Result of FASTA (ccds) for pF1KA0606
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0606, 1205 aa
  1>>>pF1KA0606 1205 - 1205 aa - 1205 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7194+/-0.00103; mu= 7.1972+/- 0.062
 mean_var=194.0295+/-40.080, 0's: 0 Z-trim(111.1): 134  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.092075
 statistics sampled from 11998 (12137) to 11998 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.373), width:  16
 Scan time:  4.120

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS45881.2 PHLPP1 gene_id:23239|Hs108|chr18       (1717) 8031 1080.5       0
CCDS32479.1 PHLPP2 gene_id:23035|Hs108|chr16       (1323) 4113 559.9 1.4e-158
CCDS73910.1 PHLPP2 gene_id:23035|Hs108|chr16       (1256) 1838 257.7 1.3e-67
CCDS58095.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10         ( 536)  511 81.2 7.6e-15
CCDS646.1 LRRC40 gene_id:55631|Hs108|chr1          ( 602)  444 72.3   4e-12
CCDS7568.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10          ( 582)  421 69.3 3.2e-11
CCDS4953.2 LRRC1 gene_id:55227|Hs108|chr6          ( 524)  409 67.6 8.9e-11


>>CCDS45881.2 PHLPP1 gene_id:23239|Hs108|chr18            (1717 aa)
 initn: 8031 init1: 8031 opt: 8031  Z-score: 5771.4  bits: 1080.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 8031; 99.9% identity (99.9% similar) in 1205 aa overlap (1-1205:513-1717)

                                             10        20        30
pF1KA0                               MDSEIGCLIRFYAGKPHSTGSSERIQLSGM
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LEAEEKPLQIQNDYLFQLGFGELWRVQEEGMDSEIGCLIRFYAGKPHSTGSSERIQLSGM
            490       500       510       520       530       540  

               40        50        60        70        80        90
pF1KA0 YNVRKGKMQLPVNRWTRRQVILCGTCLIVSSVKDSLTGKMHVLPLIGGKVEEVKKHQHCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YNVRKGKMQLPVNRWTRRQVILCGTCLIVSSVKDSLTGKMHVLPLIGGKVEEVKKHQHCL
            550       560       570       580       590       600  

              100       110       120       130       140       150
pF1KA0 AFSSSGPQSQTYYICFDTFTEYLRWLRQVSKVASQRISSVDLSCCSLEHLPANLFYSQDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AFSSSGPQSQTYYICFDTFTEYLRWLRQVSKVASQRISSVDLSCCSLEHLPANLFYSQDL
            610       620       630       640       650       660  

              160       170       180       190       200       210
pF1KA0 THLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNHLGDFPLAVCSIPTLAELNVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 THLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNHLGDFPLAVCSIPTLAELNVS
            670       680       690       700       710       720  

              220       230       240       250       260       270
pF1KA0 CNALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQLSYLGLSFNEFTDIPEVLEKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CNALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQLSYLGLSFNEFTDIPEVLEKL
            730       740       750       760       770       780  

              280       290       300       310       320       330
pF1KA0 TAVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TAVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNK
            790       800       810       820       830       840  

              340       350       360       370       380       390
pF1KA0 LGDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSNELVQLDVYPVPNYLSYMDVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LGDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSNELVQLDVYPVPNYLSYMDVS
            850       860       870       880       890       900  

              400       410       420       430       440       450
pF1KA0 RNRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLERT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RNRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLERT
            910       920       930       940       950       960  

              460       470       480       490       500       510
pF1KA0 SVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLSEETNSILQELYLTNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLSEETNSILQELYLTNN
            970       980       990      1000      1010      1020  

              520       530       540       550       560       570
pF1KA0 SLTDKCVPLLTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SLTDKCVPLLTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNC
           1030      1040      1050      1060      1070      1080  

              580       590       600       610       620       630
pF1KA0 SRMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPEIKCVDLSCNELSEVTLPENLPPKLQELDLTGNPRLV
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RRMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPEIKCVDLSCNELSEVTLPENLPPKLQELDLTGNPRLV
           1090      1100      1110      1120      1130      1140  

              640       650       660       670       680       690
pF1KA0 LDHKTLELLNNIRCFKIDQPSTGDASGAPAVWSHGYTEASGVKNKLCVAALSVNNFCDNR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LDHKTLELLNNIRCFKIDQPSTGDASGAPAVWSHGYTEASGVKNKLCVAALSVNNFCDNR
           1150      1160      1170      1180      1190      1200  

              700       710       720       730       740       750
pF1KA0 EALYGVFDGDRNVEVPYLLQCTMSDILAEELQKTKNEEEYMVNTFIVMQRKLGTAGQKLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EALYGVFDGDRNVEVPYLLQCTMSDILAEELQKTKNEEEYMVNTFIVMQRKLGTAGQKLG
           1210      1220      1230      1240      1250      1260  

              760       770       780       790       800       810
pF1KA0 GAAVLCHIKHDPVDPGGSFTLTSANVGKCQTVLCRNGKPLPLSRSYIMSCEEELKRIKQH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GAAVLCHIKHDPVDPGGSFTLTSANVGKCQTVLCRNGKPLPLSRSYIMSCEEELKRIKQH
           1270      1280      1290      1300      1310      1320  

