPEIKCVDLSCNELSEVTLPENLPPKLQELDLTGNPRLV
        :::::::::::::::::::::::::                                  
XP_011 RRMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPEIKD                                 
           1090      1100                                          

>>NP_001275932 (OMIM: 611066) PH domain leucine-rich rep  (1256 aa)
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                                     . ..::.::::. ::      .:: :::.:
NP_001 EPTERPLQIVYDYLSRLGFDDPVRIQEEATNPDLGCMIRFYGEKPCHMDRLDRILLSGIY
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pF1KA0 NVRKGKMQLPVNRWTRRQVILCGTCLIVSSVKDSLTGKMHVLPLIGGKVEEVKKHQHCLA
       :::::: ::  ..:..: :.:::::::::::::  :::::.:::.:::.::::..:. ::
NP_001 NVRKGKTQL--HKWAERLVVLCGTCLIVSSVKDCQTGKMHILPLVGGKIEEVKRRQYSLA
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pF1KA0 FSSSGPQSQTYYICFDTFTEYLRWLRQVSKVASQRISSVDLSCCSLEHLPANLFYSQDLT
       :::.: :.:::.. :.:..:: :: ::.:::.:::::.::::: :::..: .::::::.:
NP_001 FSSAGAQAQTYHVSFETLAEYQRWQRQASKVVSQRISTVDLSCYSLEEVPEHLFYSQDIT
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pF1KA0 HLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNHLGDFPLAVCSIPTLAELNVSC
       .:::..::..    :    ::. : .:..::.::::.:.:: ::. .: : ::.:::.::
NP_001 YLNLRHNFMQ----LERPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTLTELNLSC
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pF1KA0 NALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQLSYLGLSFNEFTDIPEVLEKLT
       :.....:. .: . ::::. :::::: .:: :: :..::: ::.:::.:..:::: ::::
NP_001 NGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIPEVYEKLT
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pF1KA0 AVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNKL
        .:.. :.:::.:.: : .: .: ::::::::.: .. .. ....  .:.:..:::::.:
NP_001 MLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHVDLRDNRL
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pF1KA0 GDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSNELVQLDVYPVPNYLSYMDVSR
        :::   . ..: ::: ::::  : . :. :..::::::.:. ..:::::. :...:.::
NP_001 TDLDLSSLCSLEQLHCGRNQLRELTLSGFSLRTLYASSNRLTAVNVYPVPSLLTFLDLSR
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pF1KA0 NRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLERTS
       : :: ::.:.::..:.::::...: . :.:.:.. . :::::. :::..  ::  .:.  
NP_001 NLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLGHNHVQNLPTLVEHIP
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pF1KA0 VEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLSEETNSILQELYLTNNS
       .::::.::: : .:: .:. ::     ::                               
NP_001 LEVLDLQHNALTRLPDTLFSKA-----LN-------------------------------
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pF1KA0 LTDKCVPLLTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNCS
                                      :. :::.:::..:::::::.::::: ::.
NP_001 -------------------------------KLNKLEQLEELNLSGNKLKTIPTTIANCK
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pF1KA0 RMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPEIKCVDLSCNELSEVTLPENLPPKLQELDLTGNPRLVL
       :.::..:::: : .:::..:::.:. ::::::.:.:. .:: ::  ::.::::::  :::
NP_001 RLHTLVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDLTEILIPEALPATLQDLDLTGNTNLVL
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pF1KA0 DHKTLELLNNIRCFKIDQ---PSTGDASGAPAVWSHGYTEASGVKNKLCVAALSVNNFCD
       .::::.....:  .::::   :.: :.. . . :::: .: .: .:::::.::....: .
NP_001 EHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTT-DSTVTSTFWSHGLAEMAGQRNKLCVSALAMDSFAE
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pF1KA0 NREALYGVFDGDRNVEVPYLLQCTMSDILAEELQKTKNEEEYMVNTFIVMQRKLGTAGQK
       .  :.::.:::::: :.: ::::::.:.: ::.:.. :.  .:.:::.: .:::: ::::
NP_001 GVGAVYGMFDGDRNEELPRLLQCTMADVLLEEVQQSTNDTVFMANTFLVSHRKLGMAGQK
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pF1KA0 LGGAAVLCHIKHDPVDPGGSFTLTSANVGKCQTVLCRNGKPLPLSRSYIMSCE-EELKRI
       ::..:.::.:. : .::..::.:: :::: ::.::::.:::.:::. . .  . :: .:.
NP_001 LGSSALLCYIRPDTADPASSFSLTVANVGTCQAVLCRGGKPVPLSKVFSLEQDPEEAQRV
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pF1KA0 KQHKAIITEDGKVNGVTESTRILGYTFLHPSVVPRPHVQSVLLTPQDEFFILGSKGLWDS
       :..:::::::.::::::  ::.:: :.:.: ..:.::..:. :: :::..:::.:.::. 
NP_001 KDQKAIITEDNKVNGVTCCTRMLGCTYLYPWILPKPHISSTPLTIQDELLILGNKALWEH
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pF1KA0 LSVEEAVEAVRNVPDALAAAKKLCTLAQSYGCHDSISAVVVQLSVTEDSFCCCELSAGGA
       ::  :::.:::.: : ::::::::::::::::.:...:.:: :.. :.. : ::.. : .
NP_001 LSYTEAVNAVRHVQDPLAAAKKLCTLAQSYGCQDNVGAMVVYLNIGEEG-CTCEMN-GLT
           930       940       950       960       970         980 

