Result of FASTA (ccds) for pF1KA0580
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0580, 1704 aa
  1>>>pF1KA0580 1704 - 1704 aa - 1704 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7460+/-0.00151; mu= 17.0925+/- 0.090
 mean_var=115.3897+/-23.890, 0's: 0 Z-trim(102.0): 152  B-trim: 298 in 2/47
 Lambda= 0.119396
 statistics sampled from 6609 (6777) to 6609 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.554), E-opt: 0.2 (0.208), width:  16
 Scan time:  6.240

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3441.1 ARAP2 gene_id:116984|Hs108|chr4         (1704) 11202 1942.5       0
CCDS8217.2 ARAP1 gene_id:116985|Hs108|chr11        (1205) 2749 486.4 2.5e-136
CCDS41687.1 ARAP1 gene_id:116985|Hs108|chr11       (1450) 2749 486.5 2.9e-136
CCDS44671.1 ARAP1 gene_id:116985|Hs108|chr11       (1133) 1831 328.3 9.6e-89
CCDS4266.1 ARAP3 gene_id:64411|Hs108|chr5          (1544) 1700 305.8 7.7e-82
CCDS8951.1 AGAP2 gene_id:116986|Hs108|chr12        ( 836)  340 71.3 1.5e-11
CCDS44932.1 AGAP2 gene_id:116986|Hs108|chr12       (1192)  340 71.4 2.1e-11
CCDS7215.1 AGAP4 gene_id:119016|Hs108|chr10        ( 663)  326 68.9 6.8e-11
CCDS44397.1 AGAP6 gene_id:414189|Hs108|chr10       ( 686)  324 68.5 8.9e-11
CCDS2514.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2         ( 804)  325 68.7   9e-11
CCDS33408.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2        ( 857)  325 68.8 9.5e-11


>>CCDS3441.1 ARAP2 gene_id:116984|Hs108|chr4              (1704 aa)
 initn: 11202 init1: 11202 opt: 11202  Z-score: 10427.9  bits: 1942.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 11202; 99.9% identity (100.0% similar) in 1704 aa overlap (1-1704:1-1704)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MSSVSEVNVDIKDFLMSINLEQYLLHFHESGFTTVKDCAAINDSLLQKIGISPTGHRRRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MSSVSEVNVDIKDFLMSINLEQYLLHFHESGFTTVKDCAAINDSLLQKIGISPTGHRRRI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 LKQLQIILSKMQDIPIYANVHKTKKNDDPSKDYHVPSSDQNICIELSNSGSVQTSSPPQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LKQLQIILSKMQDIPIYANVHKTKKNDDPSKDYHVPSSDQNICIELSNSGSVQTSSPPQL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 ETVRKNLEDSDASVERSQYPQSDDKLSPPKRDFPTAEEPHLNLGSLNDSLFGSDNIKIES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ETVRKNLEDSDASVERSQYPQSDDKLSPPKRDFPTAEEPHLNLGSLNDSLFGSDNIKIES
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 LITKKTVDHTVEEQQTEKVKLITENLSKLPNADSECLSFVGCSTSGTNSGNGTNGLLEGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LITKKTVDHTVEEQQTEKVKLITENLSKLPNADSECLSFVGCSTSGTNSGNGTNGLLEGS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 PPSPFFKFQGEMIVNDLYVPSSPILAPVRSRSKLVSRPSRSFLLRHRPVPEIPGSTKGVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PPSPFFKFQGEMIVNDLYVPSSPILAPVRSRSKLVSRPSRSFLLRHRPVPEIPGSTKGVS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 GSYFRERRNVATSTEKSVAWQNSNEENSSSIFPYGETFLFQRLENSKKRSIKNEFLTQGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GSYFRERRNVATSTEKSVAWQNSNEENSSSIFPYGETFLFQRLENSKKRSIKNEFLTQGE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 ALKGEAATATNSFIIKSSIYDNRKEKISEDKVEDIWIPREDKNNFLIDTASESEYSTVEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ALKGEAATATNSFIIKSSIYDNRKEKISEDKVEDIWIPREDKNNFLIDTASESEYSTVEE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 CFQSLRRKNSKASKSRTQKALILDSVNRHSYPLSSTSGNADSSAVSSQAISPYACFYGAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CFQSLRRKNSKASKSRTQKALILDSVNRHSYPLSSTSGNADSSAVSSQAISPYACFYGAS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 AKKVKSGWLDKLSPQGKRMFQKRWVKFDGLSISYYNNEKEMYSKGIIPLSAISTVRVQGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AKKVKSGWLDKLSPQGKRMFQKRWVKFDGLSISYYNNEKEMYSKGIIPLSAISTVRVQGD
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 NKFEVVTTQRTFVFRVEKEEERNDWISILLNALKSQSLTSQSQAVVTPEKCGYLELRGYK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NKFEVVTTQRTFVFRVEKEEERNDWISILLNALKSQSLTSQSQAVVTPEKCGYLELRGYK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 AKIFTVLSGNSVWLCKNEQDFKSGLGITIIPMNVANVKQVDRTVKQSFEIITPYRSFSFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AKIFTVLSGNSVWLCKNEQDFKSGLGITIIPMNVANVKQVDRTVKQSFEIITPYRSFSFT
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 AETEKEKQDWIEAVQQSIAETLSDYEVAEKIWFNESNRSCADCKAPDPDWASINLCVVIC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AETEKEKQDWIEAVQQSIAETLSDYEVAEKIWFNESNRSCADCKAPDPDWASINLCVVIC
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 KKCAGQHRSLGPKDSKVRSLKMDASIWSNELIELFIVIGNKRANDFWAGNLQKDEELHMD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KKCAGQHRSLGPKDSKVRSLKMDASIWSNELIELFIVIGNKRANDFWAGNLQKDEELHMD
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 SPVEKRKNFITQKYKEGKFRKTLLASLTKEELNKALCAAVVKPDVLETMALLFSGADVMC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SPVEKRKNFITQKYKEGKFRKTLLASLTKEELNKALCAAVVKPDVLETMALLFSGADVMC
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 ATGDPVHSTPYLLAKKAGQSLQMEFLYHNKFSDFPQHDIHSEGVLSQESSQSTFLCDFLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ATGDPVHSTPYLLAKKAGQSLQMEFLYHNKFSDFPQHDIHSEGVLSQESSQSTFLCDFLY
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 QAPSAASKLSSEKKLLEETNKKWCVLEGGFLSYYENDKSTTPNGTININEVICLAIHKED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QAPSAASKLSSEKKLLEETNKKWCVLEGGFLSYYENDKSTTPNGTININEVICLAIHKED
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 FYLNTGPIFIFEIYLPSERVFLFGAETSQAQRKWTEAIAKHFVPLFAENLTEADYDLIGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FYLNTGPIFIFEIYLPSERVFLFGAETSQAQRKWTEAIAKHFVPLFAENLTEADYDLIGQ
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 LFYKDCHALDQWRKGWFAMDKSSLHFCLQMQEVQGDRMHLRRLQELTISTMVQNGEKLDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LFYKDCHALDQWRKGWFAMDKSSLHFCLQMQEVQGDRMHLRRLQELTISTMVQNGEKLDV
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA0 LLLVEKGRTLYIHGHTKLDFTVWHTAIEKAAGTDGNALQDQQLSKNDVPIIVNSCIAFVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLLVEKGRTLYIHGHTKLDFTVWHTAIEKAAGTDGNALQDQQLSKNDVPIIVNSCIAFVT
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA0 QYGLGCKYIYQKNGDPLHISELLESFKKDARSFKLRAGKHQLEDVTAVLKSFLSDIDDAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QYGLGCKYIYQKNGDPLHISELLESFKKDARSFKLRAGKHQLEDVTAVLKSFLSDIDDAL
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA0 LTKELYPYWISALDTQDDKERIKKYGAFIRSLPGVNRATLAAIIEHLYRVQKCSEINHMN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LTKELYPYWISALDTQDDKERIKKYGAFIRSLPGVNRATLAAIIEHLYRVQKCSEINHMN
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA0 AHNLALVFSSCLFQTKGQTSEEVNVIEDLINNYVEIFEVKEDQVKQMDIENSFITKWKDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AHNLALVFSSCLFQTKGQTSEEVNVIEDLINNYVEIFEVKEDQVKQMDIENSFITKWKDT
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KA0 QVSQAGDLLIEVYVERKEPDCSIIIRISPVMEAEELTNDILAIKNIIPTKGDIWATFEVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QVSQAGDLLIEVYVERKEPDCSIIIRISPVMEAEELTNDILAIKNIIPTKGDIWATFEVI
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KA0 ENEELERPLHYKENVLEQVLRWSSLAEPGSAYLVVKRFLTADTIKHCSDRSTLGSIKEGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ENEELERPLHYKENVLEQVLRWSSLAEPGSAYLVVKRFLTADTIKHCSDRSTLGSIKEGI
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KA0 LKIKEEPSKILSGNKFQDRYFVLRDGFLFLYKDVKSSKHDKMFSLSSMKFYRGVKKKMKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LKIKEEPSKILSGNKFQDRYFVLRDGFLFLYKDVKSSKHDKMFSLSSMKFYRGVKKKMKP
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KA0 PTSWGLTAYSEKHHWHLCCDSSQTQTEWMTSIFIAQHEYDIWPPAGKERKRSITKNPKIG
       ::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PTSWGLTAYSEKHHWHLCCDSSRTQTEWMTSIFIAQHEYDIWPPAGKERKRSITKNPKIG
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KA0 GLPLIPIQHEGNATLARKNIESARAELERLRLSEKCDKESVDSSLKERASMVAHCLEHKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GLPLIPIQHEGNATLARKNIESARAELERLRLSEKCDKESVDSSLKERASMVAHCLEHKD
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KA0 DKLRNRPRKHRSFNCLEDTEPEAPLGQPKGHKGLKTLRKTEDRNSKATLDSDHKLPSRVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DKLRNRPRKHRSFNCLEDTEPEAPLGQPKGHKGLKTLRKTEDRNSKATLDSDHKLPSRVI
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700    
pF1KA0 EELNVVLQRSRTLPKELQDEQILK
       ::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EELNVVLQRSRTLPKELQDEQILK
             1690      1700    