              820       830       840       850       860       870
pF1KA0 KAIITEDGKVNGVTESTRILGYTFLHPSVVPRPHVQSVLLTPQDEFFILGSKGLWDSLSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KAIITEDGKVNGVTESTRILGYTFLHPSVVPRPHVQSVLLTPQDEFFILGSKGLWDSLSV
           1330      1340      1350      1360      1370      1380  

              880       890       900       910       920       930
pF1KA0 EEAVEAVRNVPDALAAAKKLCTLAQSYGCHDSISAVVVQLSVTEDSFCCCELSAGGAVPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EEAVEAVRNVPDALAAAKKLCTLAQSYGCHDSISAVVVQLSVTEDSFCCCELSAGGAVPP
           1390      1400      1410      1420      1430      1440  

              940       950       960       970       980       990
pF1KA0 PSPGIFPPSVNMVIKDRPSDGLGVPSSSSGMASEISSELSTSEMSSEVGSTASDEPPPGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PSPGIFPPSVNMVIKDRPSDGLGVPSSSSGMASEISSELSTSEMSSEVGSTASDEPPPGA
           1450      1460      1470      1480      1490      1500  

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KA0 LSENSPAYPSEQRCMLHPICLSNSFQRQLSSATFSSAFSDNGLDSDDEEPIEGVFTNGSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LSENSPAYPSEQRCMLHPICLSNSFQRQLSSATFSSAFSDNGLDSDDEEPIEGVFTNGSR
           1510      1520      1530      1540      1550      1560  

             1060      1070      1080      1090      1100      1110
pF1KA0 VEVEVDIHCSRAKEKEKQQHLLQVPAEASDEGIVISANEDEPGLPRKADFSAVGTIGRRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VEVEVDIHCSRAKEKEKQQHLLQVPAEASDEGIVISANEDEPGLPRKADFSAVGTIGRRR
           1570      1580      1590      1600      1610      1620  

             1120      1130      1140      1150      1160      1170
pF1KA0 ANGSVAPQERSHNVIEVATDAPLRKPGGYFAAPAQPDPDDQFIIPPELEEEVKEIMKHHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ANGSVAPQERSHNVIEVATDAPLRKPGGYFAAPAQPDPDDQFIIPPELEEEVKEIMKHHQ
           1630      1640      1650      1660      1670      1680  

             1180      1190      1200     
pF1KA0 EQQQQQQPPPPPQLQPQLPRHYQLDQLPDYYDTPL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EQQQQQQPPPPPQLQPQLPRHYQLDQLPDYYDTPL
           1690      1700      1710       

>>CCDS32479.1 PHLPP2 gene_id:23035|Hs108|chr16            (1323 aa)
 initn: 3627 init1: 1880 opt: 4113  Z-score: 2960.3  bits: 559.9 E(32554): 1.4e-158
Smith-Waterman score: 4343; 54.8% identity (80.1% similar) in 1207 aa overlap (2-1186:128-1315)

                                            10        20        30 
pF1KA0                              MDSEIGCLIRFYAGKPHSTGSSERIQLSGMY
                                     . ..::.::::. ::      .:: :::.:
CCDS32 EPTERPLQIVYDYLSRLGFDDPVRIQEEATNPDLGCMIRFYGEKPCHMDRLDRILLSGIY
       100       110       120       130       140       150       

              40        50        60        70        80        90 
pF1KA0 NVRKGKMQLPVNRWTRRQVILCGTCLIVSSVKDSLTGKMHVLPLIGGKVEEVKKHQHCLA
       :::::: ::  ..:..: :.:::::::::::::  :::::.:::.:::.::::..:. ::
CCDS32 NVRKGKTQL--HKWAERLVVLCGTCLIVSSVKDCQTGKMHILPLVGGKIEEVKRRQYSLA
       160         170       180       190       200       210     

             100       110       120       130       140       150 
pF1KA0 FSSSGPQSQTYYICFDTFTEYLRWLRQVSKVASQRISSVDLSCCSLEHLPANLFYSQDLT
       :::.: :.:::.. :.:..:: :: ::.:::.:::::.::::: :::..: .::::::.:
CCDS32 FSSAGAQAQTYHVSFETLAEYQRWQRQASKVVSQRISTVDLSCYSLEEVPEHLFYSQDIT
         220       230       240       250       260       270     

             160       170       180       190       200       210 
pF1KA0 HLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNHLGDFPLAVCSIPTLAELNVSC
       .:::..::..    :    ::. : .:..::.::::.:.:: ::. .: : ::.:::.::
CCDS32 YLNLRHNFMQ----LERPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTLTELNLSC
         280           290       300       310       320       330 

             220       230       240       250       260       270 
pF1KA0 NALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQLSYLGLSFNEFTDIPEVLEKLT
       :.....:. .: . ::::. :::::: .:: :: :..::: ::.:::.:..:::: ::::
CCDS32 NGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIPEVYEKLT
             340       350       360       370       380       390 

