Result of FASTA (ccds) for pF1KA0577
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0577, 1041 aa
  1>>>pF1KA0577 1041 - 1041 aa - 1041 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5170+/-0.00132; mu= 3.5752+/- 0.078
 mean_var=329.6306+/-65.556, 0's: 0 Z-trim(108.7): 67  B-trim: 86 in 1/53
 Lambda= 0.070642
 statistics sampled from 10348 (10397) to 10348 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.65), E-opt: 0.2 (0.319), width:  16
 Scan time:  5.260

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4685.1 DHX16 gene_id:8449|Hs108|chr6           (1041) 6778 706.2 9.1e-203
CCDS11464.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17          (1220) 2590 279.5 3.1e-74
CCDS77040.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17          (1181) 2422 262.3 4.3e-69
CCDS10907.1 DHX38 gene_id:9785|Hs108|chr16         (1227) 2331 253.1 2.7e-66
CCDS33966.1 DHX15 gene_id:1665|Hs108|chr4          ( 795) 2076 226.9 1.4e-58
CCDS11072.1 DHX33 gene_id:56919|Hs108|chr17        ( 707) 1852 204.0 9.4e-52
CCDS54463.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20        ( 672) 1426 160.5 1.1e-38
CCDS13310.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20        ( 703) 1426 160.6 1.1e-38
CCDS12700.1 DHX34 gene_id:9704|Hs108|chr19         (1143) 1131 130.7 1.7e-29
CCDS7652.1 DHX32 gene_id:55760|Hs108|chr10         ( 743) 1096 127.0 1.5e-28
CCDS1949.2 DQX1 gene_id:165545|Hs108|chr2          ( 717)  985 115.6 3.8e-25
CCDS54150.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17        ( 702)  876 104.5 8.2e-22
CCDS11617.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17        ( 779)  876 104.6 8.8e-22
CCDS3171.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3         (1008)  644 81.0 1.4e-14
CCDS1800.1 DHX57 gene_id:90957|Hs108|chr2          (1386)  636 80.4   3e-14
CCDS54657.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3        ( 994)  574 73.9 1.9e-12
CCDS4113.1 YTHDC2 gene_id:64848|Hs108|chr5         (1430)  545 71.1 1.9e-11


>>CCDS4685.1 DHX16 gene_id:8449|Hs108|chr6                (1041 aa)
 initn: 6778 init1: 6778 opt: 6778  Z-score: 3753.8  bits: 706.2 E(32554): 9.1e-203
Smith-Waterman score: 6778; 100.0% identity (100.0% similar) in 1041 aa overlap (1-1041:1-1041)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MATPAGLERWVQDELHSVLGLSERHVAQFLIGTAQRCTSAEEFVQRLRDTDTLDLSGPAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MATPAGLERWVQDELHSVLGLSERHVAQFLIGTAQRCTSAEEFVQRLRDTDTLDLSGPAR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 DFALRLWNKVPRKAVVEKPARAAEREARALLEKNRSYRLLEDSEESSEETVSRAGSSLQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DFALRLWNKVPRKAVVEKPARAAEREARALLEKNRSYRLLEDSEESSEETVSRAGSSLQK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 KRKKRKHLRKKREEEEEEEASEKGKKKTGGSKQQTEKPESEDEWERTERERLQDLEERDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KRKKRKHLRKKREEEEEEEASEKGKKKTGGSKQQTEKPESEDEWERTERERLQDLEERDA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 FAERVRQRDKDRTRNVLERSDKKAYEEAQKRLKMAEEDRKAMVPELRKKSRREYLAKRER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FAERVRQRDKDRTRNVLERSDKKAYEEAQKRLKMAEEDRKAMVPELRKKSRREYLAKRER
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 EKLEDLEAELADEEFLFGDVELSRHERQELKYKRRVRDLAREYRAAGEQEKLEATNRYHM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EKLEDLEAELADEEFLFGDVELSRHERQELKYKRRVRDLAREYRAAGEQEKLEATNRYHM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 PKETRGQPARAVDLVEEESGAPGEEQRRWEEARLGAASLKFGARDAASQEPKYQLVLEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PKETRGQPARAVDLVEEESGAPGEEQRRWEEARLGAASLKFGARDAASQEPKYQLVLEEE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 ETIEFVRATQLQGDEEPSAPPTSTQAQQKESIQAVRRSLPVFPFREELLAAIANHQVLII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ETIEFVRATQLQGDEEPSAPPTSTQAQQKESIQAVRRSLPVFPFREELLAAIANHQVLII
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 EGETGSGKTTQIPQYLFEEGYTNKGMKIACTQPRRVAAMSVAARVAREMGVKLGNEVGYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EGETGSGKTTQIPQYLFEEGYTNKGMKIACTQPRRVAAMSVAARVAREMGVKLGNEVGYS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 IRFEDCTSERTVLRYMTDGMLLREFLSEPDLASYSVVMVDEAHERTLHTDILFGLIKDVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IRFEDCTSERTVLRYMTDGMLLREFLSEPDLASYSVVMVDEAHERTLHTDILFGLIKDVA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 RFRPELKVLVASATMDTARFSTFFDDAPVFRIPGRRFPVDIFYTKAPEADYLEACVVSVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RFRPELKVLVASATMDTARFSTFFDDAPVFRIPGRRFPVDIFYTKAPEADYLEACVVSVL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 QIHVTQPPGDILVFLTGQEEIEAACEMLQDRCRRLGSKIRELLVLPIYANLPSDMQARIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QIHVTQPPGDILVFLTGQEEIEAACEMLQDRCRRLGSKIRELLVLPIYANLPSDMQARIF
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 QPTPPGARKVVVATNIAETSLTIEGIIYVLDPGFCKQKSYNPRTGMESLTVTPCSKASAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QPTPPGARKVVVATNIAETSLTIEGIIYVLDPGFCKQKSYNPRTGMESLTVTPCSKASAN
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 QRAGRAGRVAAGKCFRLYTAWAYQHELEETTVPEIQRTSLGNVVLLLKSLGIHDLMHFDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QRAGRAGRVAAGKCFRLYTAWAYQHELEETTVPEIQRTSLGNVVLLLKSLGIHDLMHFDF
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 LDPPPYETLLLALEQLYALGALNHLGELTTSGRKMAELPVDPMLSKMILASEKYSCSEEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LDPPPYETLLLALEQLYALGALNHLGELTTSGRKMAELPVDPMLSKMILASEKYSCSEEI
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 LTVAAMLSVNNSIFYRPKDKVVHADNARVNFFLPGGDHLVLLNVYTQWAESGYSSQWCYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LTVAAMLSVNNSIFYRPKDKVVHADNARVNFFLPGGDHLVLLNVYTQWAESGYSSQWCYE
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 NFVQFRSMRRARDVREQLEGLLERVEVGLSSCQGDYIRVRKAITAGYFYHTARLTRSGYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NFVQFRSMRRARDVREQLEGLLERVEVGLSSCQGDYIRVRKAITAGYFYHTARLTRSGYR
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 TVKQQQTVFIHPNSSLFEQQPRWLLYHELVLTTKEFMRQVLEIESSWLLEVAPHYYKAKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TVKQQQTVFIHPNSSLFEQQPRWLLYHELVLTTKEFMRQVLEIESSWLLEVAPHYYKAKE
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040 
pF1KA0 LEDPHAKKMPKKIGKTREELG
       :::::::::::::::::::::
CCDS46 LEDPHAKKMPKKIGKTREELG
             1030      1040 