>>CCDS8217.2 ARAP1 gene_id:116985|Hs108|chr11             (1205 aa)
 initn: 2581 init1: 1026 opt: 2749  Z-score: 2560.9  bits: 486.4 E(32554): 2.5e-136
Smith-Waterman score: 2904; 41.7% identity (70.6% similar) in 1143 aa overlap (484-1591:84-1203)

           460       470       480       490       500       510   
pF1KA0 SSTSGNADSSAVSSQAISPYACFYGASAKKVKSGWLDKLSPQGKRMFQKRWVKFDGLSIS
                                     .:.:::::  :::. ..:::::..:   . 
CCDS82 SSLSLSLPSTIAAPHPMDGPPGGSTPVTPVIKAGWLDKNPPQGSYIYQKRWVRLDTDHLR
            60        70        80        90       100       110   

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pF1KA0 YYNNEKEMYSKGIIPLSAISTVRVQGDNKFEVVTTQRTFVFRVEKEEERNDWISILLNAL
       :....:. ::: .: .. :: : . ::.::::.:..:::.::.:.. ::..:.. : .:.
CCDS82 YFDSNKDAYSKRFISVACISHVAAIGDQKFEVITNNRTFAFRAESDVERKEWMQALQQAM
           120       130       140       150       160       170   

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pF1KA0 KSQSLTSQ-SQAVVT-------PEKCGYLELRGYKAKIFTVLSGNSVWLCKNEQDFKSGL
         :   .. :.: .        :.. : :::::.: :..... :..: : :: .... :.
CCDS82 AEQRARARLSSAYLLGVPGSEQPDRAGSLELRGFKNKLYVAVVGDKVQLYKNLEEYHLGI
           180       190       200       210       220       230   

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pF1KA0 GITIIPMNVANVKQVDRTVKQSFEIITPYRSFSFTAETEKEKQDWIEAVQQSIAETLSDY
       :::.: :.:.:::.:::   .::.. :::: :::.:..: ::..:.::.: .:::.::  
CCDS82 GITFIDMSVGNVKEVDR---RSFDLTTPYRIFSFSADSELEKEQWLEAMQGAIAEALSTS
           240       250          260       270       280       290