             280       290       300       310       320       330 
pF1KA0 AVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNKL
        .:.. :.:::.:.: : .: .: ::::::::.: .. .. ....  .:.:..:::::.:
CCDS32 MLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHVDLRDNRL
             400       410       420       430       440       450 

             340       350       360       370       380       390 
pF1KA0 GDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSNELVQLDVYPVPNYLSYMDVSR
        :::   . ..: ::: ::::  : . :. :..::::::.:. ..:::::. :...:.::
CCDS32 TDLDLSSLCSLEQLHCGRNQLRELTLSGFSLRTLYASSNRLTAVNVYPVPSLLTFLDLSR
             460       470       480       490       500       510 

             400       410       420       430       440       450 
pF1KA0 NRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLERTS
       : :: ::.:.::..:.::::...: . :.:.:.. . :::::. :::..  ::  .:.  
CCDS32 NLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLGHNHVQNLPTLVEHIP
             520       530       540       550       560       570 

             460       470       480       490       500       510 
pF1KA0 VEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLSEETNSILQELYLTNNS
       .::::.::: : .:: .:. :: .::.::::::.::::: :  .::. :.:: :::::: 
CCDS32 LEVLDLQHNALTRLPDTLFSKALNLRYLNASANSLESLPSACTGEESLSMLQLLYLTNNL
             580       590       600       610       620       630 

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pF1KA0 LTDKCVPLLTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNCS
       :::.:.:.:.:: ::.:::.: :.::.:::::. :::.:::..:::::::.::::: ::.
CCDS32 LTDQCIPVLVGHLHLRILHLANNQLQTFPASKLNKLEQLEELNLSGNKLKTIPTTIANCK
             640       650       660       670       680       690 

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pF1KA0 RMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPEIKCVDLSCNELSEVTLPENLPPKLQELDLTGNPRLVL
       :.::..:::: : .:::..:::.:. ::::::.:.:. .:: ::  ::.::::::  :::
CCDS32 RLHTLVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDLTEILIPEALPATLQDLDLTGNTNLVL
             700       710       720       730       740       750 

             640          650       660       670       680        
pF1KA0 DHKTLELLNNIRCFKIDQ---PSTGDASGAPAVWSHGYTEASGVKNKLCVAALSVNNFCD
       .::::.....:  .::::   :.: :.. . . :::: .: .: .:::::.::....: .
CCDS32 EHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTT-DSTVTSTFWSHGLAEMAGQRNKLCVSALAMDSFAE
             760       770        780       790       800       810

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pF1KA0 NREALYGVFDGDRNVEVPYLLQCTMSDILAEELQKTKNEEEYMVNTFIVMQRKLGTAGQK
       .  :.::.:::::: :.: ::::::.:.: ::.:.. :.  .:.:::.: .:::: ::::
CCDS32 GVGAVYGMFDGDRNEELPRLLQCTMADVLLEEVQQSTNDTVFMANTFLVSHRKLGMAGQK
              820       830       840       850       860       870

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pF1KA0 LGGAAVLCHIKHDPVDPGGSFTLTSANVGKCQTVLCRNGKPLPLSRSYIMSCE-EELKRI
       ::..:.::.:. : .::..::.:: :::: ::.::::.:::.:::. . .  . :: .:.
CCDS32 LGSSALLCYIRPDTADPASSFSLTVANVGTCQAVLCRGGKPVPLSKVFSLEQDPEEAQRV
              880       890       900       910       920       930

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pF1KA0 KQHKAIITEDGKVNGVTESTRILGYTFLHPSVVPRPHVQSVLLTPQDEFFILGSKGLWDS
       :..:::::::.::::::  ::.:: :.:.: ..:.::..:. :: :::..:::.:.::. 
CCDS32 KDQKAIITEDNKVNGVTCCTRMLGCTYLYPWILPKPHISSTPLTIQDELLILGNKALWEH
              940       950       960       970       980       990

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pF1KA0 LSVEEAVEAVRNVPDALAAAKKLCTLAQSYGCHDSISAVVVQLSVTEDSFCCCELSAGGA
       ::  :::.:::.: : ::::::::::::::::.:...:.:: :.. :.. : ::.. : .
CCDS32 LSYTEAVNAVRHVQDPLAAAKKLCTLAQSYGCQDNVGAMVVYLNIGEEG-CTCEMN-GLT
             1000      1010      1020      1030       1040         

       930       940       950       960       970       980       
pF1KA0 VPPPSPGIFPPSVNMVIKDRPSDGLGVPSSSSGMASEISSELSTSEMSSEVGSTASDEPP
       .: :  :.   . . .::: :. .  .::::::.:::.:::.::::.:::::::::::  
CCDS32 LPGPV-GF---ASTTTIKDAPKPA--TPSSSSGIASEFSSEMSTSEVSSEVGSTASDEHN
     1050          1060        1070      1080      1090      1100  

