Result of FASTA (ccds) for pF1KSDF0187
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDF0187, 563 aa
  1>>>pF1KSDF0187 563 - 563 aa - 563 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3140+/-0.00113; mu= 11.2174+/- 0.067
 mean_var=219.1958+/-41.763, 0's: 0 Z-trim(111.7): 948  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.086628
 statistics sampled from 11535 (12557) to 11535 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.719), E-opt: 0.2 (0.386), width:  16
 Scan time:  3.880

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS34698.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7        ( 563) 3835 492.6 5.4e-139
CCDS69349.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7        ( 527) 3610 464.4 1.5e-130
CCDS75640.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7        ( 350) 2381 310.6   2e-84
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7           ( 446) 1231 167.0 4.3e-41
CCDS5666.1 ZNF394 gene_id:84124|Hs108|chr7         ( 561) 1126 154.0 4.5e-37
CCDS14649.1 ZNF449 gene_id:203523|Hs108|chrX       ( 518) 1040 143.2 7.3e-34
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 616)  940 130.8 4.7e-30
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 658)  940 130.9 4.9e-30
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 670)  940 130.9   5e-30
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 682)  940 130.9   5e-30
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19      ( 688)  937 130.5 6.6e-30
CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6         ( 578)  928 129.3 1.3e-29
CCDS45852.1 ZNF397 gene_id:84307|Hs108|chr18       ( 534)  927 129.1 1.3e-29
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15       ( 614)  928 129.3 1.3e-29
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19        ( 706)  918 128.1 3.5e-29
CCDS12491.1 ZNF565 gene_id:147929|Hs108|chr19      ( 499)  913 127.3 4.3e-29
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19      ( 475)  907 126.6   7e-29
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17        ( 502)  907 126.6 7.2e-29
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5           ( 461)  906 126.4 7.5e-29
CCDS47944.1 ZNF251 gene_id:90987|Hs108|chr8        ( 671)  908 126.9   8e-29
CCDS74924.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3       ( 373)  903 125.9 8.5e-29
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3        ( 754)  905 126.5 1.1e-28
CCDS74346.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19       ( 314)  898 125.2 1.2e-28
CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19       ( 572)  902 126.0 1.2e-28
CCDS32980.1 ZNF708 gene_id:7562|Hs108|chr19        ( 563)  901 125.9 1.3e-28
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19      ( 674)  902 126.1 1.3e-28
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1          ( 470)  899 125.5 1.4e-28
CCDS12494.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19       ( 418)  898 125.4 1.4e-28
CCDS46061.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19       ( 419)  898 125.4 1.4e-28
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19       ( 488)  899 125.6 1.4e-28
CCDS12966.1 ZNF256 gene_id:10172|Hs108|chr19       ( 627)  900 125.8 1.5e-28
CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19       ( 687)  900 125.9 1.6e-28
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19       ( 715)  900 125.9 1.7e-28
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16         ( 585)  898 125.5 1.7e-28
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16         ( 643)  898 125.6 1.8e-28
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9          ( 364)  893 124.7   2e-28
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9          ( 474)  893 124.8 2.3e-28
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9           ( 498)  893 124.8 2.4e-28
CCDS74207.1 ZSCAN30 gene_id:100101467|Hs108|chr18  ( 307)  888 123.9 2.7e-28
CCDS46032.1 ZNF492 gene_id:57615|Hs108|chr19       ( 531)  892 124.7 2.7e-28
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 665)  891 124.7 3.4e-28
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 667)  891 124.7 3.5e-28
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 692)  891 124.8 3.5e-28
CCDS74462.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19       ( 617)  890 124.6 3.6e-28
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3         ( 544)  889 124.4 3.6e-28
CCDS42427.1 ZSCAN30 gene_id:100101467|Hs108|chr18  ( 494)  888 124.2 3.7e-28
CCDS12950.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19       ( 659)  890 124.6 3.7e-28
CCDS77365.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19       ( 706)  890 124.6 3.9e-28
CCDS42639.1 ZNF154 gene_id:7710|Hs108|chr19        ( 437)  886 123.9 4.1e-28
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX          ( 779)  887 124.3 5.4e-28