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pF1KA0 EVAEKIWFNESNRSCADCKAPDPDWASINLCVVICKKCAGQHRSLGPKDSKVRSLKMDAS
       ::::.::    :: :::: ::.::::::::::::::.:::.::.::   ::::::::: .
CCDS82 EVAERIWAAAPNRFCADCGAPQPDWASINLCVVICKRCAGEHRGLGAGVSKVRSLKMDRK
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pF1KA0 IWSNELIELFIVIGNKRANDFWAGNLQKDEELHMDSPVEKRKNFITQKYKEGKFRKTLLA
       .:.. :::::. .::  .: :::.:.  .: :. .:    :.  .  ::.:::.:.    
CCDS82 VWTETLIELFLQLGNGAGNRFWAANVPPSEALQPSSSPSTRRCHLEAKYREGKYRRYHPL
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pF1KA0 SLTKEELNKALCAAVVKPDVLETMALLFSGADVMCATGDPVHSTPYLLAKKAGQSLQMEF
         ..:::.:::::::.  :. ::.:::  :: . : .:::   ::  ::..:::.:::::
CCDS82 FGNQEELDKALCAAVTTTDLAETQALLGCGAGINCFSGDPEAPTPLALAEQAGQTLQMEF
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pF1KA0 LYHNKFSDFPQHDIHSEGVLSQESS---QSTFLCDFLYQAPSAASKLSSEKKLLEETNKK
       : .:. .. :. :  :   : .. :    ..    :::.. ::. :: ....  :: ...
CCDS82 LRNNRTTEVPRLD--SMKPLEKHYSVVLPTVSHSGFLYKTASAG-KLLQDRRAREEFSRR
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pF1KA0 WCVLEGGFLSYYENDKSTTPNGTININEVICLAIHKEDFYLNTGPIFIFEIYLPSERVFL
       ::::  : :::.::....:::: :  .:..:::.   : .   :    ::.:  .::..:
CCDS82 WCVLGDGVLSYFENERAVTPNGEIRASEIVCLAVPPPDTH---GFEHTFEVYTEGERLYL
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pF1KA0 FGAETSQAQRKWTEAIAKHFVPLFAENLTEADYDLIGQLFYKDCHALDQWRKGWFAMDKS
       :: :...  ..:.. ::: ::: .::.:   :.. .:.: ::   .:.. ..:::... :
CCDS82 FGLESAEQAHEWVKCIAKAFVPPLAEDLLARDFERLGRLPYKAGLSLQRAQEGWFSLSGS
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        :.  .     . . ..::.::::.:    :.  . .::.:::. :::::.:. .:::  
CCDS82 ELRAVFPEGPCE-EPLQLRKLQELSI----QGDSENQVLVLVERRRTLYIQGERRLDFMG
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pF1KA0 WHTAIEKAAGTDGNALQDQQLSKNDVPIIVNSCIAFVTQYGLGCKYIYQKNGDPLHISEL
       :  ::.:::.. :..:..:::. .:.:.::  :. ..:: ::  . ::.: :.  . ..:
CCDS82 WLGAIQKAAASMGDTLSEQQLGDSDIPVIVYRCVDYITQCGLTSEGIYRKCGQTSKTQRL
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pF1KA0 LESFKKDARSFKLRAGKHQLEDVTAVLKSFLSDIDDALLTKELYPYWISALDTQDDKERI
       :::...:::: .:. :.....::...:: :: :. :.:.:.     :. : . .:..:..
CCDS82 LESLRQDARSVHLKEGEQHVDDVSSALKRFLRDLPDGLFTRAQRLTWLEASEIEDEEEKV
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pF1KA0 KKYGAFIRSLPGVNRATLAAIIEHLYRVQKCSEINHMNAHNLALVFSSCLFQTKGQTSEE
       ..:  ..  :: :::::. :.: ::: ::  :. :.::.::::.::.  :::: ::  . 
CCDS82 SRYRELLVRLPPVNRATVKALISHLYCVQCFSDTNQMNVHNLAIVFGPTLFQTDGQDYKA
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pF1KA0 VNVIEDLINNYVEIFEVKEDQVKQMDIENSFITKWK----DTQVSQAGDLLIEVYVERKE
         :.:::::.:: .: : :......  : . :.: .     . ...:::..  ::.:.:.
CCDS82 GRVVEDLINHYVVVFSVDEEELRKQREEITAIVKMRVAGTASGTQHAGDFICTVYLEEKK
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pF1KA0 PDCSIIIRISPVMEAEELTNDILAIKNIIPTKGDIWATFEVIENEELERPLHYKENVLEQ
        .    :..   : ::::: .::  .:.   . : :. ::: : :: :::::. :.::  
CCDS82 AETEQHIKVPASMTAEELTLEILDRRNVGIREKDYWTCFEVNEREEAERPLHFAEKVLP-
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pF1KA0 VLRWSSLAEPGSAYLVVKRFLTADTIKHCSDRSTLGSIKEGILKIKEEPSKI---LSGNK
       .:.  .:.   ...::::.  . ...      : .:. :.:..:..:. : .   : .. 
CCDS82 ILH--GLGT--DSHLVVKKHQAMEAML-LYLASRVGDTKHGMMKFREDRSLLGLGLPSGG
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pF1KA0 FQDRYFVLRDGFLFLYKDVKSSK---------H--DKMFSLSSMKFYRGVKKKMKPPTSW
       :.::::.: .. : :::.:.:..         :  .: . ..:.: : :::::..::: :
CCDS82 FHDRYFILNSSCLRLYKEVRSQRPWSGAPETSHRPEKEWPIKSLKVYLGVKKKLRPPTCW
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pF1KA0 GLTAY--SEKH---HWHLCCDSSQTQTEWMTSIFIAQHEYDIWPPAGKERKRSITKNPKI
       :.:.   .:::   .:.::::...   ::.......::.  .::   .. .:.. .  ..
CCDS82 GFTVVHETEKHEKQQWYLCCDTQMELREWFATFLFVQHDGLVWPSEPSRVSRAVPEV-RL
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pF1KA0 GGLPLIPIQHEGNATLARKNIESARAE-LERLRLSEKCDKESVDSSLKERASMVAHCLEH
       :.. :::..  :. .  :... .  :. :  ::                           
CCDS82 GSVSLIPLR--GSENEMRRSVAAFTADPLSLLRNV                         
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pF1KA0 KDDKLRNRPRKHRSFNCLEDTEPEAPLGQPKGHKGLKTLRKTEDRNSKATLDSDHKLPSR

>>CCDS41687.1 ARAP1 gene_id:116985|Hs108|chr11            (1450 aa)
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pF1KA0 SSTSGNADSSAVSSQAISPYACFYGASAKKVKSGWLDKLSPQGKRMFQKRWVKFDGLSIS
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CCDS41 SSLSLSLPSTIAAPHPMDGPPGGSTPVTPVIKAGWLDKNPPQGSYIYQKRWVRLDTDHLR
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CCDS41 YFDSNKDAYSKRFISVACISHVAAIGDQKFEVITNNRTFAFRAESDVERKEWMQALQQAM
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pF1KA0 KSQSLTSQ-SQAVVT-------PEKCGYLELRGYKAKIFTVLSGNSVWLCKNEQDFKSGL
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CCDS41 AEQRARARLSSAYLLGVPGSEQPDRAGSLELRGFKNKLYVAVVGDKVQLYKNLEEYHLGI
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       :::.: :.:.:::.:::   .::.. :::: :::.:..: ::..:.::.: .:::.::  
CCDS41 GITFIDMSVGNVKEVDR---RSFDLTTPYRIFSFSADSELEKEQWLEAMQGAIAEALSTS
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CCDS41 EVAERIWAAAPNRFCADCGAPQPDWASINLCVVICKRCAGEHRGLGAGVSKVRSLKMDRK
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pF1KA0 IWSNELIELFIVIGNKRANDFWAGNLQKDEELHMDSPVEKRKNFITQKYKEGKFRKTLLA
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CCDS41 VWTETLIELFLQLGNGAGNRFWAANVPPSEALQPSSSPSTRRCHLEAKYREGKYRRYHPL
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CCDS41 FGNQEELDKALCAAVTTTDLAETQALLGCGAGINCFSGDPEAPTPLALAEQAGQTLQMEF
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CCDS41 LRNNRTTEVPRLD--SMKPLEKHYSVVLPTVSHSGFLYKTASAG-KLLQDRRAREEFSRR
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CCDS41 WCVLGDGVLSYFENERAVTPNGEIRASEIVCLAVPPPDTH---GFEHTFEVYTEGERLYL
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       :: :...  ..:.. ::: ::: .::.:   :.. .:.: ::   .:.. ..:::... :
CCDS41 FGLESAEQAHEWVKCIAKAFVPPLAEDLLARDFERLGRLPYKAGLSLQRAQEGWFSLSGS
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CCDS41 ELRAVFPEGPCE-EPLQLRKLQELSI----QGDSENQVLVLVERRRTLYIQGERRLDFMG
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       :  ::.:::.. :..:..:::. .:.:.::  :. ..:: ::  . ::.: :.  . ..:
CCDS41 WLGAIQKAAASMGDTLSEQQLGDSDIPVIVYRCVDYITQCGLTSEGIYRKCGQTSKTQRL
          950       960       970       980       990      1000    