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pF1KA0 PGALSENSPAYPSEQRCMLHPICLSNSFQRQLSSATFSSAFSDNGLDSDDEEPIEGVFTN
        :.:.      : :.:: :::   :. :::: :::::::  :::::::::..:.:::.::
CCDS32 AGGLDTALLPRP-ERRCSLHPTPTSGLFQRQPSSATFSSNQSDNGLDSDDDQPVEGVITN
           1110       1120      1130      1140      1150      1160 

      1050      1060      1070       1080                          
pF1KA0 GSRVEVEVDIHCSRAKEKEKQQHLLQV-PAEASDE-----------------GIVISANE
       ::.::::::::: :... :..  :..  :.  :.:                 :...  ..
CCDS32 GSKVEVEVDIHCCRGRDLENSPPLIESSPTLCSEEHARGSCFGIRRQNSVNSGMLLPMSK
            1170      1180      1190      1200      1210      1220 

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pF1KA0 DEPGLPRKADFSAVGTIGRRRANGSVAPQERSHNVIEVATDAPLRKPGGYFAAPAQPDPD
       :.  : .. . : .   :.. .:::..: : : :.:::::..: :: : :::::.: .:.
CCDS32 DRMELQKSPSTSCL--YGKKLSNGSIVPLEDSLNLIEVATEVPKRKTG-YFAAPTQMEPE
            1230        1240      1250      1260       1270        

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pF1KA0 DQFIIPPELEEEVKEIMKHHQEQQQQQQPPPPPQLQPQLPRHYQLDQLPDYYDTPL
       :::..: .::::::: ::.::... . .:    . .:                   
CCDS32 DQFVVPHDLEEEVKEQMKQHQDSRLEPEPHEEDRTEPPEEFDTAL           
     1280      1290      1300      1310      1320              

>>CCDS73910.1 PHLPP2 gene_id:23035|Hs108|chr16            (1256 aa)
 initn: 2843 init1: 1096 opt: 1838  Z-score: 1327.4  bits: 257.7 E(32554): 1.3e-67
Smith-Waterman score: 3900; 51.2% identity (75.3% similar) in 1207 aa overlap (2-1186:128-1248)

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pF1KA0                              MDSEIGCLIRFYAGKPHSTGSSERIQLSGMY
                                     . ..::.::::. ::      .:: :::.:
CCDS73 EPTERPLQIVYDYLSRLGFDDPVRIQEEATNPDLGCMIRFYGEKPCHMDRLDRILLSGIY
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pF1KA0 NVRKGKMQLPVNRWTRRQVILCGTCLIVSSVKDSLTGKMHVLPLIGGKVEEVKKHQHCLA
       :::::: ::  ..:..: :.:::::::::::::  :::::.:::.:::.::::..:. ::
CCDS73 NVRKGKTQL--HKWAERLVVLCGTCLIVSSVKDCQTGKMHILPLVGGKIEEVKRRQYSLA
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pF1KA0 FSSSGPQSQTYYICFDTFTEYLRWLRQVSKVASQRISSVDLSCCSLEHLPANLFYSQDLT
       :::.: :.:::.. :.:..:: :: ::.:::.:::::.::::: :::..: .::::::.:
CCDS73 FSSAGAQAQTYHVSFETLAEYQRWQRQASKVVSQRISTVDLSCYSLEEVPEHLFYSQDIT
         220       230       240       250       260       270     

             160       170       180       190       200       210 
pF1KA0 HLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNHLGDFPLAVCSIPTLAELNVSC
       .:::..::..    :    ::. : .:..::.::::.:.:: ::. .: : ::.:::.::
CCDS73 YLNLRHNFMQ----LERPGGLDTLYKFSQLKGLNLSHNKLGLFPILLCEISTLTELNLSC
         280           290       300       310       320       330 

             220       230       240       250       260       270 
pF1KA0 NALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQLSYLGLSFNEFTDIPEVLEKLT
       :.....:. .: . ::::. :::::: .:: :: :..::: ::.:::.:..:::: ::::
CCDS73 NGFHDLPSQIGNLLNLQTLCLDGNFLTTLPEELGNLQQLSSLGISFNNFSQIPEVYEKLT
             340       350       360       370       380       390 

             280       290       300       310       320       330 
pF1KA0 AVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNKL
        .:.. :.:::.:.: : .: .: ::::::::.: .. .. ....  .:.:..:::::.:
CCDS73 MLDRVVMAGNCLEVLNLGVLNRMNHIKHVDLRMNHLKTMVIENLEGNKHITHVDLRDNRL
             400       410       420       430       440       450 

             340       350       360       370       380       390 
pF1KA0 GDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSNELVQLDVYPVPNYLSYMDVSR
        :::   . ..: ::: ::::  : . :. :..::::::.:. ..:::::. :...:.::
CCDS73 TDLDLSSLCSLEQLHCGRNQLRELTLSGFSLRTLYASSNRLTAVNVYPVPSLLTFLDLSR
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pF1KA0 NRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLERTS
       : :: ::.:.::..:.::::...: . :.:.:.. . :::::. :::..  ::  .:.  
CCDS73 NLLECVPDWACEAKKIEVLDVSYNLLTEVPVRILSSLSLRKLMLGHNHVQNLPTLVEHIP
             520       530       540       550       560       570 