>>CCDS34698.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7             (563 aa)
 initn: 3835 init1: 3835 opt: 3835  Z-score: 2608.9  bits: 492.6 E(32554): 5.4e-139
Smith-Waterman score: 3835; 100.0% identity (100.0% similar) in 563 aa overlap (1-563:1-563)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MMTAESREATGLSPQAAQEKDGIVIVKVEEEDEEDHMWGQDSTLQDTPPPDPEIFRQRFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MMTAESREATGLSPQAAQEKDGIVIVKVEEEDEEDHMWGQDSTLQDTPPPDPEIFRQRFR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD RFCYQNTFGPREALSRLKELCHQWLRPEINTKEQILELLVLEQFLSILPKELQVWLQEYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RFCYQNTFGPREALSRLKELCHQWLRPEINTKEQILELLVLEQFLSILPKELQVWLQEYR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD PDSGEEAVTLLEDLELDLSGQQVPGQVHGPEMLARGMVPLDPVQESSSFDLHHEATQSHF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PDSGEEAVTLLEDLELDLSGQQVPGQVHGPEMLARGMVPLDPVQESSSFDLHHEATQSHF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD KHSSRKPRLLQSRALPAAHIPAPPHEGSPRDQAMASALFTADSQAMVKIEDMAVSLILEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KHSSRKPRLLQSRALPAAHIPAPPHEGSPRDQAMASALFTADSQAMVKIEDMAVSLILEE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD WGCQNLARRNLSRDNRQENYGSAFPQGGENRNENEESTSKAETSEDSASRGETTGRSQKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 WGCQNLARRNLSRDNRQENYGSAFPQGGENRNENEESTSKAETSEDSASRGETTGRSQKE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD FGEKRDQEGKTGERQQKNPEEKTRKEKRDSGPAIGKDKKTITGERGPREKGKGLGRSFSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FGEKRDQEGKTGERQQKNPEEKTRKEKRDSGPAIGKDKKTITGERGPREKGKGLGRSFSL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD SSNFTTPEEVPTGTKSHRCDECGKCFTRSSSLIRHKIIHTGEKPYECSECGKAFSLNSNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SSNFTTPEEVPTGTKSHRCDECGKCFTRSSSLIRHKIIHTGEKPYECSECGKAFSLNSNL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD VLHQRIHTGEKPHECNECGKAFSHSSNLILHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSDLTKHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VLHQRIHTGEKPHECNECGKAFSHSSNLILHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSDLTKHQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD RIHTGEKPYECSECGKAFNRNSYLILHRRIHTREKPYKCTKCGKAFTRSSTLTLHHRIHA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RIHTGEKPYECSECGKAFNRNSYLILHRRIHTREKPYKCTKCGKAFTRSSTLTLHHRIHA
              490       500       510       520       530       540

              550       560   
pF1KSD RERASEYSPASLDAFGAFLKSCV
       :::::::::::::::::::::::
CCDS34 RERASEYSPASLDAFGAFLKSCV
              550       560   

>>CCDS69349.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7             (527 aa)
 initn: 3610 init1: 3610 opt: 3610  Z-score: 2457.2  bits: 464.4 E(32554): 1.5e-130
Smith-Waterman score: 3610; 100.0% identity (100.0% similar) in 527 aa overlap (37-563:1-527)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KSD REATGLSPQAAQEKDGIVIVKVEEEDEEDHMWGQDSTLQDTPPPDPEIFRQRFRRFCYQN
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69                               MWGQDSTLQDTPPPDPEIFRQRFRRFCYQN
                                             10        20        30

         70        80        90       100       110       120      
pF1KSD TFGPREALSRLKELCHQWLRPEINTKEQILELLVLEQFLSILPKELQVWLQEYRPDSGEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 TFGPREALSRLKELCHQWLRPEINTKEQILELLVLEQFLSILPKELQVWLQEYRPDSGEE
               40        50        60        70        80        90

        130       140       150       160       170       180      
pF1KSD AVTLLEDLELDLSGQQVPGQVHGPEMLARGMVPLDPVQESSSFDLHHEATQSHFKHSSRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 AVTLLEDLELDLSGQQVPGQVHGPEMLARGMVPLDPVQESSSFDLHHEATQSHFKHSSRK
              100       110       120       130       140       150

        190       200       210       220       230       240      
pF1KSD PRLLQSRALPAAHIPAPPHEGSPRDQAMASALFTADSQAMVKIEDMAVSLILEEWGCQNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 PRLLQSRALPAAHIPAPPHEGSPRDQAMASALFTADSQAMVKIEDMAVSLILEEWGCQNL
              160       170       180       190       200       210

        250       260       270       280       290       300      
pF1KSD ARRNLSRDNRQENYGSAFPQGGENRNENEESTSKAETSEDSASRGETTGRSQKEFGEKRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ARRNLSRDNRQENYGSAFPQGGENRNENEESTSKAETSEDSASRGETTGRSQKEFGEKRD
              220       230       240       250       260       270

        310       320       330       340       350       360      
pF1KSD QEGKTGERQQKNPEEKTRKEKRDSGPAIGKDKKTITGERGPREKGKGLGRSFSLSSNFTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 QEGKTGERQQKNPEEKTRKEKRDSGPAIGKDKKTITGERGPREKGKGLGRSFSLSSNFTT
              280       290       300       310       320       330

        370       380       390       400       410       420      
pF1KSD PEEVPTGTKSHRCDECGKCFTRSSSLIRHKIIHTGEKPYECSECGKAFSLNSNLVLHQRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 PEEVPTGTKSHRCDECGKCFTRSSSLIRHKIIHTGEKPYECSECGKAFSLNSNLVLHQRI
              340       350       360       370       380       390

        430       440       450       460       470       480      
pF1KSD HTGEKPHECNECGKAFSHSSNLILHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSDLTKHQRIHTGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 HTGEKPHECNECGKAFSHSSNLILHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSDLTKHQRIHTGE
              400       410       420       430       440       450

        490       500       510       520       530       540      
pF1KSD KPYECSECGKAFNRNSYLILHRRIHTREKPYKCTKCGKAFTRSSTLTLHHRIHARERASE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 KPYECSECGKAFNRNSYLILHRRIHTREKPYKCTKCGKAFTRSSTLTLHHRIHARERASE
              460       470       480       490       500       510

        550       560   
pF1KSD YSPASLDAFGAFLKSCV
       :::::::::::::::::
CCDS69 YSPASLDAFGAFLKSCV
              520       

>>CCDS75640.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7             (350 aa)
 initn: 2381 init1: 2381 opt: 2381  Z-score: 1629.1  bits: 310.6 E(32554): 2e-84
Smith-Waterman score: 2381; 100.0% identity (100.0% similar) in 350 aa overlap (214-563:1-350)