       930       940       950       960       970       980       
pF1KA0 VPPPSPGIFPPSVNMVIKDRPSDGLGVPSSSSGMASEISSELSTSEMSSEVGSTASDEPP
       .: :  :.   . . .::: :. .  .::::::.:::.:::.::::.:::::::::::  
NP_001 LPGPV-GF---ASTTTIKDAPKPA--TPSSSSGIASEFSSEMSTSEVSSEVGSTASDEHN
                 990      1000        1010      1020      1030     

       990      1000      1010      1020      1030      1040       
pF1KA0 PGALSENSPAYPSEQRCMLHPICLSNSFQRQLSSATFSSAFSDNGLDSDDEEPIEGVFTN
        :.:.      : :.:: :::   :. :::: :::::::  :::::::::..:.:::.::
NP_001 AGGLDTALLPRP-ERRCSLHPTPTSGLFQRQPSSATFSSNQSDNGLDSDDDQPVEGVITN
        1040       1050      1060      1070      1080      1090    

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pF1KA0 GSRVEVEVDIHCSRAKEKEKQQHLLQV-PAEASDE-----------------GIVISANE
       ::.::::::::: :... :..  :..  :.  :.:                 :...  ..
NP_001 GSKVEVEVDIHCCRGRDLENSPPLIESSPTLCSEEHARGSCFGIRRQNSVNSGMLLPMSK
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    1090      1100      1110      1120      1130      1140         
pF1KA0 DEPGLPRKADFSAVGTIGRRRANGSVAPQERSHNVIEVATDAPLRKPGGYFAAPAQPDPD
       :.  : .. . : .   :.. .:::..: : : :.:::::..: :: : :::::.: .:.
NP_001 DRMELQKSPSTSCL--YGKKLSNGSIVPLEDSLNLIEVATEVPKRKTG-YFAAPTQMEPE
         1160        1170      1180      1190      1200       1210 

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pF1KA0 DQFIIPPELEEEVKEIMKHHQEQQQQQQPPPPPQLQPQLPRHYQLDQLPDYYDTPL
       :::..: .::::::: ::.::... . .:    . .:                   
NP_001 DQFVVPHDLEEEVKEQMKQHQDSRLEPEPHEEDRTEPPEEFDTAL           
            1220      1230      1240      1250                 

>>NP_001255968 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich repeat  (536 aa)
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NP_001 GKKDSSAAQPGVAFSVDNTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMR-LDLSKRS
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pF1KA0 LGDFPLAVCSIPTLAELNVSCNALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQL
       .  .: ..  .  :.:: .  : :.:.:: :: . ::.:. :. : : :::  :.:.:.:
NP_001 IHILPSSIKELTQLTELYLYSNKLQSLPAEVGCLVNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKL
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pF1KA0 SYLGLSFNEFTDIPEVLEKLTAVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKL
        .: :  :.. .:: :. .: ..  : .  : . :.. . .... ... ...: : :..:
NP_001 RMLDLRHNKLREIPSVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVE-KDIKNLSKLSMLSIRENKIKQL
             180       190       200        210       220       230