           1170      1180      1190      1200      1210      1220  
pF1KA0 LESFKKDARSFKLRAGKHQLEDVTAVLKSFLSDIDDALLTKELYPYWISALDTQDDKERI
       :::...:::: .:. :.....::...:: :: :. :.:.:.     :. : . .:..:..
CCDS41 LESLRQDARSVHLKEGEQHVDDVSSALKRFLRDLPDGLFTRAQRLTWLEASEIEDEEEKV
         1010      1020      1030      1040      1050      1060    

           1230      1240      1250      1260      1270      1280  
pF1KA0 KKYGAFIRSLPGVNRATLAAIIEHLYRVQKCSEINHMNAHNLALVFSSCLFQTKGQTSEE
       ..:  ..  :: :::::. :.: ::: ::  :. :.::.::::.::.  :::: ::  . 
CCDS41 SRYRELLVRLPPVNRATVKALISHLYCVQCFSDTNQMNVHNLAIVFGPTLFQTDGQDYKA
         1070      1080      1090      1100      1110      1120    

           1290      1300      1310          1320      1330        
pF1KA0 VNVIEDLINNYVEIFEVKEDQVKQMDIENSFITKWK----DTQVSQAGDLLIEVYVERKE
         :.:::::.:: .: : :......  : . :.: .     . ...:::..  ::.:.:.
CCDS41 GRVVEDLINHYVVVFSVDEEELRKQREEITAIVKMRVAGTASGTQHAGDFICTVYLEEKK
         1130      1140      1150      1160      1170      1180    

     1340      1350      1360      1370      1380      1390        
pF1KA0 PDCSIIIRISPVMEAEELTNDILAIKNIIPTKGDIWATFEVIENEELERPLHYKENVLEQ
        .    :..   : ::::: .::  .:.   . : :. ::: : :: :::::. :.::  
CCDS41 AETEQHIKVPASMTAEELTLEILDRRNVGIREKDYWTCFEVNEREEAERPLHFAEKVLP-
         1190      1200      1210      1220      1230      1240    

     1400      1410      1420      1430      1440      1450        
pF1KA0 VLRWSSLAEPGSAYLVVKRFLTADTIKHCSDRSTLGSIKEGILKIKEEPSKI---LSGNK
       .:.  .:.   ...::::.  . ...      : .:. :.:..:..:. : .   : .. 
CCDS41 ILH--GLGT--DSHLVVKKHQAMEAML-LYLASRVGDTKHGMMKFREDRSLLGLGLPSGG
            1250        1260       1270      1280      1290        

        1460      1470                 1480      1490      1500    
pF1KA0 FQDRYFVLRDGFLFLYKDVKSSK---------H--DKMFSLSSMKFYRGVKKKMKPPTSW
       :.::::.: .. : :::.:.:..         :  .: . ..:.: : :::::..::: :
CCDS41 FHDRYFILNSSCLRLYKEVRSQRPWSGAPETSHRPEKEWPIKSLKVYLGVKKKLRPPTCW
     1300      1310      1320      1330      1340      1350        

           1510         1520      1530      1540      1550         
pF1KA0 GLTAY--SEKH---HWHLCCDSSQTQTEWMTSIFIAQHEYDIWPPAGKERKRSITKNPKI
       :.:.   .:::   .:.::::...   ::.......::.  .::   .. .:.. .  ..
CCDS41 GFTVVHETEKHEKQQWYLCCDTQMELREWFATFLFVQHDGLVWPSEPSRVSRAVPEV-RL
     1360      1370      1380      1390      1400      1410        

    1560      1570      1580       1590      1600      1610        
pF1KA0 GGLPLIPIQHEGNATLARKNIESARAE-LERLRLSEKCDKESVDSSLKERASMVAHCLEH
       :.. :::..  :. .  :... .  :. :  ::                           
CCDS41 GSVSLIPLR--GSENEMRRSVAAFTADPLSLLRNV                         
      1420        1430      1440      1450                         

     1620      1630      1640      1650      1660      1670        
pF1KA0 KDDKLRNRPRKHRSFNCLEDTEPEAPLGQPKGHKGLKTLRKTEDRNSKATLDSDHKLPSR

>>CCDS44671.1 ARAP1 gene_id:116985|Hs108|chr11            (1133 aa)
 initn: 2218 init1: 701 opt: 1831  Z-score: 1706.7  bits: 328.3 E(32554): 9.6e-89
Smith-Waterman score: 2663; 40.0% identity (67.7% similar) in 1132 aa overlap (484-1591:84-1131)

           460       470       480       490       500       510   
pF1KA0 SSTSGNADSSAVSSQAISPYACFYGASAKKVKSGWLDKLSPQGKRMFQKRWVKFDGLSIS
                                     .:.:::::  :::. ..:::::..:   . 
CCDS44 SSLSLSLPSTIAAPHPMDGPPGGSTPVTPVIKAGWLDKNPPQGSYIYQKRWVRLDTDHLR
            60        70        80        90       100       110   

           520       530       540       550       560       570   
pF1KA0 YYNNEKEMYSKGIIPLSAISTVRVQGDNKFEVVTTQRTFVFRVEKEEERNDWISILLNAL
       :....:. ::: .: .. :: : . ::.::::.:..:::.::.:.. ::..:.. : .:.
CCDS44 YFDSNKDAYSKRFISVACISHVAAIGDQKFEVITNNRTFAFRAESDVERKEWMQALQQAM
           120       130       140       150       160       170   

           580               590       600       610       620     
pF1KA0 KSQSLTSQ-SQAVVT-------PEKCGYLELRGYKAKIFTVLSGNSVWLCKNEQDFKSGL
         :   .. :.: .        :.. : :::::.: :..... :..: : :: .... :.
CCDS44 AEQRARARLSSAYLLGVPGSEQPDRAGSLELRGFKNKLYVAVVGDKVQLYKNLEEYHLGI
           180       190       200       210       220       230   

         630       640       650       660       670       680     
pF1KA0 GITIIPMNVANVKQVDRTVKQSFEIITPYRSFSFTAETEKEKQDWIEAVQQSIAETLSDY
       :::.: :.:.:::.:::   .::.. :::: :::.:..: ::..:.::.: .:::.::  
CCDS44 GITFIDMSVGNVKEVDR---RSFDLTTPYRIFSFSADSELEKEQWLEAMQGAIAEALSTS
           240       250          260       270       280       290

         690       700       710       720       730       740     
pF1KA0 EVAEKIWFNESNRSCADCKAPDPDWASINLCVVICKKCAGQHRSLGPKDSKVRSLKMDAS
       ::::.::    :: :::: ::.::::::::::::::.:::.::.::   ::::::::: .
CCDS44 EVAERIWAAAPNRFCADCGAPQPDWASINLCVVICKRCAGEHRGLGAGVSKVRSLKMDRK
              300       310       320       330       340       350

         750       760       770       780       790       800     
pF1KA0 IWSNELIELFIVIGNKRANDFWAGNLQKDEELHMDSPVEKRKNFITQKYKEGKFRKTLLA
       .:.. :::                                                    
CCDS44 VWTETLIE----------------------------------------------------
                                                                   