           190       200       210       220       230       240   
pF1KSD SRKPRLLQSRALPAAHIPAPPHEGSPRDQAMASALFTADSQAMVKIEDMAVSLILEEWGC
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75                               MASALFTADSQAMVKIEDMAVSLILEEWGC
                                             10        20        30

           250       260       270       280       290       300   
pF1KSD QNLARRNLSRDNRQENYGSAFPQGGENRNENEESTSKAETSEDSASRGETTGRSQKEFGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QNLARRNLSRDNRQENYGSAFPQGGENRNENEESTSKAETSEDSASRGETTGRSQKEFGE
               40        50        60        70        80        90

           310       320       330       340       350       360   
pF1KSD KRDQEGKTGERQQKNPEEKTRKEKRDSGPAIGKDKKTITGERGPREKGKGLGRSFSLSSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KRDQEGKTGERQQKNPEEKTRKEKRDSGPAIGKDKKTITGERGPREKGKGLGRSFSLSSN
              100       110       120       130       140       150

           370       380       390       400       410       420   
pF1KSD FTTPEEVPTGTKSHRCDECGKCFTRSSSLIRHKIIHTGEKPYECSECGKAFSLNSNLVLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FTTPEEVPTGTKSHRCDECGKCFTRSSSLIRHKIIHTGEKPYECSECGKAFSLNSNLVLH
              160       170       180       190       200       210

           430       440       450       460       470       480   
pF1KSD QRIHTGEKPHECNECGKAFSHSSNLILHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSDLTKHQRIH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QRIHTGEKPHECNECGKAFSHSSNLILHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSDLTKHQRIH
              220       230       240       250       260       270

           490       500       510       520       530       540   
pF1KSD TGEKPYECSECGKAFNRNSYLILHRRIHTREKPYKCTKCGKAFTRSSTLTLHHRIHARER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TGEKPYECSECGKAFNRNSYLILHRRIHTREKPYKCTKCGKAFTRSSTLTLHHRIHARER
              280       290       300       310       320       330

           550       560   
pF1KSD ASEYSPASLDAFGAFLKSCV
       ::::::::::::::::::::
CCDS75 ASEYSPASLDAFGAFLKSCV
              340       350

>>CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7                (446 aa)
 initn: 2726 init1: 963 opt: 1231  Z-score: 851.2  bits: 167.0 E(32554): 4.3e-41
Smith-Waterman score: 1231; 51.5% identity (74.5% similar) in 369 aa overlap (184-546:9-369)

           160       170       180       190       200       210   
pF1KSD ARGMVPLDPVQESSSFDLHHEATQSHFKHSSRKPRLLQSRALPAAHIPAPPHEGSPRDQA
                                     :..:. : . :::. ..::   . :  :. 
CCDS43                       METQADLVSQEPQALLDSALPS-KVPAFSDKDSLGDEM
                                     10        20         30       

           220       230       240       250       260       270   
pF1KSD MASALFTADSQAMVKIEDMAVSLILEEWGCQNLARRNLSRDNRQENYGSAFPQGGENRNE
       .:.::. : :: .: .::.:: .: .::   . :.:.: ::   ::::..:    :.:.:
CCDS43 LAAALLKAKSQELVTFEDVAVYFIRKEWKRLEPAQRDLYRDVMLENYGNVFSLDRETRTE
        40        50        60        70        80        90       

           280       290       300             310       320       
pF1KSD NEESTSKAETSEDSASRGETTGRSQKE------FGEKRDQEGKTGERQQKNPEEKTRKEK
       :..     : :::. :.:   :: ::.      : :  ..: .  .   ..: :.  .. 
CCDS43 NDQ-----EISEDTRSHGVLLGRFQKDISQGLKFKEAYEREVSLKRPLGNSPGERLNRKM
       100            110       120       130       140       150  

       330       340       350       360       370       380       
pF1KSD RDSGPAIGKDKKTITGERGPREKGKGLGRSFSLSSNFTTPEEVPTGTKSHRCDECGKCFT
        : : .  ..: :  :::.  :: . .: ::...::. . ...:.: . :.::::.: :.
CCDS43 PDFGQVTVEEKLTPRGERS--EKYNDFGNSFTVNSNLISHQRLPVGDRPHKCDECSKSFN
            160       170         180       190       200       210

       390       400       410       420       430       440       
pF1KSD RSSSLIRHKIIHTGEKPYECSECGKAFSLNSNLVLHQRIHTGEKPHECNECGKAFSHSSN
       :.:.::.:. ::::::::::.::::::: .:.:. ::::::::::.::..:::.:: :: 
CCDS43 RTSDLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLIQHQRIHTGEKPYECSDCGKTFSCSSA
              220       230       240       250       260       270

       450       460       470       480       490       500       
pF1KSD LILHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSDLTKHQRIHTGEKPYECSECGKAFNRNSYLILH
       ::::.:::.::::::::::::.:: :: ::.::::::::::: :.::::::.:.: :: :
CCDS43 LILHRRIHTGEKPYECNECGKTFSWSSTLTHHQRIHTGEKPYACNECGKAFSRSSTLIHH
              280       290       300       310       320       330