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pF1KA0 IADEVDFLQHVTQLDLRDNKLGDLDAMI--FNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYA-
        : :.  :. ...: :: :.:. .   .   . .: :. : :.. ::     .:..:   
NP_001 PA-EIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIPRSLAKCSALEELNLENNNISTLPES--LLSSLVKL
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pF1KA0 SSNELVQ--LDVYPV--PNYLSY---MDVSRNRLENVPEWVCESRK-LEVLDIGHNQICE
       .:  :..  ...:::  :. .:    ... .::....:  .    : :  :..  ::.  
NP_001 NSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTS
       290       300       310       320       330       340       

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pF1KA0 LPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLER-TSVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRF
       ::  .   .:. .:  . :::...:: .   .:.::: .  :.::.  :. : .  .:: 
NP_001 LPLDFGTWTSMVELNLATNQLTKIPEDVSGLVSLEVL-ILSNNLLKKLPHGLGNLRKLRE
       350       360       370       380        390       400      

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pF1KA0 LNASANKLESLPP--ATLSEETNSILQELYLTNNSLTDKCVPLLTGH-PHLKILHMAYNR
       :.   :::::::   : :..     ::.: ::::.::   .:   ::  .:  : .. : 
NP_001 LDLEENKLESLPNEIAYLKD-----LQKLVLTNNQLT--TLPRGIGHLTNLTHLGLGENL
        410       420            430         440       450         

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pF1KA0 LQSFPASKMAKLEELEEIDLSGN-KLKAIPTTIMNCSRMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPE
       :  .:  ... ::.:::. :. : .:...:  .  ::.. ....  ::            
NP_001 LTHLPE-EIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPFELALCSKL-SIMSIENCPLSHLPPQIVAG
     460        470       480       490        500       510       

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pF1KA0 IKCVDLSCNELSEVTLPENLPPKLQELDLTGNPRLVLDHKTLELLNNIRCFKIDQPSTGD
                                                                   
NP_001 GPSFIIQFLKMQGPYRAMV                                         
       520       530                                               

>>NP_001311265 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich repeat  (582 aa)
 initn: 328 init1: 187 opt: 421  Z-score: 294.9  bits: 65.6 E(85289): 1.1e-09
Smith-Waterman score: 524; 28.1% identity (61.2% similar) in 477 aa overlap (161-629:83-530)

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       .  .: ..  .  :.:: .  : :.:.:: :: . ::.:. :. : : :::  :.:.:.:
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        .: :  :.. .:: :. .: ..  : .  : . :.. . .... ... ...: : :..:
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        : :.  : ..  ::.  :.:  :        :. .:  .:...::.          . :
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       ::..: :.    . :: . .  :::  .:. . .   :: :.. .:.:  ::  :. .  
NP_001 ELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIPRSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLV
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       .: .:  ..:  ::  .    . ...  :...::.. ..: ... .:  :  :: . :.:
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        :::   :.  : . . :: :..:.::   .:  ..:   :..: .. : :...: . ..
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pF1KA0 KLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNCSRMHTVIAHSNCIEVFPE-VMQLPEIKCVDLSCNE
       .:..:.:.::  :::...:. :   . .. ..  .: . ..:. . .: ..  . :. : 
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pF1KA0 LSEVTLPENLPP--KLQELDLTGNPRLVLDHKTLELLNNIRCFKIDQPSTGDASGAPAVW
       :..  :::..    .:.:: :. :: :                                 
NP_001 LTH--LPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPFELALCSKLSIMSIENCPLSHLPPQIVAG
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>>XP_016872191 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leucine-  (582 aa)
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Smith-Waterman score: 524; 28.1% identity (61.2% similar) in 477 aa overlap (161-629:83-530)