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pF1KA0 VEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLSEETNSILQELYLTNNS
       .::::.::: : .:: .:. ::     ::                               
CCDS73 LEVLDLQHNALTRLPDTLFSKA-----LN-------------------------------
             580       590                                         

             520       530       540       550       560       570 
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                                      :. :::.:::..:::::::.::::: ::.
CCDS73 -------------------------------KLNKLEQLEELNLSGNKLKTIPTTIANCK
                                        600       610       620    

             580       590       600       610       620       630 
pF1KA0 RMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPEIKCVDLSCNELSEVTLPENLPPKLQELDLTGNPRLVL
       :.::..:::: : .:::..:::.:. ::::::.:.:. .:: ::  ::.::::::  :::
CCDS73 RLHTLVAHSNNISIFPEILQLPQIQFVDLSCNDLTEILIPEALPATLQDLDLTGNTNLVL
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pF1KA0 DHKTLELLNNIRCFKIDQ---PSTGDASGAPAVWSHGYTEASGVKNKLCVAALSVNNFCD
       .::::.....:  .::::   :.: :.. . . :::: .: .: .:::::.::....: .
CCDS73 EHKTLDIFSHITTLKIDQKPLPTT-DSTVTSTFWSHGLAEMAGQRNKLCVSALAMDSFAE
          690       700        710       720       730       740   

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pF1KA0 NREALYGVFDGDRNVEVPYLLQCTMSDILAEELQKTKNEEEYMVNTFIVMQRKLGTAGQK
       .  :.::.:::::: :.: ::::::.:.: ::.:.. :.  .:.:::.: .:::: ::::
CCDS73 GVGAVYGMFDGDRNEELPRLLQCTMADVLLEEVQQSTNDTVFMANTFLVSHRKLGMAGQK
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pF1KA0 LGGAAVLCHIKHDPVDPGGSFTLTSANVGKCQTVLCRNGKPLPLSRSYIMSCE-EELKRI
       ::..:.::.:. : .::..::.:: :::: ::.::::.:::.:::. . .  . :: .:.
CCDS73 LGSSALLCYIRPDTADPASSFSLTVANVGTCQAVLCRGGKPVPLSKVFSLEQDPEEAQRV
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pF1KA0 KQHKAIITEDGKVNGVTESTRILGYTFLHPSVVPRPHVQSVLLTPQDEFFILGSKGLWDS
       :..:::::::.::::::  ::.:: :.:.: ..:.::..:. :: :::..:::.:.::. 
CCDS73 KDQKAIITEDNKVNGVTCCTRMLGCTYLYPWILPKPHISSTPLTIQDELLILGNKALWEH
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pF1KA0 LSVEEAVEAVRNVPDALAAAKKLCTLAQSYGCHDSISAVVVQLSVTEDSFCCCELSAGGA
       ::  :::.:::.: : ::::::::::::::::.:...:.:: :.. :.. : ::.. : .
CCDS73 LSYTEAVNAVRHVQDPLAAAKKLCTLAQSYGCQDNVGAMVVYLNIGEEG-CTCEMN-GLT
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pF1KA0 VPPPSPGIFPPSVNMVIKDRPSDGLGVPSSSSGMASEISSELSTSEMSSEVGSTASDEPP
       .: :  :.   . . .::: :. .  .::::::.:::.:::.::::.:::::::::::  
CCDS73 LPGPV-GF---ASTTTIKDAPKPA--TPSSSSGIASEFSSEMSTSEVSSEVGSTASDEHN
                 990      1000        1010      1020      1030     

       990      1000      1010      1020      1030      1040       
pF1KA0 PGALSENSPAYPSEQRCMLHPICLSNSFQRQLSSATFSSAFSDNGLDSDDEEPIEGVFTN
        :.:.      : :.:: :::   :. :::: :::::::  :::::::::..:.:::.::
CCDS73 AGGLDTALLPRP-ERRCSLHPTPTSGLFQRQPSSATFSSNQSDNGLDSDDDQPVEGVITN
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pF1KA0 GSRVEVEVDIHCSRAKEKEKQQHLLQV-PAEASDE-----------------GIVISANE
       ::.::::::::: :... :..  :..  :.  :.:                 :...  ..
CCDS73 GSKVEVEVDIHCCRGRDLENSPPLIESSPTLCSEEHARGSCFGIRRQNSVNSGMLLPMSK
         1100      1110      1120      1130      1140      1150    

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pF1KA0 DEPGLPRKADFSAVGTIGRRRANGSVAPQERSHNVIEVATDAPLRKPGGYFAAPAQPDPD
       :.  : .. . : .   :.. .:::..: : : :.:::::..: :: : :::::.: .:.
CCDS73 DRMELQKSPSTSCL--YGKKLSNGSIVPLEDSLNLIEVATEVPKRKTG-YFAAPTQMEPE
         1160        1170      1180      1190      1200       1210 