       510       520       530       540       550       560       
pF1KSD RRIHTREKPYKCTKCGKAFTRSSTLTLHHRIHARERASEYSPASLDAFGAFLKSCV    
       .:::: ::::.:..:::::..:: :  :.:::. :.  :                     
CCDS43 QRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLYQHQRIHTGEKPYECMECGGKFTYSSGLIQHQRIH
              340       350       360       370       380       390

CCDS43 TGENPYECSECGKAFRYSSALVRHQRIHTGEKPLNGIGMSKSSLRVTTELNIREST
              400       410       420       430       440      

>>CCDS5666.1 ZNF394 gene_id:84124|Hs108|chr7              (561 aa)
 initn: 556 init1: 556 opt: 1126  Z-score: 779.1  bits: 154.0 E(32554): 4.5e-37
Smith-Waterman score: 1132; 37.9% identity (64.4% similar) in 554 aa overlap (1-539:20-547)

                                  10        20        30        40 
pF1KSD                    MMTAESREATGLSPQAAQEKDGIVIVKVEEEDEEDHMWGQD
                          .:.:.:..:      : ...::.. :::::..  .  :  .
CCDS56 MNSSLTAQRRGSDAELGPWVMAARSKDA------APSQRDGLLPVKVEEDSPGS--WEPN
               10        20              30        40          50  

              50        60        70        80        90       100 
pF1KSD STLQDTPPPDPEIFRQRFRRFCYQNTFGPREALSRLKELCHQWLRPEINTKEQILELLVL
            .  ::::  : .::.. ::.. ::.::::::.:::..:::::. .::::::::::
CCDS56 ---YPAASPDPETSRLHFRQLRYQEVAGPEEALSRLRELCRRWLRPELLSKEQILELLVL
                60        70        80        90       100         

             110       120       130       140       150           
pF1KSD EQFLSILPKELQVWLQEYRPDSGEEAVTLLEDLELDLSGQQVPGQVHGPE----MLARGM
       ::::.:::.:::.:..:. :.::::::.... :.  :.: .  :.:   .    .  .  
CCDS56 EQFLTILPEELQAWVREHCPESGEEAVAVVRALQRALDGTSSQGMVTFEDTAVSLTWEEW
     110       120       130       140       150       160         

       160       170       180       190       200         210     
pF1KSD VPLDPVQESSSFDLHHEATQSHFKHSSRKPRLLQSRALPAAHIPAPP--HEGSPRDQAMA
         :::...    :. .:..:.    .:  :  :.::.     ::     .:. :. : . 
CCDS56 ERLDPARR----DFCRESAQK--DSGSTVPPSLESRVENKELIPMQQILEEAEPQGQLQE
     170           180         190       200       210       220   

         220       230       240       250       260       270     
pF1KSD SALFTADSQAMVKIEDMAVSLILEEWGCQNLARRNLSRDNRQENYGSAFPQGGENRNENE
       .  : .    . :  .   . . .. :     . . : . .  :  :   ..:  ..:. 
CCDS56 A--FQGKRPLFSKCGSTHEDRVEKQSGDPLPLKLENSPEAEGLNSISDVNKNGSIEGED-
             230       240       250       260       270       280 

         280       290       300       310       320           330 
pF1KSD ESTSKAETSEDSASRGETTGRSQKEFGEKRDQEGKTGERQQKNPEEKT----RKEKRDSG
          :: .  ..::  .. .  ..   .:.  .  . :.. ... .  :    . .: :::
CCDS56 ---SKNNELQNSARCSNLVLCQHIPKAERPTDSEEHGNKCKQSFHMVTWHVLKPHKSDSG
                 290       300       310       320       330       

                  340       350       360       370       380      
pF1KSD PAIGKD-----KKTITGERGPREKGKGLGRSFSLSSNFTTPEEVPTGTKSHRCDECGKCF
        .. ..     .. .  :: : . :.  :.::.  :..   ... :: : . :.:::: :
CCDS56 DSFHHSSLFETQRQLHEER-PYKCGN-CGKSFKQRSDLFRHQRIHTGEKPYGCQECGKSF
       340       350        360        370       380       390     

        390       400       410       420       430       440      
pF1KSD TRSSSLIRHKIIHTGEKPYECSECGKAFSLNSNLVLHQRIHTGEKPHECNECGKAFSHSS
       ..:..: .:.  ::::::: : .::. :  ::.:  ::  :. .:  .:.:::..  : :
CCDS56 SQSAALTKHQRTHTGEKPYTCLKCGERFRQNSHLNRHQSTHSRDKHFKCEECGET-CHIS
         400       410       420       430       440       450     

        450       460       470       480       490       500      
pF1KSD NLILHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSDLTKHQRIHTGEKPYECSECGKAFNRNSYLIL
       ::. :::.:.::.::.:.:: :.:.: ::: ::.::::::::: :: ::: ::... :: 
CCDS56 NLFRHQRLHKGERPYKCEECEKSFKQRSDLFKHHRIHTGEKPYGCSVCGKRFNQSATLIK
          460       470       480       490       500       510    

        510       520       530       540       550       560   
pF1KSD HRRIHTREKPYKCTKCGKAFTRSSTLTLHHRIHARERASEYSPASLDAFGAFLKSCV
       :.:::: :::::: .::. : .:. :  :.:::                        
CCDS56 HQRIHTGEKPYKCLECGERFRQSTHLIRHQRIHQNKVLSAGRGGSRL          
          520       530       540       550       560           