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pF1KA0 DLSCCSLEHLPANLFYSQDLTHLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNH
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       .  .: ..  .  :.:: .  : :.:.:: :: . ::.:. :. : : :::  :.:.:.:
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        : :.  : ..  ::.  :.:  :        :. .:  .:...::.          . :
XP_016 PA-EIGELCNLITLDVAHNQLEHLPK------EIGNC--TQITNLDL----------QHN
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pF1KA0 ELVQL-DVYPVPNYLSYMDVSRNRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCN-S
       ::..: :.    . :: . .  :::  .:. . .   :: :.. .:.:  ::  :. .  
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pF1KA0 SLRKLLAGHN--QLARLPERLERTSVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKL
       .: .:  ..:  ::  .    . ...  :...::.. ..: ... .:  :  :: . :.:
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pF1KA0 ESLPPATLSEETNSILQELYLTNNSLTDKCVPL-LTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMA
        :::   :.  : . . :: :..:.::   .:  ..:   :..: .. : :...: . ..
XP_016 TSLP---LDFGTWTSMVELNLATNQLTK--IPEDVSGLVSLEVLILSNNLLKKLPHG-LG
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pF1KA0 KLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNCSRMHTVIAHSNCIEVFPE-VMQLPEIKCVDLSCNE
       .:..:.:.::  :::...:. :   . .. ..  .: . ..:. . .: ..  . :. : 
XP_016 NLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENL
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pF1KA0 LSEVTLPENLPP--KLQELDLTGNPRLVLDHKTLELLNNIRCFKIDQPSTGDASGAPAVW
       :..  :::..    .:.:: :. :: :                                 
XP_016 LTH--LPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPFELALCSKLSIMSIENCPLSHLPPQIVAG
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>>NP_001311266 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich repeat  (582 aa)
 initn: 328 init1: 187 opt: 421  Z-score: 294.9  bits: 65.6 E(85289): 1.1e-09
Smith-Waterman score: 524; 28.1% identity (61.2% similar) in 477 aa overlap (161-629:83-530)

              140       150       160       170       180       190
pF1KA0 DLSCCSLEHLPANLFYSQDLTHLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNH
                                     ... .  . . ::. .. .... :.::.  
NP_001 GKKDSSAAQPGVAFSVDNTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMR-LDLSKRS
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pF1KA0 LGDFPLAVCSIPTLAELNVSCNALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQL
       .  .: ..  .  :.:: .  : :.:.:: :: . ::.:. :. : : :::  :.:.:.:
NP_001 IHILPSSIKELTQLTELYLYSNKLQSLPAEVGCLVNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKL
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pF1KA0 SYLGLSFNEFTDIPEVLEKLTAVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKL
        .: :  :.. .:: :. .: ..  : .  : . :.. . .... ... ...: : :..:
NP_001 RMLDLRHNKLREIPSVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVE-KDIKNLSKLSMLSIRENKIKQL
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pF1KA0 IADEVDFLQHVTQLDLRDNKLGDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSN
        : :.  : ..  ::.  :.:  :        :. .:  .:...::.          . :
NP_001 PA-EIGELCNLITLDVAHNQLEHLPK------EIGNC--TQITNLDL----------QHN
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pF1KA0 ELVQL-DVYPVPNYLSYMDVSRNRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCN-S
       ::..: :.    . :: . .  :::  .:. . .   :: :.. .:.:  ::  :. .  
NP_001 ELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIPRSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLV
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pF1KA0 SLRKLLAGHN--QLARLPERLERTSVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKL
       .: .:  ..:  ::  .    . ...  :...::.. ..: ... .:  :  :: . :.:
NP_001 KLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQL
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        :::   :.  : . . :: :..:.::   .:  ..:   :..: .. : :...: . ..
NP_001 TSLP---LDFGTWTSMVELNLATNQLTK--IPEDVSGLVSLEVLILSNNLLKKLPHG-LG
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pF1KA0 KLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNCSRMHTVIAHSNCIEVFPE-VMQLPEIKCVDLSCNE
       .:..:.:.::  :::...:. :   . .. ..  .: . ..:. . .: ..  . :. : 
NP_001 NLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENL
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pF1KA0 LSEVTLPENLPP--KLQELDLTGNPRLVLDHKTLELLNNIRCFKIDQPSTGDASGAPAVW
       :..  :::..    .:.:: :. :: :                                 
NP_001 LTH--LPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPFELALCSKLSIMSIENCPLSHLPPQIVAG
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>>NP_031399 (OMIM: 602775,607721) leucine-rich repeat pr  (582 aa)
 initn: 328 init1: 187 opt: 421  Z-score: 294.9  bits: 65.6 E(85289): 1.1e-09
Smith-Waterman score: 524; 28.1% identity (61.2% similar) in 477 aa overlap (161-629:83-530)