>>CCDS11464.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17               (1220 aa)
 initn: 2652 init1: 1960 opt: 2590  Z-score: 1446.2  bits: 279.5 E(32554): 3.1e-74
Smith-Waterman score: 2604; 48.7% identity (75.0% similar) in 855 aa overlap (189-1039:383-1199)

      160       170       180       190        200       210       
pF1KA0 ESEDEWERTERERLQDLEERDAFAERVRQRDKDRTRNVLER-SDKKAYEEAQKRLKMAEE
                                     : .  :. : : :: . .:   :..  :. 
CCDS11 NLVGETNEETSMRNPDRPTHLSLVSAPEVEDDSLERKRLTRISDPEKWE--IKQMIAANV
            360       370       380       390       400         410

       220       230       240       250       260       270       
pF1KA0 DRKAMVPELRKKSRREYLAKREREKLEDLEAELADEEFLFGDVELSRHERQELKYK--RR
         :   :.. ...    : : . :. :::: ::..::  :    :  : .: . ..  . 
CCDS11 LSKEEFPDFDEET--GILPKVDDEEDEDLEIELVEEEPPF----LRGHTKQSMDMSPIKI
              420         430       440           450       460    

         280       290       300       310       320       330     
pF1KA0 VRDLAREYRAAGEQEKLEATNRYHMPKETRGQPARAVDLVEEESGAPGEEQRRWEEARLG
       :..       :. ...  : .: .. .  :           : .. :   ...: .    
CCDS11 VKNPDGSLSQAAMMQSALAKERRELKQAQREA---------EMDSIPMGLNKHWVDPLPD
          470       480       490                500       510     

         340       350       360       370       380       390     
pF1KA0 AASLKFGARDAASQEPKYQLVLEEEETIEFVRATQLQGDEEPSAPPTSTQAQQKESIQAV
       :     : . ::...   ..     . :   .   . :..      .:   . . ::   
CCDS11 AE----GRQIAANMRGIGMM----PNDIPEWKKHAFGGNK------ASYGKKTQMSILEQ
             520       530           540             550       560 

         400       410       420       430       440       450     
pF1KA0 RRSLPVFPFREELLAAIANHQVLIIEGETGSGKTTQIPQYLFEEGYTNKGMKIACTQPRR
       :.:::.. ..:.:. :. ..:.::. ::::::::::: ::: : :::..: ::.::::::
CCDS11 RESLPIYKLKEQLVQAVHDNQILIVIGETGSGKTTQITQYLAEAGYTSRG-KIGCTQPRR
             570       580       590       600       610        620

         460       470       480       490       500       510     
pF1KA0 VAAMSVAARVAREMGVKLGNEVGYSIRFEDCTSERTVLRYMTDGMLLREFLSEPDLASYS
       ::::::: ::..:.:  ::.::::.:::::::: .::..:::::::::: : .:::..:.
CCDS11 VAAMSVAKRVSEEFGCCLGQEVGYTIRFEDCTSPETVIKYMTDGMLLRECLIDPDLTQYA
              630       640       650       660       670       680

         520       530       540       550       560       570     
pF1KA0 VVMVDEAHERTLHTDILFGLIKDVARFRPELKVLVASATMDTARFSTFFDDAPVFRIPGR
       ..:.:::::::.:::.::::.: ... : ..:..:.:::.:...:: .: .::.: ::::
CCDS11 IIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKKTVQKRQDMKLIVTSATLDAVKFSQYFYEAPIFTIPGR
              690       700       710       720       730       740

         580       590       600       610       620       630     
pF1KA0 RFPVDIFYTKAPEADYLEACVVSVLQIHVTQPPGDILVFLTGQEEIEAACEMLQDRCRRL
        .::.:.::: ::.:::.: ...:.:::.:.:::::::::::::::..:::.: .: . :
CCDS11 TYPVEILYTKEPETDYLDASLITVMQIHLTEPPGDILVFLTGQEEIDTACEILYERMKSL
              750       760       770       780       790       800

         640       650       660       670       680       690     
pF1KA0 GSKIRELLVLPIYANLPSDMQARIFQPTPPGARKVVVATNIAETSLTIEGIIYVLDPGFC
       :  . ::..::.:. :::.::.:::.:.:::.::::.:::::::::::.:: ::.:::: 
CCDS11 GPDVPELIILPVYSALPSEMQTRIFDPAPPGSRKVVIATNIAETSLTIDGIYYVVDPGFV
              810       820       830       840       850       860

         700       710       720       730       740       750     
pF1KA0 KQKSYNPRTGMESLTVTPCSKASANQRAGRAGRVAAGKCFRLYTAWAYQHELEETTVPEI
       ::: :: .::...:.::: :.:.:.::::::::.. :::.::::  ::. :.  :.::::
CCDS11 KQKVYNSKTGIDQLVVTPISQAQAKQRAGRAGRTGPGKCYRLYTERAYRDEMLTTNVPEI
              870       880       890       900       910       920

         760       770       780       790       800       810     
pF1KA0 QRTSLGNVVLLLKSLGIHDLMHFDFLDPPPYETLLLALEQLYALGALNHLGELTTSGRKM
       :::.:...:: ::..::.::. :::.: ::.:::. :.::::.::::.  : ::  ::.:
CCDS11 QRTNLASTVLSLKAMGINDLLSFDFMDAPPMETLITAMEQLYTLGALDDEGLLTRLGRRM
              930       940       950       960       970       980

         820       830       840       850       860       870     
pF1KA0 AELPVDPMLSKMILASEKYSCSEEILTVAAMLSVNNSIFYRPKDKVVHADNARVNFFLPG
       ::.:..::: ::.. : . .::::.::...::::.: .::::::: . ::. ...:    
CCDS11 AEFPLEPMLCKMLIMSVHLGCSEEMLTIVSMLSVQN-VFYRPKDKQALADQKKAKFHQTE
              990      1000      1010       1020      1030         

         880       890       900       910       920       930     
pF1KA0 GDHLVLLNVYTQWAESGYSSQWCYENFVQFRSMRRARDVREQLEGLLERVEVGLSSCQGD
       ::::.:: ::..: .. .:. ::::::.: ::.:::.:.:.:. :...: .. . ::  .
CCDS11 GDHLTLLAVYNSWKNNKFSNPWCYENFIQARSLRRAQDIRKQMLGIMDRHKLDVVSCGKS
    1040      1050      1060      1070      1080      1090         

         940       950        960       970       980       990    
pF1KA0 YIRVRKAITAGYFYHTARLT-RSGYRTVKQQQTVFIHPNSSLFEQQPRWLLYHELVLTTK
        .::.::: .:.: ..:.   . ::::. .::.:.:::.:.::..::.:..:::::::::
CCDS11 TVRVQKAICSGFFRNAAKKDPQEGYRTLIDQQVVYIHPSSALFNRQPEWVVYHELVLTTK
    1100      1110      1120      1130      1140      1150         

         1000      1010      1020      1030      1040              
pF1KA0 EFMRQVLEIESSWLLEVAPHYYKAKELEDPHAKKMPKKIGKTREELG             
       :.::.:  :.  ::.: :: ..:..   ::   :. :.  . : :               
CCDS11 EYMREVTTIDPRWLVEFAPAFFKVS---DP--TKLSKQKKQQRLEPLYNRYEEPNAWRIS
    1160      1170      1180           1190      1200      1210    