>>CCDS14649.1 ZNF449 gene_id:203523|Hs108|chrX            (518 aa)
 initn: 1618 init1: 930 opt: 1040  Z-score: 721.4  bits: 143.2 E(32554): 7.3e-34
Smith-Waterman score: 1063; 37.7% identity (62.5% similar) in 530 aa overlap (40-541:15-515)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KSD TGLSPQAAQEKDGIVIVKVEEEDEEDHMWGQDSTLQDTPPPDPEIFRQRFRRFCYQNTFG
                                     : :..:.    : :.::::::.: :... :
CCDS14                 MAVALGCAIQASLNQGSVFQEYDT-DCEVFRQRFRQFQYREAAG
                               10        20         30        40   

      70        80        90       100       110       120         
pF1KSD PREALSRLKELCHQWLRPEINTKEQILELLVLEQFLSILPKELQVWLQEYRPDSGEEAVT
       :.::...: ::: :::.:.. .::::::::::::::.::: :...:..:. :.. :..:.
CCDS14 PHEAFNKLWELCCQWLKPKMRSKEQILELLVLEQFLTILPTEIETWVREHCPENRERVVS
            50        60        70        80        90       100   

     130         140       150       160       170       180       
pF1KSD LLEDL--ELDLSGQQVPGQVHGPEMLARGMVPLDPVQESSSFDLHHEATQSHFKHSSRKP
       :.:::  ::..  :::  ..:  .:: . ..:.  ..   .. :.  : :          
CCDS14 LIEDLQRELEIPEQQV--DMH--DMLLEELAPVGTAHIPPTMHLESPALQV---------
           110         120         130       140       150         

       190       200       210          220       230       240    
pF1KSD RLLQSRALPAAHIPAPPHEGSPRDQAMASAL---FTADSQAMVKIEDMAVSLILEE--WG
        .  ..  :.:.   : . : :. .  :..    :   .  . :. ::  ::  .:  : 
CCDS14 -MGPAQEAPVAEAWIP-QAGPPELNYGATGECQNFLDPGYPLPKL-DMNFSLENREEPW-
               160        170       180       190        200       

            250       260       270       280                 290  
pF1KSD CQNLARRNLSRDNRQENYGSAFPQGGENRNENEESTSKAE----------TSEDSASRGE
        ..:      .:... .       : :   ::::.::: .          : : .: .: 
CCDS14 VKEL------QDSKEMKQLLDSKIGFEIGIENEEDTSKQKKMETMYPFIVTLEGNALQGP
        210             220       230       240       250       260

            300        310               320        330        340 
pF1KSD TTGRSQKEFGEKRDQ-EGKTGERQ--------QKNPEEKTRKEKRD-SGPAIGKD-KKTI
            ::.. . ..: :    . :        :.::      :. .   :   :  ::  
CCDS14 IL---QKDYVQLENQWETPPEDLQTDLAKLVDQQNPTLGETPENSNLEEPLNPKPHKKKS
                 270       280       290       300       310       

             350       360       370       380       390       400 
pF1KSD TGERGPREKGKGLGRSFSLSSNFTTPEEVPTGTKSHRCDECGKCFTRSSSLIRHKIIHTG
        ::. :..  .  :. :. .:..:  ... .: . :.: :::: : :::.: ::. .:::
CCDS14 PGEK-PHRCPQ-CGKCFARKSQLTGHQRIHSGEEPHKCPECGKRFLRSSDLYRHQRLHTG
       320         330       340       350       360       370     

             410       420       430       440       450       460 
pF1KSD EKPYECSECGKAFSLNSNLVLHQRIHTGEKPHECNECGKAFSHSSNLILHQRIHSGEKPY
       :.::::. : : :.  :.:. ::: :. :. ..: ::::.: :.:.:  : . :.::::.
CCDS14 ERPYECTVCKKRFTRRSHLIGHQRTHSEEETYKCLECGKSFCHGSSLKRHLKTHTGEKPH
         380       390       400       410       420       430     

             470       480       490       500       510       520 
pF1KSD ECNECGKAFSQSSDLTKHQRIHTGEKPYECSECGKAFNRNSYLILHRRIHTREKPYKCTK
       .:..:::.::. . :: ::: :: :.:..:. :::.: .   :..: :::: :::::::.
CCDS14 RCHNCGKSFSRLTALTLHQRTHTEERPFKCNYCGKSFRQRPSLVIHLRIHTGEKPYKCTH
         440       450       460       470       480       490     

             530       540       550       560   
pF1KSD CGKAFTRSSTLTLHHRIHARERASEYSPASLDAFGAFLKSCV
       :.:.: . . : .:.  : :                      
CCDS14 CSKSFRQRAGLIMHQVTHFRGLI                   
         500       510                           

>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (616 aa)
 initn: 7525 init1: 897 opt: 940  Z-score: 653.0  bits: 130.8 E(32554): 4.7e-30
Smith-Waterman score: 940; 52.1% identity (75.3% similar) in 267 aa overlap (280-546:304-565)

     250       260       270       280       290       300         
pF1KSD NLSRDNRQENYGSAFPQGGENRNENEESTSKAETSEDSASRGETTGRSQKEFGEKRDQEG
                                     . .:.:   . ::     ..  .  . :. 
CCDS74 HERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRI
           280       290       300       310       320       330   