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pF1KA0 DLSCCSLEHLPANLFYSQDLTHLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNH
                                     ... .  . . ::. .. .... :.::.  
NP_031 GKKDSSAAQPGVAFSVDNTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMR-LDLSKRS
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pF1KA0 LGDFPLAVCSIPTLAELNVSCNALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQL
       .  .: ..  .  :.:: .  : :.:.:: :: . ::.:. :. : : :::  :.:.:.:
NP_031 IHILPSSIKELTQLTELYLYSNKLQSLPAEVGCLVNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKL
             120       130       140       150       160       170 

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pF1KA0 SYLGLSFNEFTDIPEVLEKLTAVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKL
        .: :  :.. .:: :. .: ..  : .  : . :.. . .... ... ...: : :..:
NP_031 RMLDLRHNKLREIPSVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVE-KDIKNLSKLSMLSIRENKIKQL
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pF1KA0 IADEVDFLQHVTQLDLRDNKLGDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSN
        : :.  : ..  ::.  :.:  :        :. .:  .:...::.          . :
NP_031 PA-EIGELCNLITLDVAHNQLEHLPK------EIGNC--TQITNLDL----------QHN
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pF1KA0 ELVQL-DVYPVPNYLSYMDVSRNRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCN-S
       ::..: :.    . :: . .  :::  .:. . .   :: :.. .:.:  ::  :. .  
NP_031 ELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIPRSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLV
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pF1KA0 SLRKLLAGHN--QLARLPERLERTSVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKL
       .: .:  ..:  ::  .    . ...  :...::.. ..: ... .:  :  :: . :.:
NP_031 KLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQL
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pF1KA0 ESLPPATLSEETNSILQELYLTNNSLTDKCVPL-LTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMA
        :::   :.  : . . :: :..:.::   .:  ..:   :..: .. : :...: . ..
NP_031 TSLP---LDFGTWTSMVELNLATNQLTK--IPEDVSGLVSLEVLILSNNLLKKLPHG-LG
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pF1KA0 KLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNCSRMHTVIAHSNCIEVFPE-VMQLPEIKCVDLSCNE
       .:..:.:.::  :::...:. :   . .. ..  .: . ..:. . .: ..  . :. : 
NP_031 NLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENL
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pF1KA0 LSEVTLPENLPP--KLQELDLTGNPRLVLDHKTLELLNNIRCFKIDQPSTGDASGAPAVW
       :..  :::..    .:.:: :. :: :                                 
NP_031 LTH--LPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPFELALCSKLSIMSIENCPLSHLPPQIVAG
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>>XP_016872193 (OMIM: 602775,607721) PREDICTED: leucine-  (582 aa)
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Smith-Waterman score: 524; 28.1% identity (61.2% similar) in 477 aa overlap (161-629:83-530)

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pF1KA0 LGDFPLAVCSIPTLAELNVSCNALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQL
       .  .: ..  .  :.:: .  : :.:.:: :: . ::.:. :. : : :::  :.:.:.:
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pF1KA0 SYLGLSFNEFTDIPEVLEKLTAVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKL
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pF1KA0 IADEVDFLQHVTQLDLRDNKLGDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSN
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XP_016 PA-EIGELCNLITLDVAHNQLEHLPK------EIGNC--TQITNLDL----------QHN
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pF1KA0 ELVQL-DVYPVPNYLSYMDVSRNRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCN-S
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XP_016 ELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIPRSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLV
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60827320 residues in 85289 library sequences
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 start: Thu Nov  3 09:53:16 2016 done: Thu Nov  3 09:53:18 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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