CCDS11 RAFRRR
         1220

>>CCDS77040.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17               (1181 aa)
 initn: 2099 init1: 1799 opt: 2422  Z-score: 1353.9  bits: 262.3 E(32554): 4.3e-69
Smith-Waterman score: 2436; 48.8% identity (75.3% similar) in 797 aa overlap (189-981:383-1146)

      160       170       180       190        200       210       
pF1KA0 ESEDEWERTERERLQDLEERDAFAERVRQRDKDRTRNVLER-SDKKAYEEAQKRLKMAEE
                                     : .  :. : : :: . .:   :..  :. 
CCDS77 NLVGETNEETSMRNPDRPTHLSLVSAPEVEDDSLERKRLTRISDPEKWE--IKQMIAANV
            360       370       380       390       400         410

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pF1KA0 DRKAMVPELRKKSRREYLAKREREKLEDLEAELADEEFLFGDVELSRHERQELKYK--RR
         :   :.. ...    : : . :. :::: ::..::  :    :  : .: . ..  . 
CCDS77 LSKEEFPDFDEETG--ILPKVDDEEDEDLEIELVEEEPPF----LRGHTKQSMDMSPIKI
              420         430       440           450       460    

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pF1KA0 VRDLAREYRAAGEQEKLEATNRYHMPKETRGQPARAVDLVEEESGAPGEEQRRWEEARLG
       :..       :. ...  : .: .. .  :           : .. :   ...: .    
CCDS77 VKNPDGSLSQAAMMQSALAKERRELKQAQREA---------EMDSIPMGLNKHWVDPLPD
          470       480       490                500       510     

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pF1KA0 AASLKFGARDAASQEPKYQLVLEEEETIEFVRATQLQGDEEPSAPPTSTQAQQKESIQAV
       :     : . ::...   ..     . :   .   . :..      .:   . . ::   
CCDS77 AE----GRQIAANMRGIGMM----PNDIPEWKKHAFGGNK------ASYGKKTQMSILEQ
             520       530           540             550       560 

         400       410       420       430       440       450     
pF1KA0 RRSLPVFPFREELLAAIANHQVLIIEGETGSGKTTQIPQYLFEEGYTNKGMKIACTQPRR
       :.:::.. ..:.:. :. ..:.::. ::::::::::: ::: : :::..: ::.::::::
CCDS77 RESLPIYKLKEQLVQAVHDNQILIVIGETGSGKTTQITQYLAEAGYTSRG-KIGCTQPRR
             570       580       590       600       610        620

         460       470       480       490       500       510     
pF1KA0 VAAMSVAARVAREMGVKLGNEVGYSIRFEDCTSERTVLRYMTDGMLLREFLSEPDLASYS
       ::::::: ::..:.:  ::.::::.:::::::: .::..:::::::::: : .:::..:.
CCDS77 VAAMSVAKRVSEEFGCCLGQEVGYTIRFEDCTSPETVIKYMTDGMLLRECLIDPDLTQYA
              630       640       650       660       670       680

         520       530       540       550       560       570     
pF1KA0 VVMVDEAHERTLHTDILFGLIKDVARFRPELKVLVASATMDTARFSTFFDDAPVFRIPGR
       ..:.:::::::.:::.::::.: ... : ..:..:.:::.:...:: .: .::.: ::::
CCDS77 IIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKKTVQKRQDMKLIVTSATLDAVKFSQYFYEAPIFTIPGR
              690       700       710       720       730       740

         580       590       600       610       620       630     
pF1KA0 RFPVDIFYTKAPEADYLEACVVSVLQIHVTQPPGDILVFLTGQEEIEAACEMLQDRCRRL
        .::.:.::: ::.:::.: ...:.:::.:.:::::::::::::::..:::.: .: . :
CCDS77 TYPVEILYTKEPETDYLDASLITVMQIHLTEPPGDILVFLTGQEEIDTACEILYERMKSL
              750       760       770       780       790       800

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pF1KA0 GSKIRELLVLPIYANLPSDMQARIFQPTPPGARKVVVATNIAETSLTIEGIIYVLDPGFC
       :  . ::..::.:. :::.::.:::.:.:::.::::.:::::::::::.:: ::.:::: 
CCDS77 GPDVPELIILPVYSALPSEMQTRIFDPAPPGSRKVVIATNIAETSLTIDGIYYVVDPGFV
              810       820       830       840       850       860

         700       710       720       730       740       750     
pF1KA0 KQKSYNPRTGMESLTVTPCSKASANQRAGRAGRVAAGKCFRLYTAWAYQHELEETTVPEI
       ::: :: .::...:.::: :.:.:.::::::::.. :::.::::  ::. :.  :.::::
CCDS77 KQKVYNSKTGIDQLVVTPISQAQAKQRAGRAGRTGPGKCYRLYTERAYRDEMLTTNVPEI
              870       880       890       900       910       920

         760       770       780       790       800       810     
pF1KA0 QRTSLGNVVLLLKSLGIHDLMHFDFLDPPPYETLLLALEQLYALGALNHLGELTTSGRKM
       :::.:...:: ::..::.::. :::.: ::.:::. :.::::.::::.  : ::  ::.:
CCDS77 QRTNLASTVLSLKAMGINDLLSFDFMDAPPMETLITAMEQLYTLGALDDEGLLTRLGRRM
              930       940       950       960       970       980

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pF1KA0 AELPVDPMLSKMILASEKYSCSEEILTVAAMLSVNNSIFYRPKDKVVHADNARVNFFLPG
       ::.:..::: ::.. : . .::::.::...::::.: .::::::: . ::. ...:    
CCDS77 AEFPLEPMLCKMLIMSVHLGCSEEMLTIVSMLSVQN-VFYRPKDKQALADQKKAKFHQTE
              990      1000      1010       1020      1030         

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pF1KA0 GDHLVLLNVYTQWAESGYSSQWCYENFVQFRSMRRARDVREQLEGLLERVEVGLSSCQGD
       ::::.:: ::..: .. .:. ::::::.: ::.:::.:.:.:. :...: .. . ::  .
CCDS77 GDHLTLLAVYNSWKNNKFSNPWCYENFIQARSLRRAQDIRKQMLGIMDRHKLDVVSCGKS
    1040      1050      1060      1070      1080      1090         

         940       950        960       970       980       990    
pF1KA0 YIRVRKAITAGYFYHTARLT-RSGYRTVKQQQTVFIHPNSSLFEQQPRWLLYHELVLTTK
        .::.::: .:.: ..:.   . ::::. .::.:.:::.:.::..::             
CCDS77 TVRVQKAICSGFFRNAAKKDPQEGYRTLIDQQVVYIHPSSALFNRQPECPKHFLPVVAVA
    1100      1110      1120      1130      1140      1150         

         1000      1010      1020      1030      1040 
pF1KA0 EFMRQVLEIESSWLLEVAPHYYKAKELEDPHAKKMPKKIGKTREELG
                                                      
CCDS77 VSLEQCLSKFEDLNKELGLVTC                         
    1160      1170      1180                          

>>CCDS10907.1 DHX38 gene_id:9785|Hs108|chr16              (1227 aa)
 initn: 2308 init1: 871 opt: 2331  Z-score: 1303.5  bits: 253.1 E(32554): 2.7e-66
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              50        60        70        80              90     
pF1KA0 EFVQRLRDTDTLDLSGPARDFALRLWNKVPRKAVVEKPA-----RAAEREAR-ALLEKNR
                                     :..  :.:.     : .::  : .  ...:
CCDS10 EPESPRHRPKDAATPSRSTWEEEDSGYGSSRRSQWESPSPTPSYRDSERSHRLSTRDRDR
         200       210       220       230       240       250     