    1150      1160      1170      1180      1190      1200     
pF1KA0 DQFIIPPELEEEVKEIMKHHQEQQQQQQPPPPPQLQPQLPRHYQLDQLPDYYDTPL
       :::..: .::::::: ::.::... . .:    . .:                   
CCDS73 DQFVVPHDLEEEVKEQMKQHQDSRLEPEPHEEDRTEPPEEFDTAL           
            1220      1230      1240      1250                 

>>CCDS58095.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10              (536 aa)
 initn: 371 init1: 187 opt: 511  Z-score: 380.0  bits: 81.2 E(32554): 7.6e-15
Smith-Waterman score: 512; 30.6% identity (61.9% similar) in 438 aa overlap (161-582:83-505)

              140       150       160       170       180       190
pF1KA0 DLSCCSLEHLPANLFYSQDLTHLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNH
                                     ... .  . . ::. .. .... :.::.  
CCDS58 GKKDSSAAQPGVAFSVDNTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMR-LDLSKRS
             60        70        80        90       100        110 

              200       210       220       230       240       250
pF1KA0 LGDFPLAVCSIPTLAELNVSCNALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQL
       .  .: ..  .  :.:: .  : :.:.:: :: . ::.:. :. : : :::  :.:.:.:
CCDS58 IHILPSSIKELTQLTELYLYSNKLQSLPAEVGCLVNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKL
             120       130       140       150       160       170 

              260       270       280       290       300       310
pF1KA0 SYLGLSFNEFTDIPEVLEKLTAVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKL
        .: :  :.. .:: :. .: ..  : .  : . :.. . .... ... ...: : :..:
CCDS58 RMLDLRHNKLREIPSVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVE-KDIKNLSKLSMLSIRENKIKQL
             180       190       200        210       220       230

              320       330         340       350       360        
pF1KA0 IADEVDFLQHVTQLDLRDNKLGDLDAMI--FNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYA-
        : :.  :. ...: :: :.:. .   .   . .: :. : :.. ::     .:..:   
CCDS58 PA-EIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIPRSLAKCSALEELNLENNNISTLPES--LLSSLVKL
               240       250       260       270         280       

       370         380            390       400        410         
pF1KA0 SSNELVQ--LDVYPV--PNYLSY---MDVSRNRLENVPEWVCESRK-LEVLDIGHNQICE
       .:  :..  ...:::  :. .:    ... .::....:  .    : :  :..  ::.  
CCDS58 NSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTS
       290       300       310       320       330       340       

     420       430       440        450       460       470        
pF1KA0 LPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPERLER-TSVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRF
       ::  .   .:. .:  . :::...:: .   .:.::: .  :.::.  :. : .  .:: 
CCDS58 LPLDFGTWTSMVELNLATNQLTKIPEDVSGLVSLEVL-ILSNNLLKKLPHGLGNLRKLRE
       350       360       370       380        390       400      

      480       490         500       510       520        530     
pF1KA0 LNASANKLESLPP--ATLSEETNSILQELYLTNNSLTDKCVPLLTGH-PHLKILHMAYNR
       :.   :::::::   : :..     ::.: ::::.::   .:   ::  .:  : .. : 
CCDS58 LDLEENKLESLPNEIAYLKD-----LQKLVLTNNQLT--TLPRGIGHLTNLTHLGLGENL
        410       420            430         440       450         

         540       550        560       570       580       590    
pF1KA0 LQSFPASKMAKLEELEEIDLSGN-KLKAIPTTIMNCSRMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPE
       :  .:  ... ::.:::. :. : .:...:  .  ::.. ....  ::            
CCDS58 LTHLPE-EIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPFELALCSKL-SIMSIENCPLSHLPPQIVAG
     460        470       480       490        500       510       

          600       610       620       630       640       650    
pF1KA0 IKCVDLSCNELSEVTLPENLPPKLQELDLTGNPRLVLDHKTLELLNNIRCFKIDQPSTGD
                                                                   
CCDS58 GPSFIIQFLKMQGPYRAMV                                         
       520       530                                               

>>CCDS646.1 LRRC40 gene_id:55631|Hs108|chr1               (602 aa)
 initn: 433 init1: 208 opt: 444  Z-score: 331.2  bits: 72.3 E(32554): 4e-12
Smith-Waterman score: 444; 28.0% identity (58.8% similar) in 483 aa overlap (125-585:128-579)

          100       110       120       130       140       150    
pF1KA0 SGPQSQTYYICFDTFTEYLRWLRQVSKVASQRISSVDLSCCSLEHLPANLFYSQDLTHL-
                                     . ......:  .:. ::      ...:.: 
CCDS64 TDDLRLLPALTVLDIHDNQLTSLPSAIRELENLQKLNVSHNKLKILP------EEITNLR
       100       110       120       130       140             150 

           160       170       180       190       200       210   
pF1KA0 NLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNHLGDFPLAVCSIPTLAELNVSCNA
       :::  .:..:     ..:...:   ..:..:.::::::   : .  :. .:..::.: : 
CCDS64 NLKCLYLQHNELTCISEGFEQL---SNLEDLDLSNNHLTTVPASFSSLSSLVRLNLSSNE
             160       170          180       190       200        