     310       320       330       340       350       360         
pF1KSD KTGERQQKNPEEKTRKEKRDSGPAIGKDKKTITGERGPREKGKGLGRSFSLSSNFTTPEE
       .:::.  .  :    :   .  : : . ..: :::. : : :.  :..:: :. .:  ..
CCDS74 HTGEKPYECHE--CGKAFTQITPLI-QHQRTHTGEK-PYECGE-CGKAFSQSTLLTEHRR
           340         350        360        370        380        

     370       380       390       400       410       420         
pF1KSD VPTGTKSHRCDECGKCFTRSSSLIRHKIIHTGEKPYECSECGKAFSLNSNLVLHQRIHTG
       . :: : . :.:::: :..:::: .:.  ::::::::::.:::::  ...:. :::::::
CCDS74 IHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTG
      390       400       410       420       430       440        

     430       440       450       460       470       480         
pF1KSD EKPHECNECGKAFSHSSNLILHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSDLTKHQRIHTGEKPY
       :::.:::.:::::::::.:  :::::.::::::::.::.:::: . : .:::::::::::
CCDS74 EKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPY
      450       460       470       480       490       500        

     490       500       510       520       530       540         
pF1KSD ECSECGKAFNRNSYLILHRRIHTREKPYKCTKCGKAFTRSSTLTLHHRIHARERASEYSP
       ::..::.::...: :: :.::::.:::: :..:::.:..::.:. :.: :. :.  :   
CCDS74 ECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHD
      510       520       530       540       550       560        

     550       560                                     
pF1KSD ASLDAFGAFLKSCV                                  
                                                       
CCDS74 CGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
      570       580       590       600       610      

>--
 initn: 1784 init1: 632 opt: 650  Z-score: 457.2  bits: 94.6 E(32554): 3.8e-19
Smith-Waterman score: 650; 49.7% identity (73.8% similar) in 183 aa overlap (353-535:122-302)

            330       340       350       360       370       380  
pF1KSD TRKEKRDSGPAIGKDKKTITGERGPREKGKGLGRSFSLSSNFTTPEEVPTGTKSHRCDEC
                                     :.:...::. ..     .:   . :     
CCDS74 EWSCESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTR
             100       110       120       130       140       150 

            390       400       410       420       430       440  
pF1KSD GKCFTRSSSLIRHKIIHTGEKPYECSECGKAFSLNSNLVLHQRIHTGEKPHECNECGKAF
       ::    . .....  ..  ::::.:.::::::: .: :. :.: ::::.:.::.:: :.:
CCDS74 GKREKPDLNVLQKTCVK--EKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGF
             160         170       180       190       200         

            450       460       470       480       490       500  
pF1KSD SHSSNLILHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSDLTKHQRIHTGEKPYECSECGKAFNRNS
        .:: :  :::::.:::::.:..::..:.: . : .::: ::::::::::::::.:.  :
CCDS74 RNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRS
     210       220       230       240       250       260         

            510       520       530       540       550       560  
pF1KSD YLILHRRIHTREKPYKCTKCGKAFTRSSTLTLHHRIHARERASEYSPASLDAFGAFLKSC
        .  :.: :: ::::.:..::::: .:  :: :                           
CCDS74 SFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTK
     270       280       290       300       310       320         

                                                                   
pF1KSD V                                                           
                                                                   
CCDS74 HQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRI
     330       340       350       360       370       380         

>>CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (658 aa)
 initn: 7525 init1: 897 opt: 940  Z-score: 652.7  bits: 130.9 E(32554): 4.9e-30
Smith-Waterman score: 940; 52.1% identity (75.3% similar) in 267 aa overlap (280-546:346-607)

     250       260       270       280       290       300         
pF1KSD NLSRDNRQENYGSAFPQGGENRNENEESTSKAETSEDSASRGETTGRSQKEFGEKRDQEG
                                     . .:.:   . ::     ..  .  . :. 
CCDS74 HERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRI
         320       330       340       350       360       370     

     310       320       330       340       350       360         
pF1KSD KTGERQQKNPEEKTRKEKRDSGPAIGKDKKTITGERGPREKGKGLGRSFSLSSNFTTPEE
       .:::.  .  :    :   .  : : . ..: :::. : : :.  :..:: :. .:  ..
CCDS74 HTGEKPYECHE--CGKAFTQITPLI-QHQRTHTGEK-PYECGE-CGKAFSQSTLLTEHRR
         380         390        400        410        420       430

     370       380       390       400       410       420         
pF1KSD VPTGTKSHRCDECGKCFTRSSSLIRHKIIHTGEKPYECSECGKAFSLNSNLVLHQRIHTG
       . :: : . :.:::: :..:::: .:.  ::::::::::.:::::  ...:. :::::::
CCDS74 IHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTG
              440       450       460       470       480       490

     430       440       450       460       470       480         
pF1KSD EKPHECNECGKAFSHSSNLILHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSDLTKHQRIHTGEKPY
       :::.:::.:::::::::.:  :::::.::::::::.::.:::: . : .:::::::::::
CCDS74 EKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPY
              500       510       520       530       540       550

     490       500       510       520       530       540         
pF1KSD ECSECGKAFNRNSYLILHRRIHTREKPYKCTKCGKAFTRSSTLTLHHRIHARERASEYSP
       ::..::.::...: :: :.::::.:::: :..:::.:..::.:. :.: :. :.  :   
CCDS74 ECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHD
              560       570       580       590       600       610