         100       110       120       130       140       150     
pF1KA0 SYRLLEDSEESSEETVSRAGSSLQKKRKKRKHLRKKREEEEEEEASEKGKKKTGGSKQQT
       : :    .. :..  .   . . ..    :.:: .       . .  .:... :    . 
CCDS10 SVR----GKYSDDTPLPTPSYKYNEWADDRRHLGST-----PRLSRGRGRREEGEEGISF
             260       270       280            290       300      

         160       170       180       190       200       210     
pF1KA0 EKPESEDEWERTERERLQDLEERDAFAERVRQRDKDRTRNVLERSDKKAYEEAQKRLKMA
       .  : ...::  .:.  .:    :   .. ..     ... ..: ... ... :::.  .
CCDS10 DTEEERQQWEDDQRQADRDWYMMDEGYDEFHNPLAYSSEDYVRRREQHLHKQKQKRI--S
        310       320       330       340       350       360      

         220       230         240       250                 260   
pF1KA0 EEDRKAMVPELRKKSRREYLAK--REREKLEDLEAELADE----------EFLFGDVELS
        . :.    . : .. :   .   .. :  ::.: . : .           :: : . ..
CCDS10 AQRRQINEDNERWETNRMLTSGVVHRLEVDEDFEEDNAAKVHLMVHNLVPPFLDGRIVFT
          370       380       390       400       410       420    

           270       280       290       300       310       320   
pF1KA0 RHERQELKYKRRVRDLAREYRAAGEQEKLEATNRYHMPKETRGQPARAVDLVEEESGAPG
       .. .  .  :  . :::   :  : :     : : :  .. : .                
CCDS10 KQPEPVIPVKDATSDLAIIARK-GSQ-----TVRKHREQKERKKA---------------
          430       440             450       460                  

           330       340       350       360       370       380   
pF1KA0 EEQRRWEEARLGAASLKFGARDAASQEPKYQLVLEEEETIEFVRATQLQGDEEPSAPPTS
        ....::      :. :.:   ....: . . .. :.  ... :. :  .:.      .:
CCDS10 -QHKHWE-----LAGTKLGDIMGVKKEEEPDKAVTEDGKVDY-RTEQKFADHMKRKSEAS
                 470       480       490        500       510      

           390       400       410       420       430       440   
pF1KA0 TQAQQKESIQAVRRSLPVFPFREELLAAIANHQVLIIEGETGSGKTTQIPQYLFEEGYTN
       ..  .:.::   :. ::.:  ..:::. : .....:. ::::::::::. ::: :.:::.
CCDS10 SEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDNSIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTD
        520       530       540       550       560       570      

           450       460       470       480       490       500   
pF1KA0 KGMKIACTQPRRVAAMSVAARVAREMGVKLGNEVGYSIRFEDCTSERTVLRYMTDGMLLR
        :: :.::::::::::::: ::..::: .::.::::.::::::::: :...:::::.:::
CCDS10 YGM-IGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGNLGEEVGYAIRFEDCTSENTLIKYMTDGILLR
         580       590       600       610       620       630     

           510       520       530       540       550       560   
pF1KA0 EFLSEPDLASYSVVMVDEAHERTLHTDILFGLIKDVARFRPELKVLVASATMDTARFSTF
       : : : ::  ::....::::::.:.::.::::...:.  : .::..:.:::::. .:..:
CCDS10 ESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLFGLLREVVARRSDLKLIVTSATMDAEKFAAF
         640       650       660       670       680       690     

           570       580       590       600       610       620   
pF1KA0 FDDAPVFRIPGRRFPVDIFYTKAPEADYLEACVVSVLQIHVTQPPGDILVFLTGQEEIEA
       : ..:.:.:::: :::::...:.:. ::.:: : . ::.:..  :::::.:. :::.::.
CCDS10 FGNVPIFHIPGRTFPVDILFSKTPQEDYVEAAVKQSLQVHLSGAPGDILIFMPGQEDIEV
         700       710       720       730       740       750     

           630       640       650       660       670       680   
pF1KA0 ACEMLQDRCRRLGSKIRELLVLPIYANLPSDMQARIFQPTPPGARKVVVATNIAETSLTI
       . ... .. ..:  .   : :::::..::::.::.::: .: :.:: .:::::::::::.
CCDS10 TSDQIVEHLEEL-ENAPALAVLPIYSQLPSDLQAKIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSLTV
         760        770       780       790       800       810    

           690       700       710       720       730       740   
pF1KA0 EGIIYVLDPGFCKQKSYNPRTGMESLTVTPCSKASANQRAGRAGRVAAGKCFRLYTAWAY
       .::..:.: :.:: : .::: ::..: . : :.:.::::.:::::.. :.::::::  ::
CCDS10 DGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDALQIYPISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAY
          820       830       840       850       860       870    

           750       760       770       780       790       800   
pF1KA0 QHELEETTVPEIQRTSLGNVVLLLKSLGIHDLMHFDFLDPPPYETLLLALEQLYALGALN
       ..::  :::::::::.:.::::::::::..::..: :.:::: ...: .. ::. ::::.
CCDS10 KNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLKSLGVQDLLQFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGALD
          880       890       900       910       920       930    

           810       820       830       840       850       860   
pF1KA0 HLGELTTSGRKMAELPVDPMLSKMILASEKYSCSEEILTVAAMLSVNNSIFYRPKDKVVH
       . : ::..:: :.:.:.:: ::::...:  ..:: ::: ...::::  .:::::: .  .
CCDS10 NTGGLTSTGRLMVEFPLDPALSKMLIVSCDMGCSSEILLIVSMLSVP-AIFYRPKGREEE
          940       950       960       970       980        990   

           870       880       890       900       910       920   
pF1KA0 ADNARVNFFLPGGDHLVLLNVYTQWAESGYSSQWCYENFVQFRSMRRARDVREQLEGLLE
       .:. : .: .: .:::. :::: :: ...::. :: ..:.. ..::..:.:: ::. .. 
CCDS10 SDQIREKFAVPESDHLTYLNVYLQWKNNNYSTIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMV
          1000      1010      1020      1030      1040      1050   

           930       940       950        960       970         980
pF1KA0 RVEVGLSSCQGDYIRVRKAITAGYFYHTARLTRSG-YRTVKQQQTVFIHPNSSLFEQ--Q
       . ...:.::  :.  ::: : :.::...:.:   : : ...  .   .::.:::: .   
CCDS10 QQRMSLASCGTDWDIVRKCICAAYFHQAAKLKGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYT
          1060      1070      1080      1090      1100      1110   

              990      1000      1010      1020      1030      1040
pF1KA0 PRWLLYHELVLTTKEFMRQVLEIESSWLLEVAPHYYKAKELEDPHAKKMPKKIGKTREEL
       : ...:::::.::::.:. :  ... :: :..: .:..:.                    
CCDS10 PDYIVYHELVMTTKEYMQCVTAVDGEWLAELGPMFYSVKQAGKSRQENRRRAKEEASAME
          1120      1130      1140      1150      1160      1170   

