seq1 = pF1KSDF0041.tfa, 933 bp
seq2 = pF1KSDF0041/gi568815588r_71651668.tfa (gi568815588r:71651668_71873439), 221772 bp

>pF1KSDF0041 933
>gi568815588r:71651668_71873439 (Chr10)

(complement)

1-82  (100001-100082)   100% ->
83-511  (111414-111842)   100% ->
512-568  (112516-112572)   98% ->
569-676  (117974-118081)   100% ->
677-704  (120438-120465)   100% ->
705-898  (121579-121772)   100% ->
899-933  (122150-122184)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCGTCCCCACGGCCCTGGAGGCCGGCAGCTGGCGCTGGGGATCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCGTCCCCACGGCCCTGGAGGCCGGCAGCTGGCGCTGGGGATCCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTCTTCGCTCTCTTCCTGGCTGCGTCCCTAG         GTCCGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100051 GCTCTTCGCTCTCTTCCTGGCTGCGTCCCTAGGTA...CAGGTCCGGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAGCCTTCAAGGTCGCCACGCCGTATTCCCTGTATGTCTGTCCCGAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111423 CAGCCTTCAAGGTCGCCACGCCGTATTCCCTGTATGTCTGTCCCGAGGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGAACGTCACCCTCACCTGCAGGCTCTTGGGCCCTGTGGACAAAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111473 CAGAACGTCACCCTCACCTGCAGGCTCTTGGGCCCTGTGGACAAAGGGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGATGTGACCTTCTACAAGACGTGGTACCGCAGCTCGAGGGGCGAGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111523 CGATGTGACCTTCTACAAGACGTGGTACCGCAGCTCGAGGGGCGAGGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGACCTGCTCAGAGCGCCGGCCCATCCGCAACCTCACGTTCCAGGACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111573 AGACCTGCTCAGAGCGCCGGCCCATCCGCAACCTCACGTTCCAGGACCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CACCTGCACCATGGAGGCCACCAGGCTGCCAACACCAGCCACGACCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111623 CACCTGCACCATGGAGGCCACCAGGCTGCCAACACCAGCCACGACCTGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TCAGCGCCACGGGCTGGAGTCGGCCTCCGACCACCATGGCAACTTCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111673 TCAGCGCCACGGGCTGGAGTCGGCCTCCGACCACCATGGCAACTTCTCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCACCATGCGCAACCTGACCCTGCTGGATAGCGGCCTCTACTGCTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111723 TCACCATGCGCAACCTGACCCTGCTGGATAGCGGCCTCTACTGCTGCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GTGGTGGAGATCAGGCACCACCACTCGGAGCACAGGGTCCATGGTGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111773 GTGGTGGAGATCAGGCACCACCACTCGGAGCACAGGGTCCATGGTGCCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GGAGCTGCAGGTGCAGACAG         GCAAAGATGCACCATCCAACT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 111823 GGAGCTGCAGGTGCAGACAGGTG...CAGGCAAAGATGCACCATCCAACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GTGTGGTGTACCCATCCTCCTCCCAGGAGAGTGAAA         ACATC
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||>>>...>>>|||||
 112537 GTGTGGTGTACCCATCCTCCTCCCAGGATAGTGAAAGTA...CAGACATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ACGGCTGCAGCCCTGGCTACGGGTGCCTGCATCGTAGGAATCCTCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117979 ACGGCTGCAGCCCTGGCTACGGGTGCCTGCATCGTAGGAATCCTCTGCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CCCCCTCATCCTGCTCCTGGTCTACAAGCAAAGGCAGGCAGCCTCCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118029 CCCCCTCATCCTGCTCCTGGTCTACAAGCAAAGGCAGGCAGCCTCCAACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GCC         GTGCCCAGGAGCTGGTGCGGATGGACAG         C
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 118079 GCCGTG...TAGGTGCCCAGGAGCTGGTGCGGATGGACAGGTA...CAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AACATTCAAGGGATTGAAAACCCCGGCTTTGAAGCCTCACCACCTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121580 AACATTCAAGGGATTGAAAACCCCGGCTTTGAAGCCTCACCACCTGCCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GGGGATACCCGAGGCCAAAGTCAGGCACCCCCTGTCCTATGTGGCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121630 GGGGATACCCGAGGCCAAAGTCAGGCACCCCCTGTCCTATGTGGCCCAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GGCAGCCTTCTGAGTCTGGGCGGCATCTGCTTTCGGAGCCCAGCACCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121680 GGCAGCCTTCTGAGTCTGGGCGGCATCTGCTTTCGGAGCCCAGCACCCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CTGTCTCCTCCAGGCCCCGGAGACGTCTTCTTCCCATCCCTGG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 121730 CTGTCTCCTCCAGGCCCCGGAGACGTCTTCTTCCCATCCCTGGGTA...C

    950     .    :    .    :    .    :    .
    899   ACCCTGTCCCTGACTCTCCAAACTTTGAGGTCATC
        >>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122148 AGACCCTGTCCCTGACTCTCCAAACTTTGAGGTCATC