         810       820       830       840       850       860     
pF1KA0 SLTKEELNKALCAAVVKPDVLETMALLFSGADVMCATGDPVHSTPYLLAKKAGQSLQMEF
                ::::::.  :. ::.:::  :: . : .:::   ::  ::..:::.:::::
CCDS44 ---------ALCAAVTTTDLAETQALLGCGAGINCFSGDPEAPTPLALAEQAGQTLQMEF
               360       370       380       390       400         

         870       880       890          900       910       920  
pF1KA0 LYHNKFSDFPQHDIHSEGVLSQESS---QSTFLCDFLYQAPSAASKLSSEKKLLEETNKK
       : .:. .. :. :  :   : .. :    ..    :::.. ::. :: ....  :: ...
CCDS44 LRNNRTTEVPRLD--SMKPLEKHYSVVLPTVSHSGFLYKTASAG-KLLQDRRAREEFSRR
     410       420         430       440       450        460      

            930       940       950       960       970       980  
pF1KA0 WCVLEGGFLSYYENDKSTTPNGTININEVICLAIHKEDFYLNTGPIFIFEIYLPSERVFL
       ::::  : :::.::....:::: :  .:..:::.   : .   :    ::.:  .::..:
CCDS44 WCVLGDGVLSYFENERAVTPNGEIRASEIVCLAVPPPDTH---GFEHTFEVYTEGERLYL
        470       480       490       500          510       520   

            990      1000      1010      1020      1030      1040  
pF1KA0 FGAETSQAQRKWTEAIAKHFVPLFAENLTEADYDLIGQLFYKDCHALDQWRKGWFAMDKS
       :: :...  ..:.. ::: ::: .::.:   :.. .:.: ::   .:.. ..:::... :
CCDS44 FGLESAEQAHEWVKCIAKAFVPPLAEDLLARDFERLGRLPYKAGLSLQRAQEGWFSLSGS
           530       540       550       560       570       580   

           1050      1060      1070      1080      1090      1100  
pF1KA0 SLHFCLQMQEVQGDRMHLRRLQELTISTMVQNGEKLDVLLLVEKGRTLYIHGHTKLDFTV
        :.  .     . . ..::.::::.:    :.  . .::.:::. :::::.:. .:::  
CCDS44 ELRAVFPEGPCE-EPLQLRKLQELSI----QGDSENQVLVLVERRRTLYIQGERRLDFMG
           590        600           610       620       630        

           1110      1120      1130      1140      1150      1160  
pF1KA0 WHTAIEKAAGTDGNALQDQQLSKNDVPIIVNSCIAFVTQYGLGCKYIYQKNGDPLHISEL
       :  ::.:::.. :..:..:::. .:.:.::  :. ..:: ::  . ::.: :.  . ..:
CCDS44 WLGAIQKAAASMGDTLSEQQLGDSDIPVIVYRCVDYITQCGLTSEGIYRKCGQTSKTQRL
      640       650       660       670       680       690        

           1170      1180      1190      1200      1210      1220  
pF1KA0 LESFKKDARSFKLRAGKHQLEDVTAVLKSFLSDIDDALLTKELYPYWISALDTQDDKERI
       :::...:::: .:. :.....::...:: :: :. :.:.:.     :. : . .:..:..
CCDS44 LESLRQDARSVHLKEGEQHVDDVSSALKRFLRDLPDGLFTRAQRLTWLEASEIEDEEEKV
      700       710       720       730       740       750        

           1230      1240      1250      1260      1270      1280  
pF1KA0 KKYGAFIRSLPGVNRATLAAIIEHLYRVQKCSEINHMNAHNLALVFSSCLFQTKGQTSEE
       ..:  ..  :: :::::. :.: ::: ::  :. :.::.::::.::.  :::: ::  . 
CCDS44 SRYRELLVRLPPVNRATVKALISHLYCVQCFSDTNQMNVHNLAIVFGPTLFQTDGQDYKA
      760       770       780       790       800       810        

           1290      1300      1310          1320      1330        
pF1KA0 VNVIEDLINNYVEIFEVKEDQVKQMDIENSFITKWK----DTQVSQAGDLLIEVYVERKE
         :.:::::.:: .: : :......  : . :.: .     . ...:::..  ::.:.:.
CCDS44 GRVVEDLINHYVVVFSVDEEELRKQREEITAIVKMRVAGTASGTQHAGDFICTVYLEEKK
      820       830       840       850       860       870        

     1340      1350      1360      1370      1380      1390        
pF1KA0 PDCSIIIRISPVMEAEELTNDILAIKNIIPTKGDIWATFEVIENEELERPLHYKENVLEQ
        .    :..   : ::::: .::  .:.   . : :. ::: : :: :::::. :.::  
CCDS44 AETEQHIKVPASMTAEELTLEILDRRNVGIREKDYWTCFEVNEREEAERPLHFAEKVLP-
      880       890       900       910       920       930        

     1400      1410      1420      1430      1440      1450        
pF1KA0 VLRWSSLAEPGSAYLVVKRFLTADTIKHCSDRSTLGSIKEGILKIKEEPSKI---LSGNK
       .:.  .:.   ...::::.  . ...      : .:. :.:..:..:. : .   : .. 
CCDS44 ILH--GLGT--DSHLVVKKHQAMEAML-LYLASRVGDTKHGMMKFREDRSLLGLGLPSGG
       940           950       960        970       980       990  

        1460      1470      1480      1490      1500        1510   
pF1KA0 FQDRYFVLRDGFLFLYKDVKSSKHDKMFSLSSMKFYRGVKKKMKPPTSWGLTAY--SEKH
       :.::::.: .. : :::.:.: . .: . ..:.: : :::::..::: ::.:.   .:::
CCDS44 FHDRYFILNSSCLRLYKEVRSHRPEKEWPIKSLKVYLGVKKKLRPPTCWGFTVVHETEKH
           1000      1010      1020      1030      1040      1050  

             1520      1530      1540      1550      1560      1570
pF1KA0 ---HWHLCCDSSQTQTEWMTSIFIAQHEYDIWPPAGKERKRSITKNPKIGGLPLIPIQHE
          .:.::::...   ::.......::.  .::   .. .:.. .  ..:.. :::..  
CCDS44 EKQQWYLCCDTQMELREWFATFLFVQHDGLVWPSEPSRVSRAVPEV-RLGSVSLIPLR--
           1060      1070      1080      1090       1100           

             1580       1590      1600      1610      1620         
pF1KA0 GNATLARKNIESARAE-LERLRLSEKCDKESVDSSLKERASMVAHCLEHKDDKLRNRPRK
       :. .  :... .  :. :  ::                                      
CCDS44 GSENEMRRSVAAFTADPLSLLRNV                                    
    1110      1120      1130                                       

>>CCDS4266.1 ARAP3 gene_id:64411|Hs108|chr5               (1544 aa)
 initn: 2836 init1: 1024 opt: 1700  Z-score: 1582.8  bits: 305.8 E(32554): 7.7e-82
Smith-Waterman score: 2864; 40.5% identity (67.0% similar) in 1226 aa overlap (452-1649:253-1443)