                                                             
pF1KA0 G                                                     
                                                             
CCDS10 EEMALAEEQLRARRQEQEKRSPLGSVRSTKIYTPGRKEQGEPMTPRRTPARFGL
          1180      1190      1200      1210      1220       

>>CCDS33966.1 DHX15 gene_id:1665|Hs108|chr4               (795 aa)
 initn: 2028 init1: 757 opt: 2076  Z-score: 1165.4  bits: 226.9 E(32554): 1.4e-58
Smith-Waterman score: 2204; 52.3% identity (77.6% similar) in 652 aa overlap (396-1033:134-783)

         370       380       390       400       410       420     
pF1KA0 VRATQLQGDEEPSAPPTSTQAQQKESIQAVRRSLPVFPFREELLAAIANHQVLIIEGETG
                                     : .:::. .....   .. :: ... ::::
CCDS33 GHAGHTSLPQCINPFTNLPHTPRYYDILKKRLQLPVWEYKDRFTDILVRHQSFVLVGETG
           110       120       130       140       150       160   

         430       440         450       460       470       480   
pF1KA0 SGKTTQIPQYLFEEGYTNKGMK--IACTQPRRVAAMSVAARVAREMGVKLGNEVGYSIRF
       :::::::::.  :   .  : :  .:::::::::::::: ::: :: : ::.::::::::
CCDS33 SGKTTQIPQWCVEYMRSLPGPKRGVACTQPRRVAAMSVAQRVADEMDVMLGQEVGYSIRF
           170       180       190       200       210       220   

           490       500       510       520       530       540   
pF1KA0 EDCTSERTVLRYMTDGMLLREFLSEPDLASYSVVMVDEAHERTLHTDILFGLIKDVARFR
       :::.: .:.:.:::::::::: ...: :  :.:...:::::::: ::::.:..:.:.: :
CCDS33 EDCSSAKTILKYMTDGMLLREAMNDPLLERYGVIILDEAHERTLATDILMGVLKEVVRQR
           230       240       250       260       270       280   

           550       560       570       580       590       600   
pF1KA0 PELKVLVASATMDTARFSTFFDDAPVFRIPGRRFPVDIFYTKAPEADYLEACVVSVLQIH
        .:::.: :::.:...:. .::. :.. ::::  ::.::::  :: ::::: . .:.:::
CCDS33 SDLKVIVMSATLDAGKFQIYFDNCPLLTIPGRTHPVEIFYTPEPERDYLEAAIRTVIQIH
           290       300       310       320       330       340   

            610       620       630       640       650       660  
pF1KA0 VTQPP-GDILVFLTGQEEIEAACEMLQDRCRRLGSKIRELLVLPIYANLPSDMQARIFQP
       . .   ::.:.::::::::. ::. .. .   :: .. .. ..:.:..:: ..: :::.:
CCDS33 MCEEEEGDLLLFLTGQEEIDEACKRIKREVDDLGPEVGDIKIIPLYSTLPPQQQQRIFEP
           350       360       370       380       390       400   

                  670       680       690       700       710      
pF1KA0 TPP----GA--RKVVVATNIAETSLTIEGIIYVLDPGFCKQKSYNPRTGMESLTVTPCSK
        ::    ::  :::::.::::::::::.:...:.:::: ::: ::::  .::: ::  ::
CCDS33 PPPKKQNGAIGRKVVVSTNIAETSLTIDGVVFVIDPGFAKQKVYNPRIRVESLLVTAISK
           410       420       430       440       450       460   

        720       730       740       750       760       770      
pF1KA0 ASANQRAGRAGRVAAGKCFRLYTAWAYQHELEETTVPEIQRTSLGNVVLLLKSLGIHDLM
       :::.::::::::.  ::::::::  ::. :....: ::: :..::.::: ::.::: ::.
CCDS33 ASAQQRAGRAGRTRPGKCFRLYTEKAYKTEMQDNTYPEILRSNLGSVVLQLKKLGIDDLV
           470       480       490       500       510       520   

        780       790       800       810       820       830      
pF1KA0 HFDFLDPPPYETLLLALEQLYALGALNHLGELTTSGRKMAELPVDPMLSKMILASEKYSC
       ::::.:::  :::. ::: :  :.:::  :.::  :  :::.:.::.:.::..::  :.:
CCDS33 HFDFMDPPAPETLMRALELLNYLAALNDDGDLTELGSMMAEFPLDPQLAKMVIASCDYNC
           530       540       550       560       570       580   

        840       850       860       870       880       890      
pF1KA0 SEEILTVAAMLSVNNSIFYRPKDKVVHADNARVNFFLPGGDHLVLLNVYTQWAESGYSSQ
       :.:.:...::::: .  : :: .    ::.:.. :    ::::.:::::  . ..  : :
CCDS33 SNEVLSITAMLSVPQC-FVRPTEAKKAADEAKMRFAHIDGDHLTLLNVYHAFKQNHESVQ
           590        600       610       620       630       640  

        900       910       920       930           940       950  
pF1KA0 WCYENFVQFRSMRRARDVREQLEGLLERVEVGLSSC----QGDYIRVRKAITAGYFYHTA
       :::.::...::.  : .::.::  ...: ..   :     .  :: .:::...:::...:
CCDS33 WCYDNFINYRSLMSADNVRQQLSRIMDRFNLPRRSTDFTSRDYYINIRKALVTGYFMQVA
            650       660       670       680       690       700  

             960       970       980       990      1000      1010 
pF1KA0 RLTRSG-YRTVKQQQTVFIHPNSSLFEQQPRWLLYHELVLTTKEFMRQVLEIESSWLLEV
       .: :.: : :::..:.: .:: :......:.:.::.:.:::::...:   .:.  ::...
CCDS33 HLERTGHYLTVKDNQVVQLHP-STVLDHKPEWVLYNEFVLTTKNYIRTCTDIKPEWLVKI
            710       720        730       740       750       760 

            1020      1030      1040     
pF1KA0 APHYYKAKELEDPHAKKMPKKIGKTREELG    
       ::.::  ... . .::..  .:            
CCDS33 APQYYDMSNFPQCEAKRQLDRIIAKLQSKEYSQY
             770       780       790     

>>CCDS11072.1 DHX33 gene_id:56919|Hs108|chr17             (707 aa)
 initn: 1210 init1: 455 opt: 1852  Z-score: 1042.6  bits: 204.0 E(32554): 9.4e-52
Smith-Waterman score: 1852; 46.0% identity (73.0% similar) in 655 aa overlap (375-1019:52-701)

          350       360       370       380       390       400    
pF1KA0 DAASQEPKYQLVLEEEETIEFVRATQLQGDEEPSAPPTSTQAQQKESIQAVRRSLPVFPF
                                     . : : :...     :...  :::::.:  
CCDS11 RAGSFPPGRQVVMLLTAGSGGRGGGGGRRQQPPLAQPSAS--PYPEAVELQRRSLPIFQA
              30        40        50        60          70         

          410       420       430       440       450       460    
pF1KA0 REELLAAIANHQVLIIEGETGSGKTTQIPQYLFEEGYTNKGMKIACTQPRRVAAMSVAAR
       : .::: . : .  .. :::::::::::::::.: : . .:. :: ::::::::.:.:.:
CCDS11 RGQLLAQLRNLDNAVLIGETGSGKTTQIPQYLYEGGISRQGI-IAVTQPRRVAAISLATR
      80        90       100       110       120        130        

          470       480       490       500       510       520    
pF1KA0 VAREMGVKLGNEVGYSIRFEDCTSERTVLRYMTDGMLLREFLSEPDLASYSVVMVDEAHE
       :. :  ..::. :::..::.: ::: : ....:::::::: .:.  : .:: :..:::::
CCDS11 VSDEKRTELGKLVGYTVRFDDVTSEDTRIKFLTDGMLLREAISDSLLRKYSCVILDEAHE
      140       150       160       170       180       190        