           220       230       240       250       260       270   
pF1KA0 LRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQLSYLGLSFNEFTDIPEVLEKLTAV
       :.:.:: .. :. :. .  ..:.:...: :: .:..:  : :  :..  .:: . . . .
CCDS64 LKSLPAEINRMKRLKHLDCNSNLLETIPPELAGMESLELLYLRRNKLRFLPE-FPSCSLL
      210       220       230       240       250       260        

           280       290       300       310       320       330   
pF1KA0 DKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNKLGD
        .: .. : .: :. . :...  :  .::: : . : . ::. .:. . .::: .: ...
CCDS64 KELHVGENQIEMLEAEHLKHLNSILVLDLRDNKL-KSVPDEIILLRSLERLDLSNNDISS
       270       280       290       300        310       320      

           340       350       360       370       380         390 
pF1KA0 LDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSNELVQLDVYPVPNYL--SYMDVSR
       :   . :    ::     :  : . :  :...     :...  .  : .::  .  : . 
CCDS64 LPYSLGN----LH-----LKFLALEGNPLRTI---RREIISKGTQEVLKYLRSKIKDDGP
        330                340          350       360       370    

             400                  410       420         430        
pF1KA0 NRLENVPEWV----CESR-------KLEVLDIGHNQICELPARLF--CNSSLRKLLA-GH
       .. :.. : .     :::        :..:: . .:   .: ..:   .:..   .  ..
CCDS64 SQSESATETAMTLPSESRVNIHAIITLKILDYSDKQATLIPDEVFDAVKSNIVTSINFSK
          380       390       400       410       420       430    

       440         450       460       470       480       490     
pF1KA0 NQLARLPERLE--RTSVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLS
       ::: ..:.:.   .  :  .:.. :.:  .  .: .  ..: ::.   : :.:::     
CCDS64 NQLCEIPKRMVELKEMVSDVDLSFNKLSFISLELCV-LQKLTFLDLRNNFLNSLP-----
          440       450       460       470        480             

         500         510        520       530       540       550  
pF1KA0 EETNSI--LQELYLTNNSLTDKCVP-LLTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEE
       :: .:.  :: . :. : .  : .: .:     :. . .. :.. :   .::  .:.:  
CCDS64 EEMESLVRLQTINLSFNRF--KMLPEVLYRIFTLETILISNNQVGSVDPQKMKMMENLTT
      490       500         510       520       530       540      

            560       570       580       590       600       610  
pF1KA0 IDLSGNKLKAIPTTIMNCSRMHTVIAHSNCIEVFPEVMQLPEIKCVDLSCNELSEVTLPE
       .::..: :  ::  . ::  ..:..  .: ..:                           
CCDS64 LDLQNNDLLQIPPELGNCVNLRTLLLDGNPFRVPRAAILMKGTAAILEYLRDRIPT    
        550       560       570       580       590       600      

            620       630       640       650       660       670  
pF1KA0 NLPPKLQELDLTGNPRLVLDHKTLELLNNIRCFKIDQPSTGDASGAPAVWSHGYTEASGV

>>CCDS7568.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10               (582 aa)
 initn: 328 init1: 187 opt: 421  Z-score: 314.9  bits: 69.3 E(32554): 3.2e-11
Smith-Waterman score: 524; 28.1% identity (61.2% similar) in 477 aa overlap (161-629:83-530)

              140       150       160       170       180       190
pF1KA0 DLSCCSLEHLPANLFYSQDLTHLNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNH
                                     ... .  . . ::. .. .... :.::.  
CCDS75 GKKDSSAAQPGVAFSVDNTIKRPNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMR-LDLSKRS
             60        70        80        90       100        110 

              200       210       220       230       240       250
pF1KA0 LGDFPLAVCSIPTLAELNVSCNALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQL
       .  .: ..  .  :.:: .  : :.:.:: :: . ::.:. :. : : :::  :.:.:.:
CCDS75 IHILPSSIKELTQLTELYLYSNKLQSLPAEVGCLVNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKL
             120       130       140       150       160       170 

              260       270       280       290       300       310
pF1KA0 SYLGLSFNEFTDIPEVLEKLTAVDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKL
        .: :  :.. .:: :. .: ..  : .  : . :.. . .... ... ...: : :..:
CCDS75 RMLDLRHNKLREIPSVVYRLDSLTTLYLRFNRITTVE-KDIKNLSKLSMLSIRENKIKQL
             180       190       200        210       220       230

              320       330       340       350       360       370
pF1KA0 IADEVDFLQHVTQLDLRDNKLGDLDAMIFNNIEVLHCERNQLVTLDICGYFLKALYASSN
        : :.  : ..  ::.  :.:  :        :. .:  .:...::.          . :
CCDS75 PA-EIGELCNLITLDVAHNQLEHLPK------EIGNC--TQITNLDL----------QHN
               240       250             260                   270 

               380       390       400       410       420         
pF1KA0 ELVQL-DVYPVPNYLSYMDVSRNRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCN-S
       ::..: :.    . :: . .  :::  .:. . .   :: :.. .:.:  ::  :. .  
CCDS75 ELLDLPDTIGNLSSLSRLGLRYNRLSAIPRSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLV
             280       290       300       310       320       330 