             430       440       450         460       470         
pF1KA0 FQSLRRKNSKASKSRTQKALILDSVNRHSYPLSST--SGNADSSAVSSQAISPYACFYGA
                                     : .::  : . ..  .:.. ::::: :  .
CCDS42 RGVCQGRAEHRLSRQDLEAREDAGYASLELPGDSTLLSPTLETEETSDDLISPYASFSFT
            230       240       250       260       270       280  

     480         490       500       510       520       530       
pF1KA0 SAK--KVKSGWLDKLSPQGKRMFQKRWVKFDGLSISYYNNEKEMYSKGIIPLSAISTVRV
       . .   . :::::::::::. .::.:.:.:.: :. :....:. . ::.:::.::  .: 
CCDS42 ADRLTPLLSGWLDKLSPQGNYVFQRRFVQFNGRSLMYFGSDKDPFPKGVIPLTAIEMTRS
            290       300       310       320       330       340  

       540       550       560       570       580         590     
pF1KA0 QGDNKFEVVTTQRTFVFRVEKEEERNDWISILLNALKSQSLTSQSQAVVTPE--KCGYLE
       . ::::.:.: ::.::::.:.: .:. : : : . :: : : .. .    :.  . :.::
CCDS42 SKDNKFQVITGQRVFVFRTESEAQRDMWCSTLQSCLKEQRLLGHPRPPQPPRPLRTGMLE
            350       360       370       380       390       400  

         600       610       620       630       640       650     
pF1KA0 LRGYKAKIFTVLSGNSVWLCKNEQDFKSGLGITIIPMNVANVKQVDRTVKQSFEIITPYR
       :::.:::.:..:: . . : :.:: :. :.:: .: ..  .:..   : ..::...::.:
CCDS42 LRGHKAKVFAALSPGELALYKSEQAFSLGIGICFIELQGCSVRE---TKSRSFDLLTPHR
            410       420       430       440          450         

         660       670       680       690       700       710     
pF1KA0 SFSFTAETEKEKQDWIEAVQQSIAETLSDYEVAEKIWFNESNRSCADCKAPDPDWASINL
        ::::::.   .:.:  :.:....::::::::::::: :..::.:::: .  ::::..::
CCDS42 CFSFTAESGGARQSWAAALQEAVTETLSDYEVAEKIWSNRANRQCADCGSSRPDWAAVNL
     460       470       480       490       500       510         

         720       730       740       750       760       770     
pF1KA0 CVVICKKCAGQHRSLGPKDSKVRSLKMDASIWSNELIELFIVIGNKRANDFWAGNLQKDE
        :::::.::::::.::   :::.:::.:.:.::::...::::.:: ::: ::::.:   :
CCDS42 GVVICKQCAGQHRALGSGISKVQSLKLDTSVWSNEIVQLFIVLGNDRANRFWAGTLPPGE
     520       530       540       550       560       570         

         780       790       800       810       820       830     
pF1KA0 ELHMDSPVEKRKNFITQKYKEGKFRKTLLASLTKEELNKALCAAVVKPDVLETMALL---
        :: :.    : .::..::. : :::       . .: .::::::..:..:..:. :   
CCDS42 GLHPDATPGPRGEFISRKYRLGLFRKPHPQYPDHSQLLQALCAAVARPNLLKNMTQLLCV
     580       590       600       610       620       630         

              840       850       860       870       880       890
pF1KA0 --FSGADVMCATGDPVHSTPYLLAKKAGQSLQMEFLYHNKFSDFPQHDIHSEGVLSQESS
         : : .     . :  : : ::                  :: :     : :: ..   
CCDS42 EAFEGEEPWFPPA-PDGSCPGLLP-----------------SD-P-----SPGVYNEVVV
     640       650        660                              670     

              900        910       920       930       940         
pF1KA0 QSTFLCDFLYQAP-SAASKLSSEKKLLEETNKKWCVLEGGFLSYYENDKSTTPNGTININ
       ..:.   ::: .: :  .  :  ..  .   . :::: :. : .. ...:  : . :. .
CCDS42 RATY-SGFLYCSPVSNKAGPSPPRRGRDAPPRLWCVL-GAALEMFASENSPEPLSLIQPQ
          680       690       700       710        720       730   

     950       960       970       980       990      1000         
pF1KA0 EVICLAIHKEDFYLNTGPIFIFEIYLPSERVFLFGAETSQAQRKWTEAIAKHFVPLFAEN
       ...::..       .    : ::. : . :.  ::.. ... . :: :..: : ::  ..
CCDS42 DIVCLGVSPPPTDPGDRFPFSFELILAGGRIQHFGTDGADSLEAWTSAVGKWFSPLSCHQ
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    1010      1020          1030      1040      1050         1060  
pF1KA0 LTEADYDLIGQLFYKD-CH---ALDQWRKGWFAMDKSSLHFCLQM---QEVQGDRMHLRR
       :       .:.:. ..  :   :   : .:.  .  . : .:        .  : .::::
CCDS42 LLGPGLLRLGRLWLRSPSHTAPAPGLWLSGFGLLRGDHLFLCSAPGPGPPAPEDMVHLRR
           800       810       820       830       840       850   

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pF1KA0 LQELTISTMVQNGEKLDVLLLVEKGRTLYIHGHTKLDFTVWHTAIEKAAGTDGNALQDQQ
       :::... . ... .: . :.::: :::::..:. .::::.:..::  :::  :..::.::
CCDS42 LQEISVVSAADTPDKKEHLVLVETGRTLYLQGEGRLDFTAWNAAIGGAAGGGGTGLQEQQ
           860       870       880       890       900       910   

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pF1KA0 LSKNDVPIIVNSCIAFVTQYGLGCKYIYQKNGDPLHISELLESFKKDARSFKLRAGKHQL
       .:..:.::::..::.::::.::  . .:.:.:   .  .::  :..:::: ::: :.: .
CCDS42 MSRGDIPIIVDACISFVTQHGLRLEGVYRKGGARARSLRLLAEFRRDARSVKLRPGEHFV
           920       930       940       950       960       970   

           1190      1200      1210      1220      1230      1240  
pF1KA0 EDVTAVLKSFLSDIDDALLTKELYPYWISALDTQDDKERIKKYGAFIRSLPGVNRATLAA
       :::: .:: :. ..:: . . .: : :  : .  . ..:..::   :  :: ::: :::.
CCDS42 EDVTDTLKRFFRELDDPVTSARLLPRWREAAELPQKNQRLEKYKDVIGCLPRVNRRTLAT
           980       990      1000      1010      1020      1030   

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pF1KA0 IIEHLYRVQKCSEINHMNAHNLALVFSSCLFQTKGQTSEEVNVIEDLINNYVEIFEVKED
       .: ::::::::. .:.: ..::::.:.  .::: :.  .:: :...::..:. .:..  :
CCDS42 LIGHLYRVQKCAALNQMCTRNLALLFAPSVFQTDGRGEHEVRVLQELIDGYISVFDIDSD
          1040      1050      1060      1070      1080      1090   