          530       540            550       560       570         
pF1KA0 RTLHTDILFGLIKDVARFRPEL-----KVLVASATMDTARFSTFFDDAPVFRIPGRRFPV
       ::.:::.:::..: . . : ::     ::.: :::::.  :: .:. :::. . ::. :.
CCDS11 RTIHTDVLFGVVKAAQKRRKELGKLPLKVIVMSATMDVDLFSQYFNGAPVLYLEGRQHPI
      200       210       220       230       240       250        

     580       590       600        610       620       630        
pF1KA0 DIFYTKAPEADYLEACVVSVLQIHVTQPPG-DILVFLTGQEEIEAACEMLQDRCRRLGSK
       ..:::: :. :::.: .:::.:::   : . ::::::::::::::  .  .:  ..: . 
CCDS11 QVFYTKQPQNDYLHAALVSVFQIHQEAPSSQDILVFLTGQEEIEAMSKTCRDIAKHLPDG
      260       270       280       290       300       310        

      640       650       660       670       680       690        
pF1KA0 IRELLVLPIYANLPSDMQARIFQPTPPGARKVVVATNIAETSLTIEGIIYVLDPGFCKQK
          .::::.::.::  .: :.:: .: : :::...:::::::.:: :: ::.: :. : :
CCDS11 CPAMLVLPLYASLPYAQQLRVFQGAPKGYRKVIISTNIAETSITITGIKYVVDTGMVKAK
      320       330       340       350       360       370        

      700       710       720       730       740       750        
pF1KA0 SYNPRTGMESLTVTPCSKASANQRAGRAGRVAAGKCFRLYTAWAYQHELEETTVPEIQRT
       .::: .:.: :.:   ::..: ::.:::::  .: :.::::   .. .... ::::::: 
CCDS11 KYNPDSGLEVLAVQRVSKTQAWQRTGRAGREDSGICYRLYTEDEFE-KFDKMTVPEIQRC
      380       390       400       410       420        430       

      760       770       780       790       800          810     
pF1KA0 SLGNVVLLLKSLGIHDLMHFDFLDPPPYETLLLALEQLYALGALNHLGE---LTTSGRKM
       .:..:.: : .. . ... :::.. :  . .  :. ::  ::::.:  .   ::  ::::
CCDS11 NLASVMLQLLAMKVPNVLTFDFMSKPSPDHIQAAIAQLDLLGALEHKDDQLTLTPMGRKM
       440       450       460       470       480       490       

         820       830       840       850       860       870     
pF1KA0 AELPVDPMLSKMILASEKYSCSEEILTVAAMLSVNNSIFYRPKDKVVHADNARVNFFLPG
       : .:..: ..: :: : :. :.:::::....:::. :... : ..  .....: .:.   
CCDS11 AAFPLEPKFAKTILMSPKFHCTEEILTIVSLLSVD-SVLHNPPSRREEVQGVRKKFISSE
       500       510       520       530        540       550      

         880       890       900       910       920       930     
pF1KA0 GDHLVLLNVYTQWAESGYSSQWCYENFVQFRSMRRARDVREQLEGLLERVEVGLSSCQGD
       :::..:::.:  . . : ...:: ::::. ..:  . .:: ::. .  .. . ..: .::
CCDS11 GDHMTLLNIYRTFKNLGGNKDWCKENFVNSKNMTLVAEVRAQLRDICLKMSMPIASSRGD
        560       570       580       590       600       610      

         940       950        960       970       980       990    
pF1KA0 YIRVRKAITAGYFYHTARLTRSG-YRTVKQQQTVFIHPNSSLFEQQPRWLLYHELVLTTK
          ::. .. . :. ::.:  .: : :.  .: : :::.: ::. .:  ..: ::. :.:
CCDS11 VESVRRCLAHSLFMSTAELQPDGTYATTDTHQPVAIHPSSVLFHCKPACVVYTELLYTNK
        620       630       640       650       660       670      

         1000      1010      1020      1030      1040 
pF1KA0 EFMRQVLEIESSWLLEVAPHYYKAKELEDPHAKKMPKKIGKTREELG
        .::..  :...:: :.::.:.. :                      
CCDS11 CYMRDLCVIDAQWLYEAAPEYFRRKLRTARN                
        680       690       700                       

>>CCDS54463.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20             (672 aa)
 initn: 1760 init1: 511 opt: 1426  Z-score: 808.2  bits: 160.5 E(32554): 1.1e-38
Smith-Waterman score: 1868; 47.8% identity (77.4% similar) in 601 aa overlap (434-1017:58-655)

           410       420       430       440       450       460   
pF1KA0 FREELLAAIANHQVLIIEGETGSGKTTQIPQYLFEEGYTNKGMKIACTQPRRVAAMSVAA
                                     .:: : :.: .:  .. ::::::::..::.
CCDS54 SLAENSGTTVVYNPYAALSIEQQRQKLPVFKYLAEAGWTAEGRVVGVTQPRRVAAVTVAG
        30        40        50        60        70        80       

           470       480        490       500       510       520  
pF1KA0 RVAREMGVKLGNEVGYSIRFEDCTSE-RTVLRYMTDGMLLREFLSEPDLASYSVVMVDEA
       :::.: :. ::.:::: :::.:::..  : ....:::::.::.. .: :..:::.:.:::
CCDS54 RVAEERGAVLGHEVGYCIRFDDCTDQLATRIKFLTDGMLVREMMVDPLLTKYSVIMLDEA
        90       100       110       120       130       140       

            530       540       550       560                 570  
pF1KA0 HERTLHTDILFGLIKDVARFRPELKVLVASATMDTARFSTFF----------DDAPVFRI
       :::::.::: .::.: . . : .:...:::::.:. .:  ::          :   .. .
CCDS54 HERTLYTDIAIGLLKKIQKKRGDLRLIVASATLDADKFRDFFNQNETSDPARDTCVILTV
       150       160       170       180       190       200       

            580       590       600       610       620       630  
pF1KA0 PGRRFPVDIFYTKAPEADYLEACVVSVLQIHVTQPPGDILVFLTGQEEIEAACEMLQDRC
        :: ::::::: ..:  ::... : .:..:: :.  ::.:.:::::::.:..  :: .. 
CCDS54 EGRTFPVDIFYLQSPVPDYIKSTVETVVKIHQTEGDGDVLAFLTGQEEVETVVSMLIEQA
       210       220       230       240       250       260       

               640       650       660       670       680         
pF1KA0 R---RLGSKIRELLVLPIYANLPSDMQARIFQPTPPGARKVVVATNIAETSLTIEGIIYV
       :   : : : :.: :::.::.:::  : ..:. .  ..:::.::::.::::.:: ::.::
CCDS54 RALARTGMK-RHLRVLPMYAGLPSFEQMKVFERVSRSVRKVIVATNVAETSITISGIVYV
       270        280       290       300       310       320      

     690       700       710       720       730       740         
pF1KA0 LDPGFCKQKSYNPRTGMESLTVTPCSKASANQRAGRAGRVAAGKCFRLYTAWAYQHELEE
       .: :: : ..:::::..: :.:.: :.:::::::::.::  .:::.::::  :.. .: .
CCDS54 IDCGFVKLRAYNPRTAIECLVVVPVSQASANQRAGRGGRSRSGKCYRLYTEEAFD-KLPQ
        330       340       350       360       370       380      