     550       560                                     
pF1KSD ASLDAFGAFLKSCV                                  
                                                       
CCDS74 CGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
              620       630       640       650        

>--
 initn: 1847 init1: 632 opt: 650  Z-score: 456.8  bits: 94.6 E(32554): 4e-19
Smith-Waterman score: 657; 35.5% identity (60.2% similar) in 349 aa overlap (214-535:1-344)

           190       200       210       220       230       240   
pF1KSD SRKPRLLQSRALPAAHIPAPPHEGSPRDQAMASALFTADSQAMVKIEDMAVSLILEEWGC
                                     :. .. .. .  .: .::..:..  :::: 
CCDS74                               MTPGVRVSTDPEQVTFEDVVVGFSQEEWGQ
                                             10        20        30

           250       260                  270         280       290
pF1KSD QNLARRNLSRDNRQENY------GSAFPQGG-----ENRNE--NEESTSKAETSEDSASR
        . :.:.: ::   ...      :  .:. .     :.. :    ::     .  :  .:
CCDS74 LKPAQRTLYRDVMLDTFRLLVSVGHWLPKPNVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETR
               40        50        60        70        80        90

              300                  310          320       330      
pF1KSD GETTGRSQKE-----------FGEKRDQEGK---TGERQQKNPEEKTRKEKRDSGPAIGK
        ..     :.           . :.   .:     ::  . . : . .. .  . :.   
CCDS74 PKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAFT
              100       110       120       130       140       150

        340       350       360       370       380       390      
pF1KSD DKKTITGERGPREKGKGLGRSFSLSSNFTTPEEVPTGTKSHRCDECGKCFTRSSSLIRHK
         :: . :.  :.   :.:...::. ..     .:   . :     ::    . ..... 
CCDS74 PVKTPVLEQWQRN---GFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKT
              160          170       180       190       200       

        400       410       420       430       440       450      
pF1KSD IIHTGEKPYECSECGKAFSLNSNLVLHQRIHTGEKPHECNECGKAFSHSSNLILHQRIHS
        ..  ::::.:.::::::: .: :. :.: ::::.:.::.:: :.: .:: :  :::::.
CCDS74 CVK--EKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHT
       210         220       230       240       250       260     

        460       470       480       490       500       510      
pF1KSD GEKPYECNECGKAFSQSSDLTKHQRIHTGEKPYECSECGKAFNRNSYLILHRRIHTREKP
       :::::.:..::..:.: . : .::: ::::::::::::::.:.  : .  :.: :: :::
CCDS74 GEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKP
         270       280       290       300       310       320     

        520       530       540       550       560                
pF1KSD YKCTKCGKAFTRSSTLTLHHRIHARERASEYSPASLDAFGAFLKSCV             
       :.:..::::: .:  :: :                                         
CCDS74 YECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECH
         330       340       350       360       370       380     

>>CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (670 aa)
 initn: 7525 init1: 897 opt: 940  Z-score: 652.6  bits: 130.9 E(32554): 5e-30
Smith-Waterman score: 940; 52.1% identity (75.3% similar) in 267 aa overlap (280-546:358-619)

     250       260       270       280       290       300         
pF1KSD NLSRDNRQENYGSAFPQGGENRNENEESTSKAETSEDSASRGETTGRSQKEFGEKRDQEG
                                     . .:.:   . ::     ..  .  . :. 
CCDS12 HERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRI
       330       340       350       360       370       380       

     310       320       330       340       350       360         
pF1KSD KTGERQQKNPEEKTRKEKRDSGPAIGKDKKTITGERGPREKGKGLGRSFSLSSNFTTPEE
       .:::.  .  :    :   .  : : . ..: :::. : : :.  :..:: :. .:  ..
CCDS12 HTGEKPYECHE--CGKAFTQITPLI-QHQRTHTGEK-PYECGE-CGKAFSQSTLLTEHRR
       390         400       410        420         430       440  

     370       380       390       400       410       420         
pF1KSD VPTGTKSHRCDECGKCFTRSSSLIRHKIIHTGEKPYECSECGKAFSLNSNLVLHQRIHTG
       . :: : . :.:::: :..:::: .:.  ::::::::::.:::::  ...:. :::::::
CCDS12 IHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTG
            450       460       470       480       490       500  

     430       440       450       460       470       480         
pF1KSD EKPHECNECGKAFSHSSNLILHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSDLTKHQRIHTGEKPY
       :::.:::.:::::::::.:  :::::.::::::::.::.:::: . : .:::::::::::
CCDS12 EKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPY
            510       520       530       540       550       560  

     490       500       510       520       530       540         
pF1KSD ECSECGKAFNRNSYLILHRRIHTREKPYKCTKCGKAFTRSSTLTLHHRIHARERASEYSP
       ::..::.::...: :: :.::::.:::: :..:::.:..::.:. :.: :. :.  :   
CCDS12 ECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHD
            570       580       590       600       610       620  

     550       560                                     
pF1KSD ASLDAFGAFLKSCV                                  
                                                       
CCDS12 CGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
            630       640       650       660       670

>--
 initn: 1847 init1: 632 opt: 650  Z-score: 456.7  bits: 94.6 E(32554): 4e-19
Smith-Waterman score: 650; 49.7% identity (73.8% similar) in 183 aa overlap (353-535:176-356)