      430         440       450       460       470       480      
pF1KA0 SLRKLLAGHN--QLARLPERLERTSVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKL
       .: .:  ..:  ::  .    . ...  :...::.. ..: ... .:  :  :: . :.:
CCDS75 KLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQFSTIYSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQL
             340       350       360       370       380       390 

        490       500       510        520       530       540     
pF1KA0 ESLPPATLSEETNSILQELYLTNNSLTDKCVPL-LTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMA
        :::   :.  : . . :: :..:.::   .:  ..:   :..: .. : :...: . ..
CCDS75 TSLP---LDFGTWTSMVELNLATNQLTK--IPEDVSGLVSLEVLILSNNLLKKLPHG-LG
                400       410         420       430       440      

         550       560       570       580        590       600    
pF1KA0 KLEELEEIDLSGNKLKAIPTTIMNCSRMHTVIAHSNCIEVFPE-VMQLPEIKCVDLSCNE
       .:..:.:.::  :::...:. :   . .. ..  .: . ..:. . .: ..  . :. : 
CCDS75 NLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENL
         450       460       470       480       490       500     

          610         620       630       640       650       660  
pF1KA0 LSEVTLPENLPP--KLQELDLTGNPRLVLDHKTLELLNNIRCFKIDQPSTGDASGAPAVW
       :..  :::..    .:.:: :. :: :                                 
CCDS75 LTH--LPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPFELALCSKLSIMSIENCPLSHLPPQIVAG
           510       520       530       540       550       560   

>>CCDS4953.2 LRRC1 gene_id:55227|Hs108|chr6               (524 aa)
 initn: 392 init1: 148 opt: 409  Z-score: 307.0  bits: 67.6 E(32554): 8.9e-11
Smith-Waterman score: 409; 29.1% identity (59.6% similar) in 406 aa overlap (124-521:11-397)

           100       110       120       130       140        150  
pF1KA0 SSGPQSQTYYICFDTFTEYLRWLRQVSKVASQRISSVDLSCCSLEHLPANLF-YSQDLTH
                                     .... :.:   ::: ..: ... :...: .
CCDS49                     MFHCIPLWRCNRHVESIDKRHCSLVYVPEEIYRYARSLEE
                                   10        20        30        40

            160       170       180       190       200       210  
pF1KA0 LNLKQNFLRQNPSLPAARGLNELQRFTKLKSLNLSNNHLGDFPLAVCSIPTLAELNVSCN
       : :  : ::. :        ... ...::..:.::.:..  .:  . ..  :.::.:: :
CCDS49 LLLDANQLRELP--------EQFFQLVKLRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRN
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pF1KA0 ALRSVPAAVGVMHNLQTFLLDGNFLQSLPAELENMKQLSYLGLSFNEFTDIPEVLEKLTA
        .  .: ...  . ::.  ..:: :  ::  . ....:. :...   . ..:: . .:  
CCDS49 EIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRLPESFPELQNLTCLSVNDISLQSLPENIGNLYN
            100       110       120       130       140       150  

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pF1KA0 VDKLCMSGNCVETLRLQALRKMPHIKHVDLRLNVIRKLIADEVDFLQHVTQLDLRDNKLG
       . .: .  : .  :  ..: .. .....::  : : .:  . .  : :. .: :  :.:.
CCDS49 LASLELRENLLTYLP-DSLTQLRRLEELDLGNNEIYNL-PESIGALLHLKDLWLDGNQLS
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pF1KA0 DLDAMIFN--NIEVLHCERNQLVTL--DICGYF-LKALYASSNELVQL-DVYPVPNYLSY
       .:   : :  :.  :   .:.:  :  .: :   :  :  :.: :  . :     . :: 
CCDS49 ELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEISGLTSLTDLVISQNLLETIPDGIGKLKKLSI
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pF1KA0 MDVSRNRLENVPEWVCESRKLEVLDIGHNQICELPARLFCNSSLRKLLAGHNQLARLPER
       . :..::: ..:: : : ..:  : . .::.  ::  .   ..: .: : .:.:. ::..
CCDS49 LKVDQNRLTQLPEAVGECESLTELVLTENQLLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKE
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pF1KA0 LERT-SVEVLDVQHNQLLELPPNLLMKADSLRFLNASANKLESLPPATLSEETNSILQEL
       .    :. :. :. :.: ..: ..  .:  :. :....:.:  ::   ::  :   :. :
CCDS49 IGGCCSLTVFCVRDNRLTRIPAEV-SQATELHVLDVAGNRLLHLP---LSL-TALKLKAL
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pF1KA0 YLTNNSLTDKCVPLLTGHPHLKILHMAYNRLQSFPASKMAKLEELEEIDLSGNKLKAIPT
       .:..:    .  ::::                                            
CCDS49 WLSDN----QSQPLLTFQTDTDYTTGEKILTCVLLPQLPSEPTCQENLPRCGALENLVND
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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