     750       760       770       780       790       800         
pF1KA0 TTVPEIQRTSLGNVVLLLKSLGIHDLMHFDFLDPPPYETLLLALEQLYALGALNHLGELT
       .::::.::..:. :.: ::.::: ....: :..::: .... ::: :::::.:..  .::
CCDS54 STVPEMQRSNLAPVILQLKALGIDNVLRFHFMSPPPAQSMVQALELLYALGGLDKDCRLT
         390       400       410       420       430       440     

     810        820       830       840       850       860        
pF1KA0 TS-GRKMAELPVDPMLSKMILASEKYSCSEEILTVAAMLSVNNSIFYRPKDKVVHADNAR
          : ..::.:..::..::.: : ...::.:::..:::....: ::  : ..  ::  ..
CCDS54 EPLGMRIAEFPLNPMFAKMLLESGNFGCSQEILSIAAMMQIQN-IFVVPPNQKSHAIRVH
         450       460       470       480        490       500    

      870       880       890       900       910       920        
pF1KA0 VNFFLPGGDHLVLLNVYTQWAESGYSSQWCYENFVQFRSMRRARDVREQLEGLLERVEVG
        .: .  ::::..::.:  . . . .:.:: :.:...... ::  :::::. :: . .: 
CCDS54 RKFAVEEGDHLTMLNIYEAFIKHNKDSKWCQEHFLNYKGLVRAATVREQLKKLLVKFQVP
          510       520       530       540       550       560    

      930       940       950        960       970        980      
pF1KA0 LSSCQGDYIRVRKAITAGYFYHTARLTRSG-YRTVKQQQTVFIHPNSSLF-EQQPRWLLY
        .: .::   : . :..:.: ..::.  .: :::..... . ::: : :. :. :::..:
CCDS54 RKSSEGDPDLVLRCIVSGFFANAARFHSTGAYRTIRDDHELHIHPASVLYAEKPPRWVIY
          570       580       590       600       610       620    

        990      1000      1010      1020      1030      1040 
pF1KA0 HELVLTTKEFMRQVLEIESSWLLEVAPHYYKAKELEDPHAKKMPKKIGKTREELG
       .:.. :.: .::.:  :::.::::.:::.:.                        
CCDS54 NEVIQTSKYYMRDVTAIESAWLLELAPHFYQQGTHLSLKAKRAKVQDP       
          630       640       650       660       670         

>>CCDS13310.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20             (703 aa)
 initn: 1882 init1: 511 opt: 1426  Z-score: 808.0  bits: 160.6 E(32554): 1.1e-38
Smith-Waterman score: 2023; 48.3% identity (77.6% similar) in 644 aa overlap (391-1017:46-686)

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 ETIEFVRATQLQGDEEPSAPPTSTQAQQKESIQAVRRSLPVFPFREELLAAIANHQVLII
                                     ::.  :..:::: .:...:  : :.:...:
CCDS13 EGPGVSISEERQSLAENSGTTVVYNPYAALSIEQQRQKLPVFKLRNHILYLIENYQTVVI
          20        30        40        50        60        70     

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 EGETGSGKTTQIPQYLFEEGYTNKGMKIACTQPRRVAAMSVAARVAREMGVKLGNEVGYS
        :::: ::.::::::: : :.: .:  .. ::::::::..::.:::.: :. ::.:::: 
CCDS13 VGETGCGKSTQIPQYLAEAGWTAEGRVVGVTQPRRVAAVTVAGRVAEERGAVLGHEVGYC
          80        90       100       110       120       130     

               490       500       510       520       530         
pF1KA0 IRFEDCTSE-RTVLRYMTDGMLLREFLSEPDLASYSVVMVDEAHERTLHTDILFGLIKDV
       :::.:::..  : ....:::::.::.. .: :..:::.:.::::::::.::: .::.: .
CCDS13 IRFDDCTDQLATRIKFLTDGMLVREMMVDPLLTKYSVIMLDEAHERTLYTDIAIGLLKKI
         140       150       160       170       180       190     

     540       550       560                 570       580         
pF1KA0 ARFRPELKVLVASATMDTARFSTFF----------DDAPVFRIPGRRFPVDIFYTKAPEA
        . : .:...:::::.:. .:  ::          :   .. . :: ::::::: ..:  
CCDS13 QKKRGDLRLIVASATLDADKFRDFFNQNETSDPARDTCVILTVEGRTFPVDIFYLQSPVP
         200       210       220       230       240       250     

     590       600       610       620       630          640      
pF1KA0 DYLEACVVSVLQIHVTQPPGDILVFLTGQEEIEAACEMLQDRCR---RLGSKIRELLVLP
       ::... : .:..:: :.  ::.:.:::::::.:..  :: .. :   : : : :.: :::
CCDS13 DYIKSTVETVVKIHQTEGDGDVLAFLTGQEEVETVVSMLIEQARALARTGMK-RHLRVLP
         260       270       280       290       300        310    

        650       660       670       680       690       700      
pF1KA0 IYANLPSDMQARIFQPTPPGARKVVVATNIAETSLTIEGIIYVLDPGFCKQKSYNPRTGM
       .::.:::  : ..:. .  ..:::.::::.::::.:: ::.::.: :: : ..:::::..
CCDS13 MYAGLPSFEQMKVFERVSRSVRKVIVATNVAETSITISGIVYVIDCGFVKLRAYNPRTAI
          320       330       340       350       360       370    

        710       720       730       740       750       760      
pF1KA0 ESLTVTPCSKASANQRAGRAGRVAAGKCFRLYTAWAYQHELEETTVPEIQRTSLGNVVLL
       : :.:.: :.:::::::::.::  .:::.::::  :.. .: ..::::.::..:. :.: 
CCDS13 ECLVVVPVSQASANQRAGRGGRSRSGKCYRLYTEEAFD-KLPQSTVPEMQRSNLAPVILQ
          380       390       400       410        420       430   

        770       780       790       800       810        820     
pF1KA0 LKSLGIHDLMHFDFLDPPPYETLLLALEQLYALGALNHLGELTTS-GRKMAELPVDPMLS
       ::.::: ....: :..::: .... ::: :::::.:..  .::   : ..::.:..::..
CCDS13 LKALGIDNVLRFHFMSPPPAQSMVQALELLYALGGLDKDCRLTEPLGMRIAEFPLNPMFA
           440       450       460       470       480       490   

         830       840       850       860       870       880     
pF1KA0 KMILASEKYSCSEEILTVAAMLSVNNSIFYRPKDKVVHADNARVNFFLPGGDHLVLLNVY
       ::.: : ...::.:::..:::....: ::  : ..  ::  .. .: .  ::::..::.:
CCDS13 KMLLESGNFGCSQEILSIAAMMQIQN-IFVVPPNQKSHAIRVHRKFAVEEGDHLTMLNIY
           500       510        520       530       540       550  

         890       900       910       920       930       940     
pF1KA0 TQWAESGYSSQWCYENFVQFRSMRRARDVREQLEGLLERVEVGLSSCQGDYIRVRKAITA
         . . . .:.:: :.:...... ::  :::::. :: . .:  .: .::   : . :..
CCDS13 EAFIKHNKDSKWCQEHFLNYKGLVRAATVREQLKKLLVKFQVPRKSSEGDPDLVLRCIVS
            560       570       580       590       600       610  