            330       340       350       360       370       380  
pF1KSD TRKEKRDSGPAIGKDKKTITGERGPREKGKGLGRSFSLSSNFTTPEEVPTGTKSHRCDEC
                                     :.:...::. ..     .:   . :     
CCDS12 EWSCESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTR
         150       160       170       180       190       200     

            390       400       410       420       430       440  
pF1KSD GKCFTRSSSLIRHKIIHTGEKPYECSECGKAFSLNSNLVLHQRIHTGEKPHECNECGKAF
       ::    . .....  ..  ::::.:.::::::: .: :. :.: ::::.:.::.:: :.:
CCDS12 GKREKPDLNVLQKTCVK--EKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGF
         210       220         230       240       250       260   

            450       460       470       480       490       500  
pF1KSD SHSSNLILHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSDLTKHQRIHTGEKPYECSECGKAFNRNS
        .:: :  :::::.:::::.:..::..:.: . : .::: ::::::::::::::.:.  :
CCDS12 RNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRS
           270       280       290       300       310       320   

            510       520       530       540       550       560  
pF1KSD YLILHRRIHTREKPYKCTKCGKAFTRSSTLTLHHRIHARERASEYSPASLDAFGAFLKSC
        .  :.: :: ::::.:..::::: .:  :: :                           
CCDS12 SFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTK
           330       340       350       360       370       380   

                                                                   
pF1KSD V                                                           
                                                                   
CCDS12 HQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRI
           390       400       410       420       430       440   

>>CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (682 aa)
 initn: 7525 init1: 897 opt: 940  Z-score: 652.5  bits: 130.9 E(32554): 5e-30
Smith-Waterman score: 940; 52.1% identity (75.3% similar) in 267 aa overlap (280-546:370-631)

     250       260       270       280       290       300         
pF1KSD NLSRDNRQENYGSAFPQGGENRNENEESTSKAETSEDSASRGETTGRSQKEFGEKRDQEG
                                     . .:.:   . ::     ..  .  . :. 
CCDS54 HERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRI
     340       350       360       370       380       390         

     310       320       330       340       350       360         
pF1KSD KTGERQQKNPEEKTRKEKRDSGPAIGKDKKTITGERGPREKGKGLGRSFSLSSNFTTPEE
       .:::.  .  :    :   .  : : . ..: :::. : : :.  :..:: :. .:  ..
CCDS54 HTGEKPYECHE--CGKAFTQITPLI-QHQRTHTGEK-PYECGE-CGKAFSQSTLLTEHRR
     400       410         420        430         440       450    

     370       380       390       400       410       420         
pF1KSD VPTGTKSHRCDECGKCFTRSSSLIRHKIIHTGEKPYECSECGKAFSLNSNLVLHQRIHTG
       . :: : . :.:::: :..:::: .:.  ::::::::::.:::::  ...:. :::::::
CCDS54 IHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTG
          460       470       480       490       500       510    

     430       440       450       460       470       480         
pF1KSD EKPHECNECGKAFSHSSNLILHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSDLTKHQRIHTGEKPY
       :::.:::.:::::::::.:  :::::.::::::::.::.:::: . : .:::::::::::
CCDS54 EKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPY
          520       530       540       550       560       570    

     490       500       510       520       530       540         
pF1KSD ECSECGKAFNRNSYLILHRRIHTREKPYKCTKCGKAFTRSSTLTLHHRIHARERASEYSP
       ::..::.::...: :: :.::::.:::: :..:::.:..::.:. :.: :. :.  :   
CCDS54 ECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHD
          580       590       600       610       620       630    

     550       560                                     
pF1KSD ASLDAFGAFLKSCV                                  
                                                       
CCDS54 CGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
          640       650       660       670       680  

>--
 initn: 1847 init1: 632 opt: 650  Z-score: 456.6  bits: 94.6 E(32554): 4.1e-19
Smith-Waterman score: 650; 49.7% identity (73.8% similar) in 183 aa overlap (353-535:188-368)

            330       340       350       360       370       380  
pF1KSD TRKEKRDSGPAIGKDKKTITGERGPREKGKGLGRSFSLSSNFTTPEEVPTGTKSHRCDEC
                                     :.:...::. ..     .:   . :     
CCDS54 EWSCESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTR
       160       170       180       190       200       210       

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pF1KSD GKCFTRSSSLIRHKIIHTGEKPYECSECGKAFSLNSNLVLHQRIHTGEKPHECNECGKAF
       ::    . .....  ..  ::::.:.::::::: .: :. :.: ::::.:.::.:: :.:
CCDS54 GKREKPDLNVLQKTCVK--EKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGF
       220       230         240       250       260       270     

            450       460       470       480       490       500  
pF1KSD SHSSNLILHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSDLTKHQRIHTGEKPYECSECGKAFNRNS
        .:: :  :::::.:::::.:..::..:.: . : .::: ::::::::::::::.:.  :
CCDS54 RNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRS
         280       290       300       310       320       330     

            510       520       530       540       550       560  
pF1KSD YLILHRRIHTREKPYKCTKCGKAFTRSSTLTLHHRIHARERASEYSPASLDAFGAFLKSC
        .  :.: :: ::::.:..::::: .:  :: :                           
CCDS54 SFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTK
         340       350       360       370       380       390     

                                                                   
pF1KSD V                                                           
                                                                   
CCDS54 HQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRI
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563 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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