           1310      1320      1330      1340      1350      1360  
pF1KA0 QVKQMDIENSFITKWKDTQVSQAGDLLIEVYVERKEPDCSIIIRISPVMEAEELTNDILA
       :: :.:.: :.:: :::.:.::::::..:::.:.. ::  . ...::.. ::::::..: 
CCDS42 QVAQIDLEVSLITTWKDVQLSQAGDLIMEVYIEQQLPDNCVTLKVSPTLTAEELTNQVLE
          1100      1110      1120      1130      1140      1150   

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pF1KA0 IKNIIPTKGDIWATFEVIENEELERPLHYKENVLEQVLRWSSLAEPGSAYLVVKRFLTAD
       ...   .  :.:.:::. :. ::::::: ::.::::.:.: .: :: :: :..:.   :.
CCDS42 MRGTA-AGMDLWVTFEIREHGELERPLHPKEKVLEQALQWCQLPEPCSASLLLKKVPLAQ
           1160      1170      1180      1190      1200      1210  

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pF1KA0 TIKHCSDRSTLG-SIKEGILKIKEEPSKILSGNKFQDRYFVLRDGFLFLYKDVKSSKHDK
       .   :   .    : . :.:. .::: ..: :..::.:.:.::   :.: :. :::: ..
CCDS42 A--GCLFTGIRRESPRVGLLRCREEPPRLL-GSRFQERFFLLRGRCLLLLKEKKSSKPER
             1220      1230      1240       1250      1260         

            1490      1500      1510      1520      1530      1540 
pF1KA0 MFSLSSMKFYRGVKKKMKPPTSWGLTAYSEKHHWHLCCDSSQTQTEWMTSIFIAQHEYDI
        . : . : : :..::.:::: ::.:   :: : .: : . . . .: :::. :::. : 
CCDS42 EWPLEGAKVYLGIRKKLKPPTPWGFTLILEKMHLYLSCTDEDEMWDWTTSILKAQHD-DQ
    1270      1280      1290      1300      1310      1320         

            1550      1560       1570      1580      1590      1600
pF1KA0 WPPAGKERKRSITKNPKIGGLPLIPIQ-HEGNATLARKNIESARAELERLRLSEKCDKES
        : . .... :     :.: .::.::.  ...:::   : .. :   .:  ::     .:
CCDS42 QPVVLRRHSSSDLARQKFGTMPLLPIRGDDSGATLLSAN-QTLRRLHNRRTLSMFFPMKS
     1330      1340      1350      1360       1370      1380       

             1610       1620          1630        1640      1650   
pF1KA0 VDSSLKERASMVAHCLEHK-DDKLRNRPR----KHRSFNCLED--TEPEAPLGQPKGHKG
        ..:..:.  .     :.   ...   :.       ::.  ..  ..:: :: . :    
CCDS42 SQGSVEEQEELEEPVYEEPVYEEVGAFPELIQDTSTSFSTTREWTVKPENPLTSQKSLDQ
      1390      1400      1410      1420      1430      1440       

          1660      1670      1680      1690      1700             
pF1KA0 LKTLRKTEDRNSKATLDSDHKLPSRVIEELNVVLQRSRTLPKELQDEQILK         
                                                                   
CCDS42 PFLSKSSTLGQEERPPEPPPGPPSKSSPQARGSLEEQLLQELSSLILRKGETTAGLGSPS
      1450      1460      1470      1480      1490      1500       

>>CCDS8951.1 AGAP2 gene_id:116986|Hs108|chr12             (836 aa)
 initn: 322 init1: 200 opt: 340  Z-score: 320.6  bits: 71.3 E(32554): 1.5e-11
Smith-Waterman score: 362; 29.4% identity (56.6% similar) in 279 aa overlap (645-901:517-789)

          620       630       640       650          660       670 
pF1KA0 CKNEQDFKSGLGITIIPMNVANVKQVDRTVKQSFEII---TPYRSFSFTAETEKEKQDWI
                                     ...::..   .  ... : : . .:.. :.
CCDS89 EPPPSPMVKKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWV
        490       500       510       520       530       540      

             680                      690       700       710      
pF1KA0 EAVQQSIAETL---------------SDYEVAEKIWFNESNRSCADCKAPDPDWASINLC
       .:....:  .:               :.  . . :   ..:  :.:: ::.: :::.:: 
CCDS89 QAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLG
        550       560       570       580       590       600      

        720       730       740       750       760       770      
pF1KA0 VVICKKCAGQHRSLGPKDSKVRSLKMDASIWSNELIELFIVIGNKRANDFWAGNLQKDEE
       ..:: .:.: ::.:: . :.:::: .:   :  ::  .. .:::  ::  : .. .   .
CCDS89 ALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDD--WPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAK
        610       620       630         640       650       660    

        780       790       800       810       820       830      
pF1KA0 LHMDSPVEKRKNFITQKYKEGKFRKTLLASLTKEELNKALCAAVVKPDVLETMALLFSGA
          ::  :.:...:  ::..  :   :  : ..: :.. : :::   ::  :. ::.. :
CCDS89 PSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPL--STSEEPLGRQLWAAVQAQDV-ATVLLLLAHA
          670       680       690         700       710        720 

           840       850       860       870       880       890   
pF1KA0 ---DVMCATGDPVHSTPYLLAKKAGQSLQMEFLYHNKFSDFPQHDIHSEGVLSQESSQST
           .  .. ::   .:  :: . .. .  ..:     .:   .: ... .:    . ..
CCDS89 RHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYG-ADVAARDAQGRTALFYARQAGS
             730       740       750        760       770       780

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pF1KA0 FLC-DFLYQAPSAASKLSSEKKLLEETNKKWCVLEGGFLSYYENDKSTTPNGTININEVI
        :: :.: :                                                   
CCDS89 QLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV    
              790       800       810       820       830          

>>CCDS44932.1 AGAP2 gene_id:116986|Hs108|chr12            (1192 aa)
 initn: 357 init1: 200 opt: 340  Z-score: 318.4  bits: 71.4 E(32554): 2.1e-11
Smith-Waterman score: 362; 29.4% identity (56.6% similar) in 279 aa overlap (645-901:873-1145)

          620       630       640       650          660       670 
pF1KA0 CKNEQDFKSGLGITIIPMNVANVKQVDRTVKQSFEII---TPYRSFSFTAETEKEKQDWI
                                     ...::..   .  ... : : . .:.. :.
CCDS44 KTEGSAGQAEAKRKMWKLKSFGSLRNIYKAEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWV
            850       860       870       880       890       900  

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pF1KA0 EAVQQSIAETL---------------SDYEVAEKIWFNESNRSCADCKAPDPDWASINLC
       .:....:  .:               :.  . . :   ..:  :.:: ::.: :::.:: 
CCDS44 QAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLG
            910       920       930       940       950       960  

        720       730       740       750       760       770      
pF1KA0 VVICKKCAGQHRSLGPKDSKVRSLKMDASIWSNELIELFIVIGNKRANDFWAGNLQKDEE
       ..:: .:.: ::.:: . :.:::: .:   :  ::  .. .:::  ::  : .. .   .
CCDS44 ALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDD--WPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAK
            970       980       990        1000      1010      1020

        780       790       800       810       820       830      
pF1KA0 LHMDSPVEKRKNFITQKYKEGKFRKTLLASLTKEELNKALCAAVVKPDVLETMALLFSGA
          ::  :.:...:  ::..  :   :  : ..: :.. : :::   ::  :. ::.. :
CCDS44 PSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPL--STSEEPLGRQLWAAVQAQDV-ATVLLLLAHA
             1030      1040        1050      1060       1070       