         950        960       970        980       990      1000   
pF1KA0 GYFYHTARLTRSG-YRTVKQQQTVFIHPNSSLF-EQQPRWLLYHELVLTTKEFMRQVLEI
       :.: ..::.  .: :::..... . ::: : :. :. :::..:.:.. :.: .::.:  :
CCDS13 GFFANAARFHSTGAYRTIRDDHELHIHPASVLYAEKPPRWVIYNEVIQTSKYYMRDVTAI
            620       630       640       650       660       670  

          1010      1020      1030      1040 
pF1KA0 ESSWLLEVAPHYYKAKELEDPHAKKMPKKIGKTREELG
       ::.::::.:::.:.                        
CCDS13 ESAWLLELAPHFYQQGTHLSLKAKRAKVQDP       
            680       690       700          

>>CCDS12700.1 DHX34 gene_id:9704|Hs108|chr19              (1143 aa)
 initn: 1177 init1: 449 opt: 1131  Z-score: 643.0  bits: 130.7 E(32554): 1.7e-29
Smith-Waterman score: 1248; 33.9% identity (61.7% similar) in 741 aa overlap (224-941:4-714)

           200       210       220        230        240       250 
pF1KA0 RNVLERSDKKAYEEAQKRLKMAEEDRKAMVPELRK-KSRREYL-AKREREKLEDLEAELA
                                     :. :. ..::..  :  :.: ::  . .  
CCDS12                            MPPPRTREGRDRRDHHRAPSEEEALEKWDWNCP
                                          10        20        30   

             260       270       280        290       300       310
pF1KA0 DEEFLFGDVELSRHERQELKYKRRVRDLAREYRAAGEQ-EKLEATNRYHMPKETRGQPAR
       . . :. :. .    :.:  : :.  .  ... .  :. ....  .  .  ..  ::: .
CCDS12 ETRRLLEDAFF----REE-DYIRQGSEECQKFWTFFERLQRFQNLKTSRKEEKDPGQPKH
            40             50        60        70        80        

              320       330       340       350       360       370
pF1KA0 AVDLVEEESGAPGEEQRRWEEARLGAASLKFGARDAASQEPKYQLVLEEEETIEFVRATQ
       ..  . .      . . : . . :: :.   :..  . . :        :.. :: ::  
CCDS12 SIPALADLP-RTYDPRYRINLSVLGPATR--GSQGLGRHLPA-------ERVAEFRRALL
       90        100       110         120              130        

              380       390       400       410       420       430
pF1KA0 LQGDEEPSAPPTSTQAQQKESIQAVRRSLPVFPFREELLAAIANHQVLIIEGETGSGKTT
          :   .         :.:     : .::.  . ...: .. .:::... :.:: ::.:
CCDS12 HYLDFGQKQAFGRLAKLQRE-----RAALPIAQYGNRILQTLKEHQVVVVAGDTGCGKST
      140       150            160       170       180       190   

              440       450       460       470       480       490
pF1KA0 QIPQYLFEEGYTNKGMKIACTQPRRVAAMSVAARVAREMGVKLGNEVGYSIRFEDCTSER
       :.::::.  :...    .:::::::.: .:.: ::. :   . :..:::.::::.  :  
CCDS12 QVPQYLLAAGFSH----VACTQPRRIACISLAKRVGFESLSQYGSQVGYQIRFESTRSAA
           200           210       220       230       240         

              500       510       520       530       540       550
pF1KA0 TVLRYMTDGMLLREFLSEPDLASYSVVMVDEAHERTLHTDILFGLIKDVARFRPELKVLV
       : . ..: :.:::..  ::.: .: :..:::.::: ::.:.:.:... .   ::.:::..
CCDS12 TKIVFLTVGLLLRQIQREPSLPQYEVLIVDEVHERHLHNDFLLGVLQRLLPTRPDLKVIL
     250       260       270       280       290       300         

              560       570       580          590           600   
pF1KA0 ASATMDTARFSTFFDDAPVFRIPGRRFPVDIFYTKA---PEADYLEAC----VVSVLQ-I
        :::.. . ::..:..::: ..::: ::. . :      : ..  :       . ::. :
CCDS12 MSATINISLFSSYFSNAPVVQVPGRLFPITVVYQPQEAEPTTSKSEKLDPRPFLRVLESI
     310       320       330       340       350       360         

               610       620       630       640       650         
pF1KA0 HVTQPP---GDILVFLTGQEEIEAACEMLQDRCRRLGSKIRELLVLPIYANLPSDMQARI
           ::   ::.::::.:. :: :. :  :      .:. .. .:::... :    : ..
CCDS12 DHKYPPEERGDLLVFLSGMAEISAVLEAAQTY----ASHTQRWVVLPLHSALSVADQDKV
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       :. .:::.:: ...:::::::.::.:: .:.: :  :. ::.:.. .. :     :.:::
CCDS12 FDVAPPGVRKCILSTNIAETSVTIDGIRFVVDSGKVKEMSYDPQAKLQRLQEFWISQASA
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       .:: :::::.. : :::::.   :.  .    ::::.:..: ..:: .::... :   : 
CCDS12 EQRKGRAGRTGPGVCFRLYAESDYD-AFAPYPVPEIRRVALDSLVLQMKSMSVGDPRTFP
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       :..:::  .:  :.  :   :::.    ::  :  .:.:::: ...::.. .  .:  : 
CCDS12 FIEPPPPASLETAILYLRDQGALDSSEALTPIGSLLAQLPVDVVIGKMLILGSMFSLVEP
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pF1KA0 ILTVAAMLSVNNSIFYRPKDKVVHADNARVNFFLPGGDHLVLLNVYTQWAE-----SGYS
       .::.:: :::. : : :  ..  .   ::  .    :: ..:.::.. :..     :  :
CCDS12 VLTIAAALSVQ-SPFTRSAQSSPECAAARRPLESDQGDPFTLFNVFNAWVQVKSERSRNS
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pF1KA0 SQWCYENFVQFRSMRRARDVREQLEGLLER--VEVGLSSCQ-GD-YIRVRKAITAGYFYH
        .:: .  .. . . .  ..:.:.. :::   . .: .. : :: : :...         
CCDS12 RKWCRRRGIEEHRLYEMANLRRQFKELLEDHGLLAGAQAAQVGDSYSRLQQRRERRALHQ
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CCDS12 LKRQHEEGAGRRRKVLRLQEEQDGGSSDEDRAGPAPPGASDGVDIQDVKFKLRHDLAQLQ
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CCDS76 CGKSAQVPQWCAEYCLSIHYQHGG--VICTQVHKQTVVQLALRVADEMDVNIGHEVGYVI
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CCDS76 ARPELKLIINSSPHLISKLNSYYGNVPVIEVKNKH-PVEVVYLSEAQKDSFESILRLIFE
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CCDS76 IHHSGEKGDIVVFLACEQDIEKVCETVY-QGSNLNPDLGELVVVPLY---PKE-KCSLFK
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CCDS76 PLDETEKRCQVYQRRVVLTTSSGEFLIWSNSVRFVIDVGVERRKVYNPRIRANSLVMQPI
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CCDS76 SQSQAEIRKQILGSSSSGKFFCLYTEEFASKDMTPLKPAEMQEANLTSMVLFMKRIDIAG
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CCDS76 LGHCDFMNRPAPESLMQALEDLDYLAALDNDGNLSEFGIIMSEFPLDPQLSKSILASCEF
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CCDS76 DCVDEVLTIAAMVTAPNCFSHVPHGAEEAALTCWKTFLHPEGDHFTLISIYKAYQDTTLN
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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