           840       850       860       870       880       890   
pF1KA0 ---DVMCATGDPVHSTPYLLAKKAGQSLQMEFLYHNKFSDFPQHDIHSEGVLSQESSQST
           .  .. ::   .:  :: . .. .  ..:     .:   .: ... .:    . ..
CCDS44 RHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYG-ADVAARDAQGRTALFYARQAGS
      1080      1090      1100      1110       1120      1130      

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pF1KA0 FLC-DFLYQAPSAASKLSSEKKLLEETNKKWCVLEGGFLSYYENDKSTTPNGTININEVI
        :: :.: :                                                   
CCDS44 QLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV    
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>>CCDS7215.1 AGAP4 gene_id:119016|Hs108|chr10             (663 aa)
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       610       620       630       640       650        660      
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pF1KA0 KQDWIEAVQQSIAETLSDYEVA---------------EKIWFNESNRSCADCKAPDPDWA
       .. :..:.:..:  .:.. : .               ..:   ..:  :.::.. .: ::
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pF1KA0 SINLCVVICKKCAGQHRSLGPKDSKVRSLKMDASIWSNELIELFIVIGNKRANDFWAGNL
       :.:: :..: .:.: ::::: . :.::::..:   :  :: ...  :::  ::..: :. 
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pF1KA0 QKDEELHMDSPVEKRKNFITQKYKEGKFRKTLLASLTKEELN--KALCAAVVKPDVLETM
       : . .    :  :... .: .::.:    : .:: :   ::.  . :  :..  :.  ..
CCDS72 QGQTKPSEKSTREEKERWIRSKYEE----KLFLAPLPCTELSLGQQLLRATADEDLQTAI
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pF1KA0 ALLFSGA----DVMCATGDPVHSTPYLLAKKAGQSLQMEFLYHNKFSDFPQHDIHSEGVL
        ::  :.    .  :. ::   .. .:  .:..  : . .....   :   .: :.. .:
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pF1KA0 S---QESSQSTFLCDFLYQAPSAASKLSSEKKLLEETNKKWCVLEGGFLSYYENDKSTTP
       .   : :::  .   . :  :                                       
CCDS72 TYARQASSQECINVLLQYGCPDKCV                                   
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>>CCDS44397.1 AGAP6 gene_id:414189|Hs108|chr10            (686 aa)
 initn: 206 init1: 206 opt: 324  Z-score: 306.9  bits: 68.5 E(32554): 8.9e-11
Smith-Waterman score: 364; 28.9% identity (57.4% similar) in 291 aa overlap (638-903:401-682)

       610       620       630       640       650        660      
pF1KA0 SGNSVWLCKNEQDFKSGLGITIIPMNVANVKQVDRTVKQSFEIITPY-RSFSFTAETEKE
                                     :.. .   ..: :..   ... : : : .:
CCDS44 LGDSICFSPSISSTTSPKLNPPPSPHANKKKHLKKKSTNNFMIVSATGQTWHFEATTYEE
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pF1KA0 KQDWIEAVQQSIAETLSDYEVA---------------EKIWFNESNRSCADCKAPDPDWA
       .. :..:.:..:  .:.. : .               ..:   ..:  :.::.. .: ::
CCDS44 RDAWVQAIQSQILASLQSCESSKSKSQLTSQSEAMALQSIQNMRGNAHCVDCETQNPKWA
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pF1KA0 SINLCVVICKKCAGQHRSLGPKDSKVRSLKMDASIWSNELIELFIVIGNKRANDFWAGNL
       :.:: :..: .:.: ::::::. :.::::..:   :  :: ...  : :  ::..: :. 
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pF1KA0 QKDEELHMDSPVEKRKNFITQKYKEGKFRKTLLASLTKEELN--KALCAAVVKPDVLETM
       : . .    :  :... .: .::.:    : .:: :   ::.  . :  :..  :.  ..
CCDS44 QGQTKPSEKSTREEKERWIRSKYEE----KLFLAPLPCTELSLGQQLLRATADEDLQTAI
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pF1KA0 ALLFSGA----DVMCATGDPVHSTPYLLAKKAGQSLQMEFLYHNKFSDFPQHDIHSEGVL
        ::  :.    .  :. ::   .. .:  .:..  : . .....   :   .: :.. .:
CCDS44 LLLAHGSCEEVNETCGEGDGC-TALHLACRKGNVVLAQLLIWYG--VDVMARDAHGNTAL
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pF1KA0 S---QESSQSTFLCDFLYQAPSAASKLSSEKKLLEETNKKWCVLEGGFLSYYENDKSTTP
       .   : :::  .   . :  :                                       
CCDS44 TYARQASSQECINVLLQYGCPDECV                                   
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>>CCDS2514.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2              (804 aa)
 initn: 316 init1: 188 opt: 325  Z-score: 306.9  bits: 68.7 E(32554): 9e-11
Smith-Waterman score: 353; 28.4% identity (58.2% similar) in 282 aa overlap (645-901:498-770)

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pF1KA0 CKNEQDFKSGLGITIIPMNVANVKQVDRTVKQSFEIIT---PYRSFSFTAETEKEKQDWI
                                     ...::.:      ... : : : .:.. :.
CCDS25 SPHANRKKHRRKKSTSNFKADGLSGTAEEQEENFEFIIVSLTGQTWHFEATTYEERDAWV
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pF1KA0 EAVQQSIAETLSDYEVA---------------EKIWFNESNRSCADCKAPDPDWASINLC
       .:....:  .:.. : .               ..:   ..:  :.::.. .:.:::.:: 
CCDS25 QAIESQILASLQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNMRGNSHCVDCETQNPNWASLNLG
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pF1KA0 VVICKKCAGQHRSLGPKDSKVRSLKMDASIWSNELIELFIVIGNKRANDFWAGNLQKDEE
       ...: .:.: ::.:: . :.:::: .:   :  :::...  :::. ::. :  . :   .
CCDS25 ALMCIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDD--WPVELIKVMSSIGNELANSVWEESSQGRTK
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pF1KA0 LHMDSPVEKRKNFITQKYKEGKFRKTLLASLTKEELN--KALCAAVVKPDVLETMALLFS
         .::  :... .:  ::..    : .:: :   ::.  . :  :..  :.  .. ::  
CCDS25 PSVDSTREEKERWIRAKYEQ----KLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAH
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pF1KA0 GA----DVMCATGDPVHSTPYLLAKKAGQSLQMEFLYHNKFSDFPQHDIHSEGVLSQESS
       :.    .  :. ::  ... .:  .:..  : . .....   :   .: :.. .:.   .
CCDS25 GSRDEVNETCGEGDG-RTALHLACRKGNVVLAQLLIWYG--VDVTARDAHGNTALAYARQ
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pF1KA0 QSTFLC-DFLYQAPSAASKLSSEKKLLEETNKKWCVLEGGFLSYYENDKSTTPNGTININ
        :.  : : : :                                                
CCDS25 ASSQECIDVLLQYGCPDERFVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII              
      760       770       780       790       800                  




1704 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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